Accession
stringlengths 8
11
| Organism_Name
stringlengths 10
53
| Submitters
stringlengths 4
2.42k
⌀ | Organization
stringlengths 3
234
⌀ | Org_location
stringlengths 3
24
⌀ | Release_Date
stringlengths 10
10
| Isolate
stringlengths 1
75
⌀ | Species
stringlengths 10
53
⌀ | Genus
stringlengths 7
22
⌀ | Family
stringlengths 10
19
⌀ | Molecule_type
stringclasses 14
values | Length
int64 5k
95.4k
| Sequence_Type
stringclasses 2
values | Publications
float64 1
134
⌀ | Geo_Location
stringlengths 3
88
⌀ | Country
stringlengths 3
32
⌀ | Host
stringlengths 3
64
⌀ | Isolation_Source
stringlengths 3
31
⌀ | Collection_Date
stringlengths 4
10
⌀ | BioSample
stringlengths 12
14
⌀ | BioProject
stringlengths 9
23
⌀ | GenBank_Title
stringlengths 22
320
| Sequence
stringlengths 5k
95.4k
| __index_level_0__
int64 39
112k
|
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_023635.1
|
Arumowot virus
|
Palacios,G., Savji,N., Sze,W., Hutchinson,S., Tesh,R., Travassos da Rosa,A., Lipkin,W.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2014-03-04
| null |
Phlebovirus arumowotense
|
Phlebovirus
|
Phenuiviridae
|
ssRNA(+/-)
| 6,376
|
RefSeq
| null |
Spain
|
Spain
| null | null | null | null |
PRJNA485481
|
Arumowot virus segment L, complete sequence
|
ACACAAAGGCGCCAAGAATGAATCAATTGCTATCAAAACAAACCTCACCAAGAGTGGGTTTTTTCTGTAAAGCTATAGGACACCATGACTATTTTGTGGGAAATGTTGTCCTACCCAATTTCCAAGTCAGGAGAGTGATGGATGGGATAGAGATTGATTTGAATCTAGATGACTTGGACACAGCATCTGATCTGGGCTCTTCCTTAAGGCCTTCTTTAACAGTGAGGTCTAACAATGTCCCAAATTTCATACATGACTTTACATTTGGTCATTTGGCAGACACCACTGATAGAGCCTTTTCTTCTGTGTTCCAAGTTGTGAATGATGGCTTTGATGATCTGACACCAGATGTTATTGTTAAAACTCCTTCCGGCAGCTTCCATGTTGTGGAGTTTACAACCTTTAGAGGACGACAAGAGGAAGCTAGATTTGCCACTCAAAACAAAATAACAAAATATGAATTAGCTTGTAGAAACAGATCAGTTCAAGGCCCAGTGTCATTGCACACTATTGGGGTGCATAGAGGAGGCCTATGGACCAACATGAAAATTGACCAAAAAGAGGTTGAAGAGCTTTGCTTTAGATTTAGACTATCGCTAGCTATTGAAGCAGAAATTAAATTGATCTGCCCTGATTTAAGGGAGGTTGACGAAGAGTATTCAAAATTGGAGAGGGAAATATTAGGGATTGTTTCAGGGATTAAAATTGACTGGGATGTAACTCAGTCAGTTTTCCCTTCATTCAAGAGAGAATTGTTTAGAAGATTCTACCAATCTGAGCCTGATCAAGAGTATCTTCAATCCATAATTGATAAAGTCACTAGAAAGTCTCAAGATGATCTCCTAAAATCATCTTTCATTAATCTAACCAACACTCTACCTGAGAGGTTGATGAGCAACCTCCAAGAATGCGAGAATGCAATTACTGACTTTATTGACAATCATGAATCAAGAGATAATTTAAGGCCAGCAAACTGGAGGAAGGGGACTGTCCTGTTTCCCCCTTGGGTGTTTAGAGAATCAGATGAAGGAAAGAGCTTAACTCCTCTAAAGGATCTAAATGTAGAAGGAGACCATCCTATGTGTAGAATATGGGAAAGAGTCAGGCTATCAGCTCAATTAGAAGAAATTGAAAGAATGGATGATGATCCTGAGAGTGAATTAGAATTTGCACTATCTGGAGAGAGAACTAGAGATGATGAGAGGAGCAAGTATCATAGAGTGAGGGTTGATTTGGACTTGGAAGAAAAGGAGTTTGTGGCTATGCTTGGTATTAATGGGAAAGCCTATAAGGACTGGTCTTCTATTAAGGATAATAGAGAAAAGAGTAAATTAATATTTTCAATTTACCATGATACAACACCGGTTGAAGAATTTTTATACACAGATTCATCTTTAGACATGACTCCAGAAGATGATTTATACGGGCCTTACCTTGAGGATATTGAGCTGAGATTACAAGCTCAAAAGATTCACCAGCCAACTCTATCTAGGAAAGGCTTAAACGAGTTTGTAGAATGTCATCAAGGGATTCTGAAAACTCCCTTAGGATCTTGGTGTCAATTTGTGAATGTTGTAGGCTCGGAATTATCAGCCTCAGTTAAACAACATGTCAAGCCTAGTAGTTTTGTGGTGAAAAGGTTGTTAAATTCTCCTGTGTACCTTTTAATTAAACCAACCTCTTCCAAAGGTCACATATTTGTGTCCTTTGCCATAGACAGGAGTTACTATATAAGAGATCTGCTGGGAAGTTCATGTTTTCGGACCTACTATGATGCAGGAGATTTACTTGTCACTGATTTTGTATCTTTCAAACTAAGTAAGTTGACAAATTTGTGTAAAACATCAGCTTTGTATGAATCAGCTCTCTGCTTTTGGAATGAGTGTTATGGTAAGAAGGTCTGGCTATCTCATGACCCTTCTCATATAACAACAAACACAAACAAGGACATTCAGTACATGGTAAAATTGTCTCTCTTAACTTTGATGGAAGACAAAGCTACAACTGAAGAGTTGCAGACTCTATCTAGATATATAGTTATGGAGGGCTTTGTCTCTCAACCAGAACTGCCAAAACCTCAAAAAATGCTCTCAAAGTTGCCCACAAAATTAAGGTCAGAGTTGCAGGTTTTCCTCATAAATAGACTCTTCTCCGCAATGAAGAGAATTAGTCAGAGTCCTTTTAATCTTAAGAGGGGTGAAAACTCTTTATCCTGGTCTGGTCTCTTCAATCCACTGTCTGGGAGAGATACAACAGAAATTCAACCCATAATTAATGCATGTTATAATGGTTATTTCAAAAATAAAGAAGAAGAGACAGAGCCTTCTGCTTTATCAGGCATGTATAAGAAAATAATAGAGCTTGAGCATTTAAGACCAGAGACAGACAGATATCTGGGCTGGGATGATCCACAAGATCCTAAAATGCATGAATTTAGTAGAAGTTATCTAAAAGAAGTCTGTAATCATGGAAAGAATTTGCTCCAAAAACTATATGGAAAGAATGTATTAGAACAAATAGACCAAGATATTAGAAGAGAAGTCGGATCTTTGACCCTTGAGAGGCTGGCAACACTTAAAGCAACCAGCAACTTCTCAGAGGATTGGTACATTTACAAGGATGTTAAGGATAAGAATTATACTCGTGATAAAGTTCTAGTTAAAATGACAGAGTATGCTAAGAGAGGCAAGACTTTAGCTATTGAAATGTTTGATGAATGTATGAGTAGCATAGAAGAGAAGGGCTGTATGCATATCTGTCTATTCAAGAAGCAGCAACATGGTGGTTTGAGGGAGATTTATGTCATGGCTGCAGAAGAAAGAATAGTTCAATCTATAGTAGAGTCCATCTCCAAATGCATTGGCAGATTCTTCCCTTCAGACACTTTGTGCAATCCTAGTAATAAGACAAAAATTCCAGAGAGTCATGGTATTAGAGCAAGAAAGCACTGCAAAGGCTCAGTTTGGACAACTGCAACATCAGATGATGCACGGAAGTGGAATCAAGGTCACTTTGTCACAAAGTTTGCTCTAATGCTATGCGAATTCACAAATTCAATGTGGTGGCCGATAATTATACGAGGTTGCTCTATGTTTACTAAGAAAAGAATGATGATGAATTTAGATTTCATGAATATAATAGACAGCAAAAGGGAGTTAGAATTGGAAGATGATTTTGTTATGACACTATACAATGCTTATCATGGAAATCTTACAGTTCCATGGCTAGAAGCTGGTAAGACTTATCTAGAAACTTCCACTGGAATGATGCAGGGCATACTTCACTTCACCTCATCCCTACTACATTCTTTGCATCAAGAATATATTCGATCTCTATCTTTCAAAGTCTTCAATTCCAAAGTTAATCCTGAAATGAGTCTATCTGTTGTTTGTGACATGATGCAAGGATCAGATGATAGCAGTATGCTGATAAGCTTCCCAAGCTCATCAGAAGAGATTGTAGTAAAATGTAAAGTTGCTTCTGCAATATGTTTTAGGATTAAGAAAAATCTTGGCTATTATTTAGGCATTTACCCTTCAGAGAAATCAACTGCTAATACTGATTTTGTGATGGAATATAACTCAGAGTTTTACTTCCATAATCAGCACATACGGCCTACTATAAGATGGATTGCTGCCAGTAATAACTTATCAGAGGCAGAAACATTAGTTGCTAGACAAGAAGAAGCATCCAACCTTGTCACACCTGTTTGTGAGGGAGGAGGATCTTTTTCATTGACAGCAATGATTCAGCAATCTCAATGCACAACACATTATGCTCTGATGGGAATGGGAGTATCTAGCTTATTTCGAGAATACAAAAAAGCAATTCTTAAGTGGTGTGATCCTGGACTTGGTTTTTTCTTACTAGACAACCCTAGAGCAGCTGGCTTGGGAGGATTCAGGTACAACTTGTATAAGGCAATAACTAGAACACAACTCTCAAAAATCTATAGCTTCTTCATGAAGAAGGTTAGAATTGGAGCCTCACCAGATGATCCAAATGAGATTCCTGAAACATGCAGTGTTAGCCCAGGTGGTGCATTAATCTTAAGTTCTTCTCTCAAATGGGGGTCAAGGAAAAAGTTCCAGAAACTAAGAGCTAGGCTAGGAATAGCAGATGACTGGGTAGATCAGATAAACAGGAATCCACATATACTCTATAGAGCTCCTAGAACAGGAGAAGAAATTTTATTAAGAATTGCAGAAAAGGTTCATAGTCCAGGTGTAGTCTCCTCTCTATCAACTGGTAATGCTGTAGCTAAGGTGATGGCATCTTCTGTTTACTTTTTGTCAGCCACTATCTTTGAGGATGCAGGAAGACCAGAGTTTTCATTTATTGAAGATTCAAAGTATTCCCTTCTGTATAAGCTTGCATCATATGAAGGCTACTCTGATTTTGATGAAATTGATCCTGAAGATGTTCTTTTTCTTTTCCCTAATTTAGAGGAATTCTATTCTTTAGATCAATTGATTTTTGACAGAGGGGAGGTAGAAATCATACTGCGATCAAACATGAGAGAAGCAACACAGACCAGAGTCACTGTTTTTGACCATTCTGCTAATGATAAATGCTCTCCTGAGAAATTAGTATCTGATAAGTGGTTTGGCACCCAGAAATGTAGAATAGGAAGGACTGGGATGAATAGAGAGTGGGAAAGACTCAAACTTACAATTAGGTGGTTAAAAGACTCTCCTGAGGAGACTTTGGAATCTTCACCACTTCACAATCATATTCAAATCCGAAATTTCTTTGCCAGAATGGAAGGCAAGGCAAGAACAATAAGAATAACAGGGGCTCCAGTTAAGAAAAGATCTGGTCTAAGCAAACTCTCAATGGTAGTGAGAGATAACTTTACGAAAGTGGGAATACTAGGAGGAATTGAAGATGATCTTGCTATCACAAGATCAGTATCTGTTGATATAGCAAAACACACATTATTCTCCATTTTAAATGGTCCTTATTCAGACGAGACAAAAGCCAGATTTTGCCAGAAGAGCTTGGAGGTGTTGCCTCAGATAGCTCTAAACATGTCAGATAGGAAAACAAGATCCAATGTGGTGGCCTTATTCCAAGAGTACTGCAAAGATTATACTGGGATAATAAAGAAATTAGAGACCCTTGGGGCTGGGACAATAGGAGCTTATATAAAACCTCAAAAGTCAAAAAAGGTCGATAATAGAGTTCAATATTTTGGAGAAGGCATCTGGAGAGGAGTGATGGATGGCTATAGTGTGCAGATCTCAGTTGATTGTAAGGAGGGGCAAATGCCTCAAATCACATCTGTCTGGGTTAGCAAATGCAAAGAGATATGGGTGCTGTCAAAATCTATTAGAGCTTGGTGTGACGACATGGGAGTAAGGAATGACCAAAACTTTAAGCCAACCTATGGAACTTCTCCTAATGGCTGGATCTTCAACTTCCAAATTTATGGATCTGGACATAGGTATGGTGCTCCAATTTATTCTCTCAGAGAGGAAATGGATAATATCCATGACATACAAGATGATCAAATAGGCCTCAAAGTGACAAACAATGTCCTTCGTTTGTATGTGAACCTGCCCAAAATCAAAAGAGACCTGCACATCTTAACATATACTGCTACTGATAATGACATCAGCTCTACTAGTATAATGGAGTTGTCAGCTTATAATATAATGGAAATGATTCCAGAGTTCAGTAAACAACCCAGCAAAAGCTGGTTGCTATGTGATAGTTTGCCCATAAAATTCTTAAAGCCTGTTCTAGATATAACAGAAGGGGTAAGAGTTGTTGAGGGCATTAGACCTGACTTGCTAAAAGAGCTGATAAAAAATTGTACTGAATCTTCTATTAGATCAAAAGTCGGAACTGTGTTTTCAATGGTTCAAACCAGCCAAACATCAGGCCCAGAAATAGACACAAGTGAGATGATAGATTTAATTCTGTCTGAAATGGATGACATAAGTTTTGACGCTGCAGTAACAAGTGTAAACGAATGTTTAGATTTAAGTAATGTCTTATATGATGAGGAATTTGGATCTGTTGATGTTGGCTTATTCGGGCCAGCATATCACAGAGAGATTAGAAATCTAATGACAATATCCCACCCCTTAATGGATACCCTTATAGACACATCTCTATCACAGATGGGGAGGAATGGGATCCGAAGATTAGTAGAAACAGGAAAGTGCTGCCAACGAGACTTAGGCTTGTCTGAATTGATCTACAGAGCTTTAGGAAGGGATCCTTCTAATATAAGAGTAGATATGGTACTAGCTGATGTCATGGATACAGTGGATGATGATGAATTAGGTTAACTGAAATCTTGGCAGTGGTATGGCAGGCTTCTCATTTTGGGAAGCCAAAGCAGTATGATTCTTGGCGGTCTTTGTGT
| 6,676
|
OL774817.1
|
Arumowot virus
|
Ashraf,S., Love,H., Burton,C., Carmichael,S., Filipe,A.D., Roddy,S., Smollett,K., Summers,S., Tong,L., Richards,K.S., Thomson,E.C.
|
University of Glasgow, MRC Centre for Virus Research
|
United Kingdom
|
2022-12-10
| null |
Phlebovirus arumowotense
|
Phlebovirus
|
Phenuiviridae
|
ssRNA(+/-)
| 6,376
|
GenBank
| null |
Kenya
|
Kenya
|
Pelomys isseli
| null |
1972-02
| null | null |
Arumowot virus strain SB3265 segment L, complete sequence
|
ACACAAAGGCGCCAAGAATGAATCAATTGCTATCAAAACAAACCTCACCAAGAGTGGGTTTTTTCTGTAAAGCTATAGGACACCATGACTACTTTGTGGGAAATGTTGTCCTACCCAATTTCCAAGTCAGGAGAGTGATGGATGGGATAGAGATTGATTTGAATCTAGATGACTTGGACACAGCATCTGATCTGGGCTCTTCCTTAAGGCCTTCTTTAACAGTGAGGTCTAACAATGTCCCAAATTTCATACATGACTTTACATTTGGTCATTTGGCAGACACCACTGATAGAGCCTTTTCTTCTGTGTTCCAAGTTGTGAATGATGGCTTTGATGATCTCACACCAGATGTTATTGTTAAAACTCCTTCCGGCAGCTTCCATGTTGTGGAATTTACAACCTTTAGAGGACGACAAGAGGAAGCTAGATTTGCCACTCAAAACAAAATAACAAAATATGAATTAGCTTGCAGAAACAGATCAGTTCAAGGCCCAGTGTCATTGCACACTATTGGGGTGCATAGAGGAGGCCTATGGACCAACATGAAAATTGACCAAAAAGAGGTTGAAGAGCTTTGCTTTAGATTTAGACTCTCGCTAGCTATTGAAGCAGAAATTAAATTGATCTGCCCTGATTTAAGGGAGGTTGACGAAGAGTATTCAAAATTGGAGAGGGAAATATTAGGAATTGTTTCAGGGATTAAAATTGACTGGGATGTTACTCAGTCAGTTTTCCCTTCATTCAAGAGAGAATTGTTTAGAAGATTCTATCAATCTGAGCCTGATCAAGAGTATCTTCAATCCATAATTGATAAAGTCACTAGAAAGTCTCAAGATGATCTCCTAAAATCATCTTTCATTAATCTAACCAACACTCTGCCTGAGAGGTTGATGAGCAACCTCCAAGAATGCGAGAATGCAATTACTGATTTTATTAACAATCATGAATCAAGAGATAATTTAAGGCCAGCAAACTGGAGGAAGGGGACTGTCCTGTTTCCTCCTTGGGTGTTTAGAGAATCAGATGAAGGAAAGAGCTTAACTCCTCTAAAGGATCTAAATGTAGAAGGAGACCATCCTATGTGTAGAATATGGGAAAGAGTCAGGCTATCAGCTCAATTAGAAGAAATTGAAAGAATGGATGATGATCCTGAGAGTGAATTAGAATTTGCACTATCTGGAGAGAGAACTAGAGATGATGAGAGGAGTAAGTATCATAGAGTGAGGGTTGATTTGGACTTGGAAGAAAAGGAGTTTGTGGCTATGCTTGGTATTAATGGGAAAGCCTATAAGGACTGGTCTTCTATTAAGGATAATAGAGAAAAGAGTAAATTAATATTTTCAATTTACCATGATACAACACCGGTTGAAGAATTTTTATACACAGATTCATCTTTAGACATGACTCCAGAAGATGATTTATACGGGCCTTACCTTGAGGATATTGAGCTGAGATTACAAGCTCAAAAGATCCACCAGCCAACTCTATCTAGGAAAGGCTTAAACGAGTTTGTAGAATGTCATCAAGGGATTCTAAAAACTCCCTTAGGATCTTGGTGTCAATTTGTGAATGTTGTAGGCTCGGAGTTATCAGCCTCAGTTAAACAACATGTCAAGCCTAGTAGTTTTGTGGTGAAAAGATTGTTGAATTCTCCTGTGTACCTTTTAATCAAACCAACCTCTTCCAAAGGTCACATATTTGTGTCCTTTGCCATAGATAGGAGTTACTATATAAGAGATCTGCTGGGAAGTTCATGTTTTCGGACCTACTATGATGCAGGAGATTTACTTGTCACTGACTTTGTATCTTTCAAACTAAGTAAGTTGACAAATTTGTGCAAAACATCAGCTTTGTATGAATCAGCTCTCTGCTTTTGGAATGAGTGTTATGGTAAGAAGGTCTGGCTATCTCATGACCCTTCTTATATAACAACAAATACAAACAAGGACATTCAGTACATGGTAAAATTGTCTCTTTTAACTTTGATGGAAGACAAAGCTACAACTGAAGAGTTGCAGACTCTATCTAGATATATAATTATGGAGGGCTTTGTCTCTCAACCAGAACTGCCAAAACCTCAAAAAATGCTCTCAAAGTTGCCCACAAAATTAAGGTCAGAGTTGCAGGTTTTCCTCATAAATAGACTCTTCTCCGCAATGAAGAGAATTAGTCAGAGTCCTTTTAATCTTAAGAGAGGTGAAAACTCTTTATCCTGGTCTGGCCTCTTTAATCCACTGTCTGGGAGAGATACAACAGAAATTCAACCCATAGTTAATGCATGTTATAATGGTTATTTCAAAAATAAAGAAGAAGAGACAGAGCCTTCTGCTTTATCAGGCATGTATAAGAAAATAATAGAACTTGAGCATTTAAGACCAGAAACAGACAGATATCTAGGCTGGGATGATCCGCAAGATCCTAAAATGCATGAATTTAGCAGAAGTTATCTAAAAGAAGTCTGTAATCATGGAAAGAATTTGCTCCAAAAACTATATGGAAAGAATGTATTAGAACAAATAGACCAAGATATTAGAAGAGAAGTCGGATCTCTGACCCTTGAGAGGCTGGCAACACTTAAAGCAACCAGCAACTTTTCAGAGGATTGGTACATTTACAAGGATGTTAAGGATAAGAATTATACTCGTGATAAAGTACTAGTTAAAATGACAGAGTATGCTAAGAGAGGCAAAACTTTAGCTATTGAAATGTTTGATGAATGTATGAGTAGCATAGAAGAGAAGGGCTGTATGCATATCTGTCTATTCAAGAAGCAGCAACATGGTGGTTTGAGGGAGATTTATGTCATGGCTGCAGAAGAAAGAATAGTTCAATCTATAGTAGAGTCCATCTCCAAATGCATTGGCAGATTCTTCCCTTCAGATACTTTGTGCAATCCTAGTAATAAGACAAAAATTCCAGAGAGTCATGGTATTAGAGCAAGAAAGCACTGCAAAGGCTCAGTTTGGACAACTGCAACATCAGATGATGCACGGAAGTGGAATCAAGGTCACTTTGTCACAAAGTTTGCTCTAATGCTTTGCGAATTCACAAATTCAATGTGGTGGCCGATAATTATACGAGGTTGCTCTATGTTTACTAAGAAAAGAATGATGATGAATTTAGATTTCATGAATATAATAGACAGCAGAAGGGAATTAGGATTAGAAGATGATTTTGTTATGACACTATATAATGCTTATCATGGAAATCTTACAGTTCCATGGCTAGAAGCTGGTAAAACTTATCTAGAAACTTCCACTGGAATGATGCAGGGCATACTTCACTTCACCTCATCCCTACTACATTCTTTGCATCAAGAATATATTCGATCTCTATCTTTCAAAGTCTTCAATTCCAAAGTTAATCCTGAAATGAGTTTGTCTGTTGTTTGTGACATGATGCAAGGATCAGATGATAGCAGTATGCTGATAAGCTTCCCAAGCTCATCAGAAGAGATTGTAGTAAAATGTAAAGTTGCTTCTGCAATATGTTTTAGGATTAAGAAAAATCTTGGCTATTATTTAGGCATTTACCCTTCAGAGAAATCAACTGCTAATACTGATTTTGTGATGGAATATAACTCAGAGTTTTACTTCCATAATCAGCACATACGTCCTACTATAAGATGGATTGCTGCCAGTAACAACTTATCAGAGGCAGAAACATTAGTTGCTAGACAAGAAGAAGCATCCAACCTTGTCACACCTGTTTGTGAGGGAGGAGGATCTTTTTCATTAACAGCAATGATTCAACAATCTCAGTGCACAACACATTATGCTCTGATGGGAATGGGAGTATCTAGCTTATTTCGAGAATACAAAAAAGCAATTCTTAAGTGGTGTGATCCTGGACTTGGTTTTTTCTTACTAGACAACCCTAGAGCAGCTGGCTTAGGAGGATTCAGGTACAACTTGTATAAGGCAATAACTAGAACACAACTCTCAAAAATCTATAGCTTCTTCATGAAGAAGGTTAGAATTGGAGCCTCACCAGATGATCCAAATGAGATTCCTGAAACATGCAGCGTTAGCCCAGGTGGTGCATTAATCTTAAGTTCTTCTCTCAAATGGGGGTCAAGGAAAAAGTTCCAGAAACTAAGAGCTAGGCTAGGAATAGCAGATGACTGGGTAGATCAGATAAACAGGAATCCACATATACTCTATAGAGCTCCTAGAACAGGAGAAGAAATTTTATTAAGAATTGCAGAAAAGGTTCATAGTCCAGGTGTAGTCTCCTCTCTATCAACTGGTAATGCTGTAGCTAAAGTGATGGCATCTTCTGTTTACTTCTTGTCAGCCACTATCTTTGAGGATGCAGGAAGACCAGAGTTTTCATTTATTGAAGATTCAAAGTACTCCCTTCTGTATAAGCTTGCATCATATGAAGGCTACTCTGATTTTGATGAAATAGATCCTGAAGATGTTCTTTTTCTTTTCCCCAATTTAGAGGAATTCTATTCTTTAGATCAATTGATTTTTGACAGAGGGGAGGTAGAAATCATATTGCGATCAAACATGAGAGAAGCAACACAGACCAGAGTTACTGTTTTTGACCATTCTGCCAATGATAAATGCTCTCCCGAGAAATTAGTATCTGATAAGTGGTTTGGTACCCAGAAGTGTAGAATAGGAAGAACTGGGATGAATAGAGAGTGGGAAAGACTCAAACTTACAATTAGGTGGTTAAAAGACTCTCCTGAGGAGACTTTGGAATCTTCACCACTTCACAATCATATTCAAATCCGAAATTTCTTTGCCAGAATGGAAGGCAAGGCAAGAACAATAAGAATAACAGGGGCTCCAGTTAAGAAAAGATCTGGCCTAAGTAAACTCTCAATGGTAGTGAGAGATAACTTTACGAAGGTAGGAATACTAGGAGGAATTGAAGATGATCTTGCTATTACAAGATCAGTATCTGTTGATATAGCAAAACACACATTATTCTCCATTTTAAATGGTCCTTATTCAGACGAGACAAAAGCCAGATTTTGCCAGAAGAGCTTGGAGGTGTTGCCTCAGATAGCTCTAAACATGTCAGATAGGAAAACAAGATCCAATGTGGTGGCCTTATTTCAAGAGTATTGCAAAGATTATACTGGGATAATAAAGAAATTAGAGACCCTTGGGGCTGGGACAATAGGAGCTTATATAAAACCTCAAAAGTCAAAAAAGGTTGATAATAGAGTTCAGTATTTTGGAGAAGGCATCTGGAGAGGAGTGATGGATGGCTATAGTGTGCAGATCTCAGTTGATTGTAAGGAGGGGCAAATGCCTCAAATCACATCTGTCTGGGTTAGCAAATGCAAAGAGATATGGGTGCTGTCAAAATCTATTAGAGCTTGGTGTGACGACATGGGAGTGAGGAATGACCAAAACATTAAGCCAACCTATGGAACTTCTCCTAATGGCTGGATCTTCAACTTCCAAATTTATGGGTCTGGACATAGGTATGGTGCTCCAATTTATTCTCTCAGAGAGGAAATGGATAATATTCATGACATACAAGATGATCAAATAGGCCTCAAAGTGACAAACAATGTCCTTCGTTTGTATGTGAACCTGCCCAAAATCAAAAGAGACCTGCACATCTTAACATATACTGCTACTGATAATGACATCAGCTCTACTAGTATAATGGAGCTGTCAGCTTATAATATAATGGAAATGATTCCAGAGTTCAGTAAACAACCCAGCAAAAGCTGGTTGCTATGTGATAGTCTGCCCATAAAATTCTTAAAGCCTGTTCTAGATATAACAGAAGGGGTGAGAGTTGTTGAGGGCATTAGACCTGACTTGCTGAAAGAGCTGATAAAAAATTGCACTGAATCTTCTATTAGATCAAAAGTCGGAACTGTGTTTTCAATGGTTCAAACCAGCCAAACATCAGGCCCAGAAATAGACACAAGTGAGATGATAGATTTAATTCTGTCTGAAATGGATGACATAAGTTTTGACGCTGCAGTAACAAGTGTGAATGAATGTTTAGATTTAAGTAATGTCTTATATGATGAGGAATTTGGATCTGTTGATGTTGGCTTATTTGGGCCAGCATATCACAGAGAGATTAGAAATCTAATGACAATATCCCACCCCTTAATGGATACCCTTATAGATACATCTCTATCACAGATGGGGAGGAATGGGATCCGAAGATTAGTAGAAACAGGAAAGTGCTGCCAACGAGACTTAGGCTTGTCTGAATTGATCTACAGAGCTTTAGGAAGGGATCCTTCTAATATAAGAGTAGATGTGGTACTAGCTGATGTCATGGATACAGTGGATGATGATGAATTAGGTTAACTGAATTCTTGACAGTGGTATGGCAGGCTTCTCATTTTGGGAAGCCAAAGCAGTATGATTCTTGGCGGTCTTTGTGT
| 21,241
|
OL774820.1
|
Arumowot virus
|
Ashraf,S., Love,H., Burton,C., Carmichael,S., Filipe,A.D., Roddy,S., Smollett,K., Summers,S., Tong,L., Richards,K.S., Thomson,E.C.
|
University of Glasgow, MRC Centre for Virus Research
|
United Kingdom
|
2022-12-10
| null |
Phlebovirus arumowotense
|
Phlebovirus
|
Phenuiviridae
|
ssRNA(+/-)
| 6,376
|
GenBank
| null |
Kenya
|
Kenya
|
Otomys tropicalis
| null |
1972-02
| null | null |
Arumowot virus strain SB3176 segment L, complete sequence
|
ACACAAAGGCGCCAAGAATGAATCAATTGCTATCAAAACAAACCTCACCAAGAGTGGGTTTTTTCTGTAAAGCTATAGGACACCATGACTACTTTGTGGGAAATGTTGTCCTACCCAATTTCCAAGTCAGGAGAGTGATGGATGGGATAGAGATTGATTTGAATCTAGATGACTTGGACACAGCATCTGATCTGGGCTCTTCCTTAAGGCCTTCTTTAACAGTGAGGTCTAACAATGTCCCAAATTTCATACATGACTTTACATTTGGTCATTTGGCAGACACCACTGATAGAGCCTTTTCTTCTGTGTTCCAAGTTGTGAATGATGGCTTTGATGATCTCACACCAGATGTTATTGTTAAAACTCCTTCCGGCAGCTTCCATGTTGTGGAATTTACAACCTTTAGAGGACGACAAGAGGAAGCTAGATTTGCCACTCAAAACAAAATAACAAAATATGAATTAGCTTGCAGAAACAGATCAGTTCAAGGCCCAGTGTCATTGCACACTATTGGGGTGCATAGAGGAGGCCTATGGACCAACATGAAAATTGACCAAAAAGAGGTTGAAGAGCTTTGCTTTAGATTTAGACTCTCGCTAGCTATTGAAGCAGAAATTAAATTGATCTGCCCTGATTTAAGGGAGGTTGACGAAGAGTATTCAAAATTGGAGAGGGAAATATTAGGAATTGTTTCAGGGATTAAAATTGACTGGGATGTTACTCAGTCAGTTTTCCCTTCATTCAAGAGAGAATTGTTTAGAAGATTCTATCAATCTGAGCCTGATCAAGAGTATCTTCAATCCATAATTGATAAAGTCACTAGAAAGTCTCAAGATGATCTCCTAAAATCATCTTTCATTAATCTAACCAACACTCTGCCTGAGAGGTTGATGAGCAACCTCCAAGAATGCGAGAATGCAATTACTGATTTTATTAACAATCATGAATCAAGAGATAATTTAAGGCCAGCAAACTGGAGGAAGGGGACTGTCCTGTTTCCTCCTTGGGTGTTTAGAGAATCAGATGAAGGAAAGAGCTTAACTCCTCTAAAGGATCTAAATGTAGAAGGAGACCATCCTATGTGTAGAATATGGGAAAGAGTCAGGCTATCAGCTCAATTAGAAGAAATTGAAAGAATGGATGATGATCCTGAGAGTGAATTAGAATTTGCACTATCTGGAGAGAGAACTAGAGATGATGAGAGGAGTAAGTATCATAGAGTGAGGGTTGATTTGGACTTGGAAGAAAAGGAGTTTGTGGCTATGCTTGGTATTAATGGGAAAGCCTATAAGGACTGGTCTTCTATTAAGGATAATAGAGAAAAGAGTAAATTAATATTTTCAATTTACCATGATACAACACCGGTTGAAGAATTTTTATACACAGATTCATCTTTAGACATGACTCCAGAAGATGATTTATACGGGCCTTACCTTGAGGATATTGAGCTGAGATTACAAGCTCAAAAGATCCACCAGCCAACTCTATCTAGGAAAGGCTTAAACGAGTTTGTAGAATGTCATCAAGGGATTCTAAAAACTCCCTTAGGATCTTGGTGTCAATTTGTGAATGTTGTAGGCTCGGAGTTATCAGCCTCAGTTAAACAACATGTCAAGCCTAGTAGTTTTGTGGTGAAAAGATTGTTGAATTCTCCTGTGTACCTTTTAATCAAACCAACCTCTTCCAAAGGTCACATATTTGTGTCCTTTGCCATAGATAGGAGTTACTATATAAGAGATCTGCTGGGAAGTTCATGTTTTCGGACCTACTATGATGCAGGAGATTTACTTGTCACTGACTTTGTATCTTTCAAACTAAGTAAGTTGACAAATTTGTGCAAAACATCAGCTTTGTATGAATCAGCTCTCTGCTTTTGGAATGAGTGTTATGGTAAGAAGGTCTGGCTATCTCATGACCCTTCTTATATAACAACAAATACAAACAAGGACATTCAGTACATGGTAAAATTGTCTCTTTTAACTTTGATGGAAGACAAAGCTACAACTGAAGAGTTGCAGACTCTATCTAGATATATAATTATGGAGGGCTTTGTCTCTCAACCAGAACTGCCAAAACCTCAAAAAATGCTCTCAAAGTTGCCCACAAAATTAAGGTCAGAGTTGCAGGTTTTCCTCATAAATAGACTCTTCTCCGCAATGAAGAGAATTAGTCAGAGTCCTTTTAATCTTAAGAGAGGTGAAAACTCTTTATCCTGGTCTGGCCTCTTTAATCCACTGTCTGGGAGAGATACAACAGAAATTCAACCCATAGTTAATGCATGTTATAATGGTTATTTCAAAAATAAAGAAGAAGAGACAGAGCCTTCTGCTTTATCAGGCATGTATAAGAAAATAATAGAACTTGAGCATTTAAGACCAGAAACAGACAGATATCTAGGCTGGGATGATCCGCAAGATCCTAAAATGCATGAATTTAGCAGAAGTTATCTAAAAGAAGTCTGTAATCATGGAAAGAATTTGCTCCAAAAACTATATGGAAAGAATGTATTAGAACAAATAGACCAAGATATTAGAAGAGAAGTCGGATCTCTGACCCTTGAGAGGCTGGCAACACTTAAAGCAACCAGCAACTTTTCAGAGGATTGGTACATTTACAAGGATGTTAAGGATAAGAATTATACTCGTGATAAAGTACTAGTTAAAATGACAGAGTATGCTAAGAGAGGCAAAACTTTAGCTATTGAAATGTTTGATGAATGTATGAGTAGCATAGAAGAGAAGGGCTGTATGCATATCTGTCTATTCAAGAAGCAGCAACATGGTGGTTTGAGGGAGATTTATGTCATGGCTGCAGAAGAAAGAATAGTTCAATCTATAGTAGAGTCCATCTCCAAATGCATTGGCAGATTCTTCCCTTCAGATACTTTGTGCAATCCTAGTAATAAGACAAAAATTCCAGAGAGTCATGGTATTAGAGCAAGAAAGCACTGCAAAGGCTCAGTTTGGACAACTGCAACATCAGATGATGCACGGAAGTGGAATCAAGGTCACTTTGTCACAAAGTTTGCTCTAATGCTTTGCGAATTCACAAATTCAATGTGGTGGCCGATAATTATACGAGGTTGCTCTATGTTTACTAAGAAAAGAATGATGATGAATTTAGATTTCATGAATATAATAGACAGCAGAAGGGAATTAGGATTAGAAGATGATTTTGTTATGACACTATATAATGCTTATCATGGAAATCTTACAGTTCCATGGCTAGAAGCTGGTAAAACTTATCTAGAAACTTCCACTGGAATGATGCAGGGCATACTTCACTTCACCTCATCCCTACTACATTCTTTGCATCAAGAATATATTCGATCTCTATCTTTCAAAGTCTTCAATTCCAAAGTTAATCCTGAAATGAGTTTGTCTGTTGTTTGTGACATGATGCAAGGATCAGATGATAGCAGTATGCTGATAAGCTTCCCAAGCTCATCAGAAGAGATTGTAGTAAAATGTAAAGTTGCTTCTGCAATATGTTTTAGGATTAAGAAAAATCTTGGCTATTATTTAGGCATTTACCCTTCAGAGAAATCAACTGCTAATACTGATTTTGTGATGGAATATAACTCAGAGTTTTACTTCCATAATCAGCACATACGTCCTACTATAAGATGGATTGCTGCCAGTAACAACTTATCAGAGGCAGAAACATTAGTTGCTAGACAAGAAGAAGCATCCAACCTTGTCACACCTGTTTGTGAGGGAGGAGGATCTTTTTCATTAACAGCAATGATTCAACAATCTCAGTGCACAACACATTATGCTCTGATGGGAATGGGAGTATCTAGCTTATTTCGAGAATACAAAAAAGCAATTCTTAAGTGGTGTGATCCTGGACTTGGTTTTTTCTTACTAGACAACCCTAGAGCAGCTGGCTTAGGAGGATTCAGGTACAACTTGTATAAGGCAATAACTAGAACACAACTCTCAAAAATCTATAGCTTCTTCATGAAGAAGGTTAGAATTGGAGCCTCACCAGATGATCCAAATGAGATTCCTGAAACATGCAGCGTTAGCCCAGGTGGTGCATTAATCTTAAGTTCTTCTCTCAAATGGGGGTCAAGGAAAAAGTTCCAGAAACTAAGAGCTAGGCTAGGAATAGCAGATGACTGGGTAGATCAGATAAACAGGAATCCACATATACTCTATAGAGCTCCTAGAACAGGAGAAGAAATTTTATTAAGAATTGCAGAAAAGGTTCATAGTCCAGGTGTAGTCTCCTCTCTATCAACTGGTAATGCTGTAGCTAAAGTGATGGCATCTTCTGTTTACTTCTTGTCAGCCACTATCTTTGAGGATGCAGGAAGACCAGAGTTTTCATTTATTGAAGATTCAAAGTACTCCCTTCTGTATAAGCTTGCATCATATGAAGGCTACTCTGATTTTGATGAAATAGATCCTGAAGATGTTCTTTTTCTTTTCCCCAATTTAGAGGAATTCTATTCTTTAGATCAATTGATTTTTGACAGAGGGGAGGTAGAAATCATATTGCGATCAAACATGAGAGAAGCAACACAGACCAGAGTTACTGTTTTTGACCATTCTGCCAATGATAAATGCTCTCCCGAGAAATTAGTATCTGATAAGTGGTTTGGTACCCAGAAGTGTAGAATAGGAAGAACTGGGATGAATAGAGAGTGGGAAAGACTCAAACTTACAATTAGGTGGTTAAAAGACTCTCCTGAGGAGACTTTGGAATCTTCACCACTTCACAATCATATTCAAATCCGAAATTTCTTTGCCAGAATGGAAGGCAAGGCAAGAACAATAAGAATAACAGGGGCTCCAGTTAAGAAAAGATCTGGCCTAAGTAAACTCTCAATGGTAGTGAGAGATAACTTTACGAAGGTAGGAATACTAGGAGGAATTGAAGATGATCTTGCTATTACAAGATCAGTATCTGTTGATATAGCAAAACACACATTATTCTCCATTTTAAATGGTCCTTATTCAGACGAGACAAAAGCCAGATTTTGCCAGAAGAGCTTGGAGGTGTTGCCTCAGATAGCTCTAAACATGTCAGATAGGAAAACAAGATCCAATGTGGTGGCCTTATTTCAAGAGTATTGCAAAGATTATACTGGGATAATAAAGAAATTAGAGACCCTTGGGGCTGGGACAATAGGAGCTTATATAAAACCTCAAAAGTCAAAAAAGGTTGATAATAGAGTTCAGTATTTTGGAGAAGGCATCTGGAGAGGAGTGATGGATGGCTATAGTGTGCAGATCTCAGTTGATTGTAAGGAGGGGCAAATGCCTCAAATCACATCTGTCTGGGTTAGCAAATGCAAAGAGATATGGGTGCTGTCAAAATCTATTAGAGCTTGGTGTGACGACATGGGAGTGAGGAATGACCAAAACATTAAGCCAACCTATGGAACTTCTCCTAATGGCTGGATCTTCAACTTCCAAATTTATGGGTCTGGACATAGGTATGGTGCTCCAATTTATTCTCTCAGAGAGGAAATGGATAATATTCATGACATACAAGATGATCAAATAGGCCTCAAAGTGACAAACAATGTCCTTCGTTTGTATGTGAACCTGCCCAAAATCAAAAGAGACCTGCACATCTTAACATATACTGCTACTGATAATGACATCAGCTCTACTAGTATAATGGAGCTGTCAGCTTATAATATAATGGAAATGATTCCAGAGTTCAGTAAACAACCCAGCAAAAGCTGGTTGCTATGTGATAGTCTGCCCATAAAATTCTTAAAGCCTGTTCTAGATATAACAGAAGGGGTGAGAGTTGTTGAGGGCATTAGACCTGACTTGCTGAAAGAGCTGATAAAAAATTGCACTGAATCTTCTATTAGATCAAAAGTCGGAACTGTGTTTTCAATGGTTCAAACCAGCCAAACATCAGGCCCAGAAATAGACACAAGTGAGATGATAGATTTAATTCTGTCTGAAATGGATGACATAAGTTTTGACGCTGCAGTAACAAGTGTGAATGAATGTTTAGATTTAAGTAATGTCTTATATGATGAGGAATTTGGATCTGTTGATGTTGGCTTATTTGGGCCAGCATATCACAGAGAGATTAGAAATCTAATGACAATATCCCACCCCTTAATGGATACCCTTATAGATACATCTCTATCACAGATGGGGAGGAATGGGATCCGAAGATTAGTAGAAACAGGAAAGTGCTGCCAACGAGACTTAGGCTTGTCTGAATTGATCTACAGAGCTTTAGGAAGGGATCCTTCTAATATAAGAGTAGATGTGGTACTAGCTGATGTCATGGATACAGTGGATGATGATGAATTAGGTTAACTGAATTCTTGACAGTGGTATGGCAGGCTTCTCATTTTGGGAAGCCAAAGCAGTATGATTCTTGGCGGTCTTTGTGT
| 21,242
|
OL774823.1
|
Arumowot virus
|
Ashraf,S., Love,H., Burton,C., Carmichael,S., Filipe,A.D., Roddy,S., Smollett,K., Summers,S., Tong,L., Richards,K.S., Thomson,E.C.
|
University of Glasgow, MRC Centre for Virus Research
|
United Kingdom
|
2022-12-10
| null |
Phlebovirus arumowotense
|
Phlebovirus
|
Phenuiviridae
|
ssRNA(+/-)
| 6,375
|
GenBank
| null |
Kenya
|
Kenya
| null | null |
1973-03
| null | null |
Arumowot virus strain SC707 segment L, complete sequence
|
CACAAAGGCGCCAAGAATGAATCAATTGCTATCAAAACAAACCTCACCAAGAGTGGGTTTTTTCTGTAAAGCTATAGGACACCATGACTACTTTGTGGGAAATGTTGTCCTACCCAATTTCCAAGTCAGGAGAGTAATGGATGGGATAGAGATTGATTTGAATCTAGATGACTTGGACACAGCATCTGATCTGGGCTCTTCCTTAAGGCCTTCTTTAACAGTGAGGTCTAACAATGTCCCAAATTTCATACATGACTTTACATTTGGTCATTTGGCAGACACCACTGATAGAGCCTTTTCTTCTGTGTTCCAAGTTGTGAATGATGGCTTTGATGATCTGACACCAGATGTTATTGTTAAAACTCCTTCCGGCAGCTTCCATGTTGTGGAATTTACAACCTTTAGAGGACGACAAGAGGAAGCTAGATTTGCCACTCAAAACAAAATAACAAAATATGAATTAGCTTGCAGAAACAGATCAGTTCAAGGCCCAGTGTCATTGCACACTATTGGGGTGCATAGAGGAGGCCTATGGACCAACATGAAAATTGACCAGAAAGAGGTTGAAGAGCTTTGCTTTAGATTTAGACTCTCGCTAGCTATTGAAGCAGAAATTAAATTGATCTGCCCTGATTTAAGGGAGGTTGACGAAGAGTATTCAAAATTAGAGAGGGAAATATTAGGAATTGTTTCAGGGATTAAAATTGACTGGGATGTTACTCAGTCAGTTTTCCCTTCATTCAAGAGAGAATTGTTTAGAAGATTCTATCAATCTGAGCCTGATCAAGAGTATCTTCAATCCATAATTGATAAAGTCACTAGAAAGTCTCAAGATGATCTCCTAAAATCATCTTTCATTAATCTAACCAACACTCTGCCTGAGAGGTTGATGAGCAACCTCCAAGAATGCGAGAATGCAATTACTGATTTTATTAACAATCATGAATCAAGAGATAATTTAAGGCCAGCAAACTGGAGGAAGGGGACTGTCCTGTTTCCTCCTTGGGTGTTTAGAGAATCAGATGAAGGAAAGAGCTTAACTCCTCTAAAGGATCTAAATGTAGAAGGAGACCATCCTATGTGTAGAATATGGGAAAGAGTCAGGCTATCAGCTCAATTAGAAGAAATTGAAAGAATGGATGATGATCCTGAGAGTGAATTAGAATTTGCACTATCTGGAGAGAGAACTAGAGATGATGAGAGGAGCAAGTATCATAGAGTGAGGGTTGATTTGGACTTGGAAGAAAAGGAGTTTGTGGCTATGCTTGGTATTAATGGGAAAGCCTATAAGGACTGGTCTTCTATTAAGGATAATAGAGAAAAGAGTAAATTAATATTTTCAATTTACCATGATACAACACCGGTTGAAGAATTTTTATACACAGATTCATCTTTAGACATGACTCCAGAAGATGATTTATACGGGCCTTACCTTGAGGATATTGAGCTGAGATTACAAGCTCAAAAGATCCACCAGCCAACTCTATCTAGGAAAGGCTTAAACGAGTTTGTAGAATGTCATCAAGGGATTCTAAAAACTCCCTTAGGATCTTGGTGTCAATTTGTGAATGTTGTAGGCTCGGAGTTATCAGCCTCAGTTAAACAACATGTCAAGCCTAATAGTTTTGTGGTGAAAAGATTGTTGAATTCTCCTGTGTACCTTTTAATTAAACCAACCTCTTCCAAAGGTCACATATTTGTGTCCTTTGCCATAGATAGGAGTTACTATATAAGAGATCTGCTGGGAAGTTCATGTTTTCGGACCTACTATGATGCAGGAGATTTACTTGTCACTGACTTTGTATCTTTCAAACTAAGTAAGTTGACAAATTTGTGCAAAACATCAGCTTTGTATGAATCAGCTCTCTGCTTTTGGAATGAGTGTTATGGTAAGAAGGTCTGGCTATCTCATGACCCTTCTTATATAACAACAAATACAAACAAGGACATTCAGTACATGGTAAAATTGTCTCTTTTAACTTTGATGGAAGACAAAGCTACAACTGAAGAGTTGCAGACTCTATCTAGATATATAGTTATGGAGGGCTTTGTCTCTCAACCAGAACTGCCAAAACCTCAAAAAATGCTCTCAAAGTTGCCCACAAAATTAAGGTCAGAGTTGCAGGTTTTCCTCATAAATAGACTCTTCTCCGCAATGAAGAGAATTAGTCAGAGTCCTTTTAATCTTAAGAGAGGTGAAAACTCTTTGTCCTGGTCTGGCCTCTTTAATCCACTGTCTGGGAGAGATACAATAGAAATTCAACCCATAGTTAATGCATGTTATAATGGTTATTTCAAAAATAAAGAAGAAGAGACAGAGCCTTCTGCTTTATCAGGCATGTACAAGAAAATAATAGAACTTGAGCATTTAAGACCAGAGACAGACAGATATCTAGGCTGGGATGATCCGCAAGATCCTAAAATGCATGAATTTAGCAGAAGTTATCTAAAAGAAGTCTGTAATCATGGAAAGAATTTGCTCCAAAAACTATATGGAAAGAATGTATTAGAACAAATAGACCAAGATATTAGAAGAGAAGTCGGATCTTTGACCCTTGAGAGGCTGGCAACACTTAAAGCAACCAGCAACTTCTCAGAGGATTGGTACATTTACAAGGATGTTAAGGATAAGAATTATACTCGTGATAAAGTTCTGGTTAAAATGACAGAGTATGCTAAGAGAGGCAAAACTTTAGCTATTGAAATGTTTGATGAATGTATGAGTAGCATAGAAGAGAAGGGCTGTATGCATATCTGTCTATTCAAGAAGCAGCAACATGGTGGTTTGAGGGAGATTTATGTCATGGCTGCAGAAGAAAGAATAGTTCAATCTATAGTAGAGTCCATCTCCAAATGCATTGGCAGATTCTTCCCTTCAGATACTTTGTGCAATCCTAGTAATAAGACAAAAATTCCAGAGAGTCATGGTATTAGAGCAAGAAAGCACTGCAAAGGCTCAGTTTGGACAACTGCAACATCAGATGATGCACGGAAGTGGAATCAAGGTCACTTTGTCACAAAGTTTGCTCTAATGCTTTGCGAATTCACAAATTCAATGTGGTGGCCGATAATTATACGAGGTTGCTCTATGTTTACTAAGAAAAGAATGATGATGAATTTAGATTTCATGAATATAATAGACAGCAGAAGGGAATTAGAATTAGAAGATGATTTTGTTATGACACTATATAATGCTTATCATGGAAATCTTACAGTTCCATGGCTAGAAGCTGGTAAAACTTATCTAGAAACTTCCACTGGAATGATGCAGGGCATACTTCACTTCACCTCATCCCTACTACATTCTTTGCATCAAGAATATATTCGATCTCTATCTTTCAAAGTCTTCAATTCCAAAGTTAATCCTGAAATGAGTTTGTCTGTTGTTTGTGATATGATGCAAGGATCAGATGATAGCAGTATGCTGATAAGCTTCCCAAGCTCATCAGAAGAGATTGTAGTAAAATGTAAAGTTGCTTCTGCAATATGTTTTAGGATTAAGAAAAATCTTGGCTATTATTTAGGCATTTACCCTTCAGAGAAATCTACTGCTAATACTGATTTTGTGATGGAATATAACTCAGAGTTTTACTTCCATAATCAGCACATACGTCCTACTATAAGATGGATTGCTGCCAGTAACAACTTATCAGAGGCAGAAACATTAGTTGCTAGACAAGAAGAAGCATCCAACCTTGTCACACCTGTTTGTGAGGGAGGAGGATCTTTTTCATTAACAGCAATGATTCAACAATCTCAGTGCACAACACATTATGCTCTGATGGGAATGGGAGTATCTAGCTTATTTCGAGAATACAAAAAAGCAATTCTTAAGTGGTGTGATCCTGGACTTGGTTTTTTCTTACTAGACAACCCTAGAGCAGCTGGCTTAGGAGGATTCAGGTACAACTTGTATAAGGCAATAACTAGAACACAACTCTCAAAAATCTATAGCTTCTTCATGAAGAAGGTTAGAATTGGAGCCTCACCAGATGATCCAAATGAGATTCCTGAAACATGCAGCGTTAGCCCAGGTGGTGCATTAATCTTAAGTTCTTCTCTCAAATGGGGGTCAAGGAAAAAGTTCCAGAAGCTAAGAGCTAGGCTAGGAATAGCAGATGACTGGGTAGATCAGATAAACAGGAATCCACATATACTCTATAGAGCTCCTAGAACAGGAGAAGAAATTTTATTAAGAATTGCAGAAAAGGTTCATAGTCCAGGTGTAGTCTCCTCTCTATCAACTGGTAATGCTGTAGCTAAAGTGATGGCATCTTCTGTTTACTTCTTGTCAGCCACTATCTTTGAGGATGCAGGAAGACCAGAGTTTTCATTTATTGAAGATTCAAAGTACTCCCTTCTGTATAAGCTTGCATCATATGAAGGCTACTCTGATTTTGATGAAATAGATCCTGAAGATGTTCTTTTTCTTTTCCCCAATTTAGAGGAATTCTATTCTTTAGATCAATTGATTTTTGACAGAGGGGAGGTAGAAATCATATTGCGATCAAACATGAGAGAAGCAACACAGACCAGAGTTACTGTTTTTGACCATTCTGCCAATGATAAATGCTCTCCTGAGAAATTAGTATCTGATAAGTGGTTTGGTACCCAGAAGTGTAGAATAGGAAGAACTGGGATGAATAGAGAGTGGGAAAGACTCAAACTTACAATTAGGTGGTTAAAAGACTCTCCTGAGGAGACTTTGGAATCTTCACCACTTCACAATCATATTCAAATCCGAAATTTCTTTGCCAGAATGGAAGGCAAGGCAAGAACAATAAGAATAACAGGGGCTCCAGTTAAGAAAAGATCTGGTCTAAGTAAACTCTCAATGGTAGTGAGAGATAACTTTACGAAGGTAGGAATACTAGGAGGAATTGAAGATGATCTTGCTATTACAAGATCAGTATCTGTTGATATAGCAAAACACACATTATTCTCCATTTTAAATGGTCCTTATTCAGACGAGACAAAAGCCAGATTTTGCCAGAAGAGCTTGGAGGTGTTGCCTCAGATAGCTCTAAACATGTCTGATAGGAAAACAAGATCCAATGTGGTGGCCTTATTTCAAGAGTATTGCAAAGATTATACTGGGATAATAAAGAAATTAGAGACCCTTGGGGCTGGGACAATAGGAGCTTATATAAAACCTCAAAAGTCAAAAAAGGTTGATAATAGAGTTCAGTATTTTGGAGAAGGCATCTGGAGAGGAGTGATGGATGGCTATAGTGTGCAGATCTCAGTTGATTGTAAGGAGGGGCAAATGCCTCAAATCACATCTGTCTGGGTTAGCAAATGCAAAGAGATATGGGTGCTGTCAAAATCTATTAGAGCTTGGTGTGACGACATGGGAGTGAGGAATGACCAAAACGTTAAGCCAACCTATGGAACTTCTCCTAATGGCTGGATCTTCAACTTCCAAATTTATGGGTCTGGACATAGGTATGGTGCTCCAATTTATTCTCTCAGAGAGGAAATGGATAATATCCATGACATACAAGATGATCAAATAGGCCTCAAAGTGACAAACAATGTCCTTCGTTTGTATGTGAACCTGCCCAAAATCAAAAGAGACCTGCACATCTTAACATATACTGCTACTGATAATGACATCAGCTCTACTAGTATAATGGAGCTATCAGCTTATAATATAATGGAAATGATTCCAGAGTTCAGTAAACAACCCAGCAAAAGCTGGTTGCTATGTGATAGTCTGCCCATAAAATTCTTAAAGCCTGTTCTAGATATAACAGAAGGGGTGAGAGTTGTTGAGGGCATTAGACCTGACTTGCTGAAAGAGCTGATAAAAAATTGCACTGAATCTTCTATTAGATCAAAGGTCGGAACTGTGTTTTCAATGGTTCAAACCAGCCAAACATCAGGCCCAGAAATAGACACAAGTGAGATGATAGATTTAATTCTGTCTGAAATGGATGACATAAGTTTTGACACTGCAGTAACAAGTGTGAATGAATGTTTAGATTTAAGTAATGTCTTATATGATGAGGAATTTGGATCTGTTGATATTGGCTTATTTGGGCCAGCATATCACAGAGAGATTAGAAATCTAATGACAATATCTCACCCCTTAATGGATACCCTTATAGATACATCTCTATCACAGATGGGGAGGAATGGGATCCGAAGATTAGTGGAAACAGGAAAGTGCTGCCAACGAGACTTAGGCTTGTCTGAATTGATCTACAGAGCTTTAGGAAGGGATCCTTCTAATATAAGAGTAGATGTGGTACTAGCTGATGTCATGGATACAGTGGATGATGATGAATTAGGTTAACTGAATTCTTGACAGTGGTATGGCAGGCTTCTCATTTTGGGAAGCCAAAGCAGTATGATTCTTGGCGGTCTTTGTGT
| 21,243
|
OL774826.1
|
Arumowot virus
|
Ashraf,S., Love,H., Burton,C., Carmichael,S., Filipe,A.D., Roddy,S., Smollett,K., Summers,S., Tong,L., Richards,K.S., Thomson,E.C.
|
University of Glasgow, MRC Centre for Virus Research
|
United Kingdom
|
2022-12-10
| null |
Phlebovirus arumowotense
|
Phlebovirus
|
Phenuiviridae
|
ssRNA(+/-)
| 6,369
|
GenBank
| null |
Kenya
|
Kenya
| null | null |
1973-03
| null | null |
Arumowot virus strain SC680 segment L, complete sequence
|
GGCGCCAAGAATGAATCAATTGCTATCAAAACAAACCTCACCAAGAGTGGGTTTTTTCTGTAAAGCTATAGGACACCATGACTACTTTGTGGGAAATGTTGTCCTACCCAATTTCCAAGTCAGGAGAGTAATGGATGGGATAGAGATTGATTTGAATCTAGATGACTTGGACACAGCATCTGATCTGGGCTCTTCCTTAAGGCCTTCTTTAACAGTGAGGTCTAACAATGTCCCAAATTTCATACATGACTTTACATTTGGTCATTTGGCAGACACCACTGATAGAGCCTTTTCTTCTGTGTTCCAAGTTGTGAATGATGGCTTTGATGATCTGACACCAGATGTTATTGTTAAAACTCCTTCCGGCAGCTTCCATGTTGTGGAATTTACAACCTTTAGAGGACGACAAGAGGAAGCTAGATTTGCCACTCAAAACAAAATAACAAAATATGAATTAGCTTGCAGAAACAGATCAGTTCAAGGCCCAGTGTCATTGCACACTATTGGGGTGCATAGAGGAGGCCTATGGACCAACATGAAAATTGACCAGAAAGAGGTTGAAGAGCTTTGCTTTAGATTTAGACTCTCGCTAGCTATTGAAGCAGAAATTAAATTGATCTGCCCTGATTTAAGGGAGGTTGACGAAGAGTATTCAAAATTAGAGAGGGAAATATTAGGAATTGTTTCAGGGATTAAAATTGACTGGGATGTTACTCAGTCAGTTTTCCCTTCATTCAAGAGAGAATTGTTTAGAAGATTCTATCAATCTGAGCCTGATCAAGAGTATCTTCAATCCATAATTGATAAAGTCACTAGAAAGTCTCAAGATGATCTCCTAAAATCATCTTTCATTAATCTAACCAACACTCTGCCTGAGAGGTTGATGAGCAACCTCCAAGAATGCGAGAATGCAATTACTGATTTTATTAACAATCATGAATCAAGAGATAATTTAAGGCCAGCAAACTGGAGGAAGGGGACTGTCCTGTTTCCTCCTTGGGTGTTTAGAGAATCAGATGAAGGAAAGAGCTTAACTCCTCTAAAGGATCTAAATGTAGAAGGAGACCATCCTATGTGTAGAATATGGGAAAGAGTCAGGCTATCAGCTCAATTAGAAGAAATTGAAAGAATGGATGATGATCCTGAGAGTGAATTAGAATTTGCACTATCTGGAGAGAGAACTAGAGATGATGAGAGGAGCAAGTATCATAGAGTGAGGGTTGATTTGGACTTGGAAGAAAAGGAGTTTGTGGCTATGCTTGGTATTAATGGGAAAGCCTATAAGGACTGGTCTTCTATTAAGGATAATAGAGAAAAGAGTAAATTAATATTTTCAATTTACCATGATACAACACCGGTTGAAGAATTTTTATACACAGATTCATCTTTAGACATGACTCCAGAAGATGATTTATACGGGCCTTACCTTGAGGATATTGAGCTGAGATTACAAGCTCAAAAGATCCACCAGCCAACTCTATCTAGGAAAGGCTTAAACGAGTTTGTAGAATGTCATCAAGGGATTCTAAAAACTCCCTTAGGATCTTGGTGTCAATTTGTGAATGTTGTAGGCTCGGAGTTATCAGCCTCAGTTAAACAACATGTCAAGCCTAATAGTTTTGTGGTGAAAAGATTGTTGAATTCTCCTGTGTACCTTTTAATTAAACCAACCTCTTCCAAAGGTCACATATTTGTGTCCTTTGCCATAGATAGGAGTTACTATATAAGAGATCTGCTGGGAAGTTCATGTTTTCGGACCTACTATGATGCAGGAGATTTACTTGTCACTGACTTTGTATCTTTCAAACTAAGTAAGTTGACAAATTTGTGCAAAACATCAGCTTTGTATGAATCAGCTCTCTGCTTTTGGAATGAGTGTTATGGTAAGAAGGTCTGGCTATCTCATGACCCTTCTTATATAACAACAAATACAAACAAGGACATTCAGTACATGGTAAAATTGTCTCTTTTAACTTTGATGGAAGACAAAGCTACAACTGAAGAGTTGCAGACTCTATCTAGATATATAGTTATGGAGGGCTTTGTCTCTCAACCAGAACTGCCAAAACCTCAAAAAATGCTCTCAAAGTTGCCCACAAAATTAAGGTCAGAGTTGCAGGTTTTCCTCATAAATAGACTCTTCTCCGCAATGAAGAGAATTAGTCAGAGTCCTTTTAATCTTAAGAGAGGTGAAAACTCTTTGTCCTGGTCTGGCCTCTTTAATCCACTGTCTGGGAGAGATACAATAGAAATTCAACCCATAGTTAATGCATGTTATAATGGTTATTTCAAAAATAAAGAAGAAGAGACAGAGCCTTCTGCTTTATCAGGCATGTACAAGAAAATAATAGAACTTGAGCATTTAAGACCAGAGACAGACAGATATCTAGGCTGGGATGATCCGCAAGATCCTAAAATGCATGAATTTAGCAGAAGTTATCTAAAAGAAGTCTGTAATCATGGAAAGAATTTGCTCCAAAAACTATATGGAAAGAATGTATTAGAACAAATAGACCAAGATATTAGAAGAGAAGTCGGATCTTTGACCCTTGAGAGGCTGGCAACACTTAAAGCAACCAGCAACTTCTCAGAGGATTGGTACATTTACAAGGATGTTAAGGATAAGAATTATACTCGTGATAAAGTTCTGGTTAAAATGACAGAGTATGCTAAGAGAGGCAAAACTTTAGCTATTGAAATGTTTGATGAATGTATGAGTAGCATAGAAGAGAAGGGCTGTATGCATATCTGTCTATTCAAGAAGCAGCAACATGGTGGTTTGAGGGAGATTTATGTCATGGCTGCAGAAGAAAGAATAGTTCAATCTATAGTAGAGTCCATCTCCAAATGCATTGGCAGATTCTTCCCTTCAGATACTTTGTGCAATCCTAGTAATAAGACAAAAATTCCAGAGAGTCATGGTATTAGAGCAAGAAAGCACTGCAAAGGCTCAGTTTGGACAACTGCAACATCAGATGATGCACGGAAGTGGAATCAAGGTCACTTTGTCACAAAGTTTGCTCTAATGCTTTGCGAATTCACAAATTCAATGTGGTGGCCGATAATTATACGAGGTTGCTCTATGTTTACTAAGAAAAGAATGATGATGAATTTAGATTTCATGAATATAATAGACAGCAGAAGGGAATTAGAATTAGAAGATGATTTTGTTATGACACTATATAATGCTTATCATGGAAATCTTACAGTTCCATGGCTAGAAGCTGGTAAAACTTATCTAGAAACTTCCACTGGAATGATGCAGGGCATACTTCACTTCACCTCATCCCTACTACATTCTTTGCATCAAGAATATATTCGATCTCTATCTTTCAAAGTCTTCAATTCCAAAGTTAATCCTGAAATGAGTTTGTCTGTTGTTTGTGATATGATGCAAGGATCAGATGATAGCAGTATGCTGATAAGCTTCCCAAGCTCATCAGAAGAGATTGTAGTAAAATGTAAAGTTGCTTCTGCAATATGTTTTAGGATTAAGAAAAATCTTGGCTATTATTTAGGCATTTACCCTTCAGAGAAATCTACTGCTAATACTGATTTTGTGATGGAATATAACTCAGAGTTTTACTTCCATAATCAGCACATACGTCCTACTATAAGATGGATTGCTGCCAGTAACAACTTATCAGAGGCAGAAACATTAGTTGCTAGACAAGAAGAAGCATCCAACCTTGTCACACCTGTTTGTGAGGGAGGAGGATCTTTTTCATTAACAGCAATGATTCAACAATCTCAGTGCACAACACATTATGCTCTGATGGGAATGGGAGTATCTAGCTTATTTCGAGAATACAAAAAAGCAATTCTTAAGTGGTGTGATCCTGGACTTGGTTTTTTCTTACTAGACAACCCTAGAGCAGCTGGCTTAGGAGGATTCAGGTACAACTTGTATAAGGCAATAACTAGAACACAACTCTCAAAAATCTATAGCTTCTTCATGAAGAAGGTTAGAATTGGAGCCTCACCAGATGATCCAAATGAGATTCCTGAAACATGCAGCGTTAGCCCAGGTGGTGCATTAATCTTAAGTTCTTCTCTCAAATGGGGGTCAAGGAAAAAGTTCCAGAAGCTAAGAGCTAGGCTAGGAATAGCAGATGACTGGGTAGATCAGATAAACAGGAATCCACATATACTCTATAGAGCTCCTAGAACAGGAGAAGAAATTTTATTAAGAATTGCAGAAAAGGTTCATAGTCCAGGTGTAGTCTCCTCTCTATCAACTGGTAATGCTGTAGCTAAAGTGATGGCATCTTCTGTTTACTTCTTGTCAGCCACTATCTTTGAGGATGCAGGAAGACCAGAGTTTTCATTTATTGAAGATTCAAAGTACTCCCTTCTGTATAAGCTTGCATCATATGAAGGCTACTCTGATTTTGATGAAATAGATCCTGAAGATGTTCTTTTTCTTTTCCCCAATTTAGAGGAATTCTATTCTTTAGATCAATTGATTTTTGACAGAGGGGAGGTAGAAATCATATTGCGATCAAACATGAGAGAAGCAACACAGACCAGAGTTACTGTTTTTGACCATTCTGCCAATGATAAATGCTCTCCTGAGAAATTAGTATCTGATAAGTGGTTTGGTACCCAGAAGTGTAGAATAGGAAGAACTGGGATGAATAGAGAGTGGGAAAGACTCAAACTTACAATTAGGTGGTTAAAAGACTCTCCTGAGGAGACTTTGGAATCTTCACCACTTCACAATCATATTCAAATCCGAAATTTCTTTGCCAGAATGGAAGGCAAGGCAAGAACAATAAGAATAACAGGGGCTCCAGTTAAGAAAAGATCTGGTCTAAGTAAACTCTCAATGGTAGTGAGAGATAACTTTACGAAGGTAGGAATACTAGGAGGAATTGAAGATGATCTTGCTATTACAAGATCAGTATCTGTTGATATAGCAAAACACACATTATTCTCCATTTTAAATGGTCCTTATTCAGACGAGACAAAAGCCAGATTTTGCCAGAAGAGCTTGGAGGTGTTGCCTCAGATAGCTCTAAACATGTCTGATAGGAAAACAAGATCCAATGTGGTGGCCTTATTTCAAGAGTATTGCAAAGATTATACTGGGATAATAAAGAAATTAGAGACCCTTGGGGCTGGGACAATAGGAGCTTATATAAAACCTCAAAAGTCAAAAAAGGTTGATAATAGAGTTCAGTATTTTGGAGAAGGCATCTGGAGAGGAGTGATGGATGGCTATAGTGTGCAGATCTCAGTTGATTGTAAGGAGGGGCAAATGCCTCAAATCACATCTGTCTGGGTTAGCAAATGCAAAGAGATATGGGTGCTGTCAAAATCTATTAGAGCTTGGTGTGACGACATGGGAGTGAGGAATGACCAAAACGTTAAGCCAACCTATGGAACTTCTCCTAATGGCTGGATCTTCAACTTCCAAATTTATGGGTCTGGACATAGGTATGGTGCTCCAATTTATTCTCTCAGAGAGGAAATGGATAATATCCATGACATACAAGATGATCAAATAGGCCTCAAAGTGACAAACAATGTCCTTCGTTTGTATGTGAACCTGCCCAAAATCAAAAGAGACCTGCACATCTTAACATATACTGCTACTGATAATGACATCAGCTCTACTAGTATAATGGAGCTATCAGCTTATAATATAATGGAAATGATTCCAGAGTTCAGTAAACAACCCAGCAAAAGCTGGTTGCTATGTGATAGTCTGCCCATAAAATTCTTAAAGCCTGTTCTAGATATAACAGAAGGGGTGAGAGTTGTTGAGGGCATTAGACCTGACTTGCTGAAAGAGCTGATAAAAAATTGCACTGAATCTTCTATTAGATCAAAGGTCGGAACTGTGTTTTCAATGGTTCAAACCAGCCAAACATCAGGCCCAGAAATAGACACAAGTGAGATGATAGATTTAATTCTGTCTGAAATGGATGACATAAGTTTTGACACTGCAGTAACAAGTGTGAATGAATGTTTAGATTTAAGTAATGTCTTATATGATGAGGAATTTGGATCTGTTGATATTGGCTTATTTGGGCCAGCATATCACAGAGAGATTAGAAATCTAATGACAATATCTCACCCCTTAATGGATACCCTTATAGATACATCTCTATCACAGATGGGGAGGAATGGGATCCGAAGATTAGTGGAAACAGGAAAGTGCTGCCAACGAGACTTAGGCTTGTCTGAATTGATCTACAGAGCTTTAGGAAGGGATCCTTCTAATATAAGAGTAGATGTGGTACTAGCTGATGTCATGGATACAGTGGATGATGATGAATTAGGTTAACTGAATTCTTGACAGTGGTATGGCAGGCTTCTCATTTTGGGAAGCCAAAGCAGTATGATTCTTGGCGGTCTTTGTGT
| 21,244
|
MF593931.1
|
Arumowot virus
|
Ly,H.J., Lokugamage,N., Nishiyama,S., Ikegami,T.
|
The University of Texas Medical Branch at Galveston, Pathology
|
USA
|
2017-10-02
|
Ar 1286-64
|
Phlebovirus arumowotense
|
Phlebovirus
|
Phenuiviridae
|
ssRNA(+/-)
| 6,376
|
GenBank
| 1
|
Sudan
|
Sudan
|
Culex antennatus
| null |
1963
| null | null |
Arumowot virus isolate Ar 1286-64 segment L, complete sequence
|
ACACAAAGGCGCCAAGAATGAATCAATTGCTATCAAAACAAACCTCACCAAGAGTGGGTTTTTTCTGTAAAGCTATAGGACACCATGACTATTTTGTGGGAAATGTTGTCCTACCCAATTTCCAAGTCAGGAGAGTGATGGATGGGATAGAGATTGATTTGAATCTAGATGACTTGGACACAGCATCTGATCTGGGCTCTTCCTTAAGGCCTTCTTTAACAGTGAGGTCTAACAATGTCCCAAATTTCATACATGACTTTACATTTGGTCATTTGGCAGACACCACTGATAGAGCCTTTTCTTCTGTGTTCCAAGTTGTGAATGATGGCTTTGATGATCTGACACCAGATGTTATTGTTAAAACTCCTTCCGGCAGCTTCCATGTTGTGGAGTTTACAACCTTTAGAGGACGACAAGAGGAAGCTAGATTTGCCACTCAAAACAAAATAACAAAATATGAATTAGCTTGTAGAAACAGATCAGTTCAAGGCCCAGTGTCATTGCACACTATTGGGGTGCATAGAGGAGGCCTATGGACCAACATGAAAATTGACCAAAAAGAGGTTGAAGAGCTTTGCTTTAGATTTAGACTATCGCTAGCTATTGAAGCAGAAATTAAATTGATCTGCCCTGATTTAAGGGAGGTTGACGAAGAGTATTCAAAATTGGAGAGGGAAATATTAGGGATTGTTTCAGGGATTAAAATTGACTGGGATGTAACTCAGTCAGTTTTCCCTTCATTCAAGAGAGAATTGTTTAGAAGATTCTACCAATCTGAGCCTGATCAAGAGTATCTTCAATCCATAATTGATAAAGTCACTAGAAAGTCTCAAGATGATCTCCTAAAATCATCTTTCATTAATCTAACCAACACTCTACCTGAGAGGTTGATGAGCAACCTCCAAGAATGCGAGAATGCAATTACTGACTTTATTGACAATCATGAATCAAGAGATAATTTAAGGCCAGCAAACTGGAGGAAGGGGACTGTCCTGTTTCCCCCTTGGGTGTTTAGAGAATCAGATGAAGGAAAGAGCTTAACTCCTCTAAAGGATCTAAATGTAGAAGGAGACCATCCTATGTGTAGAATATGGGAAAGAGTCAGGCTATCAGCTCAATTAGAAGAAATTGAAAGAATGGATGATGATCCTGAGAGTGAATTAGAATTTGCACTATCTGGAGAGAGAACTAGAGATGATGAGAGGAGCAAGTATCATAGAGTGAGGGTTGATTTGGACTTGGAAGAAAAGGAGTTTGTGGCTATGCTTGGTATTAATGGGAAAGCCTATAAGGACTGGTCTTCTATTAAGGATAATAGAGAAAAGAGTAAATTAATATTTTCAATTTACCATGATACAACACCGGTTGAAGAATTTTTATACACAGATTCATCTTTAGACATGACTCCAGAAGATGATTTATACGGGCCTTACCTTGAGGATATTGAGCTGAGATTACAAGCTCAAAAGATTCACCAGCCAACTCTATCTAGGAAAGGCTTAAACGAGTTTGTAGAATGTCATCAAGGGATTCTGAAAACTCCCTTAGGATCTTGGTGTCAATTTGTGAATGTTGTAGGCTCGGAATTATCAGCCTCAGTTAAACAACATGTCAAGCCTAGTAGTTTTGTGGTGAAAAGGTTGTTAAATTCTCCTGTGTACCTTTTAATTAAACCAACCTCTTCCAAAGGTCACATATTTGTGTCCTTTGCCATAGACAGGAGTTACTATATAAGAGATCTGCTGGGAAGTTCATGTTTTCGGACCTACTATGATGCAGGAGATTTACTTGTCACTGATTTTGTATCTTTCAAACTAAGTAAGTTGACAAATTTGTGTAAAACATCAGCTTTGTATGAATCAGCTCTCTGCTTTTGGAATGAGTGTTATGGTAAGAAGGTCTGGCTATCTCATGACCCTTCTCATATAACAACAAACACAAACAAGGACATTCAGTACATGGTAAAATTGTCTCTCTTAACTTTGATGGAAGACAAAGCTACAACTGAAGAGTTGCAGACTCTATCTAGATATATAGTTATGGAGGGCTTTGTCTCTCAACCAGAACTGCCAAAACCTCAAAAAATGCTCTCAAAGTTGCCCACAAAATTAAGGTCAGAGTTGCAGGTTTTCCTCATAAATAGACTCTTCTCCGCAATGAAGAGAATTAGTCAGAGTCCTTTTAATCTTAAGAGGGGTGAAAACTCTTTATCCTGGTCTGGTCTCTTCAATCCACTGTCTGGGAGAGATACAACAGAAATTCAACCCATAATTAATGCATGTTATAATGGTTATTTCAAAAATAAAGAAGAAGAGACAGAGCCTTCTGCTTTATCAGGCATGTATAAGAAAATAATAGAGCTTGAGCATTTAAGACCAGAGACAGACAGATATCTGGGCTGGGATGATCCACAAGATCCTAAAATGCATGAATTTAGTAGAAGTTATCTAAAAGAAGTCTGTAATCATGGAAAGAATTTGCTCCAAAAACTATATGGAAAGAATGTATTAGAACAAATAGACCAAGATATTAGAAGAGAAGTCGGATCTTTGACCCTTGAGAGGCTGGCAACACTTAAAGCAACCAGCAACTTCTCAGAGGATTGGTACATTTACAAGGATGTTAAGGATAAGAATTATACTCGTGATAAAGTTCTAGTTAAAATGACAGAGTATGCTAAGAGAGGCAAGACTTTAGCTATTGAAATGTTTGATGAATGTATGAGTAGCATAGAAGAGAAGGGCTGTATGCATATCTGTCTATTCAAGAAGCAGCAACATGGTGGTTTGAGGGAGATTTATGTCATGGCTGCAGAAGAAAGAATAGTTCAATCTATAGTAGAGTCCATCTCCAAATGCATTGGCAGATTCTTCCCTTCAGACACTTTGTGCAATCCTAGTAATAAGACAAAAATTCCAGAGAGTCATGGTATTAGAGCAAGAAAGCACTGCAAAGGCTCAGTTTGGACAACTGCAACATCAGATGATGCACGGAAGTGGAATCAAGGTCACTTTGTCACAAAGTTTGCTCTAATGCTATGCGAATTCACAAATTCAATGTGGTGGCCGATAATTATACGAGGTTGCTCTATGTTTACTAAGAAAAGAATGATGATGAATTTAGATTTCATGAATATAATAGACAGCAAAAGGGAGTTAGAATTGGAAGATGATTTTGTTATGACACTATACAATGCTTATCATGGAAATCTTACAGTTCCATGGCTAGAAGCTGGTAAGACTTATCTAGAAACTTCCACTGGAATGATGCAGGGCATACTTCACTTCACCTCATCCCTACTACATTCTTTGCATCAAGAATATATTCGATCTCTATCTTTCAAAGTCTTCAATTCCAAAGTTAATCCTGAAATGAGTCTATCTGTTGTTTGTGACATGATGCAAGGATCAGATGATAGCAGTATGCTGATAAGCTTCCCAAGCTCATCAGAAGAGATTGTAGTAAAATGTAAAGTTGCTTCTGCAATATGTTTTAGGATTAAGAAAAATCTTGGCTATTATTTAGGCATTTACCCTTCAGAGAAATCAACTGCTAATACTGATTTTGTGATGGAATATAACTCAGAGTTTTACTTCCATAATCAGCACATACGGCCTACTATAAGATGGATTGCTGCCAGTAATAACTTATCAGAGGCAGAAACATTAGTTGCTAGACAAGAAGAAGCATCCAACCTTGTCACACCTGTTTGTGAGGGAGGAGGATCTTTTTCATTGACAGCAATGATTCAGCAATCTCAATGCACAACACATTATGCTCTGATGGGAATGGGAGTATCTAGCTTATTTCGAGAATACAAAAAAGCAATTCTTAAGTGGTGTGATCCTGGACTTGGTTTTTTCTTACTAGACAACCCTAGAGCAGCTGGCTTGGGAGGATTCAGGTACAACTTGTATAAGGCAATAACTAGAACACAACTCTCAAAAATCTATAGCTTCTTCATGAAGAAGGTTAGAATTGGAGCCTCACCAGATGATCCAAATGAGATTCCTGAAACATGCAGTGTTAGCCCAGGTGGTGCATTAATCTTAAGTTCTTCTCTCAAATGGGGGTCAAGGAAAAAGTTCCAGAAACTAAGAGCTAGGCTAGGAATAGCAGATGACTGGGTAGATCAGATAAACAGGAATCCACATATACTCTATAGAGCTCCTAGAACAGGAGAAGAAATTTTATTAAGAATTGCAGAAAAGGTTCATAGTCCAGGTGTAGTCTCCTCTCTATCAACTGGTAATGCTGTAGCTAAGGTGATGGCATCTTCTGTTTACTTTTTGTCAGCCACTATCTTTGAGGATGCAGGAAGACCAGAGTTTTCATTTATTGAAGATTCAAAGTATTCCCTTCTGTATAAGCTTGCATCATATGAAGGCTACTCTGATTTTGATGAAATTGATCCTGAAGATGTTCTTTTTCTTTTCCCTAATTTAGAGGAATTCTATTCTTTAGATCAATTGATTTTTGACAGAGGGGAGGTAGAAATCATACTGCGATCAAACATGAGAGAAGCAACACAGACCAGAGTCACTGTTTTTGACCATTCTGCTAATGATAAATGCTCTCCTGAGAAATTAGTATCTGATAAGTGGTTTGGCACCCAGAAATGTAGAATAGGAAGGACTGGGATGAATAGAGAGTGGGAAAGACTCAAACTTACAATTAGGTGGTTAAAAGACTCTCCTGAGGAGACTTTGGAATCTTCACCACTTCACAATCATATTCAAATCCGAAATTTCTTTGCCAGAATGGAAGGCAAGGCAAGAACAATAAGAATAACAGGGGCTCCAGTTAAGAAAAGATCTGGTCTAAGCAAACTCTCAATGGTAGTGAGAGATAACTTTACGAAAGTGGGAATACTAGGAGGAATTGAAGATGATCTTGCTATCACAAGATCAGTATCTGTTGATATAGCAAAACACACATTATTCTCCATTTTAAATGGTCCTTATTCAGACGAGACAAAAGCCAGATTTTGCCAGAAGAGCTTGGAGGTGTTGCCTCAGATAGCTCTAAACATGTCAGATAGGAAAACAAGATCCAATGTGGTGGCCTTATTCCAAGAGTACTGCAAAGATTATACTGGGATAATAAAGAAATTAGAGACCCTTGGGGCTGGGACAATAGGAGCTTATATAAAACCTCAAAAGTCAAAAAAGGTCGATAATAGAGTTCAATATTTTGGAGAAGGCATCTGGAGAGGAGTGATGGATGGCTATAGTGTGCAGATCTCAGTTGATTGTAAGGAGGGGCAAATGCCTCAAATCACATCTGTCTGGGTTAGCAAATGCAAAGAGATATGGGTGCTGTCAAAATCTATTAGAGCTTGGTGTGACGACATGGGAGTAAGGAATGACCAAAACTTTAAGCCAACCTATGGAACTTCTCCTAATGGCTGGATCTTCAACTTCCAAATTTATGGATCTGGACATAGGTATGGTGCTCCAATTTATTCTCTCAGAGAGGAAATGGATAATATCCATGACATACAAGATGATCAAATAGGCCTCAAAGTGACAAACAATGTCCTTCGTTTGTATGTGAACCTGCCCAAAATCAAAAGAGACCTGCACATCTTAACATATACTGCTACTGATAATGACATCAGCTCTACTAGCATAATGGAGTTGTCAGCTTATAATATAATGGAAATGATTCCAGAGTTCAGTAAACAACCCAGCAAAAGCTGGTTGCTATGTGATAGTTTGCCCATAAAATTCTTAAAGCCTGTTCTAGATATAACAGAAGGGGTAAGAGTTGTTGAGGGCATTAGACCTGACTTGCTAAAAGAGCTGATAAAAAATTGTACTGAATCTTCTATTAGATCAAAAGTCGGAACTGTGTTTTCAATGGTTCAAACCAGCCAAACATCAGGCCCAGAAATAGACACAAGTGAGATGATAGATTTAATTCTGTCTGAAATGGATGACATAAGTTTTGACGCTGCAGTAACAAGTGTAAACGAATGTTTAGATTTAAGTAATGTCTTATATGATGAGGAATTTGGATCTGTTGATGTTGGCTTATTCGGGCCAGCATATCACAGAGAGATTAGAAATCTAATGACAATATCCCACCCCTTAATGGATACCCTTATAGACACATCTCTATCACAGATGGGGAGGAATGGGATCCGAAGATTAGTAGAAACAGGAAAGTGCTGCCAACGAGACTTAGGCTTGTCTGAATTGATCTACAGAGCTTTAGGAAGGGATCCTTCTAATATAAGAGTAGATATGGTACTAGCTGATGTCATGGATACAGTGGATGATGATGAATTAGGTTAACTGAAATCTTGGCAGTGGTATGGCAGGCTTCTCATTTTGGGAAGCCAAAGCAGTATGATTCTTGGCGGTCTTTGTGT
| 74,505
|
HM566144.1
|
Arumowot virus
|
Palacios,G., Savji,N., Sze,W., Hutchinson,S., Tesh,R., Travassos da Rosa,A., Lipkin,W.
|
Columbia University, Center for Infection and Immunity
|
USA
|
2012-05-18
| null |
Phlebovirus arumowotense
|
Phlebovirus
|
Phenuiviridae
|
ssRNA(+/-)
| 6,376
|
GenBank
| null |
Spain
|
Spain
| null | null | null | null | null |
Arumowot virus segment L, complete sequence
|
ACACAAAGGCGCCAAGAATGAATCAATTGCTATCAAAACAAACCTCACCAAGAGTGGGTTTTTTCTGTAAAGCTATAGGACACCATGACTATTTTGTGGGAAATGTTGTCCTACCCAATTTCCAAGTCAGGAGAGTGATGGATGGGATAGAGATTGATTTGAATCTAGATGACTTGGACACAGCATCTGATCTGGGCTCTTCCTTAAGGCCTTCTTTAACAGTGAGGTCTAACAATGTCCCAAATTTCATACATGACTTTACATTTGGTCATTTGGCAGACACCACTGATAGAGCCTTTTCTTCTGTGTTCCAAGTTGTGAATGATGGCTTTGATGATCTGACACCAGATGTTATTGTTAAAACTCCTTCCGGCAGCTTCCATGTTGTGGAGTTTACAACCTTTAGAGGACGACAAGAGGAAGCTAGATTTGCCACTCAAAACAAAATAACAAAATATGAATTAGCTTGTAGAAACAGATCAGTTCAAGGCCCAGTGTCATTGCACACTATTGGGGTGCATAGAGGAGGCCTATGGACCAACATGAAAATTGACCAAAAAGAGGTTGAAGAGCTTTGCTTTAGATTTAGACTATCGCTAGCTATTGAAGCAGAAATTAAATTGATCTGCCCTGATTTAAGGGAGGTTGACGAAGAGTATTCAAAATTGGAGAGGGAAATATTAGGGATTGTTTCAGGGATTAAAATTGACTGGGATGTAACTCAGTCAGTTTTCCCTTCATTCAAGAGAGAATTGTTTAGAAGATTCTACCAATCTGAGCCTGATCAAGAGTATCTTCAATCCATAATTGATAAAGTCACTAGAAAGTCTCAAGATGATCTCCTAAAATCATCTTTCATTAATCTAACCAACACTCTACCTGAGAGGTTGATGAGCAACCTCCAAGAATGCGAGAATGCAATTACTGACTTTATTGACAATCATGAATCAAGAGATAATTTAAGGCCAGCAAACTGGAGGAAGGGGACTGTCCTGTTTCCCCCTTGGGTGTTTAGAGAATCAGATGAAGGAAAGAGCTTAACTCCTCTAAAGGATCTAAATGTAGAAGGAGACCATCCTATGTGTAGAATATGGGAAAGAGTCAGGCTATCAGCTCAATTAGAAGAAATTGAAAGAATGGATGATGATCCTGAGAGTGAATTAGAATTTGCACTATCTGGAGAGAGAACTAGAGATGATGAGAGGAGCAAGTATCATAGAGTGAGGGTTGATTTGGACTTGGAAGAAAAGGAGTTTGTGGCTATGCTTGGTATTAATGGGAAAGCCTATAAGGACTGGTCTTCTATTAAGGATAATAGAGAAAAGAGTAAATTAATATTTTCAATTTACCATGATACAACACCGGTTGAAGAATTTTTATACACAGATTCATCTTTAGACATGACTCCAGAAGATGATTTATACGGGCCTTACCTTGAGGATATTGAGCTGAGATTACAAGCTCAAAAGATTCACCAGCCAACTCTATCTAGGAAAGGCTTAAACGAGTTTGTAGAATGTCATCAAGGGATTCTGAAAACTCCCTTAGGATCTTGGTGTCAATTTGTGAATGTTGTAGGCTCGGAATTATCAGCCTCAGTTAAACAACATGTCAAGCCTAGTAGTTTTGTGGTGAAAAGGTTGTTAAATTCTCCTGTGTACCTTTTAATTAAACCAACCTCTTCCAAAGGTCACATATTTGTGTCCTTTGCCATAGACAGGAGTTACTATATAAGAGATCTGCTGGGAAGTTCATGTTTTCGGACCTACTATGATGCAGGAGATTTACTTGTCACTGATTTTGTATCTTTCAAACTAAGTAAGTTGACAAATTTGTGTAAAACATCAGCTTTGTATGAATCAGCTCTCTGCTTTTGGAATGAGTGTTATGGTAAGAAGGTCTGGCTATCTCATGACCCTTCTCATATAACAACAAACACAAACAAGGACATTCAGTACATGGTAAAATTGTCTCTCTTAACTTTGATGGAAGACAAAGCTACAACTGAAGAGTTGCAGACTCTATCTAGATATATAGTTATGGAGGGCTTTGTCTCTCAACCAGAACTGCCAAAACCTCAAAAAATGCTCTCAAAGTTGCCCACAAAATTAAGGTCAGAGTTGCAGGTTTTCCTCATAAATAGACTCTTCTCCGCAATGAAGAGAATTAGTCAGAGTCCTTTTAATCTTAAGAGGGGTGAAAACTCTTTATCCTGGTCTGGTCTCTTCAATCCACTGTCTGGGAGAGATACAACAGAAATTCAACCCATAATTAATGCATGTTATAATGGTTATTTCAAAAATAAAGAAGAAGAGACAGAGCCTTCTGCTTTATCAGGCATGTATAAGAAAATAATAGAGCTTGAGCATTTAAGACCAGAGACAGACAGATATCTGGGCTGGGATGATCCACAAGATCCTAAAATGCATGAATTTAGTAGAAGTTATCTAAAAGAAGTCTGTAATCATGGAAAGAATTTGCTCCAAAAACTATATGGAAAGAATGTATTAGAACAAATAGACCAAGATATTAGAAGAGAAGTCGGATCTTTGACCCTTGAGAGGCTGGCAACACTTAAAGCAACCAGCAACTTCTCAGAGGATTGGTACATTTACAAGGATGTTAAGGATAAGAATTATACTCGTGATAAAGTTCTAGTTAAAATGACAGAGTATGCTAAGAGAGGCAAGACTTTAGCTATTGAAATGTTTGATGAATGTATGAGTAGCATAGAAGAGAAGGGCTGTATGCATATCTGTCTATTCAAGAAGCAGCAACATGGTGGTTTGAGGGAGATTTATGTCATGGCTGCAGAAGAAAGAATAGTTCAATCTATAGTAGAGTCCATCTCCAAATGCATTGGCAGATTCTTCCCTTCAGACACTTTGTGCAATCCTAGTAATAAGACAAAAATTCCAGAGAGTCATGGTATTAGAGCAAGAAAGCACTGCAAAGGCTCAGTTTGGACAACTGCAACATCAGATGATGCACGGAAGTGGAATCAAGGTCACTTTGTCACAAAGTTTGCTCTAATGCTATGCGAATTCACAAATTCAATGTGGTGGCCGATAATTATACGAGGTTGCTCTATGTTTACTAAGAAAAGAATGATGATGAATTTAGATTTCATGAATATAATAGACAGCAAAAGGGAGTTAGAATTGGAAGATGATTTTGTTATGACACTATACAATGCTTATCATGGAAATCTTACAGTTCCATGGCTAGAAGCTGGTAAGACTTATCTAGAAACTTCCACTGGAATGATGCAGGGCATACTTCACTTCACCTCATCCCTACTACATTCTTTGCATCAAGAATATATTCGATCTCTATCTTTCAAAGTCTTCAATTCCAAAGTTAATCCTGAAATGAGTCTATCTGTTGTTTGTGACATGATGCAAGGATCAGATGATAGCAGTATGCTGATAAGCTTCCCAAGCTCATCAGAAGAGATTGTAGTAAAATGTAAAGTTGCTTCTGCAATATGTTTTAGGATTAAGAAAAATCTTGGCTATTATTTAGGCATTTACCCTTCAGAGAAATCAACTGCTAATACTGATTTTGTGATGGAATATAACTCAGAGTTTTACTTCCATAATCAGCACATACGGCCTACTATAAGATGGATTGCTGCCAGTAATAACTTATCAGAGGCAGAAACATTAGTTGCTAGACAAGAAGAAGCATCCAACCTTGTCACACCTGTTTGTGAGGGAGGAGGATCTTTTTCATTGACAGCAATGATTCAGCAATCTCAATGCACAACACATTATGCTCTGATGGGAATGGGAGTATCTAGCTTATTTCGAGAATACAAAAAAGCAATTCTTAAGTGGTGTGATCCTGGACTTGGTTTTTTCTTACTAGACAACCCTAGAGCAGCTGGCTTGGGAGGATTCAGGTACAACTTGTATAAGGCAATAACTAGAACACAACTCTCAAAAATCTATAGCTTCTTCATGAAGAAGGTTAGAATTGGAGCCTCACCAGATGATCCAAATGAGATTCCTGAAACATGCAGTGTTAGCCCAGGTGGTGCATTAATCTTAAGTTCTTCTCTCAAATGGGGGTCAAGGAAAAAGTTCCAGAAACTAAGAGCTAGGCTAGGAATAGCAGATGACTGGGTAGATCAGATAAACAGGAATCCACATATACTCTATAGAGCTCCTAGAACAGGAGAAGAAATTTTATTAAGAATTGCAGAAAAGGTTCATAGTCCAGGTGTAGTCTCCTCTCTATCAACTGGTAATGCTGTAGCTAAGGTGATGGCATCTTCTGTTTACTTTTTGTCAGCCACTATCTTTGAGGATGCAGGAAGACCAGAGTTTTCATTTATTGAAGATTCAAAGTATTCCCTTCTGTATAAGCTTGCATCATATGAAGGCTACTCTGATTTTGATGAAATTGATCCTGAAGATGTTCTTTTTCTTTTCCCTAATTTAGAGGAATTCTATTCTTTAGATCAATTGATTTTTGACAGAGGGGAGGTAGAAATCATACTGCGATCAAACATGAGAGAAGCAACACAGACCAGAGTCACTGTTTTTGACCATTCTGCTAATGATAAATGCTCTCCTGAGAAATTAGTATCTGATAAGTGGTTTGGCACCCAGAAATGTAGAATAGGAAGGACTGGGATGAATAGAGAGTGGGAAAGACTCAAACTTACAATTAGGTGGTTAAAAGACTCTCCTGAGGAGACTTTGGAATCTTCACCACTTCACAATCATATTCAAATCCGAAATTTCTTTGCCAGAATGGAAGGCAAGGCAAGAACAATAAGAATAACAGGGGCTCCAGTTAAGAAAAGATCTGGTCTAAGCAAACTCTCAATGGTAGTGAGAGATAACTTTACGAAAGTGGGAATACTAGGAGGAATTGAAGATGATCTTGCTATCACAAGATCAGTATCTGTTGATATAGCAAAACACACATTATTCTCCATTTTAAATGGTCCTTATTCAGACGAGACAAAAGCCAGATTTTGCCAGAAGAGCTTGGAGGTGTTGCCTCAGATAGCTCTAAACATGTCAGATAGGAAAACAAGATCCAATGTGGTGGCCTTATTCCAAGAGTACTGCAAAGATTATACTGGGATAATAAAGAAATTAGAGACCCTTGGGGCTGGGACAATAGGAGCTTATATAAAACCTCAAAAGTCAAAAAAGGTCGATAATAGAGTTCAATATTTTGGAGAAGGCATCTGGAGAGGAGTGATGGATGGCTATAGTGTGCAGATCTCAGTTGATTGTAAGGAGGGGCAAATGCCTCAAATCACATCTGTCTGGGTTAGCAAATGCAAAGAGATATGGGTGCTGTCAAAATCTATTAGAGCTTGGTGTGACGACATGGGAGTAAGGAATGACCAAAACTTTAAGCCAACCTATGGAACTTCTCCTAATGGCTGGATCTTCAACTTCCAAATTTATGGATCTGGACATAGGTATGGTGCTCCAATTTATTCTCTCAGAGAGGAAATGGATAATATCCATGACATACAAGATGATCAAATAGGCCTCAAAGTGACAAACAATGTCCTTCGTTTGTATGTGAACCTGCCCAAAATCAAAAGAGACCTGCACATCTTAACATATACTGCTACTGATAATGACATCAGCTCTACTAGTATAATGGAGTTGTCAGCTTATAATATAATGGAAATGATTCCAGAGTTCAGTAAACAACCCAGCAAAAGCTGGTTGCTATGTGATAGTTTGCCCATAAAATTCTTAAAGCCTGTTCTAGATATAACAGAAGGGGTAAGAGTTGTTGAGGGCATTAGACCTGACTTGCTAAAAGAGCTGATAAAAAATTGTACTGAATCTTCTATTAGATCAAAAGTCGGAACTGTGTTTTCAATGGTTCAAACCAGCCAAACATCAGGCCCAGAAATAGACACAAGTGAGATGATAGATTTAATTCTGTCTGAAATGGATGACATAAGTTTTGACGCTGCAGTAACAAGTGTAAACGAATGTTTAGATTTAAGTAATGTCTTATATGATGAGGAATTTGGATCTGTTGATGTTGGCTTATTCGGGCCAGCATATCACAGAGAGATTAGAAATCTAATGACAATATCCCACCCCTTAATGGATACCCTTATAGACACATCTCTATCACAGATGGGGAGGAATGGGATCCGAAGATTAGTAGAAACAGGAAAGTGCTGCCAACGAGACTTAGGCTTGTCTGAATTGATCTACAGAGCTTTAGGAAGGGATCCTTCTAATATAAGAGTAGATATGGTACTAGCTGATGTCATGGATACAGTGGATGATGATGAATTAGGTTAACTGAAATCTTGGCAGTGGTATGGCAGGCTTCTCATTTTGGGAAGCCAAAGCAGTATGATTCTTGGCGGTCTTTGTGT
| 97,108
|
NC_025388.1
|
Asian prunus virus 1
|
Marini,D.B., Gibson,P.G., Scott,S.W.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2014-10-31
|
tatao5
|
Asian prunus virus 1
|
Foveavirus
|
Betaflexiviridae
|
ssRNA(+)
| 9,409
|
RefSeq
| 1
|
USA
|
USA
|
Prunus persica
| null | null | null |
PRJNA485481
|
Asian prunus virus 1 isolate tatao5, complete genome
|
GATAAACAGAACGATCTATCAACAAACTACCTAGCTCGACAAACAGACCTAAGTTGTTCGTATGGCTTTGACATACCGAAGTCCGATAGGGGAAGTTCTTAATCGCTTCACATCTGAGGAGCAATCCAGGGTTAGTTCAACATCGGTTTCACGTCTGACCCAATTTGAAGTCAACAATCATAAGCTTTTCTCATTCGCAATGAGCGAGAAGGCTAAAGAAAAGTTGATCAAAGTTGGCATATACCTGAGTCCGTTCTCTTTTGAACCACACTCACACCCTGTTTGCAAAACTTTGGAGAATCACATTTTGTACAATATTCTTGTAAATAAGTTGGATAATAGTTTTTATGCTATAGGAATAAAGGGGTCTAAGGTCAACTTTCTGAAAAGCAGGTCAAAAAACCTGAGCATGCTTGAATACATGAACCGTATCGTCACTAGTGCCGACAAGTACCGATATGGTAGCGACTTTACGACCCTCAGCACTCAACAAATTGATAATCTCTGTTCCAAGCAAAGTCTTGAAAAATGTGGAACATTGAGAGAGCTCGTGCCCTTGGTCAAAATGAGCAAGAAGAAAAGAAATTTCTTTCTGCATGATGAGCTTCATTATTGGAGTTCACATGACTTGATGCTTTTCCTAGATTCAATAAATCCTGACCACCTCCTTGCTACTATTGTGTTCCCACCAGAGATTCTTGCTGGTGCTCAAGAAAGTCTGAACCCATGGTGTTATAGCTTCCAAAGGCATGGTAGCAAGCTAACTTTCTTTCCTGATGGGGTGCAAAGCGAGTCATACACTCAACCTTTGAGCGCAGGTTACATACTTCAGGCTTCAAAAATCGTCTGTCCAAGTGGCCAAGTTTACTCTGTTGATTTGGTTTACTCAGCATTCGCCCACCACATTGTTAGCATCACTAAAGGGGATCTGCCTGGTCTAGAGCGTCGTTTCTTTTCAAATTTCGAGGCCACAGGCGTGAAACACTTATCTGGGCTCTCTTACTCAGTGAGGGACTGTATTCCGGTTAGCTCAGAACTCATTTCAAAGCTGTACAGGTACATTCGCACACTTAAAAAACCAGACTTGCAGTCCTGTATGGCAAAACTGAGCCAGATTGTTCCAAACCCCACAGGCACTGAGATCAAATTTACTGAGGATTTTGCCCGTCTGACTATGGACGTGCAGCCTATGCGATCCATGCTCATGCCTGAAACGGCCAAGCTGATAGGGTCTCTTTTCTCTTCCTTCCTTCCTTTCAAAATGGCTAGGTTCTTTGATTGCTACAAGGCCTGCTCACTGGATAAGTTCATTCATGATCTTGAACCTTTTAGTTTCTCTGTGGAAACGAAGGTTATCAATAGCAGATCCAACCCGATGTTTGAGGCTGTGACCCTTGGTGAAACAATGAGTTCAGAGGAGGTCCTAAAGATCTTGGCCAAACTAGACATGGGGGCCCCAACAAGCTTAGAGGGGTTGACTGGAAAATTCAAGTATTCAAGTGAGGCCTATCATGGACTGCATCATGTTTTGGATGGATGTGGGCCGCATGTGTTTAGGAGGTTGGTGAGAAAGATTGCTGACTCCTTCTGCAATGAGTTTGGAATTTACAGGAAGAGCAGTTACGTGTCCTCCGTAGCTATCACAGTCTTGCAAAGAAAGACCAATTCCAATCTGAGTTTCATCTTCGGAACTGATCTCAACCCAATGATTATTGGCTTTGTAAGAAATTACTTTGCCTCCAGGCGGTCTTCTTTATTAATATGGTTTCATGATAGGCCAGAGTCTTGGTTTCAATTTTCGAGATTGAGAGCCAACCAGAAATTTTTGCGCTCCCCAATCTGGCCTAATGATCTCGGTTTGGTTGAATTCAGAATGAGAAAGAACTTGGCGCTCGAAATTTCAAACTTTGATAGAAACAGCAACTTGAGGAAGTTGGGATCTTTCCAGACTGCTCCAACAAATTCGAAGTCCAATACTTCATCTTCTGAGGGAGCCTCAAATCATCAGAGGGAACAGAGAGACCAATGTGATGAAGCCACCCTCCAAGTCAATTTTCAAAGGGAAATTGAGTTCTGCATGGGCTCTCTGCCGGAAGCTAACAGCTTCAAGAGCTTCACTCCATGTGTTGAGGCAGTTGCTGAGACTAGTTATGAAGTTCAGCCATTGGAGCCGGAACCTGAAGCAAATGGCTTGGTCCTTGGGTGCATTCCTGATGCATCTACCCCTGCCTTCACCTTCAACTCAGCAAACCAGAAGGACAGGTTATTCTCTTCCGTTGTGGAGGAGAATATTACTGACATCGGCATTCTCTCACCAATGGAGCTCGTCCTGCCTTCAAGTGCAGAGGCCACACCATTAAATGGTCGCCAATGCTACTTCTTCACCAGGTGTGGCTGCATTGACTATGGCCACAACAAAATCAGATACAAGCCGAACAAATGGTTCAGTGGCCTGGATTCAATTTTGAAAGATGAGAGTACGTACTATAATGCATGCCCGTTGCAAATCTACGAAGCTGGCGCCGGAATTGGGTTTCATTCTGACAATGAGAAGGTCTATCATAGAAGTCCAATCAAGACAATCAACTTCTGTGGTGAGGCAGATTTTGTTGTTAAGGCCAAAGGAAAACGCGATGTTGGAGTTAATGCTACCTGCCACATGAAAACCGGCCAGTTTTTCACTATGGACTCAAACTTTCAGTCGTATTACCAACATTCTGTGCAAAATTGTAGTGAGGGTCGTGTTTCCCTCACATTTAGGTACCACGTGAACAACATTGCCGGGCTGCCCATCAAACACACCTGTGGTGAATTTGGAGACACCGAATCCCTCTTTGATGTCCTAATTAGGAGAAGCTTTTCTTACTCTTCAAAGAATTTTCACACTTTTCCCGTTCCAGGGGATGGGAGCTGTTTTTGGCACAGTCTGGGGGCTCTGCTTGGAGTTGATGGTGAGGAGCTTAAAAAAATCTCAGCGAGAGAAATTTTAAAAAATGAGGTGCTATCAAGGAATTTGAGTCTGTCAGCGCAGATGGAAAATAAGCAATACGCTGAAAGGGAGTCGATTGCCGCATTCTGTAGAATTCAGTCCATCCACCTCGTTGTTCTGCTTCCCGACCAAAATTTCTCATATGAATTCCTGCCGATGCAAAATGCTGAAGTGACCCAACTCTTCGTCAAATTAAGTGGCGAGCATTTTGAGCCTGCTCTTCCCATCAACGGCTGCGTTGTGAAGTCAATCGCCGAGACCCTAAATCAAACTGAGGCAAAGATCTTGTCAGTCATTGGAAGACCTAACAATCGCCTAATTCTGGAGGGTCTAGTTGAGGGGGAAGGGCTAAACATTGAAGATTTGGAAGCAGCCTTTTCAGTCTTCGGAATATGTGCTCGAGTTAGCACAGAGAGGGGGGTATTCACACTGAACAAGGAGGGTAATCTCCATGCGAACTATGAATTGAAGTCTGGGCACATTATGTACTTAAAAAAAGCGTCAAGTTCGCAATTTGCGCCAACAAATCCAATACAAAATTTCAATGGTCAAGGTCCTGAGATCTTCCTCCGGGGCATAGTAAGCGAGGTTGATTATAAACCCAGTTGGGGACGAGCCAGAAATCTTGAAGAATCTCTCCTTAATGGAACCACAGGCATTTTGTGCGATAGAACGATCAATCTTCAAAAAAACTGGTTAACTGTGGACAGAAAACTGAATGATAATTCTCGGAATCTTGGGGTTGTTTTGGGAACCTTTGGCTCTGGAAAGAGCTCTCTGTTCAAGAGGTTTATTGTTAAGAATCCTTCCCGCTCGATTGTCTTTGTCTCGCCCAGGAGATCGCTTGCTGACCAAATTAAAGATGATCTTGGACTCAACACAAAAAGGGGTAAGTCACTTAGGGTTCGAGTACTCACTTTGGAGAGCTTCATTAAGGCTGTCTTCACTTTCAAGGCAGCCAGTGTTGTATTAGATGAGGTCCAACTGTACCCTCCTGGATACTTGGATTTGGTGATGTTGTGTCTCAGTTTAAACTGTCAGATCTATTTAGCTGGCGACCCATGCCAAAGTGATTACGATTCGGCCAAAGACAGGGCTTTGTTCGATGGCTTGAAGGGTGATATATTTGAGGTTCTCAGCGGGAAAAAGTATAAATTTAATGTCTCAAGCCGCAGGTTCCAGTCTGAAATGTTTGTGGGGCGACTTCCCTGCAGAATGGACACAAAAGCAATGACTGAAAATGAGAATTTTCACTGGCTGGAGAGTATTGAGTCAGCTGCAGAAGTGAGCAACACTGAGTATGATGTGGTCCTCGTTTCAAGCTTTGAGGAGAAGAAGATTGTGTGGGCTCACCTTGGAAGAGACCTGGAGGTTCTAACTTTTGGTGAATCTACAGGCCTGACCTTTAATAGGGGCATCATTCTCATTTCCCACGAAAGCACCTTAACCAGTGAGAGGAGGTGGATCACCGCACTCTCTAGATTCAGGCTCAACATTATCTTTGTGAATTTGGTCGGAAACTGTCTTGAGGATGCTTGCCAGGTATTTCATGATAGAACCCTGGACAGGTTTCTAACTAAGCGAGCAACAATTGCCAATATAGTCGATCAGTTACCAGGTCTGCCAGAGTTAACAAATGATTTTGGCGACAAGGTTGGTCGTTCTGAAGGGGTGATGGAAGCTAAGTTGTCTGGGGACCCCTGGCTGAAAACTGAGATTGATCTGCTTCAGGATGAGGATCAGGAGATGGAAGAGCTCGCTGAGGAGGTCAAACATGAACCATGGTTCAAAACCCATCTGCCTCTTTTTGAATTGGAATCCATTAGAGCAAGCTGGGTTCACAGGATAATGAATCGAGAATATCGTGAGGTGCGTTGCGGTTCAGAAACCACAACTCAATTTCCTGATGATCACCCCAGCGGAGCGAAAATTACTTTGGCAAATGCAGCAGAGAGATTTGAAGCCATATACCCAAGGCACAGGGGAAGTGATTCAGTCACCTTTCTAATGGCAGTCAAAAAAAGGCTGAGTTTTTCCCAACCATCAAAGGAGTCTGCCAAGCTGAACAGGGCGAAACCCTACGGGAAGTTCCTTGTGAGTGAGTTTCTTAAAAGAATACCATTGAGGGGCAATCTGGACCCTATCCTCTTTGCGAAGGCAAAGAGAGACTTTGAGGAAAAGAAAACAAGCAAAAGTGCAGCTGTAATTGAAAATCATTCTGGTCGTTCGTGCCGGGATTGGTTGGCCGATGTTGGTTTCATATTTATGAAGAGCCAGTTCTGTTCCAAGTGGGACAACAGATTTAGGGATGCAAAGGCAGGGCAAACTTTAGCTTGCTTTCACCATTCAATTCTGTGCAGATTTGCCCCATACATGAGGTACATTGAGTACAAGCTTCAGGCTGCATCGCCCAGCAACTTGTACATTCATTCTGGCAAAAACCTTGAAGATCTGAATGAGTGGGTGATCAGGAACAAGTTCTCGGGAATGAGCACGGAATCTGACTATGAGGCTTTCGACTCGAGCCAGGATCACTTTATTTTGAGCTTCGAGATTGAGATTATGAAGCATCTGCAACTGCCTTGGGACTTAATTGAGGATTATGTCTACATCAAGACTCACCTTGGTTCAAAGTTGGGGAACTTTGCTATAATGCGTTTCACTGGCGAGGCTAGTACCTTTCTCTTCAATACAATGGCAAACATGCTTTTCACTTTCTTGAGGTACGACCTAAATGGTTCTGAGGCCATATGTTTTGCTGGCGATGACATGTGCGCAAATCGAAGGCTTCGAGTTTCAAAGAAAAATGAGAATTTCTTGGGCAAGATCAAGCTTAAGGCAAAGGTGCAGTTCACTGAGAAGCCAACTTTCTGCGGCTGGAATCTGTGCATGGATGGAATCTTCAAGAGGCCGCAACTAGTGCTTGAAAGGCTGTGTGTAGCAAGGGAAAAGGACAACCTCGCCAACTGCCTGGACTCTTATGCCATAGAGGTTGGGTATGCCTTTGCCCTGGGCGAAAAAATTTTGCAGTACATGGACGAGGAAGCCCTCCAGAATCATTACAACTGCGTCCGGTTTATCATTAAACATTCTCATTTATTGAAATCTAGTGTCCGTGATCTCTTCTTAAGTGGTATGTAGATTAGGTTTAACATTGTGTTGTGTGAATAAGTATGGAATTTGTGTATGATAAGTTAATAGAAGCTGGGTATATTAGGACTATTTTACAAATTGATTTCCCTTTAATTGTACATTGCATTGCTGGCGCAGGAAAGAGCACCCTCATCCGTGAAATCATCGAATCAGATAGCAGATTTGAGGCTTTCACTTACGGGGTGCCGGATCCGGTAAACCTGTCTGGAATTAGAATTCGGGGGGCTGAAGAACTAGCTAACGCAAGGCCAGAATCCTTTAAGATCATTGACGAATACATTGGACAACATAGGCCCGAGGGTACTGCAGTCTGCTTTGCTGACCCAAACCAGTTTCCGTATTCTAGCCCAAACGCACACTTTACCTGCTATCAGTCTAAGCGTTTCGGTGACCAGACCTGTGCATTTCTCGGAAAATTAGATTGTGCAGCCTTCTCCTACAAGTCAGACCAGATAATTTTCGAGACCGTTTTTGAAGGATCAATTGAAGACCAAATCGTCTGTTACGAGAAGGAGGTTTTTGACTTACTGGATAGGCACGGTGCCGATTACAAGAAGGATTGTCAAATCAGAGGCTCCACTTTCGACATTGTGACCTTCATCACATCTTCTGAATCCTTTGAGCCAGAAGATAGATACAAAGTTTACCTGTGTTTAACAAGGCATCGTTCTGTTCTGCGTATTTTGAGTCCTGAGGGCATGTTTTTAAGGGACAATGCCAAGTTTGACGCCACCTCCTGATAACACAAGAGTCCTCTTACCCATCGCCGTTGGTTTGGGAGTTGGCATAGTCATTTGGTGCTTAACAAGATCGACCCTGCCTTCAGTTGGCGACAACGTACACAGCCTCCCTCACGGGGGAAATTATTTGGACGGCACAAAGAGGATCAGTTATTGTGGGCCAAGGGATAGCTTCCCAAGCAGCAATCTCTTTAAAGGAGGTACTTTCTCGGCAATTTGCATTGTTGTGCTTTTAGTCTTCGCGATTCATGTATCAGAGTTATTTAATAGGCCTAACCGTCGCACTTGTGGTTGTGGGTCTGCTGCACATGCTTAATTCTAATCATGATGGTTGTTTAATAGTAATTACTGGTGAGTCCGTCGTAGTTAAAAATTGTGTGTACACGAGTGACTTCATTGAATTGGTTAAGGGTCTTAAGCCGCATAATCATTGGAAGTCACTGTAGTTAGGTCGAGTGTATGTAGTTTGAAATAATAGAACTTCACTTGTGTGAACGTAGAAATGAGTGTTTCTTCCGCAGCTGTAGTTTCTACTGTGTCGAGTACCTCTTCTGAGGCTGTTCCAGTCACTTCTAGTGAGAATGAACCTGTCATCTCACAGCTTGACCTTCCACCAATTTCGTCCGGAGTGTCTGGGGTTTCGACAACCCCATCTACCGCTACCTCAAGTGTTGAGAATCCTTTCAAGCCCAGGACATCGTTCTCACTACCGTCATTGACTGCTGGGCTAGGTACCTTGAGTGCAACTGCTACAAGCTCAGCACCTGCTGCCACATCTGAGGCTAGAACCTCCTCACTCGAGAGTTGGAAGGAAAAATTAAAGAACAAGGATGAGGAGCCTAGGCGCGTTTTGTCAGAACCAGAAAGTCTTGGTTCTTTTGAAGCCGGTGCCGGGTCAGGGCCACGTGGCGTTAGCCCCAGCACCATGATACATTCCAAGTTAGAAGTAAAGAAGGGCCCAGACCTTGAGGCGACAGGAGTGAGTCTGGGTGCAAGACAGAGGATGGTGTTTGAGGCGGCTCGGAAAAGAGCTCAGGCTAACTCAGAGGCGGACAGGGAGAGTTTGGCACCACCTTTTGCCTCAGGGGATCCCTTTTCAAGGCCAAAGGTTCAGGATGTGCAAAGATTTTCTTATGAGCCGAGTTCTCCGGATGTTGCAACTGCTGAAAACATCGAGTACATAAGAGCCGATCTAGTTAGAGCTGGTGTGCCTACAAAGGATATAACTTTTGCCATGTGGGACATTGCCCGATATTGCGCTGATGCTGGGTCCTCTGAGTCCACTGAGTTTGTTGGGACAAGCAGTTATGGGGGCCGGGTCGCCAGAATGGAAATTGCAGCAGTGATCAAGAAGCATACAACACTGAGGAGGTTCTGTGGCTTTTACGCCAAAATTGTTTGGAACATCATGCTGGTGACGAACATTCCACCTTCTGGGTGGATGAAAAAGGGCTACAAAGAAAACACAAAGTTTGCTGCTTTTGATTTCTTTGTGCATGTTTCAAACAATGCTGCCTTAGAACCGGAGAATGGGCTGGTTAGAAAGCCCTATCATGAGGAGTTGGTTGCAGCTCAAGCCAACAAAGGTGTTATTTTACACAGAGCGGAGGCTGCCCAGGACAAAAATGCTTCAACGGCCCATGAGGTTACTGGTGGCAGAGCTGGACCGCGTTCAAGGTTAACTTTGAAGGGAAAGGAGATGGACTGAGGACTTCAGTCAAGTGATGGTTTGGCCTAGAACCGTGGAGAGGCCTAAAAGAGTCCACGTACCGTCTTAGGGAGATAGTATGTGTTTTAGTAAATATTAATAGTTTCCACTTCCTTAGGTCCCAGGTCTAGAACCCAGGAGAGACCCAAAAGAGTCCTGGTGAGCGTTTAGCTATAAGAACCTCTGCACTGCATAGGCCACACCAACGCTAATCATTGTGTGCCTTATGTGGGCAAGTTAACCAGGTTGTGGCGGCAACCTGGAATGTTAGATGCAAGCGTAGATTTATGAGCTACGTCCTGTGGTTGGATTTCCACCGTTATCTCGTCGTTAAGAGAGTGACCCCTCTTTTCTCGCTTATGGGGGCATTGTTAGGCGGGCGTGTGACCCATTGAAAGATGGGTTCCCTGCGTTAAGGGTAGTTGTGGTTTAGAATAAGCCTCCATGGTTCCGACCTGCCATGATTAAAGTGATCGGTAGTTCTGGGTAAGAAATAACCCTGTGCTTGGTGGCTAAGCATGACCACTCAGTTTGACCGACTGGCCAGACAGGTCACGTTTCCCACTTCGATATCAAAAGTGGGCGCATATCAAAGCGTTAAATTGTTCATCCGCATATTTTGGACTCCCAATTCTTGGGGGTTTGAAATAGACTTTGGTCCTGGTTATCTGACCTTAAAAGAGCCAAATAAACCGCATTTCAACGCGTTATAGTGTTCGCTGACAGACCGTACAAATAGTCTGTCTCACCGACCTAAGACCTAAATAATTGAATAAGGGAAGGTGATTAAATAAATTTGCTTTTTATCGCTAATTTTGC
| 6,340
|
MW427274.1
|
Asian prunus virus 1
|
Dong,Z., Zhan,B., Wang,H., Li,S.
