README.md

---
library_name: sklearn # Joblib ile kaydedilen modeller için standart
tags:
- xgboost
- qsar
- regression
- cheminformatics
- morgan-fingerprint
---

# XGBoost QSAR Regresyon Modeli (Morgan Fingerprints)

Bu model, moleküler SMILES dizilerini girdi olarak alıp bir 'value' (örn. pIC50, aktivite)
değerini tahmin etmek için eğitilmiş bir XGBoost Regresörüdür.

## 📈 Model Performansı (Test Seti)

Model, temizlenmiş veri setinin %20'si üzerinde test edilmiştir:

* **R-squared (R²):** 0.8795
* **RMSE:** 38.6370
* **MSE:** 1492.8184

## ⚙️ Model Mimarisi

* **Model Tipi:** XGBRegressor
* **Öznitelikler:** Morgan Fingerprints (radius=3, n_bits=2048)
* **Eğitim Verisi:** 8364 geçerli molekül
* **Hiperparametreler:**
    * `n_estimators`: 527
    * `max_depth`: 11
    * `learning_rate`: 0.0823
    * `subsample`: 0.9728
    * `colsample_bytree`: 0.7048

## 🚀 Modeli Kullanma (Python)

Modeli yüklemek ve tahmin yapmak için `huggingface_hub`, `joblib` ve `rdkit` gerekir.

```python
import joblib
import numpy as np
from huggingface_hub import hf_hub_download
from rdkit import Chem
from rdkit.Chem import AllChem

# --- Gerekli fonksiyonlar ---
def get_morgan_fp(smiles, radius=3, n_bits=2048):
    mol = Chem.MolFromSmiles(smiles)
    if mol is None:
        return np.zeros((n_bits,), dtype=int)
    fp = AllChem.GetMorganFingerprintAsBitVect(mol, radius, nBits=n_bits)
    return np.array(fp)

# --- Model ve ön işleyiciyi yükle ---
REPO_ID = "BURAYA-REPO-ID-GELECEK" # Örn: "kullanici-adi/model-adi"
MODEL_FILE = "xgb_morgan_regressor.joblib"

model_path = hf_hub_download(repo_id=REPO_ID, filename=MODEL_FILE)
model = joblib.load(model_path)

print("Model başarıyla yüklendi.")

# --- Tahmin yapma ---
smiles_list = ["CCO", "c1ccccc1O"]
fingerprints = np.array([get_morgan_fp(s) for s in smiles_list])

predictions = model.predict(fingerprints)
print(f"Tahminler: {predictions}")