|
China Agriculture University, College of Horticulture
|
China
|
2023-06-26
|
Guizhou
|
Asian prunus virus 1
|
Foveavirus
|
Betaflexiviridae
|
ssRNA(+)
| 9,617
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Prunus persica
| null |
2020-10-30
| null | null |
Asian prunus virus 1 isolate Guizhou, complete genome
|
GGATAAACAGAACAATCTATCAACAAACTACCTAGCTCGAAATAGACCTAAGTTGTTCGTAATGGCTTTGACATACCGAAGTCCGATAGAGGAAGTTCTTAATCGCTTCACTTCTGAGGAGCAATCCAGGGTTAGTTCAACGTCAGTCTCACGTTTGACCCAATTTGAAGTTAACAATCATAAGCTCTTCTCATTCGCAATGAGCGAGAAGGCGAAGGAAAAATTAATCAAGGTTGGGATATATCTGAGTCCGTTCTCTTTTGAGCCACACTCACACCCTGTTTGCAAAACTTTGGAGAACCACATTCTGTACAATGTTCTTGTGAATAAATTAGACAATAGTTTTTATGCTATAGGAATAAAGGGGTCTAAAGTCAACTTTCTAAAGAGCAGGTCAAAGAACCTGAGCATGCTTGAATACATGAACCGTATTGTTACGAGTGCTGACAAATACCGATATGGCAGTGACTTTACGACCCTTAGCACCCAGCAGATTGACAATCTCTGTTCCAAACAGAGTCTTGAGAAATGTGGGACACTGAGGGAGCTTGTGCCCTTGGTCAAAATGAGCAAGAAGAGGCGGAACTTTTTCTTACATGACGAGCTGCACTACTGGAGCTCGCATGACTTAATGCTTTTTCTTGATTCCATAAATCCTGACCACCTCCTTGCCACTGTTGTATTCCCACCAGAGATTCTTGCTGGTGCTCAAGAAAGTCTAAATCCATGGTGCTATGGCTTCCAAAGGCATGGGAGTAAGTTGACCTTCTTTCCTGACGGAGTGCAGAGTGAGTCATACACTCAACCTCTGAGCGCTGGCTACATACTTCAAGCGTCAAAAATTGTTTGTCCAAGTGGCCAGATCTACTCTGTTGATCTAGTTTACTCTGCGTTCGCCCACCACATTGTTAGCATCACTAAAGGGGATTTACCTGGCCTAGAACGTCGTTTTTTTTCAAATTTCGAGGCCACTGGTGTTAAACATCTGTCTGGACTCTCTTACTCAGTGAGGGACTGTATCCCGGTTAGTTCAGACCTCATTTCAAAGCTGTACCGATACATTCGCACACTTAAGAAGCCAGATCTTCAGTCTTGTATGGCAAAATTGAGCCAGATCATCCCAAACCCAACAGGCACTGAAATTAAATTTACCGAAGACTTTGCCCGTCTGACCATGGACGTTCAACCGATGCGCACCATGCTTATGCCTGAGACAGCTAAGCTCATAGGGTCTCTTTTTGCTTCCTTCCTTCCGTTCAAGATGGCTAGATTTTTTGATTGCTACAAGTCTAGTTCACTTGACAAATTCATCCATGATCTCGAGCCCTTCAGCTTCTCCGTAGAAACAAAGGTCATCAACAGCCGATCCAGTCCGATGTTTGAGGCAGTGACCCTTGGTGAAACAATGAGTTCGGAGGAGGTCCTAAAGATCTTAGCCAAGTTGGACATGGGGGCCCCAATGAGCCTTGAAGGATTGACTGGAAAGTTCAAGTATTCGAGTGAGGCTTATCATGGGCTGCACCATGTACTAGATGGGTGTGGGCCACACGTATTCAGGAGGCTGGTGAGGAAGATTGCTGATTCCTTCTGCAATGAGTTTGGGATCTACAGGAAAAGCAGTTACGTGTCCTCCGTTGCAATTACGGTTCTGCAGAGAAAGACCAACTCCAACCTAAGCTTTATTTTCGGAACTGACCTCAACCCAATGATTGTTGGCTTTGTGAGGAATTACTTTGCTTCCAGGCGGTCCTCTCTACTAATATGGTTTCATGACAGGCCAGAATCTTGGTTCCAATTTCGCAGACTAAGAGCCAATCAAAAATTTTTGCGCTCCCCAATCTGGTCCAGTGAACTTAGTCTGGCCGAATTCAGAATGAGGAAGAACTTGGCATTTGAGATTCTAGACTTCAATAAAGATAGTCATTTGAGGAAGCTGGGATCCTTCCAGACAACCCCAACGAACACAAAGTCTCACATTCCAATCCCTGAGGGGGCCTCAAGTCATCAGGGAAGCAAAAAAAAACAGTGTGATGAAGTCAGCCCCAAAGCCAGTTTCCAAAAGGAACTTGAGTTTTGCTTGGGCTCCCTGCCAGAAGCTGACAGTTCCGAAGTCTTCACTCCATGTGTGGAGGCGGTTGTTGAAGCCAGTGAAGAAATTCTGCTACCAGGGCCAGGACATGAAGCAAACGGCTTGGTTTTTGGGTGTGTTCCTGATGCATCCACTCCTGCATTCACTTTCAGCTCAGCAAACCAGAAAGATAGGCTTTTTTCTTCCGTTGTGGAAGAGAACATCACTGATGTTGGCGTTCTCTCACCAACTGAGCTTGCCCTGCCTCCGGATGCAGAGGCTACACTACTGAACGGCCGCCAGTGCTACTTTTTCACAAGGTGTGGTTGCATTGATTATGGCCACAACAAAATTAGATACAAGCCGAACAAGTGGTTCAGTGGCCTGGATTCAATTTTGAAGGACGAAAGCACGTACTACAATGCTTGCCTGTTGCAGATCTACGAAGCTGGTGCTGGAATTGGGTTTCACTCCGACAATGAAAAGGTTTACCACAGAAGCCCGATTAAAACAATCAACTTTTGTGGTGAGGCTGATTTTGTGGTCAAGGCCAAAGGGAGGCGTGATGTTGGAGTTAATGCCACATGTCACATGAAAACTGGCCAGTTCTTCACCATGGACTCGAACTTTCAATCTTACTACCAGCATTCCGTGCAAAACTGTAGTGAGGGTCGAATTTCCCTTACATTTAGGTATCACGTGAATAATATTGCTGGATTGCCTATTAAGCACATTTGTGGTGAATTCGGTGATACTGAATCCCTCTTTGACGTCCTGATTAGGCGAAGCTTCTCCTACTCTTCAAGGAATTTCCACACATTTCCTGTGCCAGGGGATGGGAACTGCTTTTGGCATAGTTTGGGAGCTTTACTAGGGGTTGATGGTGAGGAGCTAAAGAAGATTTCTGCAAGGGAAATTTCAAAAAATGAGATGCTGTCAAGAAATGCGAGCCTGTTGGTGCAAATGGAAAATAAGCAATACGCTGAGAGAGAATCAATTGCCGCATTTTGTAGAATCCAATCGGTTCACCTTGTCGTCCTGCTTCCTGATCAGAACTTTTCGTACGAGTTTCTGCCTATGCAAAATGCTGAGGTAACTCAACTTTTTGTCCAATTGAGTGGTGAACACTTTGAGCCTGCTCTTCCAATTAACGGCTGCGTTGTGAAGTCAATTGCGGAGACCCTAAACCAAACTGAAGCAAAAATTTTATCAGTCATTGGAAGGCCCAACAATCGCCTGATTCTGGAGGGCCTGGTTGAGGGGGAGGGCCTAAATATCGAAGATTTGGAAGCAGCCTTTTCGGTCTTTGGAATTTGTGCTCGGGTCAGTACAGAGAGAGGGGTGTTTACTCTAAACAAGGAAGGCAGTCTCCACGCGAACTATGAATTAAAGTCTGGGCATATTATGTATTTGAAAAAAGCCTCCAGCTCACAATTTGCGCCAATGACTCCTATACAGAACTTCAATGGTCAAGGTCCTGAGATTTTTCTGCGGGGCATAGTTAGCGAGGTTAATTACAAGCCTAGCTGGGAGCGAGCTAGGAATCTTGAAGAGTCTCTCTTGAATGGGACCACAGGCATCTTGTGTGACAGGACGATCAACCTTCAAAAAAACTGGCTAACTGAGGACAGGAGACTGAATGATGGCTCTAGGAATCTTGGGGTTGTTCTAGGGACTTTTGGTTCTGGAAAGAGTTCGCTGTTCAAGAGGTTTATTGTTAAGAATCCTTCCCGCTCTATCGTCTTCGTTTCACCCAGGAGATCACTTGCTGACCAGATTAAAGAGGATCTTGGGCTCAATACTAAAAGAGGGAAGTCACTTAGGGTGCGGGTTCTCACCTTGGAAAGCTTTGTTAAGGCTGTTTTTACTTTTAAGGCTGCCAGCATCGTTCTAGATGAGGTTCAACTGTACCCTCCTGGGTACTTAGATTTGGTGATGCTATGCCTCAGTCTGAATTGCCAGATCTATTTAGCTGGTGACCCGTGTCAGAGTGACTATGATTCAGCCAAGGATAGGGCTTTGTTTGACGGTTTGAGGGGAGATATTTTTGAAGTTCTTAGCGAAAAAAAATACAAGTTTAATATTTCAAGCCGCAGGTTTCAGTCTGAAATGTTCGTGGGACGACTCCCTTGCAGAATGGACACAAAAGCGATGACTGAGAATGAAAGTTTCCACTGGTTAGAGAGCATTGAATCAGCTGCGGAAGTGAGTAACACTGAGTATGATGTAGTTCTCGTCTCGAGCTTTGAGGAAAAGAAAATCGTGTGGGCTCATCTTGGAAGAGATTTAGAAGTTCTGACTTTTGGCGAGTCTACGGGTCTAACCTTCAATAGGGGCATCATTCTCATTTCTCATGAAAGTACCTTAACTAGTGAGAGAAGATGGATTACTGCACTCTCGAGATTTAGGCTTAATATCATCTTTGTGAATCTAGTTGGAAACTGTGTTGAGGATGTTTGCCAGGTCTTCCACGACAGAACTTTAAGCAGGTTTCTGACCAAGCGGGCAACGATTGCCAACATAGTCGATCAGCTACCAGGCTTTCCAGAGTTAACAAACGATTTCGGTGATAAGGTTGGCCGTTCTGAAGGTGTTATGGAAGCTAAGTTGTCTGGCGACCCCTGGTTGAAGACGGAGATTGATTTGCTTCAGGACGAGGATCAGGAGATGGCGGAGCTTGCTGAGGAAGTTAGGCATGAGCCATGGTTCAAGACCCATCTACCTCTCTTTGAGTTGGAATCTATTAGGGCAAGCTGGGTTCACAGGATAATGAATCGAGAATACCGTGAGGTACGTTGTGGCTCAGAGGTCACAACTCAGTTCCCTGATGATCACCCAAACAGAGCAAAGACGACTCTGGCAAATGCAGCAGAGAGATTTGAGGCCATATATCCAAGACACAGGGGAAGTGATTCAGTTACTTTCTTAATGGCAGTCAAAAAAAGGTTAAGCTTTTCTCAACCAGCCAAGGAGTCCGCCAAGTTAAACAGGGCGAAACCTTACGGGAAGTTTCTCGTAAGTGAGTTCCTCAAGCGGATACCATTGAGGGGTAATCTGGACCCGATTCTTTTCGCCAAGGCGAAGCGGGACTTTGAGGAAAAGAAGACGAGCAAAAGTGCAGCTGTTATTGAAAATCACTCTGGTCGCTCGTGTCGGGACTGGTTGGCCGATGTTGGTTTCATATTTATGAAGAGCCAGTTCTGCTCCAAGTGGGACAACAGATTCAGGGACGCAAAGGCTGGGCAGACTTTAGCTTGCTTCCACCACTCAATTTTATGCAGATTCGCCCCTTATATGAGATACATTGAGTACAAACTTCAGGCTGCGTTGCCCAGTAACTTGTATATCCACTCTGGTAAAAATCTTGAAGACCTGAATGAGTGGGTCATTAAAAACAAGTTTTTAGGAATGAGCACAGAATCTGACTATGAGGCTTTCGATTCAAGTCAGGACCACTTCATTTTGAGTTTCGAGATTGAAATCATGAAACACCTGCAGTTGCCTTGGGATCTAATCGAGGACTATGTTTACATTAAGACCCACCTTGGTTCGAAGTTGGGCAACTTTGCTATAATGCGCTTCACTGGCGAAGCTAGCACCTTCCTGTTCAACACAATGGCAAACATGCTCTTCACCTTTTTAAGGTATGATCTCAATGGCTCCGAGGCCATATGCTTTGCTGGTGATGACATGTGCGCGAACCGAAGACTTCGAGTCTCAAAAAAAAATGAAAATTTCTTGGGCAAAATCAAGCTCAAGGCAAAGGTGCAGTTCACTGAGAAACCCACTTTCTGCGGCTGGAATTTGTGCATGGATGGAATTTTCAAGAGGCCACAGTTAGTGCTTGAAAGGTTGTGTGTAGCAAGGGAGAAGGATAACCTTGCCAACTGCTTGGATTCTTATGCTATAGAGGTTGGGTATGCTTTTGCTCTAGGTGAGAAGGTTCTGCAATACATGGATGAGGAAGCTCTTCAGAACCATTACAGCTGTGTGCGGTTCATTATCAAGCACTCTCACCTGTTAAAGTCTAGTGTCCGTGACCTCTTCTTAGGGAGCATGTAGATTAGGTTTAACATTGTATTGTGTGAATAAGTATGGAATTTGTGTATGATAAGTTAATAGAAGCAGGATACATTAGAACCATTTTGCAGATTGATTTCCCCTTGATTGTGCACTGTATTGCCGGAGCAGGCAAAAGCACCCTCATTCGTGAGATTATTGAATCAGATAGCAGATTTGAGGCTTTCACATACGGAGTGCCGGATCCGGTGAATTTATCTGGGATCAGAATTCGAGGGGCTGAAGAGCTTGCTAACGCTAGGTCAGATTCCTTTAAGATCATTGACGAATACATTGGGCAACATAGGCCTGCAGGTACTGCAGTCTGTTTTGCTGATCCAAATCAGTTTCCATATTCTAGCCCAAACGCGCACTTCACTTGCTATCAGTCCAAACGTTTTGGTGATCAGACTTGTGCATTTCTCGGCAAATTGGACTGTGCAGCCTTTTCTTATAAGTCAGACCAGATAATTTTTGAGACTGTTTTTGAGGGATCAATTGAGGGTCAGATTGTCTGTTACGAGAAAGAAGTTTTTGATTTGCTAGACAGACACAGGGCTGAGTACAAGAGGGATTGTCAAATTAGAGGCTCAACCTTTGACATCGTCACCTTCATCACGGCTTCAGAAACGTTCAAACCTGAAGACAGATACAAAGTCTATCTCTGTTTGACGAGACATCGTTCAGTGCTTCGAATCCTAAGTCCGGAAGGAAAATTCCTTAGGGACGATGCCCAGTTTGACACCACCGCCTGATCACACTAAGGTACTTTTGCCAATTGCAGTGGGCCTGGGGGTGGGTGTCGTTATTTGGTGCCTAACTAGGTCAACTTTGCCCTTTGTTGGCGACAACGTTCATAGTCTCCCTCACGGTGGAAATTACCTGGACGGGACAAAGCGAATAAGCTACTGTGGCCCAAGGGACAGCTTTCCAAGCAGCAATCTGTTCAAAGGTGGAACTTTCTCTGCAATTTGTATAGTCATAATTTTGGTCACTGCCATCCATGTATCAGAGTTATTTAATAGGCCTAATCGCCGCACTTGTGGTTGTGGCTCTGCTGCGCATGCTTAATTCTGATCATGATGGTTGCTTGATCGTGATCACCGGTGAGTCCGTTGTAATCAAAAATTGTGTGTACACAAGTGACTTTATAGATTTGGTTAGGGGCCTTAAGCCACATAGTCATTGGAAGTCACTTTAGTTAGGTCGAGTGTATGTAGTTTGAAATAATAGAACTTCACTTGTGTTAGCATAGAGATGAGTACTTCTTCTGCAACTGCTGCTTCTACTTCCTTGAGCATTTCTTCTGGGACCTCTCCCGTCACTTCCAGTCAAAATGAACCTGTCATTTCACAGCTTGACTTTCCGCCAATTTCGTCCGGGGTGTCTGGAGCCGCAACAACCCCATCTGTTATCACCTCGGGTGTTGAGAACCCATTTAAGCCTAGGACCTCTTTTTCGTTACCATCGTTGACGGCTGGGCTTGGAACCCTTAGTGCAACCGCCACAATCTCAGCACCTGCTGCCACATCTGAGGTCAAGACCTCTTCACTTGAGGGCTGGAAGGAGAAGCTAAAGAGCAAAGATGAGAAGCCTAGGCGCGTCCTATCAGAGCCAGAGAGTCCTGGTTCTTTTGAAGTTGGTGGTGGGTCAGGGCCGCATGGAGTTAGCCCTAGCACTATGGTCTACTCCAGGCCAGAAGTGAAGAAGGGTTTAGATCTTGAGGCGACTGGAACGAGCCTGGGCGCGAGGCAGAGAATGGTATTTGAGGCTGCTCGGAAAAGAGCTCAGGCCAATTCGGAAACTGATAGGGAGAGTTTGGCACCACCCTTTGCTTCGGGAGACCCTTTTTCGAGGCCGAAAGTTCAAGATGTGCAAAGATTTTCGTATGAGCCGAGTTCTCCAGATGTTGCGACTGCTGAAAACATTGAATACATAAGGGCTGACTTGGTCAGAGCTGGTGTGCCTACAAAGGATATAACTTTTGCAATGTGGGACATAGCCCGCTACTGCGCTGATGCTGGATCTTCTGAGTCCACTGAGTTTGTCGGAACAAGCAGTTATGGGGGCCGTGTTGCCAGAATGGAAATTGCAGCAATAATTAAAAAGCACACAACATTAAGGAGGTTCTGTGGCTTTTACGCTAAAATTGTTTGGAATATCATGCTGGTCACAAACATTCCACCTTCTGGGTGGATGAAAAAGGGTTACAAAGAGAATACAAAGTTTGCTGCTTTTGACTTTTTTGTGCACGTCTCAAACAATGCTGCCCTGGAACCAGAAAATGGGCTGGTGAGAAAGCCATATCATGAGGAGCTGGTTGCTGCCCAGGCTAACAAGGGTGTTGTTTTGCACCGAACTGAGGCTGCCCAAGACAAGAATGCGTCAACGGCACATGAGGTTACAGGCGGCCGAGCTGGGCCACGCTCAAGGTTGACCTTGAAAGGGAAGGAGATGGACTGAGAGTATCAATCAAATGTTGGCCTGGAACCGTGGAAAGGCCTAAAAGAGTCCACGTACTAACTCACGGCTTTGGTTGGCCTAGAACCGTGGAGAGGCCTAAAAGAGTCCACGTGCCACTTTAAAGTTTTAGGGTGTGTTCAGTAGATAGTAGTAGTTTCCACTTCCTTGGTTCAAAGTCTAGAACCCAGGAGAGACTTAAAAGAGTCCTGGTTGGCGTTTAGCCTAGAGAAACCTCTGCACCTTATAGGCCACACCAACGTTAATCATTGTGTGCCCTGTAAAGGCAAGTTAACCGAGTTGTAGCGGCAACTTGGATTTGTTAGATGCAAGCGTAGATTTATGAGCTACGTCCTGTTGCTGGATTGCCACCGTTATCCCGCCGTTAAGGGAGTTACCCCTCTTTTCCCGCTTATGGGGGTTTTGTTAAGCGGGCGTGTGCCCTACCGAGAGGTGGGGTCCTTACGTTAAAGGTAGTTGGTGCTTAGAATAAGCCCCCATGGTTCCGACCTACCATGCTTAAAGCGATCGGTAGTTCTGGGTAAGAAACAACCCTGTGCTTGGTGGCTAAGCATGACCACTCAGTTTGACCAACTGGCGAGACAGGTCACGTTTCCCATTTCGATACAAAAGTGGGCGCATACCAAAGCGTTAAATTGTTCAACCATATTTCCAAACTAGTTTAGGGTCTGAGTGCTGGTCAATGGTGTTGTTTTGGGGGAGCTGTAAAGCAGCTTAAAGTGTCAATGGTGCACCTTGATGAAAGGTTTCCAGACTGTCCCTTGACTCCAATACCGACTGTGGCTCAGCCATAGGCAGGTTTGGAATGTGCTCAAGTCCTGGTGATCTGACTTTAAAAGAGCCAAATAAACCGCATTTCAACGCGTTATAGTGTTCGCTGGCAGACCGTACGAATAGTCTGTTTCACCAACCTAAGACCTAAATAATTGAATAAGGGAAGGTGATTAAACAAATTTGCTTTTTATCGCTAATTTTAGCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA
| 15,011
|
KY310580.1
|
Asian prunus virus 1
|
Jo,Y., Lian,S., Chu,H., Choi,H., Cho,J.K., Cho,W.K.
|
Seoul National University, Department of Agricultural Biotechnology
|
Korea
|
2017-07-10
|
JH
|
Asian prunus virus 1
|
Foveavirus
|
Betaflexiviridae
|
ssRNA(+)
| 8,870
|
GenBank
| null |
South Korea
|
South Korea
|
Prunus persica
| null |
2014-05-18
| null | null |
Asian prunus virus 1 isolate JH, complete genome
|
GAACGATCTATCAACAAACAACTTCGCTCGAAACAGACCTAAGTTGTTCGTAATGGCTTTGACATACCGAAGCCCGATAGAGGAAGTTCTTAATCGCTTCACTTCTGAAGAGCAATCCAGGGTTAGTTCAACATCAGTTTCACGTTTAACCCAATTTGAAGTCAACAACCATAAGCTCTTTTCATTCGCAATGAGTGAGAAGGCGAAAGAAAAATTGATTAAAGTTGGTATATACCTGAGTCCATTTTCCTTTGAACCACACTCACACCCTGTTTGCAAAACTTTGGAGAACCACATCTTGTATAATGTTCTTGTAAATAAGTTAGATAATAGTTTCTATGCTATAGGAATAAAAGGGTCTAAAGTCAATTTCCTGAAGAGCAGGTCAAAGAACCTGAGCATGCTTGAATACATGAACCGTATTGTTACAAGTGCTGACAAGTACCGATATGGTAGTGACTTCACGACTCTTAGCACCCAACAGATTGACAATCTTTGCTCCAAGCAGAGCCTTGAGAAGTGTGGAACATTGAGGGAGCTTGTGCCCTTGGTCAAAATGAGTAAAAAGAAAAGGAACTTCTTTCTGCATGATGAGCTGCATTATTGGAGCTCACATGACTTAATGCTCTTTCTTGATTCCATAAATCCTGACCACCTTCTTGCCACTGTTGTGTTTCCACCGGAGATTCTTGCTGGTGCTCAAGAGAGTCTGAATCCGTGGTGCTATAGCTTTCAGAGGCATGGAAGTAAGTTAACTTTCTTCCCTGATGGGGTGCAAAGCGAGTCATACACTCAACCCCTGAGCGCTGGCTATATACTTCAAGCTTCGAAAATCATTTGTCCAAGCGGTCAGATTTACTCTGTTGATCTGGTTTACTCGGCGTTTGCTCACCACATTATCAGCATCACCAAAGGGGACTTGCCTGGCCTAGAGCGTCGCTTCTTCTCTAACTTCGAGGCCACTGGTGTTAAACATCTATCTGGACTCTCTTACTCAGTAAGGGACTGTATTCCAGTCAGTTCTGATCTCATTTCAAAGCTATACAGGTACATTCGTACTCTTAAAAAGCCAGATCTGCAATCCTGTATGGCAAAACTAAGTCAGATTGTTCCAAACCCGACCGGCACTGAAATCAAATTCACTGAGGACTTTGCCCGTTTGACTATGGATGTACAGCCAATGCGCTCCATGCTCATGCCTGAGACAGCCAAGTTAATAGGGTCTCTTTTTGCCTCCTTCCTTCCATTCAAAATGGCCAGATTCTTTGACTGCTACAAAACTAGCTCACTTGATAAATTCATTCATGATCTCGAGCCCTTCAGTTTCTCCGTAGAAACAAAGGTTATCAGTAGCAAATCCAGTCCAATGTTTGAGGCAGTAACCCTTGGTGAAACGATGAGTTCAGAAGAGGTCCTGAAGATTTTGGCCAAGTTGGACATGGGGGCCCCAATGAGCCTAGAGGGATTAACAGGGAAATTCAAGTACTCAAGTGAGGCTTATCATGGGCTACATCATGTGCTGGATGGGTGTGGGCCGCATGTGTTTAGGAGATTGGTGAGGAAGGTTGCTGACTCCTTTTGCAATGAATTTGGAATTTACAGGAAGAGCAGTTACGTCTCTTCCGTTGCCATAACAGTCCTGCAGAGAAAAACCAACTCCAATTTGAGCTTCATTTTTGGGACTGACCTCAATCCAATGATCATTGGTTTTGTGAGGAACTACTTTGCTTCCAGGCGATCTTCTCTACTCATATGGTTTCACGACAGACCGGAATCTTGGTTCCAATTTTCGAGACTAAGGGCCAACCAAAAGTTTTTACGTTCTCCAATCTGGTCTAGTGAACTTGATTTGGCCGAATTTAGAGTGAGGAAGAATTTGGCGCTTGAGATTCTTGGCTTCAATAAAGGCAGCAATTTAAGAAAGTTGGGATCTTTCCAAACTGCCCCAACAAACACAAAGTCCCAAACCTCAATTCCTGAAGGAGCTTCAAGTCATCAGGGGAGCCAGGGAGGGCAGTGTAATGAAGCCAAACTTCAAATCAATTTTCAAAGGGAGCTAGAGTTCTGCATGGGATCTCTGCCAGAAGCTGAAAGTTTCAAAAGCCTTGCTTCATGTGTCGAGGAAATTGTTGAAACTGGCGATGAAGTCATACCATCGAGGGCAGGGCCTGGAAAAGATGGTTTAGTCTTTGGATGTATTCCTGCGGCATCCACGCCTGCATTCACATTCAGCTCAGCAAACCAGGAAGATAGACTCTTCTCTTCCGTTGTAGAGGAGAACGTTGTTGATGTCGGCATCCTCCCACCAATGGAGCTTGTCCTACCTTCAGATGCAGAGGCTACACCATTAAACGGTCGCCAATGCTACTTCTTCACCAGGTGTGGCTGCATTGATTATGGTCACAACAAAATCAGATACAAGCCGAACAAATGGTTCAGTGGCCTGGACTCAATTTTAAAAGATGAGAGCACATACTACAACGCCTGCCTGTTGCAAGTTTATGAAGCTGGTGCCGGGATCGGGTTTCATTCTGATAATGAAAAGGTTTACCACAGGAGTCCAATTAAAACAATCAACTTCTGTGGTGAGGCTGATTTTGTGGTGAAGGCCAAAGGGAGACGCGGTGTTGGAGTTAATGCTACATGCCACATGAGAACCGGTCAGTTCTTCACTATGGACTCAAACTTCCAGTCGTACTACCAACATTCTGTGCAAAATTGCAGTGAGGGTCGAGTTTCCCTCACATTTAGGTATCACGTGAACAGCATTGCCGGGCTGCCCATTAAACATACTTGTGGCGAGTTTGGAGATACAGAATCCCTCTTCGATGTTCTGATCAGAAGAAGCTTCTCCTACTCTTCAAGGAATTTTCACACGTTCCCTGTTCCAGGGGATGGGGATTGCTTTTGGCATAGTTTAGGGGCCTTGCTTGGGGTCGATGGTGAGGAGCTCAAGAAGATCTCTGCAAGAGAAATCTCAAAAAATGAAATGCTGTCAAGAAATTCAAGTCTGTCAATGCAAATGGAAAGTAAGCAATACGCTGAGAGAGAATCAATTGCAGCATTCTGTAAAATCCAATCTGTCCATCTTGTTGTTTTGCTTCCTGATCAAAATTTTTCATACGAGTTTTTGCCAATGCAGAATGCTGAGGTGACCCAACTTTTTGTTCAATTGAGTGGTGAGCACTTCGAGCCTGCTCTCCCCATCAATGGCTGTGTTGTAAAGTCAATTGCTGAGACCCTAAATCAAACTGAGGCGAAAATTTTGTCAGTCATCGGAAGGCCCAACAACCGCCTAATTCTGGAGGGTTTAGTTGAGGGGGAGGGTCTGAATATTGAAGATTTAGAGGCAGCCTTTTCGGTCTTTGGAATTTGCGCCCGGGTCAGCACGGAGAAAGGGGTTTTTACGCTTAACAAGGAGGGCAATCTCTATGCAAATTATGAATTGAAATCTGGGCACATCATGTATTTAAAAAAAAACTCCAGTTCACAATTTGCGCCAACAAATCCCATACAAAATTTTAATTGTCAGGGTCCTGAGATCTTCCTTCGGGGTATAGTGAGCGAAGTTGATTACAAACCAAGCTGGGAGCGGGCTAGGAATCTTGAAGAGTCTCTCCTCAATGGAACCACAGGCATTTTGTGTGACAAAATAATTAATCTTCAAAAGAACTGGTTAACTGAGGACAGGAAATTAAATGATGGCTCTCGAAGTCTTGGGGTTGTCTTAGGGACTTTTGGTTCTGGAAAGAGTTCGCTGTTCAAGAGGTTTATTGTCAAGAACCCATCCCGCTCAATTATCTTCGTCTCACCTAGGAGATCACTTGCCAACCAGATTAAAGAGGATCTTGGGCTCAACACAAAGAGAGGGAAATCACTTAGGGTGCGAGTTCTCACCTTGGAAAGCTTCATCAAGGCTGTCTTTTCTTTTAAGGCTGCCAGTGTCGTCTTGGACGAGGTTCAATTGTACCCTCCTGGGTACTTGGATTTGGTGATGCTGTGCCTTAGCCTGAATTGCCAGATTTATTTGGCTGGTGATCCATGCCAGAGTGACTATGATTCAGCCAAGGACAGGGCCTTGTTTGATGGTTTGAGGGGTGACATTTTTGAAGTTCTCAGTGAGAAGAGATACAAATTTAATATCTCAAGCCGCAGGTTTCAGTCTGAAATGTTTGTGGGGCGACTCCCCTGCAGAATGGATACAAAGGCCATGACTGAGAATGAAAGTTTCCATTGGTTGGAGAGCATTGAGTCAGCTGCAGAAGTGAGTAATACTGAGTATGATGTGGTTCTAGTCTCTAGCTTTGAGGAAAAGAAGATCGTGTGGGCTCATCTTGGAAGAGACCTGGATGTTCTGACTTTTGGTGAATCCACAGGTCTGACTTTCAATAGGGGCATCATCCTCATTTCTCATGAAAGCACTTTGACCAGTGAGAGGAGGTGGATTACCGCACTCTCAAGATTTAGGCTCAACATCATCTTTGTAAATCTGGTTGGAAATAGTGTTGAGGATGTTTGCCAGGTGTTCCACGATAGAACTTTGGACAGATTTTTAACTAAGCGAGCAACAATTGCCAACATAGTTGATCAGCTACCAGGTTTGCCAGAACTGACAAATGATTTCGGCGATAAGATTGGTCGCTCTGAAGGGGTGATGGAGGCTAAGTTGTCTGGGGACCCCTGGTTAAAGACAGAAATTGACCTACTTCAAGATGAGGATCAGGAAATGGAAGAACTTGCTGAGGAAGTTAGACATGAACCGTGGTTCAAGACCCACCTGCCCCTCTTTGAGTTGGAATCCATTAGAGCAAGCTGGGTTCACAGGATAATGAATCGGGAATATCGTGAGGTTCGTTGCGGCTCAGAGGTCACAACCCAGTTTCCTGATGACCACCCCAACGGAGCAAAAATGACTCTGGCAAATGCGGCAGAGAGATTTGAAGCCATATACCCGAGGCATAGGGGAAGTGACTCAGTCACATTTTTAATGGCAGTCAAGAAGAGGCTGAGTTTTTCCCAACCATCCAAGGAGTCTGCCAAGCTGAGTAGGGCTAAACCCTATGGAAAATTCCTTGTGGGTGAATTTCTCAAGAGAATCCCGCTAAGGGGTGATTTGGACCCGATTCTCTTTGCAAGGGCAAAACGAGACTTTGAGGAAAAAAAAACGAGTAAAAGTGCAGCCGTCATTGAGAACCATTCTGGCCGCTCGTGTCGGGACTGGTTGGCTGATGTTGGCTTCATATTTATGAAAAGTCAATTTTGTTCTAAGTGGGACAACAGATTTAGGGACGCAAAAGCGGGGCAGACCTTGGCTTGCTTCCATCATTCGATCTTGTGCCGATTTGCCCCATACATGAGATACATTGAGTATAAGCTTCAGGCCGTATTGCCTAGCAACTTGTACATCCACTCTGGAAAGAACCTTGAAGACCTAAATGAGTGGGTCATTAGAAACAAGTTCTCAGGGATGAGCACAGAATCTGATTATGAAGCTTTTGACTCGAGTCAGGATCACTTTATCCTGAGTTTCGAAATTGAGATTATGAAGCACCTACAGTTGCCATGGGACCTAATTGAGGATTACGTTTATATCAAAACCCATCTTGGCTCCAAGTTGGGCAACTTTGCCATAATGCGCTTCACTGGTGAAGCTAGCACCTTCCTGTTCAACACAATGGCAAATATGCTCTTCACTTTCTTGAGGTACGATCTCAATGGTTCTGAGGCAATATGTTTTGCTGGTGATGACATGTGCGCAAATCGGAGACTTAGGGTCTCAAAGAGGAATGAGAACTTCTTGGGTAAAATTAAGCTCAAAGCAAAGGTACAGTTTACAGAGAAGCCAACTTTTTGCGGCTGGAATCTGTGCATGGACGGAATTTTTAAGAGGCCACAATTGGTGCTTGAGCGGTTATGTGTAGCAAGGGAGAAGGACAACCTTGCCAACTGCCTGGATTCTTATGCCATAGAGGTTGGGTATGCCTTTGCTCTAGGCGAAAGAATCTTGCAATACATGGACGAGGAGGCTCTCCAGAATCATTACAGCTGCGTGCGTTTCATTATTAAGCATTCCCACTTGTTAAAGTCCAGTGTCCGTGACCTCTTCTTAGGGAGTATGTAGATTAGGTTTAACATTGTGTTGTGTGAATAAGTATGGAATTTGTGTATGATAAGTTAATAGCAGCAGGGTACATTAGAACTATTTTACAGATTGATTTTCCTTTGATCGTGCATTGTGTTGCTGGCGCAGGAAAAAGCACCCTCATCCGTGAGATTATTGAATCAGACAGCAGATTTGAAGCTTTTACCTACGGAGTGCCGGATCCGGTGAACTTGTCTGGGATTAGAATTCGGGGGGCTGAAGAGCTTGTTAACGCAAGGTCAGATTCCTTTAAAATCATTGACGAATATATTGGGCAGCACAGGCCTGAAGGCACCGCAGTTTGTTTCGCTGACCCAAATCAGTTTCCGTATTCCAGCCCAAACGCGCACTTCACCTGCTACCAGTCCAAGCGCTTTGGTGACCAGACTTGTGCATTTCTTGGTAAGCTGGATTGTGCAGCCTTCTCCTACAAGTCAGACCAAATCATCTTTGAGACTGTTTTTGAGGGGTCAATTGAGGGTCAAATTGTCTGTTACGAGGAAGAGGTTTTTGACTTATTAGACAGACATAGGGCTGACTACAAAAGGGATTGTCAAATTAGAGGTTCAACCTTTGACGTTGTTACTTTCATCACAGCCTCCGAAACGTTCAAGCCTGAGGACAGATACAAAGTTTATCTCTGTTTAACAAGACATCGTTCAGTGCTTCGAATTCTAAGCCCGGAAGGGAAATTTCTCAAGGACGATGCCCAGTTTGACACCACCGCCTGATCACACAAAGGTGTTTTTGCCAATTGCAGTGGGCTTTGGGGTGGGTATCGTTATTTGGTGTCTGACTAGGTCAACTCTGCCCTTTGTTGGTGACAACGTCCATAGTCTCCCTCACGGTGGGAATTACCTGGACGGCACAAAGCGGATTAGTTATTGTGGTCCGAGAGACAACTTCCCAAGTAGCAATCTTTTCAAGGGTGGGACCTTTCCTGCAATTTGCATAGTTATAATCTTGGTTACTGCCATCCATGTATCGGAGTTATTTAACAGGCCTAATCGCCGCACTTGTGGCTGTGGCTCTGCTGCACATGCTTAACTCTGATCGTGATGGTTGTTTGATTGTGATCACTGGTGAGTCCGTTGTAGTTAAGAATTGTGTGTACACGCGTGACTTTATAGACTTGGTTAGGGGTCTTAAACCGCACAGCCATTGGAAGTCACTGTAGTTAGGTCTAGTGCATGCATTTTGAAATAATAGAATTCCACTTGTATAAATTTAGAGATGAGTACCTCTTCTGCAACAGTTGTTTCTGATGTGTCAAGCACTACTTCTGAGACTCTTCCCGCCATCTCTAGCCAGAATGAGCCTGTTGTTTCACAGCTTGATTTCCCACCAATTTCCCATGGAGTATCTGGGATTTCCACAGCCCCATCCGTTACCACCTCAAGTGTTGAGAACCCATTCAAGCCTAGGACATCATTCTCACTACCATCGTTGACGGCTGGGCTTGGAACCCTTAGTGCAACTGCAACAAGCTCAACACCTGTTACAACATCTGAGGTTAAGACCTCTTCACTTGAAAGTTGGAGGGAAAGGTTGAAGAGCAAAGATGAGGAGCCTAGGCGTGTTTTGTCAGAACCAGAAAATATTGGCTCTTTTGAAGTTGGTGGTGGGTCAGGGCCGCATGGAGTTAACCCCAGCACTATGGTTCATTTCAAGCCAGAAGTAAAGAAGGGCTCAGACCTTGAGGCGACTGGGACAAGCCTGGGTGCGAGACAGCGGATGGTGTTTGAGGCGGCTCGGAAAAGAGCCCAGGCAAACTCAGAAGCGGACAGGGGGAGTTTGGCACCACCTTTTGCCTCAGGAGATCCCTTTTCGAGACCGAAAGTCCAGGACGTGCAAAGGTTTTCATATGAGCCAAGTTCCCCGGATATTGCAACAGCTGAAAACATTGAGTACATAAGAGCTGACTTGGTTAGAGCTGGGGTGCCTACAAAGGACATAACTTTTGCAATGTGGGACATTGCCCGCTACTGCGCTGATGCTGGGTCCTCTGAATCCACTGAGTTTGTTGGGACAAGCAGTTATGGAGGTCGGGTCGCCAGAATGGAAATTGCCGCCATAATCAAGAAGCACACAACACTGAGGAGGTTTTGTGGCTTTTACGCCAAGATAGTCTGGAACATCATGCTGGTGACGAATATTCCACCCTCAGGATGGATGAAGAAGGGCTACAAAGAGAACACGAAGTTTGCGGCCTTTGACTTCTTTGTGCATGTTTCAAACAACGCTGCCTTGGAACCAGAGAACGGGTTGGTTAGAAAACCATATCATGAGGAGCTGGTTGCTGCTCAAGCCAACAAGGGTGTTGTTTTACACCGAACTGAGGCCGCTCAGGACAAAAACGCTTCAACAGCCCATGAGGTCACAGGTGGTAGAGCTGGGCCACGCTCGAGGTTGACGTTGAAAGGGAAGGAGATGGATTGAGGGTCTGAACTAAGTGACGGCCTAAAAGAGTCCACGTGCCGTCTTATAGCCTTAGTGTGTGTTTTAGTAAATATTAGTAGTTTCCACTTCCTTAGGTTTCAAGTCTAGAACCCAGGAGAGACTTGAAAGAGTCCTGGTAGGCGTTTAGCCATGATGCACCTCTGCACTGCATAGGCCACACCAACGTCAATCATTGTGTGCCTTATGTGGGCAAGTTAACCGTGTTGTTGCGGCAATCGGAAATGTAAGATGCAAGCGTAGATTCATGAGCTACGTCCTGTGGTTGGAT
| 75,892
|
KR998046.1
|
Asian prunus virus 1
|
Pu,L., Bateman,M., Kinard,G.R., Li,R.
|
USDA-ARS, National Germplasm Resources Laboratory
|
USA
|
2016-06-30
|
APV_1_D2267
|
Asian prunus virus 1
|
Foveavirus
|
Betaflexiviridae
|
ssRNA(+)
| 9,474
|
GenBank
| null |
USA
|
USA
|
Prunus persica
| null |
2009-01-09
| null | null |
Asian prunus virus 1 isolate APV_1_D2267, complete genome
|
GATAAACAGAACGATCTATCAACAAACCACCTAGCTCGAAACAGACCTAAGTTGTTCGTAATGGCTTTGACATACCGAAGCCCGATAGAGGAAGTTCTTAATCGCTTCACTTCTGAAGAGCAATCCAGGGTTAGTTCAACATCAGTCTCACGTTTAACCCAATTTGAAGTCAACAACCATAAGCTCTTTTCATTCGCAATGAGTGAGAAGGCGAAAGAAAAATTGATTAAAGTTGGTATATACCTGAGTCCATTTTCCTTTGAACCACACTCACACCCTGTTTGCAAAACTTTGGAGAATCACATCTTGTATAATGCTCTCGTAAATAAGTTAGATAATAGTTTCTATGCTATAGGAATAAAAGGGTCTAAAGTCAATTTCCTGAAGAGCAGGTCAAAGAACCTGAGCATGCTTGAATACATGAACCGTATTGTTACAAGTGCTGATAAGTACCGATATGGTAGTGACTTCACGACTCTTAGCACCCAACAGATTGACAATCTTTGCTCCAAGCAGAGCCTTGAAAAGTGTGGAACATTGAGGGAGCTTGTACCCTTGGTCAAAATGAGTAAGAAGAAAAGGAACTTCTTTTTGCATGATGAGCTGCATTATTGGAGCTCACATGACTTAATGCTCTTTCTTGATTCCATAAATCCTGACCATCTTCTTGCCACTGTTGTGTTTCCACCGGAGATTCTTGCTGGTGCTCAAGAAAGTCTGAACCCGTGGTGCTATAGCTTTCAGAGGCATGGAAGTAAGTTAACTTTCTTCCCTGATGGGGTGCAAAGCGAGTCATACACTCAACCCCTGAGCGCTGGCTATATACTTCAAGCTTCAAAAATCATTTGTCCAAGCGGTCAGATCTACTCTGTTGATCTGGTTTACTCGGCGTTTGCTCACCACATTATCAGCATCACTAAAGGGGACTTGCCTGGCCTAGAGCGTCGCTTTTTCTCTAATTTCGAGGCCACTGGTGTTAAACATCTATCTGGACTCTCCTACTCAGTAAGGGACTGTATTCCAGTCAGTTCTGATCTTATTTCAAAGCTATACAGGTACATTCGTACTCTTAAAAAACCAGATCTGCAATCCTGTATGGCAAAACTGAGCCAGATTGTTCCAAACCCGACCGGCACTGAAATCAAATTCACTGAGGACTTTGCCCGTCTGACTATGGATGTACAGCCAATGCGCTCCATGCTCATGCCTGAGACAGCTAAGTTAATAGGGTCTCTTTTTGCCTCCTTCCTTCCATTCAAGATGGCCAGATTCTTTGACTGCTACAAAACTAGCTCACTCGATAAATTCATTCATGATCTTGAGCCATTCAGTTTCTCTGTAGAAACAAAGGTTATCAGTAGCAAATCCAGTCCAATGTTTGAGGCAGTAACCCTTGGTGAAACAATGAGCTCAGAAGAGGTCCTGAAGATTTTGGCCAAGTTGGACATGGGGGCTCCAATGAGCCTAGAGGGATTAACAGGGAAATTCAAATACTCAAGTGAGGCTTATCATGGGCTACACCATGTGCTGGATGGGTGTGGGCCACATGTGTTTAGGAGATTGGTGAGGAAGGTTGCTGACTCCTTCTGCAATGAATTTGGAATTTACAGAAAAAGCAGTTACGTCTCTTCCGTTGCCATAACAGTCCTACAGAGGAAAACCAACTCCAATTTGAGCTTCATTTTCGGGACTGACCTCAATCCAATGATCATTGGCTTTGTGAGGAACTACTTTGCTTCTAGGCGATCTTCTCTACTCATATGGTTTCACGACAGACCGGAATCTTGGTTCCAATTTTCGAGACTAAGGGCCAACCAAAAGTTTCTACGTTCTCCAATCTGGTCCGGTGAACTTGATTTGGCCGAATTTAGAGTGAGGAAGAATTTGGCGCTTGAGATCCTTGGCTTCAATAAAGACAGCAATTTAAGAAAGTTGGGATCTTTCCAAACTGTCCCAACAAACACAAAGTCCCAAACTTCAATTTCTGAAGGAGCTTCAAACCATCAGGGAAGCCAGGAAGGGCAGTGTAATGAAGCCAAACTCCAAATCAATTTTCAAAGGGAGCTCGAGTTCTGCATGGGCTCTCTGCCAGAAGCTGAAAGTTCCAAAAACCTTGCTTCATGTGTCGAGGAAGTTGTTGAAACTGGCGATGAAGTTATACCATCGAGGGCAGGGTCTGGAGCAGATGGTTTAGTCTTTGGCTGTATTCCTGCGGCATCCACGCCTACATTCACATTTAGCTCAGCAAATCAGAAAGATAGGCTTTTTTCTTCCGTTGTAGAGGAGAACGTTGTTGATGTCGGTGTCCTCCCACCAATGGAGCTTGTCCTACCTTCAGATGCAGAGGCTACACCATTAAACGGTCGCCAATGCTACTTTTTCACCAGGTGTGGTTGCATTGATTATGGTCACAACAAAATCAGATACAAGCCGAACAAATGGTTCAGTGGCCTGGACTCAATTTTAAAAGATGAGAGCACATACTACAACGCATGCCTGTTGCAAGTTTATGAAGCTGGTGCCGGAATCGGGTTTCATTCTGATAATGAAAAGGTTTACCACAGGAGTCCAATTAAAACAATCAACTTCTGTGGTGAGGCTGATTTTGTGGTGAAGGCCAAAGGGAGACGCGATGTTGGAGTTAATGCCACATGCCACATGCAAACCGGTCAGTTCTTCACTATGGACTCAAACTTCCAGTCATACTACCAACATTCTGTGCAAAATTGCAGTGAGGGTCGAGTCTCCCTCACATTTAGGTATCATGTGAACAGCATTGCCGGGCTGCCCATTAAACATACTTGTGGTGAATTTGGGGATACAGAATCCCTCTTCGATGTTCTGATCAGAAGAAGCTTCTCCTACTCTTCAAGGAATTTTCACACGTTCCCTGTTCCAGGGGATGGAAGTTGCTTTTGGCATAGTTTAGGGGCCTTGCTTGGGGTCGATGGTGAGGAGCTCAAGAAGATCTCTGCAAGAGAAATCTCAAAAAATGAAATGCTGTCAAGAAATTCAAGTCTGTCAATGCAAATGGAAAGTAAGCAATACGCTGAGAGAGAATCAATTGCAGCATTCTGTAAAATTCAATCTGTCCATCTTGTTGTTTTGCTTCCTGATCAAAATTTTTCATACGAATTTCTGCCAATGCAAAATGCTGAGGTGACCCAACTTTTTGTTCAATTGAGTGGTGAGCACTTCGAGCCTGCTCTCCCCATCAATGGCTGTGTTGTAAAGTCAATTGCTGAGACCCTAAATCAAACTGAGGCGAAAATTTTGTCAGTCATCGGAAGGCCCAACAACCGCCTAATTCTGGAGGGTCTAGTTGAGGGGGAGGGTCTAAATATTGAAGATTTGGAGGCAGCCTTTTCGATCTTTGGAATTTGCGCCCGGGTTAGCACGGAGAAAGGGGTATTTACGCTTAACAAGGAGGGCAGTCTCTATGCAAATTATGAGTTGAAATCTGGGCACATCATGTATTTAAAAAAAAACTCCAGTTCACAATTTGCACCAACAAATCCCATACAAAATTTTAATTGTCAGGGTCCTGAGATCTTCCTTCGGGGTATAGTGAGCGAAGTTGATTACAAACCAAGCTGGGAGCGAGCTAGGAATCTTGAAGAGTCTCTCCTTAATGGAACCACAGGCATTTTGTGTGATAAAATAATTAATCTTCAAAAGAACTGGTTGACTGAGGACAGGAAGTTGAATGATGGTTCTCGAAGTCTCGGGGTTGTTTTAGGGACTTTTGGCTCTGGCAAGAGTTCGCTATTCAAGAGGTTTATTGTCAAGAATCCCTCCCGCTCAATTGTCTTCGTCTCACCTAGGAGATCACTTGCCAACCAGATTAAAGAGGATCTTGGGCTCAACACAAAGAGAGGGAAGTCACTTAGGGTGCGAGTTCTCACCTTGGAAAGCTTCATTAAGGCTGTCTTTTCTTTTAAGGCTGCCAGTATTGTCTTAGATGAGGTTCAATTGTACCCTCCTGGGTACTTGGATTTAGTGATGCTGTGCCTTAGTCTGAATTGCCAGATTTATTTGGCTGGTGATCCGTGCCAGAGTGACTATGATTCAGCCAAGGACAGGGCCTTGTTTGATGGTTTGCGGGGTGACATTTTTGAGGTTCTCAGTGAGAAAAGATACAAATTTAATATCTCAAGCCGCAGGTTTCAGTCTGAAATGTTTGTGGGGCGACTTCCCTGCAGAATGGATACAAAGGCCATGACTGAGAATGAAAGTTTCCATTGGTTGGAGAGCATAGAGTCAGCTGCAGAAGTGAGTAATACTGAGTATGATGTGGTTCTAGTCTCTAGCTTTGAGGAAAAGAAGATTGTGTGGGCCCATCTTGGAAGAGACCTGGAGGTTCTGACTTTTGGTGAATCTACAGGTCTGACTTTCAATAGGGGCATCATCCTCATTTCTCACGAAAGCACTTTGACCAGTGAGAGGAGGTGGATCACTGCACTCTCAAGATTTAGGCTCAACATCATCTTTGTGAATCTAGTTGGAAATAGTGTTGAGGATGTTTGCCAGGTGTTCCACGATAGAACTTTGGACAGATTTTTAACGAAGCGAGCAACAATTGCTAACATAGTTGATCAGCTGCCAGGTTTGCCAGAACTGACAAATGATTTCGGCGATAAGATTGGTCGCTCTGAAGGGGTGATGGAGGCTAAGTTGTCTGGGGACCCCTGGTTAAAGACAGAAATTGACCTACTTCAAGATGAGGACCAGGAAATGGAGGAACTTGCTGAGGAAGTTAGACATGAACCGTGGTTCAAGACCCACCTGCCCCTCTTTGAGTTGGAATCCATTAGAGCAAGCTGGGTTCACAGGATAATGAATCGGGAATATCGTGAGGTTCGTTGCGGCTCAGAGGTCACAACTCAGTTTCCTGATGATCACCCTAATGGAGCAAAAATGACTCTGGCTAATGCGGCAGAGAGATTTGAAGCCATATACCCGAGGCATAGGGGAAGTGACTCAGTCACATTTTTAATGGCAGTCAAGAAGAGGCTGAGCTTTTCCCAACCATCCAAGGAATCTGCCAAGCTGAGTAGGGCTAAACCCTATGGAAAATTCCTTGTGGGTGAATTTCTTAAGAGAATCCCGCTAAGGGGTGATTTGGACCCGATTCTCTTTGCAAGGGCAAAACGAGACTTTGAAGAAAAAAAAACGAGCAAAAGTGCAGCCGTCATTGAGAATCATTCTGGCCGCTCGTGTCGAGACTGGTTGGCTGATGTTGGTTTCATATTTATGAAAAGTCAATTTTGTTCTAAGTGGGACAACAGATTTAGGGATGCAAAAGCGGGGCAGACCTTGGCTTGCTTCCATCATTCGATTTTGTGCCGATTTGCCCCATACATGAGATACATTGAGTATAAGCTTCAGGCCGTGTTGCCTAGCAACCTGTACATCCACTCTGGAAAGAACCTTGAGGACCTAAATGAGTGGGTCATTAGAAACAAGTTCTCAGGGATGAGCACAGAATCTGATTATGAAGCTTTTGACTCGAGTCAGGATCACTTCATTTTGAGTTTCGAAATTGAGATTATGAAGCACCTACAGTTGCCATGGGACCTAATTGAGGATTACGTTTATATCAAAACCCATCTTGGCTCCAAGTTGGGTAACTTTGCCATAATGCGCTTCACTGGTGAAGCTAGCACTTTCCTGTTCAACACAATGGCAAATATGCTCTTCACTTTCTTGAGGTACGATCTCAATGGTTCTGAGGCAATATGTTTTGCTGGTGATGACATGTGCGCAAATAGGAGACTTCGGGTCTCAAAGAGGAATGAGAACTTCTTGGGTAAAATTAAGCTCAAAGCAAAGGTGCAGTTTACAGAGAAGCCAACTTTTTGCGGCTGGAATCTGTGCATGGACGGAATCTTCAAGAGGCCACAACTGGTGCTTGAGCGGTTATGTGTAGCAAGGGAGAAGGACAACCTTGCCAACTGCCTGGACTCTTATGCCATAGAGGTTGGGTATGCCTTTGCTCTAGGCGAAAGAATTTTGCAATACATGGACGAGGAGGCTCTCCAGAATCATTACAGCTGCGTGCGTTTCATTATTAAGCATTCCCACTTGTTAAAGTCCAGTGTCCGTGACCTCTTCTTAGGGAGTATGTAGATTAGGTTTAACATTGTGTTTTGTGAATAAGTATGGAATTTGTGTATGATAAGTTAATAGAAGCAGGGTACATTAGAACCATTTTACAGATTGATTTCCCTTTGATCGTACATTGTGTTGCTGGCGCAGGGAAAAGCACCCTCATTCGTGAAATTATTGAATCAGACAGCAGATTTGAAGCTTTTACCTACGGAGTGCCGGATCCGGTGAACTTGTCTGGGATTAGAATTCGGGGGGCTGAAGAGCTTGTTAACGCGAGGTCAGATTCCTTTAAAATCATTGACGAATATATTGGACAGCACAGGCCTGAAGGCACCGCAGTTTGTTTTGCTGACCCAAATCAGTTTCCGTATTCCAGCCCAAACGCGCACTTTACCTGCTACCAGTCCAAGCACTTTGGTGACCAAACTTGTGCATTTCTTGGTAAGCTGGATTGTGCAGCCTTCTCCTACAAGTCAGACCAAATCATCTTTGAGACTGTTTTTGAGGGGTCAATTGAGGGTCAAATTGTCTGTTACGAGGAAGAGGTTTTTGACTTATTGGACAGACATAGGGCTGATTACAAAAGGGATTGTCAAATTAGAGGTTCAACCTTTGACGTTGTTACTTTTATCACAGCCTCAGAGACGTTCAAGCCTGAGGACAGATACAAAGTTTATCTCTGTTTGACAAGACATCGTTCAGTGCTTCGAATTCTAAGCCCGGAAGGGAAATTTCTCAAGGACGATGCCCAGTTTGACACCACCGCCTGATCACACAAAGGTGTTTCTGCCAATTGCAGTGGGCTTGGGGGTGGGTATTGTTATTTGGTGTCTGACTAGGTCAACTCTGCCCTTTGTTGGTGACAACGTCCATAGTCTCCCTCACGGTGGGAATTACCTGGACGGTACAAAGCGGATTAGTTATTGTGGTCCGAGAGACAACTTCCCAAGTAGTAATCTTTTCAAGGGTGGGACCTTTCCTGCAATTTGCATAGTTATAATCTTGGTTACTGCCATCCATGTATCGGAGTTATTTAATAGGCCTAATCGCCGCACTTGTGGCTGTGGCTCTGCTGCACATGCTTAATTCTGATCGTGATGGTTGTTTGATTGTGATCACTGGTGAGTCAGTTGTAGTTAAGAATTGTGTGTACACGCGTGACTTTATAGACTTGGTTAGGGGCCTTAAACCGCACAGCCATTGGAAGTCACTGTAGTTAGGTCTAGTGCATGTATTTTGAAATAATAGAATTCCACTTGTATAAATTTAGAGATGAGTACCTCTTCTGCAACAGTTGTTTCTGATGTGTTAAGCACTGCTTCTGAGACTCTTCCCGCCATCTCTAGCCAGAATGAGCCTGTTGTTTCACAGCTTGATCTCCCGCCAGTTTCCCATGGGGTATCTGGGATTTCCACAGCCCCATCCGTTGCCACCTCAAGTGTTGAGAACCCATTCAAGCCTAGGACATCATTTTCCCTACCATCGTTGACGGCTGGGCTTGGAACCCTTAGTGCAACTGCAACAAGCTCAACACCTGTTACAACATCTGAGGCTAAAACCTCTTCACTTGAAAGTTGGAGGGAAAGGTTGAAGAGCAAAGATGAGGAGCCTAGGCGTGTTTTGTCAGAACCAGAAAATATTGGCTCTTTTGAAGTTGGTGGTGGGTCAGGGCCGCATGGGGTTAACCCCAGCACTATGGTTCATTTCAAGCCAGAAGTAAAGAAGGGCTCAGACCTCGAGGCAACTGGGATAAGCCTGGGTGCGAGACAGCGGATGGTGTTTGAAGCGGCTCGGAAAAGAGCCCAGGCAAACTCGGAGGCGGACAGGGGGAGTTTGGCACCACCTTTTGCCTCAGGAGATCCCTTTTCGAGACCGAAAGTCCAGGACGTGCAAAGGTTTTCATATGAACCAAGTTCCCCGGATGTTGCTACGGCTGAAAACATTGAGTACATAAGAGCTGACTTGGTTAGAGCTGGGGTGCCTACAAAGGACATAACTTTTGCAATGTGGGACATCGCCCGCTACTGCGCTGATGCTGGGTCCTCTGAATCCACTGAGTTTGTCGGGACAAGCAGTTATGGAGGTCGGGTCGCTAGAATGGAAATTGCCGCAGTAATCAAGAAGCACACTACACTGAGGAGATTTTGTGGTTTTTACGCCAAAATAGTCTGGAACATCATGCTGGTAACAAATATTCCACCCTCAGGATGGATGAAGAAGGGCTACAAAGAGAACACGAAGTTTGCGGCCTTTGACTTCTTTGTGCATGTTTCAAACAACGCTGCCTTGGAACCAGAGAACGGGTTGGTTAGAAAACCATATCATGAGGAGCTGGTTGCTGCTCAAGCCAACAAGGGTGTTGTTTTACACCGAACTGAGGCCGCTCAGGATAAAAACGCTTCAACAGCCCATGAGGTCACAGGCGGTAGGGCTGGGCCACGCTCGAGGTTGACGTTGAAAGGGAAGGAGATGGATTAAGGGTCTAAACTAAGTGACGAAATTTGCTGTTGTTTAAATCTGTTGCTTTCAATTACGTTTTTAAAATTTGGAACAAATTTCTAGCTTCGGCCTAGAACCGTGGAGAGGCCTAAAAGAGTCCACGTGCCGTCTTATAGCCTTAGTGTGTGTTTTAGTAAATATTAGTAGTTTCCACTTCCTTAGGTTTCAAGTCTAGAACCCAGGAGAGACTTGAAAGAGTCCTGGTAGGCGTTTAGCCATGATGCACCTCTGCACTGCATAGGCCACACCAACGTCGATCATTGTGTGCCTTATGTGGGCAAGTTAACCGTGTTGTTGCGGCAATCGGAAATGTAAGATACAAGCGTAGATTCATGAGCTACGTCCTGTGGTTGGATTTCCACCGTTACCTCGTCGTTAAGAGGGTGACCCCTCTTTTCTCGCTTATGGGGGTATTGTTAAGCGAGCGTGCGACCCATTGAAAGGTGGGTTCCCTACGTTAAGGGTAGTTGTGGTTTAGAATAAACCTCCATGGTTCCGACCTGCCATGATTAAAGCGATCGGTAGTTCTGGGTTAAAAACAACCCTGTGCTTGGTGGCTAAGCATGACCACTCAGTTTGACCGACTGGCCAGACAGGTTACGTTTCCCATTTCGATATCAAAAGTGGGCGCATAACAAAGCGTTAAATTGTTCTTCTGCACGTTTCAAGCTTTCATTCTTTGAAGGTTTGAAATGGGCTCTAGTCCTGGTGATCTGACTTTAAAAGAGCCAAATAAACCGCATTTCAACGCGTTATAGTGTTCGCTGACAGACCGTACGAATAGTCTGTCTCACCAACCTAAGACCTAAATAATTGAATAAGGGAAGGTGATTAAACAAATTTGCTTTTTATCGCTAATTTTGC
| 81,484
|
KR998047.1
|
Asian prunus virus 1
|
Pu,L., Bateman,M., Kinard,G.R., Li,R.
|
USDA-ARS, National Germplasm Resources Laboratory
|
USA
|
2016-06-30
|
APV_1_D2363
|
Asian prunus virus 1
|
Foveavirus
|
Betaflexiviridae
|
ssRNA(+)
| 9,472
|
GenBank
| null |
USA
|
USA
|
Prunus persica
| null |
2009-01-09
| null | null |
Asian prunus virus 1 isolate APV_1_D2363, complete genome
|
GATAAACAGAACGATCTATCAACAAACCACCTAGCTCGAAACAGACCTAAGTTGTTCGTAATGGCTTTGACATACCGAAGCCCGATAGAGGAAGTTCTTAATCGCTTCACTTCTGAAGAGCAATCCAGGGTTAGTTCAACATCAGTCTCACGTTTAACCCAATTTGAAGTCAACAACCATAAGCTCTTTTCATTCGCAATGAGTGAGAAGGCGAAAGAAAAATTGATTAAAGTTGGTATATACCTGAGTCCATTTTCCTTTGAACCACACTCACACCCTGTTTGCAAAACTTTGGAGAATCACATCTTGTATAATGTTCTTGTAAATAAGTTAGATAATAGTTTTTATGCTATAGGAATAAAAGGGTCTAAAGTCAATTTCCTGAAGAGCAGGTCAAAGAACCTGAGCATGCTTGAATACATGAACCGTATTGTTACAAGTGCTGATAAGTACCGATATGGTAGTGACTTCACGACTCTTAGCACCCAACAGATTGACAATCTTTGCTCCAAGCAGAGCCTTGAAAAGTGTGGAACATTGAGGGAGCTTGTACCCTTGGTCAAGATGAGTAAGAAGAAAAGGAACTTCTTTCTGCATGATGAGCTGCATTATTGGAGCTCACATGACTTAATGCTCTTTCTTGATTCCATAAATCCTGACCACCTTCTTGCCACTGTTGTGTTTCCACCGGAGATTCTTGCTGGTGCTCAAGAAAGTCTGAACCCGTGGTGCTATAGCTTTCAGAGGCATGGAAGTAAGTTAACTTTCTTCCCTGATGGGGTGCAAAGCGAGTCATACACTCAACCCCTGAGCGCTGGCTATATACTTCAAGCTTCAAAAATCATTTGCCCAAGCGGTCAGATCTACTCTGTTGATCTGGTTTACTCGGCGTTTGCTCACCACATTATCAGCATCACTAAAGGGGACTTGCCTGGCCTAGAGCGTCGCTTTTTCTCTAATTTCGAGGCCACTGGTGTTAAACATCTATCTGGACTCTCCTACTCAGTAAGGGACTGTATTCCAGTCAGTTCTGATCTTATTTCAAAGCTATACAGGTACATTCGTACTCTTAAAAAACCAGATCTGCAATCCTGTATGGCAAAACTGAGCCAGATTGTCCCAAACCCGACCGGCACTGAAATCAAGTTCACTGAGGACTTTGCCCGTCTGACTATGGATGTACAGCCAATGCGCTCCATGCTCATGCCTGAGACAGCTAAGTTAATAGGGTCTCTTTTTGCCTCCTTCCTTCCATTCAAGATGGCCAGATTCTTTGACTGCTACAAAACTAGCTCACTCGATAAATTCATTCATGATCTCGAGCCCTTCAGTTTCTCTGTAGAAACAAAGGTTATCAGTAGCAAATCCAGCCCAATGTTTGAGGCAGTAACCCTTGGTGAAACAATGAGTTCAGAAGAGGTCCTGAAGATTTTGGCCAAGTTGGACATGGGGGCTCCAATGAGCCTAGAGGGATTAACAGGGAAATTCAAATACTCAAGTGAGGCTTATCATGGGCTACATCATGTGCTGGATGGGTGTGGGCCACATGTGTTTAGGAGATTGGTGAGGAAGGTTGCTGACTCCTTCTGCAATGAATTTGGAATTTACAGAAAAAGCAGTTACGTCTCTTCCGTTGCCATAACAGTCCTGCAAAGGAAAACCAACTCCAATTTGAGCTTCATTTTCGGGACTGACCTCAATCCAATGATCATTGGCTTTGTGAGGAACTACTTTGCTTCTAGGCGATCTTCTCTACTCATATGGTTTCACGACAGACCGGAATCTTGGTTCCAATTTTCGAGACTAAGGGCCAACCAAAAGTTTCTACGTTCTCCAATCTGGTCCGGTGAACTTGATTTGGCCGAATTTAGAGTGAGGAAGAATTTGGCGCTTGAGATTCTTGGCTTCAATAAAGACAGCAATTTAAGAAAGTTGGGATCTTTCCAAACTGTCCCAACAAACACAAAGTCCCAAACTTCAATTTCTGAAGGAGCTTCAAACCATCAGGGAAGCCAGGAAGGGCAGTGTAATGAAGCCAAACTCCAAATCAATTTTCAAAGGGAGCTCGAGTTCTGCATGGGCTCTCTGCCAGAAGCTGAAAGTTCCAAAAGCCTTGCTTCATGTGTCGAGGAAGTTGTTGAAACTGGCGATGAAGTTATACCATCGAGGGCAGGGTCTGGAGCAGATGGTTTAGTCTTTGGCTGTATTCCTGCGGCATCCACGCCTACATTCACATTTAGCTCAGCAAATCAGAAAGATAGGCTTTTTTCTTCCGTTGTAGAGGAGAACGTTGTTGATGCCGGTGTCCTCCCACCAATGGAGCTTGTCCTACCTTCAGATGCAGAGGCTACACCATTAAACGGTCGCCAATGCTACTTTTTCACCAGGTGTGGTTGCATTGATTATGGTCACAACAAAATCAGATACAAGCCGAACAAATGGTTCAGTGGCCTGGACTCAATTTTAAAAGATGAGAGCACATACTACAACGCATGCCTGTTGCAAGTTTATGAAGCTGGTGCCGGAATCGGGTTTCATTCTGATAATGAAAAGGTTTACCACAGGAGTCCAATTAAAACAATCAACTTCTGTGGTGAGGCTGATTTTGTGGTGAAGGCCAAAGGGAGACGCGATGTTGGAGTTAATGCCACATGCCACATGCGAACTGGTCAGTTCTTCACTATGGACTCAAACTTCCAGTCATACTACCAACATTCTGTGCAAAATTGCAGTGAGGGTCGAGTCTCCCTCACATTTAGGTATCATGTGAACAGCATTGCCGGGCTGCCCATTAAACATACTTGTGGTGAATTTGGAGATACAGAATCCCTCTTCGATGTTCTGATCAGAAGAAGCTTCTCCTACTCTTCAAGGAATTTTCACACGTTCCCTGTTCCAGGGGATGGGAGCTGCTTCTGGCATAGTCTAGGGGCCTTGCTTGGGGTCGATGGTGAGGAGCTCAAGAAGATCTCTGCAAGAGAGATCTCAAAAAATGAAATGTTGTCAAGAAATTCAAGTTTGTCAATGCAAATGGAAAGTAAGCAATACGCTGAGAGAGAATCAATTGCAGCATTCTGTAAAATTCAATCTGTCCATCTTGTTGTTTTGCTTCCTGATCAAAATTTTTCATACGAATTTTTGCCAATGCAAAATGCTGAGGTGACCCAACTTTTTGTTCAATTGAGTGGTGAGCACTTCGAGCCTGCTCTCCCCATCAATGGCTGTGTTGTAAAGTCAATTGCTGAGACCTTAAATCAAACTGAGGCGAAAATTTTGTCAGTCATCGGAAGGCCCAACAACCGCCTAATTCTGGAGGGTCTAGTTGAGGGGGAGGGTCTAAATATTGAAGATTTGGAGGCAGCCTTTTCGGTCTTTGGAATTTGCGCCCGGGTCAGCACGGAGAAAGGGGTATTTACGCTTAACAAGGAGGGCAATCTCTATGCAAATTATGAGTTGAAATCTGGGCACATCATGTATTTAAAAAAAAACTCCAGTTCACAATTTGCACCAACAAATCCCATACAAAATTTTAATTGTCAGGGTCCCGAGATCTTCCTTCGGGGTATAGTGAGCGAAGTTGATTACAAACCAAGCTGGGAGCGAGCTAGAAATCTTGAAGAGTCTCTCCTTAATGGAACCACAGGCATTTTGTGTGATAAAATAATTAATCTTCAAAAGAACTGGTTGACTGAGGACAGGAAGTTGAATGATGGTTCTCGAAGTCTTGGGGTTGTTTTAGGGACTTTTGGCTCTGGAAAAAGTTCGCTGTTCAAGAGGTTTATTGTCAAGAATCCCTCCCGCTCAATTGTCTTCGTCTCACCCAGGAGATCACTTGCCAACCAGATTAAAGAGGATCTTGGGCTCAACACAAAGAGAGGGAAGTCACTTAGGGTGCGAGTTCTCACCTTGGAAAGCTTCATTAAGGCTGTCTTTTCTTTTAAGGCTGCCAGTATTGTCTTAGATGAGGTTCAATTGTACCCTCCTGGGTACTTGGATTTAGTGATGCTGTGCCTTAGTCTGAATTGCCAGATTTATTTGGCTGGTGATCCGTGCCAGAGTGACTATGATTCAGCCAAGGACAGGGCCTTGTTTGATGGTTTGCGGGGTGATATTTTTGAAGTTCTCAGTGAGAAGAGATACAAATTTAATATCTCAAGCCGCAGGTTTCAGTCTGAAATGTTTGTGGGGCGACTTCCCTGCAGAATGGATACAAAGGCCATGACTGAGAATGAAAGTTTCCATTGGTTGGAGAGCATAGAGTCAGCTGCAGAAGTGAGTAATACTGAGTATGATGTGGTTCTAGTCTCTAGCTTTGAGGAAAAGAAGATTGTGTGGGCCCATCTTGGAAGAGACCTGGAGGTTCTGACTTTTGGTGAATCTACAGGTCTGACTTTCAATAGGGGCATCATCCTCATTTCTCACGAAAGCACTTTGACCAGTGAGAGGAGGTGGATCACTGCACTCTCAAGATTTAGGCTCAACATCATCTTTGTGAATCTAGTTGGAAATAGTGTTGAGGATGTTTGCCAGGTGTTCCACGATAGAACTTTGGACAGATTTTTAACGAAGCGAGCAACAATTGCTAACATAGTTGATCAGCTACCAGGTTTGCCAGAACTGACAAATGATTTCGGCGATAAGATTGGTCGCTCTGAAGGGGTGATGGAGGCTAAGTTGTCTGGGGACCCCTGGTTAAAGACAGAAATTGACCTACTTCAAGATGAGGACCAGGAAATGGAGGAACTTGCTGAGGAAGTTAGACATGAACCGTGGTTTAAGACCCACCTGCCCCTCTTTGAGTTGGAATCCATTAGAGCAAGCTGGGTTCACAGGATAATGAATCGGGAATATCGTGAGGTTCGTTGCGGCTCAGAGGTCACAACTCAGTTTCCTGATGATCACCCTAGCGGAGCAAAAATGACTCTAGCTAATGCGGCAGAGAGATTTGAAGCCATATACCCGAGGCATAGGGGAAGTGACTCAGTCACATTTTTAATGGCAGTCAAGAAGAGGCTGAGCTTTTCCCAACCATCCAAGGAATCTGCCAAGCTGAGTAGAGCTAAACCCTATGGAAAATTCCTTGTGGGTGAATTTCTTAAGAGAGTCCCGCTAAGGGGTGATTTGGACCCAATTCTCTTTGCAAGGGCAAAACGAGACTTTGAAGAAAAAAAAACGAGTAAAAGTGCAGCCGTCATTGAGAATCATTCTGGCCGCTCGTGTCGAGACTGGTTGGCTGATGTTGGTTTCATATTTATGAAAAGTCAATTTTGTTCTAAGTGGGACAACAGATTTAGGGATGCAAAAGCGGGGCAGACCTTGGCTTGCTTCCATCATTCGATTTTGTGCCGATTTGCCCCATACATGAGATACATTGAGTATAAGCTTCAGGCCGTGTTGCCTAGCAACTTGTACATCCACTCTGGAAAGAACCTTGAGGACCTAAATGAGTGGGTCATTAGAAACAAGTTCTCAGGGATGAGCACAGAATCTGATTATGAAGCTTTTGACTCGAGTCAGGATCACTTCATTTTGAGTTTCGAAATTGAGATTATGAAGCACCTACAGTTGCCATGGGACCTAATTGAGGATTACGTTTATATCAAAACCCATCTTGGCTCCAAGTTGGGCAACTTTGCCATAATGCGCTTCACTGGTGAAGCTAGCACTTTCCTGTTCAACACAATGGCAAATATGCTCTTCACTTTCTTGAGGTACGATCTCAATGGTTCTGAAGCAATATGTTTTGCTGGTGATGACATGTGCGCAAATAGGAGACTTCGGGTCTCAAAGAGGAATGAGAACTTCTTGGGTAAAATTAAGCTCAAAGCAAAGGTGCAGTTTACAGAGAAGCCAACTTTTTGCGGCTGGAATCTGTGCATGGACGGAATCTTCAAGAGGCCACAACTGGTGCTTGAGCGGTTATGTGTAGCAAGGGAGAAGGACAACCTTGCCAACTGCCTGGACTCTTATGCCATAGAGGTTGGGTATGCCTTTGCTCTGGGCGAAAGAATTTTGCAATACATGGACGAGGAGGCTCTCCAGAATCATTACAGCTGCGTGCGTTTCATTATTAAGCATTCCCACTTGTTAAAGTCCAGTGTCCGTGACCTCTTCTTAGGGAGTATGTAGATTAGGTTTAACATTGTGTTTTGTGAATAAGTATGGAATTTGTGTATGATAAGTTAATAGAAGCAGGGTACATTAGAACCATTTTACAGATTGATTTCCCTTTGATCGTACATTGTGTTGCTGGCGCAGGAAAAAGCACCCTCATTCGTGAAATTATTGAATCAGACAGCAGATTTGAAGCTTTTACCTACGGAGTGCCGGATCCGGTGAACTTGTCTGGGATTAGAATTCGGGGGGCTGAAGAGCTTGTTAACGCGAGGTCAGATTCCTTTAAAATCATTGACGAATATATTGGGCAGCACAGGCCTGAAGGCACCGCAGTTTGTTTTGCTGACCCAAATCAGTTTCCGTATTCCAGCCCAAACGCGCACTTTACCTGCTACCAGTCCAAGCGCTTTGGTGACCAAACTTGTGCACTTCTTGGTAAGCTGGATTGTGCAGCCTTCTCCTACAAGTCAGACCAAATCATCTTTGAGACTGTTTTTGAGGGGTCAATTGAGGGTCAAATTGTCTGTTACGAGGAAGAGGTTTTTGACTTATTGGACAGACATAGGGCTGATTACAAAAAGGATTGTCAAATTAGAGGTTCAACCTTTGACGTTGTTACTTTTATCACAGCCTCAGAGACGTTCAAGCCTGAGGACAGATACAAAGTTTATCTCTGTTTGACAAGACATCGTTCAGTGCTTCGAATTCTAAGCCCGGAAGGGAAATTTCTCAAGGACGATGCCCAGTTTGACACCACCGCCTGATCACACAAAGGTGTTTCTGCCAATTGCAGTGGGCTTGGGGGTGGGTATTGTTATTTGGTGTCTAACTAGGTCAACTCTGCCCTTTGTTGGTGACAACGTCCATAGTCTCCCTCACGGTGGGAATTACCTGGACGGTACAAAGCGGATTAGTTATTGTGGTCCGAGAGACAACTTCCCAAGTAGCAATCTTTTCAAGGGTGGGACCTTTCCTGCAATTTGCATAGTTATAATCTTGGTTACTGCCATCCATGTATCGGAGTTATTTAATAGGCCTAATCGCCGCACTTGTGGCTGTGGCTCTGCTGCACATGCTTAATTCTGATCGTGATGGTTGTTTGATTGTGATCACTGGTGAGTCAGTTGTAGTTAAGAATTGTGTGTACACGCGTGACTTTATAGACTTGGTTAGGGGCCTTAAACCGCACAGCCATTGGAAGTCACTGTAGTTAGGTCTAGTGCATGTATTTTGAAATAATAGAATTCCACTTGTATAAATTTGGAGATGAGTACCTCTTCTGCAACAGTTGTTTCTGATGTGTCAAGCACTGCTTCTGAGACTCTTCCCGCCATCTCTAGCCAGAATGAGCCTGTTGTTTCACAGCTTGATCTCCCACCAGTTTCCCATGGGGTATCTGGGATTTCCACAGCCCCATCCGTTACCACCTCAAGTGTTGAGAACCCATTCAAGCCTAGGACATCATTTTCACTACCATCGTTGACGGCTGGGCTTGGAACCCTTAGTGCAACTGCAACAAGCTCAACACCTGTTACAACATCTGAGGTTAAGACCTCTTCACTTGAAAGTTGGAGGGAAAGGTTGAAGAGCAAAGATGAGGAGCCTAGGCGTGTATTGTCAGAACCAGAAAATATTGGCTCTTTTGAAGTTGGTGGTGGGTCAGGGCCGCATGGGGTTAACCCCAGCACTATGGTTCATTTCAAGCCAGAAGTAAAGAAGGGCTCAGACCTCGAGGCGACTGGGATAAGCCTGGGTGCGAGACAGCGGATGGTGTTTGAAGCGGCTCGGAAAAGAGCCCAGGCAAACTCGGAGGCGGACAAGGGGAGTTTGGCACCACCTTTTGCCTCAGGAGATCCCTTTTCGAGACCGAAAGTCCAGGACGTGCAAAGGTTTTCATATGAACCAAGTTCCCCGGATGTTGCTACGGCTGAAAACATTGAGTACATAAGAGCTGACTTGGTTAGAGCTGGGGTGCCTACAAAGGACATAACTTTTGCAATGTGGGACATCGCCCGCTACTGCGCTGATGCTGGGTCCTCTGAATCCACTGAGTTTGTCGGGACAAGCAGTTATGGAGGTCGGGTCGCTAGAATGGAAATTGCCGCAGTAATCAAGAAGCACACTACACTGAGGAGATTTTGTGGTTTTTACGCCAAAATAGTCTGGAACATCATGCTGGTGACAAATATTCCACCCTCAGGATGGATGAAGAAGGGCTACAAAGAGAACACGAAGTTTGCGGCCTTTGACTTCTTTGTGCATGTTTCAAACAACGCTGCCTTGGAACCAGAGAACGGGTTGGTTAGAAAACCATATCATGAGGAGCTGGTTGCTGCTCAAGCCAACAAGGGTGTTGTTTTACACCGAACTGAGGCCGCTCAGGATAAAAACGCTTCAACAGCCCATGAGGTCACAGGCGGTAGGGCTGGGCCACGCTCGAGGTTGACGTTGAAAGGGAAGGAGATGGATTGAGGGTCTAAACTAAGTGACGAAATTTGCTGTTGTTTAAATTTGTTGCTTTCAATTACGTTTTTAAATTTGAAACAATTTCTAGCTTCGGCCTAGAACCGTGGAGAGGCCTAAAAGAGTCCACGTGCCGTCTTATAGCCTTAGTGTGTGTTTTAGTAAATATTAGTAGTTTCCACTTCCTTAGGTTTCAAGTCTAGAACCCAGGAGAGACTTGAAAGAGTCCTGGTAGGCGTTTAGCCATGATGCACCTCTGCACTGCATAGGCCACACCAACGTCAATCATTGTGTGCCTTATGTGGGCAAGTTAACCGTGTTGTTGCGGCAATCGGAAATGTAAGATACAAGCGTAGATTCATGAGCTACGTCCTGTGGTTGGATTTCCACCGTTACCTCGTCGTTAAGAGGGTGACCCCTCTTTTCTCGCTTATGGGGGTATTGTTAAGCGAGCGTGCGACCCATTGAAAGGTGGGTTCCCTACGTTAAGGGTAGTTGTGGTTTAGAATAAACCTCCATGGTTCCGACCTGCCATGATTAAAGCGATCGGTAGTTCTGGGTTAAAAACAACCCTGTGCTTGGTGGCTAAGCATGACCACTCAGTTTGACCGACTGGCCAGACAGGTTACGTTTCCCATTTCGATATCAAAAGTGGGCGCATAACAAAGCGTTAAATTGTTCTTCTGCACGTTTCAAGCTTTCATTCCTTGAAGGTTTGAAATAGGCTCTAGTCCTGGTGATCTGACTTTAAAAGAGCCAAATAAACCGCATTTCAACGCGTTATAGTGTTCGCTGACAGACCGTACGAATAGTCTGTCTCACCAGCCTAAGACCTAAATAATTGAATAAGGGAAGGTGATTAAACAAATTTGCTTTTTATCGCTAATTTTGC
| 81,485
|
KT893293.1
|
Asian prunus virus 1
|
Marais,A., Faure,C., Candresse,T.
|
INRA, Virology
|
France
|
2015-12-26
|
Bungo Q-1256-01
|
Asian prunus virus 1
|
Foveavirus
|
Betaflexiviridae
|
ssRNA(+)
| 9,473
|
GenBank
| 1
|
Japan
|
Japan
|
Prunus mume
| null | null | null | null |
Asian prunus virus 1 isolate Bungo Q-1256-01, complete genome
|
GGATAAACAGAACGATCTATCAACAAACCACCTAGCTCGAAACAGACCTAAGTTGTTCGTAATGGCTTTGACATACCGAAGTCCGATAGAGGAAGTTCTTAATCGCTTCACTTCTGAAGAGCAATCCAGGGTTAGTTCAACATCAGTCTCACGTTTGACCCAATTTGAAGTCAATAATCATAAGCTCTTTTCATTCGCAATGAGCGAGAAGGCAAAAGAGAAATTGATTAAAGTTGGTATATACCTGAGTCCATTCTCCTTTGAACCACACTCACACCCTGTTTGCAAGACTTTGGAGAATCACATCCTGTACAATATCCTTGTAAATAAATTAGATAATAGTTTCTATGCTATAGGAATAAAGGGGTCTAAAGTTAATTTCCTAAAGAGTAGGTCAAAGAACTTGAGCATGCTTGAGTATATGAACCGTGTTGTCACGAGTGCTGACAAGTATCGATATGGTAGTGACTTCACGACCCTTAGTACTCAACAGATCGACAATCTTTGCTCCAAACAGAGTCTTGAAAAATGTGGAACATTGAGGGAGCTTGTGCCCCTGGTCAAAATGAGCAAAAAGAAAAGGAACTTCTTTCTTCATGATGAGCTGCATTATTGGAGCTCACATGACTTAATGCTTTTCCTTGATTCCGTAAATCCTGACCACCTTCTTGCCACTGTCGTGTTTCCATCAGAGATTCTTGCTGGTGCTCAAGAAAGTTTGAACCCATGGTGCTATAGCTTCCAGAGGCATGGAAGCAAGTTAACTTTCTTCCCTGATGGGGTGCAAAGCGAATCGTACACTCAACCCCTGAGTGCTGGTTATATACTTCAAGCTTCGAAAATCGTTTGTCCAAGCGGCCAGATCTACTCTGTTGACCTGGTTTACTCGGCGTTCGCCCACCACATCGTCAGCATAACTAAAGGGGATCTGCCTGGTCTAGAGCGTCGGTTTTTTTCTAACTTCGAAGCCACTGGCGTTAAGCACCTATCTGGACTCTCCTACTCGGTAAGGGACTGCATTCCGGTCAGCTCAGAGCTCATTTCAAAGCTGTATAGATACATTCGTACACTCAAAAAACCAGATTTACAGTCTTGTATGGCAAAACTGAGCCAGATTGTCCCAAACCCAACTGGCACTGAGATCAAATTCACTGAGGACTTTGCCCGCCTAACTATGGATGTACAGCCGATGCGCTCCATGCTCATGCCTGAGACAGCCAAGCTGATAGGGTCTCTTTTTGCCTCCTTCCTTCCATTCAAGATGGCTAGATTCTTTGACTGCTACAAAGCTAGTTCACTTGACAAATTCATTCATGATCTCGAGCCTTTCAGTTTCTCTGTAGAAACAAAGATTATTAACAGCAGATCCAGCCCAATGTTTGAGGCAGTGACTCTTGGTGAAACAATGAGTTCAGAAGAGGTCTTGAAGATTCTGGCCAAGTTGGACATGGGGGCCCCAATGAGCCTGGAAGGATTAACCGGAAAGTTCAAGTATTCAAGTGAGGCTTATCATGGGCTGCATCACGTGCTGGATGGGTGTGGACCACATGTGTTTAGGAGATTGGTAAGAAAGATTGCTGACTCCTTCTGCAATGAATTTGGGATTTACAGGAAGAGCAGTTACGTGTCTTCCGTTGCCATAACAGTCCTGCAGAGGAAAACCAACTCCAATCTAAGCTTCATTTTCGGGGCTGACCTCAATCCAATGATCATTGGTTTTGTGAGGAACTACTTTGCTTCCAGGCGGTCTTCTTTACTCATATGGTTTCATGACAGACCAGAATCTTGGTTCCAATTTTCAAGACTAAGGGCCAATCAAAAGTTTTTACGCTCTCCAATCTGGTCCAATGAACTTGATCTGGCTGAATTTAGAATGAGAAAGAATTTGGTTCTTGAGATCCTTGGTTTCAATAAAGACGGCAATTTGAGAAAGCTGGGATCTTTCCAGACTGTCCTAACAAACACGAAGTCCCGAACTTCAACTCCTGAAGGAATTTCAAACCATCAGGGGAGTCAGAAAGGACTATGTGATGAGGCCAAACTCCAAGTTAACTTTCAAAAAGAACTCGAATTCTGCATGGGCTCTCTGCCAGAAGCTGACAGTCCCAGAAGCCTAACCTCATGTGTCGAGGCAGTGGTCGAAACCAACAATGAAGTTCCACCATTGGGGGCAGGGTCTGAAGCAAATGGTTTAGTCTTTGGATGTGTTCCTGCTGCATCCACGCCTGCATTTACATTCAGCTCAGCAAATCAGAAAGACAGGCTTTTTTCCTCCGTTGTAGAGGAGAACATCACTGATGTCGGTGTTCTTCCATCAATGGAGCTCGCCCTACCTTCAGACGCAGAGGCTACACCATTAAATGGTCGCCAGTGCTACTTTTTCACCAGGTGCAGTTGCATTGATTACGGCCACAACAAAATAAGATACAAACCAAACAAATGGTTCAGTGGTCTGGATTCAATTTTGAAGGATGAAAGCACATACTACAACGCATGCTTGTTACAAATTTATGAGGCTGGTGCCGGGATCGGATTTCATTCCGATAATGAGAAGGTTTACCACAGAAGTCCAATTAAAACAATCAATTTTTGTGGTGAGGCTGATTTCGTGGTTAAGGCTAAAGGAAGACGAGATATCGGAGTCAACGCCACATGTCACATGAGAACCGGTCAGTTCTTCACTATGGACTCGAACTTTCAGTCGTATTACCAGCATTCTGTACAAAATTGCAGTGAAGGTCGGGTTTCCCTCACATTTCGGTACCATGTGAACAACATCGCCGGGTTGCCCATTAAACACACTTGTGGTGAATTTGGAGATACAGAATCTCTCTTCGATGTCCTAATCAGAAGAAGCTTCTCCTACTCGTCAAGGAATTTTCACACGTTCCCCGTTCCAGGGGATGGGAATTGCTTTTGGCATAGTTTGGGAGCCCTGCTTGGGGTTGATGGTGAGGAGCTAAAGAAGATTTCTGCAAGAGAGATCTCAAAAAATGAAATGCTGTCAAGAAATGCAAGTCTGTCAATGCAGATGGAAAATAAGCAATACGCTGAGAGAGAATCAATTGCAGCATTCTGTAGAATCCAATCTATCCATCTTGTTGTTTTGCTTCCTGATCAAAATTTTGCATACGAATTTCTGCCGATGCAAAATGCTGAGGTGACCCAACTTTTCATTCAATTGAGTGGTGAGCACTTCGAACCTGCTCTCCCCATCAACGGCTGCGTTGTGAAATCGATTGCTGAGACCTTGAATCAGACTGAAGCAAAAATCTTGTCAGTCATTGGAAGACCCAACAACCGCCTAATTCTGGAGGGTTTAGTTGAGGGGGAGGGTCTTAATGTTGAAGATTTGGAGGCAGCCTTTTCAATCTTTGGAATTTGCGCCCGGGTCAGTACGGAGAAAGGGGTATTCACTCTTAACAAGGATGGCAATCTCCATGCAAATTATGAGTTGAAGTCTGGGCACATTATGTATTTGAAAAAAGCCTCCAGTTCACAATTTGCACCAACAAATCCCATACAAAATTTCAATTGTCAGGGTCCTGAGATTTTCCTTCGGGGTATAGTGAGCGAGGTTGATTACAAACCAAGCTGGGAGCGAGCTAGAAATCTTGAGGAGTCTTTCCTCAATGGAACCACAGGGATCCTGTGTGATAGAACAATCAATCTTCAAAAGAACTGGTTAACTGAGGACAGAAAATTGAATGATGGTTCTCGAAATCTTGGGGTTGTTTTAGGGACTTTTGGCTCTGGAAAGAGCTCGCTGTTTAAGAGGTTTATTGTTAAGAACCCTTCCCGCTCAATCATCTTCGTTTCACCCAGGAGGTCACTTGCTGACCAGATTAAAGAGGATCTTGGGCTCAACACAAGGAGGGGGAAGTCACTTAGGGTGCGAGTTCTGACCTTGGAAAGTTTTATTAAGGCTGTCTTTACTTTTAAGGCTGCAAGTATTGTGTTGGATGAAGTTCAACTGTATCCTCCTGGGTACTTGGATTTAGTGATGTTGTGCCTTAGTTTGAATTGCCAGATTTATTTGGCTGGTGATCCATGCCAGAGTGACTATGATTCGGCCAAAGATAGGGCCTTGTTTGATGGTTTGAGGGGTGACATTTTTGAAGTTCTCAGTGAGAAAAGATACAAGTTCAATATCTCGAGCCGCAGATTCCAGTCCGAAATGTTTGTGGGGCGACTTCCTTGCAGAATGGATACAAAGGCCATGACTGAGAATGAAAGTTTCCACTGGTTGGAGAGCATTGAGTCAGCCGCAGAAGTGAGCAACACTGAGTATGATGTGGTTCTCGTCTCGAGCTTTGAGGAAAAGAAGATTGTGTGGGCTCATCTTGGGAGGGACCTGGAGGTTCTAACTTTTGGTGAATCCACGGGTCTGACTTTCAATAGGGGCATCATTCTCATTTCTCATGAGAGCACTTTGACCAGTGAGAGGAGGTGGATTACCGCACTCTCTAGATTTAGGCTTAACATCATTTTCGTGAATCTGGTTGGAAATTGTGTTGAGGATGTTTGCCAGGTGTTCCATGACAGAACTTTAAGCAGATTCTTAACTAAACGAGCAACAGTCGCCAACATAGTCGATCAACTACCAGGTCTGCCAGAACTGACAAATGATTTCGGTGATAAGGTTGGCCGCTCTGAAGGGGTGATGGAAGCTAAGTTGTCTGGGGACCCCTGGTTAAAGACAGAAATTGACCTACTTCAAGATGAGGACCAGGAGATGGAAGAACTTGCTGAGGAAGTTAGCCATGAACCATGGTTCAAGACCCACCTGCCTCTCTTTGAGTTGGAATCCATTAGAGCAAGCTGGGTTCACAGGATAATGAATCGGGAATATCGTGAGGTACGTTGCGGCTCAGAGGTCACAACTCAGTTTCCTGATGATCATCCCAACGGAGCAAAGATGACTCTAGCGAATGCAGCAGAGAGATTTGAAGCCATATACCCAAGGCATAGGGGAAGTGACTCAGTAACATTTTTAATGGCAGTTAAGAAGAGGTTAAGCTTTTCCCAACCGTCCAAGGAATCTGCCAAACTGAATAGGGCCAAACCTTATGGGAAATTCCTTGTGGGTGAATTTCTCAAGAGAATACCGCTGAGGGGTGATTTGGATCCAATTCTTTTTGCAAAGGCAAAACGAGACTTTGAGGAAAAGAAAACAAGTAAGAGTGCAGCCATTATTGAAAATCATTCTGGTCGCTCATGTCGAGACTGGCTGGCTGATGTTGGTTTCATATTTATGAAGAGTCAATTTTGTTCTAAGTGGGACAACAGATTCAGGGATGCAAAAGCAGGGCAGACCTTGGCTTGCTTTCACCATTCGATTTTGTGCAGATTTGCTCCATACATGAGATATATTGAGTATAAACTTCAGGCTGTACTGCCTAGCAATTTGTATATCCACTCTGGGAAAAACCTTGAAGACTTGAATGAGTGGGTCATTAGAAACAAGTTCTCAGGAATGAGCACAGAATCTGATTATGAGGCTTTTGACTCAAGTCAGGACCACTTCATTCTGAGTTTTGAGATTGAAATCATGAAGCACTTACAGTTGCCATGGGATCTGATTGAGGATTATATTTATATCAAAACCCATCTTGGCTCCAAGTTGGGTAACTTTGCCATAATGCGCTTCACTGGCGAAGCTAGCACCTTTCTGTTCAACACGATGGCAAACATGCTTTTCACTTTCTTGAGGTACGATCTCAATGGTTCTGAGGCAATATGCTTCGCTGGGGATGATATGTGCGCAAATCGGAGACTCCGAGTCTCAAAGAGGAACGAGAACTTCCTGGGTAAAATTAAGCTCAAGGCTAAGGTGCAGTTTACAGAGAAGCCAACTTTTTGCGGCTGGAATCTGTGCATGGACGGAATCTTCAAGAGGCCACAACTGGTGCTTGAGCGGCTATGTGTGGCAAGGGAGAAGGACAACCTTGCTAACTGCCTGGACTCTTATGCCATAGAGGTTGGATATGCTTTTGCCCTAGGTGAAAGAATTTTGCAATACATGGACGAGGAGGCCCTTCAGAATCATTATAGCTGCGTGCGTTTCATTATCAAACACTCTCATTTATTGAAGTCCAGTGTCCGCGACCTCTTTTTAGGAAGTATGTAGATTAGGTTTAACATTGTGTTATGTGAATAAGTATGGAATTTGTATATGATAAGTTAATAGAAGCAGGGTACATTAGAACTATCTTGCAGATTGATTTCCCTTTGATTGTGCATTGTGTTGCTGGCGCAGGAAAAAGCACCCTCATTCGTGAGATTATTGAATCGGATAGCAAATTTGAGGCTTTTACTTACGGAGTGCCGGATCCGGTAAATTTGTCTGGGATTAGAATTCGAGGGGCTGAGGAACTTGCTAACGCAAGGCCAGATTCCCTTAAAATCATTGACGAATATATTGGGCAACACAGGCCCGAAGGCACCGTAGTTTGTTTCGCTGATCCAAATCAGTTTCCGTATTCTAGCCCAAACGCGCACTTCACCTGCTACCAGTCTAAGCGCTTTGGTGACCAAACTTGTGCATTTCTCGGCAAGCTGGATTGTGCAGCCTTCTCCTATAAGTCAGACCAAATTATATTTGAGACTGTCTTTGAGGGATCAATCGAAGGTCAAATTGTCTGTTACGAGAAAGAGGTCTTTGACTTGTTAGACAGGCACAGGGCTGATTACAAGAAAGATTGTCAAATTAGAGGTTCAACCTTTGACGTTGTTACTTTTATCACAGCCTCTGAGACGTTCAGGCCCGAGGACAGATACAAAGTCTATCTCTGTCTTACAAGACATCGTTCAGTGCTTCGAATTCTAAGCCCGGAAGGGAAATTCCTCAAGGACAATGCCCAGTTTGACACCACCGCCTGATCACACAAAGGTGTTTTTGCCAATTGCAGTAGGCCTTGGAGTGGGCGTCGTTATTTGGTGTTTAACCAGGTCAACTCTGCCCTTTGTCGGTGACAACGTTCATAGCCTCCCTCACGGTGGAAATTACCTGGACGGAACAAAGCGAATTAGTTACTGCGGTCCGAGGGACAGCTTCCCAAGTAGCAACCTTTTTAAGGGTGGAACCTTTCCTGCAATTTGCATAGTTATAATTTTGGTTACTGCCATCCATGTATCAGAGTTATTTAATAGGCCTAATCGCCGCACTTGTGGCTGTGGCTCTGCTGCACATGCTTAATTCTGATCGTGGTGGTTGTTTGATTGTGATCACTGGTGAGTCCGTCGTAGTTAGGAATTGTGTGTACACGCGTGACTTTATAGACTTAGTCAGAGGTCTTAAACCGCATAGCCATTGGAAGTCACTGTAGTTAGGTCGAGTGTATGTATTTTGAAATAATAGAACTTTACCTGTATAAACATAGAGATGAGCACCTCTTCTGCAACAGTTGTTTCTGATGTGTCAAGCACTACTTCTGAGACTCTTCCCGCTACTTCCGGCCAGAATGAGCCTGTTGTTTCACAGCTTGATCTTCCACCAGTTTCCTCTGGGGTATCTGGGGTTTCCACAGCTCCATCTGCTACCACCTCAAGTGTTGAGAATCCATTCAAGCCTAGGACTTCGTTCTCACTACCATCGTTGACGGTTGGGCTTGGAACCCTTAGTGCGACTGCAACAAGCTCGACACCTGCTATCACGTCTGAAGCCAAGACCTCCTCACTTGAAAGTTGGAAAGAAAGGCTGAAAAGCAAAGATAAGGAGCCTAGGCACGTTTTGTCAGACCCAGAGAATATTGGCTCTTTTGAAGCTGGTGGTGGATCAGGGCCGCATGGAGTTAACCCCAGCACCATGGTTTATTCCAAACCAGAGGTGAAAAAGGGCTCAGATCTTGAGGCGACTGGGATAAGCCTGGGTGCGAGGCAGCGGATGGTGTTTGAGGCGGCTCGGAAGAGGGCCCAGGCCAACTCGGAGGCGGACAAGGAGAGTTTGGCACCACCTTTTGCTTCAGGAGACCCTTTTTCCAGACCGAAAGTCCAGGATGTGCAGAGGTTCTCATATGAGCCGAGTTCTCCGGACGTTGCAACAGCTGAAAACATTGAGTACATAAGAGCTGACTTGGTTAGAGCTGGAGTGCCCACAAAGGACATAACTTTTGCTATGTGGGACATTGCCCGCTACTGCGCTGATGCTGGGTCTTCCGAATCCACTGAGTTTGTTGGAACAAGCAGTTATGGAGGTCGGGTCGCTAGAATGGAAATTGCAGCAGTAATCAAGAAGCACACAACACTGAGGAGGTTTTGTGGCTTTTACGCCAAAATAGTCTGGAATATCATGCTGGTGACGAACATTCCACCCTCAGGGTGGATGAAAAAGGGCTACAAAGAAAACACAAAGTTCGCTGCCTTTGACTTCTTTGTACATGTTTCAAACAACGCTGCCTTGGAACCAGAGAACGGGCTGGTTAGAAAGCCATATCATGAGGAGCTGGTTGCTGCTCAAGCCAACAAGGGTGTCATTTTACATCGAACTGAGGCCGCTCAAGATAAAAACGCTTCGACAGCCCATGAGGTCACAGGTGGTAGAGCTGGACCACGCTCGAGGTTGACCCTAAAAGGGAAGGAGCTGGACTGAGAGTTTCAATCGAGTGATGAAATCTGCTGTTATTTAACTTTGCTACTTTCAACTATATTTTAATTTAAAATAAGTATCTAGTTTCGGCCTAGAACCGTGGAGAGGCCTAAAAGAGTCCACGTGCCGTCTTAGAACCTTAGTGTGTGTCTTAGTAAATATTAGTAGTTTCCACTTCCTTAGGTTCCAGGTCTAGAACCCAGGAGAGACCTGAAAGAGTCCTGGTAGGCGTTTAGCCATGATGCACCTCTGCACCGCATAGGCCACACCAACGTCAATCATTGTGTGCCTTATGTGGGCAAGTTAACCGTGTTGTAGCGGCAACCGGGAATGTAAGATGCAAGCGTAGATTTATGAGCTACGCCCTGTGGTTGGATTTCCACCGTTACCTCGTCGTTAAGAAGGTGACCCCTCTTCTCTCGCTTATGGGGGTATTGTTAAGCGAGCGTGCGACTCGTTGAAAGATGGGTTCCCTACGTTAAGGGTAGTTGTGGTTTAGAATAAACCTCCATGGCTCCGACCTGCCATGATTAAAGCGATCGGTAGTTCTGGGTAAGAAGCAACCCTGTGCTTGGTGGCTAAGCATGACCACTCAGTTTGACCAACTGGCCAGACAGGTTACGTTTCCCATTTCGATATCAAAAGTGGGCGCATAACAAAGCGTTAAATTGTTCTTCTGCACGTTTCAATCTTTCATTATTGAAGGTTTGAAATAGGCTCTAGTCCTGGTGATCTGACTTTAAAAGAGCCAAATAAACCGCATTTCAACGCGTTATAGTGTTCGCTGACAGACCGTACGAGTAGTCTGTCTCACCAACCTAAGACCTAAATAATTGAATAAGGGGAGGTGATTAAACAAATTTGCTTTTTATCGCTAATTTTTGCT
| 84,421
|
FJ824737.1
|
Asian prunus virus 1
|
Marini,D.B., Gibson,P.G., Scott,S.W.
|
Clemson University, Entomology, Soils and Plant Sciences
|
USA
|
2009-08-15
|
tatao5
|
Asian prunus virus 1
|
Foveavirus
|
Betaflexiviridae
|
ssRNA(+)
| 9,409
|
GenBank
| 1
|
USA
|
USA
|
Prunus persica
| null | null | null | null |
Asian prunus virus 1 isolate tatao5, complete genome
|
GATAAACAGAACGATCTATCAACAAACTACCTAGCTCGACAAACAGACCTAAGTTGTTCGTATGGCTTTGACATACCGAAGTCCGATAGGGGAAGTTCTTAATCGCTTCACATCTGAGGAGCAATCCAGGGTTAGTTCAACATCGGTTTCACGTCTGACCCAATTTGAAGTCAACAATCATAAGCTTTTCTCATTCGCAATGAGCGAGAAGGCTAAAGAAAAGTTGATCAAAGTTGGCATATACCTGAGTCCGTTCTCTTTTGAACCACACTCACACCCTGTTTGCAAAACTTTGGAGAATCACATTTTGTACAATATTCTTGTAAATAAGTTGGATAATAGTTTTTATGCTATAGGAATAAAGGGGTCTAAGGTCAACTTTCTGAAAAGCAGGTCAAAAAACCTGAGCATGCTTGAATACATGAACCGTATCGTCACTAGTGCCGACAAGTACCGATATGGTAGCGACTTTACGACCCTCAGCACTCAACAAATTGATAATCTCTGTTCCAAGCAAAGTCTTGAAAAATGTGGAACATTGAGAGAGCTCGTGCCCTTGGTCAAAATGAGCAAGAAGAAAAGAAATTTCTTTCTGCATGATGAGCTTCATTATTGGAGTTCACATGACTTGATGCTTTTCCTAGATTCAATAAATCCTGACCACCTCCTTGCTACTATTGTGTTCCCACCAGAGATTCTTGCTGGTGCTCAAGAAAGTCTGAACCCATGGTGTTATAGCTTCCAAAGGCATGGTAGCAAGCTAACTTTCTTTCCTGATGGGGTGCAAAGCGAGTCATACACTCAACCTTTGAGCGCAGGTTACATACTTCAGGCTTCAAAAATCGTCTGTCCAAGTGGCCAAGTTTACTCTGTTGATTTGGTTTACTCAGCATTCGCCCACCACATTGTTAGCATCACTAAAGGGGATCTGCCTGGTCTAGAGCGTCGTTTCTTTTCAAATTTCGAGGCCACAGGCGTGAAACACTTATCTGGGCTCTCTTACTCAGTGAGGGACTGTATTCCGGTTAGCTCAGAACTCATTTCAAAGCTGTACAGGTACATTCGCACACTTAAAAAACCAGACTTGCAGTCCTGTATGGCAAAACTGAGCCAGATTGTTCCAAACCCCACAGGCACTGAGATCAAATTTACTGAGGATTTTGCCCGTCTGACTATGGACGTGCAGCCTATGCGATCCATGCTCATGCCTGAAACGGCCAAGCTGATAGGGTCTCTTTTCTCTTCCTTCCTTCCTTTCAAAATGGCTAGGTTCTTTGATTGCTACAAGGCCTGCTCACTGGATAAGTTCATTCATGATCTTGAACCTTTTAGTTTCTCTGTGGAAACGAAGGTTATCAATAGCAGATCCAACCCGATGTTTGAGGCTGTGACCCTTGGTGAAACAATGAGTTCAGAGGAGGTCCTAAAGATCTTGGCCAAACTAGACATGGGGGCCCCAACAAGCTTAGAGGGGTTGACTGGAAAATTCAAGTATTCAAGTGAGGCCTATCATGGACTGCATCATGTTTTGGATGGATGTGGGCCGCATGTGTTTAGGAGGTTGGTGAGAAAGATTGCTGACTCCTTCTGCAATGAGTTTGGAATTTACAGGAAGAGCAGTTACGTGTCCTCCGTAGCTATCACAGTCTTGCAAAGAAAGACCAATTCCAATCTGAGTTTCATCTTCGGAACTGATCTCAACCCAATGATTATTGGCTTTGTAAGAAATTACTTTGCCTCCAGGCGGTCTTCTTTATTAATATGGTTTCATGATAGGCCAGAGTCTTGGTTTCAATTTTCGAGATTGAGAGCCAACCAGAAATTTTTGCGCTCCCCAATCTGGCCTAATGATCTCGGTTTGGTTGAATTCAGAATGAGAAAGAACTTGGCGCTCGAAATTTCAAACTTTGATAGAAACAGCAACTTGAGGAAGTTGGGATCTTTCCAGACTGCTCCAACAAATTCGAAGTCCAATACTTCATCTTCTGAGGGAGCCTCAAATCATCAGAGGGAACAGAGAGACCAATGTGATGAAGCCACCCTCCAAGTCAATTTTCAAAGGGAAATTGAGTTCTGCATGGGCTCTCTGCCGGAAGCTAACAGCTTCAAGAGCTTCACTCCATGTGTTGAGGCAGTTGCTGAGACTAGTTATGAAGTTCAGCCATTGGAGCCGGAACCTGAAGCAAATGGCTTGGTCCTTGGGTGCATTCCTGATGCATCTACCCCTGCCTTCACCTTCAACTCAGCAAACCAGAAGGACAGGTTATTCTCTTCCGTTGTGGAGGAGAATATTACTGACATCGGCATTCTCTCACCAATGGAGCTCGTCCTGCCTTCAAGTGCAGAGGCCACACCATTAAATGGTCGCCAATGCTACTTCTTCACCAGGTGTGGCTGCATTGACTATGGCCACAACAAAATCAGATACAAGCCGAACAAATGGTTCAGTGGCCTGGATTCAATTTTGAAAGATGAGAGTACGTACTATAATGCATGCCCGTTGCAAATCTACGAAGCTGGCGCCGGAATTGGGTTTCATTCTGACAATGAGAAGGTCTATCATAGAAGTCCAATCAAGACAATCAACTTCTGTGGTGAGGCAGATTTTGTTGTTAAGGCCAAAGGAAAACGCGATGTTGGAGTTAATGCTACCTGCCACATGAAAACCGGCCAGTTTTTCACTATGGACTCAAACTTTCAGTCGTATTACCAACATTCTGTGCAAAATTGTAGTGAGGGTCGTGTTTCCCTCACATTTAGGTACCACGTGAACAACATTGCCGGGCTGCCCATCAAACACACCTGTGGTGAATTTGGAGACACCGAATCCCTCTTTGATGTCCTAATTAGGAGAAGCTTTTCTTACTCTTCAAAGAATTTTCACACTTTTCCCGTTCCAGGGGATGGGAGCTGTTTTTGGCACAGTCTGGGGGCTCTGCTTGGAGTTGATGGTGAGGAGCTTAAAAAAATCTCAGCGAGAGAAATTTTAAAAAATGAGGTGCTATCAAGGAATTTGAGTCTGTCAGCGCAGATGGAAAATAAGCAATACGCTGAAAGGGAGTCGATTGCCGCATTCTGTAGAATTCAGTCCATCCACCTCGTTGTTCTGCTTCCCGACCAAAATTTCTCATATGAATTCCTGCCGATGCAAAATGCTGAAGTGACCCAACTCTTCGTCAAATTAAGTGGCGAGCATTTTGAGCCTGCTCTTCCCATCAACGGCTGCGTTGTGAAGTCAATCGCCGAGACCCTAAATCAAACTGAGGCAAAGATCTTGTCAGTCATTGGAAGACCTAACAATCGCCTAATTCTGGAGGGTCTAGTTGAGGGGGAAGGGCTAAACATTGAAGATTTGGAAGCAGCCTTTTCAGTCTTCGGAATATGTGCTCGAGTTAGCACAGAGAGGGGGGTATTCACACTGAACAAGGAGGGTAATCTCCATGCGAACTATGAATTGAAGTCTGGGCACATTATGTACTTAAAAAAAGCGTCAAGTTCGCAATTTGCGCCAACAAATCCAATACAAAATTTCAATGGTCAAGGTCCTGAGATCTTCCTCCGGGGCATAGTAAGCGAGGTTGATTATAAACCCAGTTGGGGACGAGCCAGAAATCTTGAAGAATCTCTCCTTAATGGAACCACAGGCATTTTGTGCGATAGAACGATCAATCTTCAAAAAAACTGGTTAACTGTGGACAGAAAACTGAATGATAATTCTCGGAATCTTGGGGTTGTTTTGGGAACCTTTGGCTCTGGAAAGAGCTCTCTGTTCAAGAGGTTTATTGTTAAGAATCCTTCCCGCTCGATTGTCTTTGTCTCGCCCAGGAGATCGCTTGCTGACCAAATTAAAGATGATCTTGGACTCAACACAAAAAGGGGTAAGTCACTTAGGGTTCGAGTACTCACTTTGGAGAGCTTCATTAAGGCTGTCTTCACTTTCAAGGCAGCCAGTGTTGTATTAGATGAGGTCCAACTGTACCCTCCTGGATACTTGGATTTGGTGATGTTGTGTCTCAGTTTAAACTGTCAGATCTATTTAGCTGGCGACCCATGCCAAAGTGATTACGATTCGGCCAAAGACAGGGCTTTGTTCGATGGCTTGAAGGGTGATATATTTGAGGTTCTCAGCGGGAAAAAGTATAAATTTAATGTCTCAAGCCGCAGGTTCCAGTCTGAAATGTTTGTGGGGCGACTTCCCTGCAGAATGGACACAAAAGCAATGACTGAAAATGAGAATTTTCACTGGCTGGAGAGTATTGAGTCAGCTGCAGAAGTGAGCAACACTGAGTATGATGTGGTCCTCGTTTCAAGCTTTGAGGAGAAGAAGATTGTGTGGGCTCACCTTGGAAGAGACCTGGAGGTTCTAACTTTTGGTGAATCTACAGGCCTGACCTTTAATAGGGGCATCATTCTCATTTCCCACGAAAGCACCTTAACCAGTGAGAGGAGGTGGATCACCGCACTCTCTAGATTCAGGCTCAACATTATCTTTGTGAATTTGGTCGGAAACTGTCTTGAGGATGCTTGCCAGGTATTTCATGATAGAACCCTGGACAGGTTTCTAACTAAGCGAGCAACAATTGCCAATATAGTCGATCAGTTACCAGGTCTGCCAGAGTTAACAAATGATTTTGGCGACAAGGTTGGTCGTTCTGAAGGGGTGATGGAAGCTAAGTTGTCTGGGGACCCCTGGCTGAAAACTGAGATTGATCTGCTTCAGGATGAGGATCAGGAGATGGAAGAGCTCGCTGAGGAGGTCAAACATGAACCATGGTTCAAAACCCATCTGCCTCTTTTTGAATTGGAATCCATTAGAGCAAGCTGGGTTCACAGGATAATGAATCGAGAATATCGTGAGGTGCGTTGCGGTTCAGAAACCACAACTCAATTTCCTGATGATCACCCCAGCGGAGCGAAAATTACTTTGGCAAATGCAGCAGAGAGATTTGAAGCCATATACCCAAGGCACAGGGGAAGTGATTCAGTCACCTTTCTAATGGCAGTCAAAAAAAGGCTGAGTTTTTCCCAACCATCAAAGGAGTCTGCCAAGCTGAACAGGGCGAAACCCTACGGGAAGTTCCTTGTGAGTGAGTTTCTTAAAAGAATACCATTGAGGGGCAATCTGGACCCTATCCTCTTTGCGAAGGCAAAGAGAGACTTTGAGGAAAAGAAAACAAGCAAAAGTGCAGCTGTAATTGAAAATCATTCTGGTCGTTCGTGCCGGGATTGGTTGGCCGATGTTGGTTTCATATTTATGAAGAGCCAGTTCTGTTCCAAGTGGGACAACAGATTTAGGGATGCAAAGGCAGGGCAAACTTTAGCTTGCTTTCACCATTCAATTCTGTGCAGATTTGCCCCATACATGAGGTACATTGAGTACAAGCTTCAGGCTGCATCGCCCAGCAACTTGTACATTCATTCTGGCAAAAACCTTGAAGATCTGAATGAGTGGGTGATCAGGAACAAGTTCTCGGGAATGAGCACGGAATCTGACTATGAGGCTTTCGACTCGAGCCAGGATCACTTTATTTTGAGCTTCGAGATTGAGATTATGAAGCATCTGCAACTGCCTTGGGACTTAATTGAGGATTATGTCTACATCAAGACTCACCTTGGTTCAAAGTTGGGGAACTTTGCTATAATGCGTTTCACTGGCGAGGCTAGTACCTTTCTCTTCAATACAATGGCAAACATGCTTTTCACTTTCTTGAGGTACGACCTAAATGGTTCTGAGGCCATATGTTTTGCTGGCGATGACATGTGCGCAAATCGAAGGCTTCGAGTTTCAAAGAAAAATGAGAATTTCTTGGGCAAGATCAAGCTTAAGGCAAAGGTGCAGTTCACTGAGAAGCCAACTTTCTGCGGCTGGAATCTGTGCATGGATGGAATCTTCAAGAGGCCGCAACTAGTGCTTGAAAGGCTGTGTGTAGCAAGGGAAAAGGACAACCTCGCCAACTGCCTGGACTCTTATGCCATAGAGGTTGGGTATGCCTTTGCCCTGGGCGAAAAAATTTTGCAGTACATGGACGAGGAAGCCCTCCAGAATCATTACAACTGCGTCCGGTTTATCATTAAACATTCTCATTTATTGAAATCTAGTGTCCGTGATCTCTTCTTAAGTGGTATGTAGATTAGGTTTAACATTGTGTTGTGTGAATAAGTATGGAATTTGTGTATGATAAGTTAATAGAAGCTGGGTATATTAGGACTATTTTACAAATTGATTTCCCTTTAATTGTACATTGCATTGCTGGCGCAGGAAAGAGCACCCTCATCCGTGAAATCATCGAATCAGATAGCAGATTTGAGGCTTTCACTTACGGGGTGCCGGATCCGGTAAACCTGTCTGGAATTAGAATTCGGGGGGCTGAAGAACTAGCTAACGCAAGGCCAGAATCCTTTAAGATCATTGACGAATACATTGGACAACATAGGCCCGAGGGTACTGCAGTCTGCTTTGCTGACCCAAACCAGTTTCCGTATTCTAGCCCAAACGCACACTTTACCTGCTATCAGTCTAAGCGTTTCGGTGACCAGACCTGTGCATTTCTCGGAAAATTAGATTGTGCAGCCTTCTCCTACAAGTCAGACCAGATAATTTTCGAGACCGTTTTTGAAGGATCAATTGAAGACCAAATCGTCTGTTACGAGAAGGAGGTTTTTGACTTACTGGATAGGCACGGTGCCGATTACAAGAAGGATTGTCAAATCAGAGGCTCCACTTTCGACATTGTGACCTTCATCACATCTTCTGAATCCTTTGAGCCAGAAGATAGATACAAAGTTTACCTGTGTTTAACAAGGCATCGTTCTGTTCTGCGTATTTTGAGTCCTGAGGGCATGTTTTTAAGGGACAATGCCAAGTTTGACGCCACCTCCTGATAACACAAGAGTCCTCTTACCCATCGCCGTTGGTTTGGGAGTTGGCATAGTCATTTGGTGCTTAACAAGATCGACCCTGCCTTCAGTTGGCGACAACGTACACAGCCTCCCTCACGGGGGAAATTATTTGGACGGCACAAAGAGGATCAGTTATTGTGGGCCAAGGGATAGCTTCCCAAGCAGCAATCTCTTTAAAGGAGGTACTTTCTCGGCAATTTGCATTGTTGTGCTTTTAGTCTTCGCGATTCATGTATCAGAGTTATTTAATAGGCCTAACCGTCGCACTTGTGGTTGTGGGTCTGCTGCACATGCTTAATTCTAATCATGATGGTTGTTTAATAGTAATTACTGGTGAGTCCGTCGTAGTTAAAAATTGTGTGTACACGAGTGACTTCATTGAATTGGTTAAGGGTCTTAAGCCGCATAATCATTGGAAGTCACTGTAGTTAGGTCGAGTGTATGTAGTTTGAAATAATAGAACTTCACTTGTGTGAACGTAGAAATGAGTGTTTCTTCCGCAGCTGTAGTTTCTACTGTGTCGAGTACCTCTTCTGAGGCTGTTCCAGTCACTTCTAGTGAGAATGAACCTGTCATCTCACAGCTTGACCTTCCACCAATTTCGTCCGGAGTGTCTGGGGTTTCGACAACCCCATCTACCGCTACCTCAAGTGTTGAGAATCCTTTCAAGCCCAGGACATCGTTCTCACTACCGTCATTGACTGCTGGGCTAGGTACCTTGAGTGCAACTGCTACAAGCTCAGCACCTGCTGCCACATCTGAGGCTAGAACCTCCTCACTCGAGAGTTGGAAGGAAAAATTAAAGAACAAGGATGAGGAGCCTAGGCGCGTTTTGTCAGAACCAGAAAGTCTTGGTTCTTTTGAAGCCGGTGCCGGGTCAGGGCCACGTGGCGTTAGCCCCAGCACCATGATACATTCCAAGTTAGAAGTAAAGAAGGGCCCAGACCTTGAGGCGACAGGAGTGAGTCTGGGTGCAAGACAGAGGATGGTGTTTGAGGCGGCTCGGAAAAGAGCTCAGGCTAACTCAGAGGCGGACAGGGAGAGTTTGGCACCACCTTTTGCCTCAGGGGATCCCTTTTCAAGGCCAAAGGTTCAGGATGTGCAAAGATTTTCTTATGAGCCGAGTTCTCCGGATGTTGCAACTGCTGAAAACATCGAGTACATAAGAGCCGATCTAGTTAGAGCTGGTGTGCCTACAAAGGATATAACTTTTGCCATGTGGGACATTGCCCGATATTGCGCTGATGCTGGGTCCTCTGAGTCCACTGAGTTTGTTGGGACAAGCAGTTATGGGGGCCGGGTCGCCAGAATGGAAATTGCAGCAGTGATCAAGAAGCATACAACACTGAGGAGGTTCTGTGGCTTTTACGCCAAAATTGTTTGGAACATCATGCTGGTGACGAACATTCCACCTTCTGGGTGGATGAAAAAGGGCTACAAAGAAAACACAAAGTTTGCTGCTTTTGATTTCTTTGTGCATGTTTCAAACAATGCTGCCTTAGAACCGGAGAATGGGCTGGTTAGAAAGCCCTATCATGAGGAGTTGGTTGCAGCTCAAGCCAACAAAGGTGTTATTTTACACAGAGCGGAGGCTGCCCAGGACAAAAATGCTTCAACGGCCCATGAGGTTACTGGTGGCAGAGCTGGACCGCGTTCAAGGTTAACTTTGAAGGGAAAGGAGATGGACTGAGGACTTCAGTCAAGTGATGGTTTGGCCTAGAACCGTGGAGAGGCCTAAAAGAGTCCACGTACCGTCTTAGGGAGATAGTATGTGTTTTAGTAAATATTAATAGTTTCCACTTCCTTAGGTCCCAGGTCTAGAACCCAGGAGAGACCCAAAAGAGTCCTGGTGAGCGTTTAGCTATAAGAACCTCTGCACTGCATAGGCCACACCAACGCTAATCATTGTGTGCCTTATGTGGGCAAGTTAACCAGGTTGTGGCGGCAACCTGGAATGTTAGATGCAAGCGTAGATTTATGAGCTACGTCCTGTGGTTGGATTTCCACCGTTATCTCGTCGTTAAGAGAGTGACCCCTCTTTTCTCGCTTATGGGGGCATTGTTAGGCGGGCGTGTGACCCATTGAAAGATGGGTTCCCTGCGTTAAGGGTAGTTGTGGTTTAGAATAAGCCTCCATGGTTCCGACCTGCCATGATTAAAGTGATCGGTAGTTCTGGGTAAGAAATAACCCTGTGCTTGGTGGCTAAGCATGACCACTCAGTTTGACCGACTGGCCAGACAGGTCACGTTTCCCACTTCGATATCAAAAGTGGGCGCATATCAAAGCGTTAAATTGTTCATCCGCATATTTTGGACTCCCAATTCTTGGGGGTTTGAAATAGACTTTGGTCCTGGTTATCTGACCTTAAAAGAGCCAAATAAACCGCATTTCAACGCGTTATAGTGTTCGCTGACAGACCGTACAAATAGTCTGTCTCACCGACCTAAGACCTAAATAATTGAATAAGGGAAGGTGATTAAATAAATTTGCTTTTTATCGCTAATTTTGC
| 102,417
|
NC_028868.1
|
Asian prunus virus 2
|
Marais,A., Faure,C., Candresse,T.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2016-01-05
|
Bungo Q-1256-01
|
Asian prunus virus 2
|
Foveavirus
|
Betaflexiviridae
|
ssRNA(+)
| 9,362
|
RefSeq
| 1
|
Japan
|
Japan
|
Prunus mume
| null | null | null |
PRJNA485481
|
Asian prunus virus 2 isolate Bungo Q-1256-01, complete genome
|
GGATAACCAGAACAATCTATCAACAAACGACCCCGCTCGAAACAGACCTAAGTCGTTCGTAATGGCTTTAACATACCGAAGCCCGATAGAAGAAGTTCTTAATCGCTTCACCTCTGAGGAGCAGTCCAGGGTAAGTTCAACATCAGTGGCCAGATTAACCCAAGTTGAAGTTAGCAACCATAAGCTCTTTTCATTCGCATTGAGTGAGAAGGCCAAAGAGAAGCTAATTAAAGTTGGAATTTATTTGAGCCCATTCTCTTTTGAACCACATTCACATCCTGCCTGCAAAACATTGGAGAATCACATTTTATATAATATTTTAGCTAATAAATTAGATAACAGTTTTTATGCAATAGGTATTAAGGGTTCTAAGGTTAACTTCTTAAAAAGTAGGTCAAAGAACCTAAGCATGTTGGAGTATGTGAACCGTGTTGTCACCAGCGCAGATAAGTATAGGTATGGTAGTGACTTCACCACACTCAGCTCAAAGCAAATCGACAACCTCTGTTCAAAAAAAAGCCTTAGTGAGTGTGGCACATTAAAGGAACTGGTTCCACTGGTCAAAATGAGCAAGAAGAGGAATTTTTTCTTACATGATGAGCTTCACTACTGGAGCCCACAAGACCTGATGCTATTTTTGGACTCAGTCAATCCTGATCACTTGGTAGCAACGGTGGTCTTTCCTCCCGAGATATTAGCTGGAGCCAAGGAGAGTCTGAATCCATGGTGTTACTCATTTCACCGGCAGGGCAGCAAATTAACATTCTTTCCAGACGGGGTTCAAAGTGAGTCATACACACAACCCCTCAGCTCTGGTTACATCCTGAAGGCATCAAAAATTGTGTGTCCAAGTGGTCAGATCTACTCTGTGGATCTTGTGTATTCAGCCTTTGCACACCATGTTGTAAGCATAACAAAGGGAAATTTACCAGGGCTTGAAAGGAGGTTTTTTTCGAACTTTGAGGCAACCGGGGTGAAACACCTATCTGGCCTCTCCCACTCTGTGAGGGACTGCATTCCAGTCAGCACTGATCTAATATCTAAGATCTACAGATATATCAGGACCCTCAAGAAGCCTGACTTGCAGTCCTGCATGGCCAAGCTCAGCCAGATAGTCCCTAATCCAACTGGTGTTGAAATTAAATTCACAGAGGATTTCTCACGACTAGTCATGGAAATTCAGCCTTTAAAGTCCCTTCTTATGCCTGACACTGCGAAATTAATTGGGGCTTTGTTTGCTTCCTTTCTGCCCTTCAAAATGGCAAGGTTCTTTGACTGCTACAAATCAAGCTCATTAGACAAATTCATTCATGATTTGGAGCCATTTAGCTTTTCTGTGCCCACTGAAGTCATCAACTGCAATACAATGCCAGCTTTTGAAGCAATTTCTTTGGGTGAGTCAATGAGTCCAGAGGAAGTTATCCAAATATTGAACCGAATGGAAATGGGGGCTTTCGCTGGGTCATGTAACCTGGTGGGAAAGTTCAAATACTCAAATGAGGCCTATCATTGTCTTCACCACGTTCTTGATGGCTGCAAGCCTGAAGTTTTCAAGAGGTTGATTAGAAGAGTGGCAGGTTCCTTCTGTAATGAATTCGGCGTTTACCGGAAAAGCAGTTATGTGGCATCCGTTGCAATCAATGTGTTCCAAAGGAGGTCAAACCTAAATCTTGATTTTATCTTGGGGTCTGATCTAAATCAAAAGGTTGTTTGCATTGTCCGCAATTTCTTTTCCTCAAAGAAATCTTCTCAGCTTATCTGGTATTCCACAAATTCTATGGCTTGGTTCCGTTTTTCGAAGCTGAGAGCCAATCAAAAGTTTCTGAGATCACCAATTTTTCCTGCCTCCATGAACTGCAAAGACCTTTCAACTAGGAAAAATCTAATACTTGACTTTGAGGTTTTTGGTTTCTGTGCTGGCTTAAGAAAGCTTGGGTCTTCGGGAGTTTCTTCAGTGGTGCCTCCCAAACCTGTTCTTGGTGGCTTTGAGTTTGTACCCCCTGGGGAGGAGGCCCACGAGGATGATATTGAGGTGAAGTCGAATACCATGGCAAAGATGTTTGATCCATCACCACAGGCAGTTCTTGGAATTGAAGGTCCAGCTGCTGGTGTGCATGAGATTGACCCACAAGATCAAACTCTCTCTCCCAAAGCTGCTGACCTTGAGGAACGAAATGGTCTTATTTTTGGATGTGTTCCTGAACCAAGCTTGATGAATTTTTCATTCAGTTCAGCCAACCAGGGTGATCGCCTCTTCGCCAACATCGTGAATGAAAACATAGTAGATGTTGGAATTCTCCCTCCCACCGAACTGAAAATCCCATTGGATGCCAAGGTCACACAAATCAATGGTCGAGATTGCTACTTCTTCACAAGGTGCTCATGTATCGACTATGGCCACAATAAGATCAAGTACACTGCTAATAACTGGTTTTCAGGCCTAGATCAATTTCTATCCAATGAGGGAACATACTACAATGCGTGCCTTCTGCAAGTTTACAGGGCTGGCAGTGGAATTGGTTTTCACTCTGACAACGAAAAGGTCTACCATAGAAGTCCTATCAAAACTGTCAATCTGTGTGGAGAGGCAGACTTCCTTGTTAAAGCTAAGGGTAGGAGGGACTTAGGGACTGTTGCAAGAGGACATCTCTTTCCAGGACACTATTTCACAATGGATTCAAATTTCCAGTCTTACTACCAACATTCGGTCCAAGATTGCAGTGAGGGGAGGGTCTCCTTAACTTTCCGCCATCATGTAAACAATGTCACAGGACTGCCAATCAAACATACTTGTGGAGAGTTTGGTGATACTGAGATTTTGTTTGATGTGCTCATAAGAAGGAGTTTCACCTATGCAGCAAAAAACTTTCATACCTTCCCAGTCCCTGGGGATGGCAGTTGCTTTTGGCATAGTATGGGGGCTCTGCTGGGAGTTGATGGTGAGGAATTAAAGAAGATATCTGCGAGAGAGATCCAGAAGAACGAAATTTTACTATCCAACCTGAGCCTACGTCAGCAGATGGCAAATAAGCAGTATGCTGAAAGAGAGTCAATTGCGGCTTTCTGCAGGATCCAATCAATCCATTTGGTTGTTCTGCTTCCAGGCAATAATTTCTCTTATGAGTTTCTTCCGTCACAAAATCCTGAAGTCACCCAACTGTTTGTCAAGCTAACGGATGAACACTTCGAGCCTGCTTTGCCAGTGAATGGATGCGTTGTCAAGTCAATTGCTGAAACCCTTAATCAAACCGAAGCAAAGATCTTGTCAGTGATTGGGAGACCCACAAATAGAATGATTCTCGACAATTTAGTCGAGGGAGAAGGACTCAACCTTGAAGACCTTGAGGCAGCATTTACAATCTTTGGAATATGTGCTAGAGTTAGCTCAGAAAATGGTGTTTTTACCCTAAATAGGGATGGCAATCTGCATGCAAACTATGAGTTGAAATCTGGTCATATAATGTACTTGAGGAAAGTCCCTAACTCACAGTTTGCCCCCTCCACACCAATCCAAAACTTTAATGGACAAGGGCCTGACCTGTTTGGGAAGGGGGCTAGAAATTTAGAGGAATCATTCCTTAATGGCACAACAGGGGTCTTGTGTGACCGCACTGTCAATCTCCAGAAGAATTGGTTGACTGAGGGAAGAAGGTTAGTGAAGGATGAGCGGAATCTAGGTGTTGTTCTTGGAACCTTTGGATCTGGTAAGAGCACATTATTTAAGCGGTTCATCGTAAAAAATCCCTCAAGGTCAATTGTCTTTGTCTCTCCAAGGAGGTCATTAGCTGATCAAATTAAGGAGGATTTAGGTCTCAATTCAAAGAGGGGGAGATCCTTGAGAGTCAGAGTTTTAACCTTGGAGAGCTTCATCAAAGCAGTCTTTACTTTCAAGGCAGCAAGTGTAGTTCTCGATGAGGTGCAACTGTATCCCCCTGGGTACCTTGACTTGGTGATGCTATGTCTCAGTGGAAATTGTCAAATCTACCTCTCAGGAGATCCGTGCCAGAGCGACTACGATTCAGCCAAAGACAGAGCGCTCTTTGATGGGATGAAGGGGGATATCTTCGAGGTGCTTGAAGGAAAAAGCTATAAATTCAATGCATCCAGTAGGAGGTTTCAGTCTCAGATGTTTGTGGGCAGGCTTCCCTGTCGTCTGGATTCAAAAGATATGGTTGGAGATGAGGACTTTCATTGGCTTGAGAGCATTGAGGCTGCAGCTGAGGTTAGCAACACTGAATACGACGTTGTTCTGGTCTCAAGCTTCGAAGAAAAAAAAATCATTTGGGCACATCTCGGGAGAGACGTTGAGGTCCTAACTTTTGGAGAATCAACAGGCTTGACCTTCAACCGGGGCATTATCCTCATTTCTCACGAAAGTACCCTCACTGGTGAAAGAAGATGGATTACTGCGCTGTCAAGGTTTAGACTAAACATTATCTTTGTCAACTTGGTTGGCAACAATATTGAGGACGTATGCCAAGTTTTTCATGATCGAACATTGTTCAAATTTCTCAATCGCACCGCAACAATTGGAGACATTATTAAGCAACTTCCTGGCAACCCAGAATTGACAAATGACTTTGGTGATAAAGTTGGGAAGTCGGAAGGAGTCATGGAAGACAAGCTTGCTGGTGACCCGTGGTTAAAGACTGAGATCGATCTTCTACAGGATGAGGATCAGGAGATGGTCGAGCTGGCAGAGGAGGTTAAAAATGAGCCATGGTTTAAGACCCACCTCCCCCTATTTGAGTTGGAATCAATAAGGGCAAATTGGGTGCACAAAATAATGAACAGGGAATATCGTGAAGTACGTTGCGGAACGGAAGTGTCAACCCAGTTCCCTGAGGACCACCCCAATAAGTATAAGGTGACCCTAGCCAATGCAGCCGAGCGTTTCGAAGCAATTTATCCAAGACACAAGGGAAGTGATTCTGTAACCTTTCTAATGGCTGTTAAAAAAAGGCTTAGCTTTTCAAGACCATCAGTTGAGTCAGCCAAGTTGAATAGGGCAAAGCCGTATGGAAAATTTCTCCTGCATGAGTTTCTCAAGAGGGTCCCCCTAAAGACTGGTTTGGACTCAGCTCTGTTTGCTAGGTCAAAAAGAGAATTTGAAGAGAAGAAAACTAGCAAAAGTGCTGCTGTTATCGAGAACCATTCTGGAAGGTCATGTCGCGACTGGCTGGCTGATGTTGGATTTATTTTCATGAAAAGTCAGTTTTGCTCTAAGTGGGACAACAGGTTCAGGGATGCCAAAGCTGGACAAACTTTAGCCTGCTTCCATCATTCAATCTTGTGTCGCTTTGCGCCCTACATGAGATATATTGAACACAAGCTTCAGGAGGTCCTTCCAGCCAACCTGTACATCCATTCTGGAAAGAACCTGGAAGATCTCAATCGCTGGGTGATTGAGAACAGCTTCACTGGCATGTGCACTGAATCAGACTACGAAGCCTTCGATTCAAGCCAGGATCATTATATTCTGAGCTTTGAGATTGAAGTCATGAAGCATCTCCAGTTACCTTGGGACCTAATTGAGGATTATGTGTACATTAAAACCCACCTTGGTTCTAAGCTTGGGAATTTTTCAATCATGAGATTCACTGGTGAGGCAAGCACTTTCTTGTTCAACACGATGGCAAACATGTTGTTCACTTTCTTGAGATACGAACTCAATGGTTCAGAGGCCATATGCTTCGCTGGTGATGATATGTGCTCGAACCGGAGACTGAGGGTGTCAAATAAACATGAGGGGTTTCTGAGCAAACTTAGGTTGAAGGCCAAAGTCCAATTTACAGTTAAGCCAACATTTTGTGGATGGAATCTGTGCCTTGATGGAATTTTCAAACGCCCCCAACTTGTTTTGGAAAGGCTCTGTGTTGCAAGAGAGAAAGACAACCTGGCTAACTGTCTTGACTCCTATGCTATAGAGGTTGGTTACGCTTTCGCTTTAGGTGAAAAAGTTTTGCAGTATATGGATGAGGAGGCCATGCAAAACCATTACAATTGTGTCAGATTCATTGTCAAACATTCACACCTCCTTAAATCGAGCGTTCGTGATCTCTTCTTACAGAATATGTAGATTAGGTTTAACATTGTGTTATGTGAATAAGTATTCTTGTGTTTGGTAATGGATTTTGTTTATGATAAGTTAATAGACGCTGGTTACATTAGAACTAGACTGCCAATTAGTTTCCCTATTATTGTTCACTGTGTTGCCGGCGCTGGAAAAAGCACTTTAATCAGGGAAATCATTGAGGTTGACCACAAGTTTGAGGCCTTCACTTACGGTGTTCCGGACCCGATTAATCTCTCTGGGGTAAGAATTAAGAGCAACTCTGACATACCTTCAGCACGTGCTGACTCACTAAAAATCATCGACGAATACATCGGTCAAGACCTGCCTGAGGGAACAACTTTTTGCTTTGCAGATCCAAACCAATTTCCTTACACCTGTCCAGACGCACACTTCACGTGCTACCAGACAAAAAGGTTTGGTGATCAAACTTGTGCATTGTTGGGAAAAATTGACTGTGCTGCATTCTCTTACAAGCAGGATCAAATAATCTTTGACAAATTGTTTGCTGGTGATATTGAAGGGCAGATCGTTTGCTACGAAAAGGAAATTTTTGATCTCCTTGACCGTCACGGGGCAGATTATAAGAAATATTGCCAAATCCGGGGATCAACCTTTGATATTGTGACCTTCATAACTGCATCAGACACTTTTGAACCTGAGGATCGGTATAAAGTCTATCTTTGTCTAACGAGACACCGCTCGATCCTACGTATCTTGAGTCCTGAGGGGAAGTTCCTAAGGGAGGATGCCAAGTTTGACACCACCACCTGACAACACAAGGGTTTTGTTACCAATCGCCATTGGTCTTGGGGTGGGGGTGGTTATCTGGTGTCTAACAAGGTCTACATTGCCTCAAGTAGGAGACAATATCCACAGTTTGCCACATGGTGGGAATTATTTGGACGGGACAAAAAGAATCAGCTACTGTGGGCCAAAGAACAGTTTTCCAAGCAGCAATCTCTTCAAAGGAGGTGCTTTTTCAGCAATTTGTGTTGTAGTATTGTTAGTGTTTGCTATTCATGTTTCAGAGTTATTTAATCGGCCTAATCGCCGCTCTTGTGGCTGTGGTTCTGCTTCACATGCTTAACTCTGGGCAGGAAGGTTGTTTGATAATTATTAGTGGAGAGTCTGTAGTTATTAAGAATTGTGTGTATACCAGTGAGTTCATTAATCTGGTTAAGGGTCTTAAACCCCACAACCATTGGAATTCACTGTAGTTAGGTCCAGTGTGTGTAGATTGAAATAATAGATTGCTTTGAGATTTTGATTGAAATGACTACTTCTCAATCCACAGCAACTGCTGATGTCGAGACTTCCAAAGTCGAGACTTCTCCACCTCCGGTAGTCACCAGTGAACCTGTTTTACAGCAGGTGGTCTTTTCTGACACTTCAAATGCAGCTACTACGCCACCGCCACCTGTCACTACCAAGACGTCAACAGCTGCGACGAAAGGCGTTGAAAGGTCATGGTTTGGGCTCCCATCTAAAACGACGGGTTTGGGTACATTGAGTGCCACTGCTACATCCACATCACCCCTGTTAAGCGCTTCAGGGCGAGCCTCACAACTTGATGAAAACCTCAAAAAGCTTAAGGCGAAGGATGAGAGCTTCTTTGTGCTAAATAGTGAGGTTGAAGACCTTGAGGCGAAGGCAAGTGGGAAAGTGCAGGGGCCAAGGGGGGTTGTGCCAAGCATGATGTCTTATGAAAAACCCGAAAAAGGTAAAGTTGTTGAGGAGTCCAAGGGTTTGAGCTTAGGTTCAAGGCAGAGATTGGTCTTTGAAAAGGCTAGGCAAAGGGCACAGGTGAACATTGAAGCTGACCGTGACAGTTTGGCGCCGCCATTTGCTTCAGCAGATCCCTTCTCCCGACCAAAAGTTCAGGATGTCCAAAGGTTCTCATATGAACCAAGCTCACCTGACATTTCAACGGCTGAGGAGATTGAACACATCAGAAGTGATTTGGTTAGGGCAGGTGTGCCTGAGTCCACACTCACCTTTTCAATGTGGGACATAGCTAGATACTGCGCTGATGCTGGTTCCTCAGCCTCAACTGAGTTCATAGGGACAAGTAGTTACAGTGGCCGTGTGACCAGAATGGAGATAGCCTCGGTGATCAAAAAGCATACAACCCTGAGGCGATACTGCGGCTTCTATGCAAAAATTGTTTGGAACATAATGCTGTCGACCAACATACCACCTTCTGGATGGGTGAAAAAGGGTTACAAGAAGAACACAAAGTTTTCTGCATTTGATTTCTTTGAGCAAGTCTCAAACAATGCTGCGCTGGAGCCAGAAAATGGGCTGGTTCGTGAGCCCAACCACGAGGAGTTAGTTGCATCCCAAGTGAATAAGGGGATTTCATTGCACAGAACTGAAGCTGCACAGGACAAGAACGTGTCAACAGCACACGAGGTGACGGGTGGGAGAGCTGGACCCCGGTCAAGACTGTTGTTGAAGGGGAAGGAAATGGATTGAGTGGTTAACACATGGCCTAGAACCGTGGAGAGGCCTAAAAGAGTCCACGTGCCGTCTTAGAGCTATAGTATGTGTGTTAGTAAATATTAGTAGTTTCCACTTCCTAAGGTTCCAGGTCTCGAACCCAGGAAAGACCTTAAAGAGTCCTGGTTGGCGTTTAGCTGTATAAAACCTCTGCACCGCATAGGCCACACCAAAGTTCATCATTGTGTGCCTTATGCGGGCAAGTTAACCGAGTTGTGGCGGCAACCGGAGAAAGTCAGATACAAGCGTAGATTTATGAGCTACGCCCTGTGGTTGGATTTCCACCGTTATCTCGTCGTTAAGGGAGCAACCCCTTTTCTCTCGCTTATGGGGGTATTGTTAAGCGGGCGTGCGACCCATTGAGAGATGGGTTCCCTACGTTAAGGGTAGTTGAAGTTTAGAATAAACTTCCATGGTTCCGACCTACCATGATTAAAGTGATCGGTAGTTCTGGGTAAGAAACAACCCTGTGCTTGGTGGCTAAGCATGACCACTCAGTTTGACCGACTGGCCAGACAGGTTACGTTTCCCACTTCGATATCAAAAGTGGGCGCATATCAAAGCGTTAAATTGCTCGATCGCATGTTTCAAACTCTCAGTCTTGGGGGTTTGAGACAGGCTTTAGTCCTGGTGATCTGACTTTAAAAGAGCCAAATAAACCGCATTTCAACGCGTTATAGTGTTCGCTGACAGACCGTACAAATAGTCTGTTTCACCAACCTAAGACCTAAGTAATTGAATAAGGGGGAGTGATTAAACAAATTTGCTTTTTATCGCTAATTTTTGC
| 5,766
|
MT218431.1
|
Asian prunus virus 2
|
Bu,F., Liu,Z., Chen,J., Xiang,B., Shen,M., Cui,B., Zheng,Y.
|
Shihezi University, School of Life Sciences
|
China
|
2021-03-01
|
Tao4
|
Asian prunus virus 2
|
Foveavirus
|
Betaflexiviridae
|
ssRNA(+)
| 9,393
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Prunus persica f. compressa
| null |
2019-05-07
| null | null |
Asian prunus virus 2 isolate Tao4, complete genome
|
CCGAACAATCTATCAACAAACGACCCCGCTCGAAACAGACCTAAGTCGTTCGTAATGGCTTTAACATACCGAAGCCCGATAGAAGAAGTTCTTAATCGCTTCACCTCTGAGGAGCAGTCCAGGGTGAGTTCAACCTCAGTGGCCAGATTAACCCAAGTTGAAGTTAGCAACCATAAGCTTTTTTCATTCGCATTGAGTGAGAAAGCCAAAGAGAAGCTAATTAAAGTTGGGATTTATTTGAGCCCATTCTCTTTTGAACCACATTCACATCCTGCCTGCAAAACATTGGAGAATCACATTTTATATAACATTTTAGCTAATAAATTAGACAACAGTTTTTATGCAATAGGTATTAAGGGTTCCAAGGTCAACTTTTTAAAAAGTAGATCAAAGAACCTAAGCATGTTGGAGTATGTGAACCGTGTTGTCACCAGCGCAGATAAGTACAGATATGGTAGTGACTTCACCACACTCAGCTCAAAGCAAATCGACAACCTCTGCTCAAAAAAAAGCCTTAGTGAGTGTGGCACACTGAAGGAATTGGTTCCACTGGTTAAAATGAGCAAGAAAAGGAATTTTTTTTTGCATGACGAGCTTCATTACTGGAGCCCACAAGACTTGATGCTCTTTTTGGACTCAGTAAACCCTGATCACTTGGTAGCAACGGTGGTTTTTCCTCCCGAAATACTGGCTGGAGCCAAAGAGAGTCTTAATCCATGGTGCTACTCATTCCACCGGCAAGGTAGCAAATTAACATTCTTTCCAGACGGGGTTCAAAGTGAGTCATACACACAACCCCTTAGCTCTGGTTACATCTTGAAGGCATCCAAAATTGTGTGTCCGAGTGGTCAAATTTACTCTGTGGATCTTGTGTACTCAGTCTTTGCACACCATGTTGTAAGCATAACAAAGGGAAATTTACCAGGGCTTGAAAGGCGGTTCTTTTCAAATTTTGAGGCAACTGGAGTGAAACACCTATCTGGCCTCTCCTATTCTGTGAGAGACTGCATTCCAGTTAGCACTGATCTAATATCTAAGATCTACAGGTATATYAGGACCCTCAAGAAGCCTGACTTGCAGTCCTGCATGGCCAAGCTCAGCCAGATAGTTCCCAATCCAACTGGGGTTGAAATCAAATTCACAGAGGACTTCTCACGACTAGTTATGGAGATTCAGCCTCTGAAGTCCCTTCTTATGCCAGACACTGCTAAACTAATTGGGGCCTTGTTCGCTTCCTTTCTGCCCTTCAAAATGGCAAGGTTTTTTGACTGCTACAAATCAAGCTCATTAGACAAATTCATTCATGATTTGGAGCCATTCAGCTTTTCTGTGCCCACTGAAGTTATCAACTGCAATACAATGCCAGCTTTTGARGCAATTTCTTTGGGTGAATCAATGAGTCCAGAGGAAGTTATCCAGATATTGAGCCGAATGGAAATGGGGGCTCTCGCTGGGTCATGTAACTTGGTAGGGAAGTTTAAATACTCAAATGAGGCCTATCATTGTCTCCACCATGTTCTTGATGGCTGCAAGCCTGAAGTTTTCAAGAGGCTGATTAGAAGAGTGGCAAGTTCCTTTTGTAACGAATTTGGTGTTTACCGAAAAAGCAGTTATGTGGCATCCGTTGCAATCAATGTGTTCCAGAGGAGATCAAACCTAAATCTCGACTTTGTCTTGGGGTCTGATCTAAATCAAAAAGTCGTTTGCATTGTTCGCAATTTCTTTTCTTCAAAGAAATCCTCTCAGCTCATCTGGTATTCCACAAACTCTATGGCTTGGTTCCGTTTTTCAAAGCTGAGAGCTAATCAGAAGTTTCTAAGATCACCAATTTTTCCTGCGTCCATGGATTGCAGAGACCTCTCAATTAGGAAAAATCTGATGTTCGACTTTGAGATTTTTGGTTTCTGTGCTGGCTTGAGAAAGCTTGGGCCTTCGGGAATTTCTTCAGCGGTGCCCTCTAAACCTGTTCTTGGTGGCTTTGAGTTCGTACCCCCTGGGGAGGAGGCCCACGAGGATGATATTGAGGTGGAGTTGAATACCATGATGAAGATGTCTGACCCATCAACACAGGTGGTTCTTGGAATTGAAGGTCTAGCTGTTTGTGTGCATGAAACTGACCCACAAGATCAAATTTTCTCTCCCAAAGCTGCCAACCTTGAGGAACAAACTGGTCTTATTTTTGGATGTATCCCTGAACCAAGTTTAGGGAATTTTTCATTTAGTTCAGCCAATCAGGGTGATCGCCTCTTCGCCAACATTGTCAATGAAAACATAATAGATGTTGGAATTCTTCCTCCCACTGAATTGAAAATTCCATTGGATGCTAAGGTCACACGAATCAATGGTCGGGATTGCTTCTTCTTCACAAGGTGCTCATGTATCGACTATGGCCACAATAAGATTAAATACACTGCTAACAACTGGTTTTCAGGCCTCGATCAATTTCTATCCAATGAGGGAACATACTACAATGCATGCCTCCTGCAAGTTTACAGGGCTGGTAGTGGAATTGGTTTTCACTCAGACAACGAAAAGGTCTACCACAGAAGCCCCATCAAAACTGTTAATCTGTGTGGAGAGGCAGACTTCCTTGTTAAAGCCAAGGGTAGGAGGGACTTAGGGACTGTTGCTAGAGGACATCTCTTCCCAGGACATTATTTCACAATGGATTCAAATTTCCAGTCTTACTACCAGCATTCAGTTCAAGATTGTAGTGAGGGGAGGGTCTCCTTAACCTTTCGCCATCATGTAAATAATGTCACAGGGCTGCCAATCAAACACACTTGTGGAGAGTTTGGTGATACTGAGATTTTGTTTGATGTGCTCATAAGAAGGAGCTTCACCTATGCAGCAAAAAACTTTCACACCTTCCCAGTTCCTGGGGATGGCAGCTGCTTTTGGCATAGCATGGGGGCTTTGTTGGGAGTTGATGGTGAGGAATTAAAGAAGATATCCGCGAGAGAGATTCAGAAAAATGAAGTTTTGCTATCCAATCTGAGCCTACGTCAGCAAATGGCCAACAAACAGTATGCTGAGAGAGAGTCAATTGCGGCTTTCTGCAGGATCCAATCAATTCATTTGGTTGTCCTGCTTCCAGGCAACAATTTTTCTTATGAGTTTCTTCCGTCGCAAAACCCTGAAGTCACCCAATTGTTTGTTAAACTTACGGATGAACACTTTGAACCTGCTTTGCCAGTRAATGGATGCGTTGTTAAGTCAATTGCTGAAACCCTGAATCAAACTGAAGCAAAGATCTTGTCAGTAATTGGGAGACCCACAAATAGAATGATCCTCGACAACTTAGTCGAGGGAGAGGGACTCAATCTTGAAGACCTTGAAGCAGCATTTACTATCTTTGGAATATGTGCTAGAGTCAGCTCAGAACATGGGGTTTTCACCCTAAACAGGGATGGCAATCTGCATGCGAACTATGAATTGAAATCTGGTCACATAATGTACTTGAGGAAAGTCCCTAGCTCACAATTTGCCCCCTCCACACCAATCCAGAATTTTAATGGACAAGGGCCTGAGCTGTTCCTAAAGGGAATTGTTAGTGAGGTAAAATATAAGCCAGATTGGGAAAGGGCCAGGAATTTAGAGGAATCATTCCTTAATGGTACAACAGGGGTCTTATGTGACCGCACTGTCAATCTCCAAAAGAATTGGTTGACGGAGGGGAGAAGGCTAGTGAAGGATGAGCGGAATCTAGGTGTTGTTCTTGGAACCTTTGGATCTGGTAAGAGCACATTATTCAAACGGTTCATCGTGAAGAATCCCTCAAGGTCAATTGTCTTTGTCTCTCCAAGGAGGTCATTAGCTGATCAGATCAAGGAGGATCTGGGTCTCAATTCAAAGAGGGGGAGATCCTTAAGAGTTAGGGTCTTGACCTTGGAAAGCTTCATCAAGGCAGTTTTTACTTTCAAGGCAGCAAGTGTTGTTCTCGATGAAGTGCAGCTGTATCCCCCTGGGTACCTTGATTTAATGATGCTATGTCTTTGTGGAAATTGTCAGATCTACCTTTCAGGAGATCCATGCCAGAGCGACTACGATTCAGCTAAGGACAGAGCGCTTTTTGATGGGATGAAGGGGGACATCTTCGAGGTGCTTGAAGGCAAAAGCTATAAATTCAATGCAGCCAGCAGGAGGTTTCAGTCTCAGATGTTTGTAGGCAGGCTTCCCTGTCGTCTGGATTCAAAAGACATGGTTGGGGATGAGGACTTTCATTGGCTTGAGAGCATAGAGGCTGCAGCTGAGGTTAGCAACACCGAATACGACGTTGTTTTGGTCTCAAGCTTCGAAGAAAAAAAAATAATTTGGGCACATCTCGGGAGAGACGTTGAGGTCCTCACTTTTGGAGAATCAACAGGCTTAACCTTCAACCGGGGCATCATTCTCATTTCTCATGAAAGCACCCTCACTAGTGAAAGGAGATGGATTACAGCGCTATCAAGGTTTAGACTAAACATCATCTTTGTGAATTTGGTTGGCAACAACATTGAGGACGTATGCCAAGTTTTCCATGACCGAACACTATTCAAATTTCTCAATCGCACCGCAACTATTGGGGACATCATCAAGCAACTCCCTGGTCACCCAGAACTAACAAATGACTTTGGGGATAAGGTTGGGAAGTCGGAAGGAATCATGGAAGACAAACTTGCTGGTGATCCGTGGTTGAAGGCTGAGATCGATCTTCTACAGGATGAGGATCAGGAGATGATTGAGCTGGCTGAGGAGGTTAAAAATGAGCCATGGTTTAAGACCCACCTCCCCTTGTTTGAGTTGGAATCTATAAGGGCAAATTGGGTGCACAAAATAATGAACAGGGAATATCGTGAAGTACGTTGCGGAACGGAAGTTTCGACCCAGTTCCCTGAGGACCACCCAAACAAGTATAAGGTGACTCTAGCCAATGCAGCTGAGCGTTTCGAAGCAATTTATCCGAGACATAGGGGAAGTGATTCTGTAACCTTTCTAATGGCTGTCAAAAAAAGGCTCAGCTTTTCAAGACCATCTGTTGAGTCAGCCAAGTTAAACAGAGCAAAGCCGTATGGAAAATTTCTCCTGCATGAGTTTCTCAAGAGGGTCCCTCTAAAGACTGGTTTGGATTCGGCTTTGTTCGCTAGATCGAAAAGGGAATTTGAAGAGAAGAAAACTAGCAAAAGTGCTGCTGTCATTGAGAACCATTCTGGAAGATCATGTCGCGATTGGCTRGCTGATGTTGGGTTCATTTTCATGAAAAGTCAGTTTTGCTCCAAGTGGGACAACAGGTTCAGGGATGCCAAAGCTGGACAAACTTTAGCCTGCTTTCATCACTCAATTTTGTGTCGCTTTGCACCCTATATGAGATATATTGAACACAAGCTTCAGGAGGTCCTACCAACTAACTTGTACATCCATTCTGGGAAGAACCTGGAAGATCTCAACCGTTGGGTGATTGAGAACAGCTTTACTGGCATGTGCACTGAATCAGATTACGAAGCCTTCGATTCAAGCCAGGACCATTATATTCTGAGCTTTGAGATTGAAGTTATGAAGCATCTCCAGTTACCTTGGGACCTAATTGAGGATTATGTGTACATCAAAACCCACCTTGGTTCTAAGCTTGGGAATTTTTCAATCATGAGATTTACTGGTGAGGCAAGCACATTCCTATTTAACACGATGGCAAATATGTTGTTCACCTTTCTGAGATACGAACTCAATGGCTCAGAGGCCATATGTTTTGCTGGTGATGACATGTGCTCGAACCGGAGACTGAGGGTGTCAAACAAACATGAGAAGTTCCTGAGCAAACTCAGACTGAAGGCCAAAGTCCAATTTACAGTCAAGCCAACTTTCTGTGGATGGAATCTGTGCCTTGATGGAATTTTCAAACGTCCTCAGCTGGTTCTGGAGAGGCTCTGTGTTGCAAGAGAAAAAGATAACTTGGCCAACTGCCTTGACTCCTATGCCATAGAGGTTGGTTACGCCTTCGCTTTAGGTGAAAAAGTCTTGCAGTATATGGATGAGGAGGCTATGCAAAACCATTACAATTGTGTTAGATTTATTGTCAAACATTCACATCTCCTTAAATCGAGCGTTCGTGATCTCTTCTTACAGAATATGTAGATTAGGTTTGACACTGTGTTATGTGAATAAGTATTCTTGAGTTTGGTAATGGATTTTGTTTATGATAAATTAATAGACGCTGGTTACATTAGAACTAGACTGCCAATTAGTTTTCCTATTATTGTCCACTGCATTGCCGGCGCTGGGAAAAGCACTTTAATCAGGGAAATCATTGAAGCTGACCACAAGTTTGAGGCTTTCACTTACGGTGTCCCGGACCCAATCAACCTTTCTGGGGTGAGAATTAAGAGCAACTCTGACATACCTTCGGCACGTGCCGACTCACTCAAAATCATCGACGAATACATAGGTCAAAACCTGCCTGAGGGAACAACTTTTTGCTTTGCAGATCCAAACCAATTTCCCTACACCTGTCCTGACGCACATTTCACGTGCTACCAGACGAAAAGGTTTGGTGACCAAACTTGTGCATTGTTGGGAAAGATCGACTGTGCTGCATTCTCTTACAAGCAGGATCAGATAATCTTTGACAAATTGTTTGCTGGTGATATCGAGGGTCAAATCGTTTGCTACGAAAAGGAAATTTTTGATCTCCTTGACCGTCACGGGGCAGATTATAAGAAATATTGCCAAATCCGGGGATCAACCTTTGATATCGTGACCTTCATAACTGCATCAGACACTTTTGAACCTGAGGATCGGTACAAAGTCTATCTTTGCCTAACGAGACACCGTTCGGTCCTACGTATTCTAAGTCCTGAGGGGAAGTTTCTAAGGGAGGATGCCAAGTTTGACACCACCACCTGATAATACGAGGGTTTTGTTACCAATTGCCATTGGTCTTGGGGTGGGGGTTGTTATCTGGTGTTTAACAAGGTCTACATTGCCTCAAGTCGGAGACAATATCCACAGTTTGCCACATGGTGGGAGTTATTTGGACGGAACAAAGAGAATCAGCTACTGTGGACCAAAGGACAGTTTTCCAAGCAGCAATCTCTTCAAAGGAGGTGCCTTTTCAGCAATTTGTGTCGTAGTATTGTTAGTGTTTGCTATCCATGTTTCAGAGTTATTTAATCGGCCTAATCGCCGCTCTTGTGGCTGTGGTTCTGCTTCACATGCTTAACTCTGGGCAGGAAGGTTGTTTAATAATTATTAGTGGAGAGTCTGTAGTTATTAAGAATTGTGTGTATACTAGTGAGTTCATTAGTCTGGTTAAGGGCCTTAAGCCCCACAACCATTGGAATTCACTGTAGTTAGGTCCAGTGTGTGTAGATTGAAATAATAGATTACTTTGAGATTTTGATTGAAATGACTACTTCTCAATCCACAACAACTGCTGATGTCAAGACTTCCGAAGTCGAGACCACTTCGTCTCCAGTTGTCACCAGTGTACCTGTTTCACAGCAGGTGGTCTCTTCTGACACTTCAAAAACAGCTACTGCGTCATCGCCACCTGTCACTACTCAGACGTCAGCTACTGCGACGAAAGGCGTTGAAAGGTCATGGTTTGCGCTCCCACCCAAGACAACGGGTTTGGGTACATTGAGTGCCACTGCGACATCCACAGCACCCCTGTTGCACGCTTCAGGGCGAGCATCACAGCTTGATGAGGACCTTAAAAAGCTTAAGGCGAGAGAGGGGAGCTTCCTTGTGCTAAATAGTGAGGTTGAAGATCTTGGGGCAACAACAAGTGAAAGGGTACAGGGGCCAAGGGGGGTTGTGCCAAGCATGATGTCTTATGAGAAACCCGAAAAAGGTAAAGTTGTTGAGGAGTCCAAGGGGTTGAGCTTGGGTTCAAGGCAGAGATTGGTCTTCGAAAAGGCTAGGCAAAGGGCACAGGTGGACATTGAAGCTGACCGAGACAGTTTGGCGCCGCCATTTGCTTCAGCAGACCCCTTCTCTCGACCAAAAGTTCAGGATGTCCAAAGGTTCTCATATGAACCAAGCTCACCTGACATTTCAACGGCTGAGGAGATTGAGCACATCAGAAGTGATTTGATTAGGGCAGGTGTGCCTGAACCCACACTCACCTTTTCAATGTGGGACATAGCTAGATACTGCGCTGATGCTGGCTCCTCAGCCTCAACTGAGTTTATAGGGACAAGTAGTTACAGTGGCCGCGTGACCAGAATGGAGATAGCTTCTGTGATCAAGAAGCATACAACCCTGAGGCGATACTGTGGCTTCTACGCAAAAATTGTTTGGAACATAATGCTGTCAACCAACATACCACCTTCTGGGTGGGTGAAAAAGGGTTACAAGAAGAACACAAGGTTTTCTGCATTTGATTTCTTCGAGCAGGTCTCAAACAATGCCGCGCTGGAGCCAGAAAATGGGCTGGTTCGTGAGCCCAACCACGAGGAGTTGGTTGCATCCCAAGTGAATAAGGGGGTTTCACTGCACAGAACTGAAGCTGCACAGGACAAGAACGTGTCAACTGCACACGAGGTGACAGGTGGGAGAGCTGGACCCCGGTCAAGGCTGTTGTTGAAAGGGAAAGAAATGGATTGAGCSSTTAACACATGGCCTAGAACCGTGGAAAGGCCTGAAAGAGTCCACGTACCGTCCTAGAGTTATAGTGTGTATATTAGTAAATATTAGTAGTTTCCACTTCCTAAGGTTCCAGGTCTCGAACCCAGGAAAGACCTTAAAGAGTCCTGGTTGGCGTTTAGCCGTAGAAAACCTCTGCACCACATAGGCCACACCAAAGTTCATCATTGTGTGCCTTATGCGGGCAAGTTAACCGAGCTGTGGCGGCAGCCGGAAAAAGTCAGATACAAGCGTAGATTTATGAGCTACGCCCTGTGGTTGGATTTCCACCGTTATCTCGTCGTTAAGGGAGCAACCCCTCTTTTCTCGCTTATAGGGGTATTGTTAAGCGGGCGTGTGACCCATTGAGAGATGGGTTCCCTACGTTAAGGGTAGTTGAAGTTTAGAACAAACTTCCATGGTTCCGACCTACCATGATTAAAGTGATCGGTAGTTCTGGGTAAGAAACAACCCTGTGCTTGGTGGCTAAGCATGACCACCCAGTTTGACCGACTGGCCAGATAGGTTACGTTTCCTACTTCGATATCAAAAGTGGGCGCATACCAAAGCGTTAAATTGCTCGAACGCATGTTTCAAACTCTCAGTCTTGAGGGTTTGAGACAGGCTTTAGTCCTGGTGATCTGACTTTAAAAGAGCCAAATAAACCGCATTTCAACGCGTTATAGTGTTCGCTGACAGACCGTACAAATAGTCTGTTTCACCAACCTAAGACCTAAATAATTGAATAAGGGGAGGTGACTAAACAAATTTGCTTTTTATCGCTAATTTTGT
| 43,897
|
LC522985.1
|
Asian prunus virus 2
|
Kinoti,W.M., Nancarrow,N., Dann,A., Rodoni,B.C., Constable,F.E.
|
Bundoora, VIC 3083
|
Australia
|
2020-02-11
|
TAS10
|
Asian prunus virus 2
|
Foveavirus
|
Betaflexiviridae
|
ssRNA(+)
| 9,374
|
GenBank
| null |
Australia
|
Australia
|
Prunus armeniaca
| null | null | null | null |
Asian prunus virus 2 TAS10 RNA, complete genome
|
GGATAACCAGAACAATCTATCAACAAACGACCCAGCTCGAAACAGACCCAAGTCGTTCGTAATGGCTTTAACATACCGAAGCCCGATAGAAGAAGTTCTTAATCGCTTCACCTCTGAGGAGCAGTCCAGGGTAAGTTCAACGTCAGTGGCCAGATTAACCCAAGTTGAAGTTAGCAACCATAAGCTTTTTTCATTCGCATTGAGTGAGAAGGCCAAAGAGAAGCTAATTAAAGTTGGAATTTATTTGAGCCCATTCTCTTTTGAACCACATTCACATCCTGCCTGCAAAACATTGGAGAATCACATTTTATATAATATTTTAGCTAATAAATTAGACAACAGTTTTTATGCAATAGGTATTAAGGGTTCCAAGGTCAACTTTCTAAAAAGCAGGTCAAAGAACCTAAGTATGTTGGAGTATGTTAACCGTGTTGTTACCAGCGCAGATAAGTACAGATATGGTAGTGACTTCACCACACTCAGCTCAAAGCAAATCGACAACCTCTGCTCAAAAAAAAGCCTTAGCGAGTGTGGCACACTAAAAGAACTGGTACCACTGGTGAAAATGAGCAAAAAAAGAAACTTCTTTTTACATGATGAGCTTCACTACTGGAGCCCACAAGACTTAATGCTCTTTTTGGATTCAGTCAATCCTGATCATTTGGTCGCAACTGTGGTCTTTCCCCCCGAAATACTAGCTGGAGCTAAGGAGAGTCTTAATCCATGGTGTTACTCATTTCACCGGCAAGGCAGCAAATTGACATTTTTTCCAGACGGGGTTCAAAGTGAGTCATACACACAACCCCTCAGCTCTGGTTACATCTTGAAGGCATCCAAGATTGTGTGTCCGAGTGGTCAAATATACTCTGTGGATCTTGTGTACTCAGTCTTTGCGCACCATGTTGTAAGCATAACAAAAGGAAATCTACCAGGGCTTGAAAGGCGGTTCTTTTCAAATTTTGAGGCAACCGGGGTGAAACACCTATCTGGCCTCTCCTATTCTGTGAGGGACTGCATTCCAGTTAGTGCTGATTTAATATCTAAGATCTACAGGTATATCAGGACCCTCAAGAAGCCTGACCTACAGTCCTGCATGGCCAAGCTCAGCCAAATCGTTCCCAATCCAACTGGTGTTGAAATCAAATTCACAGAGGATTTCTCACGACTAGTCATGGAAATTCAGCCTCTGAAGTCCCTTCTAATGCCAGACACTGCTAAACTAATTGGGGCTTTGTTCGCTTCCTTCCTGCCCTTCAAAATGGCAAGGTTCTTTGACTGCTACAAATCAAGCTCATTAGACAAATTCATTCATGACTTGGAACCGTTTAGCTTTTCTGTGCCCACTGAAGTTATTGACTGCAATACCATGCCAGCTTTTGAAGCAATTTCTTTGGGTGAGTCAATGAGTCCAGAGGAGGTCATCCAAATATTGAACCGAATGGAAATGGGGGCTTTCGCTGGGTCATGCAACTTGGTAGGAAAGTTCAAGTACTCAAATGAGGCCTATCACTGTCTCCATCACGTTCTTGATGGCTGCAAGCCTGAAGTTTTCAAGAGGCTGATTAGAAGAGTAGCAAGTTCCTTTTGTAATGAATTTGGTGTTTACCGGAAAAGCAGTTATGTGGCATCCGTTGCAATCAATGTTTTCCAGAGGAGATCAAACTTAAATCTCGATTTTATCTTGGGGTCTGATCTGAATCAAAAGGTTGTTTGCATTGTCCGCAATTTCTTTTCTTCAAAGAAATCTTCTCAGCTCATCTGGTATTCCACAAATCCTATGGCTTGGTTCCGTTTTTCAAAGCTGAGAGCTAATCAAAAATTTCTAAGATCACCAATTTTTCCTACCTCCATGAATTGCAAAGACCTTTCAATTAGGAAAAATCTGATGTTTGACTTTGAGGTTTTTGGTTTCTGTGCTGGCTTGAGAAAGCTTGGGTCTTCGGAAGTTTCTCCAGTGGCGCCTTCCAAACCTGTTCTTGGTGGCTTTGAATTCGTACCCCCTGGGGAGGAGGCCCTCGAGGATGATATTGAGGTAGAGTTTAACACCGTGGTAAAAATGTCTGATCCATCGCCACAGGTGGTTCTTGGAATTGAAGGTTCAGCTGTTCTTACGCATGAGATTGACCCACAAGATCAAGCTTTCTCTCCCAAAGCTACTAACCTTGAGGAACGAACTGGTCTTATTTTTGGATGCGTCCCTGAACCAAGCTTAGGGAACTTTTCATTCAGTTCAGCTAATCAGGGTGATCGCCTCTTTGCCAACATTGTAAACGAAAACATAATAGATGTTGGAATTCTTCCTCCCACCGAATTGAAAATCCCATTGGATGCTAAGGTCACACAAATCAATGGTCGGGATTGCTTCTTTTTCACGAGGTGCTCATGTATTGACTATGGCCACAATAAGATCAAATACACTGCTAATAATTGGTTTTCAGGCCTTGATCAATTTCTATCCAATGAGGGGACATACTACAATGCATGCCTCCTGCAAGTTTACAGGGCTGGTAGTGGAATTGGTTTTCACTCTGATAACGAAAAGGTCTACCACAGAAGTCCTATCAAAACTGTCAATTTGTGTGGAGAGGCTGACTTCCTTGTCAAAGCTAAAGGTAGGAGGGACTTAGGGACTGTTGCAAGGGGACATCTCTTCCCAGGACATTACTTCACAATGGATTCAAATTTCCAGTCTTACTACCAACATTCAGTCCAAGATTGTAGTGAGGGGAGGGTCTCCTTAACTTTCCGCCATCATGTTAATAATGTCACAGGGTTGCCAATCAAACACACTTGTGGAGAGTTTGGTGATACTGAGATTCTGTTTGATGTGCTCATAAGAAGGAGTTTCACCTATGCAGCAAAAAACTTTCACACCTTTCCAGTTCCTGGGGATGGTAGTTGCTTTTGGCATAGTATGGGGGCTTTGTTGGGAGTTGATGGTGAGGAATTGAAGAAAATATCCGCAAGAGAGATCCAGAAGAACGAGGTTCTACTATCCAATCTGAGCCTACGTCAGCAGATGGCCAATAAACAGTATGCTGAAAGAGAGTCAATTGCGGCTTTCTGCAGGATCCAATCAATCCATTTGGTTGTCCTGCTTCCAGGCAATAATTTCTCTTATGAGTTTCTTCCGTCACAAAATCCTGAAGTCACCCAATTGTTTGTCAAACTAACGGATGAACACTTTGAACCTGCTTTGCCAGTGAATGGATGCGTTGTCAAGTCAATTGCTGAAACCCTGAATCAAACTGAGGCAAAGATTTTGTCAGTGATTGGGAGACCTACAAATAGAATGATTCTTGATAACTTAGTCGAGGGAGAGGGACTCAACCTTGAAGACCTTGAAGCAGCATTTACAATCTTCGGAATATGCGCTAGAGTCAGCTCAGAACATGGGGTTTTTACCCTAAACAGGGATGGTAATCTGCATGCGAACTATGAATTGAAATCTGGTCACATAATGTACTTGAGGAAAGTCCCTAGCTCACAGTTTGCCCCCTCCACACCAATCCAAAATTTTAATGGACAGGGGCCTGAGCTGTTCCTAAAGGGAATTGTCAGTGAGGTAAAATATAAGCCAGATTGGGAGAGGGCCAGGAATTTGGAGGAATCATTCCTTAATGGCACAACAGGGGTCTTATGTGACCGCACCGTCAATCTCCAAAAAAATTGGTTGACTGAGGGAAGAAGGCTGGTAAAGGATGAGCGGAATCTAGGTGTTGTCCTTGGAACCTTTGGATCTGGTAAGAGCACGTTATTCAAGCGGTTTATCGTGAAAAATCCCGCAAGGTCAATTGTCTTTGTTTCTCCAAGGAGGTCATTAGCTGACCAGATTAAGGAGGATTTGGGCCTCAATTCAAAGAGGGGGAGATCCCTGAGAGTCAGGGTCTTAACTTTGGAGAGCTTCATCAAAGCCGTTTTTACTTTCAAGGCAGCAAGTGTGGTTCTCGATGAGGTGCAACTGTACCCCCCTGGGTACCTTGATTTAATGATGCTATGCCTTAGTGGAAACTGTCAGATTTACCTCTCAGGAGATCCGTCCCAGAGCGACTACGATTCAGCCAAGGACAGAGCACTCTTTGATGGGATGAAGGGGGACATCTTCGAGGTGCTTGAAGGCAAAAGCTATAAATTCAATGCAGCCAGCAGGAGGTTCCAGTCTCAGATGTTTGTGGGCAGGCTTCCCTGTCGTCTGGATTCAAAAGACATGGTTGGGGATGAGGACTTTCACTGGCTTGAGAGCATTGAGGCTGCAGCTGAGGTTAGCAACACCGAATACGACGTTGTCTTGGTCTCAAGCTTCGAAGAAAAGAAAATCATTTGGGCACATCTCGGGAGAGACGTTGAGGTCCTTACTTTTGGGGAATCAACAGGCTTAACTTTCAACCGGGGCATCATTCTCATCTCTCACGAAAGTACCCTCACTGGTGAAAGGAGATGGATCACAGCGCTATCAAGGTTTAGACTAAATATCATCTTTGTCAATTTGGTTGGCAATAATATTGAGGATGTGTGCCAAGTTTTCCATGACCGAACACTATTCAAATTCCTCAACCGCACTGCAACAGTTGGAGACATTGTCAAACAACTCCCTGGCCACCCAGAGCTAACAAATGATTTTGGTGATAAGGTTGGGAAGTCTGAAGGAGTCATGGAAGACAAGCTTGCTGGTGACCCGTGGTTAAAGGCTGAGATCGATCTTCTACAGGATGAGGATCAGGAAATGATTGAGTTGGCTGAGGAGGTTAAAAATGAGCCATGGTTTAAGACCCATCTCCCCTTGTTTGAGTTGGAATCTATAAGGGCAAATTGGGTGCACAGAATAATGAACAGGGAATATCGTGAAGTGCGTTGCGGAACGGAAATGTCTACCCAGTTTCCTGAGGACCATCCCAGCAAGTTTAAGGTGACTCTAGCCAATGCAGCCGAGCGTTTCGAAGCAATTTATCCAAGACATAGGGGGAGCGATTCTGTAACCTTCCTAATGGCTGTTAAAAAAAGGCTTAGCTTTTCAAGACCTTCTGTTGAGTCAGCCAAGTTAAACAGGGCAAAACCATATGGAAAATTCCTCCTGCATGAGTTCCTCAAGAGGGTCCCCCTAAAGACTGGTTTGGATTCAGCTCTGTTCGCCAGATCGAAGAGGGAGTTTGAAGAGAAGAAAACTAGCAAAAGCGCCGCTGTCATCGAGAACCATTCTGGAAGGTCATGTCGCGACTGGCTAGCTGATGTCGGGTTCATTTTCATGAAAAGTCAGTTTTGCTCTAAGTGGGACAACAGGTTCAGGGACGCCAAAGCTGGACAAACTTTAGCCTGCTTTCATCATTCAATTTTGTGCCGCTTTGCACCCTATATGAGATACATTGAACACAAGCTTCAGGAGGTCCTGCCAGCCAACTTGTATATCCATTCTGGGAAGAACTTGGAAGATCTCAATCGTTGGGTGATTGAGAACAGCTTCACTGGCATGTGCACTGAATCAGACTACGAAGCTTTCGATTCAAGCCAGGATCATTACATTCTGAGCTTTGAGATTGAAGTCATGAAGCATCTTCAGTTACCTTGGGACCTAATTGAGGATTATGTGTACATCAAAACCCACCTTGGTTCTAAGCTTGGAAACTTTTCAATCATGAGATTCACTGGTGAGGCAAGCACATTCTTATTTAACACGATGGCAAACATGTTGTTCACCTTCCTGAGGTACGAACTCAATGGCTCAGAGGCCATATGCTTCGCTGGTGATGATATGTGCTCAAACCGGAGACTGAGGGTGTCAAATAAACATGAGAGGTTCCTGAGCAAACTTAGGCTGAAGGCCAAAGTCCAATTTACGGTTAAGCCAACATTTTGTGGATGGAACCTGTGCCTCGATGGAATTTTCAAGCGTCCTCAGCTGGTACTGGAGAGGCTCTGTGTTGCAAGAGAGAAAGATAACTTGGCCAACTGTCTTGACTCCTATGCTATAGAGGTTGGTTACGCTTTCGCTTTGGGTGAAAAAGTTTTGCAGTATATGGATGAGGAGGCCATGCAAAACCATTACAATTGTGTTAGATTCATTGTCAAACATTCACATCTCCTTAAATCAAGCGTTCGTGATCTCTTCTTACAGAATATGTAGATTAGGTTTAACATTGTGTTATGTGAATAAGTATTCTTGTGTTTGGTGATGGATTTTGTTTATGATAAATTAATAGACGCTGGCTACATTAGAACTAGACTGCCAATTAGTTTTCCCATTATTGTTCACTGTATTGCCGGAGCTGGAAAAAGCACTTTAATCAGGGAAATCATTGAAGCTGACCACAGGTTTGAGGCTTTCACTTACGGTGTCCCGGACCCAATTAATCTTTCTGGAGTGAGAATTAAGAGCAACCTTGACATACCTTCAGCACGTGCTGACTCACTCAAGATCATCGACGAATACATAGGTCAAGATCAGCCTGAGGGGACAACTTTTTGCTTTGCGGATCCAAACCAATTTCCCTACACCTGTCCAGACGCACATTTCACATGCTACCAGACTAAGAGGTTTGGTGATCAAACTTGTGCATTGTTGGGAAAGATTGACTGTGCTGCATTCTCTTATAAACAAGATCAGATAATCTTTGACAAATTGTTTGCTGGTGACATTGAAGGTCAGATCGTTTGCTACGAAAAGGAAATTTTTGATCTCCTTGACCGCCACGGGGCAGATTATAAGAAATATTGCCAAATCCGGGGATCAACTTTTGATATCGTGACCTTCATAACTGCATCAGACACTTTTGAACCTGAGGATCGGTACAAAGTCTATCTTTGTCTAACTAGACACCGTTCGATCCTACGTATTCTGAGTCCTGAGGGGAAGTTCTTAAGGGAGGATGCCAAGTTTGACACCACCACCTGACAACACAAGGGTTTTGTTACCAATCGCCATTGGCCTTGGGGTGGGGGTTGTTATTTGGTGTTTAACAAGGTCTACATTGCCTCAAGTCGGAGACAATATCCACAGTTTGCCACACGGTGGGAGTTATTTGGACGGAACAAAGAGAATCAGCTACTGTGGACCAAAGAACAGTTTCCCAAGCAGCAATCTCTTCAAAGGAGGTGCCTTTTCAGCAATTTGTGTCGTAGTGTTGTCAGTGTTTGCTATTCATGTTTCAGAGTTATTTAATCGGCCTAATCGCCGCCCTTGCGGCTGTAGTTCTGCTTCACATGCTTAACTCGGGGCAGGAAGGTTGTTTAATAATTATTAGCGGAGAGTCTGTAGTCATTAAGAATTGTGTGTATACTAGTGAGTTCATTAATCTGGTTAAGGGCCTCAAGCCCCACAACCATTGGAATTCACTGTAGTTAGGTCCAGTGTGAGTAGATTGAAATAATAGATCACTTTGAGTTTTTGATTAAGATGACTACTTCTCAATCCACAGCAACTGCTGATGTCGAGACTTCCGAAGTCAAGACTACTCCACCCCCGGTTGTCACCAGTGAACCTGTTTTACAGCAGGTGGTCTCTTTTGACACTTCAAGAACAGCTGCTGTACCACCGCCACCTGTCACTACTCAGACGTCAACTACTACGACGAAAGGTGTTGAGAGATCATGGTTTGGGCTCCCATCAAAGACGACGGGTTTGGGTACATTGAGTGCTACTGCGACGTACACAGCACCCCTGTTGCAAGCTTCAGGGCGAGCCTCACAGCTTGATGAGGACCTTAAGAGGCTTAAGGCAAGGGATGAAAACTTCCTTGTACTAAATAGTGATGTTGAAAACATTGAGGCAACGACAAGTGGAAAAATGAAGGGGCCAAGGGGGATTGTGCCAAGCATGATGTCTTATGAGAAACCCGAAAAGGGTAAAGTTGTTGAGGAGCCCAAGGGGTTGAGCTTAGGCTCAAGGCAGAGATTAGTTTTCGAAAAGGCTAGGCAGAGGGCACAGGTGGACATTGAAGCTGATCGTGACAGTTTGGCGCCGCCATTTGCTTCAGCAGATCCCTTCTCCCGACCAAAAGTTCAGGATGTCCAAAGGTTCTCATATGAACCCAGCTCACCTGACATTTCAACGGCTGAGGAGATTGAGCACATCAGAAGTGATCTGATTAGGGCAGGTGTGCCTGAGCCCACACTCACCTTTTCAATGTGGGACATAGCTAGATACTGCGCTGATGCTGGCTCCTCAGCCTCGACTGAGTTCATAGGGACAAGCAGTTACAGCGGCCGCGTGACCAGAATGGAGATAGCCTCGGTGATCAAGAAGCATACAACCCTGAGGCGATACTGTGGCTTCTATGCAAAAATTGTTTGGAACATAATGCTGTCAACCAACATACCACCTTCTGGGTGGGTGAAAAAGGGCTACAAGAAGAACACAAGGTTTTCTGCATTTGATTTCTTTGAGCAAGTCTCAAACAATGCTGCGCTGGAGCCAGAAAATGGGCTAGTTCGTGAGCCCAACCACGAGGAGTTGGTTGCATCCCAAGTGAATAAGGGGGTTTCATTGCACAGAACTGAAGCTGCACAGGATAAGAACGTGTCAACTGCACACGAGGTAACAGGTGGGAGAGCTGGACCCCGGTCAAGACTGTTGTTGAAGGGGAAAGAGATGGATTGAGTGGTTATGGCCTAGAACCGTGGAAAGGCCTAAAAGAGTCCACGTGCCGTCTTAGAGTTATAGTGTGCGTATTAGTAAATATTAGTAGTTTCCACTTCCCAAGGTTCCAGGTCTCGAACCCAGGAAAGACCTTAAAGAGTCCTGGTTGGCGTTTAGCCGTAGAAAACCTCTGCACCACATAGGCCACACCAAAGTTTATCATTGTGTGCCTTATGCGGGCAAGTTAACCGAGTTGTGGCGGCAACCGGAGAGAGTCAGATACAAGCGTAGATTTATGAGCTACGCCCTGTGGTTGGATTCCACCGTTATCTCGTCGTTAAGGGAGCAACCCCTTTTCTCTCGCTTATAGGGGTATTGTTAAGCGAGCGTGTGACCCATTGAGAGATGGGTTCCCTACGTTAAGGGTAGTTGAAGTTTAGAACAAACTTCCATGGTTCCGACCTGCCATGATTAAAGTGATCGGTAGTTCTGGGTAAGAAACAACCCTGTGCTTGGTGGCTAAGCATGACCACTCAGTTTGACCGACTGGCCAGACAGGTTACGTTTCCCACTTCGATATCAAAAGTGGGCGCATGCCAAAGCGTTAAATTGCTTGAAAGTATGTTTCAAACTCTCAGTTTTGGGAGTTTGAGACAGGCTTTAGTCCTGGTGATCTGACTTTAAAAGAGCCAAATAAACCGCATTTCAACGCGTTATAGTGTTCGCTAACAGACCGTACAAATAGTCTGTTTCACCAACCTAAGACCTAAATAATTGAATAAGGGGAGGTGATTAAACAAATTTG
| 53,949
|
KY445748.1
|
Asian prunus virus 2
|
Jo,Y., Lian,S., Cho,J.K., Chu,H., Choi,H., Cho,W.K.
|
Seoul National University, Department of Agricultural Biotechnology
|
Korea
|
2017-07-23
|
WY
|
Asian prunus virus 2
|
Foveavirus
|
Betaflexiviridae
|
ssRNA(+)
| 9,389
|
GenBank
| null |
South Korea
|
South Korea
|
Prunus mume
| null |
2014-07-25
| null | null |
Asian prunus virus 2 isolate WY, complete genome
|
CAATCTATCAACAAACGACCCCGCTCGAAACAGACCTAAGTCGTTCGTAATGGCTTTAACATACCGAAGCCCGATAGAAGAAGTTCTTAATCGCTTCACCTCTGAGGAGCAGTCCAGGGTAAGTTCAACGTCAGTGGCCAGATTAACCCAAGTTGAAGTTAGCAATCACAAACTCTTTTCATTCGCTTTGAGTGAGAAGGCCAAAGAGAAGCTAATTAAAGTTGGAATTTATTTGAGTCCATTTTCTTTTGAACCACATTCACATCCTGCCTGCAAAACATTGGAGAATCACATTTTATATAATATTTTAGCTAATAAATTAGACAATAGTTTTTATGCAATAGGCATTAAGGGTTCTAAGGTCAACTTCTTAAAAAGTAGGTCAAAGAACCTGAGTATGCTGGAGTATGTGAACCGTGTCGTAACCAGTGCAGATAAGTACAGGTATGGTAGTGACTTCACCACACTCAGTTCAAAGCAAATCGACAACCTCTGCTCAAAAAAGAGCCTCAGTGAGTGTGGCACATTGAAGGAACTTGTTCCACTGGTTAAAATGAGCAAGAAAAGAAATTTTTTTTTACATGATGAGCTTCATTACTGGAGCCCACAAGACTTGATGCTTTTTTTGGACTCAGTTAACCCTGATCACTTGGTAGCAACAGTGGTCTTTCCTCCCGAAATACTAGCTGGAGCCAAGGAAAGTCTCAACCCATGGTGCTATTCGTTTCACCGGCAGGGCGGCAAATTAACGTTCTTTCCAGACGGGGTTCAAAGTGAATCATACACACAACCTCTCAGCTCTGGTTACATCCTGAAGGCGTCCAAGATTGTGTGTCCAAGTGGTCAAATCTACTCCGTGGATCTTGTGTACTCAGCCTTTGCACACCATGTAGTGAGCATAACAAAGGGAAATCTACCAGGACTTGAGAGGCGGTTCTTCTCAAATTTTGAGGCAACCGGGGTGAAACATCTATCAGGCCTCTCCCATTCAGTGAGGGACTGCATCCCAGTCAGTGCTGACCTAATATCTAAGATCTACAGGTATATTCGGACCCTCAAGAAGCCTGACCTACAGTCCTGCATGGCTAAGCTCAGCCAAATTGTTCCCAATCCAACTGGCATTGAAATTAAATTCACAGAGGACTTCTCACGACTAGTCATGGAAATTCAGCCTCTAAAGTCCCTTCTCATGCCAGACACTGCTAAACTCATTGGGGCTCTGTTCGCTTCCTTCTTGCCCTTCAAAATGGCAAGGTTTTTTGACTGCTACAAATCAAGCTCATTAGACAAATTTATTCATGACTTGGAACCATTTAGTTTCTCTGTGCCCACAGAAGTTATTGACTGCAACACAATGCCAGTTTTTGAAGCAATCTCTTTGGGTGAGTCAATGAGTCCAGAAGAGGTTGTCCAAATTTTAAACCGAATGGAAATTGGGGCATTCGCTGGGTCATGTAACTTGGTAGGGAAATTCAAGTACTCAAACGAGGCCTACCACTGCCTACACCATGTTCTTGATGGTTGCAAGCCTGAAGTTTTTAAGAGGTTGATTAGAAGAGTAGCAGGTGCCTTCTGCAATGAGTTCGGTGTTTACCGGAGGAGTAGTTATGTGGCATCCGTTGCAATTAATGTGTTCCAGAGAAGATCAAACCTAAATCTTGACTTCATCTTTGGATCTGATCTGAATCAGAAGGTTGTCTGCATTGTTCGCAACTTCTTTTCCTCAAAGAAATCCTCTCAGCTTATCTGGCATTCCACAAATTCTATGGCTTGGTTCCGTTTTTCAAGGTTGAGAGCTAACCAAAAATTTCTAAGATCACCAATTTTCCCTGCCTCCATGGATTGCAAGGACCTTTCAACTAGGAAAAATCTGATTTTTGACTTCGAGGTTTTTGGTTTTTGTGCTGGTTTAAGAAAGCTTGGGTCCCCAGGAGTTTCTCCAGTGGTTCCCCCTAAGCCTGTCCTTGGTGGCTTTGAATTCGTACCCCCTGGGGAGGAGGCCCATGAGGATGATGTTAAGGTTGAATTGAACGTCACGACAGAAATGTTTAATCCACAAGTGCAGGTAGTCCCTGGAGTTGAAAGTCCAGCTGTTTATGTGCATGGGATTGACCTACAGGATCAAACTTTCTCCTCCAAAGCTACCAATCCTGAAGAACGAAATGGCCTTATTTTTGGATGTGTTCCTGAGTCAAGCTTGGGAAATTTTTCATTTAGTTCAGCAAATCAAGGTGATCGACTCTTCGCCAACATTGTAAATGAAAATATAATAGATGTCGGAATCCTTCCTCCCACTGAATTGAAAATCCCATTGGATGCTAAAGTCACACAAGTCAATGGTCGGGACTGCTTCTTCTTCACAAGGTGTTCATGCATAGACTATGGCCACAACAAGATTAAGTATATTGCTAATAACTGGTTTGCAGGCCTTGATCAATTTCTATCCAATGAGGGAACATACTACAATGCATGCCTTCTGCAAGTTTACAAGGCCGGCAGTGGAATTGGTTTTCACTCTGACAACGAAAAGGTTTACCACAGAAGTCCGATCAAAACCGTTAATCTGTGTGGAGAGGCAGACTTCCTTGTTAAAGCTAAGGGTAGGAGAGACTTGGGGACTGTCGCAAGGGGGCATCTCTTCCCAGGACATTATTTCACAATGGATTCAAACTTCCAGTCTTACTACCAACATTCGGTTCAAGATTGCAGCGAGGGGAGGGTTTCCTTAACCTTTCGCCATCATGTAAACAATATCACAGGGCTGCCAATTAAACACACTTGCGGAGAATTTGGCGATACCGAGATCCTGTTTGATGTGCTCATAAGAAGGAGTTTCACCTATGCAGCAAAGAACTTTCATACCTTCCCGGTTCCTGGGGATGGTAGTTGCTTTTGGCATAGTATGGGGGCTTTGTTGGGAGTTGATGGTGAGGAATTGAAAAAGATATCCGCGAGGGAGATTCAGAAGAACGAAGTTTTACTATCCAACCTGAACCTTCGTCAGCAGATGGCCAATAAACAGTATGCTGAAAGAGAGTCAATTGCGGCCTTCTGCAGGATCCAGTCAATCCATTTGGTTGTTCTGCTTCCAGGCAATAATTTCTCTTATGAGTTTCTGCCGTCACAAAATCCTGAAGTTACCCAGCTGTTTGTCAAATTGACGGATGAGCACTTTGAACCTGCTTTGCCAGTTAACGGATGTGTTGTCAAGTCAATTGCAGAAACCCTAAATCAGACCGAGGCGAAGATCTTGTCAGTAATTGGGAGGCCTACAAATAGAATGATTCTCGACAACTTAGTCGAGGGAGAGGGACTCAACCTTGAAGACCTTGAAGCAGCATTCACAATCTTTGGGATATGTGCCAGAGTCAGCTCAGAACATGGGGTTTTCACCTTAAACAGGGATGGCAACCTGCACGCGAACTATGAATTGAAGTCTGGTCATATAATGTACTTGAAGAAAGTCTCCAGCTCACAGTTTGCTCCATCCACACCAATCCAGAATTTTAATGGGCAAGGACCAGAGTTGTTCCTAAAGGGAATTGTCAGTGAGGTTAAATATAAGCCAGATTGGGAACGAGCCAGGAATTTGGAGGAATCGTTTCTTAATGGCACAACAGGGGTTCTGTGTGACCGCACTGTCAATCTCCAAAAGAATTGGTTAACTGAGGGAAGAAAGCTGGTGAAGGATGAGCGGAATCTAGGGGTTGTTCTCGGCACTTTTGGATCTGGTAAAAGCACATTATTCAAACGATTCATCGTTAAAAATCCTTCAAGGTCAATCATTTTTGTTTCTCCAAGGAGGTCATTAGCTGATCAGATTAAGGAGGACTTAGGCCTCAATTCAAAGAGGGGGAGATCCCTAAGAGTCAGGGTCTTAACCTTAGAGAGCTTCATTAAAGCGGTTTTCACTTTCAAGGCAGCAAGTGTGGTGCTCGATGAGGTGCAACTGTATCCTCCTGGGTACCTTGATTTAATGATGTTATGTCTTAGTGGAAACTGTCAGATCTACCTCTCCGGGGATCCATGCCAGAGTGATTACGATTCAGCCAAGGACAGAGCGCTCTTTGATGGCATGAAGGGGGACATTTTCGAAGTGCTTGAAGGAAGAAGCTACAAATTCAATGCAACCAGCAGGAGGTTTCAGTCCCAGATGTTTGTGGGAAGGCTTCCCTGCCGTTTGGATCCAAAAGACATGGTTGGAGATGAGGACTTTCATTGGCTTGAGAGTATTGAGGCTGCAGCTGAGGTTAGTAACACCGAATACGATGTTGTTCTAGTTTCAAGCTTCGAAGAGAAAAAAATCATTTGGGCACATCTCGGGAGAGAAGTTGAGGTCCTCACTTTTGGAGAGTCAACAGGTTTAACATTTAACAGGGGTATTATTCTCATCTCTCATGAAAGCACCCTCACTGGTGAGAGAAGATGGATTACAGCGCTGTCAAGATTTAGACTGAACATTATCTTTGTTAATTTGGTTGGCAACAGTATTGAGGACGTATGCCAAGTTTTCCATGACCGGACACTATTCAGGTTCCTCAATCGCACCGCAACAGTTGGGGACATCCTCAAGCAACTCCCTGGCCATCCAGAACTAACGAATGACTTTGGTGACAAGGTTGGGAAGTCGGAAGGAGTCATGGAAGACAAGCTTGCTGGTGACCCGTGGTTGAAGGCTGAGATCGATCTGCTACAGGATGAGGATCAGGAGATGATTGAGCTGGCAGAGGAGGTTAAAAATGAGCCATGGTTTAAAACCCACCTGCCCTTGTTTGAGTTGGAATCCATAAGGGCAAATTGGGTACATAAGATAATGAACAGGGAGTACCGTGAAGTACGTTGCGGAACGGAAGTGTCGACCCAGTTCCCCGAGGACCACCCCAGCAAATATAAGGTGACCTTAGCCAATGCAGCCGAGCGCTTTGAAGCAATTTATCCAAGACACAAGGGGAGCGATTCTGTGACCTTCCTAATGGCTGTTAAAAAAAGGCTTAGCTTTTCAAGACCATCTGTTGAGTCAGCCAAGTTAAATAGGGCGAAGCCGTATGGAAGATTTCTTCTGCATGAGTTTCTCAAGAGGGTCCCCCTAAAGACTGGTTTAGACTCAGCTCTGTTCGCTAGATCAAAGAGGGAATTTGAAGAGAAAAAAACTAGCAAGAGTGCTGCCGTCATCGAAAACCATTCTGGGAGGTCATGTCGCGACTGGTTAGCTGATGTTGGGTTTATTTTCATGAAAAGTCAGTTTTGCTCCAAGTGGGACAACAGGTTCAGGGATGCTAAAGCTGGGCAAACTCTGGCCTGCTTCCATCATTCAATTTTGTGTCGTTTTGCACCCTATATGAGATACATTGAACATAAGCTTCAGGAGGTTCTACCAGCCAATTTGTACATTCATTCTGGGAAGAATCTGGAGGACCTCAACCAATGGGTAATTGAGAACAGCTTCACTGGTGTGTGCACTGAATCAGACTATGAGGCCTTCGATTCAAGCCAGGATCATTACATTCTGAGCTTTGAGATTGAAGTCATGAAGCATCTCCAGCTGCCTTGGGACCTAATTGAGGATTATGTGTACATCAAAACCCACCTTGGTTCCAAGCTTGGGAATTTTTCAATAATGAGATTTACTGGTGAGGCAAGTACATTCCTGTTCAATACGATGGCGAATATGTTGTTCACTTTTCTGAGATACGAACTCAATGGTTCAGAGGCCATATGTTTCGCTGGTGATGATATGTGCTCAAATCGAAGACTGAGGGTGTCAAATAAACATGAAAGGTTTCTGAGCAAACTTAGGCTGAAGGCCAAAGTCCAATTTACAGCTAAACCAACATTCTGTGGATGGAATCTGTGCCTTGATGGTATTTTCAAACGTCCCCAGCTAGTCTTGGAAAGGCTATGTGTTGCAAGAGAGAAAGATAACCTAGCCAACTGCCTTGACTCCTATGCCATAGAGGTTGGTTACGCTTTTGCTTTGGGTGAAAAAGTCTTGCAATATATGGATGAGGAGGCCATGCAGAACCACTACAATTGTGTCAGATTCATTGTTAAACACTCACATCTCCTCAAGTCGAGCGTTCGTGATCTCTTCTTACAGAATATGTAGATTAGGTTTAACATTGTGTTATGTGAATAAGTATTCTTGTGTTTGGTAATGGATTTGGTTTATGATAAATTAATAGACGCTGGTTACATTAGAACTAGACTGCCGATTAGCTTTCCTATCATTGTTCACTGCATCGCTGGCGCTGGGAAAAGCACTTTAATCAGGGAAATCATTGACGCTGACCACAGGTTTGAGGCCTTCACTTACGGTGTCCCGGACCCGATCAATCTTTCTGGAGTGAGAATTAAGAGCAACTCTGATATACCTTCAGCACGTGCTGACTCACTCAAAATTATCGACGAATACATTGGCCAAAATCTGCCTGAGGGGACATCTTTTTGCTTTGCAGATCCAAATCAATTCCCCTACACCTGCCCAGACGCACACTTCACATGCTACCAGACAAAAAGGTTTGGTGATCAAACTTGTGCATTGTTGGGAAAGATTGACTGTGCTGCATTCTCTTATAAGCAGGACCAAATAATCTTTGACAAATTGTTTGCAGGTGATATTGAGGGTCAAATTGTCTGCTACGAAAAGGAAATCTTCGATCTTCTTGACCGTCACGGGGCGGATTATAAGAAGTTTTGCCAGATACGGGGATCAACCTTTGATATTGTGACCTTCATAACTGCATCAGACACATTTGAACCCGAGGATCGGTACAAAGTCTATCTTTGCCTAACTAGGCACCGTTCGATCCTACGTATTTTGAGTCCTGAGGGGAAGTTTCTAAGGGAGGATGCCAAGTTTGACACCACCACCTGACAACACAAGGGTTTTGTTACCAATTGCCATTGGCCTAGGGGTGGGGGTTGTTATCTGGTGTTTAACAAGGTCCACATTGCCTCAAGTTGGAGACAATATTCACAGTTTACCACATGGTGGAAATTATTTGGACGGAACAAAGAGGATCAGCTACTGTGGACCAAAGGACAGTTTCCCAAGCAGCAATCTCTTCAAAGGAGGTGCCTTTTCAGCTATTTGTGTTGTAGTGTTGTTAGTGTTTGCTATCCATGTTTCAGAGTTATTTAATCGGCCTAATCGCCGCACTTGTGGCTGTGGTTCTGCTTCACATGCTTAACTCTGGACAGGAAGGTTGTTTAATAATTATTAGTGGAGAGTCTGTGGTTATTAAGAACTGTGTGTATACTAGTGAGTTCATCAATCTGGTTAAGGGCCTCAAGCCCCATAACCATTGGAATTCACTGTAGTTAGGTCCAGTGTGTGTAGATTGAAATAATAGATCACTTTGAGATTTTGATTGAAATGACTACTTCTCAATCCACAGCAACTGCTGATGTCGAGGCTCCCAAAATCGAGACTACTTCGCCTCCGGTTGTCTCCAGTGAACCTGTTTTGCAGCAGGTGGTTTTTTCTAACACTTCAAATGCAGCTGCTACACTGCCGCCACCTGTCACTACTCAGACGTCAACTGCTTCGACGAAAGGCGCTGAAAGGTTATGGTTCGGGCTCCCATCCAAGACAACGGGTTTGGGTACATTGAGTGCCACTGCGACATCCATGGCACCCCTGTTGAGTACCTCGGGGCGAGCTTCACAGCTTGATGAGGACCTCAAAAAGCTTGAGGCGAAGGACGCGAGCTTCCTTATGCTGAATAGTGAGATTGAGGATCTTGGGGCAACGACAAGTAAAAGGGTACAGGGGCCAAGGGGGGTTGTGCCAAGCATGATGTCTTATGAAAAGCCTGAAAAGGGTGAGGTTGTTGAGGCGCCCAAAGGGTTGAGCTTAGGCTCAAGGCAGAGATTGGTCTTTGAAAAGGCTAGGCAAAGGGCACAGGTGGACATTGAGGCTGACCGTGACAGTTTGGCACCGCCATTTGCTTCAGCAGACCCCTTCTCCCGACCAAAAGTTCAGGATGTCAGGAAGTTCTCCTATGAACCAAGCTCACCTGACATTTCAACGGCTGAGGAGATTGAGCACATTAGAAGTGATTTGATTAGGGCAGGCGTGCCTGAGCCCACACTCACTTTTTCAATGTGGGACATAGCCAGATACTGTGCTGATGCTGGCTCCTCAGCCTCAACTGAGTTCATAGGGACGAGCAGTTACAGTGGCCTCGTGACCAGAATGGAGATTGCCTCGGTGATCAAGAAACATACAACCCTGAGACGATACTGTGGCTTCTATGCAAAGATTGTTTGGAACATAATGCTGTCAACCAACATACCACCTTCTGGGTGGGTGAAAAAGGGTTATAAGAAGAACACAAGATTTGCAGCATTTGATTTCTTTGAGCAGGTTTCAAATAATGCTGCTTTGGAGCCAGAAAATGGACTAGTTCGTGAGCCCAATCATGAGGAGTTGGTTGCGTCCCAAGTGAATAAGGGAGTTTCGTTGCACAGGACTGAAGCTGCACAGGATAAGAACGTGTCAACTGCACACGAGGTAACAGGTGGGAGAGCCGGACCCCGGTCAAGACTATTGTTGAAGGGGAAAGAAATGGATTGAGTTGTTAACACAGGGCCTAGAACCGTGGAGAGGCCTAAAAGAGTCCACGTGCCGTCATAGAGTTATAGTGTGTGCTTTAGTAAATATTAGTAGTTTCCACTTCCCAAGGTTCCAGGTCTAGAACCCAGGAAAGACCTTAAAGAGTCCTGGTTGGCGTTTAGCCACATAAAACCTCTGCACCACATAGGCCACACCAAAGCTCACCATTGTGTGCCTTATGCGGGCAAGTTAACCGAGTTGTGGCGGCAACCGGAGAAAGTTAGATACAAGCGTAGATTTATGAGCTACGCCCTGTGGTTGGATTTCCACCGTTATCTCGCCGTTAAGGGAGCAACCCCTCTTTTCTCGCTTATGGGGTCATTGTTAAGCGAGCGTGCGACCCATTGAGAGATGGGTTCCCTACGTTAAGGGTAGTTGAAGTTTAGAACAAACTTCCATGGTTCCGACCTGCCATGATTAAAGTGATCGGTAGTTCTGGGTAAGAAACAACCCTGTGCTTGGTGGCTAAGCATGACCACTCAGTTTGACCGACTGGCCAGATAGGTTACGTTTCCTACTTCGATACCAAAAGTAGGCGCATACCAAAGCGTTAAATTGCTCTAACGTTTGTTTCGAACTCTCAGTTTTTGGGGCTTGAAACAGACTCTAGTCCTGGTGATCTGACTTTAAAAGAGCCTAATAAACCGCATTTCAACGCGTTACAGTGTTCGCTGACAGACCGTACAAATAGTCTGTCTCACCAACCTAAGACCTAAGTAATTGAATAAGGGGAGGTGATTAAACAAATTTGCTTTTTATCGCTAATTTTTGC
| 75,602
|
KY310581.1
|
Asian prunus virus 2
|
Jo,Y., Lian,S., Chu,H., Choi,H., Cho,J.K., Cho,W.K.
|
Seoul National University, Department of Agricultural Biotechnology
|
Korea
|
2017-07-10
|
BC
|
Asian prunus virus 2
|
Foveavirus
|
Betaflexiviridae
|
ssRNA(+)
| 9,402
|
GenBank
| null |
South Korea
|
South Korea
|
Prunus persica
| null |
2014-05-18
| null | null |
Asian prunus virus 2 isolate BC, complete genome
|
GGATAACCAGAACAATCTATCAACAAACGACCCCGCTCGAAACAGACCTAAGTCGTTCGTAATGGCTTTAACATACCGAAGTCCGATAGAGGAAGTTCTTAATCGCTTCACCTCTGAGGAGCAGTCCAGGGTAAGTTCAACGTCAGTGGCCAGATTAACCCAAGTTGAAGTTAGCAACCATAAGCTTTTTTCATTCGCATTGAGTGAGAAGGCTAAGGAAAAGCTAATTAAAGTTGGAATTTATCTGAGCCCATTCTCTTTTGAACCGCATTCACATCCTGCCTGCAAAACATTGGAGAATCACATCTTATATAATATTTTAGCTAATAAATTGGACAACAGTTTCTATGCAATAGGTATTAAGGGTTCCAAGGTCAACTTTTTAAAAAGTAGATCAAAGAACCTAAGCATGCTGGAGTATGTGAACCGTGTTGTCACCAGTGCAGATAAGTACAGGTATGGTAGTGACTTCACCACACTCAGTTCAAAGCAAATCGATAACCTCTGCTCAAAAAAGAGCCTTAGTGAGTGTGGCACACTGAAAGAATTAGTTCCACTGGTTAAAATGAGCAAGAAAAGGAATTTTTTCTTGCATGATGAGCTTCACTACTGGAGCCCACAAGACTTGATGCTCTTTTTGGACTCGGTCAATCCTGATCATCTGGTAGCGACGGTGGTTTTTCCTCCCGAAATACTGGCTGGAGCCAAGGAGAGTCTAAACCCATGGTGTTATTCATTCCACCGACAAGGCAGTAAATTAACATTCTTTCCAGACGGGGTTCAAAGTGAGTCATACACACAACCCCTCAGCTCTGGTTACATCTTGAAGGCATCCAAAATCGTATGTCCGAGTGGTCAGATTTACTCTGTGGATCTTGTGTACTCAGCCTTCGCGCACCATGTTGTAAGCATAACAAAAGGGAATTTGCCAGGGCTTGAAAGGCGTTTTTTTTCAAATTTCGAGGCAACTGGGGTGAAACAACTATCTGGCCTCTCCTATTCTGTGAGGGACTGTATTCCAGTTAGCACTGATCTAATATCTAAAATCTACAGATATATCAGGACCCTCAAGAAGCCTGACCTGCAGTCCTGCATGGCCAAGCTCAGCCAAATAGTCCCCAATCCAACTGGTGTTGAAATAAAATTCACAGAGGATTTTTCACGACTGGTCATGGAAATTCAGCCTCTAAAGTCCCTCCTCATGCCAGACACTGCTAAATTGATTGGGGCTTTGTTCGCTTCCTTTCTGCCCTTTAAAATGGCAAGGTTTTTTGACTGCTACAAATCAAGCTCATTGGACAAATTCATTCATGATTTGGAGCCGTTCAGCTTTTCTGTGCCCACTGAGGTTATCAACTGCAATACAATGCCAGCTTTTGAAGCAATTTCTTTGGGCGAGTCAATGAGCACAGAGGAGGTTATGCAAATATTGAACCGAATGGAAATGGGGGCTTTCGCTGGGTCATGTAACTTGGTGGGGAAGTTCAGATACTCAAATGAGGCCTATCACTGTCTCCACCACGTTCTTGATGGTTGCAAGCCTGAAGTTTTCAAGAGGTTGATTAGGAAGGTCGCAGGTTCCTTCTGTAATGAGTTTGGCGTTTACCGGAAAAGCAGTTATGTGGCATCTGTTGCAATCAATGTGTTCCAGAGAAGATCAAACCTAAATCTTGATTTTATCTTGGGGTCTGATCTGAATCAAAAGGTTGTTTGTATTGTCCGTAATTTCTTTTCTTCAAAGAAATCCTCGCAACTTATTTGGTATTCCACAAATTCTACGGCTTGGTTCCGCTTTTCAAAGCTGAGAGCCAATCAAAAATTCCTGAGATCACCAATTTTCCCTTCCTCCATGAATTGCAAAGATCTTTCGATTAGGAAAAATCTGATGTTTGATTTTGAGGTTTTTGGTTTCTGTGCTGGCTTAAGAAAGCTTGGGTCTTCGGGAATTTCTTCAGTGGTGCCCCCTGAACCAGCTCTGGGTGGCTTTGAGTTTGTACCCCCTGGGGAGGAGGCCCACGAGGATAATATTGAGGTGGAGTTGAATGCCATGAAAAAAAAATCTGATCCATCAGCACAGGTAGTTCTTGGAATTGAAAGTCCAGCTGTTTGTATGCATGAGATTGACCCACAAGATCAAACTCTCTCTTCCAAAGCAGCTTACCCTGAGGAACGAAATGGTCTTATCTTTGGATGTGTTCCTGAGCCAAGCTTAGGGAATTTTTCGTTCAGTTCAGCCAATCAGGGTGATCGCCTCTTCGCCAACATTGTGAATGAAAACATAGTTGATGTTGGGATTCTCCCTCCCACTGAATTGAAAATCCCATTGGATGCTAAGGTTACACGAATCAATGGTCGGGATTGCTTCTTCTTCACAAGGTGCTCATGTATCGACTATGGTCATAATAAGATCAAATACACTGCCAATAACTGGTTTTCAGGCCTCGATCAATTTCTATCCAATGAGGGAACATACTACAACGCATGCCTCCTGCAAGTTTACAGGGCTGGCAGTGGAATCGGTTTTCACTCTGACAACGAAAAGGTCTACCACAGAAGTCCTATCAAAACCGTTAATTTGTGTGGAGAGGCAGATTTCCTTGTTAAAGCTAAGGGTAGGAGGGACTTAGGAACTATTGCAAGAGGACACCTCTCCCCAGGACATTATTTCACAATGGATTCAAATTTCCAGTCTTACTACCAACATTCAGTCCAAGATTGTAGTGAGGGGAGGGTCTCCTTAACATTTCGCCATCATGTAAATAATATCACAGGGCTGCCAATCAAGCACACCTGTGGAGAGTTTGGTGATACTGAAATTTTGTTTGATGTGCTCATAAGGAGGAGTTTCACCTACGCAGCAAAAAACTTTCACACCTTCCCAGTTCCTGGGGATGGCAGTTGCTTTTGGCATAGTATGGGGGCTTTATTAGGAGTTGATGGTGAGGAATTAAAGAAGATATCTGCGAGAGAGATCCAGAAGAACGAAGTTTTACTATCCAACCTGAGTCTACGTCAGCAGATGGCCAATAAACAGTATGCTGAAAGAGAATCAATTGCGGCTTTTTGCAGGATCCAATCAATCCATTTGGTTGTTCTGCTTCCAGGCAATAATTTCTCCTATGAGTTCCTTCCGTCACAAAACCCTGAAGTCACCCAACTGTTTGTCAAACTAACAGATGAGCACTTTGAACCCGCTTTGCCAGTGAATGGATGCGTCGTCAAGTCAATTGCTGAAACCCTGAATCAAACCGAAGCAAAGATCTTGTCAGTGATTGGGAGACCCACAAATAGAATGATTCTCGACAACTTGGTCGAGGGAGAAGGACTGAACCTTGAAGACCTTGAAGCAGCATTTACAATCTTTGGAATATGTGCTAGGGTCAGCTCAGAACATGGGGTGTTCACCCTAAATAGGGACGGTAATCTGCATGCAAACTATGAATTAAAATCAGGTCATATAATGTACTTAAAGAAAGTTCCTAACTCACAGTTTGCTCCCTCAACACCAATCCAAAATTTTAATGGACAGGGGCCTGAGCTATTTTTAAAGGGAATTGTCAGTGAGGTGAAATATAAGCCAGATTGGGAAAGGGCTAGGAATTTGGAGGAATCATTCCTTAATGGCACAACAGGGGTCTTGTGCGACCGCACTGTCAATCTCCAAAAGAATTGGTTGACTGAAGGAAGAAAGCTTGTGAGGGATGAGCGAAATCTGGGTGTTGTTCTTGGAACCTTTGGATCTGGTAAGAGCACATTATTCAAGCGGTTCATTGTTAAAAATCCTTCAAGGTCAATCGTCTTTGTCTCTCCAAGGAGGTCATTAGCTGATCAAATTAAGGAGGATTTAGGTCTCAATTCAAAGAGGGGGAGATCCCTAAGAGTCAGGGTCTTAACCTTAGAAAGTTTCATCAAAGCAGTTTTTACTTTCAAAGCAGCAAGTGTGGTGCTTGATGAGGTGCAACTGTATCCTCCCGGGTACCTTGATTTAATGATGCTATGTCTTAGTGGAAATTGTCAGATCTACCTCTCAGGAGATCCTTGCCAAAGCGACTACGATTCAGCCAGGGACAGAGCGCTCTTTGATGGAATGAAGGGGGACATCTTCGAGGTGCTTGAAGGGAAAAGCTATAAATTCAATGCAGCCAGCAGGAGGTTTCAGTCTCAGATGTTTGTTGGTAGGCTTCCCTGTCGTCTGGACTCAAAAGACATGGTTGGAGATGAGGACTTTCATTGGCTTGAGAGCATTGAGGCTGCAGCTGAGGTTAGTAACACCGAATACGATGTTGTTCTGGTCTCAAGCTTCGAAGAAAAAAAAATCATTTGGGCACATCTTGGGAGAGACGTTGAGGTCCTCACTTTTGGAGAGTCAACAGGCTTAACCTTCAACCGGGGCATTATCCTCATTTCTCATGAAAGCACTCTCACTGGTGAAAGGAGATGGATTACTGCGCTGTCAAGGTTTAGACTGAATATCATCTTTGTCAATTTGGTTGGCAACAATATTGAGGACGTATGCCAGGTTTTCCATGACCGAACATTATTCAAATTCCTCAATCGCACCGCAACAATTGGAGACATTATTAAGCAACTCCCTGGCCACCCAGAACTTACAAATGACTTTGGTGATAAGGTTGGGAGGTCGGAAGGAGTCATGGAAGACAAGCTTGCTGGTGACCCGTGGTTAAAAACTGAGATTGATCTTCTACAAGATGAGGATCAGGAGATGATTGAGCTGGCTGAGGAGGTTAAAAATGAGCCATGGTTTAAGACCCACCTCCCCTTGTTTGAGTTAGAATCTATAAGGGCAAATTGGGTGCACAAAATAATGAACAGGGAATACCGTGAAGTACGTTGCGGAACGGAAGTGTCAACTCAGTTCCCTGAGGACCACCCCAACAAGCATAAGGTGACTTTAGCCAATGCAGCTGAGCGTTTCGAAGCAATTTATCCAAGACATAAGGGAAGTGATTCTGTAACCTTCCTGATGGCTGTTAAAAAGAGGCTTAGCTTTTCGAGACCATCTGTTGAGTCAGCCAAGTTGAACAGAGCAAAGCCGTATGGAAAATTTCTCCTGCATGAGTTTCTCAAGAGGGTCCCCCTAAAAACTGGTTTGGATTCAGCTCTGTTCGCTAGATCGAAAAGAGAGTTTGAAGAGAAGAAAACTAGCAAAAGTGCTGCTGTTATCGAGAACCATTCTGGAAGGTCATGCCGCGACTGGTTAGCTGATGTTGGATTTATTTTCATGAAAAGTCAGTTTTGCTCTAAGTGGGACAACAGGTTCAGGGATGCCAAAGCTGGACAAACTTTAGCCTGCTTTCATCATTCAATTTTGTGTCGCTTTGCACCCTACATGAGATATATTGAACACAAGCTTCAGGAGGTCCTGCCAGCCAACCTGTACATCCATTCTGGGAAGAACCTGGAAGATCTCAATCGCTGGGTGATTGAGAATAGCTTCACTGGCATGTGCACTGAATCAGACTACGAAGCCTTCGACTCAAGCCAGGACCACTATATTCTAAGCTTTGAGATTGAAGTCATGAAGCATCTTCAGTTACCTTGGGACCTAATTGAGGATTATGTGTACATCAAAACCCACCTTGGCTCCAAGCTTGGCAATTTTTCAATTATGAGATTCACTGGTGAGGCAAGCACATTCTTGTTTAACACGATGGCAAATATGTTGTTCACTTTCCTGAGATACGAACTCAATGGTTCAGAGGCCATATGCTTTGCCGGTGATGATATGTGCTCAAACCGGAGACTGAGGGTGTCAAATAAACATGAGAGGTTCCTGAGCAAGCTTAGGCTGAAGGCCAAAGTCCAATTTACAGTTAAGCCAACATTTTGTGGGTGGAATCTGTGCCTTGATGGAATTTTCAAACGTCCTCAGCTGGTTCTGGAAAGGCTCTGTGTTGCAAGAGAGAAGGATAACTTGGCCAACTGTCTTGACTCCTATGCCATAGAGGTTGGTTACGCTTTCGCTTTAGGTGAAAAAGTTCTGCAGTATATGGATGAGGAGGCCATGCAGAACCATTACAATTGTGTTAGATTTATTGTTAAACATTCACACCTCCTTAAGTCGAGCGTTCGTGATCTTTTCTTACAGAATATGTAGATTAGGTTTAACATTATGTTATGTGAATAAGTATTCTTGTGTTTGGTAATGGATTTTGTCTATGATAAATTAATAGACGCTGGTTACATTAGAACTAGACTGCCAATTAGTTTTCCCATTATTGTTCATTGCATTGCCGGCGCTGGAAAAAGCACTCTAATCAGGGAAATCATCGAAGCTGACCACAAATTTGAGGCCTTCACTTACGGTGTTCCAGACCCAATTAATCTTTCTGGGGTGAGAATCAAGAGCAACTTTGACATACCTTCAGCACGTGCTGACTCACTCAAAATAATCGACGAATACATAGGTCAAAGTTTGCCTGAGGGAACAGCTTTTTGCTTTGCGGACCCGAACCAATTTCCCTACACCTGTCCAGACGCACATTTCACATGCTACCAGACGAAAAGGTTCGGTGATCAAACTTGTGCATTGTTGGGAAAGATTGACTGTGCTGCATTCTCTTATAAGCAGGATCAAATAATCTTTGATAAATTGTTTGCTGGTGATATTGAAGGTCAAATTGTCTGCTACGAAAAGGAAATTTTTGATCTCCTTGACCGTCACGGGGCAGATTACAAGAAATATTGCCAAATTCGGGGATCAACCTTTGATATTGTGACCTTTATAACTGCATCAGACACTTTTGAACCTGAGGATCGGTATAAAGTCTATCTTTGTCTAACGAGACATCGTTCGATCCTACGTATTCTGAGTCCTGAGGGGAAGTTCCTAAGGGAGGATGCCAAGTTTGACACCACCACCTGACAACACAAGGGTTTTGTTGCCAATCGCCATTGGCCTTGGGGTGGGGGTTGTGATCTGGTGTTTGACAAGGTCTACATTGCCTCAAGTGGGGGACAATATCCACAGTCTGCCACATGGTGGGAGTTATTTGGACGGAACAAAAAGAATCAGCTACTGTGGGCCAAAGAGCAGTTTTCCAAGCAGCAATCTCTTTAAAGGAGGTGCCTTTTCAGCAATTTGTGTTGTGGTGTTGTTAGTGTTTGCCATTCATGTTTCAGAGTTATTTAATCGGCCTAATCGCCGCTCTTGTGGCTGTGGCTCTGCTGCACACACTTAACTCTAGGCAAGAGGGCTGCTTGATAGTCATTAGTGGAGAGTCTGTAATTATTAAAAATTGTGTGTATACCAGTGAATTCATTGATTTGGTGAAAGGCCTTAAACCTCACAACCATTGGAATTCACTGTAGTTAGGTCCAGTGTGTGTGTGTTGAAATAATAGACTGTTTGAATATTTGAATTGAAATGACTACTTCTCAATCCACAGCAACTGCTGATGTCGAGACTTCCAAAGTCGAGACTGCTCCACCTCCGGTTGTCACTAGTGAACCTGTTCTACAGCAGGTGGTCCTTTCTAACACTTCAAATGCAGCTACTACACCACCGCCACCTGTCACTACTCAGACGTCAACTACTGCGACGAAAGGCATTGAAAGGTCATGGTTTGGGCTCCCATCCAAGACGGCGGGTTTGGGTACATTGAGTGCCACTGCGACATCCACAGCACCCCTGTTGGACGCTTCAGGGCGAGCCTCACAACTTGATGAGAACCTTAAAAAACTTAAGGCGAAGGATGAGAGCTTCCTTGTGCTGAATAGTGGGGTTGAGGATTTTGGGGCAACAGCAAGTGGCAATGCACAGGGGCCAAGGGGAGTTATGCCAAGCATGATGTCTTATGAGAAACCTGAAAAAGGTAAAATTGTTGAGGAGCCCAAAGGGTTGAGCTTAGGTTCAAGGCAGAGGTTGGTCTTTGAAAAGGCTAGGCAGAGGGCACAGGTGGACATTGAAGCTGACCGTGACAGTTTGGCGCCGCCATTTGCTTCAGCAGATCCCTTTTCCCGACCAAAAGTTCAGGATGTCCAAAGATTCTCATATGAACCAAGCTCACCTGACATTTCAACAGCTGAGGAGATTGAGCACATTAGAAGTGATTTGATTAGGGCAGGTGTGCCTGAGTCCACACTTACCTTCTCAATGTGGGACATAGCTAGATATTGCGCTGATGCTGGCTCCTCAGCCTCAACTGAGTTCATAGGGACAAGCAGTTACAGTGGCCGCGTAACCAGAATGGAGATAGCCTCGGTCATCAAGAAGCATACAACCTTGAGGCGATATTGTGGCTTCTATGCAAAAATTGTTTGGAACATAATGCTGTCAACCAACATACCACCTTCTGGGTGGGTGAAAAAGGGTTACAAGAAAAACACAAGGTTTTCTGCATTTGATTTCTTTGAGCAAGTCTCAAACAATGCTGCGTTGGAGCCCGAGAATGGGCTGGTTCGAGAGCCCAACCACGAAGAGTTGGTTGCATCCCAAGTGAATAAAGGGGTTTCGTTGCACAGAACTGAAGCCGCACAGGATAAGAACGTGTCAACTGTACACGAGGTAACAGGTGGGAGAGCTGGACCCCGGTCAAGACTGTTGTTGAAGGGGAAAGAGATGGATTGAGTGGTTAACACATGGCCTAGAACCGTGGAAAGGCCTAAAAGAGTCCACGTGCCGTCCTAGAGTTATAGTGTGCGTATTAGTAGATAGTATTAGTTTCCACTTCCCAAGGTTCCAGGTCTCGAACCCAGGAAAGACCTTAAAGAGTCCTGGTTGGCGTTTAGCCGTAGAAGACCTCTGCACCACATAGGCCACACCAAAGTTCATCATTGTGTGCCTTATGCGGGCAAGTTAACCGAGTTGTGGCGGCAACCGGAGAAAGTCAGATACAAGCGTAGATTTATGAGCTACGTCCTGTGGTTGGATTTCCACCGTTATCTCGTCGTTAAGGGAGCAACCCCTTTTCTCTCGCTTACAGGGGTATCGTTAAGCGGGCGTGCGACCCATTGAGAGATGGGTTCCCTACGTTAAGGGTAGTTGAAGTTTAGAACAAACTTCCATGGTTCCGACCTACCATGATTAAAGTGATCGGTAGTTCTGGGTAAGAAACAACCCTGTGCTTGGTGGCTAAGCATGACCACTCAGTTTGACCGACTGGCTAGACAGGTTACGTTTCCTACTTCGATATCAAAAGTGGGCGCATACCAAAGCGTTAAATTGCTCGACCACATGTTTCAAACTCTCAGTCCTGGGGGCTTGAGACAGGCTTTAGTCCTGGTGATCTGACTTTAAAAGAGCCAAATAAACCGCATTTCAACGCGTTATAGTGTTCGCTGACAGACCGTACAAATAGTCTGTTTCACCAACCTAAGACCTAAGTAATTGAATAAGGGGAGGTGATTAAACAAATTTGCTTTTTTATCGCTAATTTTTGC
| 75,893
|
KY310582.1
|
Asian prunus virus 2
|
Jo,Y., Lian,S., Chu,H., Choi,H., Cho,J.K., Cho,W.K.
|
Seoul National University, Department of Agricultural Biotechnology
|
Korea
|
2017-07-10
|
JH
|
Asian prunus virus 2
|
Foveavirus
|
Betaflexiviridae
|
ssRNA(+)
| 9,393
|
GenBank
| null |
South Korea
|
South Korea
|
Prunus persica
| null |
2014-05-18
| null | null |
Asian prunus virus 2 isolate JH, complete genome
|
GGAACAATCTATCAACAAACGACCCCGCTCGAAACAGACCTAAGTCGTTCGTAATGGCTTTAACATACCGAAGCCCGATAGAAGAAGTTCTTAATCGCTTCACCTCTGAGGAGCAGTCCAGGGTAAGTTCAACGTCAGTGGCCAGATTAACCCAAGTTGAAGTTAGCAACCATAAGCTTTTTTCATTCGCATTGAGTGAGAAGGCTAAGGAAAAGCTAATTAAAGTTGGAATTTATCTGAGCCCATTCTCGTTTGAACCGCATTCACATCCTGCCTGCAAAACATTGGAGAATCACATTTTATATAACATTTTAGCTAATAAATTGGACAACAGTTTCTATGCAATAGGTATTAAGGGTTCCAAGGTCAACTTTTTAAAAAGTAGATCAAAGAACCTAAGCATGCTGGAGTATGTGAACCGTGTTGTCACCAGTGCAGATAAGTACAGGTATGGTAGTGACTTCACCACACTCAGCTCAAAGCAAATCGACAACCTCTGCTCAAAAAAGAGCCTTAGTGAGTGTGGCACACTGAAAGAATTAGTTCCACTGGTTAAAATGAGCAAGAAAAGGAATTTTTTCTTGCATGATGAGCTTCACTACTGGAGCCCACAAGACTTGATGCTCTTTTTGGACTCGGTCAATCCTGATCATCTGGTAGCGACGGTGGTTTTTCCTCCCGAAATACTGGCTGGAGCCAAGGAGAGTCTAAACCCATGGTGTTATTCATTCCACCGGCAAGGCAGTAAATTAACATTCTTTCCAGACGGGGTTCAAAGTGAGTCATACACACAACCCCTCAGCTCTGGTTACATCTTGAAGGCATCCAAAATTGTATGTCCGAGTGGTCAAATTTACTCTGTGGATCTTGTGTACTCAGCCTTCGCGCACCATGTTGTAAGCATAACAAAAGGGAATTTGCCAGGGCTTGAAAGGCGTTTTTTCTCAAATTTCGAGGCAACTGGGGTGAAACACCTATCTGGCCTCTCCTATTCTGTGAGGGACTGTATTCCAGTTAGCACTGATCTAATATCTAAAATCTACAGATATATCAGGACCCTCAAGAAGCCTGACCTGCAGTCCTGCATGGCCAAGCTCAGCCAAATAGTCCCCAATCCAACTGGTGTTGAAATAAAATTCACAGAGGATTTTTCACGACTGGTCATGGAAATTCAGCCTCTAAAGTCCCTCCTCATGCCAGACACTGCTAAATTGATTGGGGCTTTGTTCGCTTCCCTTCTGCCCTTTAAAATGGCAAGGTTTTTTGACTGCTACAAATCAAGCTCATTGGACAAATTCATTCATGATTTGGAGCCATTCAGCTTTTCTGTGCCCACTGAGGTTATCAACTGCAATACAATGCCAGCTTTTGAAGCAATTTCTTTGGGCGAGTCAATGAGCACAGAGGAGGTTATGCAAATATTGAACCGAATGGAAATGGGGGCTTTCGCTGGGTCATGTAACTTGGTGGGGAAGTTCAGATACTCAAATGAGGCCTATCACTGTCTCCACCACGTTCTTGATGGCTGCAAGCCTGAAGTTTTCAAGAGGTTAATTAGGAGGGTCGCAGGTTCCTTCTGTAATGAGTTTGGCGTTTACCGGAAAAGCAGTTATGTGGCATCTGTTGCAATCAATGTGTTCCAGAGAAGATCAAACCTAAATCTTGATTTTATCTTGGGGTCTGATCTGAATCAAAAGGTTGTTTGTATTGTCCGTAATTTCTTTTCTTCAAAGAAATCCTCGCAACTTATTTGGTATTCCACAAATTCTACGGCTTGGTTCCGCTTTTCAAAGCTGAGAGCCAATCAAAAGTTCCTGAGATCACCAATTTTCCCTTCCTCCATGAATTGCAAAGATCTTTCGATTAGGAAAAATCTGATGTTTGATTTTGAGGTTTTTGGTTTCTGTGCTGGCTTAAGAAAGCTTGGGTCTTCGGGAGTTTCTTCAGTGGTGCCCCCTGAACCAGCTCTGGGTGGCTTTGAGTTTGTACCCCCTGGGGAGGAGGCCCACGAGGATAATATTGAGGTGGAGTTGAATGCCATGGAAAAAAAAATTGGTCCATCAGCACAGGTAGTTCTTGGAATTGAAAGTCCAGCTGTTTGTATGCATGAGATTGACCCACAAGATCAAACTCTCTATTCCAAAGCAGCTTACCCTGAGGAACGAAATGGTCTTATCTTTGGATGTGTTCCTGAGCCAAGCTTAGGGAATTTTTCGTTCAGTTCAGCCAATCAAGGTGATCGCCTCTTCGCCAACATTGTGAATGAAAACATAGTTGATGTTGGAATTCTCCCTCCCACTGAATTGAAAATCCCATTGGATGCTAAGGTTACACGAATCAATGGTCGGGATTGCTTCTTCTTCACAAGGTGCTCATGTATCGACTATGGTCATAATAAGATCAAATACACTGCCAATAACTGGTTTTCAGGCCTCGATCAATTTCTATCCAATGAGGGGACATACTACAACGCATGCCTCCTGCAAGTTTACAGGGCTGGCAGTGGAATTGGTTTTCACTCTGACAACGAAAAGGTCTACCACAGAAGTCCTATCAAAACCGTTAATTTGTGTGGAGAGGCAGACTTCCTTGTTAAAGCTAAGGGTAGGAGGGACTTAGGAACTATTGCAAGAGGACACCTCTCCCCAGGACATTATTTCACAATGGATTCAAATTTCCAGTCTTACTACCAACATTCAGTCCAAGATTGTAGTGAGGGGAGGGTCTCCTTAACCTTTCGCCATCATGTAAATAATATCACAGGGCTGCCAATCAAGCACACCTGTGGAGAATTTGGTGATACTGAAATTTTGTTTGATGTGCTCATAAGGAGGAGTTTCACCTACGCAGCAAAAAACTTTCATACCTTCCCAGTTCCTGGGGATGGCAGTTGCTTTTGGCATAGTATGGGGGCTTTATTAGGAGTTGATGGCGAGGAATTAAAGAAGATATCTGCGAGAGAGATCCAGAAGAACGAAGTTTTACTATCCAACCTGAGTCTACGTCAGCAGATGGCCAATAAACAGTATGCTGAGAGAGAATCAATTGCGGCTTTTTGCAGGATCCAATCAATCCATTTGGTTGTTCTGCTTCCAGGCAATAATTTCTCCTATGAGTTCCTTCCGTCACAAAACCCTGAAGTCACCCAACTGTTTGTCAAACTAACAGATGAGCACTTTGAACCTGCTTTGCCAGTGAATGGATGCGTCGTCAAGTCAATTGCTGAAACCCTGAATCAAACCGAAGCAAAGATCTTGTCAGTGATTGGGAGACCCACAAATAGAATGATTCTCGACAACTTGGTCGAGGGAGAAGGACTGAACCTTGAAGACCTTGAAGCAGCATTTACAATCTTTGGAATATGTGCTAGGGTCAGCTCAGAACATGGGGTGTTCACCCTAAATAGGGATGGCAATCTGCATGCAAACTATGAATTAAAATCAGGTCATATAATGTACTTAAAGAAAGTTCCTAACTCACAGTTTGCTCCCTCGACACCAATCCAAAATTTTAATGGACAGGGGCCTGAGCTTTTTCTAAAGGGAATTGTCAGTGAGGTGAAATATAAGCCAGATTGGGAAAGGGCCCGAAATCTGGAGGAATCATTCCTCAATGGCACAACAGGGGTCTTGTGTGACCGCACTGTCAATCTCCAAAAGAATTGGTTGACTGAAGGAAGAAAGCTTGTGAGGGATGAGCGAAATCTGGGTGTTGTTCTTGGAACCTTTGGATCTGGTAAGAGCACATTATTCAAGCGGTTCATTGTTAAAAATCCTTCAAGGTCAATCGTCTTTGTCTCTCCAAGGAGGTCATTAGCTGATCAAATTAAGGAGGATTTAGGTCTCAATTCAAAGAGGGGGAGATCCCTAAGAGTCAGGGTCTTAACCTTAGAGAGCTTCATCAAAGCAGTTTTTACTTTCAAAGCAGCAAGTGTGGTGCTTGATGAGGTGCAACTGTATCCTCCCGGGTACCTTGATTTAATGATGCTATGTCTTAGTGGAAATTGTCAGATCTACCTCTCAGGAGATCCTTGCCAAAGCGACTACGATTCAGCCAGAGACAGAGCGCTCTTTGATGGAATGAAGGGGGACATCTTCGAGGTGCTTGAAGGAAAAAGCTATAAATTCAATGCAGCCAGCAGGAGGTTTCAGTCTCAGATGTTTGTTGGTAGGCTTCCCTGTCGTCTGGACTCAAAAGACATGGTTGGAGATGAGGACTTTCATTGGCTTGAGAGCATTGAGGCTGCAGCTGAGGTTAGTAACACCGAATACGATGTTGTTCTGGTCTCAAGCTTCGAAGAAAAAAAAATCATTTGGGCACATCTTGGGAGAGACGTTGAGGTCCTCACTTTTGGAGAGTCAACAGGCTTAACCTTCAACCGGGGCATTATCCTCATCTCTCATGAAAGCACTCTCACTGGTGAAAGGAGATGGATTACTGCGTTGTCAAGGTTTAGACTGAATATCATCTTTGTCAATTTGGTTGGCAACAATATTGAGGACGTATGCCAGGTTTTCCATGACCGAACATTATTCAAATTCCTCAATCGCACCGCAACAATTGGAGACATTATTAAGCAACTCCCTGGCCACCCAGAACTTACAAATGACTTCGGAGACAAAGTGGGCAAGTCAGAAGGGATTATGGAAGACAAGCTTGCTGGTGACCCGTGGTTAAAAACGGAAATTGACCTTCTGCAGGATGAGGATCAAGAGATGGTTGAGCTTGCAGAGGAGGTTAAAAATGAGCCATGGTTTAAGACCCACCTCCCCTTGTTTGAGTTGGAATCTATAAGGGCAAATTGGGTGCACAAAATAATGAACAGGGAATATCGTGAAGTACGTTGCGGAACGGAAGTGTCAACTCAGTTCCCTGAGGACCACCCCAACAAGTATAAGGTGACTTTAGCCAATGCAGCTGAGCGTTTCGAAGCAATTTATCCAAGACATAAGGGAAGTGATTCTGTAACCTTCCTGATGGCTGTTAAAAAAAGGCTTAGCTTTTCGAGACCATCTGTTGAGTCAGCCAAGTTGAACAGGGCAAAGCCGTATGGAAAATTTCTCCTGCATGAGTTCCTCAAGAGGGTCCCCCTAAAAACTGGTTTGGATTCAGCTCTGTTCGCTAGATCGAAAAGAGAGTTTGAAGAGAAGAAAACTAGCAAAAGTGCTGCTGTTATCGAGAACCATTCTGGAAGGTCATGCCGCGACTGGTTAGCTGATGTTGGATTTATTTTCATGAAAAGTCAGTTTTGCTCTAAGTGGGACAACAGGTTCAGGGATGCCAAAGCTGGACAAACTTTAGCCTGCTTTCATCATTCAATTTTGTGCCGCTTTGCACCCTACATGAGATATATTGAACACAAGCTTCAGGAGGTCCTGCCAGCCAACCTGTACATCCATTCTGGGAAGAACCTGGAAGATCTCAATCGCTGGGTGATTGAGAACAGCTTCACTGGCATGTGCACTGAATCAGACTACGAAGCCTTCGACTCAAGCCAGGACCATTATATTCTAAGCTTTGAGATTGAAGTCATGAAGCATCTTCAGTTACCTTGGGACCTAATTGAGGATTATGTGTACATCAAAACCCACCTTGGCTCCAAGCTTGGCAATTTTTCAATCATGAGATTCACTGGTGAGGCAAGCACATTCTTGTTTAACACGATGGCAAATATGTTGTTCACTTTCCTGAGATACGAACTCAATGGTTCAGAGGCCATATGCTTTGCCGGTGATGATATGTGCTCAAACCGGAGACTGAGGGTGTCAAATAAACATGAGAGGTTCCTGAGCAAGCTTAGGCTGAAGGCCAAAGTCCAATTTACAGTTAAGCCAACATTTTGTGGGTGGAATCTGTGCCTTGATGGAATTTTTAAACGTCCTCAGCTGGTTCTGGAAAGGCTCTGTGTTGCAAGAGAGAAGGATAACTTGGCCAACTGTCTTGACTCCTATGCTATAGAGGTTGGTTACGCTTTCGCTTTAGGTGAAAAAGTTCTGCAGTATATGGATGAGGAGGCCATGCAGAACCATTACAATTGTGTTAGATTTATTGTTAAACATTCACACCTCCTTAAGTCGAGCGTTCGTGATCTTTTCTTACAGAATATGTAGATTAGGTTTAACATTATGTTATGTGAATAAGTATTCTTGTGTTTGGTAATGGATTTTGTTTATGATAAATTAATAGACGCTGGTTACATCAGAACTAGACTGCCAATTAGTTTTCCCATTATTGTTCATTGCATTGCCGGCGCTGGAAAAAGCACTCTAATCAGGGAAATCATCGAAGCTGACCACAAATTTGAGGCCTTCACTTACGGTGTTCCAGACCCAATTAATCTTTCTGGGGTGAGAATCAAGAGCAGCTTTGACATACCTTCAGCACGTGCTGACTCACTCAAAATAATCGACGAATACATAGGTCAAAGTTTGCCTGAGGGAACAACTTTTTGCTTTGCAGACCCGAATCAATTTCCCTACACCTGTCCAGACGCACATTTCACATGCTACCAGACGAAAAGGTTCGGTGATCAAACTTGTGCATTGTTGGGAAAGATTGACTGTGCTGCATTCTCTTATAAGCAGGATCAAATAATTTTTGATAAATTGTTTGCTGGTGATATTGAAGGTCAAATTGTCTGCTACGAAAAGGAAATTTTTGATCTCCTTGACCGTCACGGGGCAGATTACAAGAAATATTGCCAAATTCGGGGATCAACCTTTGATATTGTGACCTTTATAACTGCATCAGACACTTTTGAACCTGAGGATCGGTATAAAGTCTATCTTTGTCTAACGAGACATCGTTCGATCCTACGTATTCTGAGTCCTGAGGGGAAGTTCCTAAGGGAGGATGCCAAGTTTGACACCACCACCTGACAACACAAGGATTTTGTTACCAATCGCCATTGGCCTTGGGGTGGGGGTTGTGATCTGGTGTTTGACAAGGTCTACATTGCCTCAAGTGGGAGACAATATCCACAGTCTGCCACATGGTGGGAGTTATTTGGACGGAACAAAAAGAATCAGCTACTGTGGGCCAAAGAACAGTTTTCCAAGCAGCAATCTCTTTAAAGGGGGTGCCTTTTCAGCAATTTGTGTTGTGGTGTTGTTAGTGTTTGCCATTCATGTTTCAGAGTTATTTAATCGGCCTAATCGCCGCTCTTGTGGCTGCAGTTCTGCTTCACATGCTTAACTCTGGTCAGGAAGGTTGTTTAATAATTATCAGTGGAGAGTCTGTAGTTATTAAGAATTGTGTGTACACCAGTGAATTCATTGATTTGGTTAAGGGCCTCAAGCCCCACAACCATTGGAATTCACTGTAGTTAGGTCCAGTGTGTGTAGATTGAAATAATAGATTACTTTGAGATTTTGAGTGAAATGACTACTTCCCAATCCACAGCAACTGCTGATGTCGAGACTTCCAAAGTCGAGACTGCTCCACCTCCGGTTGTCACTAGTGAACCTGTTCTACAGCAGGTGGTCCTTTCTAACACTTCAAATGCAGCTACTACACCACCGCCACCTGTCACTACTCAGACGTCAACTACTGCGACGAAAGGCGTTGAAAGGTCATGGTTTGGGCTCCCATCCAAGACGACGGGTTTGGGTACATTGAGTGCCACTGCGACATCCACATCACCCCTGTTGGACGCTTCAGGGCGAGCCTCACAACTTGATGAGAACCTTAAAAAACTAAAGGCGAAGGATGAGAGCTTCCTTGTGCTGAATAGTGGGGTTGAAGATTTTGGGGCAACAGCAAGTGGCAAAGCACAGGGGCCAAGGGGGGTTATGCCAAGCATGATGTCTTATGAGAAACCCGAAAAAGGTAAAATTGTTGAGGAGCCCAAAGGGTTGAGCTTAGGTTCAAGGCAGAGGTTGGTCTTTGAAAAGGCTAGGCAAAGGGCACAGGTGGACATTGAAGCTGACCGTGACAGTTTGGCGCCGCCATTCGCTTCAGCAGATCCCTTTTCCCGACCAAAAGTTCAGGATGTCCAGAGATTCTCATATGAACCAAGCTCACCTGACATTTCAACAGCGGAGGAAATTGAGCACATTAGAAGTGATTTGATTAGGGCAGGTGTGCCTGAGTCCACACTTACCTTCTCAATGTGGGACATAGCTAGATATTGCGCTGATGCTGGCTCCTCAGCCTCAACTGAGTTCATAGGGACAAGCAGTTACAGCGGCCGCGTAACCAGAATGGAGATAGCCTCGGTCATCAAGAAGCATACAACCTTGAGGCGATATTGTGGCTTCTATGCAAAAATTGTTTGGAACATAATGCTGTCAACCAACATACCACCTTCTGGGTGGGTGAAAAAGGGTTACAAGAAAAACACAAGGTTTTCTGCATTTGATTTCTTTGAGCAAGTCTCAAACAATGCTGCATTGGAGCCCGAGAATGGGCTGGTTCGAGAGCCCAACCACGAAGAGTTGGTTGCATCCCAAGTGAATAAAGGGGTTTCGTTGCACAGAACTGAAGCTGCACAGGATAAGAACGTGTCAACTGTACACGAGGTAACAGGTGGGAGAGCTGGACCCCGGTCGAGACTGTTGTTGAAGGGGAAAGAGATGGATTGAGTGGTTAACACATGGCCTAGAACCGTGGAAAGGCCTAAAAGAGTCCACGTGCCGTCCTAGAGTTATAGTGTGCGTATTAGTATATATTATTAGTTTCCACTTCCCAAGGTTCCAGGTCTCGAACCCAGGAAAGACCTTAAAGAGTCCTGGTTGGCGTTTAGCCGTAGAAGACCTCTGCACCACATAGGCCACACCAAAGTTCATCATTGTGTGCCTTATGCGGGCAAGTTAACCGAGTTGTGGCGGCAACCGGAGAAAGTCAGATACAAGCGTAGATTTATGAGCTACGTCCTGTGGTTGGATTTCCACCGTTATCTCGTCGTTAAGGGAGCAACCCCTTTTCTCTCGCTTACAGGGGTATCGTTAAGCGGGCGTGCGACCCATTGAGAGATGGGTTCCCTACGTTAAGGGTAGTTGAAGTTTAGAACAAACTTCCATGGTTCCGACCTACCATGATTAAAGTGATCGGTAGTTCTGGGTAAGAAACAACCCTGTGCTTGGTGGCTAAGCATGACCACTCAGTTTGACCGACTGGCTAGACAGGTTACGTTTCCCACTTCGATATCAAAAGTGGGCGCATACCAAAGCGTTAAATTGCTCGACCACATGTTTCAAACTCTCAGTCCTGGGGGCTTGAGACAGGCTTTAGTCCTGGTGATCTGACTTTAAAAGAGCCAAATAAACCGCATTTCAACGCGTTATAGTGTTCGCTGACAGACCGTACAAATAGTCTGTTTCACCAACCTAAGACCTAAGTAATTGAATAAGGGGAGGTGATTAAACAAATTTGCTTTTTATCGCTAATTTTTGC
| 75,894
|
KR998048.1
|
Asian prunus virus 2
|
Pu,L., Bateman,M., Kinard,G.R., Li,R.
|
USDA-ARS, National Germplasm Resources Laboratory
|
USA
|
2016-06-30
|
APV_2_Q65a
|
Asian prunus virus 2
|
Foveavirus
|
Betaflexiviridae
|
ssRNA(+)
| 9,393
|
GenBank
| null |
USA
|
USA
|
Prunus persica
| null |
2013-05-15
| null | null |
Asian prunus virus 2 isolate APV_2_Q65a, complete genome
|
GATAACCAGAACGATCTATCAGCAAACGACCCCGCTCGAAACAGACCTGAGTCGTTCGTAATGGCTTTAACATACCGAAGCCCGATAGAAGAAGTTCTTAATCGCTTCACCTCTGAAGAGCAGTCCAGGGTGAGCTCAACGTCAGTGGCTAGATTAACCCAAGTTGAGGTCAGCAATCACAAGCTTTTCTCATTTTCATTGAGTGAGAAAGCCAAAGAAAAGCTGATTAAAGTTGGGATATATTTAAGCCCTTTCTCTTTTGAGCCTCATTCTCACCCAGTTTGCAAAACCTTGGAGAATCACATATTATATAATATACTAGCTAACAAGTTAGATAATAGTTTTTATGCAATAGGCATTAAGGGGTCCAAGGTCAACTTTCTCAAGAGTAGATCAAAGAACCTAAGTATGTTAGAGTATGTCAATCGTGTTGTCACCAGTGCCGACAAGTACAGATATGGTAGTGACTTCACCACATTAAGCTCAAAGCAAATTGACAACTTGTGCTCAAAAAAAAGCTTGAGTGAATGCGGAACTTTGAAGGAATTGGTCCCGCTAGTTAAAATGAGCAAAAAGAGGAATTTCTTCCTCCATGATGAACTCCACTATTGGAGTCCACAGGATTTAATGCTTTTCCTGGATTCAGTCAATCCAGACCATCTAGTGGCCACAGTGGTTTATCCTCCTGAAATACTTGCTGGGGCTAAGGAAAGTTTGAACCCATGGTGCTACTCATTCCACAGACACGGTAGTAAACTGACATTCTTCCCAGATGGTGTAAGGAGTGAGTCTTACACTCAACCATTAAGCTCCGGGTACATCCTTAAGGCATCTAAGATCATTTGTCCAAGTGGTCAAATATACTCTGTTGATCTTGTTTACTCAGTCTTTGCGCACCATGTGGTCAGCATTACAAAGGGGAGCCTACCAGGGCTGGAAAGACGGTTCTTCTCAAACTTTGACGCCACTGGAGTGAAGCACCTGTCTGGTCTTTCACACTCCGTGAGAGATTGTATTCCAGTCAATGCTGAACTAATCTCGAAGCTTTATAGGTACATCAGGACCTTGAAGAAACCTGATTTGCAATCCTGCATGGCCAAACTTAGCCAAATTGTTCCCAACCCAACAGGCACTGAAATCAAATTTACAGAGGACTTTTCCAGGTTGGTTATGGACATTCAGCCAATGAAGTCTCTTCTTATGCCTGACACTGCAAAGCTGATTGGAGCCCTGTTTGCCTCTTTTCTGCCCTTCAAAATGGCAAGGTTTTTTGACTGCTACAAGGCCAGCTCCCTCGACAAGTTCATTCACGATTTGGAGCCGTTCAGTTTTTCAGTAGCCACTGAAGTCATCGACAGCCGCACCATGCCCATATTTGATGCTGTCACTCTTGGTGAATCGATGAGTTCTGAGGAGGTCATTAAGATTTTGAGCAAAATGGAGTTGGGTGCCTCTGTCGGATCAAGCTGTTTGATGGGAAAGTTCATGTATTCAAATGAGGCTTATCATTGCCTCCATCATGTCCTGGATGGTTGCAAACCCGAAGTTTTCAAAAGATTGATACGAAGGATTGCAAGTGCCTTCTGCAATGACTTTGGTGTTTACAGGAAGAGCAGCTACGTCTCATCAGTTGCAATTAATGTGCTTCAAAGAAAGTCAAATCTGAATCTCAACTATATTCTAGGAATTGAACTGAATCAAAAGGTTGTGGATGTGGTCCGAAATTTTTTTTCCTCAAAAAAATCCTCTCTGTTGATTTGGTTTTCAACGAGTCCAATGGCCTGGTTTCGGTTCTCTAAGCTACGTGCCAATCAGAAATTTCTCAGGTCACCAATATATCCCGACTCGATGGGCTGCGAGGATTTCAGCATTAGGAAAAGGCTTGTTACTGATCTTGAATCTTTTGGGTTCAGCAAGGGCTTAAGGAGGCTTGGGTCATCTGACTCTCTTCCCACAAAATCATCAAAGCCTGACTTTAGTGAATTCAAATTTGAGCCTGTTAATGATGGGGTTAGTCAAGGTGGGGTCGATGCGAACCCAGCAAACGGAGTGGAAGAAGCTGGGTTCCCAGAACAAGTAATGCTTGAAATTGAGCCCTCGACTGTGGTTCCAAATAGTGGGAAATCCCAAGGTTTGGCTCCTCCCCATGATGCATCCAGCGCAGTGAGTCAGCCTGGTCTCCTGTTTGGGTGTATCCCTGAGCCAAATTTGGGAGGATTCTCATTTAGCTCAGCTAATCAAGGGGATCGACTCTTTGCAAATGTAGTGAACGAGAACATCATTGATATTGGAGTCCTCCCTCCCACTGAATTGAAGATCCCATTGGATGCAAGAGCCACGCACGTTAATGGTCGGGACTGCTTCTTCTTCACGAGGTGCCCTTGCATAGATTATGGCCACAACAAAATCAGGTACATCCCGAATAATTGGTTTTCTGGGCTTGATCAGTTCCTATCCAATGAGGGAACATATTACAATGCATGCCTTCTACAGATATATAGCGCTGGGAGTGGGATCGGTTTCCATTCGGATAATGAGAAGGTCTATCATAGAAGTCCAATTAAAACAGTGAATTTGTGCGGAGAAGCTGACTTCTTGGTCAAAGCAAAGGGTAGAAGGGACCTGGGAACCATAGTGACAGGACATCTTTCCCCAGGCCATTACTTTACAATGGACTCGAGTTTTCAGTCCTACTACCAGCATTCTGTCCAAAACTGCAGTGAAGGCAGGGTTTCCCTAACATTTCGCCATCATGTGAATAATATTTCAGGGCTCCCCATTAAGCACACCTGTGGAGAGTTTGGTGACACCGAAGTCCTTTTCGATGTTTTGATAAGGAGGAGTTTTACCTATGCTGCAAAAAATTTTCACACCTTTCCGGTCCCTGGGGATGGGAGTTGCTTTTGGCACAGCATGGGAGCTTTGTTGGGAGTTGATGGCGAGGAACTCAAAAGAATATCTGCTAGGGAGATCCAAAAGAGTGACTCTCTGTCCACAAACTTAAGTTTGCGTCAACAGATGGTCAACAAGCAATATGCGGAGAGGGAATCAATTGCTGCGTTTTGCAGAATCCAATCAATCCACCTTGTTGTCCTACTTCCAGGTAACAACTTTTCTTATGAGTTTTTACCTTCACAGAATTCTGAGGTGACGCAGCTGTTTGTCAAGTTGACTGAGGAGCATTTCGAGCCTGCCTTGCCAATCAACGGGTGCGTTGTTAAGTCGATTGCGGAAACCCTTAATCAAACTGAAGCGAAGATCTTGTCCGTAATCGGTAGACCAACAAACAGGATGATTCTTGATAACTTGATCGAGGGGGAGGGCCTGAATCTTGAGGATTTGGAAGCGGCTTTCACCATTTTTGGAATATGTGCCAGAGTGAGCTCAGAAAGCGGGGTCTTTACCCTAAACAAGGATGGCAATCTACATGCCAACTATGAGCTGAAGGCCGGCCACATCATGTACCTTAAAAAAACGTCCAGCTCACAATTTGCCCCCTCTACTCCAATTCAAAACTTCAATGGGCAGGGGCCGGAGTTGTTTTTGAAGGGAATAGTTAGTGAGGTCAGACACAAACCGGACTGGGAGAGGGCAAGAAATCTGGAAGAGTCTCTCCTCAATGGCACCACAGGGGTGTTGTGTGACCGCACGGTTAATCTCCAGAAGAATTGGTTGACAGAGGATAGGAAACTGGTTAAAGATGAACGCAACCTAGGTGTGGTTCTTGGCACCTTCGGGTCTGGAAAAAGCACATTGTTCAAAAGATTTATCGTTAAAAACCCCTCGAGGTCCATAGTTTTCGTCTCACCAAGGAGATCACTGGCTGATCAAATTAAAGATGATTTGGGTCTAAACACAAAAAGGGGAAGATCTCTCAGGGTTAGAGTATTAACACTTGAGAGCTTCATCAAGGCCGTTTTCAATTTTAAGGCAGCAAGTATAGTGCTTGATGAAGTTCAATTGTATCCCCCTGGATATCTTGACCTTGTGATGCTCTGCCTCAACGGAAATTGCCAAATATATCTCTCTGGAGACCCATGCCAGAGCGACTACGACTCAGCGAAGGATAGGACTCTTTTTGATGGGATCAAAGGGGACATCTTCGAAGTACTTGAGGGCAAGAGCTATAAATTCAATGCAGCAAGTAGAAGATTCCAGTCTCAAATGTTTGTTGGCAGACTCCCTTGCCGCATGGACTCCAAGAACATGATTGAAGATGAGGATTTCCACTGGCTTCAAAGCATTGAGTCCGCAGCTGAGGTCAGCAATACAGAATATGATGTTGTTCTTGTTTCAAGCTTTGAAGAGAAGAAAATTATCTGGGCGCACCTTGGGAGGGAGGTTGAAGTCTTGACTTTTGGGGAGTCAACTGGTTTGACATTCAATAGGGGCATGATCCTCATTTCCCATGAGAGCACTCTAACCAGTGAACGAAGGTGGATTACTGCCCTATCAAGGTTCAGACTGAATATAATCTTCGTGAATTTAGTGGGGAACAACGTCGAGGATGTGTGTCAAGTCTTCCATGACAGAACCTTGTTTAGATTCCTAAGCCGCACGGCCACAATTGGGGACATTTTAAATCAACTTCCTGGCCATCCTGAACTGACAAATGACTTTGGTGACAAAGTGGGCAAGTCAGAGGGGGTAATGGAAGAAAAACTTGTAGGGGACCCATGGTTGAAGGCGGAGATTGACCTTCTGCAAGATGAGGACCAAGAGATGATTGAGCTTGCTGAGGAGGTCAAAGACGAGCCTTGGTTCAAAACACACCTCCCTCTGTTTGAGTTGGAGTCCATAAGGGCAAGTTGGGTCCACAGAATAATGAACAGGGAGTATCGTGAAGTCCGGTGCGGTACTGAAGTTTCGACTCAATTTCCTGAAGATCACCCGAGCAACCATAAAATCACCTTAGCAAATGCAGCTGAACGTTTTGAGGCAATCTACCCAAGGCATAGGGGTAGTGATTCGGTCACTTTTCTGATGGCAGTTAAGAAACGACTGAACTTTTCGAGGCCATCGGTTGAGTCGGCCAAGTTAAATAGAGCCAAACCTTATGGGAAATTCCTCTTACAGGAGTTCCTCAAGCGGGTCCCCCTCAAAACAAATCTGGATTCAGCCTTGTTTGCAAAGTCAAAGCGGGAGTTTGAGGAGAAGAAAACGAGCAAAAGTGCGGCTGTTATTGAAAATCATTCTGGGAGATCTTGCCGTGACTGGCTTGCAGACGTTGGTTTTATCTTCATGAAAAGCCAATTTTGCTCAAAGTGGGATAATCGATTTAGAGATGCAAAGGCTGGACAGACTCTCGCATGTTTCCATCATTCTATTCTATGTCGCTTTGCACCTTACATGAGGTACATTGAACATAAGCTTCAGGAGGTCCTACCAAGCAACCTGTATATTCACTCTGGGAAGAACCTCGAAGATCTCAACAGATGGGTAATTGAGAATGGCTTTACTGGGATGTGTACAGAATCAGACTACGAGGCTTTTGATTCCAGTCAAGACCACTACATTCTCAGTTTTGAAATTGAAGTGATGAAGCATTTGCAACTTCCCTGGGACTTAATAGAGGACTATGTGTATATCAAGACTCATCTTGGATCCAAACTTGGAAACTTCTCAATCATGAGATTCACTGGTGAGGCTAGCACATTCTTGTTTAATACCATGGCCAACATGCTGTTTACCTTCTTAAGGTATGAACTGAATGGGTCTGAGGCTATATGCTTTGCCGGCGACGATATGTGTTCAAATAGAAGGTTGCGTGTCTCAGAAAGACATAATGGTTTTTTAAGCAAGTTGAGATTGAAGGCTAAGGTGCAGTTCACAGTCAAACCCACTTTCTGCGGCTGGAACTTGTGCCTTGATGGAATATTCAAGCGTCCTCAATTGGTTCTGGAGAGGTTATGTGTCGCAAGGGAAAAAGATAATCTGGCAAATTGTCTTGATTCTTACGCCATAGAAGTTGGCTATGCTTTCGCTCTGGGTGAGAGGGTTCTGCAGTATATGGACGAGGAGGCCATGCAGAATCATTACAGCTGTGTCAGATTCATAATCAAGCATTCCCACCTCCTCAAGTCGAGTGTTCGTGATCTCTTCTTACAGAGTATGTAGATTAGGTTTAACATTTGTTATGTGAATAAGTATTTGTGAGTTTGATTATGGACTTTGTTTATGACAAATTAGTTGAGGCTGGCTACATCAGAACTAGACTACCAATAAGTTTCCCAATAATTGTTCACTGTATAGCTGGAGCTGGGAAGAGCACCTTAATTAGAGAGATTCTTGAGGCAGATCACAGGTTCGAGGCCTTCACCTACGGCGTTCCGGATCCCATTAACCTTTCTGGGGTCAGAATTAAGGGTTCCTTTGACTTACCAAACTGCCGCGCTGATTCACTGAAGATAATTGACGAGTATATTGGTCAAGACCTGCCTGGAAGTACAACCTTTTGTTTCGCTGACCCAAATCAATTTCCCTACACTTGCCCAGACGCTCACCTCACCAGCTATCAAACAAAAAGGTTCGGGGATCAAACCTGTACGTTGTTAGGGAAGCTTGATTGTGCACCGTTCTCCTACAAACAAGATCAGAAAATTTTTGAGAAACTATTTGCTGGGGACATTGAGGGCCAGATCGTCTGTTACGAAGAAGAAATTTTCAATCTCCTTGATCGTCACGGTGCAGACTACAAAAAGGACTGTCAAATCAGGGGTTCAACTTTTGACATTGTGACTTTCATCACTGCATCAGACACATTTGAGCCTGAGGACAGGTACAAGGTTTACCTTTGCTTGACAAGGCATAGATCAATTCTGCGTATCTTAAGCCCTGAAGGGAAGTTTCTGAGGGAGGATGCCAAGTTTGACACCACCGCCTGACAACACAAGAATTTTGTTACCAGTCGCCATTGGTTTGGGAGTGGGGATTGTGATTTGGTGTTTGACGAGGTCCACACTGCCGCAAGTTGGGGACAATGTACATAGTTTGCCACATGGTGGAAATTATTTGGACGGAACCAAGAGAATAAGCTACTGTGGCCCAAAGGAGAGCTTTCCAAGCAGTAATCTCTTTAAGGGGGGAACTTTCTCAGCGATCTGTGTTGTAGTTTTGCTCGTATTTGCCATTCATGTATCAGAGTTATTTAATCGGCCTAATCGCCGCTCTTGTGGTTGTGGTTCTGCTGCACATAATTAACCCTGAAAAGGATGGTTGTTTGATAGTCATTAGTGGGGAGTCTGTAATTATTAAAAATTGTGTGTATACAAGTGAATTCATTGACTTGGTTAGAGGCCTCAAGCCTCATAGTCATTGGAATTCACTGTAGTTAGGTTCAGTGCGTGTAGATTGAAATAATAGAATACTTTAAATTTGATTAGAAATGACTACTTCTCAATCCACAGCAAGCACTAATGTCGAGACCACCAAAATCAAGACAACTTCATCTCCTGTTGTCACCAGTGAGCCTGTTCTGCAGCAGGTGGCCTTTTCTACCACTGCGACATCAGCTACTTTACCGCCGCCACCTGTTACTACTCAAGCGTCGGTTGTTGCGACGAAAAGCAATGAGAGGCCATGGTTCGGGCTGCATTCAACGACAGCAGGCCTGGGCACACTAAGCGCTACTGCAACATCCATGGCGCCCCTACTAAATTCCTCAGGACAGCCATTACAGTCTGGTGATGACCTCAAGAAGCTCAAAGAAAAAGACGAAAGTCTCTTTGGGGTCAACTCTGGGATTGAGACCTTTGAAGCAACCACAAGTGGAAAGGGGCAAGGGCCAAGGGGTGTGGTACCGAGCATGATGTCCTATCAGAAGCCAGAAGAGAACAAAGTGGCTGGAGAGCAGAAGGGGTTGAGCCTGGGATCAAGACAAAGAATGGTCTTCGAAAAAGCCAGACACAGGGCTCAGGTGGATATTGATGCTGATCGAAGCAGTTTGGCGCCGCCATTTGCTTCAGCTGACCCTTTCTCGAGGCCAAAAGTTCAGGATGTTAGAAGGTTCTCATACGAACCAAGTTCACCAGACATATCTACTGCGGAGGAGATAGAGTACATTAGGAGTGATTTGGTCAGAGCGGGTGTGCCTGAAGCTACACTTACTTTCTCAATGTGGGATATTGCAAGATATTGTGCAGATGCGGGGTCCTCTGCGTCAACTGAGTTTGTGGGAACAAGTAGCTATGGTGGTAGAGTGACCAGGATGGAGATAGCATCAGTGATCAAGAAACATACAACTTTGAGGAGATTCTGTGGCTTTTATGCCAAGATCGTCTGGAATATAATGCTGTCGACCAACATTCCACCCTCCGGATGGGTTAAAAAGGGGTACAAAAAGAACACCAGATTTGCTGCGTTTGACTTCTTTGGCCATGTTTCTAATAACGCTGCCTTGGAGCCAGAGAATGGATTAGTGCGTGAGCCTACCCATGAGGAGTTGGTTGCATCACAGGTGAACAAGGGGGTGTTGCTGCATAGGACAGAGGCTGCGCAGGATAAAAATGTATCAACAGCACACGAGGTGACAGGTGGGAGGGCTGGGCCCCGCTCAAGGCTCCTTTTGAAAGGGAAGGAAATGGATTGAGGTGTTTTGGCCTGGAACCGTGGAGAGGCCTAAAAGAGTCCACGTGCCGTCTTAGAGTCTTAGTGTGTGTATTAGTAAATATTAGTAGTTTCCACTTCCTTAGGTTCCAGGTCTAGAACCCAGGAGAGACCTAAAAGAGTCCTGGTTGGCGTTTAGCCGTTCAGAACCTCTGCACTGCATAGGCCACACCAAAGCCAATCATTGTGTGCCTTATGTTGGCAAGTTAACCGAGTTGTGGCGGCAACCGGAAATGCTAGGTACAAGCGTAGAATTATGAGCTACGTCCTGTGACTGGATTGTCACCGTTATCTCGTCGTTAAGGGTGCAACCCTCCTTCTCTCGCTTATGAGGGCATTGTTAAGCGGGCGTGTGACCTACTGAAAGGTGGGTTCCCTACGTTAAGGGTAGTTGGAGTTTAGAATAAACTTCCATGGTTCCGACCTACCATGATTAAAGCGATCGGTAGTTCTGGGTAAGAAATAACCCTGTGCTTGGTGGCTAAGCATGACCACTCAGTTTGACCAACTGGACAGATGGGTTACGTTTCCTACTTCGATATCAAAAGTAGGCGCATATCAAAGCGTGAAATTGCTCACTTGCCTGTTCAAAGCCCTCCACTTTAAAGGGCTTGGTGCAGACTTCAGTCCTGGTGATCTGACTATAAAAGAGCCAAATAAACCGCATTTCAACGCGTTATAGTGTTCGCTGACAGACCGTACGAATAGTCTGTTTCACCAACCTAAGACCTAAATAATTGCATAAGGGGAGGTGATTAAACAAATTTGCTTTTTATCGCTAATTTTTGC
| 81,486
|
KR998049.1
|
Asian prunus virus 2
|
Pu,L., Bateman,M., Kinard,G.R., Li,R.
|
USDA-ARS, National Germplasm Resources Laboratory
|
USA
|
2016-06-30
|
APV_2_Q86
|
Asian prunus virus 2
|
Foveavirus
|
Betaflexiviridae
|
ssRNA(+)
| 9,400
|
GenBank
| null |
USA
|
USA
|
Prunus persica
| null |
2013-05-15
| null | null |
Asian prunus virus 2 isolate APV_2_Q86, complete genome
|
GATAACCAGAACAATCTATCAACAAACGACCCAGCTCGAAACAGACCCAAGTCGTTCGTAATGGCTTTAACATACCGAAGCCCGATAGAAGAAGTTCTTAATCGCTTCACCTCTGAGGAGCAGTCCAGGGTAAGTTCAACGTCGGTGGCCAGATTAACCCAAGTTGAAGTTAGCAATCATAAGCTTTTCTCATTCGCATTGAGTGAGAAGGCAAAGGAGAAGCTAATTAAAGTTGGAATTTATTTGAGCCCATTCTCTTTTGAACCACATTCACATCCTGCCTGCAAAACATTGGAGAATCACATTCTATATAATATTTTAGCTAATAAATTAGACAATAGTTTTTACGCAATAGGTATCAAGGGTTCCAAGGTCAACTTCTTAAAAAGTAGGTCAAAGAACCTAAGTATGTTGGAGTATGTGAACCGTGTTGTCACTAGCGCAGATAAGTACAGATATGGTAGTGACTTTACCACACTCAGCTCAAAGCAGATCGACAACCTCTGTTCAAAGAAAAGCCTTAGCGAGTGTGGCACACTGAAAGAGCTGGTTCCACTGGTTAAAATGAGCAAGAAAAGGAATTTCTTTATACATGATGAGCTTCACTACTGGAGCCCACAAGACTTAATGCTCTTTTTGGACTCAGTTAATCCCGACCACCTAGTAGCAACGGTGGTCTTTCCTCCCGAAATATTAGCTGGAGCCAAGGAGAGTCTTAACCCATGGTGTTACTCATTTCACCGGCAGGGCAGTAAATTAACATTTTTTCCAGACGGGGTCCAAAGTGAATCATACACACAACCCCTCAGCTCTGGTTACATTTTGAAGGCATCCAAGATTGTGTGTCCGAGTGGTCAAATATACTCTGTTGATCTTGTGTACTCAGCCTTTGCGCACCACGTCGTGAGCCTAACGAAAGGGAATCTACCAGGGCTTGAAAGGCGGTTCTTTTCAAATTTTGAGGCAACCGGGGTGAAACACCTATCCGGCCTCTCCTACTCTGTGAGGGATTGTATTCCTGTAAGCACTGATCTAATATCTAAGATTTACAGGTACATCAGGACCCTCAAGAAGCCTGACCTGCAGTCCTGCATGGCGAAGCTCAGCCAAATAGTTCCCAATCCAACTGGTGTTGAAATTAAGTTCACAGAGGATTTTTCACGACTAGTCATGGAAATTCAGCCTCTGAAGTCCCTTCTTATGCCAGACACTGCTAAACTAATTGGGGCTTTGTTCGCTTCCTTTCTGCCCTTCAAAATGGCAAGGTTTTTTGACTGCTACAAATCAAGCTCATTAGACAAATTCATTCATGACTTGGAACCATTCAGCTTTTCTGTGCCCACTGAAGTTATTGACTGTAATACAATGCCGGCCTTTGAAGCAGTTTCTTTGGGTGAGTCAATAAGTCCAGAGGAGGTTATTCAAATATTGAACCGAATGGAAATGGGGGCTTTCACTGGGCCATATGACTTGGTGGGGAAGTTCAAGTACTCAAATGAGGCCTATCACTGTCTCCACCATGTTCTTGATGGCTGCAGGCCTGAGGTTTTTAAGAGGTTGATTAGAAGGGTAGCAAGTTCATTCTGTAATGAATTTGGGGTCTACAGGAAAAGCAGTTATGTGGCATCCGTTGCAATCAATGTTTTCCAGAGAAGGTCAAACCTGAATCTCGATTTTATCTTGGGGTCTGATCTGAATCAAAAGGTTGTTGGTATTGTCCGCAATTTCTTTTCTTCAAAGAAATCCTCTCAGCTCATCTGGTATTCCACAAATTCCATGGCTTGGTTCAGGTTTTCAAAGTTGAGAGCTAATCAAAAATTCCTAAGATCACCATTTTTTCCTGCCTCTATGGATTGCAAAGACCTTTCAATTAGGAAAAAACTGATGTTTGACTTTGAGGTCTTTGGTTTCTGTGCCGGTTTAAGAAAGCTTGGGCCTTCAGGAGTTTTTTCAGTGGCGCCCCCTAAACCTGTTGTCGGTGGCTTTGAGTTCGTGCCTCCTGGGGAGGAGACCCACGAGGATGATATTGAGGTGGAGTTGAGCACCATGGCTAAAATGTCAGATCCATCAACACAGGTAGTTTTTGGAATTGAAGGTCCAGCTGTTCCTGTGCATGAGATTGCCCCACAAGACCAAACTTTCTCTCCCAAAGCAGCTAACCTTGAGGAACGAACTGGTCTTATTTTTGGATGTGTCCCTGAAACAAACTTAGAGAATTTTTCATTCAGTTCAGCCAATCAGGGTGATCGCCTCTTTGCCAACATTGTAAATGAGAACATAATAGATGTTGGAATCCTTCCTCCCACCGAATTGAAAATCCCATTGGATGCTAAAGTCACACAAATCAATGGTCGGGACTGCTTCTTCTTTACAAGGTGTTCATGTATTGACTATGGCCACAACAAGATCAAATACACTGCTAATAACTGGTTTTCAGGCCTTGATCAATTTCTATCCAATGAGGGAACATACTACAATGCATGCCTCCTGCAGGTTTACAAGGCTGGTAGTGGAATTGGTTTCCACTCTGACAACGAAAAGGTCTACCACAGAAGTCCTATCAAAACTGTTAATCTGTGTGGAGAGGCTGACTTCCTCGTTAAAGCTAAGGGTAGGAGGGACTTGGGTACTGTTGCAAGAGGACATCTCTTCCCAGGACATTATTTCACAATGGATTCAAATTTTCAGTCCTACTATCAACATTCAGTCCAAGATTGCAGTGAGGGGAGGGTTTCCTTAACTTTCCGCCATCATGTGAATAATGTCACAGGGTTGCCAATCAAGCACACTTGTGGAGAGTTTGGTGACACTGAAATTCTGTTTGATGTGCTCATCAGAAGGAGTTTCACCTATGCAGCAAAAAACTTTCACACCTTCCCAGTTCCTGGGGATGGCAGTTGCTTTTGGCATAGCATGGGGGCTTTGTTGGGAGTTGATGGTGAGGAATTGAAGAAGATATCTGCGAGAGAGATTCAAAAGAACGAAATTTTACTATCCAATCTAAGCCTACGTCAGCAGATGGCCAACAAACAGTATGCTGAAAGAGAGTCAATTGCGGCTTTCTGCAGGATCCAATCAATCCATTTGGTTGTTCTGCTCCCAGGCAATAATTTCTCTTATGAGTTTCTCCCGTCACAAAATCCTGAAGTCACCCAACTGTTTGTCAAGCTAACAGGTGAACACTTTGAGCCTGCTTTGCCAGTGAATGGATGCGTTGTCAAGTCAATTGCCGAAACCCTGAATCAAACTGAAGCAAAGATCTTGTCAGTAATCGGGAGACCTACAAATAGGATGATTCTCGACAACTTGGTCGAGGGAGAGGGACTCAACCTTGAAGACCTTGAGGCAGCATTTACAATCTTTGGAATATGTGCTAGGGTCAGCTCAGAACATGGGGTTTTCACCCTAAATAGGGATGGCAATCTGCATGCAAACTATGAATTGAAGTCTGGCCACATAATGTATTTGAGAAAAGTTCCTAGCTCACAGTTTGCCCCCTCCACACCAATTCAAAATTTTTATGGACAAGGGCCTGAGTTGTTTCTAAAGGGAATTGTCAGTGAGGTGAGATACAAGCCAGATTGGGAAAGGGCCAGGAACTTGGAGGAATCATTCCTTAATGGCACGACAGGGGTTTTATGTGACCGCACTGTCAATCTCCAAAAAAATTGGTTGACTGAAGGAAGAAGGCTGGTGAGGGATGAGCGGAATCTGGGTGTTGTTCTTGGAACCTTTGGATCTGGTAAGAGCACATTATTCAAGCGGTTCATCGTGAAAAATCCCTCAAGGTCAATTGTCTTTGTCTCTCCAAGGAGGTCATTAGCTGATCAAATTAAGGAGGATCTGGGTCTCAATTCAAAGAGGGGGAGATCCCTGAGAGTCAGGGTTTTAACCTTAGAGAGCTTCATCAAAGCGGTTTTCACTTTCAAGGCAGCAAGTGTTGTTCTCGATGAGGTGCAACTGTACCCCCCTGGGTACCTTGATTTAATGATGCTATGTCTTAGTGGAAATTGTCAGATCTACCTCTCAGGAGATCCGTGCCAGAGCGACTACGATTCAGCCAAGGACAGGGCACTCTTTGATGGGATGAAGGGGGACATCTTCGAGGTGCTTGAAGGAAAGAGCTATAAATTCAATGCAGCCAGCAGGAGGTTTCAGTCTCAGATGTTTGTGGGCAGGCTTCCCTGTCGTCTAGATTCAAAGGACATGGTTGGGGATGAGGACTTTCACTGGCTTGAGAGCATTGAGGCTGCAGCTGAGGTTAGTAACACTGAATATGACGTTGTTTTGGTCTCAAGCTTTGAAGAAAAGAAAATCATTTGGGCACATCTCGGGAGAGACGTTGAAGTCCTCACTTTTGGGGAATCAACAGGCTTGACCTTCAACCGGGGCATAATTCTCATTTCTCACGAAAGTACCCTCACTAGTGAAAGGAGATGGATTACAGCGCTGTCAAGGTTTAGACTGAATGTCATCTTTGTCAATTTGGTTGGCAACAATATTGAGGACGTATGCCAAGTTTTTCATGACCGAACACTGTTCAAATTCCTCAACCGCACCGCAACAATTGGAGACATTGTCAAACAACTCCCTGGCCACCCAGAGCTGACAAATGACTTTGGTGATAAGGTTGGGAGGTCGGAAGGGGTTATGGAAGACAAGCTTGCTGGTGACCCGTGGTTAAAGGCCGAGATCGATCTTCTACAGGATGAGGATCAGGAGATGATTGAGTTGGCTGAGGAGGTTAGAAATGAGCCATGGTTCAAGACCCACCTCCCCTTGTTTGAGTTGGAATCTATAAGGGCAAATTGGGTGCACAAAATAATGAACAGGGAGTATCGTGAAGTACGTTGCGGAACGGAAGTGTCGACTCAGTTCCCTGAGGATCATCCCAACAAATATAAGGTGACTCTAGCCAATGCAGCCGAGCGCTTCGAAGCAATTTACCCAAGACATAGGGGAAGCGATTCTGTAACCTTCCTAATGGCTGTTAAAAAAAGGCTTAGCTTTTCGAGACCATCTGTTGAGTCAGCCAAGTTGAACAGGGCAAAGCCGTATGGAAAATTTCTCCTGCAGGAGTTTCTCAAGAGGGTCCCCCTAAAGACTAGTTTGGATTCAGCTCTGTTCGCTAGATCGAAAAGGGAATTTGAAGAAAAGAAAACAAGCAAAAGTGCTGCTGTCATTGAGAACCATTCTGGAAGATCATGTCGCGATTGGCTAGCTGATGTTGGGTTTATTTTCATGAAAAGCCAATTTTGCTCCAAGTGGGACAACAGGTTCAGAGATGCCAAAGCTGGACAAACTTTAGCCTGCTTTCATCATTCAATTTTATGTCGCTTTGCACCCTATATGAGATATATTGAACATAAGCTTCAGGAGGTCCTGCCAGCTAACTTGTACATCCACTCTGGGAAGAACCTGGAAGACCTCAATCGCTGGGTTATTGAAAACAGCTTCACTGGCATGTGCACTGAATCGGATTACGAAGCCTTCGATTCAAGCCAGGATCATTATATTCTAAGCTTTGAGATTGAAATTATGAAGCATCTCCAGTTACCTTGGGACCTGATTGAGGATTATGTGTACATCAAAACCCACCTTGGTTCTAAGCTTGGGAATTTTTCAATCATGAGATTCACTGGTGAGGCGAGCACATTCTTGTTTAACACGATGGCAAATATGTTGTTCACTTTTCTAAGGTACGAACTCAATGGCTCAGAGGCCATATGCTTCGCTGGTGATGACATGTGCTCGAACCGGAGACTGAGGGTGTCAAATAAACATGAGAAGTTCCTGAGCAAAATTAGGCTAAAGGCCAAAGTCCAATTTACAGTCAAGCCAACATTTTGTGGATGGAATCTGTGCCTTGATGGAATTTTTAAACGTCCTCAGTTGGTACTGGAAAGGCTCTGTGTTGCAAGAGAGAAAGATAACCTGGCCAACTGTCTTGACTCTTATGCTATAGAGGTTGGTTATGCTTTCGCTTTGGGTGAAAAAGTTTTGCAGTATATGGATGAGGAGGCCATGCAAAACCATTACAATTGTGTTAGATTTATTGTCAAACATTCACATCTCCTTAAGTCGAGCGTTCGTGATCTCTTCTTACAGAATATGTAGATTAGGTTTAACATTGTGTTATGTGAATAAGTATTCTTGTGTTTGGTAATGGATTTGGTTTATGATAGATTAATAGACGCTGGTTACATTAGAACTAGATTGCCAATTAGTTTTCCTATTATTGTTCACTGCATTGCTGGCGCTGGAAAAAGCACTCTAATCAGGGAAATCATTGAAGTTGACCACAGGTTTGAGGCTTTCACTTACGGTGTCCCGGACCCAATCAATCTTTCTGGAGTGAGAATTAAGAGCAACCTTGACATACTTTCAGCACGTGCTGACTCACTCAAAATCATTGACGAATACATAGGTCAAGACCTGCCTGAGGGAACAACTTTTTGCTTTGCAGATCCAAACCAGTTTCCCTACACCTGTCCAGACGCACATTTCACTTGCTACCAGACTAAAAGGTTTGGTGATCAAACCTGTGCATTGTTGGGAAAGATTGACTGTGCTGCATTCTCTTATAAACAGGATCAAATAATCTTTGACAAATTGTTTGCTGGTGATATTGAAGGTCAGATCGTTTGCTACGAAAAGGAAATTTTTGATCTCCTTGACCGTCACGGGGCAGATTATAAGAAATATTGCCAAATCCGGGGATCAACATTTGATATCGTGACCTTCATTACTGCATCAGACACTTTTGAACCTGAGGATCGGTATAAAGTCTACCTTTGTCTAACAAGACACCGTTCAATCCTACGTATTTTGAGTCCTGGGGGAAAGTTCCTAAGGGAGGATGCCAAGTTTGACCCCACCACCTGACAACACAAGGGTTTTGTTACCAATCGCCATTGGCCTTGGGGTGGGGGTTGTTATCTGGTGTTTAACAAGGTCTACATTGCCTCAAGTCGGAGACAATATCCACAGTTTGCCACATGGTGGGAATTATTTGGACGGAACAAAGAGAATTAGCTACTGTGGGCCGAAGAACAGTTTTCCAAGCAGCAATCTTTTCAAAGGGGGTGCCTTTTCAGCAATTTGTGTCGTGGTATTGTTAGTGTTTGCTATCCATGTTTCAGAGTTATTTAATCGGCCTAATCGCCGCTCTTGTGGCTGTGGTTCTGCTGCACATGCTTAACTCTGGGCAGGAAGGTTGTTTAATAATTATTAGTGGGGAGTCTGTAGTTATTAAGAATTGTGTGTACACTAGTGAGTTCATTAATCTGGTTAAGGGCCTCAAGCCCCACAACCATTGGAATTCACTGTAGTTAGGTCCAGTGTGTGTAGATTGAAATAATAGATTACCTTGAGATTTTGATTGAAATGACTACTTCTCAATCCACAGCAAGTACTGATGTCGAGACTTCCAAAGTCGAGGCTACTTCACCTCCGGTTGTCACCAGTGAACCTGTTCTACAGCAGGTGGTCTTTCCTGACACTTCAAAAGCAGCTACTGCGTCACCGCCACCTGTTACTTCTCAGACGTCAACTGCTACGACGAAAGGCGTTGAAAGGTCATGGTTTGGGCTCCCACCAAAGACGACGGGCTTGGGTACACTGAGTGCCACTGCGACACACACAGCACCCTTGCTGCACGCTTCAGGGCGAGCCTCACAGCTTGATGAGGACCTTAAAAAACTTAAGGCGAGGGATGAGAGCTTCCTTGTGTTAAATAGTGAGGTTGAAGATCTTGGAGCAACAACGAGTGGAAAAGTACAGGGGCCAAGGGGGGTTGTGCCAAGCATGATGTCTTATGAGAAACCCGAAAAAGGCAAAACTATTGAAGAGCCCAAGGGGTTGAGCTTAGGTTCGAGGCAGAGATTGGTCTTCGAAAAGGCTAGGCAGAGGGCCCAGGTGGACATTGAAGCTGACCGTGACAGTTTGGCACCGCCATTTGCTTCAGCAGACCCCTTCTCCCGACCAAAAGTTCAGGATGTCAAAAGGTTCTCATATGAACCAAGCTCACCTGACATTTCAACAGCTGAGGAGATTGAGCACATTAGAAGTGATTTGATTAGGGCAGGTGTGCCAGAGTCCACACTCACCTTTTCAATGTGGGATATAGCTAGATACTGCGCCGATGCTGGCTCCTCAGCCTCAACTGAATTTATAGGGACAAGCAGTTACAGCGGCCGCGTGACCAGAATGGAGATAGCTTCGGTTATCAAAAAGCATACAACCCTGAGGCGATACTGTGGCTTCTACGCAAAAATTGTTTGGAACATAATGCTGTCAACCAACATCCCACCATCTGGGTGGGTGAAAAAGGGTTACAAGAAGAACACAAGGTTTTCTGCATTTGATTTCTTTGAGCAGGTTTCAAACAATGCTGCGCTGGAGCCAGAAAATGGGCTAGTTCGTGAGCCCAACCACGAGGAGTTGGTTGCATCCCAAGTGAATAAGGGGGTTTCATTGCACAGAACTGAAGCTGCACAGGATAAGAACGTGTCAACTGCACACGAGGTGACAGGTGGGAGAGCTGGACCCCGGTCAAGGCTGTTGTTGAAGGGGAAAGAAATGGATTGAGTGGTTAACACATGGCCTAGAACCGTGGAAAGGCCTAAAAGAGTCCACGTGCCGTCTTAGAGTTATAGTGTGTGTATTAGTAAATATTAGTAGTTTCCACTTCCCAAGGTTCCAGGTCTCGAACCCAGGAAAGACCTTAAAGAGTCCTGGTTGGCGTTTAGCCATGGAGAACCTCTGCACCACATAGGCCACACCAAAGTTCATCATTGTGTGCCTTACGTGGGCAAGTTAACCGAGTTGTGGCGGCAACCGGAAAAAAGTCAGATACAAGCGTAGATTTATGAGCTACGCCCTGTGGTTGGATTTCCACCGTTATCTCGTCGTTAAGGGAGCAACCCCTTTTCTCTCGCTTATAGGGGTATTGTTAAGCGGGCGTGCGACCCATTGAGAGATGGGTTCCCTACGTTAAGGGTAGTTGAAGTTTAGAACAAACTTCCATGGTTCCGACCTACCATGATTAAAGTGATCGGTAGTTCTGGGTAAGAAGCAACCCTGTGCTTGGTGGCTAAGCATGACCACTCAGTTTGACCGACTGGCCAGACAGGTTACGTTTCCCATTTCGATATCAAAAGTGGGCGCATGTCAAAGCGTTAAATTGTTCGAGCTCATGTTTCAGATCCTCAGTCTTGGGGCTTGAAACAGGCTTCAGTCCTGGTGATCTGACTTTAAAAGAGCCAAATAAACCGCATTTCAACGCGTTATAGTGTTCGCTAACAGACCGTACAAATAGTCTGTTTCACCAACCTAAGACTTAAATAATTGAATAAGGGGAGGTGATTAAACAAATTTGCTTTTTATCGCTAATTTTTGC
| 81,487
|
KT893294.1
|
Asian prunus virus 2
|
Marais,A., Faure,C., Candresse,T.
|
INRA, Virology
|
France
|
2015-12-26
|
Bungo Q-1256-01
|
Asian prunus virus 2
|
Foveavirus
|
Betaflexiviridae
|
ssRNA(+)
| 9,362
|
GenBank
| 1
|
Japan
|
Japan
|
Prunus mume
| null | null | null | null |
Asian prunus virus 2 isolate Bungo Q-1256-01, complete genome
|
GGATAACCAGAACAATCTATCAACAAACGACCCCGCTCGAAACAGACCTAAGTCGTTCGTAATGGCTTTAACATACCGAAGCCCGATAGAAGAAGTTCTTAATCGCTTCACCTCTGAGGAGCAGTCCAGGGTAAGTTCAACATCAGTGGCCAGATTAACCCAAGTTGAAGTTAGCAACCATAAGCTCTTTTCATTCGCATTGAGTGAGAAGGCCAAAGAGAAGCTAATTAAAGTTGGAATTTATTTGAGCCCATTCTCTTTTGAACCACATTCACATCCTGCCTGCAAAACATTGGAGAATCACATTTTATATAATATTTTAGCTAATAAATTAGATAACAGTTTTTATGCAATAGGTATTAAGGGTTCTAAGGTTAACTTCTTAAAAAGTAGGTCAAAGAACCTAAGCATGTTGGAGTATGTGAACCGTGTTGTCACCAGCGCAGATAAGTATAGGTATGGTAGTGACTTCACCACACTCAGCTCAAAGCAAATCGACAACCTCTGTTCAAAAAAAAGCCTTAGTGAGTGTGGCACATTAAAGGAACTGGTTCCACTGGTCAAAATGAGCAAGAAGAGGAATTTTTTCTTACATGATGAGCTTCACTACTGGAGCCCACAAGACCTGATGCTATTTTTGGACTCAGTCAATCCTGATCACTTGGTAGCAACGGTGGTCTTTCCTCCCGAGATATTAGCTGGAGCCAAGGAGAGTCTGAATCCATGGTGTTACTCATTTCACCGGCAGGGCAGCAAATTAACATTCTTTCCAGACGGGGTTCAAAGTGAGTCATACACACAACCCCTCAGCTCTGGTTACATCCTGAAGGCATCAAAAATTGTGTGTCCAAGTGGTCAGATCTACTCTGTGGATCTTGTGTATTCAGCCTTTGCACACCATGTTGTAAGCATAACAAAGGGAAATTTACCAGGGCTTGAAAGGAGGTTTTTTTCGAACTTTGAGGCAACCGGGGTGAAACACCTATCTGGCCTCTCCCACTCTGTGAGGGACTGCATTCCAGTCAGCACTGATCTAATATCTAAGATCTACAGATATATCAGGACCCTCAAGAAGCCTGACTTGCAGTCCTGCATGGCCAAGCTCAGCCAGATAGTCCCTAATCCAACTGGTGTTGAAATTAAATTCACAGAGGATTTCTCACGACTAGTCATGGAAATTCAGCCTTTAAAGTCCCTTCTTATGCCTGACACTGCGAAATTAATTGGGGCTTTGTTTGCTTCCTTTCTGCCCTTCAAAATGGCAAGGTTCTTTGACTGCTACAAATCAAGCTCATTAGACAAATTCATTCATGATTTGGAGCCATTTAGCTTTTCTGTGCCCACTGAAGTCATCAACTGCAATACAATGCCAGCTTTTGAAGCAATTTCTTTGGGTGAGTCAATGAGTCCAGAGGAAGTTATCCAAATATTGAACCGAATGGAAATGGGGGCTTTCGCTGGGTCATGTAACCTGGTGGGAAAGTTCAAATACTCAAATGAGGCCTATCATTGTCTTCACCACGTTCTTGATGGCTGCAAGCCTGAAGTTTTCAAGAGGTTGATTAGAAGAGTGGCAGGTTCCTTCTGTAATGAATTCGGCGTTTACCGGAAAAGCAGTTATGTGGCATCCGTTGCAATCAATGTGTTCCAAAGGAGGTCAAACCTAAATCTTGATTTTATCTTGGGGTCTGATCTAAATCAAAAGGTTGTTTGCATTGTCCGCAATTTCTTTTCCTCAAAGAAATCTTCTCAGCTTATCTGGTATTCCACAAATTCTATGGCTTGGTTCCGTTTTTCGAAGCTGAGAGCCAATCAAAAGTTTCTGAGATCACCAATTTTTCCTGCCTCCATGAACTGCAAAGACCTTTCAACTAGGAAAAATCTAATACTTGACTTTGAGGTTTTTGGTTTCTGTGCTGGCTTAAGAAAGCTTGGGTCTTCGGGAGTTTCTTCAGTGGTGCCTCCCAAACCTGTTCTTGGTGGCTTTGAGTTTGTACCCCCTGGGGAGGAGGCCCACGAGGATGATATTGAGGTGAAGTCGAATACCATGGCAAAGATGTTTGATCCATCACCACAGGCAGTTCTTGGAATTGAAGGTCCAGCTGCTGGTGTGCATGAGATTGACCCACAAGATCAAACTCTCTCTCCCAAAGCTGCTGACCTTGAGGAACGAAATGGTCTTATTTTTGGATGTGTTCCTGAACCAAGCTTGATGAATTTTTCATTCAGTTCAGCCAACCAGGGTGATCGCCTCTTCGCCAACATCGTGAATGAAAACATAGTAGATGTTGGAATTCTCCCTCCCACCGAACTGAAAATCCCATTGGATGCCAAGGTCACACAAATCAATGGTCGAGATTGCTACTTCTTCACAAGGTGCTCATGTATCGACTATGGCCACAATAAGATCAAGTACACTGCTAATAACTGGTTTTCAGGCCTAGATCAATTTCTATCCAATGAGGGAACATACTACAATGCGTGCCTTCTGCAAGTTTACAGGGCTGGCAGTGGAATTGGTTTTCACTCTGACAACGAAAAGGTCTACCATAGAAGTCCTATCAAAACTGTCAATCTGTGTGGAGAGGCAGACTTCCTTGTTAAAGCTAAGGGTAGGAGGGACTTAGGGACTGTTGCAAGAGGACATCTCTTTCCAGGACACTATTTCACAATGGATTCAAATTTCCAGTCTTACTACCAACATTCGGTCCAAGATTGCAGTGAGGGGAGGGTCTCCTTAACTTTCCGCCATCATGTAAACAATGTCACAGGACTGCCAATCAAACATACTTGTGGAGAGTTTGGTGATACTGAGATTTTGTTTGATGTGCTCATAAGAAGGAGTTTCACCTATGCAGCAAAAAACTTTCATACCTTCCCAGTCCCTGGGGATGGCAGTTGCTTTTGGCATAGTATGGGGGCTCTGCTGGGAGTTGATGGTGAGGAATTAAAGAAGATATCTGCGAGAGAGATCCAGAAGAACGAAATTTTACTATCCAACCTGAGCCTACGTCAGCAGATGGCAAATAAGCAGTATGCTGAAAGAGAGTCAATTGCGGCTTTCTGCAGGATCCAATCAATCCATTTGGTTGTTCTGCTTCCAGGCAATAATTTCTCTTATGAGTTTCTTCCGTCACAAAATCCTGAAGTCACCCAACTGTTTGTCAAGCTAACGGATGAACACTTCGAGCCTGCTTTGCCAGTGAATGGATGCGTTGTCAAGTCAATTGCTGAAACCCTTAATCAAACCGAAGCAAAGATCTTGTCAGTGATTGGGAGACCCACAAATAGAATGATTCTCGACAATTTAGTCGAGGGAGAAGGACTCAACCTTGAAGACCTTGAGGCAGCATTTACAATCTTTGGAATATGTGCTAGAGTTAGCTCAGAAAATGGTGTTTTTACCCTAAATAGGGATGGCAATCTGCATGCAAACTATGAGTTGAAATCTGGTCATATAATGTACTTGAGGAAAGTCCCTAACTCACAGTTTGCCCCCTCCACACCAATCCAAAACTTTAATGGACAAGGGCCTGACCTGTTTGGGAAGGGGGCTAGAAATTTAGAGGAATCATTCCTTAATGGCACAACAGGGGTCTTGTGTGACCGCACTGTCAATCTCCAGAAGAATTGGTTGACTGAGGGAAGAAGGTTAGTGAAGGATGAGCGGAATCTAGGTGTTGTTCTTGGAACCTTTGGATCTGGTAAGAGCACATTATTTAAGCGGTTCATCGTAAAAAATCCCTCAAGGTCAATTGTCTTTGTCTCTCCAAGGAGGTCATTAGCTGATCAAATTAAGGAGGATTTAGGTCTCAATTCAAAGAGGGGGAGATCCTTGAGAGTCAGAGTTTTAACCTTGGAGAGCTTCATCAAAGCAGTCTTTACTTTCAAGGCAGCAAGTGTAGTTCTCGATGAGGTGCAACTGTATCCCCCTGGGTACCTTGACTTGGTGATGCTATGTCTCAGTGGAAATTGTCAAATCTACCTCTCAGGAGATCCGTGCCAGAGCGACTACGATTCAGCCAAAGACAGAGCGCTCTTTGATGGGATGAAGGGGGATATCTTCGAGGTGCTTGAAGGAAAAAGCTATAAATTCAATGCATCCAGTAGGAGGTTTCAGTCTCAGATGTTTGTGGGCAGGCTTCCCTGTCGTCTGGATTCAAAAGATATGGTTGGAGATGAGGACTTTCATTGGCTTGAGAGCATTGAGGCTGCAGCTGAGGTTAGCAACACTGAATACGACGTTGTTCTGGTCTCAAGCTTCGAAGAAAAAAAAATCATTTGGGCACATCTCGGGAGAGACGTTGAGGTCCTAACTTTTGGAGAATCAACAGGCTTGACCTTCAACCGGGGCATTATCCTCATTTCTCACGAAAGTACCCTCACTGGTGAAAGAAGATGGATTACTGCGCTGTCAAGGTTTAGACTAAACATTATCTTTGTCAACTTGGTTGGCAACAATATTGAGGACGTATGCCAAGTTTTTCATGATCGAACATTGTTCAAATTTCTCAATCGCACCGCAACAATTGGAGACATTATTAAGCAACTTCCTGGCAACCCAGAATTGACAAATGACTTTGGTGATAAAGTTGGGAAGTCGGAAGGAGTCATGGAAGACAAGCTTGCTGGTGACCCGTGGTTAAAGACTGAGATCGATCTTCTACAGGATGAGGATCAGGAGATGGTCGAGCTGGCAGAGGAGGTTAAAAATGAGCCATGGTTTAAGACCCACCTCCCCCTATTTGAGTTGGAATCAATAAGGGCAAATTGGGTGCACAAAATAATGAACAGGGAATATCGTGAAGTACGTTGCGGAACGGAAGTGTCAACCCAGTTCCCTGAGGACCACCCCAATAAGTATAAGGTGACCCTAGCCAATGCAGCCGAGCGTTTCGAAGCAATTTATCCAAGACACAAGGGAAGTGATTCTGTAACCTTTCTAATGGCTGTTAAAAAAAGGCTTAGCTTTTCAAGACCATCAGTTGAGTCAGCCAAGTTGAATAGGGCAAAGCCGTATGGAAAATTTCTCCTGCATGAGTTTCTCAAGAGGGTCCCCCTAAAGACTGGTTTGGACTCAGCTCTGTTTGCTAGGTCAAAAAGAGAATTTGAAGAGAAGAAAACTAGCAAAAGTGCTGCTGTTATCGAGAACCATTCTGGAAGGTCATGTCGCGACTGGCTGGCTGATGTTGGATTTATTTTCATGAAAAGTCAGTTTTGCTCTAAGTGGGACAACAGGTTCAGGGATGCCAAAGCTGGACAAACTTTAGCCTGCTTCCATCATTCAATCTTGTGTCGCTTTGCGCCCTACATGAGATATATTGAACACAAGCTTCAGGAGGTCCTTCCAGCCAACCTGTACATCCATTCTGGAAAGAACCTGGAAGATCTCAATCGCTGGGTGATTGAGAACAGCTTCACTGGCATGTGCACTGAATCAGACTACGAAGCCTTCGATTCAAGCCAGGATCATTATATTCTGAGCTTTGAGATTGAAGTCATGAAGCATCTCCAGTTACCTTGGGACCTAATTGAGGATTATGTGTACATTAAAACCCACCTTGGTTCTAAGCTTGGGAATTTTTCAATCATGAGATTCACTGGTGAGGCAAGCACTTTCTTGTTCAACACGATGGCAAACATGTTGTTCACTTTCTTGAGATACGAACTCAATGGTTCAGAGGCCATATGCTTCGCTGGTGATGATATGTGCTCGAACCGGAGACTGAGGGTGTCAAATAAACATGAGGGGTTTCTGAGCAAACTTAGGTTGAAGGCCAAAGTCCAATTTACAGTTAAGCCAACATTTTGTGGATGGAATCTGTGCCTTGATGGAATTTTCAAACGCCCCCAACTTGTTTTGGAAAGGCTCTGTGTTGCAAGAGAGAAAGACAACCTGGCTAACTGTCTTGACTCCTATGCTATAGAGGTTGGTTACGCTTTCGCTTTAGGTGAAAAAGTTTTGCAGTATATGGATGAGGAGGCCATGCAAAACCATTACAATTGTGTCAGATTCATTGTCAAACATTCACACCTCCTTAAATCGAGCGTTCGTGATCTCTTCTTACAGAATATGTAGATTAGGTTTAACATTGTGTTATGTGAATAAGTATTCTTGTGTTTGGTAATGGATTTTGTTTATGATAAGTTAATAGACGCTGGTTACATTAGAACTAGACTGCCAATTAGTTTCCCTATTATTGTTCACTGTGTTGCCGGCGCTGGAAAAAGCACTTTAATCAGGGAAATCATTGAGGTTGACCACAAGTTTGAGGCCTTCACTTACGGTGTTCCGGACCCGATTAATCTCTCTGGGGTAAGAATTAAGAGCAACTCTGACATACCTTCAGCACGTGCTGACTCACTAAAAATCATCGACGAATACATCGGTCAAGACCTGCCTGAGGGAACAACTTTTTGCTTTGCAGATCCAAACCAATTTCCTTACACCTGTCCAGACGCACACTTCACGTGCTACCAGACAAAAAGGTTTGGTGATCAAACTTGTGCATTGTTGGGAAAAATTGACTGTGCTGCATTCTCTTACAAGCAGGATCAAATAATCTTTGACAAATTGTTTGCTGGTGATATTGAAGGGCAGATCGTTTGCTACGAAAAGGAAATTTTTGATCTCCTTGACCGTCACGGGGCAGATTATAAGAAATATTGCCAAATCCGGGGATCAACCTTTGATATTGTGACCTTCATAACTGCATCAGACACTTTTGAACCTGAGGATCGGTATAAAGTCTATCTTTGTCTAACGAGACACCGCTCGATCCTACGTATCTTGAGTCCTGAGGGGAAGTTCCTAAGGGAGGATGCCAAGTTTGACACCACCACCTGACAACACAAGGGTTTTGTTACCAATCGCCATTGGTCTTGGGGTGGGGGTGGTTATCTGGTGTCTAACAAGGTCTACATTGCCTCAAGTAGGAGACAATATCCACAGTTTGCCACATGGTGGGAATTATTTGGACGGGACAAAAAGAATCAGCTACTGTGGGCCAAAGAACAGTTTTCCAAGCAGCAATCTCTTCAAAGGAGGTGCTTTTTCAGCAATTTGTGTTGTAGTATTGTTAGTGTTTGCTATTCATGTTTCAGAGTTATTTAATCGGCCTAATCGCCGCTCTTGTGGCTGTGGTTCTGCTTCACATGCTTAACTCTGGGCAGGAAGGTTGTTTGATAATTATTAGTGGAGAGTCTGTAGTTATTAAGAATTGTGTGTATACCAGTGAGTTCATTAATCTGGTTAAGGGTCTTAAACCCCACAACCATTGGAATTCACTGTAGTTAGGTCCAGTGTGTGTAGATTGAAATAATAGATTGCTTTGAGATTTTGATTGAAATGACTACTTCTCAATCCACAGCAACTGCTGATGTCGAGACTTCCAAAGTCGAGACTTCTCCACCTCCGGTAGTCACCAGTGAACCTGTTTTACAGCAGGTGGTCTTTTCTGACACTTCAAATGCAGCTACTACGCCACCGCCACCTGTCACTACCAAGACGTCAACAGCTGCGACGAAAGGCGTTGAAAGGTCATGGTTTGGGCTCCCATCTAAAACGACGGGTTTGGGTACATTGAGTGCCACTGCTACATCCACATCACCCCTGTTAAGCGCTTCAGGGCGAGCCTCACAACTTGATGAAAACCTCAAAAAGCTTAAGGCGAAGGATGAGAGCTTCTTTGTGCTAAATAGTGAGGTTGAAGACCTTGAGGCGAAGGCAAGTGGGAAAGTGCAGGGGCCAAGGGGGGTTGTGCCAAGCATGATGTCTTATGAAAAACCCGAAAAAGGTAAAGTTGTTGAGGAGTCCAAGGGTTTGAGCTTAGGTTCAAGGCAGAGATTGGTCTTTGAAAAGGCTAGGCAAAGGGCACAGGTGAACATTGAAGCTGACCGTGACAGTTTGGCGCCGCCATTTGCTTCAGCAGATCCCTTCTCCCGACCAAAAGTTCAGGATGTCCAAAGGTTCTCATATGAACCAAGCTCACCTGACATTTCAACGGCTGAGGAGATTGAACACATCAGAAGTGATTTGGTTAGGGCAGGTGTGCCTGAGTCCACACTCACCTTTTCAATGTGGGACATAGCTAGATACTGCGCTGATGCTGGTTCCTCAGCCTCAACTGAGTTCATAGGGACAAGTAGTTACAGTGGCCGTGTGACCAGAATGGAGATAGCCTCGGTGATCAAAAAGCATACAACCCTGAGGCGATACTGCGGCTTCTATGCAAAAATTGTTTGGAACATAATGCTGTCGACCAACATACCACCTTCTGGATGGGTGAAAAAGGGTTACAAGAAGAACACAAAGTTTTCTGCATTTGATTTCTTTGAGCAAGTCTCAAACAATGCTGCGCTGGAGCCAGAAAATGGGCTGGTTCGTGAGCCCAACCACGAGGAGTTAGTTGCATCCCAAGTGAATAAGGGGATTTCATTGCACAGAACTGAAGCTGCACAGGACAAGAACGTGTCAACAGCACACGAGGTGACGGGTGGGAGAGCTGGACCCCGGTCAAGACTGTTGTTGAAGGGGAAGGAAATGGATTGAGTGGTTAACACATGGCCTAGAACCGTGGAGAGGCCTAAAAGAGTCCACGTGCCGTCTTAGAGCTATAGTATGTGTGTTAGTAAATATTAGTAGTTTCCACTTCCTAAGGTTCCAGGTCTCGAACCCAGGAAAGACCTTAAAGAGTCCTGGTTGGCGTTTAGCTGTATAAAACCTCTGCACCGCATAGGCCACACCAAAGTTCATCATTGTGTGCCTTATGCGGGCAAGTTAACCGAGTTGTGGCGGCAACCGGAGAAAGTCAGATACAAGCGTAGATTTATGAGCTACGCCCTGTGGTTGGATTTCCACCGTTATCTCGTCGTTAAGGGAGCAACCCCTTTTCTCTCGCTTATGGGGGTATTGTTAAGCGGGCGTGCGACCCATTGAGAGATGGGTTCCCTACGTTAAGGGTAGTTGAAGTTTAGAATAAACTTCCATGGTTCCGACCTACCATGATTAAAGTGATCGGTAGTTCTGGGTAAGAAACAACCCTGTGCTTGGTGGCTAAGCATGACCACTCAGTTTGACCGACTGGCCAGACAGGTTACGTTTCCCACTTCGATATCAAAAGTGGGCGCATATCAAAGCGTTAAATTGCTCGATCGCATGTTTCAAACTCTCAGTCTTGGGGGTTTGAGACAGGCTTTAGTCCTGGTGATCTGACTTTAAAAGAGCCAAATAAACCGCATTTCAACGCGTTATAGTGTTCGCTGACAGACCGTACAAATAGTCTGTTTCACCAACCTAAGACCTAAGTAATTGAATAAGGGGGAGTGATTAAACAAATTTGCTTTTTATCGCTAATTTTTGC
| 84,422
|
KT893295.1
|
Asian prunus virus 2
|
Marais,A., Faure,C., Candresse,T.
|
INRA, Virology
|
France
|
2015-12-26
|
Bonsai
|
Asian prunus virus 2
|
Foveavirus
|
Betaflexiviridae
|
ssRNA(+)
| 9,375
|
GenBank
| 1
|
Japan
|
Japan
|
Prunus mume
| null | null | null | null |
Asian prunus virus 2 isolate Bonsai, complete genome
|
GGATAACCAGAACAATCTATCAACAAACGACCCAGCTCGAAATAGACCCAAGTCGTTCGTAATGGCTTTAACATACCGAAGCCCGATAGAAGAAGTTCTTAATCGCTTCACCTCTGAGGAGCAGTCCAGGGTAAGTTCAACGTCAGTGGCCAGATTAACCCAAGTTGAAGTTAGCAACCATAAGCTTTTTTCATTCGCATTGAGTGAGAAGGCCAAAGAGAAGCTAATTAAAGTTGGAATTTATTTGAGCCCATTTTCTTTTGAACCACATTCACATCCTGCCTGCAAAACATTGGAGAATCACATTTTATATAATATTTTAGCTAATAAATTAGACAACAGTTTTTATGCAATAGGTATTAAGGGTTCCAAGGTCAACTTCTTAAAAAGTAGGTCAAAGAATCTAAGCATGTTGGAGTATGTTAACCGTGTTGTCACTAGTGCAGATAAGTACAGATACGGTAGTGACTTTACCACACTCAGCTCAAAGCAAATCGACAACCTCTGCTCAAAAAAAAGCCTGAGTGAGTGTGGTACATTAAAAGAACTGGTGCCTCTGGTGAAAATGAGCAAAAAAAGAAACTTCTTTTTACATGATGAGCTTCACTACTGGAGCCCACAAGACTTAATGCTCTTTTTGGATTCAGTCAATCCTGATCATTTGGTCGCAACTGTGGTCTTTCCCCCCGAAATACTAGCTGGAGCTAAGGAGAGTCTTAATCCATGGTGTTACTCATTTCACCGGCAAGGCAGCAAATTGACATTTTTCCCAGACGGGGTTCAAAGCGAGTCATACACACAACCCCTCAGCTCTGGTTACATCTTGAAGGCATCAAAAATTGTGTGTCCGAGTGGTCAAATATACTCTGTGGATCTTGTGTACTCGGTCTTTGCGCACCATGTTGTAAGCATAACAAAGGGAAATCTACCAGGGCTTGAAAGGCGGTTCTTTTCAAACTTTGAGGCAACCGGGGTGAGACACCTATCTGGCCTCTCCTATTCCGTGAGGGACTGCATTCCAGTTAGCACTGATTTAATATCCAAGATCTACAGGTATATCAGGACCCTCAAGAAGCCTGACCTACAGTCCTGCATGGCCAAGCTCAGCCAAATAGTTCCCAATCCAACTGGTGTTGAAATCAAATTCACAGAGGATTTTTCACGACTAGTCATGGAAATTCAGCCTCTGAAGTCCCTTCTCATGCCAGACACCGCTAAACTAATTGGGGCTCTGTTTGCTTCCTTTTTGCCCTTCAAAATGGCAAGGTTCTTTGATTGCTACAAGTCAAGCTCATTAGACAAATTCATTCACGACTTGGAACCATTCAGCTTTTCTGTGCCCACTGAAGTTATTGACTGCAATACCATGCCCGCTTTTGAAGCAATTTCTTTGGGTGAGTCAATGAGTCCAGAGGAGGTCATCCAAATATTGAACCGAATGGAAATGGGGGCTTTCGCTGGGTCATGCAACTTGGTAGGAAAGTTTAAATACTCAAATGAGGCCTATCACTGTCTCCACCACGTTCTTGATGGCTGCAAGCCTGAAGTCTTCAAGAGGTTGGTTAGAAGAGTGGCAAGTTCCTTCTGTAATGAATTTGGTGTTTACCGAAAAAGCAGTTATGTGGCATCCGTTGCAATCAATGTTTTCCAGAGGAGATCAAACCTAAATCTCGATTTTATCTTGGGGTCTGATCTGAATCAAAAGGTTGTTTGTATTGTCCGCAATTTCTTTTCTTCAAAGAAATCTTCTCAGCTCATTTGGTATTCCATAAATTCTATGGCTTGGTTCCGCTTTTCAAAGTTGAGAGCTAATCAAAAATTTCTAAGATCACCAATTTTTCCTGCCTCCATGAACTGCAAAGACCTTTCAATTAGGAAAAATTTGATGCTTAACTTTGAGGTTTTTGGTTTCTGTGCGGGCTTGAGAAAGCTTGGGTCTTCAGGAATTTCTTCAGTGGTGCCCCCTAAGCCTGTCCTTGGTGGCTTTGAGTTCGTACCTCCTGGGGAGGAGGCCCACGAGGATGATATTGAGGTAGAGTTAGATGTTGTGGCAAAAATGTCTGATTCAGCGCCACAGGTGGTTCTTGGAATTGAAGGCCCAGCTATTTTAATGCAGGAGACTGACCCACAAGATCAAACTTTCTCTCCTAAAGCTACTAACCTTGAGGAACGAACTGGTCTTATTTTTGGATGCATTCCTGAACCAAGCTTAGGGAATTTTTCATTCAGTTCAGCTAATCAGGGTGATCGCCTCTTCGCCAACATTGTAAACGAAAACATAATAGATGTTGGAATTCTTCCTCCCACCGAATTGAAAATCCCATTGGATGCTAAGGTTACACAAATCAATGGTCGGGATTGCTTCTTCTTCACAAGGTGCTCATGTATTGACTATGGTCACAATAAGATCAAATACACTGCTAATAATTGGTTTTCAGGCCTTGATCAATTTCTATCCAATGAGGGGACATACTACAATGCATGCCTCCTGCAGGTTTACAGGGCTGGTAGTGGAATTGGTTTTCACTCTGACAATGAAAAGGTCTACCATAGAAGTCCTATCAAAACTGTTAATTTGTGTGGAGAGGCAGACTTCCTTGTTAAAGCTAAGGGTAGGAGGGACTTGGGGACCGTTGCAAGAGGACATCTCTTCCCAGGACATTACTTCACAATGGATTCAAATTTCCAGTCTTACTACCAACATTCGGTCCAAGATTGTAGTGAGGGGAGGGTCTCCTTAACTTTTCGCCATCATGTCAATAACGTCACAGGGTTGCCAATCAAACACACTTGTGGAGAGTTTGGTGATACTGAGATTTTGTTTGATGTGCTCATAAGAAGGAGTTTCACCTATGCGGCAAAAAACTTTCACACCTTTCCGGTTCCTGGGGATGGTAGTTGCTTTTGGCATAGTATGGGGGCTTTGTTGGGAGTTGATGGTGAGGAATTAAAGAAGATATCAGCGAGAGAGATCCAGAAGAACGAAGTTCTGCTGTCCAATCTGAGCCTACGTCAGCAGATGGCCAATAAACAGTATGCTGAAAGAGAGTCAATTGCGGCCTTTTGCAGGATTCAATCAATCCATTTGGTTGTCCTGCTTCCAGGCAATAATTTCTCTTACGAGTTTCTTCCGTCACAAAACCCTGAAGTCACCCAACTGTTTGTCAAACTAACGGATGAGCACTTTGAACCTGCTTTGCCAGTGAATGGATGCGTTGTCAAGTCAATTGCTGAAACCCTGAATCAAACTGAAGCAAAGATCTTGTCAGTGATTGGGAGACCTACAAATAGAATGATTCTCGACAACTTGGTCGAGGGAGAGGGACTCAACCTTGAAGACCTTGAAGCAGCATTCACAATCTTTGGAATATGCGCTAGAGTCAGCTCAGAACATGGGGTCTTTACCCTAAATAGGGATGGTAATCTGCATGCGAACTATGAACTGAAATCTGGTCATATAATGTACTTAAGAAAAGTCCCTAGCTCACAGTTTGCCCCCTCCACACCAATCCAAAATTTTAATGGACAGGGGCCTGAGCTGTTCCTGAAGGGAATTGTCAGTGAGGTAAAATATAAGCCAGATTGGGAAAGGGCCAGGAATTTAGAGGAATCATTCCTTAATGGCACAACAGGGGTCTTATGTGACCGCACCGTCAATCTCCAAAAAATTAGGTTGACTGAGGAAAGAAGGCTGGTGAAGGATGAGCGGAATCTAGGTGTTGTTCTTGGAACCTTTGGATCTGGTAAGAGCACTTTATTCAAGCGGTTTATCGTGAAAAATCCCTCAAGGTCAATTGTCTTTGTTTCTCCAAGGAGGTCATTAGCTGACCAGATTAAGGAGGATTTGGGCCTCAATTCAAAGAGGGGGAGATCCCTGAGAGTCAGGGTCTTAACTTTGGAGAGCTTCATCAAAGCCGTTTTTACTTTCAAGGCAGCAAGTGTGGTTCTCGATGAGGTGCAACTGTACCCCCCTGGGTACCTTGATTTAATGATGCTATGCCTTAGTGGAAACTGTCAGATTTACCTCTCAGGAGATCCGTGCCAGAGCGACTACGATTCAGCCAAGGACAGAGCACTCTTTGATGGGATGAAGGGGGACATCTTCGAGGTGCTTGAAGGAAAAAGCTACAAATTTAACGCAGCCAGCAGGAGGTTCCAGTCTCAGATGTTTGTGGGCAGGCTTCCCTGTCGTCTGGATTCAAAAGACATGGTTGGGGACGAGGACTTTCACTGGCTTGAGAGCATTGAGGCTGCAGCTGAGGTCAGCAACACCGAATACGACGTTGTTTTGGTCTCAAGCTTCGAAGAAAAGAAGATCATTTGGGCACATCTCGGGAGAGACGTTGAGGTTCTTACTTTTGGAGAATCAACAGGCTTGACATTCAACCGGGGCATCATTCTCATATCTCACGAAAGCACGCTCACTGGTGAAAGGAGATGGATCACAGCACTATCAAGGTTTAGACTAAATATCATCTTTGTCAATTTGGTTGGCAATAATATTGAGGATGTGTGCCAAGTTTTCCATGACCGAACACTATTCAAATTTCTCAACCGCACCGCAACAGTTGGAGACATTGTCAAACAGCTCCCTGGCCACCCAGAGCTAACAAATGATTTTGGTGATAAGGTTGGGAAGTCTGAAGGAGTCATGGAAGACAAGCTTGCTGGTGACCCGTGGTTAAAGGCCGAGATCGACCTTCTACAGGATGAGGATCAGGAAATGGTTGAGTTGGCTGAGGAGGTTAAAAATGAGCCATGGTTTAAGACCCACCTCCCCCTGTTTGAGCTGGAATCTATAAGGGCAAATTGGGTGCACAGAATAATGAACAGGGAATATCGTGAAGTACGTTGCGGAACGGAAATGTCGACCCAGTTTCCTGAGGACCATCCCAGCAAGTATAAAGTGACTCTAGCCAATGCGGCCGAGCGTTTCGAAGCAATTTATCCAAGACATAGGGGAAGCGATTCTGTAACCTTCCTAATGGCTGTCAAAAAAAGGCTTAGCTTTTCAAGACCTTCTGTTGAGTCAGCTAAGCTAAACAGGGCAAAACCGTATGGAAAATTCCTCCTGCATGAGTTTCTTAAGAGGATCCCCCTAAAAACTGGTTTGGATTCAGCCCTTTTCGCTAGATCGAAGAGGGAGTTTGAAGAGAAGAAAACTAGCAAAAGCGCCGCTGTCATCGAGAACCATTCTGGAAGGTCATGTCGCGACTGGCTAGCTGATGTCGGGTTCATTTTCATGAAAAGTCAGTTTTGCTCTAAGTGGGACAACAGGTTCAGGGACGCCAAAGCTGGACAAACTTTAGCCTGCTTTCATCATTCAATTTTGTGCCGCTTTGCACCCTATATGAGATACATTGAACACAAGCTTCAGGAGGTCCTGCCAGCCAACTTGTATATCCATTCTGGGAAGAACTTGGAAGATCTCAATCGTTGGGTGATTGAGAACAGCTTCACTGGCATGTGCACTGAATCAGACTACGAAGCCTTCGATTCAAGCCAGGATCATTACATTCTGAGTTTTGAGATTGAAGTCATGAAGCATCTTCAGTTACCTTGGGACCTAATTGAAGATTATGTGTACATCAAAACCCACCTTGGTTCTAAGCTTGGAAATTTTTCAATCATGAGATTCACTGGTGAGGCAAGCACATTCTTATTCAACACGATGGCAAACATGTTGTTCACTTTCCTGAGGTACGAACTCAATGGCTCAGAGGCCATATGCTTCGCTGGTGATGACATGTGCTCAAACCGGAGACTGAGGGTGTCAAATAAACATGAGAGGTTCCTGAGCAAACTGAGGCTGAAGGCCAAAGTCCAATTTACAGTTAAGCCAACATTTTGTGGATGGAATCTGTGCCTCGATGGAATTTTCAAACGTCCTCAGCTGGTGCTGGAGAGGCTCTGTGTTGCAAGAGAGAAAGATAACCTGGCCAACTGTCTTGATTCCTATGCTATAGAGGTTGGTTATGCTTTCGCTTTAGGTGAAAAAGTTTTGCAGTATATGGATGAGGAGGCCATGCAAAACCATTACAATTGTGTTAGATTCATCGTCAAACATTCACATCTCCTCAAATCGAGCGTTCGTGATCTCTTCTTACAGAATATGTAGATTAGGTTTAACATTGTGTTGTGTGAATAAGTATTCTTGTGTTTGGTAATGGATTTTGTTTATGATAAATTAATAGACGCTGGGTACATTAGAACTAGACTGCCAATTAGTTTTCCCATTATTGTTCACTGCATTGCCGGAGCTGGAAAAAGCACCTTAATCAGGGAAGTCATTGAAGTTGACCACAGGTTTGAGGCCTTCACTTACGGTGTCCCGGACCCAATTAATCTTTCTGGAGTGAGAATTAAGAGCAGCCTTGACATACCTTCAGCACGTGCTGACTCACTCAAAATCATCGACGAATACATAGGTCAAAATCTGCCTGAAGGGACAACTTTTTGCTTCGCAGATCCAAACCAATTTCCCTACACCTGTCCAGACGCACATTTCACATGCTACCAGACTAAGAGGTTTGGTGATCAAACTTGTTCATTGTTGGGAAAGATTGACTGTGCTGCATTCTCTTACAAACAAGATCAGATAATCTTTGACAAATTGTTTGCTGGTGATATTGAAGGTCAGATTGTTTGCTACGAAAAGGAAATTTTTGATCTCCTTGACCGTCACGGAGCGGATTATAAGAAATATTGCCAAATCCGGGGATCAACATTTGATATCGTAACCTTCATAACTGCATCAGACACTTTTGAACCTGAGGATCGGTACAAAGTCTATCTTTGTCTAACTAGACACCGTTCGATCCTACGTATTCTGAGTCCTGAGGGGAAGTTCTTAAGGGAGGATGCCAAGTTTGACACCACCACCTGACAACACAAGGGTTTTGTTACCAATCGCCATTGGCCTCGGGGTGGGGGTTGTTATCTGGTGTTTAACAAGGTCTACATTGCCTCAAGTTGGAGACAACATCCACAGTTTGCCACACGGTGGGAATTATTTGGACGGGACAAAGAGGATTAGCTACTGTGGACCAAAGGACAGTTTCCCAAGCAGCAATCTATTCAAAGGAGGTGCTTTTTCAGCAATTTGTGTCGTAGTATTGTTAGTTTTTGCTATTCATGTTTCAGAGTTGTTTAATCGGCCTAATCGCCGCCCTTGCGGCTGTGGTTCTGCTTCACATGCTTAACTCTGGGCAGGAAGGTTGTTTAATAATTATTAGCGGAGAGTCTGTAGTCATTAAGAATTGTGTGTATACTAGTGAGTTCATTAATCTGGTTAAGGGCCTCAAGCCCCACAACCATTGGAATTCACTGTAGTTAGGTCCAGTGTGTGTAGATTGAAATAATAGATTACCTTGAGTTTTTGATTAAGATGACTACTTCTCAACCCACAGCAACTACTGATGTCGAGACTTCCGAAGTCAAGACCACTCCACCTCCGGTTGTCACCAGTGAACCTGTTTTACAGCAGGTGGTCTTTTCTGACACTTCAAAATCAGCTACTGCGCCACCGCCACCTGTCACTACTCAGACGTCAACTACTACGACGAAAGGCGTTGAGAGGTCATGGTTTGGGCTCCCATCAAAGACGACGGGTTTGGGTACATTAAGTGCTACTGCGACATACACTGCACCCTTGTTGCAAGCTTCAGGGCGAGCCTCACAGCTTGATGAGGACCTTAAAAAGCTTAAGGCAAAGGATGAGGGCTTCCTTGTACTAAATAGTGATATTGAGGATCTTGGGGCAACGACAAGTGGAAAAGTACAGGGGCCAAGGGGGATTGTGCCAAGCATGATGTCTTATGAGAAACCCGAAAAAGGCAAAGTTGTTGAGGAGCCCAAGGGGTTGAGCTTAGGCTCAAGGCAGAGATTGGTTTTTGAAAAGGCTAGGCAGAGGGCAAAGGTGGACATTGAAGCTGACCGTGACAGTTTGGCGCCACCATTTGCTTCAGCAGACCCCTTCTCCCGACCAAAAGTTCAGGATGTCCAAAGGTTCTCATATGAACCCAGCTCACCTGACATTTCAACAGCTGAGGAGATTGAGCATATCAGAAGCGATTTGATTAGGGCAGGTGTGCCTGAGCCCACACTCACCTTTTCAATGTGGGACATAGCTAGATACTGCGCTGATGCTGGCTCCTCAGCCTCGACTGAGTTCATAGGGACAAGCAGTTACAGCGGCCGCGTGACCAGAATGGAGATAGCCTCGGTGATCAAGAAGCATACAACCCTGAGGCGATACTGTGGCTTTTATGCAAAGATTGTTTGGAACATAATGCTGTCAACCAACATACCACCCTCTGGGTGGGTGAAGAAAGGTTACAAGAAGAGCACAAGGTTCTCTGCATTTGATTTCTTTGAGCAAGTCTCAAACAATGCTGCGCTGGAGCCAGAAAATGGGCTAGTTCGTGAGCCCAACCACGAGGAGTTGGTTGCATCCCAAGTGAATAAGGGGGTTTCATTGCACAGAACTGAAGCTGCACAGGATAAGAATGTGTCAACTGCACACGAGGTAACGGGTGGGAGAGCTGGACCCCGGTCAAGACTGTTGTTGAAGGGGAAAGAGATGGATTGAGTGGTTATGGCCTAGAACCGTGGAAAGGCCTAAAAGAGTCCACGTGCCGTCTTAGAGTTGTAGTGTGTGCATTAGTAAATATTAGTAGTTTCCACTTCCCAAGGTTCCAGGTCTCGAACCCAGGAAAGACCTTAAAGAGTCCTGGTTGGCGTTTAGCCATAGAAAACCTCTGCACCACATAGGCCACACCAAAGTTTATCATTGTGTGCCTTATGCGGGCAAGTTAACCGAGTTGTGGCGGCAACCGGAAAAAGTCAGATACAAGCGTAGATTTATGAGCTACGTCCTGTGGTTGGATTTCCACCGTTATCTCGTCGTTAAGGGAGCAACCCCTTTTCTCTCGCTTATAGGGGTATTGTTAAGCGGGCGTGTGGCCCATTGAGAGATGGGTTCCCTACGTTAAGGGTAGTTGAAGTTTAGAACAAACTCCCATGGTTCCGACCTGCCATGATTAAAGCGATCGGTAGTTCTGGGTAAGAAACAACCCTGTGCTTGGTGGCTAAGCATGACCACTCAGTTTGACCGACTGGCTAGACAGGTTACGTTTCCTACTTCGATATCAAAAGTGGGCGCATACCAAAGCGTTAAATTGCTCGAACGTGTGTCTCAAACTCTCAGTTTTGGGGGTTTAAGACAGGCTTTAGTCCTGGTGATCTGACTTTAAAAGAGCCAAATAAACCGCATTTCAACGCGTTATAGTGTTCGCTGACAGACCGTACAAATAGTCTGTTTCACCAACCTAAGACCTAAATAATTGAATAAGGGGAGGTGATTAAACAAATTTG
| 84,423
|
NC_025821.1
|
Asparagus virus 1
|
Blockus,S., Lesker,T., Maiss,E.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2014-12-09
|
DSMZ PV-0954
|
Asparagus virus 1
|
Potyvirus
|
Potyviridae
|
ssRNA(+)
| 9,741
|
RefSeq
| 1
| null | null | null | null | null | null |
PRJNA485481
|
Asparagus virus 1 isolate DSMZ PV-0954, complete genome
|
AAATTATCAAAACTCAACACAACACAACACAACACAGCACAACACAACTCAACTCAACAACTGAATTCTTAGACTACCATATCTGAATTCAAAACAACCGATCACACAAACCAAACACGCTTTATAATTTGTAATCGACATGGACTGCATACAGATTGGAAGCATGATCATTTCCATCCCAACCGCGCAGGCATCCACATTAGCCTGCACCGCTGTCAAACCCACATCCACCAAGCCGACACAAGCCGATCTTAAAATGGTTGGCTTTCATCCAAAGGAACCAACTCGCGTAGCATCTGTTACGCCAGTACTAGTGAAGAAAGCCTTATTCAAAAAGGCTGAAGTGGAGAAGAGCGCCCTCGACAAGTGGGCAGAAGCCTATGAAAATGCCAATCATAGGAAGGATGACAAGATAGTCACTACCAGGCGTGGAGTGACAAGGTTTGTTCGCAAGAACCGAAAGGACTTGCGCCGCGAGAGAGATGAGCTGGCTGCAACAGCTCGTGAAAAGTTGGCACAGGAAATTCGCCACCTCAAAATTAGGCGAAACGAAAACCAATTGAAAAATAGTCACGTAAGTATTATTTCAAAAATTTCAATTGGTGGAGCTCCCAGATCTGCATCTGAGGAGGAGATCACACCAGTACAGAAGTGGGGTCTCAACAAAACAGCAAGTTCCAAAACTTGCAAGAAACAAACCCATTTGACTGTTTCAAATGGGGAATTCAAGAAACTGCTCCGCTCATTAGCCCAAATAATGCGCGAAAAAGCATCCACAATAGAAATTGTGGAAAAGACAACGCTACGAGCACGTAGCAAAGAGTTTAAGGGACGTCAAAGAATGTTTGTTGACGTACTACATCAAACTGGCATATATCGGTCATTTGATGTAAAGATGGGCTCCTGGACTGAGAGTGTATTTGGATACATGTTTAAGTATTTTGAGAAAGGGCCCATAATACATCACACAAAAATTCAGCCAGGTTGTAGTGGACTCGTCGTACGGAGAAGTTCATTGAAGGACTGCATTTCAGGAAATCACACGGAATTTTTCATTGTGCGTGGTCGAATCAGAAACATTCTCTGCGACGCACGTGCATTTATACCATATGAGTCACTATTTGATGTGCATCACTACTCAAGTCTTGGAGAAAAATTTTGGAAAGGTTTCACCAACGTCTTTCTAGAATTGAAACCAACACAGATTAGCCATGACTGCACATCAGACCTTGATGTTGTTAGATGTGGGGAGGTCTCCGCACTGGTTTGTCAAACAGTGTTTCCTTGTGGAAAAATAACTTGTAACAAATGCGTGGAAAGTTACACGCTCTTGGATGAGGAAAGCAAGAAGGCACAAATTCAACAGTCTTTGGAGCGAATCGAGAAAGACTTGACTCACAAGTACACTGATTTCCCTCACGTTCACGAGATTCTGAAGGTGTTTGGAAATTCCTTGTTAATTCCTAACAAGAATTACAAGGCATTTGCTGACATTAAACACATGATCGGGGATCGAACTGAAGCACCTTTTAGTCATGTCAATAAATTGAACGAAATTATAATAAAAGGTAGCATGTCAACAACTGCTGACTATTTTGATGCTTCCAACACTTTGTTGGAGGTAGCAAGATATCTCAAGAATCGGACAGAGAACATACAGAAAGGCTCACTTGCAGCTTTTAGAAATAGAGCTTCTGCGAAAGCACATATCAACACAATCTTGCTGTGTGATAACCAACTTGACAAGAATGGAAATTTCGTTTGGGGAAAAAGAGGCTATCATGCAAAGAGATTCTTTAAGAATTACTTTGAACTTGTTGATCCATCAAATGGATATGCAAAACACATCGTCAGAAATGGACCAAATGGAGAAAGACAACTAGCAATTGGTCATTTGGTTATGTCGACGAATTTCCAAACCTTGAGGCTGCAACTCGAGGGAAACCAAGTTGAAAAATTCCCAGTAACCAAAGCTTGCATCAGTAAACGAAATGAAAATTTCATATATCCATGCTGCTGCGTCACAACCGAAACTGGAGAACCATTGGAGTCACCATTATACACTCCAACAAAAGGTCATCTTGTAATTGGCAACACTGGTGATGCTAAGTATATAGACTTACCTGAGCAGGAGAATGAACGATTGTACATATCACAAGAAGGGTATTGTTATGTAAATGTATTCTTAGCAATGTTGGTGAACGTCAACGAGGATGATGCCAAGAATTTCACAAAGATTGTACGTGACGATGTGGTCAGGAAGCTTGGGAAGTGGCCGACACTGATAGATTTAGCAACTGCTTGCTATTATCTCACAATGTTTTTCCCAGAAACACGAAATGCAGAATTACCTAGAATTCTGGTTGATCATAAACACAACACGATGCATGTCATTGATGCATATGGTTCAAAGAACACAGGATATCACATTTTGAAGGCAGGAACTATTGCACAATTGATCTTATTCGCTAGTGAGTCACTTGATTCTGAGATCAAGGAATATCGCGTTGGAGGCTTGATAGAGGACACAGCTGTTGTACAAACGGGTATCAAAACATTGATTCGATCTATTTACAGACCCAAAATGTTCAAAGAACTCTTGTTGACAGAACCATATTTGATAACTCTGAGTGTTTTATCACCAGGAGTTCTTTTGGCAATGTACAACAATGGATCTTTTGAACAAGCCACTCAAAAATTCATAACACACAATGATTCACTTGCAACCATTTCCACTACTCTGGCATTACTCGCAACGAAAGTCTCTCTCGCACAAACCCTCAATGAGCAATGTAACATAATTGATGCACATGCACAATTATTGTTGCAAGCGATTGGTGAGGGACAAAGTGAGATTAGTCACACAAAACGACTGGCAAAAGAAGCTCTTCAAGTGATGATTGCACAAAATGAGAATGACTCTTCACTCTTGGATGGAGGTTACTTTGTTTTACGCGAATCTTCTAAGGGTTTTACTGAGAAAAAATATCTGCGCCTTTTGGAGGAATCATGGGAAGATCTAAACTTGTTGGAAAAATATTATGCAGTAAGAGCATCATATTCTTGGCGACGCGTTATTCAGCGACCTTTAAACCCCACAAAAGGTGCAGATTTGAAAGGCAGATACGATATATCCATCAATGCATTACTCAAGAAAGCATCTGAAGCCATGAACGTAATTGTCAGGAAGAATTTGGCAAAAGGTGAACTTGTATATAAAAATGTGACAAGGAAAGGTTTAGAGTTATCTTATTCTGCATGTAGATATTTAATACCAGATTTCATGCGTGCTGTTAGTGTTTTAACTGTTTTAAGTTTGTTTGTTTCTTTAATAGCAGCTTTAAATAACATGTTGGTTGCTCATAAACATCTTAAAATGAAAAATTTCGAATTTGAACAACAAATGACTGATAGGACTTTATATAAGTTGTACAAAAGCTTGAAGCGAAACATGAAAGGTAACCCTAGCCTGGAAGAATTCAGAGATTTTGTGGGAGAGAGAAACCCTGAACTGGTTAAGAAAATTGATCCGGATGAGTTTGATCTTGAAGGGGTACAACATCAGCACAAGAGTAAGTCACAAGATACTCTTCAGAAAATCGTCGCTTTTGTAGCATTAATAATGATGACATTTGACGCTGACCGAAGCGATTGTGTGTACAAAATTTTAAACAAGCTGAAGGGGATAATTGGAACAATCGAGTATGAAGTGCAACATCAGGCGATTGATGACATCAAACTTGGTTTGGAGGAGGAGAATACAAAGATTGATTTTGAAGTGTCAACAGATCCACAGCTAGACAAGACATTCAGCGAACCAACTTTTTCTGACTGGTGGAGCAATCAACTAACAAATAATAACGTGATTCCACACTACCGAACTGAAGGATTTTTTATGGAATTCACTCGACAATCCGCCATTGAAGTTTCAAATCAGATTGCACATGGCCCACACATGGATATTTTATTACGAGGTGCAGTAGGATCTGGTAAGTCAACAGGATTACCATATCATCTTTCAAAACGTGGTCAAGTACTGCTACTTGAACCAACAAGACCATTGGCAGAAAACGTCTGTACACAATTGCGCGGAGACCCTTTTCACACAAATCCAACATTGCGTATGCGTGGCATGACTTCGTTTGGATCAGCACCAATCACAGTCATGACAAGCGGTTATGCTCTACATTATTTAGCCAACAACCCACATCTTTTGCGCGACTATAACTACATCATATTCGATGAATGTCATGTTAGTGATAGTTCAGCAATGGCTTTTAGGTGTTTGCTACATGAATATAGTTTCAACGGGAAGATAATCAAAGTTTCAGCAACACCACAAGGTAGAGAGGTTGAATTCAAGACACAATTTCCAGTAACTCTTATTACCGAGGAGCATCTCTCTTTCAGTCAGTTTTGTGAAGCCCAGAGAACGAACGCAAAGTGCGATGTTGCGACAAGTGGAGAGAATATCTTGGTCTATGTTGCGAGTTATAACGAAGTGGATCAACTCAGTAGGATGCTTGTCGAAAGGAAGTTTAAGGTGACAAAGGTGGACGGTCGAACAATGAAAGTTGGAAAAGTTGCCATTGAAACACACGGAAGTGTCGGAGCACCTCATTTTATTGTGGCGACCAACATCATTGAGAATGGAGTAACTTTGGATGTGGACACAGTTGTTGATTTTGGGCAGAAAATTTCACCTACACTGGACGTCGACAATCGTTGTATACACTATTCGAAACAATGTGTCACATACGGAGAGCGAATTCAGAGACTTGGAAGAGTTGGACGTCATAAGCAAGGAAAAGCTTTGAGAATAGGTTTCACTGAGAAAGGACAGGTAGCAATACCTGACATTGTAGCCACAGAAGCAGCTTTTCTCTGCTTCACATATGGGTTGCCTGTCATGACACACAATGTTTCAGTTAGTTTACTGTCTAAATGCACGGTTAAACAAGCAAGAACAATGCATTTATTCGAACTACCTGCATTTTATACAGTCAACCTTGTTAGATACGATGGTTCAATGCACAAAGCAATACATGATTTATTGAAACCATATCGTCTGCGAGACTCTGAGATCATACTGAACAAAATGGCAATTCCAACACATGGCTTGACAACTTGGATGAAAGCAATTGATTACAACAAAATTGGGAAGAAGCTTGAACTAGAAGCAGAAACACGTATACCATTCTATGCACGCGACATTCCAGAAATGCTTCACAGGCGAGTGTATGAAGCAATGCTCAGATTCAAAGGTGATGCGGGTTTCGGAAGAATCTCAACAGCAAGTGCTTGCAAAATCGCGTACACATTGCAAACTGATTTGCAATCCATTCCACGAACAGTGAAACTCATTGATATGTTGATTGAAAAGGAGCAGCAAAAACACGCACATTATCAGCTAGCTATTTCAACATCATGTTCATCTTTCAGTTATTCATTATCCACTCTCAGTGACATTGTTAGAAGAACATATCAGAAGGATCATTCTCTCGAAAACATCAGTATCCTTCAAGCAGCAAAAGCACAAATTCTGTCTTTCAATACGATATCAGAAGATTTTTCTTACGCTGAGCAAAGTACTTCCTATCTTTGTGAATCTGTATTGGAGCACACAGCAACGGAGTGCATTTATCATCAATCTGAAGGCGAGCTTGCAAAACATCTGAAGCTCAAGGGATACTGGAATAAGAGTCTTATAACACGTGATATTATTATCATGCTTGGTGTTATTGGTGGGGGTTGTTGGATGGCTTACTCTTATTTCACAGAAAAATTCTCAGAAGAAGTCTCGCATGAAGGGTGGAACCGTAGACAAAAGCAAAAGTTGAAGTTTAGAAATGCGAGAGATGAGAAGCTAGGGAGAGAGGTTTATGGTGATGATGGAACTCTTGAACATTTCTTTGGTGAAGCATATACGAAGAAAGGCAAAACAAAAGGCAAGACGAGAGGAGCTGGGACAAAAACAAGGCGATTTATCAACATGTATGGATATGACCCAGCTGATTATTCGTTTGTTCGATTTGTTGATCCTTTGACAGGGCGGACACTTGATGACTCACCATACACAGATATTGGATTGATACAAGATCATTTTGCTGATGTACGAGATGAGATGATCGCCAACGGTGAACTTGATAGGCAGCGATTGCATCTCGGAAACGCCAACAGGATTGAGGCATATTTCATAAACAATGCGACAAAGAAAGCACTGCAAGTTGACATGACACCACACAATCCACTCTTATTCTGTAAGAGTGGCACAGCCATTGCAGGTTTTCCAGAGCGAGAAGGAGAGTTTCGTCAAACAGGAGCAGCAACGCCAATTGACATTGAGAAAGTACCAAAACAGTGTGAAGCATCTGTTGTCACACATGAAGGAAAAGCACTTTTTGGGGGTCTGCGTGATTATAATGGAATCGCAAGTGTTATCTGTCAACTGAGCAACGAATCGGATGGACATGTCGAAACAATGTTTGGAATTGGATATGGTCCCTTCATCGTCACAAATCAGCACCTTTTCAAAAGGAACAATGGAAAACTCACGATAAGGTCACGATCTGGTAAGTTCATCATTGAAGATACAACTGTCATTGATATGTTCCCTTGTAAGAGTTTTGACATATTAATAATGAGACTGCCCAAAGATTTTCCACCATTTCCACAACGTTTAAACTTCAGACAACCTCAAAGTGGCGAGCAAATCTGCATGGTTGGTTCAAATTTTCAAGAGAAGAGCATCACAAGTGTTATTTCTGCAACAAGTGAGACTGTCCCATTTCCCAATAGCCACTTTTGGAAGCACTGGATTACAACCAAGAATGGATATTGTGGTCTCCCGCTTGTCGCAGTGAAAGATGGAAACATTGTTGGATTGCATAGCCTAGCAAATTTCGCACAGACACAGAATTACTTTGCGAATTTTCCAGAGAACTTTCAGGATTCTATTCTTAACTCAACCGAGTCACTCAATTGGGTTCAGAGGTGGAAATACAATTCAAGAGAGATTTGCTGGGGAAAGCTCAAGATGCATGAGAGTGTGCCAGATGGACTATTCAAGATTCACAAACTCATAAGCGACCTCAGTAATGCGGATGTTTTCCAACAATCACAACAGCGAAAGTGGATGTATGAAGCGTTGAAGGACAACTTACAAGCAATTGCTCAAACACCCAATCAATTGGTCACGAAACATTCTGTTAAGGGCAAGTGTAGATTGTTCGACTTATACCTGCGTCAAAATGAGGAAGCCAACACATACTTCCAACCTTTGATGGGTGCGTATCAGAAGAGTGTTTTGAGTCGAGAAGCATACATCAAGGACATAATGAAGTACTCAACACCGATCATAATTGGCAAAGTCGACTGTGATGCGTTTGAAACTGTTGTTGATTTCTTCATCATTCAACTCAGAGAGTTTGGGATCGAAACTTGCAATTATATCACATGCCATGAAGACATCTTCAATTCATTGAACATGAAGGCTGCGGTTGGTGCACTCTACACTGGAAAGAAACGAGATTATTTTAAGGAATTCACAGAGGGTGACAAGGAGGAGATCTTAAAGCAAAGTTGCTTTAGATTATTCTCAGGAAAGTTTGGTGTTTGGAATGGCTCCTTGAAATCTGAGCTGCGGGCCAGAGAGAAAGTCGAAGAAGGAAAAACTAGAACCTTCACAGCAGCACCACTTGATTCACTACTCGGAGCAAAGTCATGTGTGGATGATTTCAACAATCAATTTTATGACTTAAACTTGAAGGCTCCTTGGAGTGTTGGAATGACGAAGTTTTACTGTGGATGGGACAATTTGTTGAGTGGATTCCCTGAGGGTTGGATCTATTGTGACGCGGACGGTTCTCGATTCGATAGCTCACTTTCTCCATACTTGATAAACTCAGTTTTACAAATTCGGTTGTCTTTTATGGAAGAGTGGGAGATTGGTGCTCAAATGCTCAAGAACTTGTATACGGAAATCGTCTATACACCAATTGCTACTCCAGACGGGACGATAGTGAAGAAGTTCAAAGGAAACAACAGCGGCCAACCATCAACTGTTGTGGATAACACTCTAATGGTTATTGTATCTATGAAATATAGTTTGTTTAAATTAGGAATAAAGTTAGAAAACCAGGATTCTATATGTAAGTATTATGTTAATGGTGATGATTTAATTATAGCTATTAGACCGGATCACGAGTACATCCTTGATGGACTTCAGGAAATCTTCTACACACTAGGTCTGAATTATGAATTCAATTCAAGAACTAAGAATAAAGCAGACTTGTGGTTCATGTCGCATCAAGGAGTGATGCGAGAGGGAAAATTCATACCAAAGCTTGAGAAGGAAAGAATTGTTTCAATTCTGGAATGGGATCGTTCAGACGAACCTGTTCACAGGTTGGAGGCTATTTGTGCTGCGATGATCGAAGCATGGGGTTATGATGAGTTAGTCCACGAAATCCGAAAGTTTTACTTGTGGGTACTCGATCAAGCTCCATACAATGCACTGGCATTAGAAGGCAAGGCACCATACATCGCAGAGACCGCTCTGAGGAAATTATATCTTAACGAGGAACCAAGTGAATTAGAGCTGGGAGCATACCAAAAAGCCTTCGAAGAGGAAGATGAGGAGAGCGAGGCAATTTTTGAGGTTTCACATCAAGCCAATGACACGGTCGACGCTGGAGCTTCTGGATCAGGAAGTCAACAAGGTCAAACAAAGGAAAAACAGCCTCGAGAGAGTAGGCCAGCACTTGACAAGGATGTTGATGTTGGGACTGTTGGTACTTTTTCTGTGCCACGAATGAAAGTCGTGAGTGACAAAATGAAATTACCAAAAGTTGATGGAAAGGTTGTTTTGAGCGCTGAGCATTTGTTACAGTACAAACCACCACAGCTCGAACTTTCGAACACACGTGCCACTCACAGCCAATTCAAATCATGGTATGAAGAAGTCAAAGGAGCGTACGGAATGGATGATGCCAACATGCAAATTATATTGAATGGTCTGATGGTGTGGTGTATTGAGAATGGAACATCACCAAACATAAATGGAAACTGGGTTATGATGGATGGAGAGGCACAAGTTGAATATCCTTTAAAACCAATCATAGAAAATGCCAAACCCACGTTTCGCCAAATAATGGCCCATTTCAGTGACGTAGCTGAAGCGTACATTGAAATGCGTAATACAACAGAGAAGTACATGCCAAGGTATGGACGTCAGCGCAATCTCAACGACTACCAACTTGCACGTTATGCATTTGACTTTTATGAGATAACGTCGAGGACACCGAATCGTGCACGAGAAGCTCACTTTCAGATGAAAGCAGCAGCTCTACATAACACGAAGACACGAACATTCGGTTTGGATGGGAAAGTTGGAACACAGGAAGAGGACACGGAGAGGCACACAGCAGGGGATGTCAATGCTAATATGCATAGTTTGTTAGGCATGCGATCTATGTAGTTTAAGTGTGTTTCGGTAGGCTTAAGTACTATTAATATAGTAAGTCAATATTAAATATAGTGCTTTCTTTGTTTACCCGTTCGATCCTCCCTTCGGCCTATACTTTAGAGTGTCAATTTGATGAGTGTGGGCTTCCCACGAGTATCTCGCCACTCTCTATGTCTAGGAGCTAAGTTTGCATTTGCACTATGTGAGTATTCATGGTTTTAAAGCAGCCTGGTGCCACCATGAAATGTCAGTATTGTACGTGTTGAACAAGGGAC
| 6,274
|
OP150412.1
|
Asparagus virus 1
|
Knierim,D., Margaria,P., Menzel,W., Winter,S.
|
Leibniz Institute DSMZ - German Collection of Microorganisms and Cell Cultures, Plant Virus Department
|
Germany
|
2022-11-21
|
DSMZ PV-0954
|
Asparagus virus 1
|
Potyvirus
|
Potyviridae
|
ssRNA(+)
| 9,741
|
GenBank
| null |
Germany: Rastatt
|
Germany
|
Asparagus officinalis
| null | null | null | null |
Asparagus virus 1 isolate DSMZ PV-0954, complete genome
|
AAAATATAACAACTCAACACAACACAACACAACACAGCACAACACAACTCAACTCAACAACTGAATTCTTAGACTACCATATCTGAATTCAAAACAACCGATCACACAAACCAAACACGCTTTATAATTTGTAATCGACATGGACTGCATACAGATTGGAAGCATGATCATTTCCATCCCAACCGCGCAGGCATCCACATTAGCCTGCACCGCTGTCAAACCCACATCCACCAAGCCGACACAAGCCGATCTTAAAATGGTTGGCTTTCATCCAAAGGAACCAACTCGCGTAGCATCTGTTACGCCAGTACTAGTGAAGAAAGCCTTATTCAAAAAGGCTGAAGTGGAGAAGAGCGCCCTCGACAAGTGGGCAGAAGCCTATGAAAATGCCAATCATAGGAAGGATGACAAGATAGTCACTACCAGGCGTGGAGTGACAAGGTTTGTTCGCAAGAACCGAAAGGACTTGCGCCGCGAGAGAGATGAGCTGGCTGCAACAGCTCGTGAAAAGTTGGCACAGGAAATTCGCCACCTCAAAATTAGGCGAAACGAAAACCAATTGAAAAATAGTCACGTAAGTATTATTTCAAAAATTTCAATTGGTGGAGCTCCCAGATCTGCATCTGAGGAGGAGATCACACCAGTACAGAAGTGGGGTCTCAACAAAACAGCAAGTTCCAAAACTTGCAAGAAACAAACCCATTTGACTGTTTCAAATGGGGAATTCAAGAAACTGCTCCGCTCATTAGCCCAAATAATGCGCGAAAAAGCATCCACAATAGAAATTGTGGAAAAGACAACGCTACGAGCACGTAGCAAAGAGTTTAAGGGACGTCAAAGAATGTTTGTTGACGTACTACATCAAACTGGCATATATCGGTCATTTGATGTAAAGATGGGCTCCTGGACTGAGAGTGTATTTGGATACATGTTTAAGTATTTTGAGAAAGGGCCCATAATACATCACACAAAAATTCAGCCAGGTTGTAGTGGACTCGTCGTACGGAGAAGTTCATTGAAGGACTGCATTTCAGGAAATCACACGGAATTTTTCATTGTGCGTGGTCGAATCAGAAACATTCTCTGCGACGCACGTGCATTTATACCATATGAGTCACTATTTGATGTGCATCACTACTCAAGTCTTGGAGAAAAATTTTGGAAAGGTTTCACCAACGTCTTTCTAGAATTGAAACCAACACAGATTAGCCATGACTGCACATCAGACCTTGATGTTGTTAGATGTGGGGAGGTCTCCGCACTGGTTTGTCAAACAGTGTTTCCTTGTGGAAAAATAACTTGTAACAAATGCGTGGAAAGTTACACGCTCTTGGATGAGGAAAGCAAGAAGGCACAAATTCAACAGTCTTTGGAGCGAATCGAGAAAGACTTGACTCACAAGTACACTGATTTCCCTCACGTTCACGAGATTCTGAAGGTGTTTGGAAATTCCTTGTTAATTCCTAACAAGAATTACAAGGCATTTGCTGACATTAAACACATGATCGGGGATCGAACTGAAGCACCTTTTAGTCATGTCAATAAATTGAACGAAATTATAATAAAAGGTAGCATGTCAACAACTGCTGACTATTTTGATGCTTCCAACACTTTGTTGGAGGTAGCAAGATATCTCAAGAATCGGACAGAGAACATACAGAAAGGCTCACTTGCAGCTTTTAGAAATAGAGCTTCTGCGAAAGCACATATCAACACAATCTTGCTGTGTGATAACCAACTTGACAAGAATGGAAATTTCGTTTGGGGAAAAAGAGGCTATCATGCAAAGAGATTCTTTAAGAATTACTTTGAACTTGTTGATCCATCAAATGGATATGCAAAACACATCGTCAGAAATGGACCAAATGGAGAAAGACAACTAGCAATTGGTCATTTGGTTATGTCGACGAATTTCCAAACCTTGAGGCTGCAACTCGAGGGAAACCAAGTTGAAAAATTCCCAGTAACCAAAGCTTGCATCAGTAAACGAAATGAAAATTTCATATATCCATGCTGCTGTGTCACAACCGAAACTGGAGAACCATTGGAGTCACCATTATACACTCCAACAAAAGGTCATCTTGTAATTGGCAACACTGGTGATGCTAAGTATATAGACTTACCTGAGCAGGAGAATGAACGATTGTACATATCACAAGAAGGGTATTGTTATGTAAATGTATTCTTAGCAATGTTGGTGAACGTCAACGAGGATGATGCCAAGAATTTCACAAAGATTGTACGTGACGATGTGGTCAGGAAGCTTGGGAAGTGGCCGACACTGATAGATTTAGCAACTGCTTGCTATTATCTCACAATGTTTTTCCCAGAAACACGAAATGCAGAATTACCTAGAATTCTGGTTGATCATAAACACAACACGATGCATGTCATTGATGCATATGGTTCAAAGAACACAGGATATCACATTTTGAAGGCAGGAACTATTGCACAATTGATCTTATTCGCTAGTGAGTCACTTGATTCTGAGATCAAGGAATATCGCGTTGGAGGCTTGATAGAGGACACAGCTGTTGTACAAACGGGTATCAAAACATTGATTCGATCTATTTACAGACCCAAAATGTTCAAAGAACTCTTGTTGACAGAACCATATTTGATAACTCTGAGTGTTTTATCACCAGGAGTTCTTTTGGCAATGTACAACAATGGATCTTTTGAACAAGCCACTCAAAAATTCATAACACACAATGATTCACTTGCAACCATTTCCACTACTCTGGCATTACTCGCAACGAAAGTCTCTCTCGCACAAACCCTCAATGAGCAATGTAACATAATTGATGCACATGCACAATTATTGTTGCAAGCGATTGGTGAGGGACAAAGTGAGATTAGTCACACAAAACGACTGGCAAAAGAAGCTCTTCAAGTGATGATTGCACAAAATGAGAATGACTCTTCACTCTTGGATGGAGGTTACTTTGTTTTACGCGAATCTTCTAAGGGTTTTACTGAGAAAAAATATCTGCGCCTTTTGGAGGAATCATGGGAAGATCTAAACTTGTTGGAAAAATATTATGCAGTAAGAGCATCATATTCTTGGCGACGCGTTATTCAGCGACCTTTAAACCCCACAAAAGGTGCAGATTTGAAAGGCAGATACGATATATCCATCAATGCATTACTCAAGAAAGCATCTGAAGCCATGAACGTAATTGTCAGGAAGAATTTGGCAAAAGGTGAACTTGTATATAAAAATGTGACAAGGAAAGGTTTAGAGTTATCTTATTCTGCATGTAGATATTTAATACCAGATTTCATGCGTGCTGTTAGTGTTTTAACTGTTTTAAGTTTGTTTGTTTCTTTAATAGCAGCTTTAAATAACATGTTGGTTGCTCATAAACATCTTAAAATGAAAAATTTCGAATTTGAACAACAAATGACTGATAGGACTTTATATAAGTTGTACAAAAGCTTGAAGCGAAACATGAAAGGTAACCCTAGCCTAGAAGAATTCAGAGATTTTGTGGGAGAGAGAAACCCTGAACTGGTTAAGAAAATTGATCCGGATGAGTTTGATCTTGAAGGGGTACAACATCAGCACAAGAGTAAGTCACAAGATACTCTTCAGAAAATCGTCGCTTTTGTAGCATTAATAATGATGACATTTGACGCTGACCGAAGCGATTGTGTGTACAAAATTTTAAACAAGCTGAAGGGGATAATTGGAACAATCGAGTATGAAGTGCAACATCAGGCGATTGATGACATCAAACTTGGTTTGGAGGAGGAGAATACAAAGATTGATTTTGAAGTGTCAACAGATCCACAGCTAGACAAGACATTCAGCGAACCAACTTTTTCTGACTGGTGGAGCAATCAACTAACAAATAATAACGTGATTCCACACTACCGAACTGAAGGATTTTTTATGGAATTCACTCGACAATCCGCCATTGAAGTTTCAAATCAGATTGCACATGGCCCACACATGGATATTTTATTACGAGGTGCAGTAGGATCTGGTAAGTCAACAGGATTACCATATCATCTTTCAAAACGTGGTCAAGTACTGCTACTTGAACCAACAAGACCATTGGCAGAAAACGTCTGTACACAATTGCGCGGAGACCCTTTTCACACAAATCCAACATTGCGTATGCGTGGCATGACTTCGTTTGGATCAGCACCAATCACAGTCATGACAAGCGGTTATGCTCTACATTATTTAGCCAACAACCCACATCTTTTGCGCGACTATAACTACATCATATTCGATGAATGTCATGTTAGTGATAGTTCAGCAATGGCTTTTAGGTGTTTGCTACATGAATATAGTTTCAACGGGAAGATAATCAAAGTTTCAGCAACACCACAAGGTAGAGAGGTTGAATTCAAGACACAATTTCCAGTAACTCTTATTACCGAGGAGCATCTCTCTTTCAGTCAGTTTTGTGAAGCCCAGAGAACGAACGCAAAGTGCGATGTTGCGACAAGTGGAGAGAATATCTTGGTCTATGTTGCGAGTTATAACGAAGTGGATCAACTCAGTAGGATGCTTGTCGAAAGGAAGTTTAAGGTGACAAAGGTGGACGGTCGAACAATGAAAGTTGGAAAAGTTGCCATTGAAACACACGGAAGTGTCGGAGCACCTCATTTTATTGTGGCGACCAACATCATTGAGAATGGAGTAACTTTGGATGTGGACACAGTTGTTGATTTTGGGCAGAAAATTTCACCTACACTGGACGTCGACAATCGTTGTATACACTATTCGAAACAATGTGTCACATACGGAGAGCGAATTCAGAGACTTGGAAGAGTTGGACGTCATAAGCAAGGAAAAGCTTTGAGAATAGGTTTCACTGAGAAAGGACAGGTAGCAATACCTGACATTGTAGCCACAGAAGCAGCTTTTCTCTGCTTCACATATGGGTTGCCTGTCATGACACACAATGTTTCAGTTAGTTTACTGTCTAAATGCACGGTTAAACAAGCAAGAACAATGCATTTATTCGAACTACCTGCATTTTATACAGTCAACCTTGTTAGATACGATGGTTCAATGCACAAAGCAATACATGATTTATTGAAACCATATCGTCTGCGAGACTCTGAGATCATACTGAACAAAATGGCAATTCCAACACATGGCTTGACAACTTGGATGAAAGCAATTGATTACAACAAAATTGGGAAGAAGCTTGAACTAGAAGCAGAAACACGTATACCATTCTATGCACGCGACATTCCAGAAATGCTTCACAGGCGAGTGTATGAAGCAATGCTCAGATTCAAAGGTGATGCGGGTTTCGGAAGAATCTCAACAGCAAGTGCTTGCAAAATCGCGTACACATTGCAAACTGATTTGCAATCCATTCCACGAACAGTGAAACTCATTGATATGTTGATTGAAAAGGAGCAGCAAAAACACGCACATTATCAGCTAGCTATTTCAACATCATGTTCATCTTTCAGTTATTCATTATCCACTCTCAGTGACATTGTTAGAAGAACATATCAGAAGGATCATTCTCTCGAAAACATCAGTATCCTTCAAGCAGCAAAAGCACAAATTCTGTCTTTCAATACGATATCAGAAGATTTTTCTTACGCTGAGCAAAGTACTTCCTATCTTTGTGAATCTGTATTGGAGCACACAGCAACGGAGTGCATTTATCATCAATCTGAAGGCGAGCTTGCAAAACATCTGAAGCTCAAGGGATACTGGAATAAGAGTCTTATAACACGTGATATTATTATCATGCTTGGTGTTATTGGTGGGGGTTGTTGGATGGCTTACTCTTATTTCACAGAAAAATTCTCAGAAGAAGTCTCGCATGAAGGGTGGAACCGTAGACAAAAGCAAAAGTTGAAGTTTAGAAATGCGAGAGATGAGAAGCTAGGGAGAGAGGTTTATGGTGATGATGGAACTCTTGAACATTTCTTTGGTGAAGCATATACGAAGAAAGGCAAAACAAAAGGCAAGACGAGAGGAGCTGGGACAAAAACAAGGCGATTTATCAACATGTATGGATATGACCCAGCTGATTATTCGTTTGTTCGATTTGTTGATCCTTTGACAGGGCGGACACTTGATGACTCACCATACACAGATATTGGATTGATACAAGATCATTTTGCTGATGTACGAGATGAGATGATCGCCAACGGTGAACTTGATAGGCAGCGATTGCATCTCGGAAACGCCAACAGGATTGAGGCATATTTCATAAACAATGCGACAAAGAAAGCACTGCAAGTTGACATGACACCACACAATCCACTCTTATTCTGTAAGAGTGGCACAGCCATTGCAGGTTTTCCAGAGCGAGAAGGAGAGTTTCGTCAAACAGGAGCAGCAACGCCAATTGACATTGAGAAAGTACCAAAACAGTGTGAAGCATCTGTTGTCACACATGAAGGAAAAGCACTTTTTGGGGGTCTGCGTGATTATAATGGAATCGCAAGTGTTATCTGTCAACTGAGCAACGAATCGGATGGACATGTCGAAACAATGTTTGGAATTGGATATGGTCCCTTCATCGTCACAAATCAGCACCTTTTCAAAAGGAACAATGGAAAACTCACGATAAGGTCACGATCTGGTAAGTTCATCATTGAAGATACAACTGTCATTGATATGTTCCCTTGTAAGAGTTTTGACATATTAATAATGAGACTGCCCAAAGATTTTCCACCATTTCCACAACGTTTAAACTTCAGACAACCTCAAAGTGGCGAGCAAATCTGCATGGTTGGTTCAAATTTTCAAGAGAAGAGCATCACAAGTGTTATTTCTGCAACAAGTGAGACTGTCCCATTTCCCAATAGCCACTTTTGGAAGCACTGGATTACAACCAAGAATGGATATTGTGGTCTCCCGCTTGTCGCAGTGAAAGATGGAAACATTGTTGGATTGCATAGCCTAGCAAATTTCGCACAGACACAGAATTACTTTGCGAATTTTCCAGAGAACTTTCAGGATTCTATTCTTAACTCAACCGAGTCACTCAATTGGGTTCAGAGGTGGAAATACAATTCAAGAGAGATTTGCTGGGGAAAGCTCAAGATGCATGAGAGTGTGCCAGATGGACTATTCAAGATTCACAAACTCATAAGCGACCTCAGTAATGCGGATGTTTTCCAACAATCACAACAGCGAAAGTGGATGTATGAAGCGTTGAAGGACAACTTACAAGCAATTGCTCAAACACCCAATCAATTGGTCACGAAACATTCTGTTAAGGGCAAGTGTAGATTGTTCGACTTATACCTGCGTCAAAATGAGGAAGCCAACACATACTTCCAACCTTTGATGGGTGCGTATCAGAAGAGTGTTTTGAGTCGAGAAGCATACATCAAGGACATAATGAAGTACTCAACACCGATCATAATTGGCAAAGTCGACTGTGATGCGTTTGAAACTGTTGTTGATTTCTTCATCATTCAACTCAGAGAGTTTGGGATCGAAACTTGCAATTATATCACATGCCATGAAGACATCTTCAATTCATTGAACATGAAGGCTGCGGTTGGTGCACTCTACACTGGAAAGAAACGAGATTATTTTAAGGAATTCACAGAGGGTGACAAGGAGGAGATCTTAAAGCAAAGTTGCTTTAGATTATTCTCAGGAAAGTTTGGTGTTTGGAATGGCTCCTTGAAATCTGAGCTGCGGGCCAGAGAGAAAGTCGAAGAAGGAAAAACTAGAACCTTCACAGCAGCACCACTTGATTCACTACTCGGAGCAAAGTCATGTGTGGATGATTTCAACAATCAATTTTATGACTTAAACTTGAAGGCTCCTTGGAGTGTTGGAATGACGAAGTTTTACTGTGGATGGGACAATTTGTTGAGTGGATTCCCTGAGGGTTGGATCTATTGTGACGCGGACGGTTCTCGATTCGATAGCTCACTTTCTCCATACTTGATAAACTCAGTTTTACAAATTCGGTTGTCTTTTATGGAAGAGTGGGAGATTGGTGCTCAAATGCTCAAGAACTTGTATACGGAAATCGTCTATACACCAATTGCTACTCCAGACGGGACGATAGTGAAGAAGTTCAAAGGAAACAACAGCGGCCAACCATCAACTGTTGTGGATAACACTCTAATGGTTATTGTATCTATGAAATATAGTTTGTTTAAATTAGGAATAAAGTTAGAAAACCAGGATTCTATATGTAAGTATTATGTTAATGGTGATGATTTAATTATAGCTATTAGACCGGATCACGAGTACATCCTTGATGGACTTCAGGAAATCTTCTACACACTAGGTCTGAATTATGAATTCAATTCAAGAACTAAGAATAAAGCAGACTTGTGGTTCATGTCGCATCAAGGAGTGATGCGAGAGGGAAAATTCATACCAAAGCTTGAGAAGGAAAGAATTGTTTCAATTCTGGAATGGGATCGTTCAGACGAACCTGTTCACAGGTTGGAAGCTATTTGTGCTGCGATGATCGAAGCATGGGGTTATGATGAGTTAGTCCACGAAATCCGAAAGTTTTACTTGTGGGTACTCGATCAAGCTCCATACAATGCACTGGCATTAGAAGGCAAGGCACCATACATCGCAGAGACCGCTCTGAGGAAATTATATCTTAACGAGGAACCAAGTGAATTAGAGCTGGAAGCATACCAAAAAGCCTTCGAAGAGGAAGATGAGGAGAGCGAGGCAATTTTTGAGGTTTCACATCAAGCCAATGACACGGTCGACGCTGGAGCTTCTGGATCAGGAAGTCAACAAGGTCAAACAAAGGAAAAACAGCCTCGAGAGAGTAGGCCAGCACTTGACAAGGATGTTGATGTTGGGACTGTTGGTACTTTTTCTGTGCCACGAATGAAAGTCGTGAGTGACAAAATGAAATTACCAAAAGTTGATGGAAAGGTTGTTTTGAGCGCTGAGCATTTGTTACAGTACAAACCACCACAGCTCGAACTTTCGAACACACGTGCCACTCACAGCCAATTCAAATCATGGTATGAAGAAGTCAAAGGAGCGTACGGAATGGATGATGCCAACATGCAAATTATATTGAATGGTCTGATGGTGTGGTGTATTGAGAATGGAACATCACCAAACATAAATGGAAACTGGGTTATGATGGATGGAGAGGTACAAGTTGAATATCCTTTAAAACCAATCATAGAAAATGCCAAACCCACGTTTCGCCAAATAATGGCCCATTTCAGTGACGTAGCTGAAGCGTACATTGAAATGCGTAATACAACAGAGAAGTACATGCCAAGGTATGGACGTCAGCGCAATCTCAACGACTACCAACTTGCACGTTATGCATTTGACTTTTATGAGATAACGTCGAGGACACCGAATCGTGCACGAGAAGCTCACTTTCAGATGAAAGCAGCAGCTCTACATAACACGAAGACACGAACATTCGGTTTGGATGGGAAAGTTGGAACACAGGAAGAGGACACGGAGAGGCACACAGCAGGGGATGTCAATGCTAATATGCATAGTTTGTTAGGCATGCGATCTATGTAGTTTAAGTGTGTTTCGGTAGGCTTAAGTACTATTAATATAGTAAGTCAATATTAAATATAGTGCTTTCTTTGTTTACCCGTTCGATCCTCCCTTCGGCCTATACTTTAGAGTGTCAATTTGATGAGTGTGGGCTTCCCACGAGTATCTCGCCACTCTCTATGTCTAGGAGCTAAGTTTGCATTTGCACTATGTGAGTATTCATGGTTTTAAAGCAGCCTGGTGCCACCATGAAATGTCAGTATTGTACGTGTTGAACAAGGGAC
| 22,116
|
MW848534.1
|
Asparagus virus 1
|
Gaafar,Y.Z.A., Westenberg,M., Botermans,M., Laszlo,K., De Jonghe,K., Foucart,Y., Ferretti,L., Kutnjak,D., Pecman,A., Mehle,N., Kreuze,J., Muller,G., Vakirlis,N., Beris,D., Varveri,C., Ziebell,H.
|
Julius Kuehn Institute, Institute for Epidemiology and Pathogen Diagnostics
|
Germany
|
2021-10-10
|
NGSTPS18/IT 1770
|
Asparagus virus 1
|
Potyvirus
|
Potyviridae
|
ssRNA(+)
| 9,741
|
GenBank
| 1
|
Italy
|
Italy
|
Asparagus officinalis
| null |
2018
| null | null |
Asparagus virus 1 isolate NGSTPS18/IT 1770, complete genome
|
AAATTATCAAAACTCAACACAACATAACACAACACAGCTCAACACAACTCAATTCAACAACTGAATTCCTAGACTACCATATCTGAATTCAAAACAACCAACCACACAAACCAAACATTCTTCATAATTTGTAATCGACATGGACTGCATACAGATTGGAAGCATGATCATCTCCATCCCGACCGCACAGGCACCCACATTAGCCTGTACCATTGCCAAACCCACATCCACCACACCCACACAAGCTGATCTCAAAATGGTTGGCTTTCACTCGAAAGAACCAAAGCGCGTAGTACCGACTACGCCGGCATTGATTAAGAAGGCCTTATTTAAAAAGGCTGAGGTGGAAAAGAGCGCCCTCGACAAGTGGGCAGAGACCTATGAGGCTGCAAATCATAGGAAGGATGAGAAGATAGTCACTACCAGGCGTGGAGTGACAAGGTTTGTTCGCAAGAACCGAAAGGACTTGCGAAGGGAGAGGGACGAGTTGGCTGCAACAGCTCGTGAAAAGTTGGCTCAGGAGATTCGCCTCCTTAAAATTAAGCGAAATGAAAACCAATTGAAAAATAATCATGTGAGTATTGTCTCATCAATTTCAATTGGCGGAGCTCCCAGATCTGCGTCTGAGGAGGAGACCACACCAGTACAAAAATGGGGTCTCAACAAAACAGCAAGCTCCAAGACTTGCAAGAAGCAAACCCACTTAGTTGTTTCAAGTGGGGAATTCAGGAGACTGCTACGCTCACTAGCTCAAATAGTGCGCGAGAAATCATCCACAATTGAAATTGTGGAAAAATCGACAGTCAGAGCACGCAGCAAGGTGTTCAAAGGACGTCAACGGATGTTCGTTGACGTGCTACACCAAAAAGGAACTTACCGATCGTTTGACGTGAAGATGAGTCCTTGGACTGAGAGATTGTTCGGATACATATTCAAGCATTTTGAGAGAGGACCTACAATTCACCATACTGAAATTCAACCAGGTTGTAGTGGACTCGTTGTGCGGAGAGATTCGTTGGCGGATTGTATTTCAGGGAACCATACGAAATTCTTTATCGTGCGAGGTCGAATTAAGAACATTCTTTGTGACGCACGTGCATACATACCATACAGTTCACTATTCGACGTGCACCATTACACAAGTCCTGGAGAAAAGTTTTGGAAAGGTTTCACCGAAGTCTTTCAAGAACTAAAGCCAACACAAATTAGACACGATTGTACATCGGATCTTGATGTAGTCAAGTGTGGAGAAGTCTCCGCATTGGTTTGCCAAGCAGTGTTTCCTTGTGGGAAGATTACTTGCAATAAATGCGTGGAAAATTACACACTTGTGGGTGAAGAAAGCAAGAAAGCACAAATCCAGCAATCTTTGGAACGGATTGAAAAAGACCTGGCTCATAAATACGCTGATTTTCCTCACGTTCACGAGATTTTGAAGGTGTTTGGAAATTCTTTATTAGTTCCTAACAAGAACTACAAGGCATTTGCTGACATCAAACATATGATTGGAGAGCGAACTGAAGCACCTTTTAGTCATATCAATAAATTGAACGAAATCATAATAAAAGGTGGCACATCAACAACTTCTGACTACTTTGATGCTTCTAGTGCTCTATTAGAAGTAGCAAGGTATCTTAAGAACCGGACCGAGAACATACAAAAAGGATCACTTGCATCTTTCAGAAACAAAGCATCAGCAAAAGCACATGTTAATACGATCTTATTGTGTGATAATCAACTTGATAAGAATGGAAATTTTGTATGGGGAAAGAGAGGCTATCATGCAAAAAGATTTTTCAAGAATTATTTCGAACTCGTCAACCCATCAAACGGATACGCAAAACACATCATCAGGAATGGGCCAAGTGGTGAGAGACAGTTGGCCATTGGTCATTTAGTCATGTCAACAAACTTTCAAACTTTGAGGCTGCAACTCGAAGGAAACCAAGTTGAGAAGTTTCCAGTGACAAAAGCCTGCATCAGCAAACGAAACGAAAATTTCATATATCCATGTTGCTGCGTCACAACTGAAACTGGGGAACCATTGGAATCACCGCTATACACCCCAACGAAAGGTCATCTTGTTGTTGGCAACACTGGTGATGCCAAGTACATAGACTTACCCGAGCAAGAAAATGAACGACTGTACATATCACAAGAGGGGTTTTGCTATGTAAATATATTCCTAGCAATGTTAGTGAATGTTAACGAAGATGATGCCAAAAATTTCACGAAAATTGTGCGCGATGATGTGGTCAGAAAACTTGGAAAGTGGCCGACGCTGATAGATTTAGCAACTGCTTGCTACTATCTCACGATGTTTTTCCCAGAAACGCGGAATGCTGAACTACCCAGAATTCTGGTTGATCACAAACACAATACGATGCATGTCATTGATGCATATGGTTCGAAGGACACAGGGTATCATGTTTTGAAAGCAGGAACTATCGCACAGTTAATTCTGTTTGCTAGTGAGTCACTTGAATCCAAGATCAAGGAATATCGTGTCGGAGGTCTCGTTGAGGATACAGCCATTGTACAGACAGGTATCAAGACACTGATTCGAGCCATTTATAGACCTAAAATGTTCAAAGAACTTTTGTTGACAGAACCATACTTAATCACTTTGAGTGTTTTGTCACCAGGAGTACTTTTGGCAATGTATAATAATGGTTCTTTTGAGCAGGCTACGCAGAAATTCATAACACAAAACGATTCTCTCGCAACCATCTCCACCACTTTAGCACTTCTTGCAACAAAAGTTTCTCTTGCACAAACTCTAAATGAACAATGTAACATTATTGATGCACATGCACAATTACTGTTGCAAGCAATAGGTGAAGGGCAAAGTGAGATCAGTCACACAAAACGGTTAGCTAAAGAAGCCCTTCAAGTCATGATTGCGCAGACTGAAAACAATGCTTCACTTTTGGATGGAGGTTACTTCGTTCTGCGTGAATCCTCTAAACACTTCACTGAGAAAAAATATCTGCGCCTTTTGGAGGAATCATGGGAAGAGCTAAACTTGTTGGAAAAATATTATGCGGTAAGAGCATCATATTCCTGGCGACGCGTTATTCAGCGACCTTTAAACCCCACAAAAGGCGCAGATTTGAAAGGCAGATACGATATATCCATCAATGCATTACTCAAGAAAGCGTCTGAGGCCATGAATGAAATCGTCAGAAAGAACTTGGCAAAAGGTGAACTTGCATATAAAAATGTGACAAAGAAAGGTTTAGAGTTATCTTATTCTGCATGTAGATATTTAATACCGGACTTCATGCGTGCTGTTAGTATTTTAACTGTTTTAAGTTTGTTTGTTTCTTTAATTGCAGCTTTAAATAACATGTTGGTTGCTCATAAACGTCTTAAAATGGAAAATCACGTATTTGAACAACAAATGGTTGATAGGAATTTATCTAAGTTGTACAAAAGTTTGAAGCGAAACATTAAAGGTAACCCTAGCCTAGAAGAATTCAGAGATTTTGTGGGAGAGAGAAACCCTGAACTGGTAAAGAAAATTGATTCGGATGAATTTGATCTTGAAGGGGTACAACATCAGCACAAGAGTAAGTCACAAGATACTCTCCAGAAAATCGTCGCTTTTGTAGCATTAATTATGATGACATTCGATGCTGACCGAAGCGATTGTGTGTACAAAATTTTAAACAAGCTGAAAGGGATAATTGGAACAATCGAATATGAAGTACAACATCAGGCGATTGATGACATCAAACTTGGTTTGGAGGAGCAGAATACAAAGATCGATTTTGAAGTTTCAACAGATCCACAGCTAGACAAGACATTCAGCGAACCAACTTTTTCTGACTGGTGGAGTAATCAACTGACAAATAATAACGTGATTCCACACTACCGAACTGAAGGATTTTTCATGGAATTCACTCGACAGTCCGCCATTGAAGTTTCAAATCAGATTGCACATGGTCCACACATGGATATTTTGTTGCGAGGTGCAGTAGGATCTGGTAAGTCAACAGGATTACCATACCATCTTTCAAAACGTGGTCAAGTACTGCTACTTGAACCAACAAGACCATTGGCAGAAAACGTCTGTACACAATTACGCGGAGACCCTTTTCACACAAATCCAACATTGCGTATGCGTGGCATGACTTCATTTGGATCAGCACCAATCACAGTTATGACAAGCGGTTATGCTCTACATTATTTAGCCAACAACCCACATCTTTTGCGCGACTATAACTACATCATATTCGATGAATGTCATGTTAGTGATAGTTCAGCAATGGCTTTTAGGTGTTTGCTACATGAATATAGTTTCAATGGGAAGATAATCAAAGTTTCAGCAACACCACAAGGTAGAGAGGTTGAATTCAAGACACAATTTCCAGTGACTCTCATCACCGAGGAGCATCTCTCTTTCAGTCAGTTTTGTGAAGCTCAGAGAACGAACGCTAAATGCGATGTTGCGACAAGTGGAGAGAACATCTTAGTCTATGTTGCGAGTTATAACGAAGTGGATCAACTCAGTAGGATGCTTGTCGAAAGGAGGTTTAAGGTGACAAAGGTGGATGGTCGAACAATGAAAGTTGGAAAAGTTGCCATTGAAACACACGGATGTGCCGGAGCACCTCACTTTATTGTGGCAACCAACATCATTGAGAATGGAGTAACTTTGGATGTGGATACAGTTGTTGATTTTGGACAGAAAATTTCACCTACACTGGACGTCGACAATCGTTGTATACACTATTCGAAACATTGCGTCACATACGGAGAGCGAATTCAGAGACTGGGAAGAGTTGGACGTCATAAGCAAGGAAAAGCTTTGAGAATAGGATTCACTGAGAAAGGACAGGTAGCAATACCTGACATTGTAGCCACAGAAGCGGCTTTTCTTTGCTTCACATATGGGTTGCCTGTCATGACACATAATGTTTCAGTTAGTTTACTGTCTAAATGCACGGTTAAACAAGCAAGAACAATGCATTTATTCGAACTACCTGCATTTTATACAGTCAATCTTGTTAGATACGATGGTTCAATGCACAAAGCAATACACGATTTATTGAAACCATATCGTTTGCGAGATTCTGAGATCATACTGAATAAAATGGCAATTCCAACACATGGCTTGACGACTTGGATGAAGGCAATCGACTACAATAAGCTTGGGAAAAAGCTCGAGCTGGAAGCAGAAACGCGCATTCCATTCTACGCACGTGACATACCAGAGATGCTTCACAGACGAATATATGAGGCAATGCTTAAGTTCAAAGGTGATGCAGGATTTGGGAGAATTTCGACGGCGAGCGCTTGTAAAATTGCGTACACATTGCAAACTGATTTGCAATCCATCCCACGAACAGTGAAACTCATTGACATGTTGATTGAGAAGGAGCAGCAAAAACACGCACACTATCAGCTAGCTATTTCAACATCATGCTCATCTTTCAGTTATTCATTATCCACTCTCAGTGACATTGTTAGAAGAACATATCAGAAGGATCATTCTCTCGAAAACATCAGCATCCTCCAAGCAGCAAAAGCGCAAATCCTGTCTTTCAACACGATATCAGAAGATTTCTCGTACGCGGAACAAAACACATCTTATATTTGTGAATCTATACTGGAACACACAGCAACAGAGTGTATATATCATCAATCTGAAAGTGAGCTGGCAAAACATCTGAAGCTCAAGGGATACTGGAACAAGAGCTTGATAACACGTGATATTATTATCATGCTTGGTGTTATTGGTGGAGGTTGTTGGATGGCTTACTCTTACTTCACAGAAAAATTCTCAGAGGAAGTATCACACGAGGGATGGAATCGCAGGCAGAGACAAAAATTAAAGTTCAGAAATGCGAGAGATGAGAAACTAGGGAGAGAGGTTTATGGAGACGATGGAACTCTTGAGCATTTCTTTGGTGAAGCATACACGAAAAAGGGCAAGACAAAGGGTAAGACAAGAGGTGCTGGGACAAAGACAAGACGATTCATCAACATGTATGGATATGACCCTGCTGATTATTCATTCGTCCGATTCGTTGATCCTCTAACAGGGCGAACAATTGATGACTCACCATACACAGACATCGGGTTGATACAGGACCATTTTGCTGATGTGAGAGATGAAATGATCGCAAACGATGAGCTTGATAAACAGCGGTTGCATCTTGGGAATGCCAATAGGATTGAAGCATATTTTGTAAATAATGCAACAAAGAAAGCACTGAAGGTTGACATGACACCACATAACCCACTTTTATTTTGTAAGAGTGGTACAGCTATTGCAGGCTTTCCAGAGCGAGAAGGAGAGTTTCGTCAGACAGGAGCAGCAACACCAATTGACATCGAAAAAGTGCCAAAACAAAGCGAAACATCTGTTGTCACACACGAAGGAAAAGCACTGTTTGGGGGTTTGCGTGATTATAATGGAATTGCGAGTGTCATTTGTCAACTGAGCAACGAATCAGATGGTCATGTTGAGACTATGTTTGGAGTTGGATATGGACCTTTCATTGTCACGAATCAACACCTTTTCAAGAGAAACAATGGGAAACTTACAATAAGGTCACGATCTGGAAAGTTCATTATTGAAGATACAACTGTTATTGATATGTTTCCTTGCAAGAGTTTTGACATATTAATAATGAGACTGCCTAAGGATTTTCCACCATTTCCACAGCGTTTGAATTTCAGACAACCCCAAAGTGGTGAACAGATTTGCATGGTCGGTTCAAATTTTCAGGAAAAGAGCATCACAAGTGTCATCTCCGCAACAAGCGAAACTGTTCCTTTTCCCAATAGTCATTTTTGGAAGCATTGGATTACAACCAAGAATGGATATTGTGGTCTCCCGCTCGTTGCTGTGAAGGACGGAAATATAGTTGGATTGCACAGCCTGGCAAACTTCGCACAAACGCAGAATTATTTCGCAAACTTTCCAGAAAATTTTCAGGAATCCATTCTCGACTCGACTGAGTCACTCAATTGGGTCCAGAGATGGAAATACAATTCAAGAGAGATTTGTTGGGGAAAGCTCAAAATGCATGAAAGTGTGCCAGATGGACTGTTTAAAATTCATAAACTCATAAGCGATCTCAGTAATGCGGATGTTTTCCAACAATCACAACAGCGAAAGTGGATGTATGAAGCGTTAAAGGACAACTTACAAGCAATTGCTCAAACACCCAATCAATTGGTCACGAAACATTCTGTTAAGGGCAAGTGTAGATTGTTCGACTTATACCTGCGTCAAAACGAGGAAGCCAACACATACTTCCAACCTTTGATGGGTGCGTATCAGAAAAGTGTTTTGAGTCGAGAAGCATACATCAAAGACATAATGAAGTACTCAACACCGATCATAATTGGCAAAGTTGACTGCGATGCGTTTGAAACTGTTGTTGATTTCTTCATCATTCAACTCAGAGGGTTTGGAATTGAAACTTGCAATTATATCACATGCCATGAAGACATCTTCAATTCATTGAACATGAAGGCCGCTGTTGGTGCACTTTACACCGGAAAGAAACGAGATTATTTCAAGGAATTCACAGAGGGTGACAAGGAGGAGATCTTAAAGCAAAGTTGCTTTAGATTATTCTCAGGGAAGTTTGGTGTTTGGAATGGCTCCTTGAAATCTGAGCTACGGGCCAGAGAGAAAGTCGAAGAAGGAAAAACCAGAACCTTCACAGCAGCACCACTTGATTCACTACTCGGAGCAAAGTCATGTGTGGATGATTTCAACAATCAATTTTATGACTTAAACTTGAAGGCTCCTTGGAGTGTTGGAATGACGAAGTTTTACTGTGGATGGGACAATTTGTTGAGTGGATTCCCTGAGGGCTGGATTTATTGCGACGCGGACGGTTCTCGATTCGATAGCTCACTTTCTCCATATTTGATAAACTCAGTTTTACAAATTCGGTTGTCTTTTATGGAAGAGTGGGAGATCGGTGCTCAAATGCTCAAGAACTTGTATACGGAAATCGTCTATACACCAATTGCTACTCCAGATGGGACGATAGTGAAGAAGTTCAAAGGAAACAACAGCGGCCAACCATCAACTGTTGTGGATAACACTCTAATGGTTATTGTATCTATGAAATATAGTTTGTTTAAATTAGGAATAAAATTAGAAAACCAGGATTCTATATGTAAATACTATGTTAATGGTGATGATTTAATTATAGCTATTAGACCAGATCATGAATATATCCTTGATGGACTTCAGGAAATCTTCTACACGCTAGGTCTGAACTATGAATTCAGTTCAAGAACTAGGAATAAAGCTGATTTGTGGTTTATGTCACACCAAGGGATTATGAGAGAAGGGAAATTCATACCAAAACTTGAGAAGGAGAGAATTGTTTCTATTCTTGAGTGGGATCGTTCAGATGAACCCGTTCATAGATTAGAAGCGATTTGTGCTGCAATGATTGAGGCATGGGGTTATGATGAGTTGGTTCACGAGATTCGAAAGTTTTATTTGTGGGTGCTCGATCAAGCTCCATACAATGCATTGGCTTTGGAAGGAAAGGCGCCATACATCGCAGAGACTGCACTTAGAAAGTTGTATCTCAATGAAGAACCAAGCGAATTAGAACTTGAAGCCTATCAGAAAGCCTTTGAAGAAGAGGATGAGGAAAGTGAGGCAATATTCGAAGTTTCACATCAAGCTGATGACACTGTTGATGCTGGAACATCTGGATCGGGGAGTCAACAAAGCCAGACAAAGGAGAAACAGCCTCGGGAAGGAAGATCTACATCTGACAGAGATGTTGATGTCGGAACTACAGGAACTTTCTCAGTACCACGGATGAAGGCTGTGAATAACAAGATGAAACTACCAAAAGTTGATGGCAAAATTGTTCTAAATGCGGATCACTTGTTACAGTACAAACCACCACAGCTTGAACTTTCAAATACACGTTCCACTCACAGTCAGTTCAAATCATGGTATGAAGAAGTCAAGGGAGCATATGGAATGGATGACGCCAACATGCAAATCATATTGAATGGTCTGATGGTGTGGTGTATCGAGAATGGAACATCACCAAACATAAACGGAAACTGGGTTATGATGGATGGAGAAACACAAGTTGAATATCCTTTAAAACCAATCATTGAAAATGCCAAACCCACGTTTCGCCAAATAATGGCCCATTTCAGTGACGTAGCTGAGGCGTACATTGAAATGCGTAATACAACAGAGAAGTACATGCCAAGGTATGGACGTCAGCGCAATCTCAACGATTACCAACTTGCACGTTATGCATTTGACTTTTATGAGATAACGTCGAGAACACCGAATCGTGCACGAGAAGCTCACTTTCAAATGAAAGCAGCAGCTCTACACAACACGAAGACACGAACATTCGGTTTGGATGGGAAAGTTGGAACACAGGAAGAGGACACGGAGAGACACACAGCAGGGGATGTCAATGCTAATATGCATAGTTTGTTAGGCATGCGATCTATGTAGTTTAAGTGTGTTTCGGTAGGCTTAAGTACTATTAATATAGTAAGTCAATATTAAATGTAGTGCTTTATTTGTTTACCCGTTCGATCCTCCCTTCGGCCTATACTTTAGAGTGTCAATTTGATGAGTGTGGGCTTCCCACGAGTATCTCGCCACTCTCTATGTCTAGGAGCTAAGTTTGCATTTGCACTATGTGAGTATTCATGGTTTTAAAGCAGCCTGGTGCCACCATGAAATGTCAGTATTGTACGTGTTGAACAAGGGAC
| 37,346
|
KJ830760.1
|
Asparagus virus 1
|
Blockus,S., Lesker,T., Maiss,E.
|
Leibniz Universitaet Hannover, Institute for Horticultural Production Systems / Phytomedicine
|
Germany
|
2014-12-03
|
DSMZ PV-0954
|
Asparagus virus 1
|
Potyvirus
|
Potyviridae
|
ssRNA(+)
| 9,741
|
GenBank
| 1
| null | null | null | null | null | null | null |
Asparagus virus 1 isolate DSMZ PV-0954, complete genome
|
AAATTATCAAAACTCAACACAACACAACACAACACAGCACAACACAACTCAACTCAACAACTGAATTCTTAGACTACCATATCTGAATTCAAAACAACCGATCACACAAACCAAACACGCTTTATAATTTGTAATCGACATGGACTGCATACAGATTGGAAGCATGATCATTTCCATCCCAACCGCGCAGGCATCCACATTAGCCTGCACCGCTGTCAAACCCACATCCACCAAGCCGACACAAGCCGATCTTAAAATGGTTGGCTTTCATCCAAAGGAACCAACTCGCGTAGCATCTGTTACGCCAGTACTAGTGAAGAAAGCCTTATTCAAAAAGGCTGAAGTGGAGAAGAGCGCCCTCGACAAGTGGGCAGAAGCCTATGAAAATGCCAATCATAGGAAGGATGACAAGATAGTCACTACCAGGCGTGGAGTGACAAGGTTTGTTCGCAAGAACCGAAAGGACTTGCGCCGCGAGAGAGATGAGCTGGCTGCAACAGCTCGTGAAAAGTTGGCACAGGAAATTCGCCACCTCAAAATTAGGCGAAACGAAAACCAATTGAAAAATAGTCACGTAAGTATTATTTCAAAAATTTCAATTGGTGGAGCTCCCAGATCTGCATCTGAGGAGGAGATCACACCAGTACAGAAGTGGGGTCTCAACAAAACAGCAAGTTCCAAAACTTGCAAGAAACAAACCCATTTGACTGTTTCAAATGGGGAATTCAAGAAACTGCTCCGCTCATTAGCCCAAATAATGCGCGAAAAAGCATCCACAATAGAAATTGTGGAAAAGACAACGCTACGAGCACGTAGCAAAGAGTTTAAGGGACGTCAAAGAATGTTTGTTGACGTACTACATCAAACTGGCATATATCGGTCATTTGATGTAAAGATGGGCTCCTGGACTGAGAGTGTATTTGGATACATGTTTAAGTATTTTGAGAAAGGGCCCATAATACATCACACAAAAATTCAGCCAGGTTGTAGTGGACTCGTCGTACGGAGAAGTTCATTGAAGGACTGCATTTCAGGAAATCACACGGAATTTTTCATTGTGCGTGGTCGAATCAGAAACATTCTCTGCGACGCACGTGCATTTATACCATATGAGTCACTATTTGATGTGCATCACTACTCAAGTCTTGGAGAAAAATTTTGGAAAGGTTTCACCAACGTCTTTCTAGAATTGAAACCAACACAGATTAGCCATGACTGCACATCAGACCTTGATGTTGTTAGATGTGGGGAGGTCTCCGCACTGGTTTGTCAAACAGTGTTTCCTTGTGGAAAAATAACTTGTAACAAATGCGTGGAAAGTTACACGCTCTTGGATGAGGAAAGCAAGAAGGCACAAATTCAACAGTCTTTGGAGCGAATCGAGAAAGACTTGACTCACAAGTACACTGATTTCCCTCACGTTCACGAGATTCTGAAGGTGTTTGGAAATTCCTTGTTAATTCCTAACAAGAATTACAAGGCATTTGCTGACATTAAACACATGATCGGGGATCGAACTGAAGCACCTTTTAGTCATGTCAATAAATTGAACGAAATTATAATAAAAGGTAGCATGTCAACAACTGCTGACTATTTTGATGCTTCCAACACTTTGTTGGAGGTAGCAAGATATCTCAAGAATCGGACAGAGAACATACAGAAAGGCTCACTTGCAGCTTTTAGAAATAGAGCTTCTGCGAAAGCACATATCAACACAATCTTGCTGTGTGATAACCAACTTGACAAGAATGGAAATTTCGTTTGGGGAAAAAGAGGCTATCATGCAAAGAGATTCTTTAAGAATTACTTTGAACTTGTTGATCCATCAAATGGATATGCAAAACACATCGTCAGAAATGGACCAAATGGAGAAAGACAACTAGCAATTGGTCATTTGGTTATGTCGACGAATTTCCAAACCTTGAGGCTGCAACTCGAGGGAAACCAAGTTGAAAAATTCCCAGTAACCAAAGCTTGCATCAGTAAACGAAATGAAAATTTCATATATCCATGCTGCTGCGTCACAACCGAAACTGGAGAACCATTGGAGTCACCATTATACACTCCAACAAAAGGTCATCTTGTAATTGGCAACACTGGTGATGCTAAGTATATAGACTTACCTGAGCAGGAGAATGAACGATTGTACATATCACAAGAAGGGTATTGTTATGTAAATGTATTCTTAGCAATGTTGGTGAACGTCAACGAGGATGATGCCAAGAATTTCACAAAGATTGTACGTGACGATGTGGTCAGGAAGCTTGGGAAGTGGCCGACACTGATAGATTTAGCAACTGCTTGCTATTATCTCACAATGTTTTTCCCAGAAACACGAAATGCAGAATTACCTAGAATTCTGGTTGATCATAAACACAACACGATGCATGTCATTGATGCATATGGTTCAAAGAACACAGGATATCACATTTTGAAGGCAGGAACTATTGCACAATTGATCTTATTCGCTAGTGAGTCACTTGATTCTGAGATCAAGGAATATCGCGTTGGAGGCTTGATAGAGGACACAGCTGTTGTACAAACGGGTATCAAAACATTGATTCGATCTATTTACAGACCCAAAATGTTCAAAGAACTCTTGTTGACAGAACCATATTTGATAACTCTGAGTGTTTTATCACCAGGAGTTCTTTTGGCAATGTACAACAATGGATCTTTTGAACAAGCCACTCAAAAATTCATAACACACAATGATTCACTTGCAACCATTTCCACTACTCTGGCATTACTCGCAACGAAAGTCTCTCTCGCACAAACCCTCAATGAGCAATGTAACATAATTGATGCACATGCACAATTATTGTTGCAAGCGATTGGTGAGGGACAAAGTGAGATTAGTCACACAAAACGACTGGCAAAAGAAGCTCTTCAAGTGATGATTGCACAAAATGAGAATGACTCTTCACTCTTGGATGGAGGTTACTTTGTTTTACGCGAATCTTCTAAGGGTTTTACTGAGAAAAAATATCTGCGCCTTTTGGAGGAATCATGGGAAGATCTAAACTTGTTGGAAAAATATTATGCAGTAAGAGCATCATATTCTTGGCGACGCGTTATTCAGCGACCTTTAAACCCCACAAAAGGTGCAGATTTGAAAGGCAGATACGATATATCCATCAATGCATTACTCAAGAAAGCATCTGAAGCCATGAACGTAATTGTCAGGAAGAATTTGGCAAAAGGTGAACTTGTATATAAAAATGTGACAAGGAAAGGTTTAGAGTTATCTTATTCTGCATGTAGATATTTAATACCAGATTTCATGCGTGCTGTTAGTGTTTTAACTGTTTTAAGTTTGTTTGTTTCTTTAATAGCAGCTTTAAATAACATGTTGGTTGCTCATAAACATCTTAAAATGAAAAATTTCGAATTTGAACAACAAATGACTGATAGGACTTTATATAAGTTGTACAAAAGCTTGAAGCGAAACATGAAAGGTAACCCTAGCCTGGAAGAATTCAGAGATTTTGTGGGAGAGAGAAACCCTGAACTGGTTAAGAAAATTGATCCGGATGAGTTTGATCTTGAAGGGGTACAACATCAGCACAAGAGTAAGTCACAAGATACTCTTCAGAAAATCGTCGCTTTTGTAGCATTAATAATGATGACATTTGACGCTGACCGAAGCGATTGTGTGTACAAAATTTTAAACAAGCTGAAGGGGATAATTGGAACAATCGAGTATGAAGTGCAACATCAGGCGATTGATGACATCAAACTTGGTTTGGAGGAGGAGAATACAAAGATTGATTTTGAAGTGTCAACAGATCCACAGCTAGACAAGACATTCAGCGAACCAACTTTTTCTGACTGGTGGAGCAATCAACTAACAAATAATAACGTGATTCCACACTACCGAACTGAAGGATTTTTTATGGAATTCACTCGACAATCCGCCATTGAAGTTTCAAATCAGATTGCACATGGCCCACACATGGATATTTTATTACGAGGTGCAGTAGGATCTGGTAAGTCAACAGGATTACCATATCATCTTTCAAAACGTGGTCAAGTACTGCTACTTGAACCAACAAGACCATTGGCAGAAAACGTCTGTACACAATTGCGCGGAGACCCTTTTCACACAAATCCAACATTGCGTATGCGTGGCATGACTTCGTTTGGATCAGCACCAATCACAGTCATGACAAGCGGTTATGCTCTACATTATTTAGCCAACAACCCACATCTTTTGCGCGACTATAACTACATCATATTCGATGAATGTCATGTTAGTGATAGTTCAGCAATGGCTTTTAGGTGTTTGCTACATGAATATAGTTTCAACGGGAAGATAATCAAAGTTTCAGCAACACCACAAGGTAGAGAGGTTGAATTCAAGACACAATTTCCAGTAACTCTTATTACCGAGGAGCATCTCTCTTTCAGTCAGTTTTGTGAAGCCCAGAGAACGAACGCAAAGTGCGATGTTGCGACAAGTGGAGAGAATATCTTGGTCTATGTTGCGAGTTATAACGAAGTGGATCAACTCAGTAGGATGCTTGTCGAAAGGAAGTTTAAGGTGACAAAGGTGGACGGTCGAACAATGAAAGTTGGAAAAGTTGCCATTGAAACACACGGAAGTGTCGGAGCACCTCATTTTATTGTGGCGACCAACATCATTGAGAATGGAGTAACTTTGGATGTGGACACAGTTGTTGATTTTGGGCAGAAAATTTCACCTACACTGGACGTCGACAATCGTTGTATACACTATTCGAAACAATGTGTCACATACGGAGAGCGAATTCAGAGACTTGGAAGAGTTGGACGTCATAAGCAAGGAAAAGCTTTGAGAATAGGTTTCACTGAGAAAGGACAGGTAGCAATACCTGACATTGTAGCCACAGAAGCAGCTTTTCTCTGCTTCACATATGGGTTGCCTGTCATGACACACAATGTTTCAGTTAGTTTACTGTCTAAATGCACGGTTAAACAAGCAAGAACAATGCATTTATTCGAACTACCTGCATTTTATACAGTCAACCTTGTTAGATACGATGGTTCAATGCACAAAGCAATACATGATTTATTGAAACCATATCGTCTGCGAGACTCTGAGATCATACTGAACAAAATGGCAATTCCAACACATGGCTTGACAACTTGGATGAAAGCAATTGATTACAACAAAATTGGGAAGAAGCTTGAACTAGAAGCAGAAACACGTATACCATTCTATGCACGCGACATTCCAGAAATGCTTCACAGGCGAGTGTATGAAGCAATGCTCAGATTCAAAGGTGATGCGGGTTTCGGAAGAATCTCAACAGCAAGTGCTTGCAAAATCGCGTACACATTGCAAACTGATTTGCAATCCATTCCACGAACAGTGAAACTCATTGATATGTTGATTGAAAAGGAGCAGCAAAAACACGCACATTATCAGCTAGCTATTTCAACATCATGTTCATCTTTCAGTTATTCATTATCCACTCTCAGTGACATTGTTAGAAGAACATATCAGAAGGATCATTCTCTCGAAAACATCAGTATCCTTCAAGCAGCAAAAGCACAAATTCTGTCTTTCAATACGATATCAGAAGATTTTTCTTACGCTGAGCAAAGTACTTCCTATCTTTGTGAATCTGTATTGGAGCACACAGCAACGGAGTGCATTTATCATCAATCTGAAGGCGAGCTTGCAAAACATCTGAAGCTCAAGGGATACTGGAATAAGAGTCTTATAACACGTGATATTATTATCATGCTTGGTGTTATTGGTGGGGGTTGTTGGATGGCTTACTCTTATTTCACAGAAAAATTCTCAGAAGAAGTCTCGCATGAAGGGTGGAACCGTAGACAAAAGCAAAAGTTGAAGTTTAGAAATGCGAGAGATGAGAAGCTAGGGAGAGAGGTTTATGGTGATGATGGAACTCTTGAACATTTCTTTGGTGAAGCATATACGAAGAAAGGCAAAACAAAAGGCAAGACGAGAGGAGCTGGGACAAAAACAAGGCGATTTATCAACATGTATGGATATGACCCAGCTGATTATTCGTTTGTTCGATTTGTTGATCCTTTGACAGGGCGGACACTTGATGACTCACCATACACAGATATTGGATTGATACAAGATCATTTTGCTGATGTACGAGATGAGATGATCGCCAACGGTGAACTTGATAGGCAGCGATTGCATCTCGGAAACGCCAACAGGATTGAGGCATATTTCATAAACAATGCGACAAAGAAAGCACTGCAAGTTGACATGACACCACACAATCCACTCTTATTCTGTAAGAGTGGCACAGCCATTGCAGGTTTTCCAGAGCGAGAAGGAGAGTTTCGTCAAACAGGAGCAGCAACGCCAATTGACATTGAGAAAGTACCAAAACAGTGTGAAGCATCTGTTGTCACACATGAAGGAAAAGCACTTTTTGGGGGTCTGCGTGATTATAATGGAATCGCAAGTGTTATCTGTCAACTGAGCAACGAATCGGATGGACATGTCGAAACAATGTTTGGAATTGGATATGGTCCCTTCATCGTCACAAATCAGCACCTTTTCAAAAGGAACAATGGAAAACTCACGATAAGGTCACGATCTGGTAAGTTCATCATTGAAGATACAACTGTCATTGATATGTTCCCTTGTAAGAGTTTTGACATATTAATAATGAGACTGCCCAAAGATTTTCCACCATTTCCACAACGTTTAAACTTCAGACAACCTCAAAGTGGCGAGCAAATCTGCATGGTTGGTTCAAATTTTCAAGAGAAGAGCATCACAAGTGTTATTTCTGCAACAAGTGAGACTGTCCCATTTCCCAATAGCCACTTTTGGAAGCACTGGATTACAACCAAGAATGGATATTGTGGTCTCCCGCTTGTCGCAGTGAAAGATGGAAACATTGTTGGATTGCATAGCCTAGCAAATTTCGCACAGACACAGAATTACTTTGCGAATTTTCCAGAGAACTTTCAGGATTCTATTCTTAACTCAACCGAGTCACTCAATTGGGTTCAGAGGTGGAAATACAATTCAAGAGAGATTTGCTGGGGAAAGCTCAAGATGCATGAGAGTGTGCCAGATGGACTATTCAAGATTCACAAACTCATAAGCGACCTCAGTAATGCGGATGTTTTCCAACAATCACAACAGCGAAAGTGGATGTATGAAGCGTTGAAGGACAACTTACAAGCAATTGCTCAAACACCCAATCAATTGGTCACGAAACATTCTGTTAAGGGCAAGTGTAGATTGTTCGACTTATACCTGCGTCAAAATGAGGAAGCCAACACATACTTCCAACCTTTGATGGGTGCGTATCAGAAGAGTGTTTTGAGTCGAGAAGCATACATCAAGGACATAATGAAGTACTCAACACCGATCATAATTGGCAAAGTCGACTGTGATGCGTTTGAAACTGTTGTTGATTTCTTCATCATTCAACTCAGAGAGTTTGGGATCGAAACTTGCAATTATATCACATGCCATGAAGACATCTTCAATTCATTGAACATGAAGGCTGCGGTTGGTGCACTCTACACTGGAAAGAAACGAGATTATTTTAAGGAATTCACAGAGGGTGACAAGGAGGAGATCTTAAAGCAAAGTTGCTTTAGATTATTCTCAGGAAAGTTTGGTGTTTGGAATGGCTCCTTGAAATCTGAGCTGCGGGCCAGAGAGAAAGTCGAAGAAGGAAAAACTAGAACCTTCACAGCAGCACCACTTGATTCACTACTCGGAGCAAAGTCATGTGTGGATGATTTCAACAATCAATTTTATGACTTAAACTTGAAGGCTCCTTGGAGTGTTGGAATGACGAAGTTTTACTGTGGATGGGACAATTTGTTGAGTGGATTCCCTGAGGGTTGGATCTATTGTGACGCGGACGGTTCTCGATTCGATAGCTCACTTTCTCCATACTTGATAAACTCAGTTTTACAAATTCGGTTGTCTTTTATGGAAGAGTGGGAGATTGGTGCTCAAATGCTCAAGAACTTGTATACGGAAATCGTCTATACACCAATTGCTACTCCAGACGGGACGATAGTGAAGAAGTTCAAAGGAAACAACAGCGGCCAACCATCAACTGTTGTGGATAACACTCTAATGGTTATTGTATCTATGAAATATAGTTTGTTTAAATTAGGAATAAAGTTAGAAAACCAGGATTCTATATGTAAGTATTATGTTAATGGTGATGATTTAATTATAGCTATTAGACCGGATCACGAGTACATCCTTGATGGACTTCAGGAAATCTTCTACACACTAGGTCTGAATTATGAATTCAATTCAAGAACTAAGAATAAAGCAGACTTGTGGTTCATGTCGCATCAAGGAGTGATGCGAGAGGGAAAATTCATACCAAAGCTTGAGAAGGAAAGAATTGTTTCAATTCTGGAATGGGATCGTTCAGACGAACCTGTTCACAGGTTGGAGGCTATTTGTGCTGCGATGATCGAAGCATGGGGTTATGATGAGTTAGTCCACGAAATCCGAAAGTTTTACTTGTGGGTACTCGATCAAGCTCCATACAATGCACTGGCATTAGAAGGCAAGGCACCATACATCGCAGAGACCGCTCTGAGGAAATTATATCTTAACGAGGAACCAAGTGAATTAGAGCTGGGAGCATACCAAAAAGCCTTCGAAGAGGAAGATGAGGAGAGCGAGGCAATTTTTGAGGTTTCACATCAAGCCAATGACACGGTCGACGCTGGAGCTTCTGGATCAGGAAGTCAACAAGGTCAAACAAAGGAAAAACAGCCTCGAGAGAGTAGGCCAGCACTTGACAAGGATGTTGATGTTGGGACTGTTGGTACTTTTTCTGTGCCACGAATGAAAGTCGTGAGTGACAAAATGAAATTACCAAAAGTTGATGGAAAGGTTGTTTTGAGCGCTGAGCATTTGTTACAGTACAAACCACCACAGCTCGAACTTTCGAACACACGTGCCACTCACAGCCAATTCAAATCATGGTATGAAGAAGTCAAAGGAGCGTACGGAATGGATGATGCCAACATGCAAATTATATTGAATGGTCTGATGGTGTGGTGTATTGAGAATGGAACATCACCAAACATAAATGGAAACTGGGTTATGATGGATGGAGAGGCACAAGTTGAATATCCTTTAAAACCAATCATAGAAAATGCCAAACCCACGTTTCGCCAAATAATGGCCCATTTCAGTGACGTAGCTGAAGCGTACATTGAAATGCGTAATACAACAGAGAAGTACATGCCAAGGTATGGACGTCAGCGCAATCTCAACGACTACCAACTTGCACGTTATGCATTTGACTTTTATGAGATAACGTCGAGGACACCGAATCGTGCACGAGAAGCTCACTTTCAGATGAAAGCAGCAGCTCTACATAACACGAAGACACGAACATTCGGTTTGGATGGGAAAGTTGGAACACAGGAAGAGGACACGGAGAGGCACACAGCAGGGGATGTCAATGCTAATATGCATAGTTTGTTAGGCATGCGATCTATGTAGTTTAAGTGTGTTTCGGTAGGCTTAAGTACTATTAATATAGTAAGTCAATATTAAATATAGTGCTTTCTTTGTTTACCCGTTCGATCCTCCCTTCGGCCTATACTTTAGAGTGTCAATTTGATGAGTGTGGGCTTCCCACGAGTATCTCGCCACTCTCTATGTCTAGGAGCTAAGTTTGCATTTGCACTATGTGAGTATTCATGGTTTTAAAGCAGCCTGGTGCCACCATGAAATGTCAGTATTGTACGTGTTGAACAAGGGAC
| 88,612
|
KJ830761.1
|
Asparagus virus 1
|
Blockus,S., Lesker,T., Maiss,E.
|
Leibniz Universitaet Hannover, Institute for Horticultural Production Systems / Phytomedicine
|
Germany
|
2014-12-03
|
DSMZ PV-0955
|
Asparagus virus 1
|
Potyvirus
|
Potyviridae
|
ssRNA(+)
| 9,741
|
GenBank
| 1
| null | null | null | null | null | null | null |
Asparagus virus 1 isolate DSMZ PV-0955, complete genome
|
AAATTATAAAAACTCAACACAACACAACACAACACAGCACAACACAACTCAACTCAACAACTGAATTCTTAGACTACCATATCTGGATTCAAAACAACCGATCACACAAACCAAACACGCTTTTTAATTTGTAATCGACATGGACTGCATACAGATTGGAAGCATGATCATTTCCATCCCAACCGCGCAGGCATCCACATTAGCCTGCACCGCTGTCAAACCCACATCCACCAAGCCGACACAAGCCGATCTTAAAATGGTTGGCTTTCATCCAAAGGAACCAACTCGCGTAGCATCTGTTACGCCAGTACTAGTGAAGAAAGCCTTATTCAAAAAGGCTGAAGTGGAGAAGAGCGCCCTCGACAAGTGGGCAGAAGCCTATGAAAATGTCAATCATAGGAAGGATGACAAGATAGTCACTACCAGGCGTGGAGTGACAAGGTTTGTTCGCAAGAACCGAAAGGACTTGCGCCGCGAGAGAGATGAGCTGGCTGCAACAGCTCGTGAAAAGTTGGCACAGGAAATTCGCCACCTCAAAATTAGGCGAAACGAAAACCAATTGAAAAATAATCACGTAAGTATTATTTCAAAAATTTCAATTGGTGGAGCTCCCAGATCTGCATCTGAGGAGGAGATCACACCAGTACAGAAGTGGGGTCTCAACAAAACAGCAAGTTCCAAAACTTGCAAGAAACAAACCCATTTGACTGTTTCAAATGGGGAATTCAAGAAACTGCTCCGCTCATTAGCCCAAATAATGCGCGAAAAAGCATCCACAATAGAAATTGTGGAAAAGACAACGCTACGAGCACGTAGCAAAGAGTTTAAGGGACGTCAAAGAATGTTTGTTGACGTACTACATCAAACTGGCATATATCGGTCATTTGATGTAAAGATGGGCTCCTGGACTGAGAGTGTATTTGGATACATGTTTAAGTATTTTGAGAAAGGGCCCATAATACATCACACAAAAATTCAGCCAGGTTGTAGTGGACTCGTCGTACGGAGAAGTTCATTGAAGGACTGCATTTCAGGAAATCACATGGAATTTTTCATTGTGCGTGGTCGAATCAGAAACATTCTCTGCGACGCACGTGCATTTATACCATATGAGTCACTATTTGATGTGCATCACTACTCAAGTCTTGGAGAAAAATTTTGGAAAGGTTTCACCAACGTCTTTCTAGAATTGAAACCAACACAGATTAGCCATGACTGCACATCAGACCTTGATGTTGTTAGATGTGGGGAGGTCTCCGCACTGGTTTGTCAAACAGTGTTTCCTTGTGGAAAAATAACTTGTAACAAATGCGTGGAAAGTTACACGCTCTTGGATGAGGAAAGCAAGAAGGCACAAATTCAACAGTCTTTGGAACGAATTGAGAAAGACTTGACTCACAAGTACACTGATTTCCCTCACGTTCACGAGATTCTGAAGGTGTTTGGAAATTCCTTGTTAATTCCTAACAAGAATTACAAGGCATTTGCTGACATTAAACACATGATCGGGGATCGAACTGAAGCACCTTTTAGTCATGTCAATAAATTGAACGAAATTATAATAAAAGGTAGCATGTCAACAACTGCTGACTATTTTGATGCTTCCAACACTTTGTTGGAGGTAGCAAGATATCTCAAGAATCGGACAGAGAACATACAGAAAGGCTCACTTGCAGCTTTTAGAAATAAAGCTTCTGCGAAAGCACATATCAACACAATCTTGCTGTGTGATAACCAACTTGACAAGAATGGAAATTTCGTTTGGGGAAAAAGAGGCTATCATGCAAAGAGATTCTTTAAGAATTACTTTGAACTTGTTGATCCATCAAATGGATATGCAAAACACATCGTCAGAAATGGACCAAATGGAGAAAGACAACTAGCAATTGGTCATTTGGTTATGTCGACGAATTTCCAAACCTTGAGGCTGCAACTCGAGGGAAACCAAGTTGAAAAATTCCCAGTAACCAAAGCTTGCATCAGTAAACGAAATGAAAATTTCATATATCCATGCTGCTGTGTCACAACCGAAACTGGAGAACCATTGGAGTCACCATTATACACTCCAACAAAAGGTCATCTTGTAATTGGCAACACTGGTGATGCTAAGTATATAGACTTACCTGAGCAGGAGAATGAACGATTGTACATATCACAAGAAGGGTATTGTTATGTAAATGTATTCTTAGCAATGTTGGTGAACGTCAACGAGGATGACGCCAAGAATTTCACAAAGATTGTACGCGACGATGTGGTCAGGAAGCTTGGGAAGTGGCCGACACTGATAGATTTAGCAACTGCTTGCTATTATCTCACAATGTTTTTCCCAGAAACACGAAATGCAGAATTACCTAGAATTCTGGTTGATCATAAACACAACACGATGCATGTCATTGATGCATATGGTTCAAAGAACACAGGATATCACATTTTGAAGGCAGGAACTATTGCACAATTGATCTTATTCGCTAGTGAGTCACTTGATTCTGAGATCAAGGAATATCGCGTTGGAGGCTTGATAGAGGACACAGCTGTTGTACAAACGGGTATCAAAACATTGATTCGATCTATTTACAGACCTAAAATGTTCAAAGAACTCTTGTTGACAGAACCATATTTGATAACTCTGAGTGTTTTATCACCAGGAGTTCTTTTGGCAATGTACAACAATGGATCTTTTGAACAAGCCACTCAAAAATTCATAACACACAATGATTCACTTGCAACCATTTCCACTACTCTGGCATTACTCGCAACGAAAGTCTCTCTCGCACAAACCCTCAATGAGCAATGTAACATAATTGATGCACATGCACAATTATTGTTGCAAGCGATTGGTGAGGGACAAAGTGAGATTAGTCACACAAAACGACTGGCAAAAGAAGCTCTTCAAGTGATGATTGCACAAAATGAGAATAACTCTTCACTCTTGGATGGAGGTTACTTTGTTTTACGCGAATCTTCTAAGGGTTTTACTGAGAAAAAATATCTGCGCCTTTTGGAGGAATCATGGGAAGATCTAAACTTGTTGGAAAAATATTATGCAGTAAGAGCATCATATTCTTGGCGACGCGTTATTCAGCGACCTTTAAACCCCACAAAAGGTGCAGATTTGAAAGGCAGATACGATATATCCATCAATGCATTACTCAAGAAAGCATCTGAAGCCATGAACGTAATTGTCAGGAAGAATTTGGCGAAAGGTGAACTTGTATATAAAAATGTGACAAGGAAAGGTTTAGAGTTATCTTATTCTGCATGTAGATATTTAATACCAGATTTCATGCGTGCTGTTAGTGTTTTAACTGTTTTAAGTTTGTTTGTTTCTTTGATAGCAGCTTTAAATAACATGTTGGTTGCTCATAAACATCTTAAAATGAAAAATTTCGAATTTGAACAACAAATGACTGATAGGACTTTATATAAGTTGTACAAAAGCTTGAAGCGAAACATGAAAGGTAACCCTAGCCTGGAAGAATTCAGAGATTTTGTGGGAGAGAGAAACCCTGAACTGGTTAAGAAAATTGATCCGGATGAGTTTGATCTTGAAGGGGTACAACATCAGCACAAGAGTAAGTCACAAGATACTCTTCAGAAAATCGTCGCTTTTGTAGCATTAATAATGATGACATTTGACGCTGACCGAAGCGATTGTGTGTACAAAATTTTAAACAAGCTGAAGGGGATAATTGGAACAATCGAGTATGAAGTGCAACATCAGGCGATTGATGACATCAAACTTGGTTTGGAGGAGGAGAATACAAAGATTGATTTTGAAGTGTCAACAGATCCACAGCTAGACAAGACATTCAGCGAACCAACTTTTTCTGACTGGTGGAGCAATCAACTAACAAATAATAACGTGATTCCACACTACCGAACTGAAGGATTTTTCATGGAATTCACTCGACAATCCGCCATTGAAGTTTCAAATCAGATTGCACATGGCCCACACATGGATATTTTATTACGAGGTGCAGTAGGATCTGGTAAGTCAACAGGATTACCATATCATCTTTCAAAACGTGGTCAAGTACTGCTACTTGAACCAACAAGACCATTGGCAGAAAACGTCTGTACACAATTGCGCGGAGACCCTTTTCACACAAATCCAACATTGCGTATGCGTGGCATGACTTCATTTGGATCAGCACCAATCACAGTCATGACAAGCGGTTATGCTCTACATTATTTAGCCAACAACCCACATCTTTTGCGCGACTATAACTACATCATATTCGATGAATGTCATGTTAGTGATAGTTCAGCAATGGCTTTTAGGTGTTTGCTACATGAATATAGTTTCAACGGGAAGATAATCAAAGTTTCAGCAACACCACAAGGTAGAGAGGTTGAATTCAAGACACAATTTCCAGTAACTCTTATTACCGAGGAGCATCTCTCTTTCAGTCAGTTTTGTGAAGCCCAGAGAACGAACGCAAAGTGCGATGTTGCGACAAGTGGAGAGAATATCTTGGTCTATGTTGCGAGTTATAACGAAGTGGATCAACTCAGTAGGATGCTTGTCGAAAGGAAGTTTAAGGTGACAAAGGTGGACGGTCGAACAATGAAAGTTGGAAAAGTTGCCATTGAAACACACGGAAGTGTCGGAGCACCTCATTTTATTGTGGCGACCAACATCATTGAGAATGGAGTAACTTTGGATGTGGACACAGTTGTTGATTTTGGGCAGAAAATTTCACCTACACTGGACGTCGACAATCGTTGTATACACTATTCGAAACAATGTGTCACATACGGAGAGCGAATTCAGAGACTTGGAAGAGTTGGACGTCATAAGCAAGGAAAAGCTTTGAGAATAGGTTTCACTGAGAAAGGACAGGTAGCAATACCTGACATTGTAGCCACAGAAGCAGCTTTTCTTTGCTTCACATATGGGTTGCCTGTCATGACACACAATGTTTCAGTTAGTTTACTGTCTAAATGCACGGTTAAACAAGCAAGAACAATGCATTTATTCGAACTACCTGCATTTTATACAGTCAACCTTGTTAGATACGATGGTTCAATGCACAAAGCAATACATGATTTATTGAAACCATATCGTCTGCGAGACTCTGAGATCATACTGAACAAAATGGCAATTCCAACACATGGCTTGACAACTTGGATGAAAGCAATTGATTACAACAAACTTGGGAAGAAGCTTGAACTAGAAGCAGAAACACGTATACCATTCTATGCACGCGACATTCCAGAAATGCTTCACAGACGAGTGTATGAAGCAATGCTCAGATTCAAAGGTGATGCGGGATTCGGAAGAATCTCAACAGCAAGTGCTTGCAAAATCGCGTACACATTGCAAACTGATTTGCAATCCATTCCACGAACAGTGAAACTCATTGATATGTTGATTGAAAAGGAGCAGCAAAAACACGCACATTATCAGCTAGCTATTTCAACATCATGTTCATCTTTCAGTTATTCATTATCCACTCTCAGTGACATTGTTAGAAGAACATATCAGAAGGATCATTCTCTCGAAAACATCAGTATCCTTCAAGCAGCAAAAGCACAAATCCTGTCTTTCAATACGATATCAGAAGATTTTTCTTACGCTGAGCAAAATACTTCCTATCTTTGTGAATCTGTATTGGAGCACACAGCAACGGAGTGCATTTATCATCAATCTGAAGGTGAGCTTGCAAAACATCTGAAGCTCAAGGGATACTGGAATAAGAGTCTTATAACACGTGATATTATTATCATGCTTGGTGTTATTGGTGGGGGTTGTTGGATGGCTTACTCTTATTTCACAGAAAAATTCTCAGAAGAAGTCTCGCATGAAGGGTGGAACCGTAGACAAAAGCAAAAGTTGAAGTTTAGAAATGCGAGAGATGAGAAGCTAGGGAGAGAGGTTTATGGTGATGATGGAACTCTTGAACATTTCTTTGGTGAAGCATATACGAAGAAAGGCAAAACAAAAGGCAAGACGAGAGGAGCTGGGACAAAAACAAGGCGATTTATCAACATGTATGGATATGACCCAGCTGATTATTCGTTTGTTCGATTTGTTGATCCTTTGACAGGGCGGACACTTGATGACTCACCATACACAGATATTGGATTGATACAAGATCATTTTGCTGATGTACGAGATGAGATGATCGCCAACGATGAACTTGATAGGCAGCAATTGCATCTCGGAAACGCCAACAGGATTGAGGCATATTTCATAAACAATGCGACAAAGAAAGCACTGAAAGTTGACATGACACCACACAATCCACTCTTATTCTGTAAGAGTGGCACAGCCATTGCAGGTTTTCCAGAGCGAGAAGGAGAGTTTCGTCAAACAGGAGCAGCAACGCCAATTGACATTGAGAAAGTACCAAAACAGTGTGAAGCATCTGTTGTCACACATGAAGGAAAAGCACTTTTTGGGGGTCTGCGTGATTATAATGGAATCGCAAGTGTTATCTGTCAACTGAGCAACGAATCGGATGGACATGTCGAAACAATGTTTGGAATTGGATATGGTCCCTTCATCGTCACAAATCAGCACCTTTTCAAAAGGAACAATGGAAAACTCACGATAAGGTCACGATCTGGTAAGTTCATCATTGAAGATACAACTGCCATTGATATGTTCCCTTGTAAGAGTTTTGACATATTAATAATGAGACTGCCCAAAGATTTTCCACCATTTCCACAACGTTTAAACTTCAGACAACCTCAAAGTGGCGAGCAAATCTGCATGGTTGGTTCAAATTTTCAAGAGAAGAGCATCACAAGTGTTATTTCTGCAACAAGTGAGACTGTCCCATTTCCCAATAGCCACTTTTGGAAACACTGGATTACAACCAAGAATGGATATTGTGGTCTCCCGCTTGTCGCAGTGAAAGATGGAAACATTGTTGGATTGCATAGCCTAGCAAATTTCGCACAGACACAGAATTACTTTGCGAATTTTCCAGAGAACTTTCAGGATTCTATTCTTAACTCAACCGAGTCACTCAATTGGGTTCAGAGGTGGAAATACAATTCAAGAGAGATTTGCTGGGGAAAGCTCAAGATGCATGAGAGTGTGCCAGATGGACTATTCAAGATTCACAAACTCATAAGCGACCTCAGTAATGCGGATGTTTTCCAACAATCACAACAGCGAAAGTGGATGTATGAAGCGTTGAAGGACAACTTACAAGCAATTGCTCAAACACCCAATCAATTGGTCACGAAACATTCTGTTAAGGGCAAGTGTAGATTGTTCGACTTATACCTGCGTCAAAATGAGGAAGCCAACATATACTTCCAACCTTTGATGGGTGCGTATCAGAAGAGTGTTTTGAGTCGAGAAGCATACATCAAGGACATAATGAAGTACTCAACACCGATCATAATTGGCAAAGTCGACTGTGATGCGTTTGAAACTGTTGTTGATTTCTTCATCATTCAACTCAGAGAGTTTGGGATCGAAACTTGCAATTATATCACATGCCATGAAGACATCTTCAATTCATTGAACATGAAGGCTGCAGTTGGTGCACTCTACACTGGAAAGAAACGAGATTATTTTAAGGAATTCACAGAGGGTGACAAGGAGGAGATCTTAAAGCAAAGTTGCTTTAGATTATTCTCAGGAAAGTTTGGTGTTTGGAATGGCTCCTTGAAATCTGAGCTGCGGGCCAGAGAGAAAGTCGAAGAAGGAAAAACTAGAACCTTCACAGCAGCACCACTTGATTCACTACTCGGAGCAAAGTCATGTGTGGATGATTTCAACAATCAATTTTATGACTTAAACTTGAAGGCTCCTTGGAGTGTTGGAATGACGAAGTTTTACTGTGGATGGGACAATTTGTTGAGTGGATTCCCTGAGGGTTGGATTTATTGTGACGCGGACGGTTCTCGATTCGATAGCTCACTTTCTCCATACTTGATAAACTCAGTTTTACAAATTCGGTTGTCTTTTATGGAAGAGTGGGAGATTGGTGCTCAAATGCTCAAGAACTTGTATACGGAAATCGTCTATACACCAATTGCTACTCCAGACGGGACGATAGTGAAGAAGTTCAAAGGAAACAACAGCGGCCAACCATCAACTGTTGTGGATAACACTCTAATGGTTATTGTATCTATGAAATATAGTTTGTTTAAATTAGGAATAAAGTTAGAAAACCAGGATTCTATATGTAAGTATTATGTTAATGGTGATGATTTAATTATAGCTATTAGACCGGATCACGAGTACATCCTTGATGGACTTCAGGAAATCTTCTACACACTAGGTCTGAATTATGAATTCAATTCAAGAACTAAGAATAAAGCAGACTTGTGGTTCATGTCGCATCAAGGAGTGATGCGAGAGGGAAAATTCATACCAAAGCTTGAGAAGGAAAGAATTGTTTCAATTCTGGAATGGGATCGTTCAGACGAACCTGTTCACAGGTTGGAGGCTATTTGTGCTGCGATGATCGAAGCATGGGGTTATGATGAGTTAGTCCACGAAATCCGAAAGTTTTACTTGTGGGTACTCGATCAAGCTCCATACAATGCACTGGCATTAGAAGGCAAGGCACCATACATCGCAGAGACCGCTCTGAGGAAATTGTATCTTAACGAGGAACCAAGTGAATTAGAGCTGGAAGCATACCAAAAAGCCTTCGAAGAGGAAGATGAGGAGAGCGAGGCAATTTTTGAGGTTTCACATCAAGCCAATGACACGGTCGACGCTGGAGCTTCTGGATCAGGAAGTCAACAAGTTCAAACAAAGGAAAAGCAGCCTCGAGAGAGTAGGCCAGCACTTGACAAGGATGTTGATGTTGGGACTGTTGGCACTTTTTCTGTGCCACGAATGAAAGTCGTGAGTGACAAAATGAAATTACCAAAAGTTGATGGAAAGGTTGTTTTGAGCGCTGAGCATTTGTTACAGTACAAACCACCACAGCTCGAACTTTCGAACACACGTGCCACTCACAGCCAATTCAAATCATGGTATGAAGAAGTCAAAGGAGCGTACGGAATGGATGATGCCAACATGCAAATTATATTGAATGGTCTGATGGTGTGGTGTATTGAGAATGGAACATCACCAAACATAAATGGAAACTGGGTTATGATGGATGGAGAGGTACAAGTTGAATATCCTTTAAAACCAATCATAGAAAATGCCAAACCCACGTTTCGCCAAATAATGGCCCATTTCAGTGACGTAGCTGAAGCGTACATTGAAATGCGTAATACAACAGAGAAGTACATGCCAAGGTATGGACGTCAGCGCAATCTCAACGACTACCAACTTGCACGTTATGCATTTGACTTTTATGAGATAACGTCGAGGACACCGAATCGTGCACGAGAAGCTCACTTTCAGATGAAAGCAGCAGCTCTACATAACACGAAGACACGAACATTCGGTTTGGATGGGAAAGTTGGAACACAGGAAGAGGACACGGAGAGGCACACAGCAGGGGATGTCAATGCTAATATGCATAGTTTGTTAGGCATGCGATCTATGTAGTTTAAGTGTGTTTCGGTAGGCTTAAGTACTATTAATATAGTAAGTCAATATTAAATATAGTGCTTTCTTTGTTTACCCGTTCGATCCTCCCTTCGGCCTATACTTTAGAGTGTCAATTTGATGAGTGTGGGCTTCCCACGAGTATCTCGCCACTCTCTATGTCTAGGAGCTAAGTTTGCATTTGCACTATGTGAGTATTCATGGTTTTAAAGCAGCCTGGTGCCACCATGAAATGTCAGTATTGTACGTGTTGAACAAGGGAC
| 88,613
|
NC_010416.1
|
Asparagus virus 3
|
Hashimoto,M., Ozeki,J., Komatsu,K., Senshu,H., Kagiwada,S., Mori,T., Yamaji,Y., Namba,S., Oshima,K.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2008-03-04
| null |
Asparagus virus 3
|
Potexvirus
|
Alphaflexiviridae
|
ssRNA(+)
| 6,937
|
RefSeq
| 1
| null | null | null | null | null | null |
PRJNA485481
|
Asparagus virus 3, complete genome
|
GAAAACAAAACGACATCGAAACACTCGCAGCTTATCTGSCCATATAAGGGAGAATAACCGCAAACCGCACTATACTCCCATATGGCCAAAGTTCGAGCGTCGTTAGAGAGGATCCGGGACCCATCAGTGCAAACTGCTATCTCAGAAGCAGCTTACGCTCATGTACGCCCCGTCCTCAAAGAAGCATTAGTTAATTGCCCCTACGCCCTCACCGATGCCGAAGCGGACTGTTTAGAAAACTTCGGTATCACTGTAAATCCATACGCCACCCAAACACATACCCACGCCGCATGTAAAGCTATAGAAAATAGATTATTAGAAATAGTAGGTAAACACCTCCCTAAGGAACGCTGCACCATGCTCTTCCTCAAACGCAGCAAACTTAGGTACCTCCGACGTGCCGCCGCTCTCAAAGACGACTTCATCAACCAGGACGTCGAGCCTAAAGACCTCTTCCGGTATGATCGGGACACCATTCGCACCAGACTCAAGGACATCAACACCCCGATCGCCTACATGTCTGACACGCTCCATTTTATGTCTCACTCGGAGCTTATCCATATCTTCGCCGATTCCCCGAAGCTCCAAACCATGTTGGCCACGGTTGTCCTACCAATCGAGGCCGTGCACCGACGCTCCGCCCTATATCCAGCCCTCTACAGCATCAACTACGGACCCAAAGGGTTCGAGTACATTCCTGGAAATCACGGCGGCGGAGCCTACTTCCACCCGTATGACACCTTGGACTGGTTAAAGGTGCGCCAGCTCCAAGGTAAGGACTACTACGGCATCGACACCGACCTCACTCTCACCTTCCAACTCGTCGAAAGCCTCGGGGCCAACCACCTCTTCATCATCCAACGTGGTGACCTCCGCACCCCCCTTATGCGGACCTTCTGCCGCAATGCCCTTGTCACCATGCCCAAAATCTTCTGCCCCGAGTCTATGAACGCCAACCGCCCACTCACCAAAACGAAGGCAATGCAGATGCTCATGTATTGCAAGTCCGTCAAACAAGTGTCAGAGAGAGACATATATGCAAAATTCCGACAGATCATCTCCACGCAAGAGTTGGAGCTGTATGAGCCTGACGAAATAGTGCATTTGTGCAACTACTTCAACTTCGTCGCTCACCTCGACTCCATCACCTGCTACGAAGACCTGTTAGGCAACTCTCTGTGGCGCCGGCTCACCATCCCCATTCGCACCACGATCACCAAGGCCCTAGACTTCTTCCGCGGCCAGCAAAGCTTCAGTAAACTGCTGGGTGCGCTTAAATGGGAATCCTTCTCCTACTCTCTCGAGCCGATCGATTTCACAGTGCGCTACCACAGCGCCTCAGCTCGACTCCTCTCCAGCAAGACCGGTCTCGCTGTCCCAGCCGCTGCCGCCATCATCAAAGACAGCCGGTCCGACCCCACTCTGTTCTCCGAAGAGGACCTCGAAGAAGCCCCCTTCGAGGATTTCCTAGGCCGACTCTCCTTCCCCCCCAACGCCCCCCGCAACGACCCCACTTCCACCGACGACTCCGACGGCTCTCCCGATACACCCGACGACCCACCAGTTGAGCCGTCTCCCGCCGGACCCGCCCCCGCTAACGAAGCCTCCACGTCCAGCACCTCATCAGGCCCGCCTGTCCACCACAGCGACTGGCAGTCAGCAACCATTCTCCATATGCTGACCAACCTACCTTTCCTCCAATTGAAAGGCAGACGGGCATACTTCTTCGCCACCCACCCCGTCATAGATTACGGCCACGACCGTGTGCTTTACTCCACTCTCGCTTGGCCCTCCACGCTTACCGACATCGTCAGCTCTCTTCACATCCTCACCAACGCATGTTTGGTGCAAGTTTATGAAGAAGGAGCTTCCATCCCATGGCACCGGGACAACGAAAGGTGCTATGAGTTTGACCCAATCACTACGCTAAACTTCGGCAAGGCCACCTTTGAATTCGAAGGTGGCGTTGCCCTGAAACTAGACGAAGGTGATTGGTTCTCCATGGCCGGGCCACTACTCCACCTGCGCCACCGAGTCACCGCACATTCTCCCATGCGCATATCCCTCACGTTTCGGTTGCATAAGCACAACATGCTGGGCGTGCCCCTCCCCGACGGCCTGACTCTCCCTTTCACGCCCGCACCAGAAGAACCTACGACACCTCACTCTAACGACGGAACCAGCTCCGGGGCGAATGACACAACCGCCACGAAACCCGACCCCCCCCCCACCAGCTTTCGGTCACCAATCCACCCCGACCCAGCGGCTGACCTCACCAAGCAGCCCGTCACCCCGCTTCCTTGGGCCAGCTGGGTTCCCCTGCTCCAAAACCATGGCTTCGACGGCCAACAAATGCAACACGACCCGGCAGGGAATTTGATCATTCCCGTGCAGGACATCCATCGGCTGGCCCACTGCGCTTACCCTGACGAAGTYCCTGAGTGTCTGCGCCACACCCTCAACACCATCAAGAGGCACCCTGTTGAGATCACCATCGACCACCAACGCGCCAGCTCCTACGCATCCGACATCAAGAATTGCCGCACTGGCAAGCTGCTGGCTCAGATGGACATGAAGTGGAAGGCCTCCTTCGCTTACAAGATGCAGCACGAAAGCAAAACTGTGACTGGCACAGTCATCCACGGGTGCGGGGGTTCAGGCAAGTCACACGCTATCCAAACTTGGATGCGCACTCTCCCCGCTGATCAAACCATTGTCACTGTCATCACACCCACTGTTCTGCTCCGCAACGACTGGAGCACCAAGCTGCCCATCCTCCCCAGCGACGTCTTCAAAACTTTTGAGAAGGCGATCGTTCAACCATGTAACCCGGTGGTCATCTTCGACGACTATACCAAACTCCCACCCGGTTCCATTGAAGCAACCGTCATGCATCACAGCAACATCTCCTACATTGTCCTAACTGGAGATAGCAGACAGTCGGTGTACCACGAGCTCAATGCCGAGGCTTACATCGCCACCTTACCAGAGGCTGTGGACGTCTTCACCCCCTTCTGCGAGTTCTACCTCAACGCTACACACAGAAATGTGCAGTCCCTCGCCAACAAACTGGGAGTCTACTCAGAGAGACAAGGTCGGCTCAAAATAAACTTCGCTTCTCACCACCTCAAGGCTTCTAGGACACCACTGCTGGTGCCCTCCACAATGAAGCGGAATGCTATGGCGGACATGGGTCACCATAGCATGACCTACGCAGGGTGTCAAGGGCTCACCGCACCGAAGATCCAGATCTTGCTTGACAGTCACACCCAGTTCTGTTCCGACCGTGTGTTGTACACCTGCCTCTCCCGCGCCGTCGATTCAATACACTTCATCAACACTGGCCCGACTACCGGCGACTACTGGGCAAAACTCGAGAGCACTCCCTACCTCAAAGCTTTCATTGACACCTACCGGGACGAGAAGACCGAGCTCTACAACAGTGAGCCCGCTTCTGACCAGCCCAGAGAGCCGGAAGCTCCCACCACTCATTTTCCCCTCGCCCCCAAACCACTACTCGAGCCGCTCGTGTCGACACTGCCCACCAAAGAGGAAAGGGAAATTTTCTCTCGCTCCACCGGCTACTCCGACACCATCCAAACCGAAGATCCGGAAGTGCAGCTCTTCCAGCACCAACAAGCCCGAGACGAAACCCTATACTGGGCCACTATTGACGCTCGCCTCTCTCTCGCCACCCCCGAAGAGAATCTCCAAGAATTCAACATGAAAAAAGACGTGGGAGACATCCTCTTCATGAACTACGCCAAAGTCATGAACCTCCCCGCCGAGCCGGTGGAGTTCGAAGAGAGATTGTGGGAGGTTTCTGCTGCTGAAGTCAGAAACGTCTACCTCAGCAAGCCTGTGGGTAACCTCATCAACGCAGCCGCCCGCCAATCACCCGACTTCCCAAAACACAAAATCGCCCTTTTCCTGAAGTCTCAGTGGGTGAAGAAGGTCGAGAAATTGGGTGCTCTCAAAGTGAAGCCCGGACAGACTATCGCCTCCTTCATGCAGGAAACTGTGATGCTCTACGGGACGATGGCCCGTTACTTACGCAAAATGAGGCAAAGATTCCAGCCGCCCAACATCTTCATCAACTGCGAGCGAACTCCTGAGGACTTGGACACCTTTGTCAAAACTCAATGGAATTTCGCCCGCCCAGCCCACACCAACGACTTCACCGCCTTCGACCAATCTCAGGATGGCGCCATGCTGCAATTTGAGGTCATGAAAGCTAAATTCTTCAACGTGCCCTCCGAGATCATCGAGGGATACATTTACATCAAGCTTAACGCGGCCATCTTCCTCGGGACTCTGGGCATCATGCGCCTGTCTGGCGAGGGTCCAACTTTCGACGCAAATACCGAATGCTCCATCGCCTACAACGCCACCCGCTTCCACATTGACAGCGGTACCGCCCAGGTTTACGCTGGAGATGACATGGCCCTTGACCGCATCTGCCCCGAGAAGAGCAGCTTCCACCGTTTGGAACGACAACTCAAGCTCACATCCAAACCCATGTTCCCAAAGCAAGTCAAAGGGGATTACGCTGAATTCTGCGGCTGGGTCATCACCCCTGCCGGCATCATTAAGCATTCCCTGAAGATGTACGCCTCCATCCAACTCCAGAAGAAGCTGAACAACATCAAAGAGAGTGCCCGTTCTTACGCTCTCGACCTCCGTTACGCTTACAAGCTGGGTGATTCACTCCAAGATCACCTCACAGAAGAGGAGGCCGCCTACCACCAACAATCCGTGCGGGACATGCATCTCCTCCACCAATCAGAGACTCTCGCCCACGGACCCTCCAGCCCGCCACACCACTTCGCCACAACAGAACCCATCCGCACCAAAACACAGAAGAGAAACGCCACCAAGCGTAAACAAAAAGTGCGGTTGGCCGACATTGCACCACCCGCTTACTAGCGGGGTTAAGTAGCCTTTTCTTTTTCTTTGAAATGGAAATTAGTTATATAGTAGATCTTTTGAACTTCTTAGGCTTTACCCGTTCCAGCCGTCCCTTCTCCTTGCCCCTCGTTGTGCACGGTGTCGCCGGTTCTGGCAAAACTCACCTCTTGCGGAAAGTCTCCCTCCATTTCCCCGAGTTGGTTCACTGCAGTTTCACCCCCCAACTCATCGATCCAAATTCCGGTAGGCGCCAACTCCCAGCTTCCGAAACACCCACCGACCTGCTCGACGAATACCTCGGCGGGCCGAACCCAGTCGTGCGCCTGCTGAAAGTTTGCGATCCGCTCCAATACAACTGCCCAGATCCGGAGATCCCACACTTCCAATCCCTCACCACCAGACGGTTCTGCCCCCTCACGACCACCCTGCTCAACTCACTGTTCGGCACCAACATCGTATCAGCCGTCCCCACCTGCTGCCGCATCGAGATCCAAGACCCGTATTCCACTGATCCCATCGGCACCGTGGTCACTTTCTCTCCCGAGATCCACACTCTTCTATCCAGACACGGTTGCCAACCAACTCCGATTTCCGAACTCTGGGGCCTTAACATCCGTGTGGTGTCTTGCTACGTCGATTCTCTTGAAGAGGCCCTTCTGAACCACCGCGCTCCATTATTCTTGGCACTCACCCGACACACCGCCGAACTTCACATCTTCCTCTTCGATGCCCGGACTGACGCCGCCTACGAACTACGAAAGTGTCTTCAAGATCCTCGCCATCGGGGCTCTTAGTTGCCTTTCTATCTACTCCCTCCGCACTAACCACCTTCCTCACACCGGCGACAACATACATCACCTTCCGCACGGTGGCAACTACGCTGACGGCACAAAACGCGTGCAATACTTTCGCCCCAGCGCCCCTGTCCATGGCAGTTCAAAATTCACCGCCGCCTGCGCCATTCTTTTCCTCACTCTGCTCATCCTTGCTCAGTCTCAATGGCCTGCTCGTGCTGTCCGTTGTTCTGTGCGCGTATGCGGCCACTGTCACCCCGACTCCACCATGCCAAGTAATAGTGACCGGTGAGGCTGTACGCATCATCGGCTGCGCTGAACCTAGCCACATCCTCGCCAATCTCAATCTAGCACCCTGGAACGGGGTTAAGTTTCCTATTTTACAGGTTTGAAATTATTTGTTTTCTTTCTTTAGGATCCCCTACCCCACAATAAAGCTTCATGGCGAACACCACTAAAGACTCGACTTCCACCAAGGCGCCTGAACCCGTCCCAGTCGACCTCTCCGACCCTACCCGGGCGCCCTCGTTGAAAGACCTGCAGGCCATCAAGTACGTTTCCACCACCACCGCTGTGGCCACCCCGGACGAGATCAAACTGCTTGGCGACCTCTTCAAGAAACTCGGTGTCGACGGTGCCTCTGTGGGCCCCGCCATGTGGGATCTTGCCCGCGCCTACGCCGATGTCCAATCCAGTCGCTCCGCCACACTCTCCGGCACCACACCGTCCAATCCAGCCATCACTCGCCAAGCCCTGGCGCGCCAATTCTACGTCATCAACATCACACCGCGCCAATTCTGCATGTACTTCGCGAAGGTCGTCTGGAACATGATGATCGACTCTAATGTGCCACCAGCTGGTTGGGTTAAACATGGGCTCCCAGAAGATTGCAAGTTCGCTGGCTTCGATTTCTTCGAAGGCGTACTTTCACCCTCCTCGCTCGACCCCGCCGACGGCTTGATCCGTCAACCCTCCCAGCGTGAAGTCCAGGCTCATTCTACCGCCAAATATGGAGCTCTCGCCCGCCAGCGTATCCAGAACGGTAACTTCGTGTCCAACTTGGCCGAGGTCACCCGCGGACGTGCTGGCGGCGTGAATTCCATGTACGCCATCGAAGCTCCCCCCGAACTATAATTGCATTAGCCAACTTAAATTAATGCGTGGGTTTCTATAGTTTATTTCCCACAGCAGACTATCATATTTACTCTCTTTGAGCGTTAATAAGTACGTGTGTT
| 7,871
|
NC_003400.1
|
Asparagus virus 3
|
Che,J., Zheng,H.Y., Chen,J.P., Adams,M.J.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2002-02-06
| null |
Asparagus virus 3
|
Potexvirus
|
Alphaflexiviridae
|
ssRNA(+)
| 6,985
|
RefSeq
| 1
|
China:Zhejiang: Hangzhou
|
China
|
Allium chinense
| null | null | null |
PRJNA485481
|
Scallion virus X, complete genome
|
GGAAAACAAAACAACACAGAAACACTCGCAACTTAACTGCCCATATAAGGAGAATAACCGCACCCCGCACTATAATCCCATATGGCCAGAGTACGAGCGTCGTTGGAGAAGATCCGGGACCCATCTGTACAAACAGCTATCTCTGAAGCTGCTTACGCACATGTACGCCCTGTTCTAAAAGAAGCCCTCGTTAATTGCCCCTATGCTCTCAATGATGCCGAAGCGGACTGCCTTGAAAACTTCGGTATTACTGTAAATCCGTACGCCACCCAAACTCACACACACGCCGCTTGTAAAGCGATAGAGAATAGGATGTTAGAAATAGTAGGTAAACATCTCCCAAAAGAACGCTGCACAATGCTTTTCCTGAAACGCAGCAAGCTAAGATACCTTAGACGTGCCGCAGCCTTGAAAGATGACTTCATCAACCAGGACATTGAACCTAAGGACCTTTTTCGTTACGATCGGGATACTATACGAACCCGCCTTAAGGATATTACTACCCCAATAGCCTATATGTCCGACACCCTACACTTCATGTCCCACACGGAGTTGATGTTGCTTTTCGCTGATTCTCCGCCACTCCAGACCATGTTGGCCACTTTAGTCTTGCCGATCGAGGCTATGCATCGCCGCACCACGCTATACCCCGCCCTCTACAGCATCAACTACGGGCCCAAAGGATTTGAGTACATACCAGGTAATCATGGGGGAGGTGCCTACTTCCACCCCTACGACACCCTAGACTGGCTTAAAGTGCGCCAACTCCGGGGGGAAGACCATCACGGAATTGACCCCACTATTACACTCACTTTCCAGCTGGTGGAAAGCCTGGGCGCTAACCATCTCTTTATCATCCAACGAGGCGACCTCCGGACTCCGCTGGTACGCACATTCTGTAGAGACACACTGGTCACCATGCCCAAAATCTTTTGCCCCGACTCCATGAATGCCAACCGTCCCCTCACCAAGACAAAAGCCATGCAGATGCTGATGTATTGCAAATCTGTCAAGCAAGTAAGTGAACGGGACATCTACGCAAAGTTCCGACAAATGATCTCCACCCCTGAACTGGAGCTTTACGAGCCCGACGAGATGGTGCACCTCTGTAACTACTTTCACTTCGTAGCTCATTTGGACTCAATCACTTGCTACGACGACCTCCTAGGCAATTCTTTATGGGCGACGCCTCACCATCCCCGTACGCACCAAAGTCACCCAATTTTAGACTTCTTCCGTGGACAGAACAATTTCAGTAAGCTGCTGGCTGCACTTAAATGGGAACCCTTTTCCTATTCCCTGGAGCCTAACGACTTCACCGTGTCATACGACGGCCATTCCGCTCGCGCCCTTGCCGACAGGACTGGACTGTCTCTCACCGTCGCTGCCGCAACCATCAAAGACAGTCGGGCCGACCCCACACTCTTCACCGAGGCTGACCTAGAAGATACTCCTTTTGAGGACTTTCTAGGCCGTCTAACTTACCCCATTCCAACCAACCAGGAGGGGTCACCGCGTGACACGGAGCCAGAAAGCCCATCTATTAGCGGCGCCACACAAGTCTTCCATTTCAACACCTCAGCGCAGGCTTTAACCAGCTCCCCAGAGTCCCCCCAGGCACAAGAGTGGCCTGAAGTTCACCACAGCAGCTGGTTGGCCGCTACTTTCCATCACATGCTCGGTGAATTGCCATTCGCACAAACTGTAGGCAGACGCACCTACCTCTTCGCCTCACCGCCCGTGCTCTTCTCTGACCCAGACCTCACCCACCACACCAATTTAGCCTGGCAACCCATTCTCTCCGATGTGGTTGATTCCTTGGGCATTAGCGCCACCGCCTGCTTCATACAGGTGTACGACGAAGGCCTCAACCAACCATGGCGCTGCAACTACGGAAGAAAACCCGAGTCCGATGTCATCTCGACCTTAACTTTAGGCCAGGCCGAGCTCGAGTTAGCTGGTGGGAAACGCCTCAGCTTGAAAGAAGGTGACTGGTTCACCATCAACGGCCCTTTACTCCAGCGGGGTCACCATATCTCAGTGGGCTCGCCACAATGCATCACACTCACTTTCTGGCTGCACATGAGCCCCGTGGCAAGCGCATCACCACTCCAGAACTGGCTTTCCGTCCAACCCACCTCGCCGGCAGAAAGCTCACGGGGAAAGTGTGCTCCCAACTTGGCACACCAGCCCTCCAATCCTGTTGACACCCACTATGTCCCGAGCCGCAACCGAGCTCAAAGTCTTACAACCGACAACACGCCGCTCATACACAAGGCTGTCAGCACTCGCACCCCACTCACGCCAATCCCAGACGACGTGGCCACTGCTAATTCCACGTGTGCCATACCATGGGTCAGTTGGGTGCCCCTCCTCCAGAGCCACGGTTTCGATGGCACACAACTCCAGCACGACCCCGCCGGCAGTTTAATCATCCCCGTCCAAGACATTCGGCGGCTTGCCCATGCTAATTACCCCGAAGAGGTGCCCGCTAGCTTGCAGGACACTTTGAATGCCATCAAGCGCTTCCCCGTGACGATTAAAATTGACCACCAACGAGCCAGCTCATACGCCTCCGACATCAAAAATTGTAGAACTGGCAAGTTGCTTACCCAGATGGACCTCAAATGGAAGTCTTCCTTCGCTTACAAGATGCAGCACGAGGATAAGCAGGTAGCCGGCACTGTCATTCATGGGTGCGGCGGCTCTGGCAAATCTCACGCCATCCAAAAGTGGATGCGCACTCTCCCCGCGGATCAGAGCACGGTCACGGTCATCACCCCCACAGTCATCCTCCGGAACGACTGGGGCACCAAACTGCCCATCTTGCCCAGCGAAACCTTTAAAACCTTTGAGAAGGGCATCATCCAGCCTTGCAACCCAGTTGTGATCTTCGACGACTATACCAAACTGCCCCCCGGATCCATAGAAGCCACGGTCATGCACCATAGCAACATATCCTACATAGTGCTCACTGGAGACAGCCGGCAGTCTGTGTACCACGAACTCAACGCCGAAGCTTACATCGCCACGCTGCCTGAAGCTGTCGATGTCTTCACCCCGTTTTGCGAATTCTACCTCAATGCCACCCACCGCAACGTCCAAGCTTTGGCCAACAAGCTGGGGGTTTATTCAGAGCGCCAAGGTAGACTTAAAGTCAATTTCGCCTCCCACCACCTCAAGGCCTCCAGGACGCCTCTGCTAGTGCCCTCCACCATGAAGCGGAATGCCATGGCGGACATGGGCCACCACGGTATGACATATGCCGGATGCCAAGGACTCACGGCCCCAAAAATCCAAATTCTTCTGGACAATCACACTCAATTCTGCTCCGACCGGGTGCTCTATACCTGCCTCTCTCGCGCGGTTGACTCCATCCACTTCATAAACACTGGGCCCACCACGGGGGACTATTGGACCAAGCTTGAGAGCACTCCATACTTGAAAGCTTTCATTGACACCTACAGGGACGAGAAGACGGAGCTTTACAATGCCGAACCAGCATCTGACGCCCCCGTCGAACCCGAAGCCCCTTGCACCCACTTCCCACCAGCGCCCAAACCGTTACTCGAGCCCCTCGTTTCCGAGTTATCTGCCAAAGAGGATAGGGAGATCTTCTCTAAGTCCGCCGGCTACTCCGACACCATCCAGACGGAAGACCCCGAGGTCCAATTATTTCAGCACCAACAAGCCAAAGACGAGACTTTATATTGGGCCACCATCGACGCTCGGCTTTCACTTGCCACCCCCGAGGATAATCTACTCGAATTTAACATGAAGAGAGATGTGGGCGACATCCTCTTTATGAACTACGCTAAAGTCATGAACCTCCCCGCTGAACCTGTCCAATTCGAGGAGCGATTGTGGGAAATCTCCGCTGCTGAGGTGCGCAATGTCTACCTTAGCAAACCCATCGGCAATCTTGTCAATGCTGCCTCCCGTCAGTCTCCCGACTTTCCAAAGCATAAAATAGCCCTCTTTCTGAAATCTCAGTGGGTTAAGAAAGTAGAAAAGCTGGGTGCACTTAAAGTCAAGCCAGGGCAAACCATAGCTTCTTTCATGCAGGAAACCGTTATGTTGTATGGCACGATGGCCCGATACTTGCGTAAGATGCGTCAGCGCTTCCAGCCACCGAACATTTTCATCAACTGCGAGCGGACGCCAGACGACCTAGACGTCTTTGTCAAGACCCATTGGAACTTCTCCCGCCCCGCCCACACCAATGACTTCACCGCGTTCGACCAATCTCAAGACGGCGCCATGCTACAGTTTGAAGTTATGAAAGCTAAGTTCTTTAACGTGCCCTCCGAAATCATCGAAGGCTACATTTACATCAAACTGAACGCTGCCATTTTCCTAGGCACTCTTGGCATAATGCGACTTTCCGGAGAGGGGCCTACTTTTGATGCCAATACTGAATGCTCAATCGCCTACAACGCCACTCGCTTCCACATTGACAGTGGAACTGCCCAGGTTTACGCCGGCGACGACATGGCCCTCGACCGCATCTGCCCGGAGAAATCTAGCTTCCACAGACTGGAAAACCAGCTCAAACTTACTTCCAAGCCTATGTTTCCGCGGCAAACAACCGGTGATTACGCAGAATTCTGTGGCTGGGTGTTCACTCCCGCCGGGATTATCAAACATTCACTCAAGATGTACGCCTCTATCCAGCTTCAGAAGAAATTGAATAATATTAAGGAAAGTGCTCGCTCTTATGCGCTGGACCTCCGGTATGCCTACAAATTGGGCGATAATCTCCAGGAGCATCTAACCGAGGAGGAAGCCGCGTACCATCAACAATCCGTGCGGGACATGCATTTGCTGCACCAGGCCGAAGTTCTCGCACATGGCTCGTCTAGTCCGCCGCACTCATTTTCAACGGCCGAGCCTAACCGTACAAAGACCCAAAAGCGTAATGCCACCAAGCGGAAATCCAAAGTGCGAATTGCCGAAATTCTACCCCCGGACTACTAACGGGGTTAAGTAACCTTTTAGTATTTCGATATGGAAGTTAGTTATATTGTAGAACTTTTAGATTTTCTTGGTTTCACCCGTTCCAGACGTCCCTTTTCCCTTCCCCTGGTAGTACACGGCGTCGCAGGCTCCGGCAAAACCTACCTCCTTCGCAAAGTCAGTTCACACTTTCCCCACCTGGTCCACTGCAGTTTCGCCCCCCAAATCATAGACTCAAATTCAGGTCGCAAACAGGCGCCCGTCACTTCAGAACCTACGGACCTCCTTGACGAATATTTGGGCGGCCCCAATCCCTTGGTACGGCTGTTGAAAGTTTGCGATCCGCTCCAGTACGACTGCCCCGAGCCTGAAGTACCACATTACGTCTCACTCACCACCAGGCGGTTTTGCCCATTAACTACGACCCTGCTTAACTCCCTGTTTGGGTGCGACATAGTTTCTCTCGTCGATCGCAACTGTCATATACAAATTCACGACCCCTACACAGACGACCCAATTGGAACCGTCGTCTCCCTCTCCCCCGACATTGGTGCGTTACTCCTCCGTCACGGCTGCGCAACAACGCCCATCGCCGACTTGTGGGATGTCAATCTCAGTGTTGTCTCCTGCTACTTGCACTCCCTAGAAGAGGCCCTCACCCACTACCGGGCCCCTTTGTTTCTGACTCTTACACGACACACAGCTGAACTGCACATCTTCCTTTTCGATGCCCGGACTGACGCCGCCCACGAACTACGAAACCGTCTTCAAGATTTTGGCCATAGGAGCTCTTAGTTGTCTCTCCATCTACGCACTCCGTGCCAATCAACTACCTCACACGGGTGACAATATTCACCACCTACCCCACGGCGGCAACTACGCAGACGGTACCAAGAGGATCCAATACTTCCGACCCGGCGGCAACCTACATGACCACTCCAAATTCACAGCAGGGTGTGTCGTCTTCTTCCTCACTCTCCTCATTTTGGTTCAGTCTCAATGGCCTTCTCGTACTATCCGGAGTTCTGTTCATGTTTGCACTCATTGCCCCCAAACCCCAACCCTGTCTGGTGATCATCACCGGTGAGGCAGTGCGCATCTCTGGCTGCGCAGACCCAAGCCTTATCTTAGCCCACATCAACCTCGCACCCTGGAACGGGGTTAAGTTTCCTATTTCCTAGTTTGAAAATTTTATTTAGTTTAGTATTGAACGTTTCGGGTTAACCCTCATGGACAAATTAGACGCTGGACAACCTCAGCGCAAGCAAGCAGAACCTGTCCCCGCCGACCTTTCCGATCCCACCCGCGCTCCCTCACTCAAAGAGCTGCAGGCTGTCAAATACGTGTCAACCACCACCTCAGTCGCTACGCCGGACGAAATCAAACAACTCGGCGAACTCTTCCAGAAGCTCGGTGTAGACGGTTCTTCCATAGGCCCAGCAATGTGGGATCTTGCACGTGCTTACGCCGATGTACAATCTAGTCGCTCTGCGATGCTGGCTGGCACCACCCCATCTAACCCCGCCATAACTCGCCAGGCCCTTGCACGCCAATTTTACATAGTCAACATCACTCCACGGCAGTTCTGCATGTACTTCGCAAAGGTAGTTTGGAATATGATGATCGACTCAAACGTGCCCCCCGCTGGTTGGGTAAAACATGGGCTCCCCGAAGATTGCAAGTTCGCCGGCTTCGTCTTCTTTGAAGGCGTGCTTTCACCTTCATCGCTCGACCCCGCCGACGGCTTGATCCGTCACCCCTCCCAGCGTGAGATCCAGGCACATTCAACCGCCAAATACGGAGCCCTTGCGCGCCAGCGGATCCAAAATGGAAACTTCGTGTCAAACTTGGCCGAGGTCACCCACGGACGCGCTGGCGGAGTCAACTCTATGTACGCCATTGAGGCCCCCCCCGAACTATAATAGCATTAGGCAACTTAAATTAATGCGTGGTTTTCTACAGTTTATTTTCCACATCAGACTCTCCATCCTACTAGCTTTATCCGCATGTATGAATGTAAGTTTGTTTT
| 8,598
|
MN059098.1
|
Asparagus virus 3
|
Jo,Y., Cho,W.K.
|
Seoul National University, Research Institute of Agriculture and Life Sciences, College of Agriculture and Life Sciences
|
Korea
|
2020-06-13
|
G87
|
Asparagus virus 3
|
Potexvirus
|
Alphaflexiviridae
|
ssRNA(+)
| 6,976
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Allium sativum
| null |
2017-10-11
| null | null |
Asparagus virus 3 isolate G87, complete genome
|
GAAAACAAAACAACATCAAACACTCGCAACTTAACTGCCCATATAAGGAGAATAACCGCACACCGCACTATACTCCCATATGGCCAGAGTCCGAGCGTCGTTGGAGAAGATCCGGGACCCATCTGTACAAACAGCAATCTCTGAAGCTGCATATGCACATGTACGCCCCGTTCTCAAAGAAGCCCTCGTCAACTGCCCATACGCACTCAACGATGCCGAAGCAGACTGCCTAGAAAGTTTCGGCATCACCGTGAATCCATACGCCACGCAAACCCACACACACGCCGCTTGTAAAGCTATAGAAAATAGAATGTTAGAAATAGTAGGTAGACACCTCCCTAAGGAACGCTGCACTATGCTCTTTCTAAAACGCAGCAAATTAAGATATCTTAGACGCGCCGCCGCATTAAAAGACGATTTCTTGAATCAAGACATTGAGCCTAAAGACCTCTTCCGCTACGATCGAGACACCATTCGCACCCGACTGAAAAATATTGCTACTCCCATAGCTTACATATCGGACACACTCCACTTCATGTCTCGCTTGGAGCTAATGATGCTCTTTTCCGACTCCCCGCAACTCCAAACCTTGTTAGCCACTCTAGTTTTGCCCGTGGAAGCCATGCACCGCCGTACTACACTCTACCCCGCACTTTACAGCGTCAACTATGGGCCTAAAGGTTTCGAATATATACCCGGAAATCACGGCGGTGGAGCTTACTTCCACCCCTACGACACCTTAGACTGGCTTAAAGTGCGACAACTCAGGGGGGAGGACCACCACGGCATTGACCCCACCATCACCCTTACTTTCCAACTTGTCGAAAGCCTAGGCGCCAACCACCTTTTCATCATTCAACGCGGTGACCTTCGGACCCCACTGGTACGAACGTTTTGCAGGGATACCCTCGTGACTATGCCTAAAGTGTTTTGCCCTGATTCTATGAACGCCAATCGTCCCCTCAGCAAGACCAAGGCCATGCAGATGCTGATGTACTGCAAGTCGGTTAAGCAGGTCAGCGAACGGGACATCTACGCAAAATTTCGACAGATGATCTCAACGCCCGAGCTAGAACTTTACGAGCCCGACGAGATAGTGCATCTCTGCAATTACTTTCACTTTATAACCCACCTGGACTCCATCACCTGCTACGAAGATCTGCTGGGCAATTCCCTCTGGAGGCGGCTCACCATCCCTGTGCGTACCAAAATCACTCAATTTCTAGATTTCTTCCGGGGCCAAAATAACTTCAGCAAACTGCTTGCCGCTCTCAAGTGGGAATCGTTTTCCTACTCCTTGGAACCCACCGACTTCACCGTAACATACGACGGCCATGCCACCCGGGCCCTGTCGGACAGGCTTAGCTTGCCTCTCGCAGATGCAGCCACCATCATTAAGGACAGCCGGTCGGATCCAACCCTTTTCACCGAGGAAGACTTGGAGGACACCCCATTTGAGGACTTCCTCGATCGGCTCAAGTATCCCCCACACCACTACAAGGCTGAAATTACCTCACCCAGTGGAACCAACACCCCTGCTACCAACATTTCCCCACAACCTCCCCAGTCCGGAACTCATTCCCCTGCGCCTACCAGCATTCCCGACTCTGTAAACGATCGGGAAAACATTGAGATCCACAATAGCAGTTGGTTAGCTGCCACTATACACCATATGCTGGCGGACCTGCCTTTCGTCCAATCGGAAAGTAAGCGCACCTATTTTTTCGCTTCTCCACCCGTACTCCTCTCTGATCCAGACCTCACTCACCACACTAACCTAGCCTGGCCGCCCATTCTGTCCGACATGGTTGACTCCCTCAACATTAACGCCAACGCTTGTTTCGTGCAGGTGTACGACAACGGTTACAGCCGACCCTGGCGATGTGACTACGGACGCAAGCCGGAATCTGACGCCATCACGACCCTGATACTGGGCGAGGTCAACCTTAAAGCCGGAGGGGAGGCCGAAATCCCGCTAAAGGAAGGGGACTGGTTCACCATTAGCGGAGCACTCCTGACACGCTGCCACCATATCTCGGTCAGATCAGCCCTATGCATCTCTCTCACTTTCTGGGTCCACGGCAGCCCTGTGCTAAGCGCACTACCCACCGAAGGATGGACAACTCCCCAATCAGCCCCATTTTCTGTCCATTCACGCCAACAGCTCGACGGAGGACCTCCATGCCAACCGGCTGATTGCTCCGGCAGCCCCCAGCCGCATTTTCTCGAGCGTCCTCAGATTTCCACGGTCGACAGCACACCGCCCATCCCAAAGGCTACTAGCTTCCGCGCCCCTCTCCAGCCGACCGCCGTAGAGACCGCCACGACCAACCCTGATGGTGCTCTGCCCTGGACGACCTGGGTGCCTCTCCTCCAAAGTCATGGTTTTGACGGCAAGCAACTCCAGTATGACCCCACAGGCAACCTGATTGTGCCCGTCCAGGACATCCGCCGTTTAGACCATGCCCGTTACCCAGACGAGGTGCCAGTCAGCCTACAAGACACTTTGAATGCAATCAAACGGTTCCCTGTGGAAATTAGAATGGACCATCAACGAGCCAGTTCTTACGCCTCAGACATTAAAAATTGCCGAACCGGTAAGTTGCTCACCCAAATGGACACTAAATGGAAGGCCTCCTTTGCCTATAAAATGCAACATGAGGATAAATACGTAGCCGGCACGGTCATCCATGGGTGTGGTGGCTCCGGCAAGTCCCACGCCATTCAGACGTGGATGCGTACACTACCCGCAGACCAGAACACAGTCACCATCATTACTCCCACCGTCATCCTCAGAAACGACTGGAGCACCAAGTTACCAATACTACCCAGTGACGTCTTTAAAACCTTTGAGAAGGCCATCATCCAGCCCTGTAACCCAGTTGTGATTTTTGACGACTACACCAAGCTTCCTCCAGGTTCTATCGAGGCTACCGTGATGCACCACAGTAACATAGCTTATGTAGTTCTCACTGGAGACAGTCGCCAATCAGTCTATCACGAAATCAACCCTGAGGCTTACATTGCCATGCTACCGGAGGCGGTCGACGTTTTCACTCCTTTCTGTGAGTTTTATTTGAACGCCACCCACCGTAATGTGCAAGCCCTGGCCAACAAACTGGGCGTTTATTCCGAACGTCAAGGCCGACTCAAAGTCAATTTCGCCTCTCACCACCTCAAAGCATCCAGAACACCGTTGCTTGTGCCCTCTACAATGAAGAGGAACGCCATGGCGGACATGGGCCACCATAGCATGACGTACGCAGGCTGTCAAGGTCTCACTGCCCCAAAGATCCAAATACTTCTTGACAATCACACCCAATTTTGTTCGGACCGGGTGCTTTACACGTGTCTCTCCCGCGCGGTAGACTCAATACACTTCATAAATACAGGGCCCACCACCGGGGACTACTGGACCAAACTCGAAAGCACGCCATACTTGAAGGCGTTCATAGACACCTACCGGGACGAAAAGACGGAGATGTACAACAGCGACCCTGCTTCTGAAGCTCCCACCGAGCCGGAAGCTCCTAGCACACATTTCCCACTAGCACCAAAACCACTGCTCGAACCTATTGTGTCCGAGCTACCCGCCAAAGAGGCGAGAGAAATTTTCTCCCATTCCGCTGGGTACTCTGACACCATCCAGACTGAAGACCCAGTCGTACAACTATTCCAACATCAACAGGCTAGGGACGAGACTCTATATTGGGCTACCATCGAAGCTAGGCTTTCCCTCTCCACTCCTGAAGACAACTTGTCAGAGTTCAACATGAAGCGAGATGTGGGAGACATCCTCTTCATGAACTACTCAAAAGTCATGAACCTCCCCGCCGAACCAGTTGAATTCGAGGAACGCTTATGGGAGATCTCCGCCGCCGAAGTGAGGAATGTCTATCTCAGCAAACCTATCGGGAATTTGGTCAACGCTGCCTCCCGACAGTCTCCAGACTTCCCAAAACACAAAATTGCACTCTTCCTAAAATCTCAATGGGTGAAGAAAGTCGAGAAATTAGGGGCCCTAAAGGTCAAGCCGGGACAAACCATAGCTTCGTTCATGCAGGAAACAGTGATGCTTTACGGCACAATGGCCCGATACTTGCGCAAGATGCGCCAACGCTTCCAACCGCCGAATATTTTCATCAACTGCGAAAAAACTCCCGACGACCTCGACTCCTTTGTGAAAACCCATTGGAACTTTGCACGTCCGGCCCACACTAACGATTTCACAGCGTTCGACCAGTCGCAAGACGGGGCAATGCTGCAATTCGAAGTTATGAAAGCGAAATTCTTCAATGTGCCCCCAGAAATTATAGAAGGTTACATTTACATCAAACTAAATGCAGCTATCTTCCTCGGCACCCTCGGCATCATGCGTCTCTCCGGAGAGGGGCCTACATTTGACGCTAATACGGAATGCTCCATCGCCTACAACGCCACGCGATTTCACATCGACAGCGGCACGGCTCAAGTTTACGCCGGTGACGACATGGCCCTAGATCGCATATGCCCAGAGAAAGCCAGCTTCCACCGGCTGGAGAATCAGCTTAAACTGACCTCCAAGCCTATGTTCCCACGACAGACCACGGGGGATTACGCAGAATTCTGTGGCTGGGTTTTCACCCCCGCGGGCATCATCAAACATTCCCTTAAGATGTACGCTTCTATTCAACTCCAAAAGAAGCTGAACAACATCAAAGAAAGTGCCCGCTCGTACGCCCTAGATCTTAGGTACGCTTACAAATTGGGTGACAGTCTTCAAGAGCATCTAACAGAAGAAGAGGCGGCATACCACCAACAATCCGTACGGGACATGCACCTATTACACCAGGCTGAGGTCCTAGCCCATGGCTCCTCCAGTCCGCCACATCCATTCTCTACCGCAGAGGCTGCCCGCACGAAAACGCAAAAACGCAATGCCACGAAACGAAAACAGAAAGTGCGGATTGCAGAAATTCTACCCCCCGATTACTAACGGGGTTAAGTAACCTTTTAATATTTGAAATGGAAGTTAGTTATACTATAGAATTGTTAGATTTTCTAGATTTCACCCGTTCCAGACGCCCCTTCTCTCTTCCGCTAGTTGTCCACGGAGTCGCCGGCTCAGGCAAAACTCACCTCCTCCGCAAAATCAGCGCACACTTTCCCGACTTGACCCACTGCAGCTTTGCCCCCCAAATTATTGATCCAGACTCTGGCCGCAAGCAGTCGCCCGTCACCACCGAGCCAACAGACCTCCTTGACGAATACTTAGGCGGCCCAAACCCAGTCGTCCGGCTCTTAAAGGTCTGCGACCCACTGCAATACGACTGCCCTGAACCAGAGGTGCCGCACTACTTCTCGCTCACCACTAGGAGATTTTGCCCTCGGACTACCACCCTCCTGAACTCCCTCTTTGGTTGCCACATTGTCTCACTCGTCAACACCACTTGCCAAGTTCAGCTCCACGACCCCTACACGGAAGATCCTCTAGGCACCGTTGTCTCACTCTCTCCCGACATCACCAGGTTGCTCCTTCGACACGGTTGCGCAACCACACCAATCTCAGATTTGTGGGGTGCAAACCTCAGCGTGGTCTCCTGCTACCTCCATTCTCTCGAGGACGCCCTCACCCATTACCGTGCCCCCCTGTTTCTGACTCTTACTCGCCATACCACCGAGCTGCACATCTTTCTCTTCAATGCCCGGACTGACGCCGCCCACCAATTACGAAAGCGTCTTCAAGATTTTGGCGATCGGAGCTCTTAGCTGCCTCTCTATTTACGCACTCCGCGCCAATCAGCTTCCGCACACAGGCGACAACGTCCACCATTTGCCCCACGGAGGGAATTACGCGGACGGCACGAAACGCATCCAGTACTTCCGACCTGGAGGCAAGTTGCATGACCACTCCAAGTTCACTGCCGGGTGTGTCGTCCTTTTCCTCACCCTCCTCATCCTGGTTCAGTCTCAATGGCCTTCTCGCACTATCCGTAGCTCTGTGCATGTTTGCACTCATTGTTCCCAAGCCCCAACCCTGCCTGGTGATCATCACCGGTGAGTCCGTGAGCATCTCCGGATGTCCAGACCCGAGCCTTATCCTAGCCCATCTCAACTTAGCACCTTGGAACGGGGTTAAGTTTCCTATTTAACAGTGTGAAATAATATTAATCTAGTCTCTTGAACACTTGAATAAAGCTTCATGGACAAATTGGACGCCGGCCAGCCCCAACGCAAGAAAGTAGAGCCGGCCCCCGCCGACCTCTCCGATCCCACCAGAGCCCCTTCACTCAAGGAGTTGCAGGCCGTCAAGTATGTTTCTACTACCACTTCCGTAGCCACCCCAGATGAGATTAAACAACTCGGCGAACTTTTCCAAAAATTGGGCATTGACGGGGCTTCCGTCGGCCCAGCCATGTGGGACCTTGCTAGAGCTTACGCCGACGTGCAATCGAGCCGCTCTGCCGTGCTTTCTGGGACCACACCCTCCAACCCCACCATCTCCCGCCAGGCTCTCGCCCGTCAATTCTACATCATCAACATCACCCCGCGCCAATTCTGCATGTATTTCGCCAAGGTGGTCTGGAACATGATGATAGACTCAAATGTACCTCCCGCTGGTTGGGTTAAACATGGGCTCCCAGAAGATTGCAAGTTCGCCGGATTCGACTTCTTCGAAGGCGTGCTTTCACCTTCATCGCTCGACCCCGCCGATGGTCTAATCCGTCATCCCTCCCAGCGTGAGATCCAGGCTCATTCCACCGCCAAGTACGGGGCACTCGCACGTCAGCGTATCCAGAACGGTAACTTTGTGTCAAACTTGGCTGAAGTTACCCACGGACGCGCCGGCGGCGTTAACTCCATGTACGCCATCGAAGCCCCCCCTGAACTTTAATAGCATTAGCCAACTTAAATTAATGCGTGGTTTTCTACATTTTCTTTTCCACAGCCGACTTTCCATCTTTCCTGCTTTAATAGTGTGAACGATTGTAAGAGC
| 49,140
|
KJ544560.1
|
Asparagus virus 3
|
Wylie,S.J., Li,H., Saqib,M., Jones,M.G., Jones,M.G.K.
|
Murdoch University, Plant Virology, WA State Agricultural Biotechnology Centre
|
Australia
|
2014-08-27
|
SW12
|
Asparagus virus 3
|
Potexvirus
|
Alphaflexiviridae
|
ssRNA(+)
| 6,398
|
GenBank
| 1
|
Australia
|
Australia
|
Allium vineale
| null |
2013-01-16
| null | null |
Asparagus virus 3 isolate SW12, complete genome
|
GGAAAACAAAACAACCCCGAAACACCCGCAACTTAACTGCCCATATAAGGAGAATAACCGCAAATCGCACTATACTCCCATATGGCTAGAGTTCGAGCGTCGTTGGAGAAGATCCGGGACCCATCAGTACAAACAGCCATATCTGAGGCTGCTTACGCTCATGTCCGCCCTGTTCTCAAAGAAGCCCTTGTCAACTGCCCCTACGCACTCAGCGATGCCGAAGCTGACTGTCTCGAGAACTTCGGCATCACCATCAACCCCTATGCCACTCAAACTCACACCCACGCCGCCTGCAAGGCGGTCGAAAATCGGATGCTAGAAATCGTGGGTAAACACCTTCCAAAAGAACGCTGCACCATGCTCTTCCTAAAACGCAGCAAGCTACGATATCTTCGACGTGCTGCCGCTCTTAAAGACGATTTCGTCAACAAAGACGTCGAGCCCAAAGACCTGTTCAGATACGATCGGGACACCATTCGGACTAGACTCAAAGGCATAAGCACCCCGATCGCATACATGTCCGACACGCTCCACTTCATGTCCCACCTGGAGCTCATGTTACTATTCTCTGACTCCCCCCAGCTTCAAACGATGCTTGCTACAGTCGTCTTACCAATTGAAGCAATCCACCACCGCACTTCCCTTTACCCTACGCTTTACAGCATAAATTACGGACCAAAAGGGTTTGAGTACATCCCCGGGAATCACGGGGGGGGCGCCTACTTCCATCCCTACGCCACCCTGGACTGGCTTAAAGTACGACAACTCCGGGGGGTAGACTACTACGGGATTGACCCTGATATCACCCTTACCTTCCAGCTGGTTGAAAGCCTGGGCGCCAACCATCTTTTCATCATCCAACGAGGTGACCTCAAGACGCCTCAGGTGCGTACTTTTTGCCGCAATGCACTGGTCACTATGCCCAAAATCTTCTGCCCCGACTCCATGAACGCGAACCGGCCTCTCACCAAAACTAAAGCCATGCAAATGCTGATGTACTGCAAGTCCGTCAAGCAGGTCACCGAACGCGACATCTACGCAAAGTTCCGGCAGATGATCTCCACTCAAGAGTTGGAACTCTACGAGCCCGACGAAATAGTGCATCTTTGCAACTATTTCCACTTCATAGCCCACCTGGACTCCATCTCATGCTATGAGGACTTGCTGGGCAACTCACTTTGGCGGCGCCTAACTATCCCGGTGCGCACTAAGATCAACCAATTCCTTGACCTCTTCCGCGGCCAGAGTGGCTTCACCAAGCTATTATCCGCTCTGAAGTGGGAAGCCTTCTCTTACTCGCTGGAGCCCACCGACTCCACCGTCCATTACAACGGCCACTCAGCTCGCGCTTTGTCTCACAAGTTAGGCATTCCACTCCCTAGCGCAGCGTCGATTTTACAGGACAGTCGCGCAGACCCCTCTCTCTTCACTGAAGCCGATCTGGAGGAAGCCCCTTTTGAGGATTTCTTGGGCAGACTCAACTTTCCAATTAATCCACACCCAGAAACAACCCCTTCGGTTGATTGCCCAGACGGCACGGCGCCCGACGACACTCCAGTCACCCCCGGCCCATGCTCCACATCGGCGGACCAAGCCCACTCAGACCCACAACCGTCGAAATCCCAACCCACACAGGCCCCAGGCCCTACGCAGACAGTGGACCCCAACGACGATTCCACCGCACCAAGGCCAACTAGTTTCCGGGAACCCCTGTCAGATCCCACCTCTGAATCCTCGAACGCGGGCCCTAACATTCTCGTCCCTTGGGCCAGCTGGGTACCACTCCTTCAGAGCCATGGTTTCGACGGGCAACAACTACAAAATGACCCGGAAGGGAATTTGATCATCCCAGTCCAAGATATCCGCCGACTAGCGCACTGCCCGTACCCAGACGAGGTCCCGACCAGCCTCCAGACCACCCTCAACGCCATTAAGCGTTACCCCGTATCAATCCAAATAGACCACCAGCGGGCCAGCTCCTACGCCTCGGACATCAAGAATTGCCGAACTGGCAAGTTGCTCACACAGATGGACGCAAAATGGAAAGCAGCCTTCGCCTACAAAATGCAGCACGAAGACAAGACCGTGGCAGGCACTGTCATACATGGTTGCGGCGGTTCAGGCAAATCACACGCCATACAAGAATGGATGCGAAAGCTCCCCGCTGACCAAAACGTGGTCACTGTCGTAACCCCCACAGTCATCCTTCGCAACGACTGGAGCACCAAGCTGCCTATACTGCCGAGCGAAACCTTCAAGACCTTCGAAAAGGCCATCGTCCAGCCCTGTAACGCCGTCGTGGTTTTCGACGATTACACGAAGCTTCCTCCGGGATCCATAGAAGCGACGGTGATGCACCACAGCAACATATCCTACATCATCCTCACGGGGGACAGTCGGCAGTCCGTCTACCATGAACTCAACGCTGAGGCCTACATTGCCACCCTCCCCGAAGCCGTGGACGTCTTCACGCCATTTTGCGAATTCTACCTCAACGCCACGCATCGCAACGTCCAGGGCCTAGCCAACAAACTGGGGGTCTACTCAGAGCGGCCAGGTAAACTCAAGGTCCACTTTGCCTCCCACCACCTCAAAGCCTCAAGGACCCCGTTGCTGGTGCCATCTACCATGAAACGCAACGCCATGTCGGACATGGGCCACCACAGTATGACCTACGCTGGCTGCCAGGGTCTCACAGCCCCAAAAGTCCAGATACTGCTCGACAACCATACACAATTCTGTTCCGATCGGGTGCTCTACACTTGCCTCTCTAGGGCCGTCGACTCCATACATTTCATCAACACGGGGCCCACCACCGGCGACTATTGGGCCAAGCTGGAGAGCACACCCTATCTGAAAGCTTTCATAGACACTTATAGGGACGAGAAAACTGAGCTCTACAACGGCGAGCCCGCCTCCGATTTGCCCACAGAACCTGAGCCTCCTATTACGCACTTCCCCCTCGCGCCCAAACCCCTACTCGAACCGCTGGTGTCCGAGTTGCCCACGAAAGAAGCTAGGGAAATCTTTTCCCAGTCCACCGGGTACTCCGACACCATTCAGACCGAAGACCCCGAGGTCCAGCTCTTCCAACACCAGCAAGCGAAGGACGAGACCCTCTATTGGGCCACCATTGACGCACGCCTCTCACTAGCCACGCCGGAAGAGAATCTGCGGGAGTTTAATATGAAGAAAGATGTGGGGGACATACTTTTTATGAACTACGCACAAGTCATGCAGCTCCCCGCTGAGCCCGTCGAATTCGAAGAGCGGCTTTGGGAGATCTCCGCGGCCGAGGTGCGCAATGTGTACCTCAGCAAGCCCATCGGTAACCTCGTCAACGCCGCGACCCGTCAATCTCCCGATTTTCCAAAGCACAAGATAGCACTCTTCCTGAAGTCCCAGTGGGTCAAGAAAACGGAAAAGTTAGGGGCTCTCAAGGTCAAGCCTGGCCAGACCATAGCCTCATTTATGCAGGAAACCGTGATGCTATACGGGACCATGGCCCGGTACCTACGCAAGATGCGCCAGCGTTTCCAACCCAAGAACATATTCATCAATTGTGAGACAACGCCAGACGACCTAGACGCCTTTGTGAAAACACACTGGGACTTCACCAGGCCTGCGCACACCAACGACTTCACTGCCTTTGACCAATCGCAAGATGGGGCAATGCTACAGTTCGAAGTGATGAAAGCCAAATTCTTCAACGTACCCTCCGAAATCATTGAGGGTTATATTTTCATTAAACTAAACGCCGCTATCTTCCTAGGCACCCTCGGCATCATGCGCCTCTCAGGGGAAGGGCCCACATTTGACGCCAACACAGAATGTTCCATAGCTTACAACGCAACGCGTTTCCACATCAACGATGGCACTGCCCAGGTTTACGCAGGGGATGACATGGCCCTGGACCGCATTTGTCCGGAGAAGGCAAGCTTTCATAGGTTGGAAAAACAACTCAAACTCACCTCCAAACCTATGTTCCCCCGGCAAACCGTCGGGGATTACGCCGAGTTTTGCGGCTGGGTCTTCACACCAGCCGGTATCATCAAGCACTCTCTAAAGATGTATGCCTCAATACAGCTGCAGAAGAAATTGAACAACATCAAAGAGAGCGCTCGCTCCTACGCTTTAGATCTACGCTACGCCTACAAGTTAGGCGACGACCTTCAGGAGCATCTAACCGAAGAAGAAGCAGCCTACCACCAGCAGTCTGTCCGCGACATGCACTTGTTACATCAAGCTGAGACACTTGCCCATGGCTCTTCTAGTCCCCCACACCAGTTCTCCACGGCGGAAACTGGTCGCACCAGAACCCAAAAGCGGAACGACACAAAAAAGAAAAGACGGGTGCGGATTGCCGAAATCCTACCCCCCGACTACTAACGGGGTTAAGTAGCCTTTCATTTTCTTTGAAATGGAAGTTAATTACATAGTAGAACTTTTAGATTTTCTAGGATTCTCCCGTTCCACACGTCCCTTCTCACTACCTCTTGTAGTCCACGGTGTGGCCGGTTCAGGCAAAACACATCTTCTCCGCAAAGTCAGTCTCCACTTCCCTCACCTCACACACAGCAGCTTCACTCCCCAGATTATTGACCCAGACTCCGGCAGGAAACAGAAGCTAGTAACGTCCGAACCGACAGACTTGCTGGACGAGTATCTAGGAGGCCCTAATCCGACAGTGAGCTTACTCAAGGTCTGTGATCCACTACAGTACGACTGCCCTGACCCAGAGGTGCCACACTACGTCTCGCTGGTGACCCGACGCTTCTGTCCCCGGACCGCCAACCTGCTCAACACACTTTTCGGTTGTCACATTACTTCTCTAGTCTCTGCGGATTGCGACATCCAGATCCACGACCCCTACGTCGACGACCCGTCCGGTACCGTAGTCACTTTCACCTCCGATATTCACACATTGCTCACAAGCCACGGTTGCACACCCACGCCCGTCTCTGAACTGTGGGGCGTCAATTTGCGCGTTGTCTCGTGCTATCTTCAATCTCTTGAAGACGCGCTCTGCCATCACCGTGCGCCCTTGTTTCTGACGCTTACTCGCCACACAGCCGAACTACACATATTTCTCTTCGATGCCCGGACTGACCTCGCCGACGAATTACGAAAGCGTCTTCAAGATTTTGGCCATCGGAGCCCTTAGCTGTTTAACTATCTACTCGCTTAGGTCCAGTCAGCTCCCGCACACTGGGGACAACATTCACCATCTCCCGCACGGTGGAAATTACGCCGACGGCACCAAGAGAATACAGTACTTTCAGCCAGGCGGGAATACTCCAGACTATGCCAAATTCCGAGCCGGGTGCGTCGTCCTCTTTCTCACCGCTCTCATTCTTATTCAGTCTAAATGGGCTACTCGCCATCTCCGCACTTCTGTGCGTGTGTGTTCTCATTGCTCCCACTCCACAACCATGTCAGGTATTAGTGACCGGTGACGCCGTGCGCATCACAGGCTGCCAAGACCCGAGCCGCATCCTCGCCAACCTTAATCTAGCGCCCTGGAACGGGGTTAAGTTTCCTATTTTATAGTTTGAAATATTCTTAGTTCTAGACACTTCCTTTCAGTTTCAATAAAATCTCGATGGCAAACTTGGACGCTGGCGTGCCACAACGCAAGAAAACCGAGCCTGTTCCGGCCGACCTTTCCGACCCCACCCGCGCACCCTCTCTCAAGGATTTACAGGCCGTCAAATATGTTTCAACCACCACCTCAGTCGCCACGCCCGACGAAATCAGGCAACTCGGCGAACTCTTCCAGAAGCTCGGCGTCGACGGAGCTTCCGTCGGCCCCGCAATGTGGGATCTTGCACGTGCTTACGCCGATGTATCTAATCGCTCTGCGATGCTGGCTGGCACCACCCCATCTAACCCCGCCATAACCCGCCAAGCTCTCGCCCGCCAGTTCTACATTATCAACATCACGCCACGCCAATTCTGCATGTACTTTGCTAAGGTTGTCTGGAACATGATGATCGACTCCAATGTGCCCCCCGCTGGCTGGGTTAAACATGGGCTCCCCGAAGACTGTAAGTTCGCCGGTTTTGATTTCTTCGAAGGCGTACTCTCACCTTCATCGCTCGACCCCGCAGACGGCTTGATACGTCACCCCTCCCAGCGCGAAATCCAAGCCCACTCCCCCCCCAAATACGGAGCCCTTGCGCGCCAGCGCATCCAGAACGGAAACTTCGTGTCCAATCTGGCCGAGGTCACCCACGGACGCGCGGGCGGAGTCAACTCCATGTATGCCATTGAGGCCCCCCCCGACCTATAATAGCATTAGGCAACTTAAATTAATGCGTGGTTTTCTACAGTTTATTTTCCACAACACCCGCCCCCTCCTCCCAACCCTATCCGCATGTATGAATGTAAGTTTGTTT
| 89,105
|
AB304848.1
|
Asparagus virus 3
|
Hashimoto,M., Ozeki,J., Komatsu,K., Senshu,H., Kagiwada,S., Mori,T., Yamaji,Y., Namba,S., Oshima,K.
|
Graduate School of Agricultural and Life Sciences, Department of Agricultural and Environmental Biology, Laboratory of Plant Pathology; 1-1-1 Yayoi, Bunkyo-ku, Tokyo 113-8657
|
Japan
|
2008-03-01
| null |
Asparagus virus 3
|
Potexvirus
|
Alphaflexiviridae
|
ssRNA(+)
| 6,937
|
GenBank
| 1
| null | null | null | null | null | null | null |
Asparagus virus 3 genomic RNA, complete genome
|
GAAAACAAAACGACATCGAAACACTCGCAGCTTATCTGSCCATATAAGGGAGAATAACCGCAAACCGCACTATACTCCCATATGGCCAAAGTTCGAGCGTCGTTAGAGAGGATCCGGGACCCATCAGTGCAAACTGCTATCTCAGAAGCAGCTTACGCTCATGTACGCCCCGTCCTCAAAGAAGCATTAGTTAATTGCCCCTACGCCCTCACCGATGCCGAAGCGGACTGTTTAGAAAACTTCGGTATCACTGTAAATCCATACGCCACCCAAACACATACCCACGCCGCATGTAAAGCTATAGAAAATAGATTATTAGAAATAGTAGGTAAACACCTCCCTAAGGAACGCTGCACCATGCTCTTCCTCAAACGCAGCAAACTTAGGTACCTCCGACGTGCCGCCGCTCTCAAAGACGACTTCATCAACCAGGACGTCGAGCCTAAAGACCTCTTCCGGTATGATCGGGACACCATTCGCACCAGACTCAAGGACATCAACACCCCGATCGCCTACATGTCTGACACGCTCCATTTTATGTCTCACTCGGAGCTTATCCATATCTTCGCCGATTCCCCGAAGCTCCAAACCATGTTGGCCACGGTTGTCCTACCAATCGAGGCCGTGCACCGACGCTCCGCCCTATATCCAGCCCTCTACAGCATCAACTACGGACCCAAAGGGTTCGAGTACATTCCTGGAAATCACGGCGGCGGAGCCTACTTCCACCCGTATGACACCTTGGACTGGTTAAAGGTGCGCCAGCTCCAAGGTAAGGACTACTACGGCATCGACACCGACCTCACTCTCACCTTCCAACTCGTCGAAAGCCTCGGGGCCAACCACCTCTTCATCATCCAACGTGGTGACCTCCGCACCCCCCTTATGCGGACCTTCTGCCGCAATGCCCTTGTCACCATGCCCAAAATCTTCTGCCCCGAGTCTATGAACGCCAACCGCCCACTCACCAAAACGAAGGCAATGCAGATGCTCATGTATTGCAAGTCCGTCAAACAAGTGTCAGAGAGAGACATATATGCAAAATTCCGACAGATCATCTCCACGCAAGAGTTGGAGCTGTATGAGCCTGACGAAATAGTGCATTTGTGCAACTACTTCAACTTCGTCGCTCACCTCGACTCCATCACCTGCTACGAAGACCTGTTAGGCAACTCTCTGTGGCGCCGGCTCACCATCCCCATTCGCACCACGATCACCAAGGCCCTAGACTTCTTCCGCGGCCAGCAAAGCTTCAGTAAACTGCTGGGTGCGCTTAAATGGGAATCCTTCTCCTACTCTCTCGAGCCGATCGATTTCACAGTGCGCTACCACAGCGCCTCAGCTCGACTCCTCTCCAGCAAGACCGGTCTCGCTGTCCCAGCCGCTGCCGCCATCATCAAAGACAGCCGGTCCGACCCCACTCTGTTCTCCGAAGAGGACCTCGAAGAAGCCCCCTTCGAGGATTTCCTAGGCCGACTCTCCTTCCCCCCCAACGCCCCCCGCAACGACCCCACTTCCACCGACGACTCCGACGGCTCTCCCGATACACCCGACGACCCACCAGTTGAGCCGTCTCCCGCCGGACCCGCCCCCGCTAACGAAGCCTCCACGTCCAGCACCTCATCAGGCCCGCCTGTCCACCACAGCGACTGGCAGTCAGCAACCATTCTCCATATGCTGACCAACCTACCTTTCCTCCAATTGAAAGGCAGACGGGCATACTTCTTCGCCACCCACCCCGTCATAGATTACGGCCACGACCGTGTGCTTTACTCCACTCTCGCTTGGCCCTCCACGCTTACCGACATCGTCAGCTCTCTTCACATCCTCACCAACGCATGTTTGGTGCAAGTTTATGAAGAAGGAGCTTCCATCCCATGGCACCGGGACAACGAAAGGTGCTATGAGTTTGACCCAATCACTACGCTAAACTTCGGCAAGGCCACCTTTGAATTCGAAGGTGGCGTTGCCCTGAAACTAGACGAAGGTGATTGGTTCTCCATGGCCGGGCCACTACTCCACCTGCGCCACCGAGTCACCGCACATTCTCCCATGCGCATATCCCTCACGTTTCGGTTGCATAAGCACAACATGCTGGGCGTGCCCCTCCCCGACGGCCTGACTCTCCCTTTCACGCCCGCACCAGAAGAACCTACGACACCTCACTCTAACGACGGAACCAGCTCCGGGGCGAATGACACAACCGCCACGAAACCCGACCCCCCCCCCACCAGCTTTCGGTCACCAATCCACCCCGACCCAGCGGCTGACCTCACCAAGCAGCCCGTCACCCCGCTTCCTTGGGCCAGCTGGGTTCCCCTGCTCCAAAACCATGGCTTCGACGGCCAACAAATGCAACACGACCCGGCAGGGAATTTGATCATTCCCGTGCAGGACATCCATCGGCTGGCCCACTGCGCTTACCCTGACGAAGTYCCTGAGTGTCTGCGCCACACCCTCAACACCATCAAGAGGCACCCTGTTGAGATCACCATCGACCACCAACGCGCCAGCTCCTACGCATCCGACATCAAGAATTGCCGCACTGGCAAGCTGCTGGCTCAGATGGACATGAAGTGGAAGGCCTCCTTCGCTTACAAGATGCAGCACGAAAGCAAAACTGTGACTGGCACAGTCATCCACGGGTGCGGGGGTTCAGGCAAGTCACACGCTATCCAAACTTGGATGCGCACTCTCCCCGCTGATCAAACCATTGTCACTGTCATCACACCCACTGTTCTGCTCCGCAACGACTGGAGCACCAAGCTGCCCATCCTCCCCAGCGACGTCTTCAAAACTTTTGAGAAGGCGATCGTTCAACCATGTAACCCGGTGGTCATCTTCGACGACTATACCAAACTCCCACCCGGTTCCATTGAAGCAACCGTCATGCATCACAGCAACATCTCCTACATTGTCCTAACTGGAGATAGCAGACAGTCGGTGTACCACGAGCTCAATGCCGAGGCTTACATCGCCACCTTACCAGAGGCTGTGGACGTCTTCACCCCCTTCTGCGAGTTCTACCTCAACGCTACACACAGAAATGTGCAGTCCCTCGCCAACAAACTGGGAGTCTACTCAGAGAGACAAGGTCGGCTCAAAATAAACTTCGCTTCTCACCACCTCAAGGCTTCTAGGACACCACTGCTGGTGCCCTCCACAATGAAGCGGAATGCTATGGCGGACATGGGTCACCATAGCATGACCTACGCAGGGTGTCAAGGGCTCACCGCACCGAAGATCCAGATCTTGCTTGACAGTCACACCCAGTTCTGTTCCGACCGTGTGTTGTACACCTGCCTCTCCCGCGCCGTCGATTCAATACACTTCATCAACACTGGCCCGACTACCGGCGACTACTGGGCAAAACTCGAGAGCACTCCCTACCTCAAAGCTTTCATTGACACCTACCGGGACGAGAAGACCGAGCTCTACAACAGTGAGCCCGCTTCTGACCAGCCCAGAGAGCCGGAAGCTCCCACCACTCATTTTCCCCTCGCCCCCAAACCACTACTCGAGCCGCTCGTGTCGACACTGCCCACCAAAGAGGAAAGGGAAATTTTCTCTCGCTCCACCGGCTACTCCGACACCATCCAAACCGAAGATCCGGAAGTGCAGCTCTTCCAGCACCAACAAGCCCGAGACGAAACCCTATACTGGGCCACTATTGACGCTCGCCTCTCTCTCGCCACCCCCGAAGAGAATCTCCAAGAATTCAACATGAAAAAAGACGTGGGAGACATCCTCTTCATGAACTACGCCAAAGTCATGAACCTCCCCGCCGAGCCGGTGGAGTTCGAAGAGAGATTGTGGGAGGTTTCTGCTGCTGAAGTCAGAAACGTCTACCTCAGCAAGCCTGTGGGTAACCTCATCAACGCAGCCGCCCGCCAATCACCCGACTTCCCAAAACACAAAATCGCCCTTTTCCTGAAGTCTCAGTGGGTGAAGAAGGTCGAGAAATTGGGTGCTCTCAAAGTGAAGCCCGGACAGACTATCGCCTCCTTCATGCAGGAAACTGTGATGCTCTACGGGACGATGGCCCGTTACTTACGCAAAATGAGGCAAAGATTCCAGCCGCCCAACATCTTCATCAACTGCGAGCGAACTCCTGAGGACTTGGACACCTTTGTCAAAACTCAATGGAATTTCGCCCGCCCAGCCCACACCAACGACTTCACCGCCTTCGACCAATCTCAGGATGGCGCCATGCTGCAATTTGAGGTCATGAAAGCTAAATTCTTCAACGTGCCCTCCGAGATCATCGAGGGATACATTTACATCAAGCTTAACGCGGCCATCTTCCTCGGGACTCTGGGCATCATGCGCCTGTCTGGCGAGGGTCCAACTTTCGACGCAAATACCGAATGCTCCATCGCCTACAACGCCACCCGCTTCCACATTGACAGCGGTACCGCCCAGGTTTACGCTGGAGATGACATGGCCCTTGACCGCATCTGCCCCGAGAAGAGCAGCTTCCACCGTTTGGAACGACAACTCAAGCTCACATCCAAACCCATGTTCCCAAAGCAAGTCAAAGGGGATTACGCTGAATTCTGCGGCTGGGTCATCACCCCTGCCGGCATCATTAAGCATTCCCTGAAGATGTACGCCTCCATCCAACTCCAGAAGAAGCTGAACAACATCAAAGAGAGTGCCCGTTCTTACGCTCTCGACCTCCGTTACGCTTACAAGCTGGGTGATTCACTCCAAGATCACCTCACAGAAGAGGAGGCCGCCTACCACCAACAATCCGTGCGGGACATGCATCTCCTCCACCAATCAGAGACTCTCGCCCACGGACCCTCCAGCCCGCCACACCACTTCGCCACAACAGAACCCATCCGCACCAAAACACAGAAGAGAAACGCCACCAAGCGTAAACAAAAAGTGCGGTTGGCCGACATTGCACCACCCGCTTACTAGCGGGGTTAAGTAGCCTTTTCTTTTTCTTTGAAATGGAAATTAGTTATATAGTAGATCTTTTGAACTTCTTAGGCTTTACCCGTTCCAGCCGTCCCTTCTCCTTGCCCCTCGTTGTGCACGGTGTCGCCGGTTCTGGCAAAACTCACCTCTTGCGGAAAGTCTCCCTCCATTTCCCCGAGTTGGTTCACTGCAGTTTCACCCCCCAACTCATCGATCCAAATTCCGGTAGGCGCCAACTCCCAGCTTCCGAAACACCCACCGACCTGCTCGACGAATACCTCGGCGGGCCGAACCCAGTCGTGCGCCTGCTGAAAGTTTGCGATCCGCTCCAATACAACTGCCCAGATCCGGAGATCCCACACTTCCAATCCCTCACCACCAGACGGTTCTGCCCCCTCACGACCACCCTGCTCAACTCACTGTTCGGCACCAACATCGTATCAGCCGTCCCCACCTGCTGCCGCATCGAGATCCAAGACCCGTATTCCACTGATCCCATCGGCACCGTGGTCACTTTCTCTCCCGAGATCCACACTCTTCTATCCAGACACGGTTGCCAACCAACTCCGATTTCCGAACTCTGGGGCCTTAACATCCGTGTGGTGTCTTGCTACGTCGATTCTCTTGAAGAGGCCCTTCTGAACCACCGCGCTCCATTATTCTTGGCACTCACCCGACACACCGCCGAACTTCACATCTTCCTCTTCGATGCCCGGACTGACGCCGCCTACGAACTACGAAAGTGTCTTCAAGATCCTCGCCATCGGGGCTCTTAGTTGCCTTTCTATCTACTCCCTCCGCACTAACCACCTTCCTCACACCGGCGACAACATACATCACCTTCCGCACGGTGGCAACTACGCTGACGGCACAAAACGCGTGCAATACTTTCGCCCCAGCGCCCCTGTCCATGGCAGTTCAAAATTCACCGCCGCCTGCGCCATTCTTTTCCTCACTCTGCTCATCCTTGCTCAGTCTCAATGGCCTGCTCGTGCTGTCCGTTGTTCTGTGCGCGTATGCGGCCACTGTCACCCCGACTCCACCATGCCAAGTAATAGTGACCGGTGAGGCTGTACGCATCATCGGCTGCGCTGAACCTAGCCACATCCTCGCCAATCTCAATCTAGCACCCTGGAACGGGGTTAAGTTTCCTATTTTACAGGTTTGAAATTATTTGTTTTCTTTCTTTAGGATCCCCTACCCCACAATAAAGCTTCATGGCGAACACCACTAAAGACTCGACTTCCACCAAGGCGCCTGAACCCGTCCCAGTCGACCTCTCCGACCCTACCCGGGCGCCCTCGTTGAAAGACCTGCAGGCCATCAAGTACGTTTCCACCACCACCGCTGTGGCCACCCCGGACGAGATCAAACTGCTTGGCGACCTCTTCAAGAAACTCGGTGTCGACGGTGCCTCTGTGGGCCCCGCCATGTGGGATCTTGCCCGCGCCTACGCCGATGTCCAATCCAGTCGCTCCGCCACACTCTCCGGCACCACACCGTCCAATCCAGCCATCACTCGCCAAGCCCTGGCGCGCCAATTCTACGTCATCAACATCACACCGCGCCAATTCTGCATGTACTTCGCGAAGGTCGTCTGGAACATGATGATCGACTCTAATGTGCCACCAGCTGGTTGGGTTAAACATGGGCTCCCAGAAGATTGCAAGTTCGCTGGCTTCGATTTCTTCGAAGGCGTACTTTCACCCTCCTCGCTCGACCCCGCCGACGGCTTGATCCGTCAACCCTCCCAGCGTGAAGTCCAGGCTCATTCTACCGCCAAATATGGAGCTCTCGCCCGCCAGCGTATCCAGAACGGTAACTTCGTGTCCAACTTGGCCGAGGTCACCCGCGGACGTGCTGGCGGCGTGAATTCCATGTACGCCATCGAAGCTCCCCCCGAACTATAATTGCATTAGCCAACTTAAATTAATGCGTGGGTTTCTATAGTTTATTTCCCACAGCAGACTATCATATTTACTCTCTTTGAGCGTTAATAAGTACGTGTGTT
| 106,210
|
AJ316085.1
|
Asparagus virus 3
|
Che,J., Zheng,H.Y., Chen,J.P., Adams,M.J.
|
Adams M.J., Plant Pathogen Interactions Division, IACR-Rothamsted, Harpenden, Herts AL5 2JQ
|
United Kingdom
|
2002-02-06
| null |
Asparagus virus 3
|
Potexvirus
|
Alphaflexiviridae
|
ssRNA(+)
| 6,985
|
GenBank
| 1
|
China:Zhejiang, Hangzhou
|
China
|
Allium chinense
| null | null | null | null |
Scallion virus X, complete genome
|
GGAAAACAAAACAACACAGAAACACTCGCAACTTAACTGCCCATATAAGGAGAATAACCGCACCCCGCACTATAATCCCATATGGCCAGAGTACGAGCGTCGTTGGAGAAGATCCGGGACCCATCTGTACAAACAGCTATCTCTGAAGCTGCTTACGCACATGTACGCCCTGTTCTAAAAGAAGCCCTCGTTAATTGCCCCTATGCTCTCAATGATGCCGAAGCGGACTGCCTTGAAAACTTCGGTATTACTGTAAATCCGTACGCCACCCAAACTCACACACACGCCGCTTGTAAAGCGATAGAGAATAGGATGTTAGAAATAGTAGGTAAACATCTCCCAAAAGAACGCTGCACAATGCTTTTCCTGAAACGCAGCAAGCTAAGATACCTTAGACGTGCCGCAGCCTTGAAAGATGACTTCATCAACCAGGACATTGAACCTAAGGACCTTTTTCGTTACGATCGGGATACTATACGAACCCGCCTTAAGGATATTACTACCCCAATAGCCTATATGTCCGACACCCTACACTTCATGTCCCACACGGAGTTGATGTTGCTTTTCGCTGATTCTCCGCCACTCCAGACCATGTTGGCCACTTTAGTCTTGCCGATCGAGGCTATGCATCGCCGCACCACGCTATACCCCGCCCTCTACAGCATCAACTACGGGCCCAAAGGATTTGAGTACATACCAGGTAATCATGGGGGAGGTGCCTACTTCCACCCCTACGACACCCTAGACTGGCTTAAAGTGCGCCAACTCCGGGGGGAAGACCATCACGGAATTGACCCCACTATTACACTCACTTTCCAGCTGGTGGAAAGCCTGGGCGCTAACCATCTCTTTATCATCCAACGAGGCGACCTCCGGACTCCGCTGGTACGCACATTCTGTAGAGACACACTGGTCACCATGCCCAAAATCTTTTGCCCCGACTCCATGAATGCCAACCGTCCCCTCACCAAGACAAAAGCCATGCAGATGCTGATGTATTGCAAATCTGTCAAGCAAGTAAGTGAACGGGACATCTACGCAAAGTTCCGACAAATGATCTCCACCCCTGAACTGGAGCTTTACGAGCCCGACGAGATGGTGCACCTCTGTAACTACTTTCACTTCGTAGCTCATTTGGACTCAATCACTTGCTACGACGACCTCCTAGGCAATTCTTTATGGGCGACGCCTCACCATCCCCGTACGCACCAAAGTCACCCAATTTTAGACTTCTTCCGTGGACAGAACAATTTCAGTAAGCTGCTGGCTGCACTTAAATGGGAACCCTTTTCCTATTCCCTGGAGCCTAACGACTTCACCGTGTCATACGACGGCCATTCCGCTCGCGCCCTTGCCGACAGGACTGGACTGTCTCTCACCGTCGCTGCCGCAACCATCAAAGACAGTCGGGCCGACCCCACACTCTTCACCGAGGCTGACCTAGAAGATACTCCTTTTGAGGACTTTCTAGGCCGTCTAACTTACCCCATTCCAACCAACCAGGAGGGGTCACCGCGTGACACGGAGCCAGAAAGCCCATCTATTAGCGGCGCCACACAAGTCTTCCATTTCAACACCTCAGCGCAGGCTTTAACCAGCTCCCCAGAGTCCCCCCAGGCACAAGAGTGGCCTGAAGTTCACCACAGCAGCTGGTTGGCCGCTACTTTCCATCACATGCTCGGTGAATTGCCATTCGCACAAACTGTAGGCAGACGCACCTACCTCTTCGCCTCACCGCCCGTGCTCTTCTCTGACCCAGACCTCACCCACCACACCAATTTAGCCTGGCAACCCATTCTCTCCGATGTGGTTGATTCCTTGGGCATTAGCGCCACCGCCTGCTTCATACAGGTGTACGACGAAGGCCTCAACCAACCATGGCGCTGCAACTACGGAAGAAAACCCGAGTCCGATGTCATCTCGACCTTAACTTTAGGCCAGGCCGAGCTCGAGTTAGCTGGTGGGAAACGCCTCAGCTTGAAAGAAGGTGACTGGTTCACCATCAACGGCCCTTTACTCCAGCGGGGTCACCATATCTCAGTGGGCTCGCCACAATGCATCACACTCACTTTCTGGCTGCACATGAGCCCCGTGGCAAGCGCATCACCACTCCAGAACTGGCTTTCCGTCCAACCCACCTCGCCGGCAGAAAGCTCACGGGGAAAGTGTGCTCCCAACTTGGCACACCAGCCCTCCAATCCTGTTGACACCCACTATGTCCCGAGCCGCAACCGAGCTCAAAGTCTTACAACCGACAACACGCCGCTCATACACAAGGCTGTCAGCACTCGCACCCCACTCACGCCAATCCCAGACGACGTGGCCACTGCTAATTCCACGTGTGCCATACCATGGGTCAGTTGGGTGCCCCTCCTCCAGAGCCACGGTTTCGATGGCACACAACTCCAGCACGACCCCGCCGGCAGTTTAATCATCCCCGTCCAAGACATTCGGCGGCTTGCCCATGCTAATTACCCCGAAGAGGTGCCCGCTAGCTTGCAGGACACTTTGAATGCCATCAAGCGCTTCCCCGTGACGATTAAAATTGACCACCAACGAGCCAGCTCATACGCCTCCGACATCAAAAATTGTAGAACTGGCAAGTTGCTTACCCAGATGGACCTCAAATGGAAGTCTTCCTTCGCTTACAAGATGCAGCACGAGGATAAGCAGGTAGCCGGCACTGTCATTCATGGGTGCGGCGGCTCTGGCAAATCTCACGCCATCCAAAAGTGGATGCGCACTCTCCCCGCGGATCAGAGCACGGTCACGGTCATCACCCCCACAGTCATCCTCCGGAACGACTGGGGCACCAAACTGCCCATCTTGCCCAGCGAAACCTTTAAAACCTTTGAGAAGGGCATCATCCAGCCTTGCAACCCAGTTGTGATCTTCGACGACTATACCAAACTGCCCCCCGGATCCATAGAAGCCACGGTCATGCACCATAGCAACATATCCTACATAGTGCTCACTGGAGACAGCCGGCAGTCTGTGTACCACGAACTCAACGCCGAAGCTTACATCGCCACGCTGCCTGAAGCTGTCGATGTCTTCACCCCGTTTTGCGAATTCTACCTCAATGCCACCCACCGCAACGTCCAAGCTTTGGCCAACAAGCTGGGGGTTTATTCAGAGCGCCAAGGTAGACTTAAAGTCAATTTCGCCTCCCACCACCTCAAGGCCTCCAGGACGCCTCTGCTAGTGCCCTCCACCATGAAGCGGAATGCCATGGCGGACATGGGCCACCACGGTATGACATATGCCGGATGCCAAGGACTCACGGCCCCAAAAATCCAAATTCTTCTGGACAATCACACTCAATTCTGCTCCGACCGGGTGCTCTATACCTGCCTCTCTCGCGCGGTTGACTCCATCCACTTCATAAACACTGGGCCCACCACGGGGGACTATTGGACCAAGCTTGAGAGCACTCCATACTTGAAAGCTTTCATTGACACCTACAGGGACGAGAAGACGGAGCTTTACAATGCCGAACCAGCATCTGACGCCCCCGTCGAACCCGAAGCCCCTTGCACCCACTTCCCACCAGCGCCCAAACCGTTACTCGAGCCCCTCGTTTCCGAGTTATCTGCCAAAGAGGATAGGGAGATCTTCTCTAAGTCCGCCGGCTACTCCGACACCATCCAGACGGAAGACCCCGAGGTCCAATTATTTCAGCACCAACAAGCCAAAGACGAGACTTTATATTGGGCCACCATCGACGCTCGGCTTTCACTTGCCACCCCCGAGGATAATCTACTCGAATTTAACATGAAGAGAGATGTGGGCGACATCCTCTTTATGAACTACGCTAAAGTCATGAACCTCCCCGCTGAACCTGTCCAATTCGAGGAGCGATTGTGGGAAATCTCCGCTGCTGAGGTGCGCAATGTCTACCTTAGCAAACCCATCGGCAATCTTGTCAATGCTGCCTCCCGTCAGTCTCCCGACTTTCCAAAGCATAAAATAGCCCTCTTTCTGAAATCTCAGTGGGTTAAGAAAGTAGAAAAGCTGGGTGCACTTAAAGTCAAGCCAGGGCAAACCATAGCTTCTTTCATGCAGGAAACCGTTATGTTGTATGGCACGATGGCCCGATACTTGCGTAAGATGCGTCAGCGCTTCCAGCCACCGAACATTTTCATCAACTGCGAGCGGACGCCAGACGACCTAGACGTCTTTGTCAAGACCCATTGGAACTTCTCCCGCCCCGCCCACACCAATGACTTCACCGCGTTCGACCAATCTCAAGACGGCGCCATGCTACAGTTTGAAGTTATGAAAGCTAAGTTCTTTAACGTGCCCTCCGAAATCATCGAAGGCTACATTTACATCAAACTGAACGCTGCCATTTTCCTAGGCACTCTTGGCATAATGCGACTTTCCGGAGAGGGGCCTACTTTTGATGCCAATACTGAATGCTCAATCGCCTACAACGCCACTCGCTTCCACATTGACAGTGGAACTGCCCAGGTTTACGCCGGCGACGACATGGCCCTCGACCGCATCTGCCCGGAGAAATCTAGCTTCCACAGACTGGAAAACCAGCTCAAACTTACTTCCAAGCCTATGTTTCCGCGGCAAACAACCGGTGATTACGCAGAATTCTGTGGCTGGGTGTTCACTCCCGCCGGGATTATCAAACATTCACTCAAGATGTACGCCTCTATCCAGCTTCAGAAGAAATTGAATAATATTAAGGAAAGTGCTCGCTCTTATGCGCTGGACCTCCGGTATGCCTACAAATTGGGCGATAATCTCCAGGAGCATCTAACCGAGGAGGAAGCCGCGTACCATCAACAATCCGTGCGGGACATGCATTTGCTGCACCAGGCCGAAGTTCTCGCACATGGCTCGTCTAGTCCGCCGCACTCATTTTCAACGGCCGAGCCTAACCGTACAAAGACCCAAAAGCGTAATGCCACCAAGCGGAAATCCAAAGTGCGAATTGCCGAAATTCTACCCCCGGACTACTAACGGGGTTAAGTAACCTTTTAGTATTTCGATATGGAAGTTAGTTATATTGTAGAACTTTTAGATTTTCTTGGTTTCACCCGTTCCAGACGTCCCTTTTCCCTTCCCCTGGTAGTACACGGCGTCGCAGGCTCCGGCAAAACCTACCTCCTTCGCAAAGTCAGTTCACACTTTCCCCACCTGGTCCACTGCAGTTTCGCCCCCCAAATCATAGACTCAAATTCAGGTCGCAAACAGGCGCCCGTCACTTCAGAACCTACGGACCTCCTTGACGAATATTTGGGCGGCCCCAATCCCTTGGTACGGCTGTTGAAAGTTTGCGATCCGCTCCAGTACGACTGCCCCGAGCCTGAAGTACCACATTACGTCTCACTCACCACCAGGCGGTTTTGCCCATTAACTACGACCCTGCTTAACTCCCTGTTTGGGTGCGACATAGTTTCTCTCGTCGATCGCAACTGTCATATACAAATTCACGACCCCTACACAGACGACCCAATTGGAACCGTCGTCTCCCTCTCCCCCGACATTGGTGCGTTACTCCTCCGTCACGGCTGCGCAACAACGCCCATCGCCGACTTGTGGGATGTCAATCTCAGTGTTGTCTCCTGCTACTTGCACTCCCTAGAAGAGGCCCTCACCCACTACCGGGCCCCTTTGTTTCTGACTCTTACACGACACACAGCTGAACTGCACATCTTCCTTTTCGATGCCCGGACTGACGCCGCCCACGAACTACGAAACCGTCTTCAAGATTTTGGCCATAGGAGCTCTTAGTTGTCTCTCCATCTACGCACTCCGTGCCAATCAACTACCTCACACGGGTGACAATATTCACCACCTACCCCACGGCGGCAACTACGCAGACGGTACCAAGAGGATCCAATACTTCCGACCCGGCGGCAACCTACATGACCACTCCAAATTCACAGCAGGGTGTGTCGTCTTCTTCCTCACTCTCCTCATTTTGGTTCAGTCTCAATGGCCTTCTCGTACTATCCGGAGTTCTGTTCATGTTTGCACTCATTGCCCCCAAACCCCAACCCTGTCTGGTGATCATCACCGGTGAGGCAGTGCGCATCTCTGGCTGCGCAGACCCAAGCCTTATCTTAGCCCACATCAACCTCGCACCCTGGAACGGGGTTAAGTTTCCTATTTCCTAGTTTGAAAATTTTATTTAGTTTAGTATTGAACGTTTCGGGTTAACCCTCATGGACAAATTAGACGCTGGACAACCTCAGCGCAAGCAAGCAGAACCTGTCCCCGCCGACCTTTCCGATCCCACCCGCGCTCCCTCACTCAAAGAGCTGCAGGCTGTCAAATACGTGTCAACCACCACCTCAGTCGCTACGCCGGACGAAATCAAACAACTCGGCGAACTCTTCCAGAAGCTCGGTGTAGACGGTTCTTCCATAGGCCCAGCAATGTGGGATCTTGCACGTGCTTACGCCGATGTACAATCTAGTCGCTCTGCGATGCTGGCTGGCACCACCCCATCTAACCCCGCCATAACTCGCCAGGCCCTTGCACGCCAATTTTACATAGTCAACATCACTCCACGGCAGTTCTGCATGTACTTCGCAAAGGTAGTTTGGAATATGATGATCGACTCAAACGTGCCCCCCGCTGGTTGGGTAAAACATGGGCTCCCCGAAGATTGCAAGTTCGCCGGCTTCGTCTTCTTTGAAGGCGTGCTTTCACCTTCATCGCTCGACCCCGCCGACGGCTTGATCCGTCACCCCTCCCAGCGTGAGATCCAGGCACATTCAACCGCCAAATACGGAGCCCTTGCGCGCCAGCGGATCCAAAATGGAAACTTCGTGTCAAACTTGGCCGAGGTCACCCACGGACGCGCTGGCGGAGTCAACTCTATGTACGCCATTGAGGCCCCCCCCGAACTATAATAGCATTAGGCAACTTAAATTAATGCGTGGTTTTCTACAGTTTATTTTCCACATCAGACTCTCCATCCTACTAGCTTTATCCGCATGTATGAATGTAAGTTTGTTTT
| 110,853
|
MN920663.1
|
Astroviridae sp.
|
Chen,X., Shan,T., Yang,S., Zhang,W.
|
Jiangsu University, School of Medicine
|
China
|
2020-05-06
|
spa143ast1
|
Astroviridae sp.
| null |
Astroviridae
|
ssRNA(+)
| 6,570
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Aves
|
feces
|
2018
|
SAMN13782218
|
PRJNA600556
|
MAG: Astroviridae sp. isolate spa143ast1, complete genome
|
GTATGGAAACACCCAGGCATGGAGAGAGTTGATGGCCTGTGATGCTTACCAGCTTATAGATGTGATGACAGCGCTGGGTATAAAGGATGACAACACTGTTCGATTTACAGCCGTTAAAAACGGGGACGGTTATGATATCAACCTGCAGACAGTGAAGCTCCCAAGTCAGGAAGAAGCACTCCTACGGGCTCAGGCAAGCAACCAGATGCGCATAAGGATGTTCGCACAGCAGGCCTCCCAAAAAACGGAGGAAAATATTCGCCTGCGTGAACTGCTGAAGGATAAAGATAACAAAATAAAAGAGATGGATAGGCTCATAAAACACCATGAGCAAGAAATACGTCTCCTGAGAAATGGTATTATTGATAGCCAAACAGCAGTGTCGACAGCAGTGAGAGCATCGTCACGCACCTGGACCTTTGCCTGTATGTTGTTAGCCTTCTTGGTATTGGGGTTTCTAACAGGGGAGGCTAGAGCCCTTGAAACGGACTGTACAAAACCAATAGCAGGTTGTTATTTTGATATTTTCAAACCGACCCGTAGGCAGCTGACCTATACAGAGATTCAGAACATGTGTTATGGGACAACTACCACCATAATGAGCGCACACGCGGTAAACATGACTGGCCTTCTCTTGGAGTGTGAAGAAAAGATGGCAGCCCTTTCACCTAAGGGTAATGCAGAATGGGTTGTGGACTGGTGCAGAGACACACTAAAACCACGCATTGTTTTTGCTGAGTGCAAACAAATGACATGGCAACAAGTGATGGAAGCCAAAATGGAACCAGTAAAAGAAATTGTTAAGGAAATGGCAGAAGTTGGACCAGAACCTTGGCTAGCAATGGTTTCCTACCTGCTAGTTCTTGCTACCATCCTAGCAGAAACCAACTTTCTATATACAACACCAATAGCCCTTTTTGGCTTCTTCATGAAGATACCAACTTTGTTCATATCTCTAGCTTTGAACTTTTTCCCATGGACCACACTTATCTTTGTGCCAGCTCTGTACTTGCTTACAGAGTCGATGAAAATCTGGGTCTTTTTTGTTCATTGGATGGTAGCGATTCTTTTTGCTACCTTTGTGGAAAAAACCTATGCAGCCATTTCGCACGGGATTTTATTGTCTAGTCTCTTGCCTATCTGGTATTATGGTGCTGTATTTGTGACACACATGAAGATAACCTTGCCAGCACAATTGGTACTGATGGTGACTGGACTCACATTATCCTTTGGGCTCAGGTATGCAAATGCCACAGTGACTATAACAAAACCAGATGGCACTGTCGAAAAACAAAAGAGGCTGGAAATTTTTAAGGATAACTTTAAAGACAAGTTTTTGAAATTACAAAATGCCGTGCGTGGCATCATACCAGAAATACCAGATAAGACCCGGTGCATTCTGAGAGTAGAAACAGATGTGGGAAGTGGTGTGGGTTTTAGGTTCATGAATGAGATCTATACAATTGGCCATGTCGTGGGGGCATGTGAAACCGCGACGTTGCGGTGGAATGGAGTTAGTGTGCAAGCTGCAGTTAAAAACAGGATACCCCTTTTTGAAAGCTGTGATGAGCTAGTGACATTCAAGTTACCACCAGACTTTCAGGGAATGAAACCTTTGCGGCTGTCAAAACTGGAGACATCTGACTACATGCAACTGCTAGTTTTCAAGGAGAACGACATAGCAACCTATACGGGGTGGGCTATGCTGGACGGAAATTGGATTTCAAATACTTTCCAGACAAAAGCCGGAGATAGTGGGGCACCCTATGTGGACCGTAACGGTCGGCTAGTTGGAATACACATGGGGACACAGGGCGTAGTGGCACAAGGCTATTCACTCATGCAAGTGCTAAAACCACACAATGTAATACCACTTGCTCCAATTAATGAAGTACCGGCCCCAGAGTATGCGGTGCATGTTACGGAAACACCAAAAACTCCTGGAAAAGACAGCGGGATAACAGCAGATGACATCATGAGAGAGTTAGATGCACTTAAAAATGAGATGATTAAAAAACAAGCATCCAATGTTGATATAGATTCCCTGGCAGATACCATAATGTGCAAGGTGATAGAAGGAACAAAGAAATCTCATGCAGCCTTAACATCAGAAATAGAGAGGCTGGTTACAACAGTAAACACCCTGCAAAACATTGTGGTTGAGCAAGCGAATGTCATAAAAGAACAGGAGCAAAAAATAGCACAGCTGATGAGACCTGTTGAAGACCAAAAGAAAAAGCGCAATAAGAATAGACAGGAGCGCTTTATGAAGATTAAGGTCTTGACTGAGGAAGAATACCAGAGAATGTTGGATGAAGGCTGGTCGACAGAAGAAATAAATAATGCCATCTCACAATTGAGGCAACAAGCCTGGGCGGACTATGAGATGGAAGAAGAGGACTACCAGCCAGAGGAGATCCTTGATGATTTTTTGATGACCTACCAGAGGAAAAAACCTGAGAATGGAAAAATGGTCTTCACTTGCATGGACAATATTGTTATGGTCGTGGAACAATCAAGAAAGACCTTCAAATGTCCAAAATGCAAGGGTCGGTTCAACAGGGGAGAAAGACACAATCCAAAAACCTGCAGAGGAGTGTTAAAAGAGCAAAGTGAGCCAAAAAACGGGGAGAGTGGGAGGAAGGGGACCTCCCAGTAAAAATTTTCGACTGGAAGATCTATGTCGATAAACCCCTTAGACAACTGGTACCGGACACCCATCCAGTTCTCTTCCAAATAGATGTGGATAAATTGGTGGAGCGCAGAAAGAAAGTGCATGATCCCCTAACAACTATCTTAGATCCCTGGGATCAGCAACAATACGCATCCACGACTTGGACATCAAAGGCGTACACCAATATGTTTGAGAAATTCAACTATGCTGACCCACAGCGGATTGAAGAGAACTATAAGGACTTGTGGGATTTTGCTACCAGTGTCGTCCTGGAGGAGTATGGTTATCTTGAAAACTCCCAAATTTTGACCCCGTTGCAGACAACAAAAAATATGCTATCAACACCAGCATTTCCAAAATTCCTGCTCTACGATACAGAGGAAGAATACATGTTGGAGAAGGGCTGGAGTGAATACATGGAGCTGTGGAATATGGCCCCAGAAGAGAGATCAAAAGAAAGACCCTTGTGGTGGACCTTCCTTAAAAATGAAACATTAAAAAAGGAAAAAATAGAGAAGGATGACATCAGGATGATCATGTGCACAGATCCGGTGTATACAAGGTTTGGTGCAGCTTTCGATCAACACCAAAATGAACAGATAAAAGAAAACACCGAGGAAAAGAGTGCCCAGGTGGGGTGGACTCCCTTCTTTGGGGGATTGGACCAACGGATTCGGCGGCTGGAGACTCGCGGGGACACCTTTGTCGAGCTGGACTGGACAAGGTTTGATGGAACAATTCCCGTTGAAGTCTTTTCCCATATTAAGGAAATCCGGTGGTTTCTGCATGATGAAAAATACAAAACCCCCGAGAACAGGGAGCGCTACACCTGGTATGTGAAAAACCTGATTGATAAGATTGTCCTTCTACCTTCAGGAGAGGTCACCAGAATTACAAAAGGAAACCCTTCTGGACAAATATCCACAACAACCGATAACAACTTTGTGAATCTCTTCCTCACTGCTTTTGAGCTTGCCTATATGTATAGGGCAGAAAAAGGAAAAGTTCCAACTGTGCAGGAGTATTTTGACAACGTGGATATGCTGTGTTATGGAGATGATAGATTGTTGGCAGTAAACAGCTCTTTTCTCACTTATAGAAAGGATCTAGTTCCAAGCCTTTACAAGGGTGTTTTTGGGATGTGGGTGAAACCAGAAAATGTCAAAATTTCAACAAAGCCTGAAACCCTTTCCTTTTGTGGAATGACTCTTGTGAAAACACCAACTGGATACTATGGAGTACCAAATGTTGATAAAATATTGTCAACTTTTGATAACCCTGTAAGACCATTGCCGTCTCTTGAGGCGCTGTGGGGCAAGTTGCTATCATTGCGGATACTCCTGGAGTTTGCCGGCCCAGAACCAAAAGAGTATCTTGCCCTCCAAATGGCCAAAGTCCGATCCTTGGCCCAAGCTGAAGGCCTGAAACTTCCGGAAGTACCAAGGCACTTTTTTAGGAAGATCTGGACGGGAGGACCGAAAAATGAAAATGGAGGGAGCCAAGCCCAAGCCACAGCGCACGCGCAAACGTGCAGAAAAGAAGGTTATCAAGGAAGTGGCGAAGGCCGTGGAAAAACAGGAGAAGAGAGAGAGAAAGACCATGCCGAAAAGGAAAACCACGACCAAAATAGCCACAGACTCAGGAGAAAGAGTACTCACAACAAGGGTACTCCAGAGGGAGATCAAAAAATTGCAGAAAAAGGAAAAGGTGATGGAAGGACCAAGAGTGGAGAGTGTGATATTGACATCTGTCACGCTGGGACCACTCGTAGGCTCAACACAGGGAGACCTGTGCAGGCAAATGAAAACTTGTCTGAACCCATTGCTGCTGAAACCAATGACATCGGGAGAGGCAGCAACACCCTTGTCAACAAGAGCTAGCCAGTATGCACTCTACAAGATTATGCACATGGCAGTCAAATTACAGCCCTTGGTTGGGAGGTCGCTGGTTGCTGGATCGATAGCCTTGGTGGATATACAGCAGAACGGCGCTAGCGCAGCGCCCGACACACTAGATACAATCAAGGCGAGAAGGCATATTGAAGTGCCCCTGGGAACAGCAAGGATCTGGAAAGTACCCCAGAAAGACTTGCAGGGACCCCGTGATGGGTGGTGGTACGTTGACACAAACGATGACCCCACCCAGAGTCTGGGACCAGCTCTTAACAGCTGGTTCTATGGGCAGACGTACAACTTAATGAATACCACCACCACTGAAGTGAAACAATACAGCGGTGCATGCTTTTTGTTAGAACTGACAGTGAAGTATGCCTTCTCCAACTACACCCCGAAACCGGCACTGGCTACACTCTCAAAGGAAGTGAGAACACCAGCATCAGAGGCAACTTTTGGAAATGACCTTGATGGAGCACTAGTCATCCGAATGCCCGCCTCCTTTTCAGAAGCAATGGCCAGGGATACAGAGAAAGCAGGAGCCCTAGGGAGCACCTTTTGGGCAGTGTCATCAACAGTTGTCCAAACCCTGGCGGACTCATTCCCTCCTTGGGGCTGGGTCTTCAAGGCAGGGTGGTTTGTGGTGCGTAAGGTCTTTGGCCAAGCAACCAGAGATGGGAGCTTTTACGTCAAGGTCTACGCATCGGCTGAAGATGCAGTGAAGGACTCGCCCTTGTTTGTTAATGGCCAAGGGAAAAGGTTACCAGCAGGTTCCTATCGCGTTGAACAGCTTAATAGTGCAAACCTTCAGAAGAACACACAACCCAGCCCGCAGTCCAGATTTAATCCAACTGGGGGAGATTATCTCCCTCTTTCAATGGCTGGGGCACCTGCGGAAGAACTTCCCCCCTTGTATAACATAGTTGAAGGACAAGTGACTAAATATGACCCACCTTGGGGGGGGCTTAGTCCAGGTGAAAGGTCAGATTTAAACGGAGCAGGCATTTTGATGGCGAGGCCCATAATACACTATGTGGGCAGCACAGATAGCGTGAAGGCCATTAAAATGAAATACATCGCCTATCATTCTGGCGAGGGTTGGAAAGAACAAGAGCTCCGGGGAAAGTATGTGTGCCTCATGGAATTCCAGGAGAACTCCTTCCTTTTGGGTGGGTACCAGCTGAGGGAGCTTGGTGTGCTGCATGGTTACCACAGCCTAACAGCCTCCTTTGATAGTACATGGAACCACCTAGACCAGGAAAAATTGAGCCATTTAAATGACCCAGGTGGCCAGAGTGGAGCATTTGAATGCCCATCTGATGAGAGACTCTTTGGAGCTAGTTGGCTGAGACTACCAGTGCGCTGGGAGGGCACAGCTGCAGATCTGGTGCATAACCATGGAATTTGGGGCCATTTGGAGCATACACATGGAGATAGACCGCGTACGCTTGCAATTGAGGCGTGCTACCTAGGAGGTATAAACCCCTGGGAGTCAGAAGGGAGTATTACTCCAGCAGGGAACGCTATAATTCTTTGGGCTGCAGGAAAAATTTGGGCACTCACAACTACCCAAAAGGATCCAACCCTGTGGACTTATAAGGGACCTCAATTCTTTGCAACATTCTATGATGATAAAAAGTGGTCTAACATAAATCCATGGTACACCCTAGATCATCAGGAAACTCAAGCTCAGGAGGAGAAAGAGGATGATGAAATCGAATTGGAATTTCTTCCTCCGCCCCCAAATGCAATGGATGCACTGGCTGATGCAGTTGCGCGGAGCAACTTGACTGATGTGCTGAGTGCAATAAGGCTGTCAACCGTTCCGAAATGAACGTGAAACAAAACTATTAGGACCCTCTAGCTCACGAGGTGAAACTGAGTACATCTGGAGGATGTATAAAATCTCCGAAAATTGGCCGTAGGCCACCAGAGGCGTAGCGAAATCGTCGCCACACCTCTCGGTCCAAATTAATCAAGTTTTTTGGACCAACAAATTAAAAT
| 50,606
|
MN920664.1
|
Astroviridae sp.
|
Chen,X., Shan,T., Yang,S., Zhang,W.
|
Jiangsu University, School of Medicine
|
China
|
2020-05-06
|
sru051ast1
|
Astroviridae sp.
| null |
Astroviridae
|
ssRNA(+)
| 6,574
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Aves
|
feces
|
2018
|
SAMN13782218
|
PRJNA600556
|
MAG: Astroviridae sp. isolate sru051ast1, complete genome
|
GAGTTTTTGAGCTGCCCTCATCCTTTCTTGACAGGCGGCATGAGCACGGAGGTAAAGTTGCTCCTCCTCCGTTAATTCATCATCATTAATCATCTTGTATGAACAATCCCATCCATCATTCATCTTCTTTGATGTAAAAGAGAAGAATGTACCCTCACGGTATCAGCGTGTCCTTGAGACAGCAATGGCAAAGTTTTGTGCCCCACCAGGAACGAAAACGCTCTATAACACCATGCGAGAGCGTTATGGTGGTACTGAATCATGGAAAAAATTGATGCAATTGGATGCCATAACTATAAAAACAACAACACATGCAGTAGGCTACCGTGAGGGTACATTCTTCTCTTTTACATCAAAGAAGATGAATGATGGATGGGATTGTTCATACAAGATGATTAATGATGATGAATTAACGGAGGAGGAGCAACTTTACCTCCGTGCTCATGCCGCCTGTCAAGAAAGGATGAGGGCAGCTCAAAAACTCTCTTCGGCAATACAAGATCGTTGCCTTAGAGCGCAGTCACGACTTAGGGAGCTGGAAGCCGAATTGGAAATGCTTAAAAGGAAAACGGTTGCATGCCAAAAGCCCGAAATTACTGAGGTAAAAACTCCAAAGTTTAATTGGAGATTAATAGTAGTCCTCTGTGTGGCTATATTGGTAGCATTTTTACCGGTTTCTAATGCAGCTCAGTTTCCAGAGACAGACTGCCGTGACTATATAGATGGATGCTATCTTGAACAATCTCTAACTGGGAAAGAACTTTCCTACGATGAGTTTGTAAATGTTTGTTATGGCAGAACCAGAACAAGGCTTACAACATCAAATGTGAATGAAACAAAACTTGTCACAGAATGCCAGGAGACATTAGCTAAATACCATATGGAAAATGTTGCTTGGATGAAGGACTGGTGTCTTACACATATAAGGCAAAGATTAACACCAGTTAAATGCACCCATGTGATATGGCAAGAAAAACTCTTTTCAGAGGTTACTGACTTTTTCTTCTTTCTCCAGTCAAGTTACAAGGTCTTTTCAATGAAATTTTTCCACTATTTAAGTGTGTTTGTCATTGTTTTTACTTTTATGTGGGAGAAGAAGTTTTTTCCAGCATTATTTTTGCTATTACTCACTTTGGGTTTGAAATTGCCTTTGTTTATGGCAAGTGTTGCAGTGAACACCTTACATCCTTTTTCCTGTGTGGTGTATGTCTTATTGCTAATTTTAGAGATTCCAAATGCACACTGGCAGTGGGTAGTGTTTGTTGTTCATTGGGTAATAATGGTGTTGTTAGCTTTTTTTTCTAATAAGGAAACACTGCAAGCAGTTTCAATTGCAGTTGCAACATCATTTTTTCTACCAGCATGGTATTTTGCAACGCGTACTGTTCAAATCTTTGAGATACCCCCAGCTGTTCAATTGTTGACATTTGTTTTAGGTCTGACTTGGGCGATTGGAATCCGCTATTTGTCAGTAACTGTAACAACAACAGATGTTGATGGTAACGTCCAGAAAACTAAGCGATATGACCTCTTTAAGAAGACTCTAACCAGCACGTTTCTCAAGATTCAAAATGCCACACGAGGGGTTGTTCCAGCAATTCCTGAGAAAAGTGATTCTATAGTGGTTATTGAATCTAGTGTTGGTCAAGGGGTTGGTTTTCGCTTTATGAATTATATAATAACAGCTGGACATGTTGTTGGGCCAGATCAGCATGTGAAAATTACTTTTAGAGGTATTACTTGTGTTGCAAAAGTTAGAACAACAATGGATCTTATTGAATGTCCAGAAACTCTTGTCTTTTTAAACTTGCCAGCAGAAATGCAAGCATTAAAACCCCTGAGATTATCAAAAGTGAACACAAGTGACTATATGTCTCTTTTGTGTTTTGATGGTTCTTTTCAACAAGTCTCACAGTATACAGGTTGGGCAGCTGTGGATGGCTCTTGGATATCGACAGCTTTTGAAACACAGCCTGGTAATTCTGGTGGTCCTTATATTGACCGCTATGGAAGATTAGTTGGAATTCATCTTGGGACTCAAGGAGTACTAGCTCAGGGATATAAGATAAATACATTGCTTGCAGAACATCATCCTAGACAAGTACAAGAACAGAGTTTGTCATCAACAAGTTCCTTGAATCTTGATGAACTGGGAGACCAATTACTAGCCAAATTGATTAAAGGTACAAAAGTATCTCATGCAGCAATTCTTACTGAGCTTGAAAAATTGGTTGCTCGGGTTGAGCAGTTGGAGAAAGATAATAAAGAACTTGAAAAAAGTAATCAAAACCTTGCTGATATGCTAGTTAAAGCTCTCGAGGATACACCTGTGTTTGGCTTTGAGCGGAAGAAGAAAGGTAGAAAATTTGATAGGAAAGCTTTTAATAAAGTAAAGGTCCTGACTGAGGAGCAATATAAGGAAATGTTAGAAAATGGCTGGAGTGCTGAAAAAATAAGTGAGGCGGTTGAGGCCTTACGTGACTCCGCCTTTATGCAATACCAAATGGACCTTGAGGATGAAGCTTTGCCTGAGGATTATATTAATGATGAAATTGAGAGAGAGTTTGAAAAAACTGGTTATTATCAGGTGAAAGATGGTGTGAAAACCCAGACCATCATGCAAGGAATAATACAACAAGCTCGTAGGATTAGAAAGAGAGCACCTTTTACCTGCAAATTTTGCCTTAAAACTTTTGAAAACTGGCATGATAAAGCAAAGTGCAGGAAAAATCAAACTAAGGTTGCTAAAGAAGCTGCTGAGAAAACTGAAGAGCCAAAAAACGTGAAATCGGGGTCAAAACCATCGACCCCGAAATAAAAATTTTTTCATGGTATAACTATCTTGAAAAGTCACCAGGTAGAATTACAGTTCCAGATCAATATCCTATATTGGGCCATATAAATGTTGATAAGTTGGTATCAAGAACAAAGCGTGTTTCTGATCCACTCCTAAACCTTGTTGAAAAATATGAACAACATGAATATTCCAGTACGATCTGGAATGAAAAGGCTTACACAAAAATGTTTGAAAAATTTCATTATTCTGATGCAATTGAAATTGAAAAAACATATACTGACATCTGGGACTTTGCAACATCTGTGGTCCTAGATGAATACAGCTATATGACAGACTCAATCATAACACCGATATATGCTACAACCAAAAATATGGATTCTACGCCTGCTTTTCCAAAATATCTTTATTATGACAGTGAAGCAGAATACATTGCAGAAAATGGTTGGTCAGAGTATATTGAGATTTGGAATGCGACAGAAAGGCGTAGACCATTGTGGTGGGTGTTTCTTAAAAATGAGACACTTAAGATTAAGAAGATTGAGGAAAATGACATCAGAATGATTATGTGTACAGACCCAGTTTTCACAAGGTTTGGGGCAGCATTTGAGGAACATCAAAATAATTTGATGAAACAACATACAGAAACTCACCAGGCCCAAGTTGGATGGACACCCTTCTATGGAGGCCTGAATCAAAGGATAACTAGACTCAAAACTAAAGGTGATTATTATGTTGAAATGGATTGGACAAGGTTTGATGGTACTATACCAGTCGAAGTCTTTCAACACATAAAAGACATCAGATTTTTCTTTTTGGCAGAAAAATATAAAACCAAAGAAAATAAACTGAGGTACGACTGGTACGTTTCCAACCTCATAAACAAGGTTTGTTTGTTACCAACTGGAGAAGTAACCCTTGTTCAAAAAGGAAATCCATCAGGACAGATTTCAACAACAACTGATAATAACATGGTTAACACCTTTTTAACAGCTTTTGAGATAGGTTATATGCATAAAATCCAGAAAGGAAGGGTGCCTACACTTGGAGAATATAGGGAAAACTGTGATTCCATTTGTTATGGTGATGATAGACTTTTGGCTTTTTCTAGAAAATGGCTAAATTATGATGTTAAAATTATACCAGAAATGTATAAAGAAGTTTTTGGTATGTGGGTGAAACCAGAAAACATCAAGATTTCCAACACACCAAATGGCTTGTCTTTTTGTGGCATGACACTTGTAGAAACACCAGGTGGATATATGGGAATTCCAAATGTTAATAAGATTCTTTCAACACTTGAAAACCCAACAAAGAAACTTCCAGATGTTCAATCTCTGTGGGGCAAACTTTTGAGTTTGAGAATTCTTTGTGAGTTTGCACCCCAGGATGTCAAAGACTTCTTGGATAGGCAAATTTACAAGGTTGAAGATTTTTGTCTCCATGAAAACATTGCACTTCCGGAAGTGCCACAATCCTTTTTTTCACGGATTTGGGGTGGACCGAATTAATAATGGAGAAACCGAAACCACAGAGAGTGCGCCGAAGGCGCGAGGAGAAAACTGAAGTGAAAATTGAGGTCAAGGAGAAACCAAGGTCTAAAAAGACTAAAGAGAAGACTGTAATAAAAACAAAAGAAGGTCTAGAACATCAAATGATGATGCGTCAAGATCGAAGGAAAATAAAACAGTTAGAGAGAAGAGTCAGGAAGCTTGGAAAGGAGGAAAAAGGGCCTAAAGTTAATGATGTGATGCACACAACATTAACGCTGGGGGTTATCCCTGGAACGGATACAAAGAATTTGTGTAGAATGCGCAAGATCTTTGCCAATCCTGCCCTGCTTAAACCAATGGATGCTGAACAAGCAGCAACTCCCCTTTCAATTCGGGCTTCACAGTATGACCTCTGGAAACCAGCACAGGTTGTAATAACGTTTAGGCCTTTGACAGGGTCTACGGTTGTGACTGGTTCTATACTGTTTTGTGATCTTGATCAAGATGGCGCAGCAGCAAAACCTGAGACCGTTGATACAGTCAAAGCTCGACCTCATGCAGAAGTCACAATTGGGCAGTTGAAACATTGGAAAGTCCCACGGAAGTATTTGGTTGGTCCTAGAAATGGATGGTGGTATGTTGACACCAACGAAAATCCAACTCAATCGCTTGGACCAGCTTTTAATATATGGCTGTACATGTCAACAAGAAATGTGTTTTCAGCAGAGAATTCCACCTATAATGGGCCCCTCTTTCTTGCAGAAATGAATGTGACCTATCATTTTTCAAACTACAACCCAAAACCAGGAATGCAAACAATGGTCAGCCAGAGACTTGAAAATACTTCAACATCTAGCGCTGAATTTACATCTGACATTGATGGTAGTTTAATTCTGAGAGTCCCTGCAAACTCACAACTCTATGATGCTCTTCGAGTTACAGATGAAAATGAGAATTTTCTCACCCCTAGAGCAGAACAAAATGGAGCTGTGGGAGCCAAAATTTGGTCGCTGGCTAGCGATGCAGTTGAGGTTGCTTCAACCTCATTGGGCCCTTGGGGCTGGCTACTTAAAGGAGGCTGGTTCTTACTTCGCAGAATATTTAACCTCTCTGCAAGAGCCAACCAGGCGCAGTACTTCAAGGTGTATGCATCTGTAGAAGATGCAAGGGCAGACCAGGGGATACATCCAAATCTACCAGGTGGTAACACAGGGGTGGTACAGATACCACAAGGTGACTACTTTCTCCAGCAAATCACAGAACCCAATGTTGGTGGAGTTAGTGACAATACCCAGGTGATTTCAAAAACAATCCAGCCACCGCAGGACTACTTACCCTTGGCATACGCCGTAGATACAATTGATGATTTACCGCCAGTCTATTTATTAAACTCCCAGCAGAATGTTGCACCAATAGATTCACAGCAGTGGGGATACAGCTTTATACTTGCTGGAAGTCCTGAATGGTGGATGCATGATCAACCACAGACACCAGGAACAGAGTCAAATATGACCATTTCTTTCCAAGTGGTCGCTTCTGGTGTTGGTGCCGGTACAGTAAACCTTTCCGGCAAGCGTATTGTCTGCATGGATTTTACGCAGTCAGGAGTTATTTTTGGCTGTAATGGAATAGCTGGAATGGGTGGTATTCATACGGCAGCAACTTTTATTGAATCAATCAGAAATTTGGATGCTGAGGGAACAATTGGCAGTGGCTATGGAGCAGCTTCTATGTTTATGAAACCCTATAATATCCATGTTTCAAATGGAGCTGCAAACTGGTTGCCATTTGAATATAATATCACGCAACCAGATAATAACACAAATGATAATATTTATGTGTTTGACCTGAGGTATGAGGGAATGGTTGATTCAAAAGTAATTGGAGTAGTGAATCTTACAACAGAAAGACTCACAGTACTTTGGATCGGCCAGTCACAATCTTTCTATCCTAATTCTTGGTTCTGGTTTGCAAATGGATGGGCACCCTTTGGATTGGGCTTCCCATCTTATTTTGATAAGATGGTGGCTTTCACCCTGAAAAAACTTAGTGCACCACCACGAACACCAGTAGATAAAAAATCTTACCTTGGTTGGGTGCTTGGACCACAGACTAATGTGGTTGATGGTCATCCAACAGCAAGAAATAAACTTCCACCACTTGGAATACAAGTTCAACCAGAAACACCACCTGACTCAGACATTGAGACACTTGATGCAGAAGTTGAAAACTTGAGGAAAATGGCAAGCCTTATGCTGCAAAACCCTAGCTCACGGGTATAAACTGA
| 50,607
|
MN920665.1
|
Astroviridae sp.
|
Chen,X., Shan,T., Yang,S., Zhang,W.
|
Jiangsu University, School of Medicine
|
China
|
2020-05-06
|
stc111ast1
|
Astroviridae sp.
| null |
Astroviridae
|
ssRNA(+)
| 6,874
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Aves
|
feces
|
2018
|
SAMN13782218
|
PRJNA600556
|
MAG: Astroviridae sp. isolate stc111ast1, complete genome
|
AGGAACAGGTTTTGCAATACGATTAAGTCGATCACACTCAGCTTCTAATTCACGAAGCCTAGCCTGGAGTCGCATACAGCGTTCCTGAACAGATGATGATAGCTGTTGTGCTGCACGCATACGTTCTTGGCATGCAGCATGGGCTCTCAAATAGATTTTTTCCTCATCTGTCAGGCCCAGCCAGCCATTATTGTCATCAACTATCTTGTAATCACAATTCCATCCATCCTTGAGTTTTTGGGCAACAAACCCGAAATAAGTACCCTCACGATAGCCAAAGGCCAAAGTGGTTGTCTTGATCATCAAAGCATCAAGTTGCATAAATTTTCTCCAAGCCTCCGTACCACCAAATCTATCCCTCATAACATTATAAAGGGTTTTGGTGCCTGGAGGTGCACAGAACTTAGCCATGGCTATTTCAAGAACACGGGTGTTACGTGTTGCTGCGCTGTCAAAGGCCATTTGTTGCTTGTACAATTAGTATTTCGGGTTTGTTGCCCAAAAACTCAAGGATGGATGGAATTGTGATTACAAGATAGTTGATGACAATAATGGCTGGCTGGGCCTGACAGATGAGGAAAAAATCTATTTGAGAGCCCATGCTGCATGCCAAGAACGTATGCGTGCAGCACAACAGCTATCATCATCTGTTCAGGAACGCTGTATGCGACTCCAGGCTAGGCTTCGTGAATTAGAAGCTGAGTGTGATCGACTTAATCGTATTGCAAAACCTGTTCCTGAGTTAACACCAGTGCCAAAGAAATGGAACTACACTACTATAATGGTTGTCATCGTTGCGTTAGTTGTAGCATTTTTTCCAACAGTTATGGCAGAAAAACCTGAAGTTGATTGTAGAGAACTGATTGATGGATGCTATCTTGAAGATGGATATTCAGGTACTGAAATCAGTTATGATGACTTTGTCAACACATGCTATGGTAGAACACGCACTAGACTCACACTGTCATCATATAATGAGACTAGGCTAGTTGCAGAGTGCCGTGAAACGCTGGCCAAATACCATATGGAAAATGTTGCTTGGATGCATGATTGGTGCACAACCCATATTAGGCAAAGGATTAAACCAGTGAAATGTGTTATGGTTGCATGGCAAGACCGCATTATAACTGAAGTGCTGGATATAGTGCTAACAGTCCAGAATGCACAGAAAGTGTTTTCAATCAAGTTTTTTCACTATCTTAGTGTTTTTTTGGTTGTTTTTACTTTCTTATATGAAAGAAGATTCTTTCCAGCATTGTTAATTTTGAGTTTGGTGTGCCTAGCAAAGATACCATTGTTTATGGCAAGTGTAGCAGTAAATTGTTTTCAACCCATAACACTTATACTTTACTTTGCACTGTTAATTGTGGACTTACCTAATGCTCATTGGCAATGGGTTGTGTTTGTTGTACATTGGGTGGTCATGGTCTTAGTGGCTTTTTTTTCAAAAAGCGATGCCCTACCTTCAATTTCTGTTGCTATCGCAGGATCACTATTTTTACCGGCGTGGTATATAGCAACGCGTACGGTCCAGTACTTCGAGATTTCACCGACACTGCAGGTATTGACTTTTGTTTTGGGTCTAACTTGGGCAGTTGGATTGAAATATCTTTCTGTTACAGTGACTACAACAGATACCGAAGGCAATGTCACGAAGATCAAAAGATACGATTTGGTGAAAAAGTCTGTTGCTAATGCTTTTTTGAAATTGCAGAATGCCACGCGCGGCATAGTTCCAGCTATCCCAGAGAAGAGTGATTCTGTCGTTTATATTGAAACATCAGTAGGGCAAGGAGTGGGATTTCGCTTTATGAATTACATAGTCACTGCAGGTCATGTGATTGGACCAGATAGCTTTGTCAAAGTGACTTGGAGAGGAATAACATGCACCTCAAAAGTTAAGAAGGTTGAGGAACTAATTGAGTGTCCTGAAACATTGGTCTTTTTGAGTTTGCCATCTGAGTTGCAAGGAGTTAAGCCATTGAGACTATCTAAGATTAGTGGTAGTGATTATGTTTCACTAATTTGCTATGATGGCAGTTTCCAACAGGTTGTTCAGTTTACTGGCTGGGGAGCGGTTGATGGTCATTGGATATCCACCGCTTTTGAGACTCACCCGGGGAATTCTGGTGGACCTTATGTGGATAGATTTGGCAGACTAATTGGAATACACCTGGGAACACAAGGTGTGCTTGCTCAAGGCTATAAAATAAATGATTTTTTGGAGCACCATCGTCCTGTAAGCACAAAAGAAACAGTTGTTGCCAAAACTGATGAGGTCATAACACCAGTACAACAGCAATCTACCCAGAATATAGATGAGATAAGTGATGCTCTCCTTGCTAAGTTGATCAAAGGCACTAAAGTGTCTCATGCAGCTATTTTGACTGAAATAGAAAAACTTGTTGAGCGCGTTGCAAAGCTGGAGAAAGATAATGAGCGCCTTGAGCAAACAAACCAGAATTTAGCTGATATGCTTGTAAAAGCACTGGAGGATACACCAGTTTTTGGGTTTGAGAAGAAAAAGAAGAGGCGCCATGATAGGGCAGCTTTCAACAAAATAAAAGTGCTCACAGAAGAACAATACAAGGAGATGATTGAGAATGGCTGGACACGTGATCAGATTAGGGAAGCAGTTAATTCCCTGAGAGAGCAAGCCTACACCCAGTACCTAATGGAACTTGAAGATGAGGGAGAGCCTGAGGATTATATAAATGATGAAATAGAAAGAGAATTTACATCTACTGGCTATTGGGAAGTTAAAGATGGTGTAAGATCTCAAACAATAATGCAAAGTGTTATCCAGCAGGCAAGGCGAGTGCGTAAACGCCAACCATTTAATTGCAAGTTCTGTAATAAGGTGTTTGAAAATTGGCACGACCGCCAAAAGTGTAGGAAAGAACAAGAAAAGAAAAATTCTGGGCAAGATGAACAACCAAAGAAAGAAGAACCTTGCATTGAACAAAAAAACGGGAAGAAGGGGTCCAAACCATCGACCCCGAAACCCCAGTAAGAATTTTTGATTGGTATAAATATGTAGAAAAATCTCCTGGTAGGATTGCTGTTCCTGAAAACTACCCAATAATTGGACATATTTGGGTTGATAAATTGGTTTCACGCACTAAACGTGTTACAGACCCTTTGTTAAATTTGATATCTAAATACGAACAGCATGAGTATACTAGTACAATCTGGACTGAAAAAGCATACACAAAAATGTTTGAGAAATTTCACTACTCAGAAGCCTGTGATATTGAAAATACTTTTCCTGATGTCTGGGATTTTGCAACCAGGTTATGTCTAGATGAGTACTCGTATATGCAAGGATCTGTGATAACACCCATTTATGCGACATCCAAAAATGTCGACTCAACACCTGCATTTCCAAAATTTTTAGAGTTTGAAACAGAAGGAGATTATATTTCCACCTGTGGATGGCAAGAATATATTGACTTGTGGAATAATCCAGAAAGGCGTAGGCCCTTATGGTGGACTTTCCTGAAAAATGAAACTCTAAAAGTAAAGAAAATTGAGGAAAATGACATAAGGATGATTATGTGTACAGATCCGTGCTTCACGAGGTTTGGAGCAGCTTTTGAGGAACATCAAAATAATCTGATGAAACAATATACAGAAACACATCAGGCTCAGGTCGGTTGGACACCTTTCTATGGTGGTCTTAACCATCGTGTCAACAGACTTAGTGAAAATAGAGATGTGTATGTTGAAATGGATTGGACACGCTTTGATGGCACTATACCAGTTGAGGTTTTCAGACATATAAAAAATATGAGGTTTTTCTTTTTGTCGGAAACATGTAAAACTCCTGAGAACAAAGCTAGGTACGAGTGGTATGTAGACAATATTATCCACAAATTGGTCTTGTTACCAACAGGAGAAATTACATACATAAATAAGGGTAATCCATCAGGACAGATTTCAACCACAACCGATAATAATATGGTGAATACATTTTTAACAGCATTTGAAATTGCCTACCTTTATAAACTTCAACACGGCAGTGTACCAACTCTACAGCAATATCGTGATAATGTAGATTCTATCTGCTATGGAGATGATAGGTTATTGGCAATAAATAGTGCATTTTTGACATATGATGTCAAAATTTTGCCAGAGATGTATAAGACCATTTTTGGTATGTGGGTAAAATCAGAGAATGTTAAAATTTCAAGAACTATGAATGGACTGTCCTTTTGTGGTATGACATTGTTGAAAACCCCAAGTACCTGGGTTGGAACACCAAATGTTAACAAGATTTTGTCAACACTTGAAAATCCTGTGAAGAGGCTTCCTGATGTGCAGAGCCTGTGGGGGAAATTGGTTAGTCTCAGAATTCTATGTGAATACTCTACTGAAGAAGTCAAAGACTATCTTGACCTCCAAATACAGAAAGTTGCAGAATACTGTAGAGTAGAGAACATAGCACTTCCGGAAGTGCCCAGTTATTTTTACACCAGAATCTGGACGGGCGGACCGAAATAGAATATGGAGTCTAAACCAAAACCCCAGCGGGTTCGTCAGAAGAAGAAGAAAGATGAGAAGGTTAAGGTGGAAGTCAAAATTGAGGATAAAGAAAAGAAGAAAAGAAAGGTGACAAAACAGCGTAATAAGGAAAAAATTGTGGTTGAACATGAAGGAATGGAACATCAAATGGCATTCCAAGAAGAGCGTCGCAAGTTGAGAACTCTTGAGCGACGCATTAAGAAACTTGGAAAGGAAGAAAAAGGCCCTAAAGTTAATGACATGATGACTGTGTCTCTTACGTTGGGTGTAATACCCGGTATAGACACTAAAAACTTGGCCAGAATGAGAAAGATTTTCACAAACCCTGCTTTGCTGAAACCAGCGGATGCAGAAAAATCTGCTACACCCCTAGGTATTAGAGCCTCACAATACGACCTGTGGCGTCCAACTAAAGTTTCGTTCACTTTCAAACCACTTACTGGCCATTCTGTGGTTACAGGGTCACTCTTATTGTGTGACCTTGATCAGGATGGCGGAGCAGCAAAACCAGAGAACATTGACCTCGTCAAGGCGAGGCCACATGTTGAAGTGAACATTGGCCAAACACGAACTTGGCATGTGCCACGTAGGTTCCTGTTAGGACCACGCCAAGGGTGGTGGTATGTAGATACTAATGAAAATCCAACACAGAGTTTAGGACCAGCTTTTAATATCTGGCTGTACATGTCAACCAGAAACCTTTTTTCGGCCGACAATTCCATTTACACAGGACCACTTTTCCTGGCTGAGATGGATGTTACCTATCAATTTTCAAACTACAACCCAAAACCTGGCATGCAAGACATGCAGACTTTGCGTCTGGAAAACCCCTCAACCCAGAATGCTGATTTTACAACAGATCTGGATGGTAGCCTTATACTACGAGTACCAGCAGGTAGTGCATTTGCTAAGGAGTTGGCAGTGACAGATGAGCCGATTGACACACATCAGGCTCGTGCTGAGCAAAATGGAGCTCTTGGTTCAAAGATTTGGTCTATGGCTAGTGATGTTATTGAAACGGCTTCAACAGCACTGGGCCCGTGGGGCTGGCTACTGAAAGGTGGCTGGTTCCTCCTGAGAAGAATTTTTACAAATTCAAGAACTTCTGAGGCGCAGTACTATAAAGTGTATGCCTCTGTTGAAGATGCACGGGCAGATCAGGGTATACACCCAACACTTTCTAGCGCTTCTGTCAACCTACCGCAGGGAGACTACTTCTTGCAGCAAATAACAGAACCAAACGTGGCTGGCTCACCACCAGTAACAACAAGAACTGTTCTGGAGCCACAACCTCCCCAGGACTATTTACCCCTAGCATTTTCTGTGGATGTTATTGATGACTTGCCTTTGATCTATTTGCTAAACTCAAGCAATCACAAACCAACCAGGATTGATGGTAAGCAGTTTGGAGGTTCTTTCATTCTTGCAGGTTTGCCAGAGTGGTATATGTATGATCATCCTCAACAACCAGGAACGTCTTCCAACATGCAGATTGACTTCAAAGTCCAGGTGCCTAATGTGGGTGAACATCACCTTTCTGTCAAAGGACTCCGGATTGTTAATATGGACTTCACTCAAGCAGGAGTAATACTAGGCTGCAATGGTATAGGAGGGTTGGGCGTAATTCATACACCACAAACCTTCCTGGAATCACTTAAAGTTGCAGACGGCCTCGGTCAAATGGGTGAAGGTGCAAATCGTATGTTTATGAGACCAACATACGTAGAGGTGTCCAATGGAGCTGCAAACTGGGTCCCTTTTGATTATAACATTACTGATCCAGGAAAAACTAGGGACAACATTTATATATTTGACCTTAGATATATGGGTCAGCGTGATGCCCTGGTTATTGGCATAGCAAATTTAACCACCCAGCGATTAAATGCTTTTTGGATTGGACAATCACAATCATTTTATCCAAATTCAATGATGTGGTTCACCAATGGGTGGAAGCCATTTGGTGCTGATGGCTATGAGAACAAATTTGCAATGACACTTAAGAAAGTATCAGGACCCCAGAGACAGCCACATAATCCAGCGGATTATTTGGGCTGGGTTGAACAACAGGTTCCAGACAGGAATAGGAAAGTAAAATTGATACCTGGAACAAGAGTTGAAGAGGATGATGATGGAGATGAACTTGAAGTGATTGACAGGATTACCAAAAAATGGACCCTCTAGCTCACGAGGTGAAACTGAGCTTGACCCTCTAGCTCACGAGGTAAAACTGAGTACACCAGGTGTGGTGTATATGAATACACATTGGACCCTCTAGCTCACGAGGTGAAACTGAGTACACCAGCCATGGTGTATATGAATATGGGCCTAACTAGCAACAATCAAGTTACCT
| 50,608
|
MN920666.1
|
Astroviridae sp.
|
Chen,X., Shan,T., Yang,S., Zhang,W.
|
Jiangsu University, School of Medicine
|
China
|
2020-05-06
|
tom152ast1
|
Astroviridae sp.
| null |
Astroviridae
|
ssRNA(+)
| 7,278
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Aves
|
feces
|
2018
|
SAMN13782218
|
PRJNA600556
|
MAG: Astroviridae sp. isolate tom152ast1, complete genome
|
GTTGTGGTGGTATTATTCCACGCTGCCAATTAATTATCCTAGATGCCACACTCTTTGGTCCATTATAGCCAGTACCAGATGGAACAATAAGACAGCCAGCATGTTTCCCTTGTTCACAATTTGTCTCATAGGGTGCGTTCAAAAAGGCATCGGCTCCAGGAAAATAGGCAGCAACACAGATAATAAGAAATACTAAAATAGCATTTCTTATTCTGCGCCAAGTTTCAAGATTTGCTACTTTCCTCTCAGCCCGATCTTTCTTCCTGTCAGCAATCATCAGCTGCATTTTCAGGTAGCGCTCCTCCAAAGAGTAAGAGATTCTGGGTTGCTACGCCAGATATGACCTTTGAAAGGCCAGCTGGTGTGGAACGATCCATCTCCTCTTACGCTTTGGAGGAGCGCTATTGGCACTACTAATGTCTGGAAAGAATTGTTGAGAACTGACAAGGTTTTTCTCCAGAACCTTACAGTGGCTTATGCCATGAAAGGTGAGGAGTTTTTTCAAGTCAGGATTGTCTCTCAAGGTATACCCTTGATGAGGAAGGTTGATAGTGTACCAGACTATATTGAGGCTTATTTGAGAGCCCATGCTGCTGTTGAAGTGCGTCTGCGTGACGCTCTTAAGGAAGTATCTCACCTGAAAATGCAGCTGATGATTGCTGACAGGAAGAAAGATCGGGCTGAGAGGAAAGTAGCAAATCTTGAAACTTGGCGCAGAATAAGAAATGCTATTTTAGTATTTCTTATTATCTGTGTTGCTGCCTATTTTCCTGGAGCCGATGCCTTTTTGAACGCACCCTATGAGACAAATTGTGAACAAGGGAAACATGCTGGCTGTCTTATTGTTCCATCTGGTACTGGCTATAATGGACCAAAGATATCGTATGTGGATGTTAAAACTTTTTGTGAGGTGAATAGAGGCTGGATTTTTTCCAGAAATCAAGTTGACTATGACCACCTGATTGAAAGCTGTGTTGCTCATAAAGGCTTTGGTAAAGCTGTGAGTTCGCAGCAGGCAAGAGCATCCTGTGTAGAGTATTTTAAAAAATACTTGACAAGAGTGACTTGCGCAAAACCCTACACATTTGATTTTGCTAGTCTGAGCCAGAGCTTGGTTCAGGAGATGCAATCTTTGGAAGATTTTATGAAATCATTTGGGGTTTTGTTTTCCTATATACCTTTTGACTTTTGTCTGAAGGTATTCTCAGTTGCAAGTCTTTTGGTACAGTGGATGTGTGTACCACAGAGTGATGCAGGTGGAGTACGGACACTAGTGATAATAACAATAGTGTCTGTTTTGATGCTCTGTTCCCGAATACCAGCATTTATGGTTGCATTAATAATGCATTATTCAAACATCTACACTTTTGCCAGTGCTGTTTTGATTTACTGGTGTTCGTTCTCAATGGCGTCTTGCCTAATTGTCTTAATACATTGGGTTATGATGACATTGGTAGCGATTTTTTATGCACAACCAGGTAAATTGATGGAAGATATTTTGATGGCAGCAGTATCAACAGTGATGATAGTAGCTTGGAATGGCCTTGTTCGAATTATAATAGTTTCTGCTATGCCTGTTTGGTGCCAAGTTTTGATTGCAGTTTTAATAGCTAATATTTTAGCTATTTGTCGTTGGATTTATTCAGCTGATACCAATCAGAAGGCGCCAAAAATTGTGGCAGTACCAAAGAGTGTGGCATCTAGGATAATTAATTGGCAGCGTGGAATAATACCACCACAACTCGATATATCTGAAAGAGTTGTTACAATCTGTGCAGGAGATCGGATAGGTACAGGATTTCGCTACATGAACTACATTTTAACAGCAGGACATGTAGTTGGAGATGATAAGGTTGTGGAAATACGCTGGAAAAATTTTTCCTGCCAGTCAAATGTTAAAGGACACATTGAGTTACCTGAGTGCCCTGATACATTAGTGAAAATTGCGTTACCAGCAGGCTTGGCAAATTTGAAACCTTTGAAATTGTCAAAAGCAGATACATCCTGCTATGGTAGCTTAACAAGTTTTGATGAGCAAAGGAGTAATGTTCAAACAATGCAGGGCTGGCTGATTTTTGATGGTAATTGGATAGGTGTGCCTTTTGATACAAGACCTGGACACAGTGGAGCACCGTACTGTGATAAAGATGGCAGGTTGATTGGAATACATCTTGGTTCGCAAGCACTCTTAGGAGCTGGTTATCGATTGAACACGATTTTAGCAAATGGAATTGATGTTTGTGCAAGACAATCTACTCAAAGTGAAGATGAAGTAGTGCGCAAAGTAATAAAAGGTGTTCAGATAAGTTTTCAACAGCTCTGTGGACAACTTGAAGAGATGAATGAACGCTTGCAATATCTTGAACAACAGGAACAGGTGCCTTGTTATTATGGAATACCCGTGCAGCAAGCTGGGCGGAATGTGAATAAGAGAAGGAACCGCCTTTACCGGAGATTTGCACGGATGAAGGTGTTAACAGAGGAACAGTATCGCGAACTTCAAGAGAAAGGTGTCTCACCTGAAACGATTAGGGAGATTGTTGAACAATTGCGTCAGACAGCATTAGAAGAATTCTTGATGGATGAGGATGAGGATTATTTTTCTGAGAATGCTGTTGTAAGAGTGGTAGAAAAAACACCAACTCAGACAAAAACGCTGAAATATCAATCTCCTGATGATGAAGCAGCAAAGAAACTTTTTGATGAGATTGTGAAGTCAACTAAGGTGAAAGAAGGGACTTCAACTCATGCTGTGTATACTGATGACAACACCAACATTGAGAAAGTTGATCTTGAAGTTGATATGAAAAAGGTGAAGATCCCAGAAGGAGATCATCAGCATATTACTGGGAATTCCGATACTGTTGTGGTGAAAACAGCAAATGGCCCTATAATAATTAAAAGGAAAACAACGAATGTGGATGACCCTGAAAAGAAAGAAAAAGAAAGTGAGAAAAAAGGTAAAGAGGACGATGAAAAATCTGAGTCTGGAAGTGTTGTGCAGGAAGAGGCTGCCCCAAGACGTAGAAAGATTTTTGAATGTCCAATTTGCTCAAAACATTTTGAGAAGTACCATGATGTTGAAAAGTGTGCTGAAGAACAGGGTTATGAGGTTGTAAAGGGCCGAAAAAACCGGAAGAGCCCCCAGAAGAAGAACTAACTGGGGGCTATAAAATTTTTGACTGGATTCACTACTTAGAACCTTCATGTTGTGCTGAAGTTGTACCTGATGACTATCCTGTTTGTGGCTTTATTGCAGTGGATAAATTGGTAGAAAGAACAAAATTGATTAGAGATCCACTGTTAAATTTGATTGAGAAACCAAAAAGTGAAAATTATGGAGCCACGGTTTGGACAAAGAAATCGTATACCAAAATGTTTGACAAATTTCATTATGCGAAACCAATGGAGAATATTAAGAAATCTTTTAAAGATTTCTGGGATTTTGCAATGATAATAACATTTTGGGAGTATTATTATATGATGGGCTCATTGTTGACACCAATAATTGCCACAAACAAGAATATGGAATCAACACCTGGTTTTCCAAAATTTTTATATTTTGATTCTGAGAAAGACTACCTTAGCGCGTGTGGTAATAAAGAGTACATTGAGGTCTGGAATATGAATAAAAGACCTAAACCCCTCTGGTGGTCGTTTCTTAAAATGGAAACATTGAAGAAAAAGAAAATCCAGGAAGGGGATATTAGGATGATTATGTGTACAGACCCCGTTTATACACGCTTTGGGGCAGTTTTTGAAGAAGATCAAAATCAGAGAATGAAACAGAGAACAGAAACAAATCAAGCACAGGTTGGCTGGTGTCCCTTCTTTGGGGGTCTTGATAAAAGGCTTAAAAGACTCGAACAGAAAAATGGTGTCTACGTTGAGATGGACTGGACACGTTTTGATGGTACAATACCAAATGAAGTCTTTAGAGCCATTAAAGAAATGCGTTGGTATTTCTTGTCAGAGGATGTTAAGACACCCGAGAATCGCCAAAGATGGGAATGGTATGTTGATAATCTCTGTGACAAATTAGTTTTATTACCAACCGGGGATGTAACCAGGATAAAGCGTGGAAATCCATCAGGGCAGATATCAACAACAACTGATAACAACATGGTTAACACCTTCTTGACTGCTTTTGAAGTTGCATTTTTGTACTATGCTAAACATCAGAAGATACCAGATGTGGGTTGGTACTATGCCAATGTTGATTCTATCTGTTATGGAGACGACCGGCTCCTTACATTACCTGAAGGCTACTATAATAATGATCTTGTGATAGAGATGTATAAAAACATCTTTGGTATGTGGGTGAAACCTGAGAATGTAAAAGTTTCTGAGACCTTAGAGGGTCTTAGTTTCTGTGGTTTCACCTTCCATCATGATGGTAGCCAGTGGGTAGGAGTTGCAAACCATGAGAAAATGCTTTCTTCACTTTTGGAACCTGTGAAGAGACTTCCAGATATTGAATCACTTTGGTGTAAACTGGTGAGTATAAGGTTGATGTGCGAAAATTCACCATCGCACGTGAAAGATTACCTTGATCGTCAAATTTGGCGTGTAGAGACATTTTGTAGGAATGTTGACATCACACTTCCTGACTTGCCGGCAAGTTTTTATTCAATGTTGTGGGGTTAGGACCGAAATAACTTTGCAATGTCGACTCCTGAGGGGACTCGGAGACCGAAAGCAAAGAAAAATGTCACTGTCACAGTCTCTACAGAAGCTAAGCCTAAAAGATCAAGATCAAGATCAAGATCAAGGAATAGAACTAATGGAGCTGGACCCGTTGTCAAGGTCGTTGGAACATCTACGAGAGCGGTCACCTATCAGAAAGGTGCGTCGAACCGCCAGCGCCGACGCTTGCAACGACTTTCTGAGAGACACTTGCAGAAGGAAATTAATAACCTTAAGAAGAGAACTAAAGGTCCTCCAGTTGCAGATCTCCACACTGTCACACTCACTCTTGGAACTCTCACTGGAGTTGCAGAGAACGACTTGAGTCGCCAACTTCGCTATCCGCTATCCCCGGTACTTCTTAAATTGGAGGATGCTGGGAAAGCACTAACACCTTTGTCAGAGAGAGCGCATCAGTATAACTTGTGGAAACTTTTGCACTTGTCAGTGCATATGATACCGCTGGTGAATGGTTCAAATATATCAGGGACACTAGCCCTTGTAGATATTGATCAGGATGGGGGCTCAGTAAAACCTGATACTGTAGACACCATAAAAGCTAGGTGTCATGCAGAAGCCCATATTGGCCAGAGAGTGATTTTTACCCCTCCCCCTAAACAGCTTTGGGGACCTAGACAGGGCTGGTGGCTTGTAGATACTAATGAGGATTCAGCTGAGTCTTTTGGTCCAGCGTTAAATTTCTGGACCTACTTGCAAACTCAGAATCTCCTACATATTTCAGGAGTTGCTGGGAATGCAGCAGATGAAACAACTGTCTACAAAGGGCCACTTTGGCTTGTCGAACTTAGGGCCAAGTATGGTTTTGCAAACTATGAGCCTAAACCAGCTTTGGCTGTCTTGGGAACAACAAATGCCACTGTTTCTGATGCAAAATTTACAACTGGAGAAAATGGTGAGCTTGTGATAGAGGCACAATCATCAAAGCTAGTTGCTTTTGTGGGAAAGTCAGATAACCGTAGAGTTAAATCTGTTTCCCGTGCAACGGCAGCTGGAGGGAATCTCTCAAATGTGCTCTATTCTATGGCTGATGATGCTGTAAAAAAAATTGCACCTGCCTTAGGACCGTGGGGCTGGCTTGCCCGAGCAGGCTGGTGGGTAGCTAGACAGATACTACCAGGTGCTGATACTGAGGAAGATGCAGCAAAGTTTAGAGCAGTAGTCTATCCTTCTGTTAAAGCTGCACAGGACAATGAGCCTGTCTATGTGACTGACCTTGCCAATTCTGGAAAAAATGAGGTGTCAATACCAACAACACAATTTAAAATCCAGCAACTTAACTCACCAAATCTTAACACCGCAAACCCAGATAATGATGTTTTGGCAACTGCAATTGGGCAGGAAGAGCAGGCTTATCCATTAAATTCTGTGAATAGGTTCACAAGACCACCTCAGATAGGAGTTTGGTTGCCAGCAAGAGAACTCTGGGCAGCAATGGGATTGCCGAAAGTACATCGCTTCTTTGAAATTCATGACCACGCATCTTCAACTGCGATTAATTCTGCAGATCACGCCCATTTTTATTTTCAGATGGACGTGTTCTTGAATGCTCAAAATGGAGTACATCGTTTTTCGATGAAGCCTTTTTATAATCCCTTTTATACGACTGAACTCTATATTACACATGAGATCTACACCTGGTGGCCAGTGGCGTGTACTTTTGATTTGAAAGACCCAAAGACACGCCTTTGTTTTATGAAAACAGGGGAAACTGACACCGTGAAAAGTGCAATTTTTGCAGATTTAAGATCAATCTGCCAGTCCTTGAAGCAGACAAAGGATGATGTTTATGCTGGTTTTGGAAAAATAGCCTCATTTACAAGAGCATATGTGATTAACTCTGAAAAAGAGATAGTCACTAACCCTGATGACATTAGTGAAAGTTATAAAGCATATCTCTGGAAATTCTTCCCACTTACAGATGAGTGGAAAACCTGGAGAGACTTTTTCCGCTCAGGCTTGAGACCAGATGCATACTCACATATCTGGTATGCTATGGGTAGGCAAGATTTCTCGATTGGACACGACCATCATGAACCACCTGGACAGCTTGCATATAATTCTTCTTACAGGGGCATACCTGTACATCTTTTTGTTTCTCCTGATACTGGCCAAGCGCTTGCGATAACTTGGATGCAGTATTATAGGCCAGATGGACACTTTCCAGAAACAAAACTTAGAGGCTATACAGGACAACCACTTGCATGGACTCTTCTCTGGACGAAAGATCCACAGACCCTTAATACATCACCTGCGGTCTATGGTTCGGTAGGCCCAGAACTTTCTGCTGAATGGACTGAGGAGGATACAGAACTTGATTCTCTGCTTGAAGAACTTGAAGTACTCACTGACAAAGATATTGACCAGCCAGATTTGTCAGTGAAGACAAAGCTTGAGACACCCCTGGTAAAAGCAGATGTGAACCTGAAATCAACATCACAAGAGGAGCTACTCTTTTGGAAAAATCTTGCTCAGCAGCTTCTTAAGCAGGAAACCAGTGACTAGTCTAATACTGGTCATTGATGCTGGTAAATTCACTTGTGTGGGCTAATCCCTATCAAGTGCTGTGGAATG
| 50,609
|
MN920667.1
|
Astroviridae sp.
|
Chen,X., Shan,T., Yang,S., Zhang,W.
|
Jiangsu University, School of Medicine
|
China
|
2020-05-06
|
tom152ast2
|
Astroviridae sp.
| null |
Astroviridae
|
ssRNA(+)
| 6,510
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Aves
|
feces
|
2018
|
SAMN13782218
|
PRJNA600556
|
MAG: Astroviridae sp. isolate tom152ast2, complete genome
|
CAAAAGTAAAGGAAACATTTTTGAACCTGTTATATAACAAATTGCATGTATAACCAATCCTAGCCAAGCTCTTTTCACACTTCTGCTAAAGCACAACGCAATTGCCACTATTACCAGCTGGTCCAGATTGAACCTCTGAACCTCGCTGTATGTTGTGAGTAGCAACTTCAGCATTCTAGTGATCGGGGCAAAATATTCACCAATCAGCTCTCCAGGTGTAACCATCTTCGTGATGAGAGTTCTTGGGTATTGTCTGCAATCTTCATTTGAATAGGGTTTTAATGACGCATAGCATGTTGCTTCCAGATATTTGACATCATACTGCGACACGGTAACAAAGTTCCCGTGATCGTTGGCACATTTTCCCATGAATTCGTCGAAATTCAGCTTTTCAGCCCTGATGGGTGCGTCAACTAAGACACACCCAACATTTCCGGCATTAGCTGTCGGTATCAACCAGAGGAAAAATAAAAAGGCCAACACCAATGCCATTTTCTGGAAGCAACATGCTATGCGTCATTAAAACCCTATTCAAATGAAGATTGCAGACAATACCCAAGAACTCTCATCACGAAGATGGTTACACCTGGAGAGCTGATTGGTGAATATTTTGCCCCGATCACTAGAATGCTGAAGTTGCTACTCACAACATACAGCGAGGTTCAGAGGTTCAATCTGGACCAGCTGGTAATAGTGGCAATTGCGTTGTGCTTTAGCAGAAGTGTGAAAAGAGCTTGGCTAGGATTGGTTATACATGCAATTTGTTATATAACAGGTTCAAAAATGTTTCCTTTACTCTTGGCAATACATTATTTACCAACTTTAGCGATGCCTTTTATGGCAGCAACAATGTTGTTCCCACAAGTATATAGCATGTTAATTGCAGTAGTGTTAATAATAACATTAACTGTGGATGCATTAATGAGTGGTGAATTGACCCTAATGCAGAGATTATCCGGAGTGTTACTGTCTACTGCCGTGTTTGTGGCATGGCAGATAGCAGACATGACACTTAAAGTGTTGGCATTACCCTTGGGTATGCAGGTAGTCATCACGGTAGTGGCGGCCCTTGCTAACGTTGGGTTTAGTGCTGCTACTGGGACAGTAACAATTACGAATCCGGATGGCACCACCACAAAATATAAAAGGTATACACAGATTGGAAATACTATAGCTGAGAAAGTGGTGTCAATATGGCAGAAGGCAAAGGCAGTAAGGGGAGTTTTACCATCATTTCCGTTGCAGACAGATGCTGTTTGCTTAGTGGAAGTTGAAACACAGGATGGATTGTACCAAGGAACTGGGTTTAGACTTGGAAACTATATCTATACTGCAGGACATGTTGTCAAAGGTGCAACAAAAATAAATCTTAAATGGAATGGGCTGTCAGTTCAAGGGAAATTAGTTGGTGAAATAGAATTGCCAATGTTTACAGACACCATGGCTAGGATACAAGTCCCTAATGCCTTTACACTGATGAAGAGCCTTAGAGTGGCAAAGGAATTGCAAAATGATTATTTCCAAATGATTTCATTTGGACAAAACCATGAACCAGTTACATTTACTGGGTGGGGTACAATAGATAGTCCATATTTTGCAGCACCCTTTGCAACACACCCAGGAACATCTGGGTCACCGGTCATAGATAGGACTGGGAAAGTTGTTGCGATGCATTTTGGGTCGAATTTAGCATGTTCTAGTGGATATGTTTTAACGGACCTGTTTAGGACAGAACCACCAGTAAAACAATGTACAGTTCAAGATGAACTGATGGAAAAGGTTGTCCAAGGAGTTAGAAATGCCACATCTGACATAATGGCAAAGATAGAACAGATGTTGCTAAGGCTTAATGCAGTGGAGAAAAGTGTCACAGAAAAAGAGAACAAAATAACCAATTTATGTAAAGTTATAGATAAAAATGCAGATGAGTATAATAAAACAATACCAAAACTGCATGAAAGACTGTGCAAATTGGAAGAACTTATCAAAACACAAGAAGTACAAGAAGTGACACGTGAAGAGGCAAAAGGGAAAACAAAGAAAACAGTGAGAGGAGCTAAAGCCAGGTATGCCCCAATAGCAGCAGCCATAAAGAAAAAATTTAGCAAGATGAAAATGCTAACGGAAGAGGAATATAAGAGGCTGCAGGATGAGGGGTTCACAGCTGCTGAGATAAGGGAGGTAGTAAATAACCTTAGAGAGCAGGCATTTTTGAATTGGCAAATGGAAAATGAAGATGACTGGGAGTCAGAACCAGAATGGAGTGATTATGACCATGACTTTGATAGTGACAGAGAAATTGTTGAAACACAAAAAGCAAGACTTAAGGTACATGTGGAAAAAGAGGACAAGGTAAAATCCCTTGAGATAAAATACCCGGATGGCGCAGAGGAGGAAGCCAGAAGGGATCTTAAAGAGATTTTGACTGAAGAGCCTGTCCCAGAAAATGAGACACATGTTGTCTTGTATTATGATGATGAAGGAGCAATATATGTTGATGACAAGAAAGTCACTTTCAAAAAAGTAAAATTAGAGGGTCACACTCAGATTACTAAAAATAAGGAAACAGTCATCTCTGGAACACCGCAACAGCCAAAAATTCAAAAGATCTCCACCACAACGAAAGTTGAGAAACCCAAGGAGGAACAGGAGGAACAGATAAAAGATCAGGAATCAAGAGAGCCTGTGGAGGAACAAAAGAAGAGAGCGTGGAAACAGAAACGAACACGCAATGATGACACTGAAATGTGCACATGTAATGTGTGTGGTGAGCAATTTTCGCTCAAAAAAGCATATAGGCATAAGTGTCCAAAAAACTCCAAGAGGGCCCCGTCAGGGGCCCAATAAAAGGCTTAAGATGGTACGAATGGAGATTGTACATGGGTAGGCCTCGAACCCGTGTTACCGTACCAAGAACTTATCCTCTTGTTGGTTATATTGAGATACCAAAAAAAGCTGTAAGGGAAAAACATGCTAATGACCATCTTCTTGGAATTATTAGAAAACCGGATGTAAGTGGTTACACAGCAACAGTGTGGGGCCTTGAGGCATATGAGAAAACATATGAAAAGTTTGAGTATGGAAACTCACGCAATTTGCCTGATGAGGACACAGAGCTTGTAAAATTTGCTGATAATGCAGTCTTAGCAGAATTAGCATATATGGAGGGATCAAGAGTAATCCCAATCCAATGCACCACAAAAAACTCAATGTCAACACCAGCATTTCCAAAAATGTTGGAATTCGAGACTGAGGAAGATTATCTGCGTGACTGTGGAATGCAAGAGTACGTAGAAGCAATGTGTGATGAAAAAACCTTGAACAGGCAACCTTTGTGGTATTGTTTTCTCAAGAATGAAATTCTCAAGGAGAAAAAAGTTAAGGACCACGATATAAGAGTGATAACCTGTGCAGATCCTGTATTTACAAGAATAGGCGCGTCCCTTGATGGGATGCAGAACTCCAGGATGAAAACAAAGACAGAAACACATCATGCTCAAGTTGGCTGGACACCCTTTAGAGGTGGTCTTGATCGAAGACTAAAGAGACTTGAAAGGAAAAATGTCTTTGTTGAGCTTGACTGGACTAGATTTGATGGAACAATACCACCCTGGTTGTTGCGCCGTGCGCGACTAATTAGATGGTATTTAATGAACAAAGATGATAGGGTTAAGTATGGAAAACTTGCAAAGTGGTATACACACTGTTTGTTACACCGTTATACAGTGTTCCCAACTGGAGAAGTGACACTTATCCGGAAAGGTAATCCTTCTGGGCAATATTCGACAACTGTAGATAACAATGTTGTCAATGAATGGTTAACAGCGTATGAGTTTGGCTATCTGTATAGAAAGCAGCGTGGCAAGCTCCCCGAAGTAAAGGAATACCGCAGAAATGTAGATATGCTGTGTTATGGTGATGATAGGCTATTGTCATTTAACAGCGACTTTGTGGAATATGACCAAGAAACAGTTATCAAGATGTATAAAGATAACTTTGGCATGTGGGTCAAACCAGAAAATTTGAAAATTTCAAAAACCATTGAGGGGTTGTCCTTTTGTGGATTCACCTTTAAGAAAATCAATGGAAAATGGTTTGGAACAATGGTCGCAGAAAAGTTGTTACAAAGCCTAAATACACCAGTGAGGCAGCTCCCAAATGTAGAAGCACTTTGGGGAAAGTTAGTTAGCCTTAGAATTCTGTTAAATTACAGCAGTGAAGATAATAAGCGGTATCTAGAGGAGCAAATAAGAGCAGTGGAGGACCATTGCAAAGCTGAAGGCATTGAATTGCCTGAAGTCGGGCCCGACTTTTATAACACCATTTGGTGAGCGGAGGACCAAAAGGAAAAATGGCTCCCACCACTGCTGCTGCTAGTGCTGGTGAACAGAAAATGGCCAAAAAGACCCAGAAGAAAAGAAAGATGACTCCTGGGAGAAAACAAAAAGTAAGGCAGCAAAAACAAAAAATGCGGACTCAACCAGCTGTCGTTACTGAAGTAAAAAAGGTTGAGAGGAAAATGAAGAGACTAGAGAAGAAAACGAATGGCCCAAAAATTGATGATAAGATGACAACAACAGTTACATTGGGTATTATTGTTGGTCAGGACTCAGATGGGCTAAATAGGCAAATGAGAATACCATTCAATCCTCTCTTGATGAAAGCTTCAGATGGTGCAAACACGACACCTCTTTCAATTAGAGGCTCTATGTACGAGATGTGGAAAGTGCTTTATGCTGAGGTAAAAGCAGTACCACTCTCGGGGGCCTCTAATGTTGTTGGCTCAGTTGGGTTTATGGCTCTTACCCTAAATGGGTTAGAAGCAGGAGCTGATTCAATAGACAGTGTTAAAGCCAGAAGACATGTCCAGATGCCTTTGGGTAGGGCCGCTCATTTAAAATTGAAAATGAGAGAGTTGGAAGGCCCAAGAGAAGGGTGGTGGCTTGTTGACACAAGTGAGGATCCTGCAGAAGCCTATGGGCCTGCAGTAGACCTCCTCCTTGCCTATCCTACCCATAATTTGCTGCAGACTACCGGCAGTAATGCATACTTGGGCACACTTTGGCAAGTGGAATTGAGGGCAACTTATGCCTTCTCGACATACCACCCAAAACCTGGACTACAAAGTTTGGTGAGTGAAACACTGGATAAACCAGCAAATGTTACTATTGGAACTGAGTCAGATGGTTCCCTCATAATGACCACCAGTGATACAAGGCTGCTCTCACTCTTTGACCTCCGTGAAAGACATTTTTCACGAAATGGACAAACTGGTGGCAAAAGCCAGACAGTGTGGGCAGTGGCTGGTTCTGCGGTTGAAGCTGCGTCAGCAGTGTTAGGCCCATGGGGCTGGCTCTTGAAGGGCGGATTTTGGCTAGTTCGGAAAATCTTTGGCGGTTCTGGTAGAACAAACGCCTCTACCAAATTCCAGATATATCCTAGCATAACCGCAGCCGCTTCAGACCAGCCCATCTACGGTGGAACTGGCACTAAACAAGTCACCATTCCAGTTGTTCATGTGTCTGAGGTCATCAACCCCAACTCTGAGAGCAATGTGGCAACAAACCCAGTTACATCTGGTGGCGGCGGTGGTGGCACAGAGCTACCCTTTAGGCCTTTGAGGCAACCAGATCCAGTGTATGACTCCACAAACGATGCAGTGGTTTCAAAAAGTTACGTCGGCGCCTTCCTCTTTGGAAATTGGCGATGGCAGCTGTATAGCCAGTCCGATGACTATAACTTTGAAATGGGAGTCCAGATCACTCGCAAAGCATGCGCATATGCGCATTTGACTGAATTGCAAGGTATGGTTGCTGGTGCCAGGGTTGGCAGTAATACTGGGCCGGGCGGCATCCTCGGGACAGCACATACATGGCTAAATGCTATGCTCAAAAGAGCAAGTGAAAGCCAGTATTGGTGGCCCGCAAACTTGGCCAGTCATGCCATGAGAATGCCAAATGAGATTGTGCAGAACCTTGGATTAGGTGGGGTCACCTATGGTGGACCAATTGATGTGTTTTCAACTGTCACTGAGAGCTCTTCGAGCTCCAAGAAACTACACAACCAAGGGTTCCTGCTCTTTTCAACCAATGGTGCAGCTGGAATTGTGGTGTTTATGGATACCAACGAGAGTGCAATGATCCAGAGATGTCTTAAGGGACCTGTTGTAGTTTCTGCTGCCAGGAACATCACATGGGAAAACCACGAACTTAACACCATTACCGAGAGCCAGATTGAGGGTGACAACATTGTAGAAGATGATGAGATAAGCCTTTGTGATTCATTTATGGGGGAACAAGAAAAATCACCAGATGAAGTTGAGAGAGAGTTTCTCTTGTCTCGACTGCGCGAATTGGACTTGCGCAGATTTGAAATGGGTGGACATTAACCACTGGCTGGCTGACTACAGCAAGTTACATGACCGAGGCCACGGCGAGTAGCATCGAGGGTACAGTCATGTTGCGACTCCTGGTTGTGGACTAATTCCACTGCCTAGAGATACTCCACTGA
| 50,610
|
MN920668.1
|
Astroviridae sp.
|
Chen,X., Shan,T., Yang,S., Zhang,W.
|
Jiangsu University, School of Medicine
|
China
|
2020-05-06
|
war204ast1
|
Astroviridae sp.
| null |
Astroviridae
|
ssRNA(+)
| 6,848
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Aves
|
feces
|
2018
|
SAMN13782218
|
PRJNA600556
|
MAG: Astroviridae sp. isolate war204ast1, complete genome
|
TGATTCCACTAATCACAGTCACCAGACAACCAAGAAGCAAAATGGAAGCTTTCCACTCTCTTTCCAAGAAACATATGCGTGTCGTTCAGACTCAAGGGGCCTCCAAATTAACATCTGGCCCAGGAACGATGGCACTCTTTTGCAGGATGAAAGACAAGTATGGGCTATCCCAAGCTTGGAAAGATCTGATGGACAGCGACGCAGTTATGCTCATTGATATTACTCTGGCCTATGGATACAAGGATGGAACTGTTTCAAAATTTACAGCCGTGAGAACGCCAGATGGACTCGGCCATGTGCTAAATTATAGTGTCACGTCTTTGCCGGAACAAGATGAAGCTTTACTTAAAGCACAAGCGTCCAATCAGGCTCGCTTGCGGCTGGTTGCACAACAAAGTTCCTCAAGGCTGGAAGAAAATATGAGACTGCGTGAGAAGATTCTAGGATTACAGAAACAGATTGATGAAGAAAGGCTGTTGATCAAACATCGGGATAATGAGATAAAACATCTGAGGGAAACCTATCGTGAGCACAAAGAAAAAGTTGAAGCTGCGGTTGCACGTACTTCCTTGTCCTGGACAGCGGCATTGGTCTTAATTTTAATGTTGCTCTTTGGAATTCTTACCGGTGAAGCAAGGGCAGATGATTGTAGCAGACCCATAAAAGGATGTTATGTGAATTTGAAGGACCAGAGAGAACATGCAGGTTATACTTTTGGTCAGTTGCAACATTTATGTTATGGGGAAACTACAACGGTACTCCCTAGCTTTGCTGTGAATGACACCAAACTGAGAGAAGGGTGTGTCCAGGATTTGATGAAATCAATGAAAGTGCAAGATGACAATGCAACTCGGTCCTTGTGCAATCATCTTATTTCAACAATGATTAAAACAACTGTTTGTGACACGACAACTTATTATCAGCGAGTTTCCTTCCTGCTGAGAGATTTTTTCGCAACTTTCCAATGGCCTTCACCATCTATTTTTCTTCCCTTTGTTTCCTATTTGGTTGTCTTGGTGACTGTGATTAGTGGAACCAACTGGTATAAGACTGCACCTATTATGACCTTGGGGGTTTTTTTGAATATACCAACATTATATACATCAATTTTGGTAAATTTTTTCCCCCTTGAGACTGCAGTGTTCGCATATATTGCGCAAATTACACCAGCTGAGATCACCCCATGGATTTTTGTAGCGCATTGGATAGTTATTGTTTTGAAGGCATCACTCCTTGAAAGAACACTACCCGGGATTTCAAGGGCTCTCTTGCTTTCTATGTTGTTACCACTCTGGAACTATTCGATGATCTTGGTCCGTGAACTGAATTTGAACCTGCCAACACAGGTCCTATTGTTTGTTGTTGGTGTCACCCTCTCAATCGGCACGCGCTATGCTAACTCTACTGTAGTTATTACACAACCCGACGGATCATCCGAGAAAGTCAAGCGGATGGAACTCTTCCAGAATGGGCTTAAGGAAAAATTCTTGAAACTACAGTCAGCAATTCGTGGTGTTATACCTGAAATACCTGATAAGACCAGGTGTGTGTGCCGTGTTGAGACAAATCAGGCTGAGGGGGTTGCTTTTCGCTTTATGAATGAGCTAGTTACAATAGGCCATGTGGTAGGTAATGAAGACACTGTCACCTTTAGATGGAATGGACTAACATCAACCCAGGTGGTTAAGAGAAGGATACCTCTTTTTGAGAGCTGTGATGATTTGGTCTTTTTTAAACTACCCAATGAATTCCAAGCCATGAAGCCATTAAGGTTATCTAAGATTGAAACATCAGACTACATGCAACTTCTTTCCTACCGTGATGGGGAAGTAGCCACATATACAGGTTGGGTCATCAGAGACGGAAATTGGTTGTCAAATGTTTTCCAAACTAAACCTGGAGATAGTGGCGCCCCCTATGTTGACCGTAACGGCCGGCTTGTGGGCATTCATTTAGGAACACAAGGCGTTGTTGCGCAAGGTTATGATCTAACAACTGTCCTGAAACCGAGTGTGTTACCACCATTAGCACCTGTTAATGAGCCACCACCAGTTTTTGAGCTCACTGAAGAACAAATCCAGAAAATGACAGCTGCTTTAGCACAAGCACAGTGCCAGCCATCTTATGCAGATCTTGCTGATGAAATTACACAGAGAGTTATAACTGGAACAAAAGTTTCCCATTCAGCCCTAACAGGCGAGATGGAGAGGATGGGTGAGCTTTTGGCAAACCTGTGTGATATGGTACAATGTCAACAGAAAATGATACAAGCGCAGGATGAGAAAATATCTGTTTTGGAGAAACTTGTCCTTGATCAGGTTATGGTGCCTGAGAAAAAGAAGGGGAAAAACAAACAAGGCATGAAGAACAGGTTTATGAAGATGCGCGTGTTGACAGAAGAACAATATCGGCAGATGTTGGAGGAAGGCTGGACCAAAGATGAAATTATGGATGCTGTGAGACAACTGAGAGAACAGGCTTGGCTCAACTATGAATTAGAACAAGAAGAGGACTATGAACCTGAGGAGATCCTAGATGCTTACATGCTCATACATGAAAAAACAAAACCAACAGCTGGCAAGCGTACTCTAACAGCAGTTGATGAAGTTGTTATGGTCTTGGATGAGGCTAGGAAAAGCTACAGATGTCCTAAATGTCAGAGAACTTTCAAACGAGGTCAGCGTCACAATCCTAAAACATGTGGCATGATGGAGCAGTCTATCAAAAAAGAAGAAGTGATAGCTGAAGTTGGAGCTGTGGACTTGACAAAAAACTTGAAAACCGGGGGGAAGGGGACCTCCCGGTAAAAATTTTTGACTGGACAAAGTATTGTGAGAAACCCCTTAGGCAGGTTGTACCACAACAATATCCTGTCTATTTCACAATACAAGTGGATAGGCTAGTTGAAAGACAGAAAAAAGTCCATGATCCCTTAACCCAGATACTAGACCCCTGGGATCAGTCCATCTATATGTCATCGGTGTGGACTAGACAAGCATACACTAACATGTTTGATAAGTTTCATTATGCCATGCCACAAGAAATACAACAAAACTACCCAGACCTTTGGGATTTCGCAACCAAAGTTGTCTTGGAAGAATATGGCTACCTTGAGAATTCTAGGATTTTGACACCTTTGCAGACAACTAAAAACATGAGATCGACTCCAGCTTTTCCAAAGTTTCTTCTGTATGACACTGAGGAGGAATACCAACTAGAAAATGGATGGGGTGAGTACATGCAACTCTGGAACATGCCAGCTGAAGAAAGAGATAAGAAAAGGCCATTGTGGTGGACTTTCCTGAAAAATGAAACACTTAAGCGGGAGAAAATTCAGAATGATGATATCCGAATGATCATGTGTACAGACCCAGTTTATACGAGGTTTGGAGCAGCTTTTGATCAACACCAGAATGAACAGATTAAAGAACATACCGAAGAGAAGAGTGCCCAAGTTGGCTGGACTCCCTTCTTTGGTGGCTTAGACCAACGCATTCGGCGGCTGGAGACTCGCGGCGATACCTTTGTCGAGCTGGACTGGACAAGGTTTGATGGGACTATACCCGTTGAAGTCTTTTCCCACATCAAGGAAATGCGCTGGTTTCTTCACAATGAGGATGATAAGACACCAGAGAACAGAGCTCGCTATGTCTGGTATGTTAAAAATCTTATTGACAAAATTGTGCTGCTACCGACTGGTGAAGTCACTCGGATTACCCGTGGCAATCCTTCAGGACAAATATCCACTACAACTGATAATAACTTTGTGAATCTCTTCTTGACAGCTTTTGAATTGGCTTATATGTACAAAGCTGAGCATGGAAAATTGCCCACTCTTGCTGAGTACTTTGATAATGTTGACATGATGTGCTATGGGGATGACAGATTATTAGCTGTCAATAGCTCTTTCCTTCATTATCGTAAAGATCTTGTACCCAGCATCTATAAAGGTATTTTTGGAATGTGGGTGAAAGATCAGAATATCAAGGTCTCAACAACTCCAGAAACGCTGTCTTTTTGTGGGCTCACCATCATTAAAACACCAACAGGGTATTATGGTGTTCCTAATGTTGATAAAATCCTTTCCACCTTTGAATACCCGGTTAGACCTCTGCCTTCTTTGGACGCACTCTGGGGGAAACTTCTTTCTCTAAGAATTCTGCTTGAATTTGCACCGCAGGCAGCGCGCGATTATCTTGCATTGCAAATGGCTAAGGTGAGAACATTAGCAGAAGCAGAAGGCCTTAAACTTCCGGAAGTTCCAAGGCACTTTTTCAGAAAAATCTGGACGGGAGGACCGAAAATTAGAGATGGAGAAACCTCAGAGGACCCGTCGTCCTAGGCAGATTCAGAAGAAACAAATAAAACAGGAGGTGAAGAAAGAGGTCAAAAAGGAAACAACAAAATTGGCACGCAAAACTCCTCAAAATCGTTCCCCTCGCACCGGCAAACTCACAACTAATGCTGGTGTCGAGGTTGGCTATGTGGTTGCCAAAGAATCAGAGGACAAGCGCAGGCTTAAACTTCTGGAGAAACGGCTCAATAAATTACAACAGAAGGAAAATGGACCAAGACCTCAGAGCGTTATGTCTACAACTCTAACGCTCGGTCCCATAAATGGTTCCTCACTTAATGATCTCAATCGCCAAATGCGATATTGGTTCAACCCAACACAGCTCAAACCAGAGGACTCCCTTGATACTGTGACACCACTCTCAGTGCGGGGGTCACAATATGACTTGTGGAAGGTTCTCCATGCGTCAGTTACCTTCCAACCTCTGGTGGGGTCCTCTGTGGTCACTGGCTCCCTGGTCTATTGTGATCTTGATCAGGAAGCTTCTTCTGCCAAACCAGAAACCATAGATTCTATTAAAGCGAGGCCTCATCTCGAACTCGCTCTGGGCAGGAGAAAAACTTGGGTTATACCAGCCCGCTTTTTACAAGGACCTAGAATGGGCTGGTGGTATGTTGATACCAATGAGGATCCATCACAAAGCTTGGGACCTGGGTTGAATTTCTGGACTTACATGCAGACCCAGAATCTGTTCCAGAAAGGAGATGAACAGCAAAAACCCTATACTGGTCCGCTTTTCCTGGCTGAAATGACCATCAGATATGCTTTTGCAAATTACAACCCAAAACCTGCACTATCCCAACTGAAAATGTACTCATCAGAACATGATGAGCAGTCCTCACACTATGAAGCAAAGTTCAAGAATGATGATGAGGGCAACCTTATAATGGAGGTGAAAGATAAACAGGGTTTTGGTCTTTTCCTTAAAACTTGGGACCAACATCACCACCATTATAAAGCAACTGGGAAAGAGGAGAAAAGCACAACACTCTGGTCCTTGGCGGGAACAGCTGTGTCAGTTGCAGCCAATGCACTAGGCCCCTGGGGCTGGCTACTTAAAGGTGGCTGGTGGGTGATCAGGAAGATCTTTAATGCCCCGGGCAATGGACAGGGGGTGTCGACCTATATGGTCTATGCCTCTGTTGAGGATGCATCCAAGGATAATTCTATCAAGCAGACTGTTCAATCAGCCAATGGGGAACTCACTGTCCCTTTTTCCACAATAAAGGTGAAGCAGATTAACAATCCTAATCTCAATAATCCAGGTGGAGCCCTGCCAGTTGCAGCATCGGCAATTATTACACCACCTGTGACACCAACACCAACCCCACCACCAACACCTGAGGAAAAATACTTTATGCCCCTGGTCCGTACAGGCTGGCTTCCATCAGTAGTGCCCATGTTCTACACTTACCAGCGAAGTGGGCAGGACGAAGGGCAATACAAGGATGAAACAGATTCTTCTTGGGCTTTCAAATTCTACATCACTGGGATTCCAGCCCTGCGAAGGGTTGTGCTGAAATATGATCGTGGGTACTACTTTGAGAGGATGAAAGTTAAGATGACTTCTCAAGGAACAGGAAAATGGTTTAAAACTTTCCAGATGCCTAATCTAATCACACCCACAACAACAACTGGAAGACCACGCTATCATGATTCTCCAGTGTGGTTTTGGGCCGACTTGAGAGAAACTGGTGTGCTTATGTCCAATGCCCCCAATACCCAGGTAGGGAATTGGTATTCTAGCCAGGGCACCATGCACACTTTTCGCACTTGGCGTCAGTCGGTTCTTAAGAAAATGGAAGAGGCAGAACCAAATCAATCTATTTTCCTTGAAGTCACTGTTGAACCTGAGTACCAGCACGAACTGCCTGATGGGACCCCAAGAACATATAATAAACAATCTGAAACCATCTTTACTGAGTTGGGAATCCACCCGGATACAGGAACCCTCTATGGCTTTCCTGTGGCTTTAGATGGGGATCCAGTCAAACCAGGACTCTTCCTCTATGACATGGATCAGGACCTCTTTGGCATTCTCTTTCCACTCTACGCCAAAGATAACCAGTATGTGGGGCGGGTTGAAGACAACAATCTTTATCAACCCGGTTGGAAATCACCTTTGACTGCTGTGATGATGTGGACAGAAACACATGGCTCAGAATGGCCAGACCTCACTGACTTCTCAGATAAGATCTGTATGCAAACCTCCTTTACAACAAAGGAAATCAAGGTTCAGCTGGAGGAGGAAGATTCCTCTGACATTGAGGTGGTCTCACTAGACCGCTACACAGAATTCCGTTCCGCAATGAACGTGAAACAAAACTATGGAGAAAGGTCGAAATACCTGTAAAATAATACTTGGAACCTCTAGCTCACGAGGTAAAACTGAGTACATCTGGAGGATGTATAAAATCTCCGCAAATTGCCTTCGGGCGACTACATGTGAACCCAAATTCGTGGGCTTACATGCAGCCAAACGAATCAGTGTTTG
| 50,611
|
MN920669.1
|
Astroviridae sp.
|
Chen,X., Shan,T., Yang,S., Zhang,W.
|
Jiangsu University, School of Medicine
|
China
|
2020-05-06
|
ybb150ast01
|
Astroviridae sp.
| null |
Astroviridae
|
ssRNA(+)
| 6,816
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Aves
|
feces
|
2018
|
SAMN13782218
|
PRJNA600556
|
MAG: Astroviridae sp. isolate ybb150ast01, complete genome
|
CTAAGTCTCTCGGCACCATTCGCTCATCCATTGGGGAATTGATGTTGTTGATTTGGCAGCCTTTGATTCCCTGACCACCAAGGCACAGAGAGAAAGCCAAACACAGGGTGCTTCGCGTATAACTGGAAGCCCCGGAACAATGGCTCTCTTTGATAGGATAAAACAGAAGTATGGTAACACCAATGCGTGGAAGGAACTTATGGCATGTGGTGGGTATCAACTTCTTGACATGTCCACAGCCTATGGGATCAAGGATGAAACACCCTATAAATTTACAGCAGTAAAACAGGGTGAGCTCTATAACATCGAGCTGAAAACAACAACATTGCCAACACAAGAACATCAACTCCTAAGAGCACAAGCGTCTAACCAACTTAGGATAAGGCTCTTTGCTGCACAATCCTCTCAGAAAACAGAGGAAAATATGCGCTTGCGCGAGCTCTTGAAGGAAAGGGAAAAGGAGTTACAGGAAAAAGACAGAGTGATACGGCATCACCAGCAGGAGGTGAAACTCCTCCGAAATGCTATCATTGACAGTAAAAACGCAGTGTCAGTGGCCGTTCGTGCGTCGTCGAGGACCTGGACTTTCGCCTGTATGTTGCTTCTCTTTCTCTTACTTGGCTTCCTAGCTGGTGAAACGCGTGCCCTTGAGACCGACTGCACAGCACAGATTGAGGGATGCTACTTTGATATCTTCAAACCATCAACCCGAGAACTCACTTACACTGAAATTCAACACATGTGCTATGGGAAAACTCGAACAATCCTGTCAGCACATGGTGTGAACATGACAGATCTTCTTCTGCAATGTGAGAATCAAATGGCAGCCTTATCACCAAAGGGACATACCCAATGGGTGGAGGAATGGTGCCGAGAGACATTGACCCCGAGGATGAAATTTGCAGAATGTAAGAAGAGAACTTGGGAACAGATTATTGATGATAAACTAGAACCAATCCATGCAGTCATCACAGAGATTAGAACAATGGGGATACAACCTCTATTAAATCTCGCAAGCTATGCCTTTCTCTTGGCCACAGTGCTTGCGGAGGCTAATTTTTGGTTAGTGGGGCCAATCCTAGTCCTATCCTGGTCTCTGGGAATACCACCCCTTTTCACCTCCCTCGCAACACACTTCTTTCCACTCAAAACCTTTCTGTATGTACCCATTGTACAGATGGTTGGGGAGGAATTCAGACATTGGGCATTCTTTGCACACTGGATGACATCCATTATGTATAACACCTTTGTTGAAAAAACCTATGCAGCAATATCGCATGGGCTCTTGATGGCATGCTTGCTCCCAATCTGGTACTATTCAGCTGTCTTTGTTAAGCAGTTTAAAATACCACTTGGTGCACAGCTAGTGATGCTAGCTATAAGTATTTCAACAACCATTGGAATGAAATTCTTGAATTCGACGGTAGTCATAACACGGCCAGATGGAACAACAGAGAAACACCGGAGAGTGGATGTCATGAAGGAAGGTGTGAAAGAGAGGTACTTAAAATTGCAAAGTGCAATAAGGGGTATTATACCAGAAATACCAGATAAAACCAGATGTATTTTGAAGGTTGAAACCCAAAATGGAATAGGGGTTGGTTTTAGGTTTATGAATGAAATCCTGACAATTGGACATGTAATGGGGGATCAAGATGTAGCAACCCTCCGCTGGAATGGAATGGGTGTCACAATGCATGTGAAGAAAAGGATCCAGCTCTTTGAGAGCTGTGATGAATTGGTCTTCTTTAAACTCCCACCAGAATTTCAAGGAATGAAGCCCCTTCGCCTATCGAAATTGGAAACATCAGACTACATGCAGCTACTCGTCTTTAAGGATGAGGAAATAGCAACATATACTGGCTGGGCTATGTTGGATGGAAACTGGATATCTAACACCTTTCAAACAAAAGCAGGAGACAGTGGGGCGCCCTATGTAGATAGGAATGGGCGTCTGGTTGGAATACATCTAGGAACACAAGGTGTGGTGGCGCAAGGCTACTCCCTGATGCAAGTCCTGAAACAACAGCAACCAGTGCCCCTTGCACCTGTGAATGAAAACCCCCCAGTGCAAACACCGACTGGACCAACAGTTGAAGATATAATGAGAGAAATCGATGCACTTAAAAAACAAGGGGGCCTTATCCCAGTGCAACAAGCACAGCCAGATGTAGAACAGCTAAGTGATGATATAATGGCGAAAGTCATTGAAGGTACAAAGAAATCACATGCTGCGCTAACGGCGGAAGTGGAGAAACTTGCAAATGCAGTTAATGCATTGTTAAATATGGTGGAATGCCAAGCACAAATGATCAAGAGTCAAGAAGAGCGCATCAAGAAACTTGAAGAGCCAAGTGAGACCAGCATCATTGAACAAAAGAAGAAAAGGAACCAGCAGAGGACGGAGAGGTTCATGAAAGTCAAAGTTCTTACAGAGGAAGAATACCAGAGAATGCTGGATGAGGGCTGGTCCGCAGAAGAAATAGAAGATGCAGTGAGGCAGTTAAGACAAAGTGCCTGGCGTGATTACGAAATGGAAGAAGAAGACTATGAGCCTGAGGAGATCATGGATGACTTTCTGATGACATATCAGAAAAAGAAACCGAAAAAAGGGCAGAAAGTGGTAACATGCTTTGAAGACGCCATCTCCATTATGCAGCAGTCCAGGAAAACATATAAGTGCCCAAAATGCAAAGGCCGCTTCCAGAGAGGAGACAGACATAATCCTAAAACATGCAGGTCAAAACAGGGAGAGAATGTCGAGCCAAAAAACTCCCAGAGGGGGGCTCAGAGGGCCCCCCAATAAAAATTTTTGACTGGAAATATTATGTTGAGAAACCTTTCAGGCAGCTTGTGCCAGAAACACACCCAGTTCTCTTTCGAATTGATGTGGATAGGCTTGTGGAAAGGCGGAAAAAGGTGAAAGATCCACTAACACAAATAGTGGACCCATGGGATCAAAACACCTACGCCTCAACAACATGGACATCAAAAGCCTATACAAATATGTTTGAGAAGTTTGACTATGCAAAACCACAAAAAATACAAGAGAACTACCCAGACCTGTGGGATTTTGCAACACAAGTGGTCCTGGAGGAGTATGGCTATTTAGATCAAAGCCAGATAATAACACCTTTACAAACTACAAAGAACATGCTCTCAACACCTGCATTTCCAAAATTCCTCCTCTATGATAATGAGGAAGAGTATCAACTAGAAAATGGTTGGACAGAATACATGGAGCTCTGGAATATGGATCCTGATGAAAGAGAAAAAGAAAGGCCGTTGTGGTGGACCTTCTTGAAGAATGAAACTCTAAAAAGGGAAAAAATTGAGAAGGATGATATTAGAATGATCATGTGCACAGACCCAGTCTTCACACGCTTTGGAGCAGCTTTCGACCAACACCAGAATGAGCAAATAAAAGAACATACAGAGGAAAAAACCGCACAAGTTGGGTGGACACCCTTCTTTGGTGGGTTGGACCAAAGAATTCGGCGGCTGGAGACTCGCGGGGATACCTTTGTCGAGCTGGACTGGACAAGGTTTGATGGCACAATACCCGTTGAAGTCTTTTCCCATATCAAAGAAATTCGTTGGTTCCTCCACGCAGAAAAATATAAAACACCAGAAAACCGTAGGCGGTACACTTGGTATGTTAAAAATCTCATAGATAAGGTCGTCCTGCTCCCATCTGGGGAGGTAACAAGGATTACAAAAGGAAATCCATCAGGTCAAATATCAACCACCACAGATAACAATATGGTTAATCTCTTTCTCACTGCCTTTGAGTTGGGCTATATGTATCGCAGTCAAAAAGGGCGAGTCCCAACTTTGCAGGAGTTCTTTGACAGTGTTGACATGCTTTGCTATGGAGATGATAGGCTGCTATCAGTGAATGACAATTTCATCAAGTACGACGAAACTCTGGTACCCAACATCTACAAGGGCATCTTTGGAATGTGGGTTAAACCACAGAACATTAAGAAATCATTAACACCAGAGCAGCTGTCCTTCTGTGGGCTGACCCTCATTAAAACGCCCACAGGCTATTATGGTGTCCCAAATGTTGACAAAATCTTGTCCACCTTTGATAATCCAGTGAGACCATTACCATCTATTGAAGCCCTTTGGGGAAAACTCCTCTCATTAAGAATACTGCTCGAATTCGCCAGTGATGAGGCGAAGGAATATCTCTCCCTACAAATGGCAAAAGTAAAAGCGGTTGCCATAGCAGAAGGCCTAAAACTTCCGGAAGTTCCTAGGCACTTTTTCAGAAAAATCTGGACGGGTGGACCGAAAAAAGACTATGGAGAGTCAAAAGCCAAAACCGCAGAGGGAGCGTCGCCGCAGGCGCGAGCAGAAAAGGGAAGAGAGGATGGCAGAAAAAACAGCAGAGAAGGTGGTCAAGAAAGTGGCAGTGGGACCCAAAAAAGGGAAGCCACGTCGGAACCTGGTACTAACTAATACAGCAGGTGTGCAGCTAGGTATGACAGTTTCCAAGGAGAGTGAGGACAGGAAGAAACTGAGACAGCTTGAAAGACAAATAAAATCTCTTAAAAAATGTGAGGATGGCCCGAAAACTCAAAGTGTCATGACAACCACACTAACCCTTGGTTCATTAAATGGAACACCACTAAATGAACTGACAAGACAGATGAGAGTCTGGCTAAATCCGTGCCAATTAAAACCGGCAGATGCGGGTGAAGCAGCAACGCCCCTAACAACTCGGGGTTCTCAATATGATTTGTGGAAAGCCATTAGTGTCACCCTAGTCTTTCAACCCTTGGTTGGACCCTCGATTGTAACGGGGTCTCTGTGCTTCGCTGACCTTGATCAGGATGGGTCCTCTGCGAAACCAGAAAACATAGATTCTATCAAGGCAAGACCGCACATAGAGCTGCCAATTGGCAAGAGGATAGTGTGGAGATTACCCGCTAGGTTCTTGAGGGGACCGAGAGCGGGTTGGTGGTATATTGACACTAACGAAACACCAATGCAAAGTTTGGGACCAGCAGTAAACTTTTGGACCTACCTCAATACAAAGAACCTGCTTTCCGTGTCTCAGAAGGCAATGGGCGGAGCAGATGCTGGTGACACAAACACCTATGAGGGCCCACTCTTCTTGGCGGAGATGAGAGTTGTCTATGCCTTTGCTAACTATAACCCAAAACCAGCCCTAGCACAGCTAGGCGCAACATCCCTAGACAATAAGGTGGAACATGAAAATGCACAGTTTGCAAATGATGATGATGGAAACCTGATCTTGCAGATCAAAAAAGACTCGGCAGCTGCAAAATATATGAATGCAGTGGAGCAAACTGTCACACTTGCTACATCCACAAAAGAGGAAAAATCCAGTGTAGCATGGTCAATTGCTGGAGAAGCAGTTAATGCAGTGGCAGGGGCCTTAGGGCCTTGGGGCTGGTTGGTTAGGGGTGGATGGTGGGTCATCCGCAGAGTCTTTGGAGGCCCAGCAAGCAGAGGAACAGAAACAGTCAACTATATGGTGTATCCTGGAGTGGAGGATGCTATGAGAGACAATCCCATAAAACAGCAAGTTTCCAGTGGAGAAGGAAAAATGCCAGTTGGGCTGTACAGGATAAGACAACTTAATAACCCAAATGTGAATAGACCAACAAGTGCACAGGTCTCATACTACACTGTGAAAACACCAGGTGATACACCCACACCAACACCAGAACCAGAACCAGTGCCGCCAGAAGATCAAGAGAAGTATTACATTCTGCCGACAAGTCTCCACAACCCACAGCTGAAGCAGATGCCACCCATCTATGAAGTTCAAAGAGTGATAGATCAGGAAGGTGGGTATGGAGCACCAACTTTCAACCCACATGTTGGACACTGGATGAATTGTTTTGTGATAGCAGGAATACCATCAATCAAAAAATATTCAGTCTATAGGGATGGTAGAAAAGTGTATGCAAGGTTCAAGTTCACCTTAAGATCAAAAGCTGGCTGGAGCTTCCACTACAACTTTGAAATGCCAGGCTTGGATCCCAGTGCAACAAGCCACCCATTAATACCAAACACATCATCAGTTTGGTACCTACAAGACCTGACTCACTCCTTTGTCACACTGGCATCCTGTGTGAGGGATGATGTTACAACATATGCAAGACAGGGACAACTGCACACATCAAATACGCTGTTGGCAGCAATTCAAGATGAGTACCCAACTGCACAGATGTTTGACTTGCAACTGGTGGATTCCCTTGAAGGTGGTGAATATTGGCCACAACTGATGGAAGCAATGAACATAAACTGGCAAACAACCTGCTGTATTCCCATAGCAATGTGGGGTAATAGATATCAACCTGGCTTGCTTTTCCTAGACGCTGACCAAGAAACAATCTTTCTGGTCCATCCTGACCAAGTCTGGGAAGCCTGTCACCTGGAACAAGGATTAACAACAGATCAACCCACACCGATAGTACAAGGAGCCCAGCTCTTGTGGGGCTCCTTCTTGTATGGGGAAAACCAGCAGGACGTGGATGCTTTCAATTCTAAGGTGATCTTTAGATTGGACATGACAACTCATGACCTCAACCTAACTGCAGAAGATGATTTTGTCATTCTTGACCGTTCCGCAATGAACGAGAAACAAAACTAGGAGATAGAGAGAAAACTCTGTAAATAAACCACCTAGCTCACGGTGTAAAACTGAGTACATCTGGAGGATGTATAAAATCTCCGAAAATTGGCCGTAGGCCACAGGCGCCACACCCAAATCGGGGTGTAGCGCCCGTCCAAAACAATCAGCCGTTTTGGACCAAATGATTCAAAAATCTGTCT
| 50,612
|
MN920670.1
|
Astroviridae sp.
|
Chen,X., Shan,T., Yang,S., Zhang,W.
|
Jiangsu University, School of Medicine
|
China
|
2020-05-06
|
ybw202ast01
|
Astroviridae sp.
| null |
Astroviridae
|
ssRNA(+)
| 6,701
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Aves
|
feces
|
2018
|
SAMN13782218
|
PRJNA600556
|
MAG: Astroviridae sp. isolate ybw202ast01, complete genome
|
GTGCAAAGACTACAACCAAGACCGAAGTCCAGCTATAGTGATTTGCAACTTGCACAGTCCTCTCTGCCTCATAGTGTTTTGATCTTACCGTATCACGCAAAACGCCAATTTCCATTTTCTGCTGCTTAATCAAAATCTCATTCGATTTGAGTTGTTCCTTAAGCTTGGCGTTTTCATCCTGCAACTGCAGAACGGTAGCGGCTCAGTTGGAAGTCGCTGGAACAGAATGGCCAATCATGAAATTGGAATTGCCAAATTGGCACCCTCACATGGTGCACCCAAACTTTATAAACTAATGAAGGAAAAGTTTGGAGGAACCCAGAAATGGGGTGAACTGATGAAATGTGATTCCATCATTGTGCAAAACTTAAACACTGCATATGGCTATTTAGAAGGCGACTATTTTATCTTTGAGGCCACTCGGTATGAAGATGGCTGGAACCTGGATATACGTAAGAGCTTTGCTTTACCAGAAGAGGATAAATTAGCTCTGCGAGCGCACTCAAGTCATGCTATGCGCTTGAGAATGACTCAGGCTCAAAGTTCCAACCGAGCCGCTACCGTTCTGCAGTTGCAGGATGAAAACGCCAAGCTTAAGGAACAACTCAAATCGAATGAGATTTTGATTAAGCAGCAGAAAATGGAAATTGGCGTTTTGCGTGATACGGTAAGATCAAAACACTATGAGGCAGAGAGGACTGTGCAAGTTGCAAATCACTATAGCTGGACTTCGGTCTTGGTTGTAGTCTTTGCACTAGTCCTGACAATGTTTGCTAATCCTGCCTATGCTGAAGACTGTACTAAACCCGTACACGGCTGCTATCTGGACCCAACATCAAAGAACCGTGCCGTCCTGGATTTTACACAATTTAATACCAAGTGTTTTGGACAGACAACGACGCGTATACATCCAGATGCAGTAAATCCTGAACTCTTGGCAGCAGAATGTGTTGAACACCAGATGAAAGTCTTTGGAATTGGAGAATGGATAAAGGACTGGTGTAATACCACCATTGACTTGAGGCTGCATAGGACTATATGTGAGAAAAAGCAGTTTAAACATGTAATTGAGGATTACATCCTAGAAACAATCTATACTGCTGATATGATGACTTTTGAAAAATTTCTACCCTATGTTTGCTCAGTCTTTGGGGTGGTTACAATCTTTGCTGGCTCAGATCCCTTTAAGACACTACCAATTTACTTATTGGGATTATATGCAAGAATACCAACATTTGCATTGAGCCTTGCTTTGACATTGTTCCCAGCAATATCGCTCCCCTTCCTCATGCTCTTGTGCATCTTACCTGCAGACTATTTTATTCCACTGATAGTTACACACTGGTTAGTCAGTGTGATTTGGGCAGCGACGGTGCACAAGACCATGGAGGAGGTGTCAACAGCTGTGGTTTATTCAGCCCTTCTACCCTGTTGGCACATTGGAGTCTACTTATTGCAAACCTATTCAGTCGGTTTGCCAGCACAAATATTGTTGCTAGCGGTAACTCTTACGCTAGCAGCTGGAACATGCTACGCACAATCAACAGTAGTGATAACTTCCCCGGACGGTACCACCACTAAAACTAAGAGAGTTGAATTTTTAAAACGTGGTGCTAAAGAAACACTGCTGAGAATGCAGAATGCTGTTAGGGGAATTATTCCTGAAATACCTGATAAAACGAAGTGTGTAGCTAGAATTGAAAGTGCAGTGGGCTCTGGTGTTGCTTTCAGATTTATGAATGAGCTCCTAACTATTGGGCATGTGATCGGCCCAAATGACACTGCAGTAGTCACTTGGGGAAATGTAACAACGAGACTTGCAGTCAAGAGAAGAGTCCCACTCTTTGAGAGTGCTGATGACCTAGTCTTTTTTAAATTACCATCAGAGCTGCAAGGAATGAAGCCCCTGAGATTGACTAGAATAACGACATCAGATTACATGCAGTGTCTTAGCTTTGATCAGAGTGAAATTGTTACCTATACTGGCTGGTGTATAAGGGATGGCTACTGGTTAGCTAATTCCTTTAACACAAAACCAGGAGATTCGGGTGCCCCCTATATTGACAGACATGGGAGACTAGTTGCCATACATCTTGGCACGCAAGGGGTTGTTGGCCAAGGCTATTGTCTTGATGGTGCATTGAAACAAGAAAGTGTTGTACCTCTAGCACCAGTAAATGAGAATCCAACCCCAATTGAGACCCGTGAACCAGTCGGAGAGGTTGTTAAGGAGCAATGTAGAGCTACAATAGAGCAACTCGGAGACGAATTGCTCAGTAAATTGATTGAAGGCACCAAGAAATCCTTTGCTCAGATAACATCAGAAATGGAAAGACTTGCAGGAGACTATTCAAGCCTCAAAAACATCTGTGAAACAAAAATAGAACAACAGGCTAATCAAATTAAAGCCCTTGAAAATGAGCTCAAGACCCTGAGGTTATCTATGATGATAACACAAGCCAATAATGAACCCGTCATTGAAGAGAAGAAAAAAGGGAAAAACAAGAAAGGCGGTGTGAAAGAAAAATTCATGAAAATGAAGGTCTTGACTGAAGAGCAGTATAAACAGATGTTGGAAGAGGGCTGGTCACCGGATGAAATTAAAGAAGCCGTTAACCAGTTAAGAGAACAAGCTTGGCTTGCTTATGATATGGATAGTGATGACTATACAGATAATGATGAAGAACTGCAGGCTGAGCTCGATGATTTTCTTTTTAATCAGAAACAAAAGACGGCTAAACAAGGCAAGCTTGAATTGGCACCAATTGATATTGTGTTGCAAGAAGCCAAACGTAGGATAAGAAATAGAGTTATAACTTGCCCTGCATGTAAAAATGACTTTACCGGTGGACATAATATCATTCTCTGCAAGCGCATCCAGGAAGGGAAGAACATCTATCCCAGCAGGTCTGAGAATCCCAAATATCAGAGACATAGACAACATGAGAAGAAAGATGAGGAGCCAAAAAACGGGAATGGTGGGAGGAAGGGGACCTCCCAGTAAAGATCTTTGATTGGTACTACTACTTGGAAAAACCCCTAAGACAACTAGTACCAAATGATTTTCCCGTAATTGGCCAGATTCATGTTGATAAACTGGTTGAAAGGAGGAAGCGTGTGACAGATCCCTTGACCACCATTCTAGATGTCTGGCAACAGGATAAGTATATTTCAACAACTTGGACACGGAATGCGTATACCAAAATGTTTGAAAAATTCCACTATGCGGATCCACCTGAAATAGAACAGCTTTACAAAGACATCTGGGACTTTGCTACCGAAATAGTTCTTGATGAATATAGCTATATGTCCCAGTCTATGATATTGTCACCCTTGCAAACAGAGAAAAACATGGATTCAACTCCAGCTTTTCCGAAATTTTTACTTTATGATACGGAACGTGACTATATTGAGGAGCACGGCTGGACTGAATATATGGAACTCTGGAATGCAGACAAGAGAAAGAGAGTTCTCTGGTGGACCTTCTTAAAGAACGAAACATTGAAGAAACAAAAAGTGGAACAAGATGATATACGCATGATTATGTGTACAGATCCTGTTTTTACTAGATTTGGAGCAGCATTTGATCAACATCAAAATCAGATGATGAAAGAGAGAACAGAAACGCACCAAGCGCAAGTGGGCTGGACCCCTTTTTATGATGGCTTTAATCAGCGGCTAAGGCGGCTGGAGACTCGCGGAGATCAGATAATTGAAATGGATTGGACCCGCTTTGATGGGACTATACCCGCTGAAGTCTTTTCCCATATTAAAAATATCCGCTGGTTTTTGCATGCTGAGGACTATAAAACCTCAGAAAATAAAGAGCGCTATGATTGGTACGTATTCAATTTGATTAATAAAGTAGTGCTACTCCCTTCAGGTGAGGTTACAGTTATAAGAAAAGGAAACCCCTCGGGTCAGATTTCAACCACGACCGACAATAACTTTGTTAATACTTTCTTAACAGCCTTTGAGATTGGTTTTCTCCATAAAGAACAGCATGGAGTTTTGCCAACTCTGCAGGAATATAGGCTGAATGTTGATAGTATTTGTTATGGGGATGACAGGCTTTTGTCTGTTAATAAAAACTTCCTGGACTATGACCCCCTGAAAATACCAGACTTCTATAAGAATGTGTTTGGAATGTGGGTGAAACCAGAAAACATCAAGAAGTTCCCCACTTGTGAAGGAACATCATTTTGTGGCCTGACAGCAGTAAAGTCACAATCAGGCTATGTTGGAGTTCCAAACGTTGACAAGATCCTCTCGACGATTGAACATCCAACGAAAAGGCTACCAAATATTGAAGCTCTGTGGGGAAAATTGATCAGCTTGCGGATTCTTACAGAATTTGCGCCGAAAGAGGTTAATGACTACCTTGCTATTCAAATAGCGAAGGTGCGTGAAGTTGCTGAATCAGAAAATATAGAACTTCCGGAAGTTCCTAAAACATTCTATCGCAACATCTGGACGGGAGGACCGAAAATTAATGGCAACCCCGAAACCTCAGCGAGTGCGCAAACAGCGCAAGCAAAAGACGGAAGTCGACATCAAAATTGATGCGAAGACAAATGCAAAAGAAAAGATCAGAATACGAAAGCCTAGACGACCTATTAAACAACCAAAATCAAACATGGCTTTTGCAGAGGCTTGTAAGGAGGTTACTAAGCTGCGCCGCGAGGTTACTAAACTTCGTAAGTGCGAAAATGGGCCAAAGATTCAATCCACTATGGAAACGACCGTCACACTCGGACCAGTTAATGGAAATCTCGGTGGCGGGTTGGAAAGATCGCACAGGCAGTGGCTTTCCCCCATTTTGTTAAAAACACAAGATCAGGGCGCAGTGGCTACACCTCTCTCTACCCGTGCAAGTCAGTACAACCTATATAAAATACTTAAGGCTGAAGTTGTTGTCACTCCACTTGTTGGGAAGGCAATGGTGGCTGGCACAGTAGTGTTGGCTGATGTTGACCAGGAAAGCTCGTCAGCGAAACCCGACACAGTTGATTCCGTCAAAAGCAGGTCCTATATCGAAGTTTCGCTGGGTAGCTACCGTCGCTGGAGACTACCTGCAACAACGCTGAGGGGGCCCAGAGAGGGTTGGTGGCTCATAGATAGTAATGAGCAGCCCACATCCTCTCTTGGACCAGCGGTAAACGTTTGGACCTACATGCAAACTCGGAATCTGATGGGAACCACCAATGAAGACACAACTTTCTATACTGGTACAATTGCACTTATTGAAATGAGGGTTAAATATGCCTTTGCAAATTATAATCCGAAACCAGCATTGGCACAATTGATTGCCACTAAAGAACCTTTGAAACTGGAGAGTGCACAGCTAGTTAACAACACAGCTGACACTTCAGTAATGCTTGAGGTTGATGCTAACTCAAAAATTGGCAGAATGCTCGAAGAGAGAGATGGAACACAGAAGAGTGGAAAAGGTTCCACTTTTTGGTCTGTGGCTGGTGATGTGGTGAATGTCGTTGCCCCTGCCCTCGGACCCTGGGGCTGGCTCTTGCGTGGTGGGTTCTTTTTTATCCGACGCATTTTTGGAAAAACTGAAAATGCTAGGGCAGGGAAGAACTACTACCAAGTCTACTCCTCGGTAGAGGATGCGGCGCGCGACTTGCCTATTTACCAGCCTCTGACCTCAAACTCAACAAAGTTCCCAGAGGGACATTATCATTGGCAACAGCTCAACAGTGAGAATCTCTCAAGCCAGAGCATGAGCATTATACCCAAAAGCACTACCTTGGAGTTGATGGGCAACTTCCTGCCAGTTAACTATGCACCAGATCCAGAAGAAATACCTCCACCAGCTTATGCTTATAAGAATGGAGAGGAATATGCACCATCCTTCCCAAATATATTACTGCCACCGGCTGGTGGTGATGACCCAGTTGATAACATCATTGAAATCGAGGGTGAAGGCACCTGGTATTGGCTGGATGAAGGGGAATATCCTGAAAGGGATCTTACCCTGAAGTTTACCACATACTATGGCCAAGGACAGGCTGGTGGTTCCACCTGGTTCCTTAATGGAACCTTCTTGAATTTCTATGACTTGTCCGACTTCGGACAAGTGGTGGGACACAATGAAGCCAGGACATATGGGTTGATGCACACTGCGTCAACCTTTATGAAATCACTTGACTCAAAATGGGAAAAATCAGAATCCAGCTATACACCATCGATGCCAAGCCAGGTCTTTTTACATCTTTCGACCTGGTCCCCCCCGAATTCGCGCTGGGAAGCCTTTATGCAACACATAAGGGCATATGGGGAGAGAACGGTATTTATACCGGTACATCTCTGTGATGGTGAACTCGGCAATGTAATTGGCCGTGAAGGGGAAGCAGCAGAATCTGGAGCGACTGGCGTTTTGCTAGTTAATTTGGAGAAGCGTGTAATGGGTATTATTTTTGTAACAAATGATTGGCCTGAAGCATTGACTGGACAGTTTCATAAGATCTGGGCTTGTAATGCCAGAAACTGGACCAACTTTATGAATAGGCGTCGGTGTTTTGTGCCGCATGCAGTCGAACTTCCTGATCAGAATTTTCTTGATGAGAAAACTGAGAAACACTCCAAACACCCGGCTCCAGAACAGAAACCAACTGACCCAGAGTCGGATTCAGATTATGAGGTGATCAAGAAGAAGAAGAAGATTCCGAAACGAATCTAAAAACTAC
| 50,613
|
MN920671.1
|
Astroviridae sp.
|
Chen,X., Shan,T., Yang,S., Zhang,W.
|
Jiangsu University, School of Medicine
|
China
|
2020-05-06
|
ytb089ast01
|
Astroviridae sp.
| null |
Astroviridae
|
ssRNA(+)
| 7,172
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Aves
|
feces
|
2018
|
SAMN13782218
|
PRJNA600556
|
MAG: Astroviridae sp. isolate ytb089ast01, complete genome
|
AGTCAGTCTCAAGGGCACGCGTTTCTCCAGCAAGGAAGCCGAGCAAAAGGAAGAGGAGTAGCATACAGGCAAAGGTCCAGGTTCTAGATGATGCACGCACTGCGACTGTCACCGCATTTTTGCTGTCAATGATGGCATTACGCAGGAGTTTCACCTCCTGCTGATGGTGCCTTATCAATCTATCCTTTTCCTGTAGCTCTTTCTCCCTCTCTTTCAGGAGCTCACGCAAGCGCATGTTCTCCTCTGTTTTCTGAGATGATTGCGCGGCAAAGAGTCTTATCCTAAGCTGGTTAGATGCTTGCGCCCTCAGGAGCTGATGTTCTTGTGTTGGCAATGGCAGCCTTTGATTCCCTGACCACCAAGGCACAAAGAGTGAGCCAGACACAGGGTGCTTCGCGTATAACTGGAAGCCCTGGGACGATGGCCCTCTTTGATAGGATGAAACAGAAGTATGGTAACACCAATGCTTGGAAGGAACTTATGGCATGTGATGCGTACCAACTTCTTGACATGTCCACAGCCTATGGGATCAAGGATGACACACCCTACAAGTTCACAGCAATAAAACAGGGTGAGCTCTACAACATTGAGCTTAAGACAACAACATTGCCAACACAAGAACATCAGCTCCTGAGGGCGCAAGCATCTAACCAGCTTAGGATAAGACTCTTTGCCGCGCAATCATCTCAGAAAACAGAGGAGAACATGCGCTTGCGTGAGCTCCTGAAAGAGAGGGAGAAAGAGCTACAGGAAAAGGATAGATTGATAAGGCACCATCAGCAGGAGGTGAAACTCCTGCGTAATGCCATCATTGACAGCAAAAATGCGGTGACAGTCGCAGTGCGTGCATCATCTAGAACCTGGACCTTTGCCTGTATGCTACTCCTCTTCCTCTTGCTCGGCTTCCTTGCTGGAGAAACGCGTGCCCTTGAGACTGACTGTACAGCACAGATTGAGGGATGCTACTTTGACATCTTCAAACCATCAACCCGAGAACTCACTTATACCGAGATCCAACACATGTGCTATGGAAAAACTCGTACGATCTTGTCAGCACATGGTGTAAATATGACGGATCTCCTCTTGCAATGTGAAAGCCAAATGGCGGCATTATCACCAAAGGGGCACACACAATGGGTGGAGGAATGGTGTCGAGAAACACTGACCCCGAGAATGAAGTTCGCAGAGTGCAAGAAGAGAACGTGGGAACAAATTGTTGATGAAAAACTAGAACCAATCCACGCAGTCATTACAGAGATCAAAACAATGGGAATCCAGCCTCTTTTAAACCTTGCAAGTTATGCATTTTTATTGGCCACAGTACTTGCAGAGGCTAATTTTTGGTTGGTGGGACCAATTCTGGTCCTATCCTGGTCTTTGGGAATACCACCTTTATTCACCTCTCTTGCCACACATTTCTTCCCATTAAAAACTTTTCTGTATGTGCCTATCGTACAGATGGTTGGGGAAGAATATAGACATTGGGCATTCTTTTCACATTGGATGACGTCCATAATGTATAACACCTTTGTGGAAAAAACCTATGCAGCAATTTCGCATGGTCTTCTAATGGCATGCTTACTTCCAATCTGGTACTATTCAGCTGTCTTTGTTAAACAGTTCAAAATTCCACTCGGCGCACAACTAGTAATGCTGGCTATCAGCATTTCAACAACAATTGGAATGAAATTTCTGAACTCGACAGTGGTGATAACAAGGCCAGATGGAACAACAGAAAAACAACGTAGGGTGGACGTCATGAAAGAAGGAGTGAAAGAGAAATACCTGAAACTGCAGAGCGCAATAAGGGGAATTATACCGGAGATACCAGAAAAAACTAGATGCATACTGAAGGTTGAGACCCAAAATGGCATAGGGGTTGGTTTTAGGTTTATGAACGAAATCCTGACAATCGGACATGTGATGGGAGATCAAGACGTGGCAACCCTCCGCTGGAATGGAATGGGAGTCACAATGCATGTGAAGAAAAGGATACAGCTCTTTGAGAGCTGCGATGAATTGGTCTTCTTCAAACTCCCACCAGAATTTCAAGGAATGAAGCCCCTCCGTCTATCGAAATTGGAAACATCAGACTATATGCAGCTATTGGCTTTTAAAGATGAAGAAGTAGCAACTTATACCGGCTGGGCTATGTTGGATGGAAATTGGATATCCAACACCTTTCAAACAAAAGCAGGAGATAGTGGTGCGCCCTATGTAGATAGGAATGGGCGTCTGGTTGGAATACACCTAGGAACTCAAGGCGTAGTGGCGCAAGGCTACTCCTTAATGCAAGTCCTGAAACAACAGCAACCAGTGCCTCTTGCACCCATAAATGAGAACCCAATAGTGCAGACACCAACTGGACCAACAGTTGAAGACATTATGAGGGAAATCGATGCACTTAAAAAACAAGGGGGTCTCATTCCATTACAGCAGGCACAGCCAGATGTTGAACAACTGAGTGATGAAATAATGGCAAAAGTCATCGAAGGAACAAAGAAATCACATGCTGCATTGACGGCGGAAGTGGAAAAACTTGCAAATGCAGTTAATGCATTGTTGAACATGGTGGAGTGCCAGGCACAAATGATTAAAAGCCAAGAGGAGCGCATCAAGAAACTTGAAGAGCCAAGTGAGACCAGCCTCCTTGAACAGAAAAAGAAGAGAAACCAACAGAGGACAGAGAGATTTATGAAGATCAAGGTTCTCACTGAAGAAGAATACCAAAGAATGTTAGATGAAGGCTGGTCTGCAGAAGAAATAGAAGATGCAGTGAGGCAATTGAGACAAAGTGCCTGGCGTGATTATGAGATGGAGGAAGAAGACTATGAACCTGATGAAATCATGGACGACTTCTTAATGACTTATCAGAAGAAGAAGCCAAAGAAAGGGCAAAAGGTAGTCACATGCCTTGATGACGCCATCTCCATTATGCAGCAATCTCGAAAGACCTATAAATGCCCAAAGTGTAAGGGGCGGTTCCAGAGAGGAGATAGACACAATCCCAAAACATGCAGGTCAAAACAGGGGGAAAATGCTGAGTCAAAAAACTCCCAGAGGGGGGCTCAGAGGGCCCCCCAATAAAGATCTTTGACTGGAAACATTATGTGGAAAAACCTTTCAGACAACTTGTGCCAGAAACCCACCCAGTTCTCTTTAATATTGATGTGGATAGGCTTGTGGAGAGGCGGAAGAAAGTGAAGGATCCCCTAACACAGATAGTAGATCCATGGGACCAAAACGTGTACGCCTCAACAACTTGGACATCAAAAGCCTATACTAATATGTTTGAGAAATTCGACTATGCAAAACCACAGAAAATACAAGAGAACTATCCAGATTTGTGGGATTTTGCAACACAAGTAGTCCTGGAAGAGTATGGCTATTTAGATCAGAGCCAAATAATAACACCCTTACAAACCACAAAAAATATGCTTTCAACGCCTGCATTTCCAAAATTTCTCCTCTATGACAATGAAGAAGAATATCAATTGGAGAATGGATGGACAGAGTACATGGAACTCTGGAACATGGATCCCGATGAGAGGGAGAAAGAGAGACCTTTGTGGTGGACATTCCTTAAAAATGAAACCTTGAAAAAGGAGAAAATTGAGAAGGATGATATTAGGATGATAATGTGTACCGATCCTGTCTTCACTCGCTTTGGGGCAGCGTTTGACCAACATCAGAATGAGCAAATAAAGGAACACACTGAAGAAAAAACAGCACAAGTTGGCTGGACCCCCTTCTTTGGCGGCTTAGACCAGCGTATCCGGCGGCTGGAGACTCGCGGGGATGTCTTTGTCGAGCTGGACTGGACAAGATTTGATGGCACAATACCCGTTGAAGTCTTTTCCCATATTAAGGAGATACGCTGGTTCTTGCACGCAGAGAGATATAAGACAGAAGAGAATCGTAGGAGGTACACATGGTATGTTAAAAACCTAGTGGATAAAATTGTTCTTCTACCATCAGGGGAAGTAACTAGGATCATCAAAGGAAATCCATCTGGACAGATATCAACCACCACCGACAACAACATGGTCAATCTTTTCCTCACAGCATTTGAAATTGGGTATATGTACAGGAGCAAAACAGGCAGGACACCCAGTCTGCAAGACTACTTTGATAATGTAGACATGCTGTGCTATGGTGATGATAGGCTGCTATCTGTGAACAGCAACTTCCTGGATTATGATGAAACCCTGGTACCAGATATTTACAAGGGGATCTTTGGGATGTGGGTCAAACCACAAAATCTTAAGAAAACAACAACACCAGAAAAACTCTCCTTCTGTGGTCTGACAATTGTAAAGACTGAGACAGGGTACTATGGTGTACCTAATGTGGACAAGATATTGTCCACCTTTGAAAATCCAGTTAGACCGCTACCGTCTATTGAGGCGCTCTGGGGAAAGTTACTCTCATTAAGGATACTCTTGGAATATGCTAGCGACGAGTCCAAAGAGTATCTTGCCCTTCAAATGGCTAAAGTGAAAGCAGTAGCCGATTCAGAAGGCCTAAAACTTCCGGAAGTTCCAAGGCACTTTTTCAGGAAAATCTGGACGGGAGGACCGAAAAGAGAAAATGGAGGGAAAACCCAAGCCACAGAGACAGAGGAGAAAGGGAGAGAAAAGGCTAGCCAGGGTTGCAGCGGAAGCTGCAGCCAAGACGGCCGAGAAAATGGAAAATCAGAAGAAGACCCAAAACCCCAAAGGCCAGCGCGCGCGCAGAAGGCGCGCGGCGGTAAAGTTAACATCAAACCAGGGGGAGAGGGTGTTGACAGTCAGAACCCTACAGAGAGAGATCAACAGACTAAGGAGACAGGAGAAGAAGTTGGAAGGACCGCGAATAGAAAACGTCCTAGTGACGACAATAACGCTGGGAACAATTTTGGGAACATCACCGCAGGTCACAACAACAAACCAACTGGGAAGACAGATGAAAACATGTCTAAACCCTCTCCTGTTAAAACCAGCAGATTCTGACAAAGCAGTCACCCCACTAACCACGAGAGCATCGCAGTATGGACTGTATAAGATTCTAACAATGAAGGTAAAAATACAGCCCCTAGTTGGCCCGAGCTTGGTTGCTGGTGCCCTAGCAATTCTGGATATACAACAAAATGGCGCATCCGCAACACCTGACTCCCTAGATACCATTAAGGCAAGGCGGCATGTTGAAATTGCTCTGGGCAAATCCAGGCTCTGGACCATACCAGCGAAAGATCTTGAGGGTCCCAGGGATGGCTGGTGGTATGTTGACACTAATGATGACCCAACTCAATCGCTGGGCCCAGCCATGAACACATGGCTGTATGGTAAGACCTTCAACCTGCTCTCTACAAAGGAGCTTCTGTCAACAACAAATACCACTCAATACAATGGACCCTGCTGGCTAGTGGAGCTGGAGGTCAAATACGCCTTCTCGAATTACAGTCCCAAACCAGCACTTGCTACCCTCTTAAAAAAGGACTTCACCTTGAAAGAAAATCAAGGCACCCTAGGAAATGATATAGATGGTGCACTCCTCTTACACCTGGATAAAACCTCAGAAATTGGCAACACAATATGGAGAACAGAGATGAGAGACTCTGAAAGGGCTGGAGCACTAGGCTCAACCTTCTGGTCTGTATCAAGCCAAGTGGTAGGGCTACTAGCAGATTCACTTGGCGCATGGGGTTGGGTTGCCCGAACGGGGTGGTTCGTGTTGAGACAGGTCTTTGGTGGTGGTTTCCGAAAGGATACCATCACAATGAAAGTCTATGCCTCGGCAGAGGACGCCTCTAAGGACAGCCCTCTCTATGTTGTACCATCAGGGGGTTCTTCCAAACCACTTCCTCCTGGACAGTACAGACTAGAGCAGCTTAATAGTGCTAATTTGATGGAAAACACAAACCCAGAGCCCACTGTCAGAATGAATCCAGCAGGAAATGAATACCTGCCGTTGCCAATTGCAGGATCTGACCACAGGGAAATTCCACCAATTTATATTTATAATGATGGAGAAATCCAGAAATATGACCCTGTGTCAGAGCTGGTTGAAGGGGGAACAGAACATCAGCCATGGAAGGGAAATGAATGTATAAACCTCTTTGGCCGCCCAAAACTATATTGGGGAGGCAAGAATGAAGAAACAAATAAGATCACTATCACAATGATACCATGGCAAATTGAGGGACATGCAACTGGAAAACCAACAGAAAAACTCACCCTCATGGGAAAATACTTTTGCCTCTATGATTTCAAGGAAAACCTCTTTGTTGTCGCCGGAAATCAAATTGAGTCGCAAGGAGTGATGCATGGCATCAATAGCTGGAATTCAGCCTGGTGGGATGTGTGGGCATCCACCAATAAAAGGCTGTTGAGCTTCCTAGGAACAGATCCAACACCAAATATGAATAAAGGAGGTTGGAGAACACAAGAATACTATGGAAATGGAATGTATAAATTCCTGTGGGACATCCAAGCTGGTGACGGCTCATCAGGCGGCACAGATACATCAAGGGAAGTGGTGAAAGCCATGAAAAGGGTGATGGACTGGAGCGCTCTCTATGAACAAGAAGGAGAGACAGAAAACAAAATACCCACATTTGCCATTCCAGCATCGAAACTGGGAGGTATGTCACCCTGGGACACCGGTGCGCCCCGGGCAGCCAGATATGACGCAGTCATAATCTGGTATAATGACAAGACGTATGCCATCACGTCAAGCCTAGTCAAGCCAACGGACTGGACGTACTGGGGTCCCCAGTTCATGTCATCCTATGTAAATAATGCTGACTGGTGGACGAAATCACCACGGTGGTATGAACTGGCCGAATTAGATACGGGGCCACTCAATCAGAATGAAGAGGAGGATGAAGATCTAGAATTCCTCCCACCACCACCAGAAACCCTTGAGAAACTTGAAGAGGCAATAGAGAGGGGAGATTTGGGTGCTCTCGCGAAGTTGCTGAATAAAACCGTTCCGAAATGAACGTGAAACAAAACTATGAGAAAGAGAGACAACTCTGTAAATAAACCACCTAGCTCACGGTGTAAAACTGAGTACATCTGGAGGATGTATAAAATCTCCGAAAATTGGCCGTAGGCCACAGGTGCCACACCCAAATCAGGGCGTAGCATCCGTCCAAAACAATCATGCAAGTTTTGGACCAAATGATTAAA
| 50,614
|
MN920672.1
|
Astroviridae sp.
|
Chen,X., Shan,T., Yang,S., Zhang,W.
|
Jiangsu University, School of Medicine
|
China
|
2020-05-06
|
ytb090ast01
|
Astroviridae sp.
| null |
Astroviridae
|
ssRNA(+)
| 7,420
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Aves
|
feces
|
2018
|
SAMN13782218
|
PRJNA600556
|
MAG: Astroviridae sp. isolate ytb090ast01, complete genome
|
TTTTGCATTCTGCAAACTTCATCCTCGGGGTCAGGGTTTCCCGGCACCACTCCTCCACCCATTGAGTGTGTCCTTTTGGTGATAACGCCGCCATTTGGTTCTCACACTGTAGGAGGAGGTCTGTCATATTGACACCGTGTGCTGATAGGATTGTTCGAGTTTTCCCATAGCACATGTGTTGAATTTCAGTGTAAGTAAGTTCCCTGGTTGATGGTTTAAAGATGTCAAAGTAGCATCCCTCAATCTGCGCCGTGCAGTCAGTCTCAAGAGCACGCGTTTCTCCAGCTAGGAACCCAAGCAAGAGAAAGAGAAGTAGCATGCAGGCAAAGGTCCAGGTCCTTGATGATGCGCGCACAGCCACTGACACGGCATTTTTGCTATCGATGATGGCATTTCTAAGGAGTTTTACCTCCTGCTGATGGTGCCGTATCACTCTGTCTTTTTCCTGCAGCTCTTTCTCCCTTTCCTTCAAGAGCTCACGCAACCGCATGTTTTCCTCTGTCTTCTGGGATGATTGTGCAGCAAAGAGCCTTATCCTAAGCTGGTTGGATGCTTGTGCCCTTAAGAGTTGATGTTCTTGTGTTGGCAGCCTTTGATTCCCTGACCACCAAGGCACAGAGGGTGAGCCAGACGCAGGGTGCTTCGCGCATAACTGGAAGCCCTGGGACTATGGCCCTCTTTGACAGGATGAAACAGAAGTATGGTAATACTAATGCTTGGAGAGAACTTATGGCATGTGATGCGTACCAACTTCTTGATATGTCCACAGCCTATGGGATCAAGGATGATACACCCTACAAATTCACAGCAGTAAAACAGGGTGAGCTCTATAACATTGAGCTTAAAACAACAACACTGCCAACACAAGAACATCAACTCCTAAGGGCACAAGCGTCCAACCAGCTTAGGATAAGACTCTTTGCTGCACAATCATCTCAGAAAACAGAGGAGAACATGCGCTTGCGTGAGCTCCTTAAAGAGAGGGAGAAAGAGTTACAGGAGAAGGATAAAGTGATAAGGCACCATCAGCAGGAGGTGAAGCTCCTCCGTAATGCCATCATTGATAGCAAAAACGCGGTGACAGTGGCCGTGCGTGCATCATCAAGAACCTGGACCTTCGCCTGTATGTTGCTTCTCTTCCTCCTGCTTGGCTTCCTAGCTGGCGAAACGCGTGCTCTTGAGACCGATTGCACAACACAGATAGAGGGATGCTACTTTGACATCTTTAAACCATCAACCAGGGAACTTACTTACACTGAAATTCAACATATGTGCTATGGGAAAACTCGAACAATCCTATCAGCACACGGTGTAAACATGACGGATCTTCTCTTGCAATGTGAGCAACAAATGGCAGCATTGTCGCCGAAGGGGCACACTCAATGGGTGGAGGAGTGGTGCCGGGAAACCCTGACCCCGAGGATGAAGTTTGCAGAATGCAAAAAGAGAACCTGGGAACAGATCATTGATGAAAAACTAGAACCAATCCATGCAGTAATTACAGAGATTAAAACAATGGGGATTCAACCAATACTAAATCTTGCAAGCTATGCCTTTCTTTTGGCCACAGTGCTTGCAGAGGCTAACTTTTGGTTAGTGGGACCAATTCTAGTCCTGTCCTGGTCTTTGGGAATACCACCCCTTTTTACATCCCTTGCAACACACTTCTTCCCACTAAAGACCTTCTTGTATGTACCTATTATGCAGATGGTTGGGGAGGAGTTTAGACATTGGGCCTTCTTTGCACACTGGATGACGTCCATAATGTATAACACCTTTGTTGAAAAAACCTATGCAGCAATATCGCATGGGCTTTTGATGGCATGTTTGCTCCCAATCTGGTACTATTCAGCTGTCTTTGTTAAACAGTTCAAAATACCACTTGGTGCACAGCTAGTCATGCTGGCTATTAGCATTTCAACAACAATTGGTATGAAATTCTTGAACTCAACAGTAGTCATAACACGGCCAGATGGGACAACAGAGAAACAACGCAGAGTGGATGTCATGAAGGAAGGTGTGAAAGAGAAGTACCTTAAACTGCAAAGTGCAATAAGGGGAATTATACCAGAGATACCAGACAAAACCAGGTGTATCTTAAAGGTTGAGACCCAAAATGGAATAGGGGTTGGCTTTAGGTTCATGAATGAGATCCTGACAATTGGACACGTGATGGGAGATCAAGATGTAGCAACCCTCCGCTGGAATGGAATGGGTGTCACAATGCATGTGAAGAAAAGAATCCAGCTCTTTGAGAGTTGTGATGAATTGGTCTTCTTTAAGCTTCCACCAGAATTCCAAGGAATGAAACCCCTCCGCTTGTCAAAATTAGAAACATCAGACTATATGCAGCTACTTGTCTTCAAGGATGAGGAAATAGCAACTTACACTGGGTGGGCTATGCTGGATGGAAATTGGATATCCAACACATTTCAAACAAAAGCAGGGGATAGTGGGGCACCCTATGTAGATAGGAATGGCCGTCTGGTTGGAATACACCTAGGAACTCAAGGAGTAGTGGCACAGGGCTACTCTCTGATGCAAGTTTTGAAACAACAGCAACCAGTACCCTTGGCACCTATAAATGAAAATCCAACAGTGCAGACACCGACTGGACCGACAGTCGAGGATATAATGAGAGAAATAGATGCACTTAAAAAACAGGGAGGCCTCATCCCAATACAGCAGGCACAGCCAGATGTTGAACAACTAAGTGATGACATAATGGCCAAAGTTATTGAAGGTACAAAGAAATCACATGCTGCGCTGACAGCGGAAGTTGAAAAACTTGCAAACGCAGTCAACGCGTTGTTAAACATGGTGGAATGCCAGGCGCAAATGATCAAGAGTCAAGAGGAGCGTATTAAGAAACTTGAGGAACCAAGTGAGACCAGTATCCTCGAGCAGAAAAAGAAAAGGAACCAGCAGAGAACAGAGAGATTCATGAAGATCAAAGTTCTCACTGAGGAAGAATATCAAAGAATGCTGGATGAGGGCTGGTCTGCAGAAGAAATAGAAGATGCAGTGAGACAACTAAGACAAAGTGCCTGGCGTGACTATGAAATGGAAGAAGAAGACTATGAGCCAGATGAGATCCTGGATGACTTCTTGATGACTTACCAGAAGAAGAAGCCGAAGAAAGGACAAAAAGTGATCACATGCTTTGAGGACGCTATTTCCATTATGCAGCAATCTCGGAAAACATATAAATGCCCAAAATGCAAAGGACGCTTCCAGAGAGGGGATAGACATAATCCCAAAACATGCAGGTTGAAACAGGGGGAAAATGTAGAGCCAAAAAACTCCCAGAGGGGGGCTCAGAGGGCCCCCCAATAAAGATCTTTGACTGGAAACACTATGTAGAAAAACCCTTCAGACAACTTGTACCAGAAACACACCCAGTTCTCTTTCATATTGATGTGGATAGGCTTGTGGAGAGGCGAAAGAAAGTTAAAGACCCCTTAACCCAGATAGTGGATCCGTGGGATCAAAACGTTTACGCCTCAACAACTTGGACATCCAAAGCCTATACGAATATGTTTGAAAAGTTTGACTATGCAAAACCACAGAAAATACAAGAGAACTATCCAGACCTCTGGGACTTTGCAACACAAGTTGTTTTGGAGGAGTATGGCTATTTGGACCAGAGCCAAATAATAACACCCTTACAGACTACAAAGAATATGCTTTCAACACCTGCATTTCCAAAATTTCTTCTGTATGATAATGAAGAGGAATATCAATTGGAGAATGGTTGGACTGAGTATATGGAGCTCTGGAACATGGACCCTGATGAAAGGGAAAAAGAGAGACCATTGTGGTGGACTTTTCTCAAAAATGAAACCCTGAAGAAGGAGAAAATTGAGAAGGATGACATCAGGATGATAATGTGTACCGATCCTGTCTTCACCCGATTTGGTGCGGCGTTTGATCAACACCAAAATGAGCAAATTAAAGAACATACAGAAGAGAAGACGGCACAAGTCGGTTGGACCCCCTTCTTTGGTGGGTTGGACCAGCGAATCCGGCGGCTGGAGACTCGCGGGGATGTCTTTGTCGAGCTGGACTGGACAAGGTTTGATGGTACAATACCCGTTGAAGTCTTTTCCCATATCAAGGAGATACGTTGGTTCTTACATGCAGAGAAGTATAAAACTGACGAAAATCGAAGAAGGTACATGTGGTATGTGAAAAACCTGGTGGATAAAATTGTACTCCTACCATCAGGAGAGGTGACTAGGATTATCAAAGGAAACCCTTCAGGACAAATTTCAACCACCACAGATAACAATATGGTCAATCTCTTCCTTACAGCGTTTGAAATTGGGTATATGTATAGGAGCAAAACGGGCAGAACACCTAGTCTACAGGACTACTTTGATAATGTAGACATGCTGTGTTATGGTGATGATAGGCTGCTATCTGTGAACAGCAACTTCCTGGAATATGATGAAACCCTGGTACCAGACATCTATAAGGGGATTTTTGGGATGTGGGTTAAACCACAGAATCTTAAAAAAACAACAACACCAGAGAAACTCTCCTTTTGTGGTCTGACGATTGTGAAAACTGACACTGGATACTATGGAGTACCAAATGTAGACAAGATCCTGTCTACTTTTGAAAATCCTGTCAGACCACTACCTTCCATTGAAGCACTCTGGGGGAAATTACTATCATTAAGGATACTCTTGGAATATGCTAGCGATGAGTCCAAAGAGTACCTTGCCCTCCAAATGGCTAAGGTAAAAGCAGTAGCCGATGCAGAAGGCCTAAAACTTCCGGAAGTTCCAAGGCACTTTTTCAGGAAAATTTGGACGGGAGGACCGAAAAAAGAAAATGGAGGGAAAACCCAAGCCACAGAGACAGAGGAGAAAAGGAGAGAAAAGGCTGGCCAGGGTTGCGGCGGAAGCTGCAGCCAAGACAGCCGAGAAAATGGAAAGTCAGAAGAAAACCCAAAACCCCAAAGGCCAGCGCGTGCGCAGAAGGCGCGCGGCAGTAAAATTAACATCAAACCAGGGGGAGAGGGTGTTGACAGTCAGAACTCTACAGAGAGAGATCAACAGGTTAAGGAGACAGGAGAAAAAACTGGAAGGACCGCGGATAGAAAATGTCCTAGTGACGACAATAACGCTGGGAACGATTTTGGGAACATCACCGCAAGTAACAACAACAAACCAGTTGGGGAGGCAAATGAAAACATGCTTAAACCCCCTCCTGTTAAAACCAGCAGATTCTGACAAAGCAGTCACCCCACTCACAACGAGAGCATCACAATATGGACTGTATAAGATTCTATCAATGAAGGTAAAAATACAGCCTCTAGTTGGCCCGAGCCTGGTTGCTGGAGCTCTGGCTATTTTGGATATACAACAAAACGGTGCATCTGCAACGCCGGATTCCCTAGACACCATAAAGGCCAGGCGACATGTTGAAATCGCCCTTGGCAAGTCCAGGCTCTGGACCATTCCGGCAAAAGATCTTGAGGGCCCGAGGGATGGGTGGTGGTATGTAGACACAAATGACGACCCAACACAGTCGCTGGGTCCTGCCATGAATACATGGCTGTACGGAAAGACCTTTAACTTGCTCTCAACGAAGGAGCTTCTATCAACCACTAACACCACCCAATACAACGGGCCCTGCTGGCTGGTAGAGCTTGAGGTTAAATATGCCTTCTCAAACTACAGTCCTAAACCAGCACTTGCAACCCTCTTAAAAAAGGATTTCACCTTGAAGGAAAACCAAGGCACCTTAGGTAATGATATAGATGGTGCCCTCCTCCTTCATCTGGACAAGACATCAGAAATTGGCAACACCATCTGGAGAACAGAAATGAGGGACTCTGAGAGAGCTGGAGCACTAGGCTCAACTTTCTGGTCTGTGTCAAGCCAAGTGGTTGGCTTGCTAGCTGACTCACTTGGTGCATGGGGTTGGGTTGCCCGTACGGGGTGGTTTGTGCTGAGACAAGTCTTTGGTGGTGGTTTCCGGAAGGATACCATCACAATGAAGGTCTACGCCTCAGCAGAAGATGCCTCTAAGGATAGCCCTCTCTATGTTGTACCATCAGGGGGGAGCTCTAGACAGCTCCCCCCTGGGCAGTACAGACTGGAGCAGCTCAACAGTGCTAACTTAATGGAAAATACAAACCCAGAGCCCACTGTCAGAATGAATCCAGCAGGGAATGAATACCTGCCGTTGCCAATTGCAGGCTCTGACCATAGGGAAATACCACCAATCTACATCTATAATGATGGAGAGATCCAGAAATATGATCCTGTGTCAGAGATAGTTGAAGGAGGAACAGAACATCAGCCATGGAAGGGAAATGAGTGTATCAACCTCTTTGGACGCCCGAAACTATACTGGGGCGGAAAACAAGAAGAAACAAACAAAATCACCATCACAATGATACCATGGCAGATTGAGGGACATGCAACCGGGAAACCAACTGAAAAACTCACCCTCTCTGGAAAGTACTTTTGCCTCTATGATTTCAAAGAAAACCTCTTTGTTGTCGCCGGAAATCAAATTGAGTCACAAGGAGTGATGCATGGCATCAATAGCTGGAATTCAGCCTGGTGGGATGTGTGGGCATCCACCAACAAACGGCTGCTAAGCTTCCTAGGGACTGACCCAACACCAAACATGAACAAAGGAGGCTGGAGAACACAAGAATACTATGGAAATGGGATGTACAAATTCTTGTGGGACATTCAAGCAGGCGACGGATCATCAGAAGGAACAGACACATCAAGAGAAGTGGTGAAAGCTATGAAAAGGGTGATGGATTGGAATGCTCTCTATGAACAAGAAGGAGAGACAGAAAACAAACTACCCACCTTTGCTATTCAAGCATCTAAACTGGGAGGAATGTCACCCTGGGACACAAGTTCACCACGGGCAGCCAGATGTGACGCTGTCATACTCTGGTACAATGATAAGACGTATGCCATCACGTCTAGCCTGGTTAAACCAACAGAGTGGACCTACTGGGGCCCCCAGTTTATGTCATCATATGTTAATAATGCTGACTGGTGGACGAGATCACCACGGTGGTATGATTTGGCCGAATTAGATACGGGGCCAACTGTGCAGAATGAAGAGGAGGATGAAGACCTAGAATTCCTTCCACCACCACCAGAAACTCTTGAGAAAATTGAAGAGGCGATAGAGAGAGGGGACTTGGGTGCTCTCGCAAAGTTGCTGAACAAAACCGTTCCGAAATGAACGTGAAACAAAACTATGAGAAAGAGAGACAACTCTGTAAACAAACCACCTAGCTCACGGTGTAAAACTGAGTACATCTGGAGGATGTATAAAATCTCCGAAAATTGGCCGTAGGCCACAGGTGCCACACCCAAATCGGGGTGTAGCACCCGTCCAAAACAATCATGCAAGTTTTGGACCAAATGATTTC
| 50,615
|
NC_011400.1
|
Astrovirus MLB1
|
Finkbeiner,S.R., Kirkwood,C.D., Wang,D.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2008-10-22
|
MLB1
|
Astrovirus MLB1
|
Mamastrovirus
|
Astroviridae
|
ssRNA(+)
| 6,171
|
RefSeq
| 1
|
Australia
|
Australia
| null |
feces
|
1999-10-06
| null |
PRJNA485481
|
Astrovirus MLB1, complete genome
|
CCAAGAGTGGTGGTATGGCTGTGCCTTTCCATATTGGTGTGTCAGACAAAGTTATGAATCTGGGTTCAGCTCGCTCACGTGAGTGGCTTAATGAGCTACCCAGCACAGCACTCAACCAGCTGCGTGACATCTTCCCATTTGAAGTCCCAATTAATACTATGATAGTACCTAAGTCCAGATATCAATTGGGTACTGGTGTCACACTTGCAGTCCAAGGTATGGTTACATTGGGTTGCTACAGCACATATGCACTTGATGGTGAAGCATGGATTGAAGTTGATGAAACCAGAATAGATCCAAAGTGTGCATATGTTGGGACCATGGCCCTAGATAGGGTAAAGCTTATGGATCGCAACAAAGAACTGCAGCTGGATAATGCATCAATGAGTGTTGATTTGCAACTGACTCGCCATGAATTGGAGAGGTGTAGGCCAACCATCATTCGACCGCAAAGATATGGTAACTTTGCACTTTTTGTTCTTTTTTTCTTCCTTTTCTTTATTTTAGGAACAAAGGCTGAAGATTGGCATGATCAGACTCAGGATTATTTGGTTGAATTCCTGAAAGAAGCAAAACAGGAAATTGTGTCTAATTTGGATACATATTATAGCCTTCTTTTACATGTAGTCAGGTGGGAGGTGGTTTCATGCATTATAGCGATTGTTTCTTTTTTCAAATTAAAGAGACCCTGTGTTGCAATAATTGGTTTATTTTTGGCAACTATATCCAGATACAATTATGCAGCATTGTCCATTGTACCATTTCTGGATGTCTACAGCACTGTTTTCTTGTACACCACCATGGTTGTGTATTTTTTGGTACCCCATGTGGCTATAATTACATCATTAGTTTGTGCACTACTATTTACTATTGTAAGTATGGTATGTGCACATCACCAATTCATCATACGTGTGCGTGGAGATTGGCTTGTTGTCTTAATCACCATTGCAACATATATCTGTGATGTTATGGGTATACATACTACAGCAATAGCCATTGCTGCATCGTTAGTGCGTATTTATATGTGCTTTCCTGCGGCTAACGCATCAGTGGTGGAAATCAAGGATAGTGCTGGTAAAGTAGTTCAGAAAACAACATTGCTACCCAACTGGATCGGCTCAATGTATCAAGGTGCCCGAAACATGTTGCAAAAAGTCAGAACTGGTGTTGCGACATTTGTTCGGGTTAACCCTAATTGCTTGTGCCATATTAGAAGTGAAGGTTGTAGTGGTACAGGCTTCAGGTTAGGTAATGACATAGTTACCGCCGCACATGTTGTAGGCAATGCTGTACAGGTTGAGGTGGTATATAATAATTATGTTGCTCAAGCCAAAGTTAGACATATCCCTGATAAAGATATTGCATATCTTATATTACCAGAGGGTCTTAAAACTATGCCTGTTTTAAAATTGGCAAAAAACCCAAATTATGAACAGGTCACAATAATAGCATTAGAGGGCAATTGCATGCTTGTTTCCACTACAGAGGGTGTATGTCATGGTGAAACTATTTCATATGCCTGTGCTACCAGAGATGGTATGAGTGGTGCTCCTGTTCTTGATGTCAATGGAAATGTTCTTGGTGTTCATCAAACAAATACTGGATATACAGGTGGTGCGACAGTGATTAGAGCCACTGATGCTGCACCATATATTGATGAGAATGCTGCACTTAAGAAAGAAATAGAGGAATTAAAGAAGATGCTGCGCGAACAAACAATGAATCAGAGATCTGTCCAAGATAATGAGGTTGTAGGAATAGTTCGTGCAGCTGTCCAAAGAGAGATTGGAATATTACGTGATGAACTTAATTCATGTTATCAAAAAAAGAAAGGAAAAAATAAGAAAGGACGCGGTGCACGACATCGTATGCTGCGTCGTGGACAAAAATTTCTGACAGAAGAGGAGTACCAAGAACTGTTGGATAAGGGACTGACTAGGGAACAACTACTTGATGCAATTGAGGAAATTGTCAGGGCACGTATCGGATTCCCTGACTGGTCAGACCCTGAATATTCATCTGAAGAGGATGATGCAGCAGTTACATATTGGTGGGAACAAGTAAAAGAGAGTGATTATAAAGATGGAGTGCCCCAGTTTGAACATATTGTACCCAAGTATTCTCCAAATGAAAGAGTATTTTCTGAACAAGAGCGTAAGGATGTTAGTGAAGAACTGTCTGCTTTGCAATCTATAGTAGATGGAGTGAAGAAGGAAGATTGGGAAGAAACCAAAAAGCAGACTACTGACGCTCTTAATCATGCACTATACGTTGTTGATAAGGCTCTTGCACAACATGGTTATATACTCTTTGAACAACGTATGCGGCCAAAAAACGGAAAAAGGGGTCCTCGGAGGAGGACCCCAAACACTACCTAGATACATGGATTGGGATGCTTAGTCCTTGCGTTCGTTGGCTGGTTCCGGAACGCTTTCCTTTGTATGGTGGTGTACCTTTAGATAGGCCAGTGTATGATTTTAAAGTTGTTAATGAAGATTTGTTGGGGTTACTCCCACCCCCACCTAATAATGATTTTGAGGTTTTTGGTCCCACTGTATGGGATGAAATTGCATATAAGAAATCATTTGAAAAGTTTGAATATGCTGATTATGTTGATTTTGAACAGATATATCCTGAGTGTGTTGCTTTTGCTGATAAAAAATTTTTGGAACATTTCAATTTTTTGTCTGATTCTTCTTTTGTAAATATTTTAGCAACTGATAAAAATGTTGATTCCACACCCGCTTATCCAAAGATGCGGTGGTGGCTTACTGAGAGTGATTATCTTGAGGAGTGTGGATGGGAATATTATGTTAAGGAGTTTGAAAACATCGCTTCTGGTCAAAATCCAGATGTTTGTTGGTACCTATTCCTCAAGAAAGAAATTATCAGGCAACAAAAAATTGATGAAGGGGATGTCAGACAAATAGTGTGTGCTGACCCAATATATTCCAGAATTGGGGCATGTTTTGAGCAACACCAAAATGCCATGATGAAGGACCACACTCTTTCATCATCTGGACAGTGTGGTTGGTCCCCTTTCTTTGGTGGTTATGAAGCAAGGATGTCCAGGTTGCGCTCCAAAGGTAATAAAATCTTTGTTGAGCTTGATTGGACTCGATTTGATGGTACAATACCACCAACCTTGTTGATGCACATAAAGAAATTAAGGTTTACCTTAATGGGTTCCATGTCCCGCAAGTATGAAAATGTATACAAGTGGTATTGTAGGAACCTAATCAATAGGTTTGTTGTGCTACCTTCAGGTGAAGTTACAGCACAGCAGCGTGGAAATCCATCAGGTCAGATGTCAACCACCATGGATAATAACATGATCAACTATTGGTTGCAGGCATTTGAATACAAATTTTTGAATTTACCAGAAGAAGAGTGGATGCATTTTGATACTTTAATCTATGGAGATGATAGGATATCCACATATCGCAGCATCCCTAATGAATATACCAAGACAATAGTTGACATGTACAAAAATGTTTTTGGAATGTGGGTTAAGCCAGAAAAGGTTAAAGTCTCAGAGTCCTTGGAGGGGCTCTCATTCTGTGGTTTCACTTACACACCAAATGGCCCAGTTCCAAGTGAGCCTTATAAACTTATGGCCTCATTGTTGAAACCTGCTACAAAACTACCTGATTTAATAGCTCTTCATGGGAAACTTTTGTGCTTCCAGTTGTTGATGGCAAATGACACTGCACACCCATTTTATGGGTATATTGAACAATGTTTGCAGTACACACACCGTGCCCTCAGTGATGTTAGCTTACCAAGGCGCTTCACTCGAAGGCAGCTGGAGTACATTTGGAGGGGCGGACCAAATGATGACTATGGCTAATGCCAGTAAAGGTGTTACAGTCAACATCAACAATGCAAAACGGAAGCCTCGCTTCACCAATAACCAGCGAGCTAGATCTACTAGGCCAAATTTTACACCAGCACCCAAATTTAGGAAACGTCGGTTTATTCCTAATAGGAATCGCCGTCGTAGGCAAAATACTAGTACAACTGGGCCTAAACCTGCGGTGTCGCAGACAATTACAGCAACACTCGGCACCGTTGGATCAAATTTGAGTGATGTTGTTGAAACTGAATGTGCAGTCTTTTTGAATCCCATTATAGCAAAAGATTCTGGTGCCAGTGCAACTTTTGGGCCCCTTCAATCTCTGGGTGCACAGTATGCACTATGGAGGCTCAAGTGGCTGGAAGTCAGACTCCAGCCTTTGGTGGGTAACTCAGCTGTGAGTGGCACTGTAGCTCGTGTTAGTCTTAACATGACTACTGGTCCCACTCTCAACTCATGGTCTGGTCTTGGAGCCCGAATTCACAAGGATGTTAGAGTTGGTTCAAATCTTGTTTGGCGCATTAAACAGCGTCTAGTGAGTGGACCTTGTGAAACTTGGTGGAAAACTAATACAGCTGAGGACCCATCATTATCTCTTGGACCTGCACTGGAAGTACATACCATAGGTAAGACTATGAGTACTTACAAAAATGAAGTGTTTTCCAGTGGACTATTTCTTCTTGAGATAACTGGCCACTGGGAATTTGCAAATTATGCTGCTTCTCCAGCCCTTGCTACACTCACACAACATAAGGATGACAGTGAGACTACAAAAACACTTGCAATCAGTTCTGATGGTGCCAATGAACCAGTTGAGATGCTAATACCTGTGAATGAATGGAATATGAAGGCACAGTATGGTGGAAATGGCACGCTTGGTGAAGCAATTTACCAAGTTGTTGATACTAGTGTCACAGTTGTGACAGACCTCTTTCCACCACCATTTTCATGGATTGGTAAAGCTTCATGGTGGTTTATCAGAAAAATGATTGGCAAAACAAAACAATTCCAGGTTGTTGTTAATGGTCAAAACCAAACACTTACAGCGGATGTCTATCGTGTTTACACTTCAGCTTCTGCTGCTAGAGATGATAAACCAGCAATTTCCAGCAAGGCACATGAAGCAAAGCATCTAACTGGTGCAGTGGTTATCACACAAATTTCTACAGACAACATTCTTTCAGAAACCACATATACTGGCCCAAGGTCTATTGTCACACCAGAGACTCCTATTGGTCCGTCTAGCTATCCAATGACACCAAGTTCTTTGGTACTTATGGCTGGATATTTTAGTGGACCAGAAATTAGTGATAATTTTGGCAAGTACATGCCCTTGCTTTTCCAACAGAATACCTCTAAGGTTACATTTAGGAGTGGTAGTCATACCATAAAAATTGTAAGCATGGTTCTTGTGGACCGGCTTATGTGGTTGGATAAGCATTTTAATCAGTACACTAATGAACCAGATGGAGTCTTTGGAGACGTTGGCAACGTTTTCGTTGACAATGATAATGTAGCCAAGGTTATTACTATGAGTGGGTCATCAGCACCAGCTAATAGAGGTGCCACTTTAATGTTATGCAGAGCCACAAAAAACATCCAGACTTTTAATTTTGCAGCAACAGTATATATACCAGCCTATAAAGTTAAAGATGGTGCAGGTGGCAAAGATGTTGTTCTGAATGTGGCCCAGTGGGAAGCAAATAAAACTTTGACATACCCAGCTATACCTAAGGACACGTATTTTATGGTTGTAACAATGGGAGGTGCTAGTTTTACCATTCAAAGGTATGTGGTATACAATGAGGGCATTGGTGACGGCCTAGAATTACCAGCATTCTGGGGCAAATATTTATCCCAGCTATATGGCTTTAGCTGGAGTTCACCAACCTATGCATGTGTAACTTGGGAGCCCATCTATGCTGAAGAAGGTATACCACATAGAAGTGCATTAAATGATGATGAAATAAGCAGTGATGGTGACACTGATGATGACACTGACACAGAAGACGAAGATGAGTTCTTCGGTGAGGATCCCATTGCTGCATTGCACGCCCTTGATGAAAAGAGACCAGCTAGGCGTGCAATGTTTGATGCACTTGTTAAAACTGGTGTCAGTGTTGAAGAAGCATCTAGGTGTGTCCTTAGAGCATGTCCTACAAAACTTCAGATTAAGAAAAGGAACCTTTATGAAAGCCTCCTGTGCGATGGCTTATCACCTGAGTCGTCGTACGAGGAAGCATACAATTGTAAATAATTAATTAATTTCAATTGTAATTATAATTTGCTTTTTTTCTTCCAGCATAAATGTATGC
| 7,767
|
MZ707081.1
|
Astrovirus MLB1
|
Wang,Y., Li,J., Gao,S., Duan,Z.
|
China Cdc, Department of Viral Diarrhea, Institute for Viral Disease Control and Prevention
|
China
|
2022-06-26
|
WYL077032
|
Astrovirus MLB1
|
Mamastrovirus
|
Astroviridae
|
ssRNA(+)
| 6,247
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Homo sapiens
| null |
2020-07
| null | null |
Astrovirus MLB1 isolate WYL077032, complete genome
|
TTCCCAAGAAGGTGGGGGGTATGGCTGTGCCTTTCCATATTGGTGTGTCAGACAAAGTTTTGAATCTGGGTTCAGCTCGCTCACGTGAGTGGCTTAATGAGCTACCCAGTACAACACTCAACCAGCTGCGTGACATCTTTCCATTTGAAGTCCCAATTAATACTATGATAGTACCTAAGTCTAGATATCAATTGGGTACTGGTGTCACACTTGCAGTCCAAGGTATGGTTACATTGGGTTGCTACAGTACATATGCACTTGATGGTGAAGTATGGATCGAAGTTGATGAAACTAGAATAGATCCAAAGTGTGCATATGTTGGGACCATGGCCCTAGATAGGGTAAAGCTCATGGATCGCAATAAAGAACTGCAGCTGGAAAATGCATCAATGAGTGTTGATTTACAACTGACTCGCCATGAATTGGAGAGGTGTAGGCCAACCATCATTCGACCGCAAAGATATGGTAACTTTGCACTTTTTGTTCTTTTCTTTTTCCTTTTCTTTATTTTAGGAACAAAGGCCGAAGATTGGCATGATCAGACTCAGGATTATTTGGTTGAATTTCTGAAAGAAGCAAAACAGGAAATTGTATCTAATTTGGATACATACTACAGTCTCCTTTTACATGTAGTTAGGTGGGAGGTAGTTTCATGCATTATAGCAATTGTTTCCTTTTTTAAATTAAAGAGGCCCTGTGTTGCAATAATTGGCTTATTTTTAGCAACCATATCCAGATATAATTATGCAGCATTATCTATTGTACCATTCCTGGATGTTTACAGCACTGTTTTCTTGTATACCACCATGGTTGTGTACTTTTTGGTGCCCCATGTAGCTATAATTACATCACTAGTTTGTGCACTACTGTTTACTATTGTAAGTATGGTATGTGCGCACCACCAATTCATCATACGTGTTCGTGGAGATTGGCTTGTTGTCTTAATCACCATTGCAACGTATATTTGTGATGTTATGGGTATACATACTACAGCAATAGCTATTGCTGCATCGTTAGTGCGCATTTATATGTGCTTTCCTGCAGCTAATGCATCAGTGGTGGAAATCAAGGATAGTGCTGGTAAAGTAGTTCAGAAAACAACATTACTACCCAACTGGATCGGCTCAATGTACCAAGGTGCCCGAAATATGTTGCAAAAAGTTAGAACTGGTGTTGCGACATTTGTCCGGGTTAACCCTAATTGCTTGTGCCATATTAGAAGTGAAGGTTGCAGTGGAACAGGCTTTAGGTTGGGTAATGATATAGTTACTGCCGCACATGTTGTAGGCAATGCTGTTCAGGTTGAGGTGGTATATAATAATTATGTTGCTCAAGCTAAAGTTAGACATATCCCTGATAAAGATATTGCATATCTCATATTACCAGAGGGTCTCAAAACTATGCCTGTCTTAAAATTGGCAAAAAATCCAAATTATGAGCAGGTTACAATAATAGCACTTGAGGGAAATTGTATGCTTGTTTCCACTACAGAAGGTGTATGTCATGGTGAAACTATTTCATATGCCTGTGCTACCAGGGATGGTATGAGTGGTGCTCCTGTTCTTGATGTTAATGGAAATGTTCTTGGCGTTCATCAAACAAATACTGGATACACAGGTGGTGCGACAGTGATTAGAGCCACTGACGCTGCACCATATATTGATGAGAATGCTGCACTCAAAAAAGAAATTGAAGAATTAAAGAAGATGCTGCGCGAACAAACAATGAATCAGAGATCTGTTCAAGATAATGAAGTTGTAGGTATAGTCCGTGCAGCTGTTCAAAGAGAAATTGGAATATTACGTGATGAACTTAATTCATGTTATCAAAAAAAGAAAGGAAAAAATAAGAAAGGCCGTGGTGCACGACATCGTATGCTGCGCCGTGGGCAAAAATTTTTAACAGAAGAGGAGTACCAAGAACTGTTGGATAAGGGTCTGACTAGAGAACAGTTGCTTGATGCAATTGAGGAAATTGTTAGGGCACGTATCGGGTTCCCTGATTGGTCAGACCCTGAATATTCATCTGAAGAGGATGATGCAGCAGTTACATATTGGTGGGAACAAGTAAAAGAGAGTGATTATAAAGATGGAGTACCCCAGTTTGAACATATTGTACCCAAATATTCTCCAAATGAAAGAGTATTTTCTGAACAAGAGCGTAAAGATGTTAGTGAAGAGTTGTCTGCTCTGCAATCCATAGTAGATGGAGTGAAGAAAGAAGATTGGGAAGAAACCAAAAAGCAGACTACTGACGCTCTTAATCATGCACTATACGTTGTTGATAAGGCTCTTGCACAACATGGTTATATACTTTTTGAACAACGTATGCGGCCAAAAAACGGAAAAAGGGGTCCTCGGAGGAGGACCCCAAACACTACCTAGATACATGGATTGGGATGCTTAGTCCTTGCGTTCGTTGGCTGGTCCCAGAACGCTTTCCTTTGTATGGTGGTGTACCTTTAGATAGGCCAGTGTATGATTTTAAAATTGTTAATGAAGATCTATTGGGGTTGCTCCCACCCCCACCTAATAATGATTTTGAGGTTTTTGGTCCTACTGTATGGGATGAGATTGCATATAAGAAATCATTTGAAAAGTTTGAATATGCTGATTATGTTGATTTTGAACAGATATATCCTGAGTGTGTTGCCTTTGCTGATAAAAAGTTTTTGGAACATTTTAATTTTTTGTCTGATTCTTCTTTTGTAAATATTTTAGCAACTGATAAAAATGTTGATTCCACACCCGCATACCCAAAGATGCGGTGGTGGCTTACTGAGAGTGACTATCTTGAGGAGTGTGGATGGGAATATTATGTTAAGGAGTTTGAAAACATCGCTTCTGGTCAAAATCCAGATGTTTGTTGGTACTTGTTCCTCAAGAAAGAAATTATTAAACAACAAAAAATTGATGAAGGAGATGTCAGACAAATAGTATGTGCTGACCCAATATATTCCAGAATTGGGGCTTGCTTTGAGCAACACCAAAATGCCATGATGAAGGACCATACTCTTTTATCATCTGGACAATGTGGTTGGTCCCCTTTCTTTGGTGGTTATGAGGCAAGAATGTCCAGGCTGCGCTCCAAAGGGAACAAAATCTTTGTTGAGCTTGATTGGACTCGATTTGATGGCACGATACCACCAACCTTGTTGATGCACATAAAGAAATTAAGGTTCACCTTAATGGGTTCCATGTCCCGCAAGTATGAAAATGTATACAAGTGGTATTGTAGGAACCTAATCAACAGGTTTGTTGTGCTGCCTTCAGGTGAAGTTACAGCGCAACAACGTGGAAATCCATCGGGTCAGATATCAACCACCATGGATAATAACATGATCAACTATTGGTTGCAGGCATTTGAATATAAATTTTTGAATTTACCAGAAGAAGAGTGGATGCATTTTGATACTTTAATCTATGGAGATGATAGGATATCCACATATCGAAGCATCCCTAATGAATACACCAAACTAATAGTTGACATGTATAAAAATGTTTTTGGAATGTGGGTTAAGCCAGAAAAGGTCAAAGTCTCAGAGTCTTTGGAGGGACTCTCATTCTGTGGTTTTACTTATACACTAAATGGCCCAGTTCCAAGTGAGCCTTACAAACTCATGGCCTCATTGTTGAAACCTGCCACAAAATTACCTGATTTAATAGCTCTTCATGGGAAACTTTTGTGCTTCCAGTTGTTGATGGCAAATGATACTGCACACCCATTTTATGGGTATATTGAACAATGCTTGCAGTATACACACCGTGCCCTCAGTGATGTTAGCTTGCCAAGGCGCTTCACTCGAAGGCAGCTGGAGTACATTTGGAGGGGTGGACCAAATGACGACTATGGCTAATGCCAGTAAAGGTGTTACAGTTAACATCAACAATGCAAAACGGAAGCCTCGCTTCACCAATAACCAGCGAGCTAGATCTACTAGGCCAAATTTTACACCAGCACCCAAATTTAGGAAACGTCGGTTTATTCCTAATAGGAATCGCCGTCGTAGGCAAAATACTAGTACAACTGGGCCTAAACCTGCGGTGTCGCAGACAATTACAGCAACACTCGGCACCGTTGGATCAAATTTGAGTGATGTTGTTGAAACTGAATGTGCAGTCTTTTTGAATCCCATTATAGCAAAAGACTCTGGTGCCAGTGCAACTTTTGGGCCCCTTCAATCCTTGGGCGCACAGTATGCATTATGGAGGCTCAAGTGGCTCGAAGTCAGACTTCAGCCTTTGGTGGGAAATTCAGCTGTGAGTGGTACCGTAGCTCGTGTTAGTCTTAACATGACTACTGGTCCCACTCTCAATTCATGGTCTGGTCTTGGAGCTCGAATTCACAAGGATGTTAGAGTTGGTTCAAATCTTGTTTGGCGCATTAAACAGCGTCTAGTGAGTGGACCTTGTGAAACTTGGTGGAAAACCAATACAGCTGAGGACCCATCATTATCTCTTGGACCTGCACTGGAAGTACATACCATAGGTAAGACTATGAGCACTTATAAAAATGAAGTGTTTTCCAGTGGGCTATTCCTTCTTGAGATAACTGGCCACTGGGAATTTGCAAATTATGCTGCTTCTCCAGCCCTTGCTACACTCACACAACATAAAGATGACAGTGAGACCACAAAAACACTTGCAATTAGTGCTGATGGAGCTAATGAACCAGTTGAGATGCTAATACCTGTGAATGAATGGAATATGAAGGCACAGTATGGAGGAAATGGCACACTTGGTGAAGCAATTTACCAAGTTGTTGATACCAGTGTTACAGTTGTAACAGACCTCTTTCCACCACCATTTTCATGGATTGGTAAAGCTTCATGGTGGTTTATCAGAAAAATGATTGGTAAGACAAAACAATTCCAGGTTGTTGTTAATGGTCAAAACCAAACTCTTACAGCAGACGTCTATCGTGTTTACACTTCAGCTTCTGCTGCTAGAGATGATAAACCAGCAATTTCCAGCAAGGCACATGAAGCTAAGCATCTGACTGGTGCAGTTGTTATCACACAAATTTCCACAGACAACATTCTTTCAGAAACCACATATACAGGCCCAAGATCCATTGTCACACCAGAAACTCCTATTGGCCCGTCTAGCTATCCAATGACACCAAGTTCTTTGGTGCTTATGGCTGGATATTTCAGTGGACCAGAAATTAGTGACAATTTTGGCAAGTACATGCCTTTGCTTTTCCAACAGAGCACTTCTAAGGTTACATTTAGGAGTGGTAGTCATACCATAAAGATTGTAAGCATGGTTCTTGTTGACCGGCTTATGTGGTTGGATAAGCACTTTAACCAGTACACTAATGAACCAGATGGAGTTTTTGGTGACGTTGGCAATGTTTTTGTTGACAACGATAATGTTGCCAAGGTTATTACCATGAGTGGGTCATCGGCGCCAGCTAACAGAGGAGCCACCTTGATGCTATGTAAAGCCACAAAAAATATCCAGACTTTCAATTTTGCAGCAACAGTGTACATACCAGCTTATAAAGTAAAAGATGGTGCAGGTGGCAAAGATGTTGTTCTGAATGTGGCCCAGTGGGAAGCAAACAAGACTTTGACATACCCAGCTATACCTAAGGACACGTATTTTATGGTTGTAACAATGGGAGGTGCTAGCTTTACCATCCAAAGGTATGTGGTATACAATGAGGGAATTGGTGATGGCCTAGAATTACCGGCATTCTGGGGCAAATACTTATCCCAGCTATATGGTTTTAGTTGGAGTTCACCAACCTATGCATGTGTAACCTGGGAGCCCATCTATGCTGATGAGGGTATACCACATAGAAGTGCATTAAATGATGATGAAGTAAGCAGTGATGGTGATACTGATTATGACACTGACACAGAAGACGAAGATGAGTTCTTCGGTGAGGATCCCATTGCTGCATTGCACGCTATTGATGAAAAGAGACCAGCTAGACGTGCAATGTTTGATGCACTTGTTAAAACTGGTGTCAGTGTTGAAGAAGCATCTAGATGTGTCCTTAGAGCATGTCCTACAAAACTCCAGGTTAAGAAAAGGAACCTTTATGAAAGCCTCCTGTGCGATGGCTTATCACCTGAGTCGTCATACGAGGAAGCATGCAATTGTAAATAATCAATTAATTTCAATTGTAATTATAATTTGCTTTTTTTCTTCCAGCATAAATGTATGGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA
| 29,317
|
MT766325.1
|
Astrovirus MLB1
|
Yang,Q., Rivailler,P., Zhu,S., Yan,D., Xie,N., Tang,H., Zhang,Y., Xu,W.
|
China CDC, National Institute for Communicable Disease Control and Prevention
|
China
|
2022-06-23
|
AstV/CHN/XJ/env/2018/MD-ctg1
|
Astrovirus MLB1
|
Mamastrovirus
|
Astroviridae
|
ssRNA(+)
| 6,161
|
GenBank
| 1
|
China: Xinjiang
|
China
| null | null |
2018-08-21
|
SAMN15514204
|
PRJNA645711
|
MAG: Astrovirus MLB1 isolate AstV/CHN/XJ/env/2018/MD-ctg1, complete genome
|
GTGGTATGGCTGTGCCTTTCCATATTGGTGTGTCAGAYAAAGTTTTGAAYCTGGGTTCAGCTCGCTCACGTGAGTGGCTTAATGAGCTACCCAGTACAACACTCAACCAGCTGCGTGACATTTTTCCATTTGAAGTCCCAATTAATACTATGATAGTACCTAAGTCTAGATATCAATTGGGTACTGGTGTCACACTTGCAGTCCAAGGTATGGTTACATTGGGTTGCTACAGTACATATGCACTTGATGGTGAAGTATGGATCGAAGTTGATGAAACTAGAATAGATCCAAAGTGTGCATATGTTGGGACCATGGCCCTAGATAGGGTAAAGCTCATGGATCGCAATAAAGAACTGCAGCTGGAAAATGCATCAATGAGTGTTGATTTACAACTGACTCGCCATGAATTGGAGAGGTGTAGGCCAGCCATCATTCGACCGCAAAGATATGGTAACTTTGCACTTTTTGTTCTTTTCTTTTTCCTTTTCTTTATTTTAGGAACAAAGGCCGAAGATTGGCATGATCAGACTCAGGATTATTTGGTTGAATTTCTGAAAGAAGCAAAACAGGAAATTGTATCTAATTTGGATACATACTACAGTCTCCTTTTACATGTAGTTAGGTGGGAGGTAGTTTCATGCATTATAGCAATTGTTTCTTTTTTCAAATTAAAGAGGCCCTGTGTTGCAATAATTGGCTTATTTTTAGCAACCATATCCAGATATAATTATGCAGCATTATCTATTGTACCATTTCTGGATGTTTACAGCACTGTTTTCTTGTATACCACCATGGTTGTGTACTTTTTGGTGCCCCATGTAGCTATAATTACATCACTAGTTTGTGCACTACTGTTTACCATTGTAAGTATGGTATGTGCGCACCACCAATTCATCATACGTGTTCGTGGAGATTGGCTTGTTGTCTTAATCACCATTGCAACGTATATTTGTGATGTTATGGGTATACATACTACAGCAATAGCTATTGCTGCATCGTTAGTGCGCATTTATATGTGCTTTCCTGCAGCTAATGCATCAGTGGTGGAAATCAAGGATAGTGCTGGTAAAGTAGTTCAGAAAACAACATTACTACCCAACTGGATCGGCTCAATGTACCAAGGTGCCCGAAATATGTTGCAAAAAGTTAGAACTGGTGTTGCGACATTTGTCCGGGTTAACCCTAATTGCTTGTGCCATATTAGAAGTGAAGGTTGTAGTGGCACAGGCTTCAGGTTGGGTAATGATATAGTTACTGCCGCACATGTTGTAGGCAATGCTGTCCAGGTTGAGGTGGTATATAATAATTATGTTGCTCAAGCTAAAGTTAGACATATCCCTGATAAAGATATTGCATATCTCATATTACCAGAGGGTCTCAAAACTATGCCTGTCTTAAAATTGGCAAAAAATCCAAATTATGAGCAGGTTACAATAATAGCACTTGAGGGCAATTGTATGCTTGTTTCCACTACAGAAGGTGTATGTCATGGTGAAACTATTTCATATGCCTGTGCTACCAGGGATGGTATGAGTGGTGCTCCTGTTCTTGATGTTAATGGAAATGTTCTTGGCGTTCATCAAACAAATACTGGATACACAGGTGGTGCGACAGTGATTAGAGCCACTGACGCTGCACCATATATTGATGAGAATGCTGCACTCAAAAAAGAAATTGAAGAATTAAAGAAGATGCTGCGCGAACAAACAATGAATCAGAGATCTGTTCAAGATAATGAAGTTGTAGGTATAGTCCGTGCAGCTGTTCAAAGAGAAATTGGAATATTACGTGATGAACTTAATTCATGTTATCAAAAAAAGAAAGGAAAAAATAAGAAAGGCCGTGGTGCACGACATCGTATGCTGCGCCGTGGGCAAAAATTTCTAACAGAAGAGGAGTACCAAGAACTGTTGGATAAGGGTCTGACTAGAGAACAGTTGCTTGATGCAATTGAGGAAATTGTTAGGGCACGTATCGGGTTCCCTGATTGGTCAGACCCTGAATATTCATCTGAAGAGGATGATGCAGCAGTTACATATTGGTGGGAACAAGTAAAAGAGAGTGATTATAAAGATGGAGTACCCCAGTTTGAACATATTGTACCCAAATATTCTCCAAATGAAAGAGTATTTTCTGAACAAGAGCGTAAAGATGTTAGTGAAGAGTTGTCTGCTCTGCAATCCATAGTAGATGGAGTGAAGAAAGAAGATTGGGAAGAAACCAAAAAGCAGACTACTGACGCTCTTAATCATGCACTATACGTTGTTGATAAGGCTCTTGCACAACATGGTTATATACTTTTTGAACAACGTATGCGGCCAAAAAACGGAAAAAGGGGTCCTCGGAGGAGGACCCCAAACACTACCTAGATACATGGATTGGGATGCTTAGTCCTTGCGTTCGTTGGCTGGTCCCAGAACGCTTTCCTTTGTACGGTGGTGTACCTTTAGATAGGCCAGTGTATGATTTTAAAGTTGTTAATGAAGATCTATTGGGGTTGCTCCCACCCCCACCTAATAATGATTTTGAGGTTTTTGGTCCTACTGTATGGGATGAGATTGCATATAAGAAATCATTTGAAAAGTTTGAATATGCTGATTATGTTGATTTTGAACAGATATATCCTGAGTGTGTTGCCTTTGCTGATAAAAAATTTTTGGAACATTTTAATTTTTTGTCTGATTCTTCTTTTGTAAATATTTTAGCAACTGATAAAAATGTTGATTCCACACCCGCATACCCAAAGATGCGGTGGTGGCTTACTGAGAGTGACTATCTTGAGGAGTGTGGATGGGAATATTATGTTAAGGAGTTTGAAAACATCGCTTCTGGTCAAAATCCAGATGTTTGTTGGTACTTGTTCCTCAAGAAAGAAATTATTAAACAACAAAAAATTGATGAAGGAGATGTCAGACAAATAGTATGTGCTGACCCAATATATTCCAGAATTGGGGCTTGTTTTGAGCAACACCAAAATGCCATGATGAAGGACCATACTCTTTTATCATCTGGACAATGTGGTTGGTCCCCTTTCTTTGGTGGTTATGAGGCAAGAATGTCCAGGCTGCGCTCCAAAGGGAACAAAATCTTTGTWGAGCTTGATTGGACTCGATTTGATGGCACGATACCACCAACCTTGTTGATGCACATAAAGAAATTAAGGTTCACCTTAATGGGTTCCATGTCCCGCAAGTATGAAAATGTATACAAGTGGTATTGTAGGAACCTAATCAACAGGTTTGTTGTGCTGCCTTCAGGTGAAGTTACAGCGCAACAACGTGGAAATCCATCGGGTCAGATATCAACCACCATGGATAATAACATGATCAACTATTGGTTGCAGGCATTTGAATATAAATTTTTGAATTTACCAGAAGAAGAGTGGATGCATTTTGATACTTTAATCTATGGAGATGATAGGATATCCACATATCGAAGCATCCCTAATGAATACACCAAAATAATAGTTGACATGTATAAAAATGTTTTTGGAATGTGGGTTAAGCCAGAAAAGGTCAAAGTCTCAGAGTCTTTGGAGGGACTCTCATTCTGTGGTTTTACTTATACACCAAATGGCCCAGTTCCAAGTGAGCCTTACAAACTCATGGCCTCATTGTTGAAACCTGCTACAAAATTACCTGATTTAATAGCTCTTCATGGGAAACTTTTGTGCTTCCAGTTGTTGATGGCAAATGATACTGCACACCCATTTTATGGGTATATTGAACAATGCTTGCAGTATACACACCGTGCCCTCAGTGATGTTAGCTTGCCAAGGCGCTTCACTCGAAGGCAGCTGGAGTACATTTGGAGGGGTGGACCAAATGACGACTATGGCTAATGCCAGTAAAGGTGTTACAGTTAACATCAACAATGCAAAACGGAAGCCTCGCTTCACCAATAACCAGCGAGCTAGATCTACTAGGCCAAATTTTACACCAGCACCCAAATTTAGGAAACGTCGGTTTATTCCTAATAGGAATCGCCGTCGTAGGCAAAATACTAGTACAACTGGGCCTAAACCTGCGGTGTCGCAGACAATTACAGCAACACTCGGCACCGTTGGATCAAATTTGAGTGATGTTGTTGAAACTGAATGTGCAGTCTTTTTGAATCCCATTATAGCAAAAGACTCTGGTGCCAGTGCAACTTTTGGGCCCCTTCAATCCTTGGGCGCACAGTATGCATTATGGAGGCTCAAGTGGCTCGAAGTCAGACTTCAGCCTTTGGTGGGAAACTCAGCTGTGAGTGGTACCGTAGCTCGTGTTAGTCTTAACATGACTACTGGTCCCACTCTTAATTCATGGTCTGGTCTTGGAGCTCGAATTCACAAGGATGTTAGAGTTGGTTCAAATCTTGTTTGGCGCATTAAACAGCGTCTAGTGAGTGGACCTTGTGAAACTTGGTGGAAAACCAATACAGCTGAGGACCCATCATTATCTCTTGGACCTGCACTGGAAGTACATACCATAGGTAAGACTATGAGCACTTATAAAAATGAAGTATTTTCCAGTGGGCTATTCCTTCTTGAGATAACTGGCCACTGGGAATTTGCAAATTATGCTGCTTCTCCAGCCCTTGCTACACTCACACAACATAAAGATGACAGTGAGACCACAAAAACACTTGCAATTAGTGCTGATGGTGCTAATGAACCAGTTGAGATGCTAATACCTGTGAATGAATGGAATATGAAGGCACAGTATGGAGGAAATGGCACACTTGGTGAAGCAATTTACCAAGTTGTTGATACCAGTGTTACAGTTGTAACAGACCTCTTTCCACCACCATTTTCATGGATTGGTAAAGCTTCATGGTGGTTTATCAGAAAAATGATTGGTAAGACAAAACAATTCCAGGTTGTTGTTAATGGTCAAAACCAAACTCTTACAGCAGACGTCTATCGTGTTTACACTTCAGCTTCTGCTGCTAGAGATGATAAACCAGCAATTTCCAGCAAGGCACATGAAGCTAAGCATCTGACTGGTGCAGTTGTTATCACACAAATTTCCACAGACAACATTCTTTCAGAAACCACATATACAGGCCCAAGATCCATTGTCACACCAGAAACTCCTATTGGCCCGTCTAGCTATCCAATGACACCAAGTTCTTTGGTGCTTATGGCTGGATATTTCAGTGGACCAGAAATTAGTGACAATTTTGGCAAGTACATGCCTTTGCTTTTCCAACAGAACACTTCTAAGGTTACATTTAGGAGTGGTAGTCATACCATAAAGATTGTAAGCATGGTTCTTGTTGACCGGCTTATGTGGTTGGATAAGCACTTTAACCAGTACACTAATGAACCAGATGGAGTTTTTGGTGACGTTGGCAATGTTTTTGTTGACAACGATAATGTTGCCAAGGTTATTACCATGAGTGGGTCATCGGCGCCAGCTAACAGAGGAGCCACCTTGATGCTATGTAAAGCCACAAAAAATATCCAGACTTTCAATTTTGCAGCAACAGTGTACATACCAGCTTATAAAGTAAAAGATGGTGCAGGTGGCAAAGATGTTGTTCTGAATGTGGCCCAGTGGGAAGCAAACAAGACTTTGACATACCCAGCTATACCTAAGGACACGTATTTTATGGTTGTAACAATGGGAGGTGCTAGCTTTACCATCCAAAGGTATGTGGTATACAATGAGGGAATTGGTGATGGCCTAGAATTACCAGCATTCTGGGGCAAATACTTATCCCAGCTATATGGTTTTAGTTGGAGTTCACCAACCTATGCATGTGTAACCTGGGAGCCCATCTATGCTGATGAGGGTATACCACATAGAAGTGCATTAAATGATGATGAAGTAAGCAGTGATGGTGATACTGATTATGACACTGACACAGAAGACGAAGATGAGTTCTTCGGTGAGGATCCCATTGCTGCATTGCACGCTATTGATGAAAAGAGACCAGCTAGACGTGCAATGTTTGATGCACTTGTTAAAACTGGTGTCAGTGTTGAAGAAGCATCTAGATGTGTCCTTAGAGCATGTCCTACAAAACTTCAGGTTAAGAAAAGGAAYCTTTATGAAAGCCTCCTGTGCGATGGCTTATCACCTGAGTCGTCGTACGAGGAAGMATGCAATTGTAAATAATTAATTAATTTCAATTGTAATTATAATTTGCTTTTTTTCTTCCAGCATAAATGTATG
| 29,329
|
MT766329.1
|
Astrovirus MLB1
|
Yang,Q., Rivailler,P., Zhu,S., Yan,D., Xie,N., Tang,H., Zhang,Y., Xu,W.
|
China CDC, National Institute for Communicable Disease Control and Prevention
|
China
|
2022-06-23
|
AstV/CHN/XJ/env/2018/ht3-ctg1
|
Astrovirus MLB1
|
Mamastrovirus
|
Astroviridae
|
ssRNA(+)
| 6,148
|
GenBank
| 1
|
China: Xinjiang
|
China
| null | null |
2018-03-30
|
SAMN15514209
|
PRJNA645711
|
MAG: Astrovirus MLB1 isolate AstV/CHN/XJ/env/2018/ht3-ctg1, complete genome
|
GGTATGGCTGTGCCTTTCCATATTGGTGTGTCAGACAAAGTTATGAATCTGGGTTCAGCTCGCTCACGTGAGTGGCTTAATGAGCTACCCAGTACAACACTCAACCAGCTGCGTGACATTTTTCCATTTGAAGTCCCAATTAATACTATGATAGTACCTAAGTCTAGATATCAATTGGGTACTGGTGTCACACTTGCAGTCCAAGGTATGGTTACATTGGGTTGCTAYAGTACATATGCACTTGATGGTGAAGCATGGATCGAAGTTGATGAAACTAGAATAGATCCAAAGTGTGCATATGTTGGGACCATGGCCCTAGATAGGGTAAAACTCATGGATCGCAATAAAGAACTGCAGCTGGAAAATGCATCAATGAGTGTTGATTTACAACTGACTCGCCATGAATTGGAGAGGTGTAGGCCAGCCATCATTCGACCGCAAAGATATGGTAACTTTGCACTTTTTGTCCTTTTCTTTTTCCTTTTCTTTATTTTAGGAACAAAGGCTGAAGATTGGCATGATCAGACTCAGGATTATTTGGTTGAATTTCTGAAAGAAGCAAAACAGGAAATTGTATCTAATTTGGATACATATTATAGTCTCCTTTTACATGTGGTTAGGTGGGAGGTAGTCTCATGCATTATAGCAATTGTTTCTTTTTTCAAATTAAAGAGGCCCTGTGTTGCAATAATTGGCTTATTTTTAGCAACCATATCCAGATATAATTATGCAGCATTATCTATTGTACCATTTCTGGATGTTTACAGCACTGTTTTCTTGTATACCACCATGGTTGTGTACTTTTTGGTGCCCCATGTAGCTATAATTACATCATTAGTTTGTGCACTATTGTTCACCATTGTAAGTATGGTATGTGCGCACCATCAATTCATCATACGTGTTCGTGGGGATTGGCTTGTTGTCTTAATCACCATTGCAACGTATATTTGTGATGTTATGGGTATACATACTACAGCAATAGCTATTGCTGCATCGTTAGTGCGTATTTATATGTGCTTTCCTGCAGCTAATGCATCAGTGGTGGAAATCAAGGATAGTGCTGGTAAAGTAGTTCAGAAAACAACATTACTACCCAACTGGATTGGTTCAATGTACCAAGGTGCCCGAAATATGTTGCAAAAAGTTAGAACTGGTGTTGCGACATTTGTCCGGGTTAACCCTAATTGCTTGTGCCATATTAGAAGTGAAGGTTGTAGCGGCACAGGCTTCAGGTTGGGTAATGATATAGTTACTGCCGCACATGTTGTAGGCAATGCTGTCCAGGTTGAGGTAGTATATAATAATTATGTTGCCCAAGCTAAAGTTAGGCATATCCCTGATAAAGATATTGCATATCTCATATTACCAGAGGGTCTCAAAACTATGCCGGTCTTAAAATTGGCAAAAAATCCAAATTATGAGCAGGTCACAATAATAGCACTTGAGGGCAATTGTATGCTTGTTTCCACTACAGAAGGTGTATGTCATGGTGAAACTATTTCATATGCCTGTGCTACCAGAGATGGTATGAGTGGTGCTCCTGTTCTTGATGTTAATGGAAATGTTCTTGGCGTTCATCAAACAAATACTGGATACACAGGTGGTGCGACAGTGATTAGAGCCACTGACGCTGCACCATATATTGATGAGAATGCTGCACTCAAAAAAGAAATTGAAGAATTAAAGAAGATGCTGCGCGAACAAACAATGAATCAGAGATCTGTTCAAGATAATGAGGTTGTAGGTATAGTCCGTGCAGCTGTCCAAAGAGAAATTGGAATATTACGTGATGAACTTAATTCATGTTATCAAAAAAAGAAAGGAAAAAATAAGAAAGGCCGTGGTGCACGACATCGTATGCTGCGCCGTGGGCAAAAATTTTTAACAGAAGAGGAGTACCAAGAACTGTTGGATAAGGGTCTGACTAGAGAACAGTTGCTTGATGCAATTGAGGAAATTGTTAGGGCACGTATCGGATTCCCTGATTGGTCAGACCCTGAATATTCATCTGAAGAGGATGATGCAGCAGTTACATATTGGTGGGAACAAGTAAAAGAGAGTGATTATAAAGATGGAGTACCCCAGTTTGAACACATTGTACCCAAATATTCTCCAAATGAAAGAGTATTTTCTGAACAAGAGCGTAAAGATGTTAGTGAAGAGTTGTCTGCTTTGCAATCCATAGTAGATGGAGTGAAGAAAGAAGATTGGGAAGAAACCAAAAAGCAGACTACTGACGCTCTTAATCATGCACTATACGTTGTTGATAAAGCTCTTGCACAACATGGTTATATACTTTTTGAACAGCGTATGCGGCCAAAAAACGGAAAAAGGGGTCCTCGGAGGAGGACCCCAAACACTACCTAGATACATGGATTGGGATGCTTAGTCCTTGCGTTCGTTGGCTGGTCCCAGAACGCTTTCCTTTGTACGGTGGTGTACCTTTAGATAGGCCAGTGTATGATTTTAAAGTTGTCAATGAAGATCTATTGGGGTTGCTCCCACCCCCACCTAATAATGATTTTGAGGTTTTTGGTCCTACTGTATGGGATGAGATTGCATATAAGAAATCATTTGAAAAGTTTGAATATGCTGATTATGTTGATTTTGAACAGATATATCCTGAGTGTGTTGCTTTTGCTGATAAAAAATTTTTGGAACATTTTAATTTTTTGTCTGATTCTTCTTTTGTAAATATTTTAGCAACTGATAAAAATGTTGATTCCACACCCGCATACCCAAAGATGCGGTGGTGGCTTACTGAGAGTGACTATCTTGAGGAGTGTGGATGGGAATATTATGTTAAGGAATTTGAAAACATCGCTTCTGGTCAAAATCCAGATGTTTGTTGGTACTTGTTCCTCAAGAAAGAAATTATTAAACAACAAAAAATTGATGAAGGAGATGTCAGACAAATAGTATGTGCTGACCCAATATATTCCAGAATTGGGGCTTGTTTTGAGCAACACCAAAATGCCATGATGAAGGACCACACTCTATTATCATCTGGACAATGTGGTTGGTCCCCCTTCTTTGGTGGTTATGAGGCAAGAATGTCCAGGCTGCGCTCCAAAGGGAACAAAATCTTTGTTGAGCTTGATTGGACTCGATTCGATGGTACAATACCACCAACCTTGTTGATGCACATAAAGAAATTAAGGTTTACCTTAATGGGTTCCATGTCCCGCAAGTATGAAAATGTATACAAGTGGTATTGTAGGAACCTAATCAACAGGTTTGTTGTGCTGCCTTCAGGTGAAGTTACAGCACAACAGCGTGGAAATCCATCGGGTCAGATATCAACCACCATGGATAATAACATGATCAACTATTGGTTGCAGGCATTTGAATATAAATTTTTGAATTTACCAGAAGAAGAGTGGATGCATTTTGATACTTTAATCTATGGAGATGATAGGATATCCACATATCGAAGCATCCCTAATGAATACACCAAGGTAATAGTTGACATGTATAAAAATGTTTTTGGAATGTGGGTTAAGCCAGAAAAGGTCAAAGTCTCAGAGTCTTTGGAGGGACTCTCATTCTGTGGTTTTACTTATACACCAAATGGCCCAGTTCCAAGTGAGCCTTACAAACTTATGGCCTCATTGTTGAAACCTGCTACAAAATTACCTGATTTAATAGCTCTTCATGGGAAACTTTTGTGCTTCCAGTTGTTGATGGCAAATGATACTGCACACCCATTTTATGGGTATATTGAACAATGTTTGCAGTATACACACCGTGCCCTCAGTGATGTTAGCTTGCCAAGGCGCTTCACTCGAAGGCAGCTGGAGTACATTTGGAGGGGTGGACCAAATGACGACTATGGCTAATGCCAGTAAAGGTGTTACAGTTAACATCAACAATGCAAAACGGAAGCCTCGCTTCACCAATAACCAGCGAGCTAGATCTACTAGGCCAAATTTTACACCAGCACCCAAATTTAGGAAACGTCGGTTTATTCCTAATAGGAATCGCCGTCGTAGGCAAAATACTAGTACAACTGGGCCTAAACCTGCGGTGTCGCAGACAATTACAGCAACACTCGGCACCGTTGGATCAAATTTGAGTGATGTTGTTGAAACTGAATGTGCAGTCTTTTTGAATCCCATTATAGCAAAAGACTCTGGTGCCAGTGCAACTTTTGGGCCTCTTCAATCCCTGGGTGCACAGTATGCATTATGGAGGCTCAAGTGGCTAGAAGTTAGACTTCAGCCTTTGGTGGGTAACTCAGCTGTGAGTGGTACTGTAGCTCGTGTTAGTCTTAACATGACTACTGGTCCCACTCTCAATTCATGGTCTGGTCTTGGAGCTCGAATTCACAAGGATGTTAGAGTTGGTTCAAATCTTGTTTGGCGCATTAAACAGCGTCTAGTGAGTGGACCTTGTGAAACTTGGTGGAAAACCAATACAGCTGAGGACCCATCGTTATCTCTTGGACCTGCACTGGAAGTACATACCATAGGTAAGACTATGAGCACTTATAAAAATGAAGTGTTTTCCAGTGGACTATTCCTCCTTGAGATAACTGGCCACTGGGAATTTGCAAATTATGCTGCTTCTCCAGCCCTTGCCACACTCACACAACATAAAGATGACAGTGAGACCACAAAAACACTTGCAATTAGTTCTGATGGTGCTAATGAACCAGTTGAGATGCTAATACCTGTGAATGAATGGAATATGAAGGCACAGTATGGAGGAAATGGCACACTTGGTGAAGCAATTTACCAAGTTGTTGATACCAGTGTTACAGTTGTAACAGACCTCTTTCCACCACCATTTTCATGGATTGGTAAAGCTTCATGGTGGTTTATCAGAAAAATGATTGGTAAAACAAAACAATTCCAGGTTGTTGTTAACGGTCAAAACCAAACTCTTACAGCAGACGTTTATCGTGTTTACACGTCAGCTTCTGCTGCTAGAGATGATAAACCAGCAATTTCCAGCAAGGCACATGAGGCTAAGCATCTGACTGGTGCAGTTGTTATCACACAAATTTCCACAGACAACATTCTTTCAGAAACCACATATACAGGCCCAAGATCCATTGTCACACCAGAAACTCCTATTGGCCCGTCTAGCTATCCAATGACACCAAGTTCTTTGGTGCTTATGGCTGGATATTTCAGTGGACCAGAAATTAGTGACAATTTTGGCAAGTACATGCCTTTGCTTTTCCAACAGAACACTTCTAAGGTTACATTTAGGAGTGGTAGTCATACCATAAAGATTGTAAGCATGGTTCTTGTTGACCGGCTTATGTGGTTGGATAAGCACTTTAACCAGTACACTAATGAACCAGATGGAGTTTTTGGTGACGTTGGCAATGTTTTTGTTGACAACGATAATGTTGCCAAGGTTATTACTATGAGTGGGTCATCGGCGCCAGCTAACAGAGGAGCCACCTTGATGTTATGCAAAGCCACAAAAAATATCCAGACTTTCAATTTTGCAGCAACAGTGTACATACCAGCTTATAAAGTAAAAGATGGTGCAGGTGGCAAAGATGTTGTTCTGAATGTGGCCCAGTGGGAAGCAAACAAGACTTTGACATACCCAGCTATACCTAAGGACACGTATTTTATGGTTGTAACAATGGGAGGTGCTAGCTTTACCATCCAAAGGTATGTGGTATACAATGAGGGAATTGGTGATGGCCTAGAATTACCAGCATTCTGGGGCAAATACTTATCCCAGCTATATGGTTTTAGTTGGAGTTCACCAACCTATGCATGTGTAACCTGGGAGCCTATCTATGCTGATGAGGGTATACCACATAGAAGTGCATTAAATGATGATGAAGTAAGCAGTGATGGTGATACTGATGATGACACTGACACAGAAGACGAAGACGAGTTCTTCGGTGAGGATCCCATGGCTGCATTGCACGCTCTTGATGAAAAGAGACCAGCTAGACGTGCAATGTTTGATGCACTTGTTAAAACTGGTGTCAGTGTTGAAGAAGCATCTAGATGTGTCCTTAGGGCATGTCCAACAAAACTTCAGATTAAGAAAAGGAATCTTTATGAAAGCCTCCTGTGCGATGGCTTATCACCTGAGTCGTCGTACGAGGAAGCATRCAATTGTAAATAATCAATTAATTTCAATTGTAATTATAATTTGCTTTTTTTCTTCCAGC
| 29,330
|
LC694998.1
|
Astrovirus MLB1
|
Asakura,H., Yaoita,Y., Nagano,M., Isogai,M., Hasegawa,M., Fujiwara,T., Miyake,H., Nagashima,M., Suzuki,J., Sadamasu,K.
|
Department of Microbiology; Hyakunincho3-24-1, Shinjyuku-ku, Tokyo 169-0073
|
Japan
|
2022-05-03
|
MLB1/210966/Tokyo/2021
|
Astrovirus MLB1
|
Mamastrovirus
|
Astroviridae
|
ssRNA(+)
| 6,151
|
GenBank
| null |
Japan:Tokyo
|
Japan
|
Homo sapiens
| null |
2021-12
| null | null |
Astrovirus MLB1 MLB1/210966/Tokyo/2021 RNA, nearly complete genome
|
TTTCCATATTGGTGTGTCAGACAAAGTTTTGAATCTGGGTTCAGCTCGCTCACGTGAGTGGCTTAATGAGCTACCCAGTACAACACTCAACCAGCTGCGTGACATTTTTCCATTTGAAGTTCCAATTAATACTATGATAGTACCTAAATCTAGATATCAATTGGGTACTGGTGTCACACTTGCAGTCCAAGGTATGGTTACATTGGGTTGCTACGGTACATATGCACTTGATGGTGAAGTATGGATCGAAGTTGATGAAACTAGAATAGATCCAAAGTGTGCATATGTTGGGACCATGGCCCTGGATAGGGTAAAGCTCATGGACCGCAATAAAGAACTGCAGCTGGAAAATGCATCAATGAGTGTTGATTTACAACTGACTCGCCATGAATTGGAGAGGTGTAGGCCAGCCATCATTCGACCGCAAAGATATGGTAACTTTGCACTTTTTGTTCTTTTCTTTTTCCTTTTCTTTATTTTAGGAACAAAGGCTGAAGATTGGCATGATCAGACTCAGGATTATTTGGTTGAATTTCTGAAAGAAGCAAAACAGGAAATTGTATCTAATTTGGATACATATTACAGTCTCCTTTTACATGTAGTTAGGTGGGAGGTAGTTTCATGCATTATAGCAATTGTTTCTTTTTTCAAATTAAAGAGGCCCTGTGTTGCAATAATTGGCTTATTTTTAGCAACCATATCCAGATATAATTATGCAGCATTATCTATTGTACCATTTCTGGATGTTTACAGCACTGTTTTCTTGTATACCACCATGGTTGTGTACTTTTTGGTGCCCCATGTAGCTATAATTACATCACTAGTTTGTGCACTACTGTTTACCATTGTAAGTATGGTATGTGCGCACCACCAATTCATCATACGTGTTCGTGGAGATTGGCTTGTTGTCTTAATCACCATTGCAACGTATATTTGTGATGTTATGGGTATACATACCACAGCAATAGCTATTGCTGCATCGTTAGTGCGCATTTATATGTGCTTTCCTGCAGCTAATGCATCAGTGGTGGAAATCAAGGATAGTGCTGGTAAAGTAGTTCAGAAAACAACATTACTACCCAACTGGATCGGCTCAATGTACCAAGGTGCCCGAAATATGTTGCAGAAAGTTAGAACTGGTGTTGCGACATTTGTTCGGGTTAACCCTAATTGCTTGTGCCATATTAGAAGTGAAGGTTGTAGTGGCACAGGCTTCAGGTTGGGTAATGATATAGTTACTGCCGCACATGTTGTAGGCAATGCTGTCCAGGTTGAGGTGGTATATAATAATTATGTTGCTCAAGCTAAAGTTAGACATATCCCTGATAAAGATATTGCATATCTCATATTACCAGAGGGTCTCAAAACTATGCCTGTCTTAAAATTGGCAAAAAATCCAAATTATGAGCAGGTTACAATAATAGCACTTGAGGGCAATTGTATGCTTGTTTCCACTACAGAAGGTGTATGTCATGGTGAAACTATTTCATATGCCTGTGCTACCAGGGATGGTATGAGTGGTGCTCCTGTTCTTGATGTTAATGGAAATGTTCTTGGCGTTCATCAAACAAATACTGGATACACAGGTGGTGCGACAGTGATTAGAGCCACTGACGCTGCACCATATATTGATGAGAATGCTGCACTTAAAAAAGAAATTGAAGAATTAAAGAAGATGCTGCGCGAACAAACAATGAATCAGAGATCTGTTCAAGATAATGAAGTTGTAGGTATAGTCCGTGCAGCTGTCCAAAGAGAAATTGGAATATTACGTGATGAACTTAATTCATGTTATCAAAAAAAGAAAGGAAAAAATAAGAAAGGCCGTGGTGCACGACATCGTATGCTGCGCCGTGGGCAAAAATTTCTAACAGAAGAGGAGTACCAAGAACTGTTGGATAAGGGTCTGACTAGAGAACAGTTGCTTGACGCAATTGAGGAAATTGTTAGGGCACGTATCGGGTTCCCTGATTGGTCAGACCCTGAATATTCATCTGAAGAGGATGATGCAGCAGTTACATATTGGTGGGAACAAGTAAAAGAGAGTGATTATAAAGATGGAGTACCCCAGTTTGAACATATTGTACCCAAATATTCTCCAAATGAAAGAGTATTTTCTGAACAAGAGCGTAAAGATGTTAGTGAAGAGTTGTCTGCTCTGCAATCCATAGTAGATGGAGTGAAGAAAGAAGATTGGGAAGAAACCAAAAAACAGACTACTGACGCTCTTAATCATGCACTATACGTTGTTGATAAGGCTCTTGCACAACATGGTTATATACTTTTTGAACAACGTATGCGGCCAAAAAACGGAAAAAGGGGTCCTCGGAGGAGGACCCCAAACACTACCTAGATACATGGATTGGGATGCTTAGTCCTTGCGTTCGTTGGCTGGTCCCAGAACGCTTTCCTTTGTATGGTGGTGTACCTTTAGATAGGCCAGTGTATGATTTTAAAATTGTTAATGAAGATCTATTGGGGTTGCTCCCACCCCCACCTAATAATGATTTTGAGGTTTTTGGTCCTACTGTATGGGATGAGATTGCATATAAGAAATCATTTGAAAAGTTTGAATATGCTGATTATGTTGATTTTGAACAGATATATCCTGAGTGTGTTGCTTTTGCTGATAAAAAATTTTTGGAACATTTTAATTTTTTGTCTGATTCTTCTTTTGTAAATATTTTAGCAACTGATAAAAATGTTGATTCCACACCCGCATACCCAAAGATGCGGTGGTGGCTTACTGAGAGTGACTATCTTGAGGAGTGTGGATGGGAATATTATGTTAAGGAGTTTGAAAACATCGCTTCTGGTCAAAATCCAGATGTTTGTTGGTACTTGTTCCTCAAGAAAGAAATTATTAAACAACAAAAAATTGATGAAGGAGATGTCAGACAAATAGTATGCGCTGACCCAATATATTCCAGAATTGGGGCTTGTTTTGAGCAACACCAAAATGCCATGATGAAGGACCATACTCTTTTATCATCTGGACAATGTGGTTGGTCCCCTTTCTTTGGTGGTTATGAGGCAAGAATGTCCAGGCTGCGCTCCAAAGGGAACAAAATCTTTGTAGAGCTTGATTGGACTCGATTTGATGGCACAATACCACCAACCTTGTTGATGCACATAAAGAAATTAAGGTTCACCTTAATGGGTTCCATGTCCCGCAAGTATGAAAATGTATACAAGTGGTATTGTAGGAACCTAATCAACAGGTTTGTTGTGCTGCCTTCAGGTGAAGTTACAGCGCAACAGCGTGGAAATCCATCGGGTCAGATATCAACCACCATGGATAATAACATGATCAACTATTGGTTGCAGGCATTTGAATATAAATTTTTGAATTTACCAGAAGAAGAGTGGATGCATTTTGATACTTTAATCTATGGAGATGACAGGATATCCACATATCGAAGCATCCCTAATGAATACACCAAAATAATAGTTGACATGTATAAAAATGTTTTTGGAATGTGGGTTAAGCCAGAAAAGGTCAAAGTCTCAGAGTCTTTGGAGGGACTCTCATTCTGTGGTTTTACTTATACACCAAATGGCCCAGTTCCAAGTGAGCCTTACAAACTCATGGCCTCATTGTTGAAACCTGCTACAAAATTACCTGACTTAATAGCTCTTCATGGGAAACTTTTGTGCTTCCAGTTGTTGATGGCAAATGATACTGCACACCCATTTTATGGGTATATTGAACAATGCTTGCAGTATACACACCGTGCCCTCAGTGATGTTAGCTTGCCAAGGCGCTTCACTCGAAGGCAGCTGGAGTACATTTGGAGGGGTGGACCAAATGATGACTATGGCTAATGCCAGTAAAGGTGTTACAGTTAACATCAACAATGCAAAACGGAAGCCTCGCTTTACCAATAACCAGCGAGCTAGATCTACTAGGCCAAATTTTACACCAGCACCCAAATTTAGGAAACGTCGGTTTATTCCTAATAGGAATCGCCGTCGTAGGCAAAATACTAGTACAACTGGGCCTAAACCTGCGGTGTCGCAGACAATTACAGCAACACTCGGCACCGTTGGATCAAATTTGAGTGATGTTGTTGAAACTGAATGTGCAGTCTTTTTGAATCCCATTATAGCAAAAGACTCTGGTGCCAGTGCAACTTTTGGGCCCCTTCAATCCTTGGGCGCACAGTATGCATTATGGAGGCTCAAGTGGCTTGAAGTCAGACTTCAGCCTTTGGTGGGAAACTCAGCTGTGAGTGGTACCGTAGCTCGTGTTAGTCTTAATATGACTACTGGTCCCACTCTCAATTCATGGTCTGGTCTTGGAGCTCGAATTCACAAGGATGTTAGAGTTGGTTCAAATCTTGTTTGGCGCATTAAACAGCGTCTAGTGAGTGGACCTTGTGAAACTTGGTGGAAAACCAATACAGCTGAGGACCCATCATTATCTCTTGGACCTGCACTGGAAGTACATACCATAGGTAAGACTATGAGCACTTATAAAAATGAAGTGTTTTCCAGTGGACTATTCCTTCTTGAGATAACTGGCCACTGGGAATTTGCAAATTATGCTGCTTCTCCAGCCCTTGCTACACTCACACAACATAAAGATGACAGTGAGACCACAAAAACACTTGCAATTAGTGCTGATGGTGCTAATGAACCAGTTGAGATGCTAATACCTGTGAATGAATGGAATATGAAGGCACAGTATGGAGGAAATGGCACACTTGGTGAAGCAATTTACCAAGTTGTTGATACTAGTGTTACAGTTGTAACAGACCTCTTTCCACCACCATTTTCATGGATTGGCAAAGCTTCATGGTGGTTTATCAGAAAAATGATTGGTAAAACAAAACAATTCCAGGTTGTTGTTAATGGTCAAAACCAAACTCTTACAGCGGATGTCTATCGTGTTTACACTTCAGCTTCCGCTGCTAGAGATGATAAACCAGCAATTTCCAGTAAGGCACATGAAGCTAAGCATCTGACTGGTGCAGTTGTTATCACACAAATTTCCACAGACAACATTCTTTCAGAAACCACATATACAGGCCCAAGATCCATTGTCACACCAGAAACTCCTATTGGCCCGTCTAGCTATCCAATGACACCAAGTTCTTTGGTGCTTATGGCTGGATATTTCAGTGGGCCAGAAATTAGTGACAATTTTGGCAAGTACATGCCTTTGCTTTTCCAACAGAACACTTCTAAGGTTACATTTAGGAGTGGTAGTCATACCATAAAGATTGTAAGCATGGTTCTCGTTGACCGGCTTATGTGGTTGGATAAGCACTTTAACCAGTACACTAATGAACCAGATGGAGTTTTTGGTGATGTTGGCAATGTTTTTGTTGACAACGATAATGTTGCCAAGGTTATTACCATGAGTGGGTCATCGGCGCCAGCTAACAGAGGAGCCACCTTAATGCTATGTAAAGCCACAAAAAATATCCAGACTTTCAATTTTGCAGCAACAGTGTACATACCAGCTTATAAAGTAAAAGATGGTGCAGGTGGCAAAGATGTTGTTCTGAATGTGGCCCAGTGGGAAGCAAACAAGACTTTGACATACCCAGCTATACCTAAGGACACGTATTTTATGGTTGTAACAATGGGAGGTGCTAGCTTTACCATCCAAAGGTATGTGGTATACAATGAGGGAATTGGTGATGGCCTAGAATTACCAGCATTCTGGGGCAAATACTTATCCCAGCTATATGGTTTTAGTTGGAGTTCACCAACCTATGCATGTGTAACCTGGGAGCCCATCTATGCTGATGAGGGTATACCACATAGAAGTGCATTAAATGATGATGAAGTAAGTAGTGATGGTGATACTGATTATGACACTGACACAGAAGACGAAGATGAGTTCTTCGGTGAGGATCCCATTGCTGCATTGCACGCCATTGATGAAAAGAGACCAGCTAGACGTGCAATGTTTGATGCACTTGTTAAAACTGGTGTCAGTGTTGAAGAAGCATCTAGATGTGTCCTTAGAGCATGTCCTACAAAACTTCAGGTTAAGAAAAGGAATCTTTATGAAAGCCTCCTGTGCGATGGCTTATCACCTGAGTCGTCGTACGAGGAAGCATGCAATTGTAAATAATCAATTAATTTCAATTGTAATTATAATTTGCTTTTTTTCTTCCAGCATAAATGTATGGAAAAA
| 30,920
|
LC694999.1
|
Astrovirus MLB1
|
Asakura,H., Yaoita,Y., Nagano,M., Isogai,M., Hasegawa,M., Fujiwara,T., Miyake,H., Nagashima,M., Suzuki,J., Sadamasu,K.
|
Department of Microbiology; Hyakunincho3-24-1, Shinjyuku-ku, Tokyo 169-0073
|
Japan
|
2022-05-03
|
MLB1/210750/Tokyo/2021
|
Astrovirus MLB1
|
Mamastrovirus
|
Astroviridae
|
ssRNA(+)
| 6,144
|
GenBank
| null |
Japan:Tokyo
|
Japan
|
Homo sapiens
| null |
2021-11
| null | null |
Astrovirus MLB1 MLB1/210750/Tokyo/2021 RNA, nearly complete genome
|
ATGGCTGTGCCTTTCCATGTTGGTGTGTCAGACAAAGTTTTGAATCTGGGTTCAGCTCGCTCACGTGAGTGGCTTAATGAGCTACCCAGTACAACACTCAACCAGCTGCGTGACATTTTTCCATTTGAAGTCCCAATTAATACTATGATAGTACCTAAGTCTAGATATCAATTGGGTACTGGTGTCACACTTGCAGTCCAAGGTATGGTTACATTGGGTTGCTACAGTACATATGCACTTGATGGTGAAGTATGGATCGAAGTTGATGAAACTAGAATAGATCCAAAGTGTGCATATGTTGGGACCATGGCCCTAGATAGGGTAAAGCTCATGGATCGCAATAAAGAACTGCAGCTGGAAAATGCATCAATGAGTGTTGATTTACAACTGACTCGCCATGAATTGGAGAGGTGTAGGCCAACCATCATTCGACCGCAAAGATATGGTAACTTTGCACTTTTTGTTCTTTTCTTTTTCCTTTTCTTTATTTTAGGAACAAAGGCCGAAGATTGGCATGACCAGACTCAGGATTATTTGGTTGAATTTCTGAAAGAAGCAAAACAGGAAATTGTATCTAATTTGGATACATACTACAGTCTCCTTTTACATGTAGTTAGGTGGGAGGTAGTTTCATGCATTATAGCAATTGTTTCTTTTTTTAAATTAAAGAGGCCCTGTGTTGCAATAATTGGCTTATTTTTAGCAACCATATCCAGATATAATTATGCAGCATTATCTATTGTACCATTTCTGGATGTTTACAGCACTGTTTTCTTGTATACCACCATGGTTGTGTACTTTTTGGTGCCTCATGTAGCTATAATTACATCACTAGTTTGTGCACTACTGTTTACCATTGTAAGTATGGTATGTGCGCACCACCAATTCATCATACGTGTTCGTGGAGATTGGCTTGTTGTCTTAATCACCATTGCAACGTATATTTGTGATGTTATGGGTATACATACTACAGCAATAGCTATTGCTGCATCGTTAGTGCGCATTTATATGTGCTTTCCTGCAGCTAATGCATCAGTGGTGGAAATCAAGGATAGTGCTGGTAAAGTAGTTCAGAAAACAACATTACTACCCAACTGGATCGGCTCAATGTACCAAGGTGCCCGAAATATGTTGCAAAAAGTTAGAACTGGTGTTGCGACATTTGTCCGGGTCAACCCTAATTGCTTGTGCCATATTAGAAGTGAAGGTTGTAGTGGCACAGGCTTTAGGTTGGGTAATGATATAGTTACTGCCGCACATGTTGTAGGCAATGCTGTTCAGGTTGAGGTGGTATATAATAATTATGTTGCTCAAGCTAAAGTTAGACATATCCCTGATAAAGATATTGCATATCTCATATTACCAGAGGGTCTCAAAACTATGCCTGTTTTAAAATTGGCAAAAAATCCAAATTATGAGCAGGTTACAATAATAGCACTTGAGGGCAATTGTATGCTTGTTTCCACTACAGAAGGTGTATGTCATGGTGAAACTATTTCATATGCCTGTGCTACCAGGGATGGTATGAGTGGTGCTCCTGTTCTTGATGTTAATGGAAATGTTCTTGGCGTTCATCAAACAAATACTGGATACACAGGTGGTGCGACAGTGATTAGAGCCACTGACGCTGCACCATATATTGATGAGAATGCTGCACTCAAAAAAGAAATTGAAGAATTAAAGAAGATGCTGCGCGAACAAACAATGAATCAGAGATCTGTTCAAGATAATGAAGTTGTAGGTATAGTCCGTGCAGCTGTTCAAAGAGAAATTGGAATATTACGTGATGAACTTAATTCATGTTATCAAAAAAAGAAAGGAAAAAATAAGAAAGGCCGTGGTGCACGACATCGTATGCTGCGCCGTGGGCAAAAATTTCTAACAGAAGAGGAGTACCAAGAACTGTTGGATAAGGGCCTGACTAGAGAACAGTTGCTTGATGCAATTGAGGAAATTGTTAGGGCACGTATCGGGTTCCCTGATTGGTCAGACCCTGAATATTCATCTGAAGAGGATGATGCAGCAGTTACATATTGGTGGGAGCAAGTAAAAGAGAGTGATTATAAAGATGGAGTACCCCAGTTTGAACATATTGTACCCAAATATTCTCCAAATGAAAGAGTATTTTCTGAACAAGAGCGTAAAGATGTTAGTGAAGAGTTGTCTGCTCTGCAATCCATAGTAGATGGAGTGAAGAAAGAAGATTGGGAAGAAACCAAAAAGCAGACTACTGACGCTCTTAATCATGCACTATACGTTGTTGATAAGGCTCTTGCACAACATGGTTATATACTTTTTGAACAACGTATGCGGCCAAAAAACGGAAAAAGGGGTCCTCGGAGGAGGACCCCAAACACTACCTAGATACATGGATTGGGATGCTTAGTCCTTGCGTTCGTTGGCTGGTCCCAGAACGCTTTCCTTTGTACGGTGGTGTACCTTTAGATAGGCCAGTGTATGATTTTAAAATTGTTAATGAAGATCTATTGGGGTTGCTCCCACCCCCACCTAATAATGATTTTGAGGTTTTTGGTCCTACTGTATGGGATGAGATCGCATATAAGAAATCATTTGAAAAGTTTGAATATGCTGATTATGTTGATTTTGAACAGATATATCCTGAGTGTGTTGCCTTTGCTGATAAAAAATTTTTGGAACATTTTAATTTTTTGTCTGATTCTTCTTTTGTAAATATTTTAGCAACTGATAAAAATGTTGATTCCACACCCGCATACCCAAAGATGCGGTGGTGGCTTACTGAGAGTGACTATCTTGAGGAGTGTGGATGGGAATATTATGTTAAGGAGTTTGAAAACATCGCTTCTGGTCAAAATCCAGATGTTTGTTGGTACTTGTTCCTCAAGAAAGAAATTATTAAACAACAAAAAATTGATGAAGGAGATGTCAGACAAATAGTATGTGCTGACCCAATATATTCCAGAATTGGGGCTTGTTTTGAGCAACACCAAAATGCCATGATGAAGGACCATACTCTTTTATCATCTGGACAATGTGGTTGGTCCCCTTTCTTTGGTGGTTATGAGGCAAGAATGTCCAGGCTGCGCTCCAAAGGGAACAAAATCTTTGTTGAGCTTGACTGGACTCGATTTGATGGCACGATACCACCAACCTTGTTGATGCACATAAAGAAATTAAGGTTCACCTTAATGGGTTCCATGTCCCGCAAGTATGAAAATGTATACAAGTGGTATTGTAGGAACCTAATCAACAGGTTTGTTGTGCTGCCTTCAGGTGAAGTTACAGCGCAACAACGTGGAAATCCATCGGGTCAGATATCAACCACCATGGATAATAACATGATCAACTATTGGTTGCAGGCATTTGAATATAAATTTTTGAATTTACCAGAAGAAGAGTGGATGTATTTTGATACTTTAATCTATGGAGATGATAGGATATCCACATATCGAAGCATCCCTAATGAATACACCAAAATAATAGTTGACATGTATAAAAATGTTTTTGGAATGTGGGTTAAGCCAGAAAAGGTCAAAGTCTCAGAGTCTTTGGAGGGACTCTCATTCTGTGGTTTTACTTATACACCAAATGGCCCAGTTCCAAGTGAGCCTTACAAACTCATGGCCTCATTGTTGAAACCTGCCACAAAATTACCTGATTTAATAGCTCTTCATGGGAAACTTTTGTGCTTCCAGTTGTTGATGGCAAATGATACTGCACACCCATTTTATGGGTATATTGAACAATGCTTGCAGTATACACACCGTGCCCTCAGTGATGTTAGCTTGCCAAGGCGCTTCACTCGAAGGCAGCTGGAGTACATTTGGAGGGGTGGACCAAATGACGACTATGGCTAATGCCAGTAAAGGTGTTACAGTTAACATCAACAATGCAAAACGGAAGCCTCGCTTCACCAATAACCAGCGAGCTAGATCTATTAGGCCAAATTTTACACCAGCACCCAAATTTAGGAAACGTCGGTTTATTTCTAATAGGAATCGCCGTCGTAGGCAAAATACTAGTACAACTGGGCCTAAACCTGCGGTGTCGCAGACAATTACAGCAACACTCGGCACCGTTGGATCAAATTTGAGTGATGTTGTTGAAACTGAATGTGCAGTCTTTTTGAATCCCATTATAGCAAAAGACTCTGGTGCCAGTGCAACTTTTGGGCCCCTTCAATCCTTGGGCGCACAGTATGCATTATGGAGGCTCAAGTGGCTCGAAGTCAGACTTCAGCCTTTGGTGGGAAACTCAGCTGTGAGTGGTACCGTAGCTCGTGTTAGTCTTAACATGACTACTGGTCCCACTCTCAATTCATGGTCTGGTCTTGGAGCTCGAATTCACAAGGATGTTAGAGTTGGTTCAAATCTTGTTTGGCGCATTAAACAGCGTCTAGTGAGTGGACCTTGTGAAACTTGGTGGAAAACCAATACAGCTGAGGACCCATCATTATCTCTTGGACCTGCACTGGAAGTACATACCATAGGTAAGACTATGAGCACTTATAAAAATGAAGTGTTTTCCAGTGGGCTATTCCTTCTTGAGATAACTGGCCACTGGGAATTTGCAAATTATGCTGCTTCTCCAGCCCTTGCTACACTCACACAACATAAAGATGACAGTGAGACCACAAAAACACTTGCAATTAGTGCTGATGGTGCTAATGAACCAGTTGAGATGCTAATACCTGTGAATGAATGGAATATGAAGGCACAGTATGGAGGAAATGGCACACTTGGTGAAGCAATTTACCAAGTTGTTGATACCAGTGTTACAGTTGTAACAGACCTCTTTCCACCACCATTTTCATGGATTGGTAAAGCTTCATGGTGGTTTATCAGAAAAATGATTGGTAAGACAAAACAATTCCAGGTTGTTGTTAATGGTCAAAACCAAACTCTTACAGCAGACGTCTATCGTGTTTACACTTCAGCTTCTGCTGCTAGAGATGATAAACCAGCAATTTCCAGCAAGGCACATGAAGCTAAGCATCTGACTGGTGCAGTTGTTATCACACAAATTTCCACAGACAACATTCTTTCAGAAACCACATATACAGGCCCAAGATCCATTGTCACACCAGAAACTCCTATTGGCCCGTCTAGCTATCCAATGACACCAAGTTCTTTGGTGCTTATGGCTGGATATTTCAGTGGACCAGAAATTAGTGACAATTTTGGCAAGTACATGCCTTTGCTTTTCCAACAGAACACTTCTAAGGTTACATTTAGGAGTGGTAGTCATACCATAAAGATTGTAAGCATGGTTCTTGTTGACCGGCTTATGTGGTTGGATAAGCACTTTAACCAGTACACTAATGAACCAGATGGAGTTTTTGGTGACGTTGGCAATGTTTTTGTTGACAACGACAATGTTGCCAAGGTTATTACCATGAGTGGGTCATCGGCGCCAGCTAACAGAGGAGCCACCTTGATGCTATGTAAAGCCACAAAAAATATCCAGACTTTCAATTTTGCAGCAACAGTGTACATACCAGCTTATAAAGTAAAAGATGGTGCAGGTGGCAAAGATGTTGTTCTGAATGTGGCCCAGTGGGAAGCAAACAAGACTTTGACATACCCAGCTATACCTAAGGACACGTATTTTATGGTTGTAACAATGGGAGGTGCTAGCTTTACCATCCAAAGGTATGTGGTATACAATGAGGGAATTGGTGATGGCCTAGAATTACCAGCATTCTGGGGCAAATACTTATCCCAGCTATATGGTTTTAGTTGGAGTTCACCAACCTATGCATGTGTAACCTGGGAGCCCATCTATGCTGATGAGGGTATACCACATAGAAGTGCATTAGATGATGATGAAGTAAGCAGTGGTGGTGATACTGATTATGACACTGACACAGAAGACGAAGATGAGTTCTTCGGTGAGGATCCCATTGCTGCATTGCACGCTATTGATGAAAAGAGACCAGCTAGACGTGCAATGTTTGATGCACTTGTTAAAACTGGTGTCAGTGTTGAAGAAGCATCTAGATGTGTCCTTAGAGCATGTCCTACAAAACTTCAGGTTAAGAAAAGGAATCTTTATGAAAGCCTCCTGTGCGATGGCTTATCACCTGAGTCGTCGTACGAGGAAGCATGCAATTGTAAATAATCAATTAATTTCAATTGTAATTATAATTTGCTTTTTTTCTTCCAG
| 30,921
|
LC695000.1
|
Astrovirus MLB1
|
Asakura,H., Yaoita,Y., Nagano,M., Isogai,M., Hasegawa,M., Fujiwara,T., Miyake,H., Nagashima,M., Suzuki,J., Sadamasu,K.
|
Department of Microbiology; Hyakunincho3-24-1, Shinjyuku-ku, Tokyo 169-0073
|
Japan
|
2022-05-03
|
MLB1/210749/Tokyo/2021
|
Astrovirus MLB1
|
Mamastrovirus
|
Astroviridae
|
ssRNA(+)
| 6,162
|
GenBank
| null |
Japan:Tokyo
|
Japan
|
Homo sapiens
| null |
2021-11
| null | null |
Astrovirus MLB1 MLB1/210749/Tokyo/2021 RNA, nearly complete genome
|
GTGGTATGGCTGTGCCTTTCCATGTTGGTGTGTCAGACAAAGTTTTGAATCTGGGTTCAGCTCGCTCACGTGAGTGGCTTAATGAGCTACCCAGTACAACACTCAACCAGCTGCGTGACATTTTTCCATTTGAAGTCCCAATTAATACTATGATAGTACCTAAGTCTAGATATCAATTGGGTACTGGTGTCACACTTGCAGTCCAAGGTATGGTTACATTGGGTTGCTACAGTACATATGCACTTGATGGTGAAGTATGGATCGAAGTTGATGAAACTAGAATAGATCCAAAGTGTGCATATGTTGGGACCATGGCCCTAGATAGGGTAAAGCTCATGGATCGCAATAAAGAACTGCAGCTGGAAAATGCATCAATGAGTGTTGATTTACAACTGACTCGCCATGAATTGGAGAGGTGTAGGCCAACCATCATTCGACCGCAAAGATATGGTAACTTTGCACTTTTTGTTCTTTTCTTTTTCCTTTTCTTTATTTTAGGAACAAAGGCCGAAGATTGGCATGACCAGACTCAGGATTATTTGGTTGAATTTCTGAAAGAAGCAAAACAGGAAATTGTATCTAATTTGGATACATACTACAGTCTCCTTTTACATGTAGTTAGGTGGGAGGTAGTTTCATGCATTATAGCAATTGTTTCTTTTTTTAAATTAAAGAGGCCCTGTGTTGCAATAATTGGCTTATTTTTAGCAACCATATCCAGATATAATTATGCAGCATTATCTATTGTACCATTTCTGGATGTTTACAGCACTGTTTTCTTGTATACCACCATGGTTGTGTACTTTTTGGTGCCTCATGTAGCTATAATTACATCACTAGTTTGTGCACTACTGTTTACCATTGTAAGTATGGTATGTGCGCACCACCAATTCATCATACGTGTTCGTGGAGATTGGCTTGTTGTCTTAATCACCATTGCAACGTATATTTGTGATGTTATGGGTATACATACTACAGCAATAGCTATTGCTGCATCGTTAGTGCGCATTTATATGTGCTTTCCTGCAGCTAATGCATCAGTGGTGGAAATCAAGGATAGTGCTGGTAAAGTAGTTCAGAAAACAACATTACTACCCAACTGGATCGGCTCAATGTACCAAGGTGCCCGAAATATGTTGCAAAAAGTTAGAACTGGTGTTGCGACATTTGTCCGGGTCAACCCTAATTGCTTGTGCCATATTAGAAGTGAAGGTTGTAGTGGCACAGGCTTTAGGTTGGGTAATGATATAGTTACTGCCGCACATGTTGTAGGCAATGCTGTTCAGGTTGAGGTGGTATATAATAATTATGTTGCTCAAGCTAAAGTTAGACATATCCCTGATAAAGATATTGCATATCTCATATTACCAGAGGGTCTCAAAACTATGCCTGTTTTAAAATTGGCAAAAAATCCAAATTATGAGCAGGTTACAATAATAGCACTTGAGGGCAATTGTATGCTTGTTTCCACTACAGAAGGTGTATGTCATGGTGAAACTATTTCATATGCCTGTGCTACCAGGGATGGTATGAGTGGTGCTCCTGTTCTTGATGTTAATGGAAATGTTCTTGGCGTTCATCAAACAAATACTGGATACACAGGTGGTGCGACAGTGATTAGAGCCACTGACGCTGCACCATATATTGATGAGAATGCTGCACTCAAAAAAGAAATTGAAGAATTAAAGAAGATGCTGCGCGAACAAACAATGAATCAGAGATCTGTTCAAGATAATGAAGTTGTAGGTATAGTCCGTGCAGCTGTTCAAAGAGAAATTGGAATATTACGTGATGAACTTAATTCATGTTATCAAAAAAAGAAAGGAAAAAATAAGAAAGGCCGTGGTGCACGACATCGTATGCTGCGCCGTGGGCAAAAATTTCTAACAGAAGAGGAGTACCAAGAACTGTTGGATAAGGGCCTGACTAGAGAACAGTTGCTTGATGCAATTGAGGAAATTGTTAGGGCACGTATCGGGTTCCCTGATTGGTCAGACCCTGAATATTCATCTGAAGAGGATGATGCAGCAGTTACATATTGGTGGGAGCAAGTAAAAGAGAGTGATTATAAAGATGGAGTACCCCAGTTTGAACATATTGTACCCAAATATTCTCCAAATGAAAGAGTATTTTCTGAACAAGAGCGTAAAGATGTTAGTGAAGAGTTGTCTGCTCTGCAATCCATAGTAGATGGAGTGAAGAAAGAAGATTGGGAAGAAACCAAAAAGCAGACTACTGACGCTCTTAATCATGCACTATACGTTGTTGATAAGGCTCTTGCACAACATGGTTATATACTTTTTGAACAACGTATGCGGCCAAAAAACGGAAAAAGGGGTCCTCGGAGGAGGACCCCAAACACTACCTAGATACATGGATTGGGATGCTTAGTCCTTGCGTTCGTTGGCTGGTCCCAGAACGCTTTCCTTTGTACGGTGGTGTACCTTTAGATAGGCCAGTGTATGATTTTAAAATTGTTAATGAAGATCTATTGGGGTTGCTCCCACCCCCACCTAATAATGATTTTGAGGTTTTTGGTCCTACTGTATGGGATGAGATCGCATATAAGAAATCATTTGAAAAGTTTGAATATGCTGATTATGTTGATTTTGAACAGATATATCCTGAGTGTGTTGCCTTTGCTGATAAAAAATTTTTGGAACATTTTAATTTTTTGTCTGATTCTTCTTTTGTAAATATTTTAGCAACTGATAAAAATGTTGATTCCACACCCGCATACCCAAAGATGCGGTGGTGGCTTACTGAGAGTGACTATCTTGAGGAGTGTGGATGGGAATATTATGTTAAGGAGTTTGAAAACATCGCTTCTGGTCAAAATCCAGATGTTTGTTGGTACTTGTTCCTCAAGAAAGAAATTATTAAACAACAAAAAATTGATGAAGGAGATGTCAGACAAATAGTATGTGCTGACCCAATATATTCCAGAATTGGGGCTTGTTTTGAGCAACACCAAAATGCCATGATGAAGGACCATACTCTTTTATCATCTGGACAATGTGGTTGGTCCCCTTTCTTTGGTGGTTATGAGGCAAGAATGTCCAGGCTGCGCTCCAAAGGGAACAAAATCTTTGTTGAGCTTGACTGGACTCGATTTGATGGCACGATACCACCAACCTTGTTGATGCACATAAAGAAATTAAGGTTCACCTTAATGGGTTCCATGTCCCGCAAGTATGAAAATGTATACAAGTGGTATTGTAGGAACCTAATCAACAGGTTTGTTGTGCTGCCTTCAGGTGAAGTTACAGCGCAACAACGTGGAAATCCATCGGGTCAGATATCAACCACCATGGATAATAACATGATCAACTATTGGTTGCAGGCATTTGAATATAAATTTTTGAATTTACCAGAAGAAGAGTGGATGTATTTTGATACTTTAATCTATGGAGATGATAGGATATCCACATATCGAAGCATCCCTAATGAATACACCAAAATAATAGTTGACATGTATAAAAATGTTTTTGGAATGTGGGTTAAGCCAGAAAAGGTCAAAGTCTCAGAGTCTTTGGAGGGACTCTCATTCTGTGGTTTTACTTATACACCAAATGGCCCAGTTCCAAGTGAGCCTTACAAACTCATGGCCTCATTGTTGAAACCTGCCACAAAATTACCTGATTTAATAGCTCTTCATGGGAAACTTTTGTGCTTCCAGTTGTTGATGGCAAATGATACTGCACACCCATTTTATGGGTATATTGAACAATGCTTGCAGTATACACACCGTGCCCTCAGTGATGTTAGCTTGCCAAGGCGCTTCACTCGAAGGCAGCTGGAGTACATTTGGAGGGGTGGACCAAATGACGACTATGGCTAATGCCAGTAAAGGTGTTACAGTTAACATCAACAATGCAAAACGGAAGCCTCGCTTCACCAATAACCAGCGAGCTAGATCTATTAGGCCAAATTTTACACCAGCACCCAAATTTAGGAAACGTCGGTTTATTTCTAATAGGAATCGCCGTCGTAGGCAAAATACTAGTACAACTGGGCCTAAACCTGCGGTGTCGCAGACAATTACAGCAACACTCGGCACCGTTGGATCAAATTTGAGTGATGTTGTTGAAACTGAATGTGCAGTCTTTTTGAATCCCATTATAGCAAAAGACTCTGGTGCCAGTGCAACTTTTGGGCCCCTTCAATCCTTGGGCGCACAGTATGCATTATGGAGGCTCAAGTGGCTCGAAGTCAGACTTCAGCCTTTGGTGGGAAACTCAGCTGTGAGTGGTACCGTAGCTCGTGTTAGTCTTAACATGACTACTGGTCCCACTCTCAATTCATGGTCTGGTCTTGGAGCTCGAATTCACAAGGATGTTAGAGTTGGTTCAAATCTTGTTTGGCGCATTAAACAGCGTCTAGTGAGTGGACCTTGTGAAACTTGGTGGAAAACCAATACAGCTGAGGACCCATCATTATCTCTTGGACCTGCACTGGAAGTACATACCATAGGTAAGACTATGAGCACTTATAAAAATGAAGTGTTTTCCAGTGGGCTATTCCTTCTTGAGATAACTGGCCACTGGGAATTTGCAAATTATGCTGCTTCTCCAGCCCTTGCTACACTCACACAACATAAAGATGACAGTGAGACCACAAAAACACTTGCAATTAGTGCTGATGGTGCTAATGAACCAGTTGAGATGCTAATACCTGTGAATGAATGGAATATGAAGGCACAGTATGGAGGAAATGGCACACTTGGTGAAGCAATTTACCAAGTTGTTGATACCAGTGTTACAGTTGTAACAGACCTCTTTCCACCACCATTTTCATGGATTGGTAAAGCTTCATGGTGGTTTATCAGAAAAATGATTGGTAAGACAAAACAATTCCAGGTTGTTGTTAATGGTCAAAACCAAACTCTTACAGCAGACGTCTATCGTGTTTACACTTCAGCTTCTGCTGCTAGAGATGATAAACCAGCAATTTCCAGCAAGGCACATGAAGCTAAGCATCTGACTGGTGCAGTTGTTATCACACAAATTTCCACAGACAACATTCTTTCAGAAACCACATATACAGGCCCAAGATCCATTGTCACACCAGAAACTCCTATTGGCCCGTCTAGCTATCCAATGACACCAAGTTCTTTGGTGCTTATGGCTGGATATTTCAGTGGACCAGAAATTAGTGACAATTTTGGCAAGTACATGCCTTTGCTTTTCCAACAGAACACTTCTAAGGTTACATTTAGGAGTGGTAGTCATACCATAAAGATTGTAAGCATGGTTCTTGTTGACCGGCTTATGTGGTTGGATAAGCACTTTAACCAGTACACTAATGAACCAGATGGAGTTTTTGGTGACGTTGGCAATGTTTTTGTTGACAACGACAATGTTGCCAAGGTTATTACCATGAGTGGGTCATCGGCGCCAGCTAACAGAGGAGCCACCTTGATGCTATGTAAAGCCACAAAAAATATCCAGACTTTCAATTTTGCAGCAACAGTGTACATACCAGCTTATAAAGTAAAAGATGGTGCAGGTGGCAAAGATGTTGTTCTGAATGTGGCCCAGTGGGAAGCAAACAAGACTTTGACATACCCAGCTATACCTAAGGACACGTATTTTATGGTTGTAACAATGGGAGGTGCTAGCTTTACCATCCAAAGGTATGTGGTATACAATGAGGGAATTGGTGATGGCCTAGAATTACCAGCATTCTGGGGCAAATACTTATCCCAGCTATATGGTTTTAGTTGGAGTTCACCAACCTATGCATGTGTAACCTGGGAGCCCATCTATGCTGATGAGGGTATACCACATAGAAGTGCATTAGATGATGATGAAGTAAGCAGTGGTGGTGATACTGATTATGACACTGACACAGAAGACGAAGATGAGTTCTTCGGTGAGGATCCCATTGCTGCATTGCACGCTATTGATGAAAAGAGACCAGCTAGACGTGCAATGTTTGATGCACTTGTTAAAACTGGTGTCAGTGTTGAAGAAGCATCTAGATGTGTCCTTAGAGCATGTCCTACAAAACTTCAGGTTAAGAAAAGGAATCTTTATGAAAGCCTCCTGTGCGATGGCTTATCACCTGAGTCGTCGTACGAGGAAGCATGCAATTGTAAATAATCAATTAATTTCAATTGTAATTATAATTTGCTTTTTTTCTTCCAGCATAAATGTATGG
| 30,922
|
LC064152.1
|
Astrovirus MLB1
|
Sato,M., Kuroda,M., Kasai,M., Matsui,H., Fukuyama,T., Katano,H., Tanaka-Taya,K., Taya,K.
|
Pathogen Genomics Center; 1-23-1 Toyama, Shinjyuku-ku, Tokyo, Tokyo 162-8640
|
Japan
|
2016-03-09
| null |
Astrovirus MLB1
|
Mamastrovirus
|
Astroviridae
|
ssRNA(+)
| 6,181
|
GenBank
| 1
|
Japan: Nagano
|
Japan
|
Homo sapiens
| null |
2015-05-31
| null | null |
Astrovirus MLB1 genomic RNA, complete genome, strain: NAGANO1545
|
CCAAGAGTGGTGGTATGGCTGTGCCTTTCCATATTGGTGTGTCAGACAAAGTTATGAATCTGGGTTCAGCTCGCTCACGTGAGTGGCTTAATGAGCTACCCAGTACAACACTCAACCAGTTGCGTGACATCTTTCCATTTGAAGTCCCAATTAATACTATGATAGTACCTAAATCTAGATACCAATTGGGTACTGGTGTCACACTTGCAGTCCAAGGTATGGTTACATTGGGTTGCTACAGTACATATGCACTTGATGGTGAAACATGGATTGAAGTTGATGAAACTAGAATAGATCCAAAGTGTGCATATGTTGGGACTATGGCCCTAGATAGGGTGAAGCTCATGGATCGCAATAAAGAATTGCAGCTGGAAAACGCATCAATGAGTGTTGATTTACAACTGACCCGCCATGAATTGGAGAGGTGTAGGCCAGCCATCATTCGACCGCAAAGATATGGCAACTTTGCACTTTTTGTTCTTTTCTTTTTCCTTTTCTTTATTTTAGGAACAAAAGCTGAAGATTGGCATGATCAAACTCAGGACTATTTGGTTGAATTTTTGAAAGAAGCAAAACAGGAAATTGTATCCAATTTGGATACATACTATAGTCTTCTTTTACATGTAGTTAGGTGGGAGGTAGTTTCATGCATTATAGCAATTGTTTCTTTTTTCAAATTGAAGAGGCCCTGTGTTGCAATAATTGGTTTATTTTTAGCAACTATATCCAGATATAATTATGCAGCATTATCTATTGTACCATTTCTGGATGTCTACAGTACTGTTTTCTTGTATACCACCATGGTTGTATACTTTTTGGTGCCCCATGTGGCTATAATTACATCACTAGTTTGTGCACTACTGTTCACTATTGTAAGTATGGTATGTGCGCACCATCAATTCATCATACGTGTTCGTGGAGATTGGCTTGTTGTCTTAATCACCATTGCGACATATATTTGTGATGTTATGGGTATACATACTACAGCAATAGCTATTGCTGCATCGTTAGTGCGTATTTATATGTGCTTTCCTGCAGCTAATGCATCAGTGGTGGAAATTAAGGATAGTGCTGGCAAAGTAGTTCAGAAAACAACATTGCTACCCAACTGGATTGGCTCAATGTACCAAGGCGCCCGAAACATGTTGCAAAAAGTTAGAACTGGTGTTGCGACATTTGTTCGGGTTAACCCTAATTGTTTGTGCCATATTAGAAGTGAAGGTTGTAGTGGCACAGGCTTTAGGTTGGGTAATGATATAGTTACTGCCGCACATGTTGTAGGTAATGCTGTCCAGGTTGAGGTGGTATATAATAATTATGTTGCCCAAGCTAAAGTTAGACATATCCCTGATAAAGATATTGCTTACCTCATATTACCAGAGGGTCTCAAAACTATGCCTGTTTTAAAATTGGCAAAAAATCCAAATTATGAGCAGGTTACAATAATAGCACTTGAGGGCAATTGTATGCTTGTTTCCACTACAGAGGGTGTATGCCATGGTGAAACCATTTCATATGCCTGTGCTACCAGAGATGGTATGAGTGGTGCTCCTGTTCTTGATGTTAATGGAAATGTTCTTGGTGTTCATCAAACGAATACTGGATATACAGGTGGTGCGACAGTGATCAGAGCCACTGATGCTGCACCATATATTGATGAGAATGCTGCACTTAAGAAAGAAATAGAAGAATTAAAGAAGATGTTACGTGAACAGACAATGAATCAGAGATCTGTTCAAGATAATGAGGTTGTAGGCATAGTTCGTGCAGCTGTCCAAAGAGAGATTGGAATATTACGTGATGAACTTAACTCATGTTATCAAAAGAAAAAAGGAAAAAATAAGAAAGGACGTGGTGCACGACATCGTATGCTGCGCCGTGGACAAAAATTTTTGACAGAAGAGGAGTACCAAGAACTGTTGGATAAGGGTCTGACTAGGGAACAGTTGCTTGATGCAATTGAGGAAATTGTTAGAGCACGTATTGGATTCCCTGACTGGTCAGACCCTGAATATTCATCTGAAGAAGATGATGCAGCAGTTACATATTGGTGGGAACAAGTAAAAGAGAGTGATTATAAAGATGGAGTGCCCCAATTTGAACATATTGTACCCAAATATTCTCCAAATGAAAGAGTATTTTCTGAACAAGAGCGTAAAGATGTTAGTGAAGAATTGTCTGCTCTACAATCCATAGTAGATGGAGTGAAGAAAGAAGATTGGGAAGAAACCAAAAAGCAGACTACTGACGCTCTTAATCATGCACTATACGTTGTTGATAAAGCTCTTGCACAACATGGTTATATACTTTTTGAACAACGTATGCGGCCAAAAAACGGAAAAAGGGGTCCTCGGAGGAGGACCCCAAACACTACCTAGATACATGGATTGGGATGCTAAGTCCTTGCGTTCGTTGGCTGGTTCCAGAACGCTTTCCTTTGTATGGTGGTGTACCTTTAGATAGGCCAGTGTATGATTTTAAAGTTGTTAATGAAGATTTGTTAGGGTTACTCCCACCCCCACCTAATAATGATTTTGAGGTTTTTGGCCCCACTGTATGGGATGAGATTGCATATAAGAAATCATTTGAAAAGTTTGAATATGCTGATTATGTTGATTTTGAACAGATGTATCCTGAGTGTGTTGCTTTTGCTGATAAAAAATTTTTGGAACATTTTAATTTTTTGTCTGATTCCTCTTTTGTAAATATTTTAGCAACTGATAAAAATGTTGATTCCACACCCGCATATCCAAAGATGCGGTGGTGGCTTACTGAGAGTGATTATCTTGAGGAGTGTGGATGGGAATATTATGTCAAGGAGTTTGAAAACATCGCTTCTGGTCAAAATCCAGATGTTTGTTGGTATTTATTCCTCAAGAAAGAAATTATTAAACAACAAAAAATTGATGAAGGAGATGTCAGACAAATAGTATGTGCTGACCCAATATATTCCAGAATTGGGGCTTGTTTTGAGCAACACCAAAATGCCATGATGAAGGACCACACTCTCTTATCATCAGGACAGTGTGGTTGGTCCCCTTTCTTTGGTGGTTATGAGGCAAGAATGTCCAGGCTGCGCTCCAAAGGGAATAAAATCTTTGTTGAGCTTGATTGGACTCGGTTTGATGGTACAATACCACCAACCCTGTTGATGCATATAAAGAAATTAAGGTTTACCTTAATGGGTTCCATGTCCCGCAAGTATGAAAATGTATACAAGTGGTACTGCAGGAATCTAATCAACAGGTTTGTTGTTCTGCCTTCAGGTGAAGTTACAGCACAACAGCGTGGAAATCCATCAGGCCAGATATCTACCACCATGGACAATAACATGATCAACTATTGGTTGCAGGCATTTGAATATAAATTTTTGAACCTACCAGAAGAAGAGTGGATGCATTTTGATACCTTGATCTATGGAGATGACAGAATATCCACATATCGAAGCATCCCTAATGAATACACCAAGTTAATAGTTGACATGTATAAAAATGTTTTTGGAATGTGGGTTAAGCCAGAAAAGGTTAAAGTTTCAGATTCCTTGGAGGGACTCTCATTCTGTGGTTTTACTTATACATCAAATGGCCCAGTTCCAAGTGAGCCTTACAAACTTATGGCCTCATTGTTGAAACCTGCTACAAAATTACCTGATCTAATAGCTCTTCATGGGAAACTTTTGTGCTTCCAGTTGTTGATGGCAAATGATACTGCACACCCATTTTATGGGTATATTGAACAGTGTTTGCAGTATACACACCGTGCCCTCAGTGATGTTAGCTTACCAAGGCGCTTCACTCGAAGGCAGCTGGAGTACATTTGGAGGGGTGGACCAAATGATGACTATGGCTAATGCCAGTAAAGGTGTTACAGTTAACATCAACAATGCAAAACGGAAGCCTCGCTTCACCAATAACCAGCGAGCTAGACCTACTAGGCCAAATTTTACACCAGCACCCAAATTTAGGAAACGTCGGTATATTCCTAATAGGAATCGCCGTCGTAGGCAAAATACTAGTACAACTGGGCCTAAACCTGCGGTGTCGCAGACAATTACAGCAACACTCGGCACCGTTGGATCAAATTTAAGTGATGTTGTTGAAACTGAATGTGCAGTCTTTTTGAATCCCATTATAGCAAAAGATTCTGGTGCCAGTGCAACCTTTGGGCCCCTTCAATCTTTGGGTGCACAGTATGCATTATGGAGGCTCAAGTGGTTGGAAGTCAGACTCCAGCCTTTGGTGGGTAACTCAGCTGTGAGTGGTACTGTAGCTCGTGTTAGTCTTAACATGACTACTGGCCCCACCCTCAACTCATGGTCTGGTCTTGGAGCCCGAATTCACAAGGATGTTAGGGTTGGTTCAAACCTTGTTTGGCGCATTAAACAGCGTCTAGTGAGTGGACCTTGTGAAACTTGGTGGAAAACCAATACAGCTGAGGACCCATCATTATCTCTTGGACCTGCACTGGAAGTACACACCATAGGTAAGACCATGAGTACTTATAAAAATGAAGTGTTTTCCAGTGGACTATTTCTTCTTGAGATAACCGGCCACTGGGAATTTGCAAATTATGCTGCTTCCCCAGCTCTTGCTACACTTACACAACATAAAGATGACAGTGAAACCACAAAAACACTTGCAATTAGCTCTGATGGTGCCAATGAACCAGTTGAGATGCTAATACCTGTGAATGAATGGAATATGAAAGCACAGTATGGAGGAAATGGCACACTTGGTGAGGCAATTTACCAAGTTGTCGATACTAGTGTCACAGTCGTGACAGACCTCTTTCCACCACCATTTTCATGGATTGGTAAAGCTTCATGGTGGTTTATCAGGAAAATGATTGGTAAAACAAAACAATTCCAGGTTGTTGTTAATGGTCAAAACCAAACTCTCACAGCGGATGTCTATCGTGTTTACACTTCAGCTTCTGCTGCTAGAGATGATAAACCAGCAATTTCCAGCAAGGCACATGAAGCTAAGCATCTGACTGGTGCAGTTGTTATCACACAAATTTCTACAGACAACATTCTTTCAGAAACCACATATACTGGCCCAAGATCCATTGTCACACCAGAAACTCCTATTGGCCCGTCTAGCTATCCAATGACACCAAGTTCTTTGGTGCTGATGGCTGGATATTTCAGTGGACCAGAAATCAGTGATAATTTTGGTAAATACATGCCTTTGCTTTTCCAACAGAACACTTCTAAGGTTACATTTAGGAGTGGTAGTCATACTATAAAGATTGTAAGTATGGTTCTTGTTGACCGGCTTATGTGGTTGGATAAGCATTTTAACCAGTACACTAATGAACCAGATGGAGTTTTTGGAGACGTTGGCAATGTCTTTGTTGACAATGATAATGTTGCCAAGGTCATTACTATGAGTGGGTCATCAGCACCAGCTAATAGAGGTGCCACTTTGATGTTATGCAAAGCCACAAAAAATATCCAGACTTTTAACTTTGCAGCAACAGTATATATACCAGCTTATAAAGTCAAAGATGGTGCAGGTGGTAAGGATGTTGTTCTGAATGTGACCCAGTGGGAAGCAAACAAGACTTTGGCATATCCAGCTATACCTAAGGACACATACTTCATGGTTGTAACAATGGGAGGTGCTAGCTTTACCATCCAAAGGTATGTGGTATATAATGAGGGCATTGGTGATGGTCTGGAATTACCAGCATTCTGGGGTAAATACTTATCCCAGTTGTATGGTTTTAGTTGGAGTTCACCAACCTATGCATGTGTAACCTGGGAACCTATCTATGCTGATGAGGGTATACCACATAGAAGTGCACTAAATGATGATGAAATAAGCAGTGATGGTGATACTGATTATGACACTGACACAGAAGACGAAGATGAGTTCTTCGGTGAAGACCCCATTGCTGCATTGCACGCCCTTGATGAAAAGAGACCAGCTAGACGTGCAATGTTTGATGCACTTGTTAAAACTGGTGTCAGTGTTGAAGAGGCATCTAGATGTGTCCTTAGAGCATGTCCTACAAAACTTCAGATGAAGAAAAGGAATCTTTATGAAAGCCTCCTGTGCGATGGCTTATCACCTGAGTCGTCGTACGAGGAAGCATACAATTGTGAATAATCAATTAATTTCAATTGTAATTATAATTTGCTTTTTTTCTTCCAGCATAAATGTATGACAGGCTCTAA
| 83,471
|
AB823731.1
|
Astrovirus MLB1
|
Matsumoto,T., Wangchuk,S., Tshering,K., Yahiro,T., Zangmo,S., Dorji,T., Mitui,M.T., Nishizono,A., Ahmed,K.
|
Research Promotion Institute; 1-1 Hasama, Yufu, Oita 879-5593
|
Japan
|
2013-06-15
|
BtnMLB1-40
|
Astrovirus MLB1
|
Mamastrovirus
|
Astroviridae
|
ssRNA(+)
| 6,201
|
GenBank
| 1
|
Bhutan
|
Bhutan
|
Homo sapiens
|
feces
|
2010-03-03
| null | null |
Astrovirus MLB1 genomic RNA, complete genome, isolate: BtnMLB1-40
|
CCAAGAGTGGTGGTATGGCTGTGCCTTTCCATATTGGTGTGTCAGACAAAGTTATGAATCTGGGTTCAGCTCGCTCACGTGAGTGGCTTAATGAGCTACCCAGTACAACACTCAACCAGCTGCGTGACATTTTTCCATTTGAAGTCCCAATTAATACTATGATAGTACCCAAGTCTAGATATCAATTGGGTACTGGTGTCACACTTGCAGTCCAAGGTATGGTTACATTGGGTTGCTACAGTACATATGCACTTGATGGTGAAGCATGGATTGAAGTTGATGAAACTAGAATAGATCCAAAGTGTGCATATGTTGGGACCATGGCCCTAGATAGGGTAAAGCTCATGGATCGCAATAAAGAACTGCAGCTGGAAAATGCATCAATGAGTGTTGATTTACAACTGACTCGCCATGAATTGGAGAGGTGTAGGCCAGCCATCATTCGACCGCAAAGATATGGTAACTTTGCACTTTTTGTTCTTTTCTTTTTTCTTTTCTTTATTTTAGGAACAAAGGCTGAAGATTGGCATGATCAGACTCAGGATTATTTGGTTGAATTTCTGAAAGAAGCAAAACAGGAAATTGTATCTAATTTGGATACATATTATAGTCTCCTTTTACATGTAGTTAGGTGGGAGGTAGTTTCATGCATTATAGCAATTGTTTCTTTTTTCAAATTAAAGAGGCCCTGTGTTGCAATAATTGGTTTATTTTTAGCAACCATATCCAGATATAATTATGCAGCATTATCTATTGTACCATTTCTGGACGTTTACAGCACTGTTTTCCTGTATACCACCATGGTTGTGTACTTTTTGGTGCCCCATGTAGCTATAATTACATCATTAGTTTGTGCACTATTGTTTACTATTGTAAGTATGGTATGTGCGCACCACCAATTCATTATACGTGTTCGTGGAGATTGGCTTGTTGTCTTAATCACCATTGCAACGTATATTTGTGATGTTATGGGTATACATACTACAGCAATAGCCATTGCTGCATCGTTAGTGCGTATTTATATGTGCTTTCCTGCAGCTAATGCATCAGTGGTGGAAATCAAGGACAGTGCTGGTAAAGTAGTTCAGAAAACAACATTGTTACCCAACTGGATCGGCTCAATGTACCAGGGTGCCCGAAAAATGTTGCAAAAAGTTAGAACTGGTGTTGCGACATTTGTCCGGGTTAACCCTAATTGCTTGTGCCATATTAGAAGTGAAGGCTGTAGTGGCACAGGCTTCAGGTTGGGTAATGATATAGTTACTGCCGCACATGTTGTAGGCAATGCTGTCCAGGTTGAGGTGGTATATAATAATTATGTTGCCCAAGCTAAAGTTAGACATATCCCTGATAAAGATATTGCATATCTCATATTACCAGAGGGTCTCAAAACTATGCCTGTTTTAAAATTGGCAAAAAATCCAAATTATGAGCAGGTCACAATAATAGCACTTGAGGGCAATTGTATGCTTGTTTCCACTACAGAAGGTGTATGTCATGGTGAAACTATTTCATATGCCTGTGCTACCAGAGATGGTATGAGTGGTGCTCCTGTTCTTGATGTTAATGGAAATGTTCTTGGTGTTCATCAAACATATACTGGATACACAGGTGGTGCGACAGTGATTAGAGCCACTGACGCTGCACCATATATTGATGAGAATGCGGCACTAAAAAAAGAAATTGAAGAATTAAAGAAGATGCTGCGCGAACAAACAATGAATCAGAGATCTGTTCAAGATAATGAGGTTGTGGGTATAGTTCGTGCAGCTGTCCAAAGAGAAATTGGAATATTACGTGATGAACTTAATTCATGTTATCAAAAAAAGAAAGGAAAAAATAAGAAAGGCCGTGGTGCACGACATTGTATGCTGCGCCGTGGGCAAAAATTTCTAACAGAAGAGGAGTACCAAGAACTGTTGGATAAGGGTCTGACTAGAGAACAGTTGCTTGATGCAATTGAGGAAATTGTTAGGGCACGTATCGGATTCCCTGATTGGTCAGACCCTGAATATTCATCTGAAGAGGATGATGCAGCAGTTACATATTGGTGGGAACAAGTAAAAGAGAGTGATTATAAAGATGGAGTACCCCAGTTTGAACACATTGTACCCAAATATTCTCCAAATGAAAGAGTATTTTCTGAACAAGAGCGTAAAGATGTTAGTGAAGAGTTGTCTGCTCTGCAATCCATAGTAGATGGAGTGAAGAAAGAAGATTGGGAAGAAACTAAAAAGCAGACTACTGACGCTCTTAATCATGCACTATACGTTGTTGATAAGGCTCTTGCACAACATGGTTATATACTTTTTGAACAACGTATGCGGCCAAAAAACGGAAAAAGGGGTCCTCGGAGGAGGACCCCAAACACTACCTAGATACATGGATTGGGATGCTTAGTCCTTGCGTTCGTTGGCTGGTCCCAGAACGCTTTCCTTTGTACGGTGGTGTACCTTTAGATAGGCCAGTGTATGATTTTAAAGTTGTTAATGAAGATCTATTGGGGTTGCTCCCACCCCCACCTAATAATGATTTTGAGGTTTTTGGTCCTACTGTATGGGATGAGATTGCATATAAGAAATCATTTGAAAAGTTTGAATATGCTGATTATGTTGATTTTGAACAGATATATCCTGAGTGTGTTGCTTTTGCTGATAAGAAATTTTTGGAACATTTTAATTTTTTGTCTGATTCTTCTTTTGTAAATATTTTAGCAACTGATAAAAATGTTGATTCCACACCCGCATACCCAAAGATGCGGTGGTGGCTTACTGAGAGTGACTATCTTGAGGAATGTGGATGGGAATATTATGTTAAGGAGTTTGAAAACATCGCCTCTGGTCAAAATCCAGATGTTTGTTGGTACTTGTTCCTCAAGAAAGAAATTATTAAACAACAAAAAATTGATGAAGGAGATGTCAGACAAATAGTATGTGCTGACCCAATATATTCCAGAATTGGGGCTTGTTTTGAGCAACACCAAAATGCCATGATGAAGGACCACACTCTTTTATCATCTGGACAGTGTGGTTGGTCCCCTTTTTTTGGTGGTTATGAGGCAAGAATGTCCAGGCTGCGCTCCAAAGGGAACAAAATCTTTGTTGAGCTTGATTGGACTCGATTTGATGGTACAATACCACCAACCTTGTTGATGCACATAAAGAAATTAAGGTTTACCTTAATGGGTTCCATGTCCCGCAAGTATGAAAATGTATACAAGTGGTATTGTAGGAACCTAATCAACAGGTTTGTTGTGCTGCCTTCAGGCGAAGTTACAGCACAACAGCGTGGAAATCCATCGGGTCAGATATCAACCACCATGGATAATAACATGATCAACTATTGGTTGCAGGCATTTGAATATAAATTTTTGAATTTACCAGAAGAAGAGTGGATGCATTTTGATACTTTAATCTATGGAGATGATAGGATATCTACATATCGAAGCATCCCTAATGAATACACCAAGATAATAGTTGACATGTATAAAAATGTTTTTGGAATGTGGGTTAAGCCAGAAAAGGTCAAAGTCTCAGAGTCTTTGGAGGGACTCTCATTCTGTGGTTTTACTTATACACCAAATGGCCCAGTTCCAAGTGAGCCTTACAAACTTATGGCCTCATTGTTGAAACCTGCTACAAAATTACCTGATTTAATAGCTCTTCATGGGAAACTTTTGTGCTTCCAGTTGTTGATGGCAAATGATACTGCACACCCATTTTATGGGTATATTGAACAGTGTTTGCAGTATACACACCGTGCCCTCAGTGATGTTAGCTTGCCAAGGCGCTTCACTCGAAGGCAGCTGGAGTACATTTGGAGGGGTGGACCAAATGACGACTATGGCTAATGCCAGTAAAGGTGTTACAGTTAACATCAACAATGCAAAACGGAAGCCTCGCTTCACCAATAACCAGCGAGCTAGATCTACTAGGCCAAATTTTACACCAGCACCCAAATTTAGGAAACGTCGGTTTATTCCTAATAGGAATCGCCGTCGTAGGCAAAATACTAGTACAACTGGGCCTAAACCTGCGGTGTCGCAGACAATTACAGCAACACTCGGCACCGTTGGATCAAATTTGAGTGATGTTGTTGAAACTGAATGTGCAGTCTTTTTGAACCCCATTATAGCAAAAGACTCTGGTGCCAGTGCAACTTTTGGGCCCCTTCAATCCTTGGGTGCACAGTATGCATTATGGAGGCTCAAGTGGCTAGAAGTCAGACTTCAGCCTTTGGTGGGCAACTCAGCTGTGAGTGGTACTGTAGCTCGTGTTAGTCTTAACATGACTACTGGTCCCACTCTCAATTCATGGTCTGGTCTTGGAGCCCGAATTCACAAGGATGTTAGAGTTGGTTCAAATCTTGTTTGGCGCATTAAACAGCGTCTAGTGAGTGGACCTTGTGAAACTTGGTGGAAAACCAATACAGCTGAGGACCCATCATTATCTCTTGGACCTGCACTGGAAGTACATACCATAGGTAAGACTATGAGCACTTATAAAAATGAAGTGTTTTCCAGTGGACTATTCCTTCTTGAGATAACTGGCCACTGGGAATTTGCAAATTATGCTGCTTCTCCAGCCCTTGCTACACTCACACAACACAAAGATGACAGTGAGACCACAAAAACACTTGCAATTAGTTCTGATGGTGCTAATGAACCAGTTGAGATGTTAATACCTGTGAATGAATGGAATATGAAGGCACAGTATGGAGGAAATGGCACACTTGGTGAAGCGATTTACCAAGTTGTTGATACTAGTGTTACAGTTGTAACAGACCTCTTTCCACCACCATTTTCATGGATTGGTAAAGCTTCATGGTGGTTTATCAGAAAAATGATTGGTAAAACAAAACAATTCCAGGTTGTTGTTAATGGCCAAAACCAAACTCTTACAGCAGACGTCTATCGTGTTTACACTTCAGCTTCTGCTGCTAGAGATGATAAACCAGCAATTTCCAGCAAGGCACATGAGGCTAAGCACTTAACTGGTGCAGTTGTTATCACGCAAATTTCCACAGACAACATTCTTTCAGAAACCACATATACTGGCCCAAGATCCATTGTCACACCAGAAACTCCTATTGGCCCATCTAGCTATCCAATGACACCAAGTTCTTTGGTGCTGATGGCTGGATATTTCAGTGGACCAGAAATTAGTGATAATTTTGGCAAGTACATGCCTTTGCTTTTCCAACAGAACACTTCTAAGGTCACATTTAGGAGTGGTAGTCATACCATAAAGATTGTAAGCATGGTTCTTGTTGACCGGCTTATGTGGTTGGATAAGCACTTTAACCAGTACACTAATGAACCAGATGGAGTTTTTGGTGATGTTGGCAATGTTTTTGTTGACAGCGATAATGTTGCCAAGGTTATTACTATGAGTGGGTCATCGGCGCCAGCTAATAGAGGAGCCACTTTGATGCTATGCAAAGCCACAAAAAACATCCAGACTTTCAATTTTGCAGCAACAGTGTACATACCAGTTTATAAAGTAAAAGATGGTGCAGGTGGCAAAGATGTTGTTCTGAATGTGGCCCAGTGGGAAGCAAACAAGACTTTGACATACCCAGCCATACCTAAGGACACGTACTTTATGGTTGTAACAATGGGAGGTGCTAGCTTTACCATCCAAAGGTATGTGGTATACAATGAGGGAATTGGTGACGGCCTAGAATTACCAGCATTCTGGGGCAAATACTTATCCCAGCTATATGGTTTTAGTTGGAGTTCACCAACCTATGCATGTGTAACCTGGGAGCCTATCTATGCTGATGAGGGTATACCACATAGAAGTGCATTAAATGATGATGAGGTAAGCAGTGATGGTGATACTGATGAAGACACTGACACAGAAGACGAAGACGAGTTCTTCGGCGAGGATCCCATGGCTGCATTGCACGCTCTTGATGAAAAGAGACCAGCTAGACGTGCAATGTTTGATGCACTTGTTAAAACTGGTGTCAGTGTTGAAGAAGCATCTAGATGTGTCCTTAGAGCATGTCCTACAAAACTTCAGATTAAGAAAAGGAATCTTTATGAAAGCCTCCTGTGCGATGGCTTATCACCTGAGTCGTCGTACGAGGAAGCATACAATTGTAAATAATCAATTAGTTTCAATTGTAATTATAATTTGCTTTTTTTCTTCCAGCATAAATGTATGGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA
| 93,919
|
AB823732.1
|
Astrovirus MLB1
|
Matsumoto,T., Wangchuk,S., Tshering,K., Yahiro,T., Zangmo,S., Dorji,T., Mitui,M.T., Nishizono,A., Ahmed,K.
|
Research Promotion Institute; 1-1 Hasama, Yufu, Oita 879-5593
|
Japan
|
2013-06-15
|
BtnMLB1-86
|
Astrovirus MLB1
|
Mamastrovirus
|
Astroviridae
|
ssRNA(+)
| 6,201
|
GenBank
| 1
|
Bhutan
|
Bhutan
|
Homo sapiens
|
feces
|
2010-05-22
| null | null |
Astrovirus MLB1 genomic RNA, complete genome, isolate: BtnMLB1-86
|
CCAAGAGTGGTGGTATGGCTGTGCCTTTCCATATTGGTGTGTCAGACAAAGTTATGAATCTGGGTTCAGCTCGCTCACGTGAGTGGCTTAATGAGCTACCCAGTACAACACTCAACCAGCTGCGTGACATTTTTCCATTTGAAGTCCCAATTAATACTATGATAGTACCCAAGTCTAGATATCAATTGGGTACTGGTGTCACACTTGCAGTCCAAGGTATGGTTACATTGGGTTGCTACAGTACATATGCACTTGATGGTGAAGCATGGATTGAAGTTGATGAAACTAGAATAGATCCAAAGTGTGCATATGTTGGGACCATGGCCCTAGATAGGGTAAAGCTCATGGATCGCAATAAAGAACTGCAGCTGGAAAATGCATCAATGAGTGTTGATTTACAACTGACTCGCCATGAATTGGAGAGGTGTAGGCCAGCCATCATTCGACCGCAAAGATATGGTAACTTTGCACTTTTTGTTCTTTTCTTTTTTCTTTTCTTTATTTTAGGAACAAAGGCTGAAGATTGGCATGATCAGACTCAGGATTATTTGGTTGAATTTCTGAAAGAAGCAAAACAGGAAATTGTATCTAATTTGGATACATATTATAGTCTCCTTTTACATGTAGTTAGGTGGGAGGTAGTTTCATGCATTATAGCAATTGTTTCTTTTTTCAAATTAAAGAGGCCCTGTGTTGCAATAATTGGTTTATTTTTAGCAACCATATCCAGATATAATTATGCAGCATTATCTATTGTACCATTTCTGGACGTTTACAGCACTGTTTTCCTGTATACCACCATGGTCGTGTACTTTTTGGTGCCCCATGTAGCTATAATTACATCACTAGTTTGTGCACTATTGTTTACTATTGTAAGTATGGTATGTGCGCACCACCAATTCATTATACGTGTTCGTGGAGATTGGCTTGTTGTCTTAATCACCATTGCAACGTATATTTGTGATGTTATGGGTATACATACTACAGCAATAGCCATTGCTGCATCGTTAGTGCGTATTTATATGTGCTTTCCTGCAGCTAATGCATCAGTGGTGGAAATCAAGGACAGTGCTGGTAAAGTAGTTCAGAAAACAACATTGTTACCCAACTGGATCGGCTCAATGTACCAGGGTGCCCGAAAAATGTTGCAAAAAGTTAGAACTGGTGTTGCGACATTTGTCCGGGTTAACCCTAATTGCTTGTGCCATATTAGAAGTGAAGGCTGTAGTGGCACAGGCTTCAGGTTGGGTAATGATATAGTTACTGCCGCACATGTTGTAGGCAATGCTGTCCAGGTTGAGGTGGTATATAATAATTATGTTGCCCAAGCTAAAGTTAGACATATCCCTGATAAAGATATTGCATATCTCATATTACCAGAGGGTCTCAAAACTATGCCTGTTTTAAAATTGGCAAAAAATCCAAATTATGAGCAGGTCACAATAATAGCACTTGAGGGCAATTGTATGCTTGTTTCCACTACAGAAGGTGTATGTCATGGTGAAACTATTTCATATGCCTGTGCTACCAGAGATGGTATGAGTGGTGCTCCTGTTCTTGATGTTAATGGAAATGTTCTTGGTGTTCATCAAACATATACTGGATACACAGGTGGTGCGACAGTGATTAGAGCCACTGACGCTGCACCATATATTGATGAGAATGCGGCACTAAAAAAAGAAATTGAAGAATTAAAGAAGATGCTGCGCGAACAAACAATGAATCAGAGATCTGTTCAAGATAATGAGGTTGTAGGTATAGTTCGTGCAGCTGTCCAAAGAGAAATTGGAATATTACGTGATGAACTTAATTCATGTTATCAAAAAAAGAAAGGAAAAAATAAGAAAGGCCGTGGTGCACGACATCGTATGCTGCGCCGTGGGCAAAAATTTCTAACAGAAGAGGAGTACCAAGAACTGTTGGATAAGGGTCTGACTAGAGAACAGTTGCTTGATGCAATTGAGGAAATTGTTAGGGCACGTATCGGATTCCCTGATTGGTCAGACCCTGAATATTCATCTGAAGAGGATGATGCAGCAGTTACATATTGGTGGGAACAAGTAAAAGAGAGTGATTATAAAGATGGAGTACCCCAGTTTGAACACATTGTACCCAAATATTCTCCAAATGAAAGAGTATTTTCTGAACAAGAGCGTAAAGATGTTAGTGAAGAGTTGTCTGCTCTGCAATCCATAGTAGATGGAGTGAAGAAAGAAGATTGGGAAGAAACTAAAAAGCAGACTACTGACGCTCTTAATCATGCACTATACGTTGTTGATAAGGCTCTTGCACAACATGGTTATATACTTTTTGAACAACGTATGCGGCCAAAAAACGGAAAAAGGGGTCCTCGGAGGAGGACCCCAAACACTACCTAGATACATGGATTGGGATGCTTAGTCCTTGCGTTCGTTGGCTGGTCCCAGAACGCTTTCCTTTGTACGGTGGTGTACCTTTAGATAGGCCAGTGTATGATTTTAAAGTTGTTAATGAAGATCTATTGGGGTTGCTCCCACCCCCACCTAATAATGATTTTGAGGTTTTTGGTCCTACTGTATGGGATGAGATTGCATATAAGAAATCATTTGAAAAGTTTGAATATGCTGATTATGTTGATTTTGAACAGATATATCCTGAGTGTGTTGCTTTTGCTGATAAGAAATTTTTGGAACATTTTAATTTTTTGTCTGATTCTTCTTTTGTAAATATTTTAGCAACTGATAAAAATGTTGATTCCACACCCGCATACCCAAAGATGCGGTGGTGGCTTACTGAGAGTGACTATCTTGAGGAATGTGGATGGGAATATTATGTTAAGGAGTTTGAAAACATCGCCTCTGGTCAAAATCCAGATGTTTGTTGGTACTTGTTCCTCAAGAAAGAAATTATTAAACAACAAAAAATTGATGAAGGAGATGTCAGACAAATAGTATGTGCTGACCCAATATATTCCAGAATTGGGGCTTGTTTTGAGCAACACCAAAATGCCATGATGAAGGACCACACTCTTTTATCATCTGGACAGTGTGGTTGGTCCCCTTTTTTTGGTGGTTATGAGGCAAGAATGTCCAGGCTGCGCTCCAAAGGGAACAAAATCTTTGTTGAGCTTGATTGGACTCGATTTGATGGTACAATACCACCAACCTTGTTGATGCACATAAAGAAATTAAGGTTTACCTTAATGGGTTCCATGTCCCGCAAGTATGAAAATGTATACAAGTGGTATTGTAGGAACCTAATCAACAGGTTTGTTGTGCTGCCTTCAGGTGAAGTTACAGCACAACAGCGTGGAAATCCATCGGGTCAGATATCAACCACCATGGATAATAACATGATCAACTATTGGTTGCAGGCATTTGAATATAAATTTTTGAATTTACCAGAAGAAGAGTGGATGCATTTTGATACTTTAATCTATGGAGATGATAGGATATCTACATATCGAAGCATCCCTAATGAATACACCAAGATAATAGTTGACATGTATAAAAATGTTTTTGGAATGTGGGTTAAGCCAGAAAAGGTCAAAGTCTCAGAGTCTTTGGAGGGACTCTCATTCTGTGGTTTTACTTATACACCAAATGGCCCAGTTCCAAGTGAGCCTTACAAACTTATGGCCTCATTGTTGAAACCTGCTACAAAATTACCTGATTTAATAGCTCTTCATGGGAAACTTTTGTGCTTCCAGTTGTTGATGGCAAATGATACTGCACACCCATTTTATGGGTATATTGAACAGTGTTTGCAGTATACACACCGTGCCCTCAGTGATGTTAGCTTGCCAAGGCGCTTCACTCGAAGGCAGCTGGAGTACATTTGGAGGGGTGGACCAAATGACGACTATGGCTAATGCCAGTAAAGGTGTTACAGTTAACATCAACAATGCAAAACGGAAGCCTCGCTTCACCAATAACCAGCGAGCTAGATCTACTAGGCCAAATTTTACACCAGCACCCAAATTTAGGAAACGTCGGTTTATTCCTAATAGGAATCGCCGTCGTAGGCAAAATACTAGTACAACTGGGCCTAAACCTGCGGTGTCGCAGACAATTACAGCAACACTCGGCACCGTTGGATCAAATTTGAGTGATGTTGTTGAAACTGAATGTGCAGTCTTTTTGAACCCCATTATAGCAAAAGACTCTGGTGCTAGTGCAACTTTTGGGCCCCTTCAATCCTTGGGTGCACAGTATGCATTATGGAGGCTCAAGTGGCTAGAAGTCAGACTTCAGCCTTTGGTGGGCAACTCAGCTGTGAGTGGTACTGTAGCTCGTGTTAGTCTTAACATGACTACTGGTCCCACTCTCAATTCATGGTCTGGTCTTGGAGCCCGAATTCACAAGGATGTTAGAGTTGGTTCAAATCTTGTTTGGCGCATTAAACAGCGTCTAGTGAGTGGACCTTGTGAAACTTGGTGGAAAACCAATACAGCTGAGGACCCATCATTATCTCTTGGACCTGCACTGGAAGTACATACCATAGGTAAGACTATGAGCACTTATAAAAATGAAGTGTTTTCCAGTGGACTATTCCTTCTTGAGATAACTGGCCACTGGGAATTTGCAAATTATGCTGCTTCTCCAGCCCTTGCTACACTCACACAACACAAAGATGACAGTGAGACCACAAAAACACTTGCAATTAGTTCTGATGGTGCTAATGAACCAGTTGAGATGTTAATACCTGTGAATGAATGGAATATGAAGGCACAGTATGGAGGAAATGGCACACTTGGTGAAGCGATTTACCAAGTTGTTGATACTAGTGTTACAGTTGTAACAGACCTCTTTCCACCACCATTTTCATGGATTGGTAAAGCTTCATGGTGGTTTATCAGAAAAATGATTGGTAAAACAAAACAATTCCAGGTTGTTGTTAATGGCCAAAACCAAACTCTTACAGCAGACGTCTATCGTGTTTACACTTCAGCTTCTGCTGCTAGAGATGATAAACCAGCAATTTCCAGCAAGGCACATGAGGCTAAGCACTTAACTGGTGCAGTTGTTATCACGCAAATTTCCACAGACAACATTCTTTCAGAAACCACATATACTGGCCCAAGATCCATTGTCACACCAGAAACTCCTATTGGCCCATCTAGCTATCCAATGACACCAAGTTCTTTGGTGCTGATGGCTGGATATTTCAGTGGACCAGAAATTAGTGATAATTTTGGCAAGTACATGCCTTTGCTTTTCCAACAGAACACTTCTAAGGTCACATTTAGGAGTGGTAGTCATACCATAAAGATTGTAAGCATGGTTCTTGTTGACCGGCTTATGTGGTTGGATAAGCACTTTAACCAGTACACTAATGAACCAGATGGAGTTTTTGGTGATGTTGGCAATGTTTTTGTTGACAGCGATAATGTTGCCAAGGTTATTACTATGAGTGGGTCATCGGCGCCAGCTAATAGAGGAGCCACTTTGATGCTATGCAAAGCCACAAAAAACATCCAGACTTTCAATTTTGCAGCAACAGTGTACATACCAGCTTATAAAGTAAAAGATGGTGCAGGTGGCAAAGATGTTGTTCTGAATGTGGCCCAGTGGGAAGCAAACAAGACTTTGACATACCCAGCCATACCTAAGGACACGTACTTTATGGTTGTAACAATGGGAGGTGCTAGCTTTACCATCCAAAGGTATGTGGTATACAATGAGGGAATTGGTGACGGCCTAGAATTACCAGCATTCTGGGGCAAATACTTATCCCAGCTATATGGTTTTAGTTGGAGTTCACCAACCTATGCATGTGTAACCTGGGAGCCTATCTATGCTGATGAGGGTATACCACATAGAAGTGCATTAAATGATGATGAGGTAAGCAGTGATGGTGATACTGATGAAGACACTGACACAGAAGACGAAGACGAGTTCTTCGGCGAGGATCCCATGGCTGCATTGCACGCTCTTGATGAAAAGAGACCAGCTAGACGTGCAATGTTTGATGCACTTGTTAAAACTGGTGTCAGTGTTGAAGAAGCATCTAGATGTGTCCTTAGAGCATGTCCTACAAAACTTCAGATTAAGAAAAGGAATCTTTATGAAAGCCTCCTGTGCGATGGCTTATCACCTGAGTCGTCGTACGAGGAAGCATACAATTGTAAATAATCAATTAGTTTCAATTGTAATTATAATTTGCTTTTTTTCTTCCAGCATAAATGTATGGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA
| 93,920
|
JQ086552.1
|
Astrovirus MLB1
|
Wang,Z.
|
Liaoning Center For Disease Control and Prevention, Arbovirus Laboratory
| null |
2012-03-20
|
SY071
|
Astrovirus MLB1
|
Mamastrovirus
|
Astroviridae
|
ssRNA(+)
| 6,171
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Homo sapiens
|
feces
|
2010
| null | null |
Astrovirus MLB1 isolate SY071, complete genome
|
CCAAGAGTGGTGGTATGGCTGTGCCTTTCCATATTGGTGTGTCAGACAAAGTTATGAATCTGGGTTCAGCTCGCTCACGTGAGTGGCTTAATGAGCTACCCAGTACAACACTCAACCAGCTGCGTGACATCTTTCCATTTGAAGTCCCAATTAATACTATGATAGTACCTAAATCTAGATATCAATTGGGTACTGGTGTTACACTTGCAGTCCAAGGTATGGTTACATTGGGTTGCTACAGTACATATGCACTTGATGGTGAAACATGGATTGAAGTTGATGAAACTAGAATAGATCCAAAGTGTGCATATGTTGGGACTATGGCCCTAGATAGGGTGAAGCTCATGGATCGCAATAAAGAATTGCAGCTGGAAAACGCATCAATGAGTGTTGATTTACAACTGACCCGCCATGAATTGGAGAGGTGTAGGCCAGCCATCATTCGACCGCAAAGATATGGCAACTTTGCACTTTTTGTTCTTTTCTTTTTCCTTTTCTTTATTTTAGGAACAAAAGCTGAAGATTGGCATGATCAGACTCAGGACTATTTGGTTGAATTTTTGAAAGAAGCAAAACAGGAAATTGTATGTAATTGGGATACATATAATAGTCTTCTCTCACATGTAGTTAGGGGGGAGGTAGTTTCATGCATTATAGCAATTGTTTTTTTTTTCAAATTGAAGAGGCCGTGTGTTGCAATAATTGGTTTATTTTTAGCAACTATATCCAGATACAATTATGCAGCATTGTCTATTGTACCATTTCTGGATGTCTACAGTACTGTTTTCTTGTATACCACCATGGTTGTATACTTTTTGGTGCCCCATGTGGCCATAATTACATCACTAGTTTGTGCACTACTGTTCACTATTGTAAGTATGGTATGTGCGCACCATCAATTCATCATACGTGTTCGTGGAGATTGGCTTGTTGTCTTAATCACCATTGCAACATATATTTGTGATGTTATGGGTATACATACTACAGCAATAGCTATTGCTGCATCGTTAGTGCGTATTTATATGTGCTTTCCTGCAGCTAATGCATCAGTGGTGGAAATTAAGGATAGTGCTGGCAAAGTAGTTCAGAAAACAACATTGTTACCCAACTGGATTGGCTCAATGTACCAAGGCGCCCGAAACATGTTGCAAAAAGTTAGAACTGGTGTTGCGACATTTGTTCGGGTTAACCCTAATTGCTTGTGCCATATTAGAAGTGAAGGTTGTAGTGGCACAGGCTTTAGGTTGGGTAATGATATAGTTACTGCCGCACATGTTGTAGGTAATGCTGTCCAGGTTGAGGTGGTATATAATAATTATGTTGCCCAAGCTAAAGTTAGACATATCCCTGATAAAGATATTGCTTATCTCATATTACCAGAGGGTCTCAAAACCATGCCTGTCTTAAAATTGGCAAAAAATCCAAATTACGAGCAGGTTACAATAATAGCACTTGAGGGCAATTGTATGCTTGTTTCCACTACAGAGGGTGTATGCCATGGTGAAACCATTTCATATGCCTGTGCTACCAGAGATGGTATGAGTGGTGCTCCTGTTCTTGATGTTAATGGAAATGTTCTTGGTGTTCATCAAACAAATACTGGATATACAGGTGGTGCGACAGTGATCAGAGCCACTGACGCTGCACCATATATTGATGAGAATGCTGCACTTAAGAAAGAAATAGAAGAATTAAAGAAGATGTTACGTGAACAGGCAATGAATCAGAGATCTGTTCAAGATAATGAGGTTGTAGGCATAGTTCGTGCAGCTGTCCAAAGAGAAATTGGAATATTACGTGATGAACTTAATTCATGTTATCAAAAGAAAAAAGGAAAAAATAAGAAAGGACGCGGTGCACGACATCGTATGCTGCGCCGTGGACAAAAATTTTTAACAGAAGAGGAGTACCAAGAACTATTGGATAAGGGTCTGACTAGGGAACAGTTGCTTGATGCAATTGAGGAAATTGTTAGGGCACGTATTGGATTCCCTGACTGGTCAGACCCTGAATATTCATCTGAAGAGGATGATGCAGCAGTTACATATTGGTGGGAACAAGTAAAAGAGAGTGATTATAAAGATGGAGTGCCCCAATTTGAACATATTGTACCTAAATATTCTCCAAATGAAAGAGTATTTTCTGAACAAGAGCGTAAAGATGTTAGTGAAGAATTGTCTGCTCTACAATCCATAGTAGATGGAGTGAAGAAAGAAGATTGGGAAGAAACCAAAAAGCAGACTACTGACGCTCTTAATCATGCACTATACGTTGTTGATAAAGCTCTTGCACAACATGGTTATATACTTTTTGAACAACGTATGCGGCCAAAAAACGGAAAAAGGGGTCCTCGGAGGAGGACCCCAAACACTACCTAGATACATGGATTGGGATGTTAAGTCCTTGCGTTCGTTGGCTGGTTCCAGAACGCTTTCCTTTGTATGGTGGTGTACCTTTAGATAGGCCAGTGTATGATTTCAAAGTTGTTAATGAAGATTTGTTAGGGTTACTCCCACCCCCACCTAATAATGATTTTGAGGTTTTTGGCCCCACTGTATGGGATGAGATTGCATATAAGAAATCATTTGAAAAGTTTGAATATGCCGATTATGTTGATTTTGAACAGATGTATCCTGAGTGTGTTGCTTTTGCTGATAAAAAATTTCTGGAACATTTTAATTTTTTGTCTGATTCCTCTTTTGTAAATATTTTAGCAACTGATAAGAATGTTGATTCCACACCCGCATATCCAAAGATGCGGTGGTGGCTTACTGAGAGTGACTATCTTGAGGAGTGTGGATGGGAATATTATGTCAAGGAGTTTGAAAACATCGCTTCTGGTCAAAATCCAGATGTTTGTTGGTATTTATTCCTCAAGAAAGAAATTATTAAACAACAAAAAATTGATGAAGGAGATGTCAGACAAATAGTATGTGCTGACCCAATATATTCCAGAATTGGGGCTTGTTTTGAGCAACACCAAAATGCCATGATGAAGGACCACACTCTCTTATCATCAGGACAGTGTGGTTGGTCCCCTTTCTTTGGTGGTTATGAAGCAAGAATGTCCAGGCTGCGCTCCAAAGGGAATAAAATCTTTGTTGAGCTTGATTGGACTCGGTTTGATGGTACAATACCACCAACCCTGTTGATGCACATAAAGAAATTAAGGTTTACCTTAATGGGTTCCATGTCCCGCAAGTATGAAAATGTATACAAGTGGTACTGTAGGAATCTAATCAACAGGTTTGTTGTGCTGCCTTCAGGTGAAGTTACAGCACAACAGCGTGGAAATCCATCGGGCCAGATATCTACCACCATGGACAATAACATGATCAACTATTGGTTGCAGGCATTTGAATATAAATTTTTGAACCTACCAGAAGAAGAGTGGATGCATTTTGATACTTTGATCTATGGAGATGACAGAATATCCACATATCGAAGCATCCCTAATGAATACACCAAGATAATAGTTGACATGTATAAAAATGTTTTTGGAATGTGGGTTAAGCCAGAAAAGGTTAAAGTCTCAGAGTCCTTGGAGGGACTCTCATTCTGTGGTTTTACTTATACATCAAATGGCCCAGTTCCAAGTGAGCCTTACAAACTTATGGCCTCATTGTTGAAACCTGCCACAAAATTACCTGATCTAATAGCTCTTCATGGGAAACTTTTGTGCTTCCAGTTGTTGATGGCAAATGATACTGCACACCCATTTTATGGGTATATTGAACAGTGTTTGCAGTATACACACCGTGCCCTCAGTGATGTTAGCTTACCAAGGCGCTTCACTCGAAGGCAGCTGGAGTACATTTGGAGGGGTGGACCAAATGATGACTATGGCTAATGCCAGTAAAGGTGTTACAGTTAACATCAACAATGCAAAACGGAAGCCTCGCTTCACCAATAACCAGCGAGCTAGACCTATTAGGCCAAATTTTACACCAGCACCCAAATTTAGGAAACGTCGGTATATTCCTAATAGGAATCGCCGTCGTAGGCAAAATACTAGTACAACTGGGCCTAAACCTGCGGTGTCGCAGACAATTACAGCAACACTCGGCACCGTTGGATCAAATTTAAGTGATGTTGTTGAAACTGAATGTGCAGTCTTTTTGAATCCCATTATAGCAAAAGACTCTGGTGCCAGTGCAACCTTTGGGCCCCTACAATCTTTGGGTGCACAGTATGCATTATGGAGGCTCAAGTGGTTGGAAGTCAGACTCCAGCCTTTGGTGGGTAACTCAGCTGTGAGTGGTACTGTAGCTCGTGTTAGTCTTAACATGACTACTGGCCCCACTCTCAACTCATGGTCTGGTCTTGGAGCCCGAATTCACAAGGATGTTAGAGTTGGTTCAAACCTTGTTTGGCGCATTAAACAGCGTCTAGTGAGTGGACCTTGTGAAACTTGGTGGAAAACCAATACGGCTGAGGACCCATCATTATCTCTTGGACCTGCACTGGAAGTACACACCATAGGTAAGACTATGAGTACTTATAAAAATGAAGTGTTTTCCAGTGGATTATTTCTTCTTGAGATAACCGGCCACTGGGAATTTGCAAATTATGCTGCTTCCCCAGCTCTTGCTACACTTACACAACATAAAGATGACAGTGAAACCACAAAAACACTTGCAATTAGCTCTGATGGTGCCAATGAACCAGTTGAGATGCTAATACCTGTGAATGAATGGAATATGAAAGCACAGTATGGAGGAAATGGCACACTTGGTGAGGCAATTTACCAAGTTGTTGATACTAGTGTCACAGTCGTGACAGACCTCTTTCCACCACCATTTTCATGGATTGGTAAAGCTTCATGGTGGTTTATCAGGAAAATGATTGGTAAAACAAAACAATTCCAGGTTGTTGTTAATGGTCAAAACCAAACTCTCACAGCAGATGTCTATCGTGTTTACACTTCAGCTTCTGCTGCTAGAGATGATAAACCAGCAATTTCCAGCAAGGCACATGAGGCTAAGCATCTGACTGGTGCAGTTGTTATCACACAAATTTCTACAGACAACATTCTTTCAGAAACCACATATACTGGCCCAAGATCCATTGTCACACCAGAAACTCCTATTGGCCCGTCTAGCTATCCAATGACACCAAGTTCTTTGGTGCTGATGGCTGGATACTTCAGTGGACCAGAAATCAGTGATAATTTTGGCAAATACATGCCTTTGCTTTTCCAACAGAACACTTCTAAGGTTACATTTAGGAGTGGTAGTCATACCATAAAGATTGTAAGTATGGTTCTTGTTGACCGGCTTATGTGGTTGGATAAGCATTTTAACCAGTACACTAATGAACCAGATGGAGTTTTTGGAGACGTTGGCAATGTTTTTGTTGACAATGATAATGTTGCCAAGGTCATTACTATGAGTGGGTCATCAGCACCAGCTAATAGAGGTGCCACTTTGATGTTATGCAAAGCCACAAAAAATATCCAGACTTTTAACTTTGCAGCAACAGTATATATACCAGCTTATAAAGTCAAAGATGGTGCAGGTGGTAAGGATGTTGTTCTGAATGTGGCCCAGTGGGAAGCAAACAAGACTTTGGCATATCCAGCTATACCTAAGGACACATACTTCATGGTTGTAACAATGGGAGGTGCTAGTTTTACCATCCAAAGGTATGTGGTATATAATGAGGGCATTGGTGATGGTCTGGAATTACCAGCATTCTGGGGTAAATATTTATCCCAGTTGTATGGTTTTAGTTGGAGTTCACCAACCTATGCATGTGTAACCTGGGAACCTATCTATGCTGATGAGGGTATACCACATAGAAGTGCACTAAATGATGATGAAATAAGCAGTGATGGTGATACTGATTATGACACTGACACAGAAGACGAAGATGAGTTCTTCGGTGAAGACCCCATTGCTGCATTGCACGCCCTTGATGAAAAGAGACCAGCTAGACGTGCAATGTTTGATGCACTTGTTAAAACTGGTGTCAGTGTTGAAGAGGCATCTAGATGTGTCCTTAGAGCATGTCCTACAAAACTTCAGATGAAGAAAAGGAATCTTTATGAAAGCCTCCTGTGCGATGGCTTATCACCTGAGTCGTCGTACGAGGAAGCATACAATTGTGAATAATTAATTAATTTCAATTGTAATTATAATTTGCTTTTTTTCTTCCAGCATAAATGTATGC
| 97,372
|
FJ402983.1
|
Astrovirus MLB1
|
Finkbeiner,S.R., Le,B.M., Holtz,L.R., Storch,G.A., Wang,D., Le,B.-M.
|
Washington University, Molecular Microbiology
|
USA
|
2009-03-08
| null |
Astrovirus MLB1
|
Mamastrovirus
|
Astroviridae
|
ssRNA(+)
| 6,169
|
GenBank
| 1
|
USA
|
USA
| null | null |
2008
| null | null |
Astrovirus MLB1 strain WD0016, complete genome
|
CCAAGAGTGGTGGTATGGCTGTGCCTTTCCATATTGGTGTGTCAGATAAAGTTATGAACCTGGGTTCAGCTCGTTCACGTGAGTGGCTTAACGAGCTACCTAGTGCGACACTCAACCAGCTGCGTGACATCTTTCCATTTGAAGTCCCAATTAATACCATGATAGTACCCAAATCTAGATACCAATTGGGTACTGGTGTCACACTTGCAGCCCAAGGTATGGTTACATTGGGTTGCTACAGTACATATGCACTTGATGGTGAGACGTGGATCGAAGTTGATGAAACTAGAATAGATCCAAAGTGTGCATATGTTGGGACCATGGCCCTAGATAGGGTAAAACTTATGGATCGTAATAAAGAGTTACAGCTGGATAATGCAACATTGAGTGTTGATTTACAACTGACCCGCCATGAATTGGAGAGGTGTAGACCAACCATCATTCGACCGCAAAGATATGGTAACTTTGCACTTTTTGTTCTTTTCTTTTTCCTTTTCTTTATATTAGGAACAAAGGCTGAAGATTGGCATGATCAGACTCAGGATTATTTGGTTGAGTTTTTGAAAGAAGCAAAACAGGAAATTGTGTCTAATTTGGATACATATTATAGCCTTCTCTTACATGTAGTTAGGTGGGAGGTAGTTTCATGTATTATAGCAATTGTTTCTTTTTTCAAATTAAAGAGACCTTGTGTTGCAATAATTGGCTTGTTTTTAGCAACTATATCCAGATACAATTATGCAGCATTGTCCATTGTGCCATTCCTGGACGTTTATAGTACTGTTTTCTTGTATACCACTATGGTTGTATACTTTTTGGTACCCCATGTGGCCATAATTACATCATTAGTCTGTGCAATACTTTTTACTATTGTAAGTATGGTATGTGCACACCACCAATTCATCATACGTGTTCGTGGTGATTGGCTGGTTGTTTTAATCACCATTGCAACATATATTTGTGATGTCATGGGTATACACACCACAGCAATAGCAGTTGCTGCAGCGTTAGTGCGTATTTATATGTGCTTTCCTGCGGCTAACGCGTCCGTGGTAGAGATCAAGGACAGCACTGGTAAAGTAGTTCAGAAAACAACATTATTGCCCAACTGGATTGGTTCAATGTATCAGGGTGCCCGCAACATGTTGCAAAAAGTTAGAACTGGTGTTGCAACATTTGTTCGGGTTAACCCTAATTGCCTGTGCCATATCAGGAGTGAAGGTTGTAGTGGTACGGGCTTTAGGTTGGGTAATGATATAGTGACCGCTGCACACGTTGTGGGTAATGCTGTCCAGGTTGAGGTGGTATACAATAATTATGTTGCTCAAGCTAAAGTTAGGCACATTCCTGATAAAGATATTGCATATCTCATATTACCAGAGGGTCTTAAGACTATGCCTGTTCTCAAATTGGCCAAAAACCCAAACTATGAACAGGTTACAATAATAGCACTTGAGGGTAATTGCATGCTTGTTTCTACTACAGAGGGTGTATGTCATGGGGAAACCATTTCATATGCCTGTGCTACCAGAGATGGTATGAGTGGTGCTCCTGTTCTTGATGTCAATGGAAATGTCCTTGGTGTTCATCAAACAAACACTGGATATACAGGTGGTGCAACAGTAATTAGAGCTACTGATGCTGCACCATACATTGATGAAAATGCTGCACTTAAAAAAGAAATAGAAGAATTAAAGAAAATGCTGCGCGAACAAACAATGAATCAGAGATCTGTTCAAGATAATGAGGTTGTAGGCATAGTCCGCGCAGCAGTCCAAAGGGAAATTGGAATATTGCGTGATGAATTAAATTCATGTTATCAAAAAAAGAAAGGAAAGAATAAGAAAGGACGTGGCGCACGACACCGTATGCTGCGTCGTGGACAAAAATTCCTGACAGAAGAGGAGTACCAAGAACTGCTTGATAAGGGTCTGACTAGGGAACAGTTGCTTGATGCAATTGAGGAAATTGTCAGGGCACGTATTGGTTTCCCTGATTGGTCAGACCCCGAATATTCCTCTGAAGAGGATGATGCAGCAGTTACATATTGGTGGGAACAAGTAAAAGAGAGTGATTATAAAGATGGAGTACCCCAATTTGAGCATATTGTACCAAAATATTCTCCAAATGAAAGAGTATTTTCTGAGCAAGAGCGCAAAGATATTAGTGAAGAATTATCTGCACTACAATCTATAGTAGATGGAGTGAAGAAAGAAGATTGGGAAGAAACAAAAAAGCAGACTACTGATGCTCTTAATCATGCATTATACGTTGTTGATAAGGCTCTTGCACAACATGGTTATATACTTTTTGAACAACGTATGCGGCCAAAAAACGGAAAAAGGGGTCCTCGGAGGAGGACCCCAAACACTACCTAGATACATGGATTGGGATGCTTAATCCTTGCGTTCGTTGGCTGGTTCCAGAACGCTTTCCTTTGTACGGTGGTGTACCTTTAGATAGGCCAGTGTATGATTTTAAAGTTGTTAATGAAGATTTGTTAGGTTTACTTCCCCCCCCACCTAATAATGATTTTGAGATTTTTGGTCCTACTGTATGGGATGAGATTGCATATAAGAAATCATTTGAAAAATTTGAATATGCTGATTATGTTGATTTTGAACAAATATATCCTGAGTGTGTTGCCTTTGCTGATAAAAAATTTTTGGAGCATTTTAATTTTTTGTCTGATTCTTCTTTTGTAAATATTTTAGCAACTGATAAAAATGTTGATTCCACACCCGCATATCCAAAGATGCGATGGTGGGCTACTGAGAGTGACTATCTTGAGGAATGTGGATGGGAATATTATGTTAAGGAGCTTGAAAATATTGCTTCTGGTCAAAATCCAGATGTTTGTTGGTATCTATTCCTCAAGAAAGAAATCATTAAACAACAAAAAATTGATGAAGGAGATGTCAGACAAATAGTGTGTGCTGACCCAATATATTCCAGAATAGGGGCCTGTTTTGAGCAACATCAAAACGCTATGATGAAAGATCACACTCTTTTATCATCTGGACAGTGTGGTTGGTCCCCTTTCTTTGGTGGTTATGAAGCAAGGATGTCTAGATTACGCTCCAAAGGGAATAAAATCTTTGTTGAGCTTGATTGGACTCGATTTGACGGTACAATACCACCAACCTTGTTGATGCATATAAAGAAATTAAGGTTTACCTTAATGGGTTCCATGTCCCGCAAGTACGAAAATGTATACAAGTGGTATTGTAGGAACCTAATCAACAGGTTTGTTGTGCTGCCTTCAGGTGAAGTTACAGCACAGCAACGTGGGAACCCATCAGGCCAGATATCAACCACCATGGATAATAACATGATCAACTATTGGTTACAAGCATTTGAATATAAGTTTTTAAATCTACCAGAAGAAGAGTGGATGTATTTTGACACTTTAATCTATGGGGATGATAGGATATCCACATATCGAACTATCCCAGATGAGTACACTAAAGTAATAGTTGACATGTATAAAAATGTTTTTGGAATGTGGGTCAAGCCAGAAAAGGTTAAAGTTTCAGAGACTTTGGAGGGGCTCTCATTCTGTGGGTTTACATATACACCAAATGGCCCAGTTCCAAGTGAGCCTTACAAACTTATGGCCTCACTATTGAAACCTGCCACAAAATTACCTGATTTAATAGCTCTTCATGGGAAACTTTTGTGCTTCCAGTTGTTGATGGCAAATGATACTGCACATCCATTTTATGGGTACATTGAACAATGTTTGAAGTATACACACCGTGCCCTCAGTGATGTTAGCTTACCAAGGCGCTTCACTAGAAGGCAACTGGAGTACATTTGGAGGGGTGGACCAAATGATGACTATGGCTAATGCCAGTAAAGGTGTTACAGTCAACATCAACAATGCAAAACGGAAGCCTCGCTTTACCAATAACCAGCGAGCTAGAACTGTTAGGCCAAATTTTACACCAGCACCCAAATTTAGGAAACGTCGGTATATTCCTAATAGGAATCGCCGTCGTAGGCAAAATATTAGTACAACTGGGCCTAAACCTGCGGTGTCGCAGACAATCACAGCAACACTCGGCACCGTTGGATCAAATTTAAGTGATGTTGTTGAAACTGAATGTGCAGTCTTTTTAAATCCCATTATAGCAAAAGACTCTGGTGCCAGCTCAACTTTTGGGCCCTTACAGTCTTTGGGTGCACAGTATGCACTGTGGAGGCTCAAATGGCTGGAAGTTAGACTTCAGCCCCTGGTGGGTAACTCAGCTGTGAGTGGTACTGTGGCTCGTGTCAGCCTTAACATGACCACTGGGCCCACTCTCAATTCATGGTCTGGTCTTGGAGCTCGAATTCACAAGGACGTTAGAGTTGGTTCAAATCTCGTTTGGCGCATTAAACAGCGTCTAGTGAGTGGACCTTGTGAAACTTGGTGGAAGACTAATACAGCTGAAGACCCATCATTGTCTCTTGGACCCGCACTGGAAGTACACACTATAGGTAAGACCATGAGTACTTATAAAAATGAAGTATTTTCCAGTGGGTTGTTCCTTCTTGAGATAACCGGTCATTGGGAATTTGCAAATTATGCTGCTTCTCCAGCCCTTGCCACACTTACACAACATAAAGATGACAGTGAAACTACAAAAACACTTGCAATCAGCTCTGATGGTGCTAATGAGCCAGTCGAGATGCTAATACCTGTTAATGAGTGGAACATGAAGGCACAGTATGGAGGTAATGGCACACTTGGTGAAGCAATCTACCAGGTCGTTGATACTAGTGTCACAGTTGTGACAGACCTCTTTCCACCGCCGTTTTCATGGATTGGTAAAGCCTCATGGTGGTTTATCAGGAAAATGATTGGTAAGACAAAACAATTCCAGGTTGTTGTCAATGGTCAAAATCAAACGCTTACAGCAGATGTCTACCGTGTTTACACCTCAGCTTCTGCTGCTAGAGATGATAAACCAGCAATTTCCAGCAAGGCACATGAGGCCAAGCATTTGACTGGCGCAGTTGTCATTACACAAATTTCTACAGATAACATCCTTTCAGAAACTACATATACTGGCCCACGATCCATTGTTACACCAGAAACTCCTATTGGTCCATCCAGCTATCCAATGACACCAAGCTCTTTGGTGTTAATGGCTGGATATTTCAGTGGGCCAGAAATCAGTGATAACTTTGGCAAGTATATGCCATTGCTTTTCCAACAGAACACTTCTAAAGTTACTTTTAGAAGTGGCAGTCATACTATCAAAGTTGTAAGCATGGTCCTTGTTGACCGGCTTATGTGGTTGGACAAGCACTTCAATCAGTACACTAATGAGCCAGATGGAGTTTTTGGAGATGTTGGCAATGTTTTCATTGACAGTGATAATGTTGCCAAGGTTATCACTATGAGTGGGTCATCAGCGCCATCTAATAGAGGTGCTACTCTGATGTTATGTAAAGCTACAAAAAGCATCCAGACTTTTAATTTTGCAGCTACAGTATACATACCAGCTTATAAAGTGAAAGATGGTGCAGGTGGTAAGGATGTAGTCCTCAATGTGGCTCAATGGGAAGCAAACAAAACTTTGACATATCCAGCTATACCTAAGGACACATATTTCATGGTTGTAACAATGGGAGGGGCTAGTTTTACCATCCAAAGGTATGTGGTGTACAATGAGGGTATTGGTGATGGCCTAGAATTACCAGCATTCTGGGGCAAATACTTATCCCAGCTATATGGTTTCAGCTGGAGTTCACCAACCTATGCATGTGTGACATGGGAACCTATCTATGCTGATGAAGGTATACCACATAGAAGTGCATTAAATGATGATGAAGTAACTAGTGATGATACTGATTATGACACTGATACAGAAGATGAGGATGAATTCTTTGGTGAGGATCCCATTGCTGCGTTGCACGCCGTTGATGAAAAGAGACCGGCTAGGCGTGTAATGTTTGATGCACTTGTTAAAACTGGTGTCAGTGTTGAAGAAGCATCTAGGTGTGTCCTTAGAGCATGTCCTACAAAACTTCAGATTAAGAAAAGGAATCTCTATGAAAGCCTCCTATGCGATGGCTTATCACCTGAGTCGTCGTATGAGGAAGCATACAATTGTAAATAACTAATTAGTTTCAATTGTAATTATAATTTGCTTTTTTTCTTCCAGCATAAATGTATGCA
| 103,557
|
FJ222451.1
|
Astrovirus MLB1
|
Finkbeiner,S.R., Kirkwood,C.D., Wang,D.
|
Washington University School of Medicine, Molecular Microbiology and Pathology
|
USA
|
2008-10-21
|
MLB1
|
Astrovirus MLB1
|
Mamastrovirus
|
Astroviridae
|
ssRNA(+)
| 6,171
|
GenBank
| 1
|
Australia
|
Australia
| null |
feces
|
1999-10-06
| null | null |
Astrovirus MLB1, complete genome
|
CCAAGAGTGGTGGTATGGCTGTGCCTTTCCATATTGGTGTGTCAGACAAAGTTATGAATCTGGGTTCAGCTCGCTCACGTGAGTGGCTTAATGAGCTACCCAGCACAGCACTCAACCAGCTGCGTGACATCTTCCCATTTGAAGTCCCAATTAATACTATGATAGTACCTAAGTCCAGATATCAATTGGGTACTGGTGTCACACTTGCAGTCCAAGGTATGGTTACATTGGGTTGCTACAGCACATATGCACTTGATGGTGAAGCATGGATTGAAGTTGATGAAACCAGAATAGATCCAAAGTGTGCATATGTTGGGACCATGGCCCTAGATAGGGTAAAGCTTATGGATCGCAACAAAGAACTGCAGCTGGATAATGCATCAATGAGTGTTGATTTGCAACTGACTCGCCATGAATTGGAGAGGTGTAGGCCAACCATCATTCGACCGCAAAGATATGGTAACTTTGCACTTTTTGTTCTTTTTTTCTTCCTTTTCTTTATTTTAGGAACAAAGGCTGAAGATTGGCATGATCAGACTCAGGATTATTTGGTTGAATTCCTGAAAGAAGCAAAACAGGAAATTGTGTCTAATTTGGATACATATTATAGCCTTCTTTTACATGTAGTCAGGTGGGAGGTGGTTTCATGCATTATAGCGATTGTTTCTTTTTTCAAATTAAAGAGACCCTGTGTTGCAATAATTGGTTTATTTTTGGCAACTATATCCAGATACAATTATGCAGCATTGTCCATTGTACCATTTCTGGATGTCTACAGCACTGTTTTCTTGTACACCACCATGGTTGTGTATTTTTTGGTACCCCATGTGGCTATAATTACATCATTAGTTTGTGCACTACTATTTACTATTGTAAGTATGGTATGTGCACATCACCAATTCATCATACGTGTGCGTGGAGATTGGCTTGTTGTCTTAATCACCATTGCAACATATATCTGTGATGTTATGGGTATACATACTACAGCAATAGCCATTGCTGCATCGTTAGTGCGTATTTATATGTGCTTTCCTGCGGCTAACGCATCAGTGGTGGAAATCAAGGATAGTGCTGGTAAAGTAGTTCAGAAAACAACATTGCTACCCAACTGGATCGGCTCAATGTATCAAGGTGCCCGAAACATGTTGCAAAAAGTCAGAACTGGTGTTGCGACATTTGTTCGGGTTAACCCTAATTGCTTGTGCCATATTAGAAGTGAAGGTTGTAGTGGTACAGGCTTCAGGTTAGGTAATGACATAGTTACCGCCGCACATGTTGTAGGCAATGCTGTACAGGTTGAGGTGGTATATAATAATTATGTTGCTCAAGCCAAAGTTAGACATATCCCTGATAAAGATATTGCATATCTTATATTACCAGAGGGTCTTAAAACTATGCCTGTTTTAAAATTGGCAAAAAACCCAAATTATGAACAGGTCACAATAATAGCATTAGAGGGCAATTGCATGCTTGTTTCCACTACAGAGGGTGTATGTCATGGTGAAACTATTTCATATGCCTGTGCTACCAGAGATGGTATGAGTGGTGCTCCTGTTCTTGATGTCAATGGAAATGTTCTTGGTGTTCATCAAACAAATACTGGATATACAGGTGGTGCGACAGTGATTAGAGCCACTGATGCTGCACCATATATTGATGAGAATGCTGCACTTAAGAAAGAAATAGAGGAATTAAAGAAGATGCTGCGCGAACAAACAATGAATCAGAGATCTGTCCAAGATAATGAGGTTGTAGGAATAGTTCGTGCAGCTGTCCAAAGAGAGATTGGAATATTACGTGATGAACTTAATTCATGTTATCAAAAAAAGAAAGGAAAAAATAAGAAAGGACGCGGTGCACGACATCGTATGCTGCGTCGTGGACAAAAATTTCTGACAGAAGAGGAGTACCAAGAACTGTTGGATAAGGGACTGACTAGGGAACAACTACTTGATGCAATTGAGGAAATTGTCAGGGCACGTATCGGATTCCCTGACTGGTCAGACCCTGAATATTCATCTGAAGAGGATGATGCAGCAGTTACATATTGGTGGGAACAAGTAAAAGAGAGTGATTATAAAGATGGAGTGCCCCAGTTTGAACATATTGTACCCAAGTATTCTCCAAATGAAAGAGTATTTTCTGAACAAGAGCGTAAGGATGTTAGTGAAGAACTGTCTGCTTTGCAATCTATAGTAGATGGAGTGAAGAAGGAAGATTGGGAAGAAACCAAAAAGCAGACTACTGACGCTCTTAATCATGCACTATACGTTGTTGATAAGGCTCTTGCACAACATGGTTATATACTCTTTGAACAACGTATGCGGCCAAAAAACGGAAAAAGGGGTCCTCGGAGGAGGACCCCAAACACTACCTAGATACATGGATTGGGATGCTTAGTCCTTGCGTTCGTTGGCTGGTTCCGGAACGCTTTCCTTTGTATGGTGGTGTACCTTTAGATAGGCCAGTGTATGATTTTAAAGTTGTTAATGAAGATTTGTTGGGGTTACTCCCACCCCCACCTAATAATGATTTTGAGGTTTTTGGTCCCACTGTATGGGATGAAATTGCATATAAGAAATCATTTGAAAAGTTTGAATATGCTGATTATGTTGATTTTGAACAGATATATCCTGAGTGTGTTGCTTTTGCTGATAAAAAATTTTTGGAACATTTCAATTTTTTGTCTGATTCTTCTTTTGTAAATATTTTAGCAACTGATAAAAATGTTGATTCCACACCCGCTTATCCAAAGATGCGGTGGTGGCTTACTGAGAGTGATTATCTTGAGGAGTGTGGATGGGAATATTATGTTAAGGAGTTTGAAAACATCGCTTCTGGTCAAAATCCAGATGTTTGTTGGTACCTATTCCTCAAGAAAGAAATTATCAGGCAACAAAAAATTGATGAAGGGGATGTCAGACAAATAGTGTGTGCTGACCCAATATATTCCAGAATTGGGGCATGTTTTGAGCAACACCAAAATGCCATGATGAAGGACCACACTCTTTCATCATCTGGACAGTGTGGTTGGTCCCCTTTCTTTGGTGGTTATGAAGCAAGGATGTCCAGGTTGCGCTCCAAAGGTAATAAAATCTTTGTTGAGCTTGATTGGACTCGATTTGATGGTACAATACCACCAACCTTGTTGATGCACATAAAGAAATTAAGGTTTACCTTAATGGGTTCCATGTCCCGCAAGTATGAAAATGTATACAAGTGGTATTGTAGGAACCTAATCAATAGGTTTGTTGTGCTACCTTCAGGTGAAGTTACAGCACAGCAGCGTGGAAATCCATCAGGTCAGATGTCAACCACCATGGATAATAACATGATCAACTATTGGTTGCAGGCATTTGAATACAAATTTTTGAATTTACCAGAAGAAGAGTGGATGCATTTTGATACTTTAATCTATGGAGATGATAGGATATCCACATATCGCAGCATCCCTAATGAATATACCAAGACAATAGTTGACATGTACAAAAATGTTTTTGGAATGTGGGTTAAGCCAGAAAAGGTTAAAGTCTCAGAGTCCTTGGAGGGGCTCTCATTCTGTGGTTTCACTTACACACCAAATGGCCCAGTTCCAAGTGAGCCTTATAAACTTATGGCCTCATTGTTGAAACCTGCTACAAAACTACCTGATTTAATAGCTCTTCATGGGAAACTTTTGTGCTTCCAGTTGTTGATGGCAAATGACACTGCACACCCATTTTATGGGTATATTGAACAATGTTTGCAGTACACACACCGTGCCCTCAGTGATGTTAGCTTACCAAGGCGCTTCACTCGAAGGCAGCTGGAGTACATTTGGAGGGGCGGACCAAATGATGACTATGGCTAATGCCAGTAAAGGTGTTACAGTCAACATCAACAATGCAAAACGGAAGCCTCGCTTCACCAATAACCAGCGAGCTAGATCTACTAGGCCAAATTTTACACCAGCACCCAAATTTAGGAAACGTCGGTTTATTCCTAATAGGAATCGCCGTCGTAGGCAAAATACTAGTACAACTGGGCCTAAACCTGCGGTGTCGCAGACAATTACAGCAACACTCGGCACCGTTGGATCAAATTTGAGTGATGTTGTTGAAACTGAATGTGCAGTCTTTTTGAATCCCATTATAGCAAAAGATTCTGGTGCCAGTGCAACTTTTGGGCCCCTTCAATCTCTGGGTGCACAGTATGCACTATGGAGGCTCAAGTGGCTGGAAGTCAGACTCCAGCCTTTGGTGGGTAACTCAGCTGTGAGTGGCACTGTAGCTCGTGTTAGTCTTAACATGACTACTGGTCCCACTCTCAACTCATGGTCTGGTCTTGGAGCCCGAATTCACAAGGATGTTAGAGTTGGTTCAAATCTTGTTTGGCGCATTAAACAGCGTCTAGTGAGTGGACCTTGTGAAACTTGGTGGAAAACTAATACAGCTGAGGACCCATCATTATCTCTTGGACCTGCACTGGAAGTACATACCATAGGTAAGACTATGAGTACTTACAAAAATGAAGTGTTTTCCAGTGGACTATTTCTTCTTGAGATAACTGGCCACTGGGAATTTGCAAATTATGCTGCTTCTCCAGCCCTTGCTACACTCACACAACATAAGGATGACAGTGAGACTACAAAAACACTTGCAATCAGTTCTGATGGTGCCAATGAACCAGTTGAGATGCTAATACCTGTGAATGAATGGAATATGAAGGCACAGTATGGTGGAAATGGCACGCTTGGTGAAGCAATTTACCAAGTTGTTGATACTAGTGTCACAGTTGTGACAGACCTCTTTCCACCACCATTTTCATGGATTGGTAAAGCTTCATGGTGGTTTATCAGAAAAATGATTGGCAAAACAAAACAATTCCAGGTTGTTGTTAATGGTCAAAACCAAACACTTACAGCGGATGTCTATCGTGTTTACACTTCAGCTTCTGCTGCTAGAGATGATAAACCAGCAATTTCCAGCAAGGCACATGAAGCAAAGCATCTAACTGGTGCAGTGGTTATCACACAAATTTCTACAGACAACATTCTTTCAGAAACCACATATACTGGCCCAAGGTCTATTGTCACACCAGAGACTCCTATTGGTCCGTCTAGCTATCCAATGACACCAAGTTCTTTGGTACTTATGGCTGGATATTTTAGTGGACCAGAAATTAGTGATAATTTTGGCAAGTACATGCCCTTGCTTTTCCAACAGAATACCTCTAAGGTTACATTTAGGAGTGGTAGTCATACCATAAAAATTGTAAGCATGGTTCTTGTGGACCGGCTTATGTGGTTGGATAAGCATTTTAATCAGTACACTAATGAACCAGATGGAGTCTTTGGAGACGTTGGCAACGTTTTCGTTGACAATGATAATGTAGCCAAGGTTATTACTATGAGTGGGTCATCAGCACCAGCTAATAGAGGTGCCACTTTAATGTTATGCAGAGCCACAAAAAACATCCAGACTTTTAATTTTGCAGCAACAGTATATATACCAGCCTATAAAGTTAAAGATGGTGCAGGTGGCAAAGATGTTGTTCTGAATGTGGCCCAGTGGGAAGCAAATAAAACTTTGACATACCCAGCTATACCTAAGGACACGTATTTTATGGTTGTAACAATGGGAGGTGCTAGTTTTACCATTCAAAGGTATGTGGTATACAATGAGGGCATTGGTGACGGCCTAGAATTACCAGCATTCTGGGGCAAATATTTATCCCAGCTATATGGCTTTAGCTGGAGTTCACCAACCTATGCATGTGTAACTTGGGAGCCCATCTATGCTGAAGAAGGTATACCACATAGAAGTGCATTAAATGATGATGAAATAAGCAGTGATGGTGACACTGATGATGACACTGACACAGAAGACGAAGATGAGTTCTTCGGTGAGGATCCCATTGCTGCATTGCACGCCCTTGATGAAAAGAGACCAGCTAGGCGTGCAATGTTTGATGCACTTGTTAAAACTGGTGTCAGTGTTGAAGAAGCATCTAGGTGTGTCCTTAGAGCATGTCCTACAAAACTTCAGATTAAGAAAAGGAACCTTTATGAAAGCCTCCTGTGCGATGGCTTATCACCTGAGTCGTCGTACGAGGAAGCATACAATTGTAAATAATTAATTAATTTCAATTGTAATTATAATTTGCTTTTTTTCTTCCAGCATAAATGTATGC
| 104,596
|
OQ032517.1
|
Atypical porcine pestivirus
|
Song,H., Gao,X., Fu,Y., Li,J., Fan,G., Shao,L., Zhang,J., Qiu,H.J., Luo,Y., Qiu,H.-J.
|
Chinese Academy of Agricultural Sciences, State Key Laboratory of Veterinary Biotechnology, Harbin Veterinary Research Institute
|
China
|
2023-12-03
| null |
Pestivirus scrofae
|
Pestivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 11,511
|
GenBank
| 1
|
China
|
China
|
Sus scrofa
| null |
2017
| null | null |
Atypical porcine pestivirus strain China/HLJ491/2017, complete genome
|
AGCTCTGCAGTACGTGGGGGAAAGGGGTTAACCAGGCCTCTAGTACCACAGGCACCAATTGACAGGGCAACTCGAGCCTGGGAGAGAGGTACCGAACTCTTAAGTCCCGAGTACGGGGCAGACGTCACCGAGTAGTACACCCAAAGACCACCATGTTTAGGTGTAGGGTCTACTGAGGCTTGGGTGGACGTGGGCATGCCCAAAGAGAAATCGGTGGTGGACCTGGGGGTCGGGCCCACCGTGCCCCTTTATGGGGTGGACCTCACTGCTTGATAGAGTGCCGGCGGATGCCTCAGGTAAGAGTATAAAATCCGTTGTCTATTAACATGAAGAAGCAGATTACTTATTACTTAAAAAAAGAAAAACAAAGAAACGGGTGGACAGAGCTGGTGGTGGGTGAAAGTCATATGAAAATAACCACACTTTCTGGGAGGACCTACCGAGGTACTTGGGAAATGGAGAAGTGGTCAAATCCTTATGGAACCTACTTACCCAGGCCTAGCCCCCAAGAGCTCACAGCTTTACACCCACACCCGGTAGTAAACTGCAAAATGATGGAGTACAAGGGGGCGGATCCTGATTATGGTGATTGTCCAAGCACAAATGGAGTGTTTATTGACGAAAAAGGTAGAAGGTTTAGTAGCCCCCCATTAGGTATCTGGAAGATAAGGCTGGACTACAATGAGCTGGTAAATATAAGTAGACCAATCTTTACCAGCGGAAGAAGCTTATACCAGGTTGAAACCTGCAGTGGGGAGTTGGCCACCATAACGCTGGAGCACGATAGGGTGCTTGTGGACGACCGTAGGGGGTTTTATCAATGGAAACCTAACTGTGAAGGAATGGTGCTTTATGTGAAGACATGTTCTGACTGGGCAGATCAAGTGGAAAAACAGGAGAAGGAAAAACCTCCAAAACCTCAGCGACCACCAAGGCGAGACCCCCGAAAAGGGTTGCAGCCACAAGTCCCTAAAGAAACTGAGATCACGGAAAAAAAGAAACAACCGAGTGTCACCTTAGTATCGGGGGGGCAAAAAGCTCAGGTCATCTATAAGGGTAAGACTAAGAATAAAAAGACTCCGGATGGGGTTTATAAATACCCAGGGGCTAAGGAAGGGGATGTAGTGAAAGTCAAGAAAATGTTGAAGAACTGGCACATAGCCCTGGTGATGTGCCTGATATTTCTCGCAAACCCAAGTTTAGCCAAGGTCCAGTGGTTCCTAAAGGATGAGAATTCGACAGGGATAAATCAAGTACTGTGGCAAAGACAGGTAAATAGGTCTTTACATGGAGAGTGGCCCAATCAGATCTGTCACGGAATGCCAAACGAAACCATCACAGACGAGGAGCTACGCAGTCTTGGAATGATAGATACAAGCCCTAGAACAAACTACACTTGCTGTCAATTGCAGTACCATGAATGGAAAAAACATGGGTGGTGCAACTATCCACAAAAGCAAGCTTGGATTAAGAGAATAGCAGCCTTACAATCCAACCTAACTGGAGCTTACGAGGGACCTGAATGTGCAGTCATCTGCCGATTTAATGGTAGCTATAACATAGTGAGACAGGCCAGAGACGAGGTAAGCCCGTTGACAGGGTGCAAAGAAGGGTATCCCTTCCTGTTTTCTGGAGAAAGATCTGACACCTCATGCCTAAAAAATCCATCCACTAGTTGGGTCAGGCCGGTGAAAATGGATGAGGCATCAGTGGCAGATAGCTTCGCCCATGGAGTAGACAAGGCAATAATATTAATCAGAAAAGGGGCATCAGGAATCATCAACTTTTTAGACACCATTGGGAGGTGGCTGCCAGTAGCTGAAGCCGCCATAGTACCATATTGCGAAACTTACACCGTAACAGGGATGTATGTTCATGTAAAGCATTGCCTCCCCAGGGGACTACCTAAGCATTCGAAAATAATTTCCCCGACAATGATATACCTGGGGGAAGGTGACCCGGTCCATAATATCCAGCACTTGTTTGGCTCAGGCATAGCAAGGTGGGTCCTGGTTTTACTTGGTGTCTTGGGTGAGTGGTATGGGGAGTTGGCTTCCACGATATACCTGCTGCTGGAATACGGAACTGAATGGTTGGAACATGAAAGTCTAGTCACGGAAGGATTGATCCCTGGTATCAATATCACAGTAGAGCTCCCCGCTAGTCACACGGTACCAGGTTGGGTGTGGGTCGCTGGCCAGTGGGTATGTGTGAAACCAGATTGGTGGCCTACGCAGATCTGGATTGAGACCGTAGTGACAGAGGTATGGCATATACTGAAAATATTGGCATTAGCTTTGGTAAATATAGTCACTGCATTCGTAAATCTAGAATTAGTCTATCTGGTCATAATACTAGTCAAAATATCAAAAGGAAACTTGATGGGCGCTATATTGTGGTGCCTCTTACTGTCAGGGGCTGAGGGGTCATGCCACAAGAGACAAGACTATTACAACATCCAACTAGTTGTTGAGGAAAAAACAGGAATAGAGAAGCGGTCTGTAATGGGCAAGTGGACTGTGATAACTAGGGATGGTAGAGAACCAAGATTAATGGAGCAAATAAAGATGGTGTCGAATGGGACCCTGTCGGAAACTTACTGCTATAATAGGCTGAACACCAGTAATTGGGGACGGCAACCGACGAGACAGAGAGGGTGCGGGCAAACTGTACCCTATTGGCCTGGTGACAACGTCCTTGAAGAACAATACTACAGTACAGGTTACTGGGTGAATGCAACGGGTGGTTGCCAGTTAAGGGAAGGTGTATGGCTATCAAGGAAAGGCAACGTACAGTGTCAGCGCAATGGTACTTCCTTGATATTGCAACTGGCGATAAAAGAAGAAAACGACACTATGGAAATACCATGTGACCCAGTGGAGACTGAGAGCATGGGCCCAGTAGCACAGGGCACGTGCGTGTACAGCTGGGCAGTTGCCCCAAGAGGGTGGTACTACAACAGGAAGGACGGTTACTGGCTTCAGTACATAAAGAAAAATGACTATCAGTACTGGACTAAGATGCCCACTACTTCGTCTGCTGCCACAATGTATCGTCATCTGCTCCCCCTATTGGTGGCCTGCCTCATGGGCGGTAGAATATCAGTGTGGATTGTGGCAATGCTCCTGTCTCTACAAGTAGAGGCTAGTGAAGTCGGCACCAAGCAATTAGCTGTCACCCTAACTCTATGGAAGATGGATTGGACAGAACTGCTCTTTTACGTCGTTATAATGCTAGTTGTCAAGGAAGATCTTATAAAGAAAGTGGTGACTGCAAGTCTTGTGGCCTTGAAAAACAGCCCGGTGGCCCTGAGCTTCCTTATTGTGTTAAGGCTGGTGGGAGGCAGCGAGGCGCTCCCGGTGGGCCTACTACTAGAAAAAATGTGTATAGACCAACCAGAGTTTGGAACCCCTTTCTTGATCTACCTATGGGACAACTGGAAGTGGACTGTCCTAGTCAGCTTCTCTGCATTAAATCATGAAAAGACCATAAAATTAGCAAGAAAATTACTCTTAGCCACACATATAACAGCGCTGACATTAACTGGCTTAAGTGACTCAATATTCTATGTGGTGCTCATAATGACCAACCTTTTAATAAAGACATTCATATATCTGTTGGGGGTCAGTATCAGCTGGGTCGAAAAAGAGAAAAAGAAGCTGCTAGTAAAGAGGAGATTAATATATAAGCATGCTGCAGTCTGTCATCAAGATGAGAACGAACTAGCTAGCAAGTTCAATAAGATAACCGTGAATGCAGATTTTACCCCATGCAGACTCGAATTGCTACAATTGCTCAGAGCTTTTCTTGTCTCTCTGTGCTTTTCCTATTACAAGCCCCTCTTGTACGCAGAGACCACCTTAACTGTAATAGTGATTGGAGTGCAGGAGTACAACGTAGCAATGGCCCGTGGGCGAAGCATGATTCACAGATTATTAGCTACGGCCTATTACATATATGGCCGCATGCAGGGGGACATGTTCCAGCTTGCCACAGCCCAGTGTCTACTGTCCAGTCCAAGAAAAATCATGAAACATATGATAGAAAATCCGATTCTCAAGAAGCTCTGGCAAGGGGAAACGGAACTTTTCAACCAGGGCGTCAGTCAGTCCAAAATAGTTAACCCAAAGAAAATAGGGTTGGAGGAACTACACAAAGGCATGTGTGGCCTACCAACTGTAGTACAAAATTTAGTCATATACGCAAAGAAGAATGACTCCCTTATCTTAGGAGAAGTAGGCTACCCCCCTGGGGACCTCACTAGTGATGGGTGGGAAATTCTAGGCCCTGGCAGAATTCCAAAGATCACCAACGTTGAGTCAGCCAAGATGGACCTACTCTCTAAACTCATGACTTTCCTGGGGATTGAAACTTCCAGAGTCCCCAGAACCCCAGTCCACTCGACAAGGAAACTATTGAAGATAGTAAGAGGCATGGAGACTGGGTGGGGGTATACTCACGCAGGAGGGGTTAGCAGTGCCAAACACGTCACAGGTGAGAAGAACTTGATGACCCATATGGAGGGCAGAAAAGGCAAATATATCCTACAATCTCAAGAACATGGTGCCGATGAGGTGGAATACGGGGTTAAGACTGACCAAAAAGCACCCGATAATGCTCTGTGTTATTGCTTTAACCCTGAAGCCACAAATATAAAAGGAGAAACAGGTGCCATGGTATTCATGAAAAAAATAGGGAAAAAATGGACCCTCGTAACATCAGATGGCAACAAAGCTTATTATAATGTAAATAATCTTAAAGGGTGGTCCGGATTACCAATAATGTTGCACTCCACCGGAGCTATAGTAGGGAGGATTAAGTCAGCCTATTCAGACGAAAATGACTTAGTGGAGGAACTTATTGACTCTAGGACCATCAATAAGAGCAAAGAGACTAACCTAGACCACCTTATTAAGGAATTGGCTGATATGCGGAGGGGGGAGTTCCGCTCAATCACTCTAGGGACGGGCGCCGGAAAAACAACAGAACTGCCCAGACAATACCTCACCACAGTGGGTGCCCATAAGTCGGTATTGGTCCTAGTTCCTTTGAAAGCACCAGCTGAAAGTGTGTGCCGCTTTATGCGGTCCAAATACCCCACTATCAACTTTTCCCTGAGAGTCGGAGAACGGAAAGAGGGGGATGTGAGCAGTGGCATCACCTATGCTACTTACGGTTTCTGTTGCCAGCTTAACCTAATCCAACTCAAGGAATGGGTATCCAGGTACTCGATGGTGTTCTTCGATGAGTACCACACAGCAACCCCAGAACAAATAGCCATAATAAGCAAGATTCACGCCCTGAAAGTTAAGACCAGGATAGTGGCTATGTCCGCAACCCCTCCGGGTACCGTAACAACTGAAGGAAGGAAATTTGACATTGAAGAAGTAGGGGTTGCCACAATAGAGAAAGGAGAGGAACCAAAAAGGGGGCGTATCGCAGTGGCCGGCATGCAGGTCCCGTTAGAAGATCTGACGGGGAAGAATTGCCTGGTGTTTGTGGCAACTAAAGAATCTGCAGAAATGGAAGCCAAAGAATTACGTGCCAAAGGGATAAATGCCACCTACTACTATTCAGGCATAGACCCGAAGACCCTGGAACACGGGATGACCAACCAGCCATACTGCATTGTGGCCACTAATGCCATCGAATCAGGCATAACCTGTCCTGATCTTGACGTGGTCATAGACACTATGCAGAAGTATGAAAAAGTAGTGAATTTCTCAGCAAAGATGCCTTTAATTGTCACCTCACTGGTAAGGAAGAAAATCACCAGGGAAGAACAAGGCCAGAGGAAAGGTCGGGTAGGGAGACAAAAGAAGGGTAAGTACTATTATCCTTCGGGGGTAGTACCGAATGGGTCGAAAGATCTAAGCTACTTGATCTTACAGGCCCAGGAGTATGGCGTCTTAGAACAAGTCAACATAACAGAGTACTTCATCACAATGAATGAGGACTGGGGTCTCTATGATGTAGACGAAGTTGAAGTGAGAATACTGGAGAGGATGAATAAGGAGATCTTGCTTCCGCTGGGTATTGTCGAGAAGCAAATCCTAGAAAGGAGCACCCATCCAGAGAAGGTAGCTCTGCTGTATAATAAACTGGTACAGAAAAGCCCTATAGTCTACCCTAGAGTACAGGATGGTGAGGTCAGCAAGGAATATAATACCCACAATCTAGCTGTATATGACAAGCTAAAGGACGTTAATCCACAGGCCATCTATGTCCTGGCTGAAGAGGAAAGGGCCACAGAGATGATGGGCTTAGAATTTGAACAGGACCCATCTGACTTACAGGACTCAGTAGTCCAGCTTTGTGAAGACATAAAAAGGTATACAAAACTTTCTGGGATCACTGAGAAGCTACTGGTGGGTACGATGGTCGGGTATATAGGGTACAAAGCTTTAACTAGAAACCACGTCCCCTGGGTCAGCAAAGAATATTCTTATGAGTTGACAGACTCCCCGGACACTTACGAGAACTCATTCGCACCTCTGGATGTGGATGTCCAAAACCCTGGAGAAAACAAGCGCCCAGAGCAACTGGTAGACCATCAACTACGGCAATTACTAGAGATTGGGAAAGACAAGACAATTGGCTTCCTAAAAGGAATTCATGAGTTCACTAGTGGGGCCATACATAGCCCAAAAGCCCTGAGTATATGGGAGAAAATATACCAGTACTTGAAGAAACATCAAGGTGAAATCGTCTCATCAGCGGCGTGGGGCAGCGCAACGGCTCTTCATGACAGCATCAAGTCTAGACTGGGCGACGAGGTCGCCACTGCAGTGATAATTCTTAAGTACCTAGCATTTGGCGAGAGGGAGTTATCTGGACTTACCAGACAAGTTCTGATTGATATCATAGTATACTACATAGTCAACAAGCCCCGGTTTGAAGGAGATGATTATGCGAAGAGAAAGGGAAGAAGGCTAGTCATCGAGGTTTTAATGGGAGCACTGGCGACTTACGCAGTATCTAATTTCTGGGGCGTGTCCATTAACAAGGTGTTACAACCAATATCCGATTACTTGCCCTATGCTACAGCCACTCTAGCATTCCTCCGTCCGACCTTTATGGAATCAGCAGTGGTGGTTGCCTCTTCCATATACAGAGCTTTTCTTTCTATTAAGCATGCAGAGAACAGGAGTCTCGTCACACAGGTCGCCTCTGCTGCTCTCGAAGTTATGGGTTTGACCCCAGTATCAGCTGGCCTAGGCGTTTTGCTAGGGCTTGGGTTGTGTGTGCTCCACATGAATATAGACAAGAATGAGGAGAAGAGGACGCTGATACTGAAAATGTTCGTTAAGAACTTCATAGACCAGGCAGCATTAGATGAACTGGACAAATTAGAGCCAGAGAAAATAATCCTCTCACTGCTAGAAGGTATTCAAACCTGCACAAACCCGGTCAGAGCCGTCATGATCCTGTACAGGGTGTACTATAAAGGGGAATCATTCACAGAAGCTTTGTCCAAGATGGCTGGGAAGTCTCTCATCGTGATGGTCATCGTGGAGTTCCTAGAACTAACGGGGCAGACCCAGGGGGGGTACATAGACCTTAGCACCAACCTTCTAACCCACTTATTAGAAAAATTAAAAAAAATGGCCAATCTTGCCATTGGGGAGGCAAGAAAGGTTTTGCTACCCATTCCATATCTGTACTGTGAAACCTGGCAATCTGACTCTAGAATTAGAGCTCCGGAATCCTATGACCAAGTGGTAGTGGAATGTAAATGCGGCGCCTTGGCGAGGTATTCCTTTTACCAAGGGGCTCATGAAATGTTAGAAGAGAGAGGAACCAAGTGGTGCAAAAATTTCTTTTTATGGGGACCCAACTTCAACAATCCAGACCCAAAGAGGATGACATTCTATGAGTATGGTCAAGCAAAAAAGTGTCCCGTGACCATCATAGGTGAAGACATAACCTTTGGCAAGTATGGTATATATGTCCAATTTGGCCACAGATCTGATGGGAAAAGGTTAATACGGGGCACCACTCATGCAACTATCAGTATGGAGGAATTGCTGGAAATTTTAACAGCTCCAAGCCAAGTGGCTATAGGCAAAGTCAAGTTGACTGACTACTGCAACCAAAAAGGGATAATAGACAGGAAACTGGCTGTAATCGAGGGTAATAAAATACACTTCTGGAAATCACACCGTGGGTCCAAGATTACAGACCAGTTGACTATTGAGAGCTTGACAGACAATCTAGGGTCAGAAATTAGGGACATCACATGGGAGCTGTATACCGGTGGGACGTGTACCGTAAAAGGGGTGTCCCTTAGGTCATGTGCACCGGAGCAAAGAAGCAAGGCCACAGTCTTGTGCGATTGCACCGACGTGCTAAGTCCCTGCTACCTAATCAACGGTAGGAAACCATCCCCATTTGACGTCGCAGAGGGCTACGAATGCCATCATCGGAAACCCCGAGCGACATATGAAGATCTGGAGATGGAAGAAATACTGAAGAGGCGCGTCCCTGTATATGACCCCTCTTGTCTGTTTGACACTGACAGCAAATTATTACCTCCTGACACTTACTACTTGGAAGAGGACCAAGAAGACTTCGAGTACGCTCTAAGGTGTTGGGGCCTTGGGGTCTATGTAGTAGACGGGCCTGTTACCTCCCCCCCGAATATAAGAATACACCATAGTTCTACATTATTACTGTTAACACCTGGAGTGGACTCTGAGTTACATCTACAGTATATAAGCTGTTACTCCCACCAGGCAGAGGTTGACATTTTCGTCAGGGACCAGTTCCTGGAGGGGGAAAACTCCACTGCGGATGTGGATGACTCTCAGGAAAGCAGTGATGAAGGAACAGAAGATGTGGTAGCAGAGGAAGAGGACACATTGTCCATAGCTGAATCTATGCCCCCGTTGGAAGAGGAAGAGGACAACGGGGAAAACATTACCTATGTGGTCGTAAGGGGATTGCAGGAAGAAAGACACACTAGTCATCTTAAATTAAATGATTGGATTAGTGAAAACATTACAGAGCCGCACAGGGTCCAAATTATGCTTGACGGAACAGTGAGAGTCACGATTAAAGAGGGCAAAGTAAAACACCTATTTGGGATATACAGAATTGAAAACACCCTGGAAGCAATGTTCAAGGAGACCATAGCTGATCTTCCTGTAGCTACCCAACCGCCCCGAGGGCCGGTTTACACAGCCAAAGAGCTAGCCCAGGGAAACGTTGCCCCAGTCCAGCCCGCAACAAATTACTATGGAATGATAGAGGGGAGAGGTGACTCGATGACAGCATTTGAAGCCTTGTCGGTCTTGCGATCACAAAAAGTCTTGACCAAAGAAGTCAGGGTAAATACCCACAGAGCACAGGCCTTCCTAGACAAAGTCAAAAAGACTACTGAAGTCAGGGCGCCAGAGTTAACACTGAAGCGCTTGCCGGTACTCGGCAAAGTTAATGGGAGGAGGTTGATTAGAGAGGAGACTAACATCCCCAACCAAAGGCTAGCGTCAATCATGACTTCAATAGGGATCAGACTAGAAAAACTGCCAGTGGTCAGAGCAAACACCTCTGGCCCAAAATTTAGGCAATCAATCTTAGAGAAGATGGACAAATATGAAAATGAGCAAGTCCCGGGGCTGCACGAAAAAATGTGGGCGGCCTTCCTGACAACGGCTCGACAAGATCTAAAAAACACATATGAGGAAGTAACATACCCTGAGCTGGAGAATGGAATCAACCGGAAAGGAGCCCCAGGTTTTTTTGAGAAAGAGAGCTCGATAGGGGAAGTATTAGAAAGGAAAGGAAAAATTGATGTTGCCATCCGGGAAATTGAGAATGGCAGTCACTTATATTATGAAACAGCCATGCCAAAAAATGAGAAAAGAGACGTGCTCGACGATTGGCTGTCTGAGGACTTTGTCACATACAAAAAACCACGTGTGATACAGTATCCAGAGGCGGTAACTCGGTTAGCCATCACCAAAATAATGTACAAGTGGGTAAAGCAAAAACCTGTAGTAATCCCCGGTTATGAGGGGAAAACCCCAATCTTTGAAATATTTGAAAAAGTTAGTGCGGATTGGGCGCAGTTTAGAAACCCTGTAGCTGTGAGCTTTGACACTAAAGCTTGGGATACTCAAGTGACGAGAGAAGACCTCAGACTGGTTGGACGAATCCAAAAATACTACTACAAAAAGAGATACTGGAAATTCATTGACAATCTTACAGCCATGATGGAGGAAGTGCCAGTGGTAACCGTAGAAGGGGACATGTTCCTCAGAGTAGGTCAGCGCGGGTCTGGGCAACCTGACACCTCTGCGGGCAATTCCATACTGAATGTGCTGACAATGCTGGTTGCCTTTTCTGAATCCACAAATCTACCTATAGCAGCTGCCTGGAAAGCCTGCCGGATCCACGTTTGTGGGGACGACGGTTTCTTAATCACGGAATCAGAACTAGGGAAGAAATTTGCAGAGAAAGGCGTCCCTTTACTAGCAGCATTTGGCAAACCCCAGAAAATCACAGAAGGAGCAAGCCTGAAGATAACCAGCAATTTCGACGGGATAGAATTCTGTAGCCACTCCCCTATCAGAGTCCAAACCCCGAATGTGCAGTGGATGCCAGCAAGGCCCACGGCGACGATCCTAGGTAAAATGAGCACTAGGCTGGGTGAAGGTGCCACTAGATCAGGAGAAGAATATGAAAAACAAGTGGCATTCGCATATTTACTAATGTACCCCTGGAACCCGCTGGTCAGGAGAATCAGCCTCCTGTTGCTATCAACTACTGACCCAACTGGGAAAGAAGAAACTCCATGTTCTGACGAGGGAGTGAAGTATGTTGGGGATCCCATCGCTGCATACAGGGACGTATGGGGGCATAAGCTAGAGGATGTGGGATACGTTGACCAGCAACAGTTATCCCGGATGAACTACAGCATGACTTACTTGGGGGTCTGGAAACCAAAAACGAGCCAACGGCTAATTGAACAGTGCTGCAGATTAGCTGAGAAAAGCAATTGCGTGGTACGCGCTGACTCCCTCGTCAAGAAGAAGGTGAGGGTCACTTATGACCCAGGGATAGGAGTAGCCCAGATCATCCGCAGGTGGGAAGAGTTGGAGTGGACTAGAAGGAGACCTACACTCACTAATGCAAACACAGAGGATGACCTTTTCCTGATCTTATGGAAGAGGCTTGCAAGCTACATTTTCCAGAAAGTGAAATTCATGCAAAAAATGTTCACCCCTTATTAAGCGAGGGGCGTTCAATTAAATACAGCCAGTATCTGGCGAATATAGAATCTGTGTAAATAAAGTTTTCAGCTGCAAGGGGCAAGTGGCCTTACAGGCTGGGGCGATCGCCGCACCCCCCCTTCCACTAGGCGCCTCAACCCCATTCTTTATGGGGTTGTTGTAAATACTTGAATAAAATGGAGTAATACGGGTAATTAACTTACAGGCCAGTATTGCCCCATTTGCTTTGTAGTGGTGACGACCTGTATAGGTCCGATCTAGATGAAGCAAGGGGGCC
| 10,464
|
OP381297.1
|
Atypical porcine pestivirus
|
Huang,J., Sun,X.
|
Qingdao Agricultural University, College of Veterinary Medicine
|
China
|
2023-04-15
|
APPV-SDHY-2022
|
Pestivirus scrofae
|
Pestivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 11,556
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Sus scrofa
| null |
2022-05
| null | null |
Atypical porcine pestivirus isolate APPV-SDHY-2022, complete genome
|
CGTTGATTGGCTGCATTATGTGTTGGACATCTCAAATTACCATGCGCCCTGCGGTGAGTGGGGGAAAGGGGTTAACCAGGCCTCTAGTACCACAGGCACCAATTGACAGGGCAACTCGAGCCTGGGAGAGAGGTACCGAACTCTTAAGTCCCGAGTACGGGGCAGACGTCACCGAGTAGTACACCCAAAGACCACCATGTTTAGGTGTAGGGTCTACTGAGGCTTGGGTGGACGTGGGCATGCCCAAAGAGAAATCGGTGGTGGACCTGGGGGTCGGGCCCACCGTGCCCCTTTATGGGGTGGACCTCACTGCTTGATAGAGTGCCGGCGGATGCCTCAGGTGAGAGTATAAAATCCGTTGTTTATTAACATGAAGAAGCAGATTACTTATTACTTAAAAAAAGAAAAACAAAGAAACGGGTGGACAGAGCTGGTGGTAGGTGAAAGTCATATGAAAATAACCACACTTTCTGGGAGGACCTACCGAGGTACTTGGGAAATGGAGAGGTGGTCAAATCCTTATGGAACCTACTTACCCAGGCCTAGCCCCCGAGAGCTCACAGCTTTACACCCACACCCGGTAGTAAACTGCAAAATGATGGAGTACAAGGGGGCTGATCCTGATTATGGCGATTGTCCAAACACAAATGGAGTGTTTATTGACGAAAAAGGTAGAAGGTTTAGTAGCCCCCCATTGGGTATTTGGAAGATAAGGCTGGACTACAATGAGCTGGTAAATATAAGTAGACCAATCTTTACCAGCGGAAGAAGTTTATACCGGGTTGAAACCTGCAGTGGGGAATTGGCCACCATAACGCTGGAGCCCGACAGGGTGCTTGTGGACGACCGTAGGGGGTTTTATCAATGGAAACCTAACTGCGAAGGAATGGTGCTCTATGTGAAGACTTGTTCTGACTGGGCAGATCAAGTAGAAAAACAGGAGAAGGAAAAACCTCCAAAACCTCAGCGACCACCAAGGCGAGACCCCCGAAAAGGATTGCAGCCACAAGTCCCTAAAGAAACTGAGATCACGGAAAAAAAGAAACAACCGAGTGTCACCTTAGTATCGGGGGGGCAAAAAGCTCAGGTCATCTATAAGGGTAAGACTAAGAATAAAAAGACTCCGGATGGGGTTTATAAGTACCCGGGGGCTAAGGAAGGGGATGTAGTGAAAGTCAAGAAAATGCTGAAGAACTGGCACATAGTCCTGGTGATGTGCCTGATATTTCTCGCAAACCCAAGTTTAGCCAAGGTCCAGTGGTTCCTAAAGGATGAGAATTCGACAGGGATAAATCAAGTACTGTGGCAAAGACAGGTAAATAGGTCTTTACATGGAGAGTGGCCCAATCAGATCTGTCACGGAATGCCAAACGAAACCATCACAGACGAGGAGCTACGCAGTCTTGGAATGATAGATACAAGCCCTAGAACAAACTACACTTGCTGTCAATTGCAGTACCATGAATGGAAAAAACATGGGTGGTGCAACTATCCACAAAAACAAGCTTGGATTAAGAGAATAGCAGCCTTACAATCCAACCTAACTGGAGCTTACGAGGGGCCTGAATGTGCAGTCATCTGCCGATTTAATGGTAGCTATAACATAGTGAGACAGGCCAGGGACGAGGTAAGCCCGTTGACAGGGTGCAAAGAAGGATATCCCTTCCTGTTTTCTGGAGAAAGATCTGACACCTCATGCCTAAAAACTCCATCCACTAGTTGGGTCAGGCCGGTGAAAATGGATGAGGCATCAGTGGCAGATAGTTTTGCCCATGGAGTAGACAAGGCAATAATACTAATTAGAAAAGGGGCATCAGGAATCATCAACTTTTTAGACACCATTGGGAGGTGGCTGCCAGTATCTGAAGCCGCCATAGTACCATATTGCGAAACTTACACTGTAACAGGGATGTATGTTCATGTGAAGCATTGCCTCCCCAGGGGACTACCTAAGCATTCGAAAATAATTTCCCCGACGATGATATACCTGGGAGAAGGTGACCCGGCCCATAATATCCAGCACTTGTTTGGCTCAGGCATAGCAAGGTGGGTCCTGGTTTTACTTGGTGTCTTGGGTGAGTGGTATGGGGAGTTGGCTTCCACGATATACTTGCTGCTGGAGTACGGAACTGAATGGTTGGAACATGAAAGTCTAGTCACGGAAGGATTGATCCCTGGTATCAATATCACAGTAGAGCTCCCCGCTAGTCACACGGTACCAGGTTGGGTGTGGGTCGCTGGCCAGTGGGTATGCGTGAAACCAGATTGGTGGCCTACGCAGATCTGGATTGAGACCGTAGTAACAGAGGTATGGCATATACTGAAAATATTGGCATTAGCTTTGGTAAATATAGTCACTGCATTCGTAAATCTGGAATTAGTCTATCTGGTTATAATACTAGTTAAAATATCAAAGGGGAACTTGATAGGCGCTATATTGTGGTGCCTCTTACTGTCAGGAGCTGAGGGGTCATGCCACAAGAGACAAGACTATTACAATATCCAACTAGTCGTTGAGGAAAAAACAGGAATAGAGAAGCGGTCTGTAATGGGTAAGTGGACTGTGATAACTAGGGATGGTAGAGAACCAAGATTAATGGAGCAAATAAATATGGTGTCGAATGAGACCCTGTCAGAAACTTACTGCTATAATAGACTGAACACCAGTAATTGGGGACGGCAACCGATGAGACAGAGAGGGTGCGGGCAAACTGTACCCTATTGGCCTGGTGACAACGCCCTTGAAGAACAATACTACAGTACAGGTTACTGGGTGAATGCAACGGGTGGTTGTCAGTTAAGGGAAGGTGTATGGCTATCAAGGAAAGGCAACGTACAGTGTCAGCGCAATGGTACTTCCTTGATATTGCAACTGGCGATAAAAGAAGAGAACGACACTATGGAAATACCATGTGACCCAGTGGAGACAGAGAGCATGGGCCCAGTAGCACAGGGCACGTGCGTGTACAGCTGGGCAGTAGCCCCAAGAGGGTGGTACTACAACAGGAAGGATGGTTACTGGCTCCAGTACATAAAGAAAAATGACTATCAGTACTGGACTAAGATGCCCACTACTTCGTCTGCTGCCACAATGTATCGTCATCTGCTCCCCCTATTGGTGGCCTGCCTCATGGGCGGTAGAATATCAGTGTGGATTGTGGCAATGCTCCTGTCTCTACAAGTGGAAGCTAGTGAAGTTGGCACCAAGCAATTAGCTGTCACCCTAACTCTATGGAAGATGGATTGGACAGAACTGTTCTTTTACGTCGTTATAATGCTAGTTGTGAAGGAAGACCTTATAAAGAAAGTGGTGACTGCAAGTCTTGTGGCCTTGAAAAACAGCCCGGTGGCTCTGAGCTTCCTTATTGTGTTAAGGCTGGTGGGGGGCAGTGAGGCGCTCCCGGTGGGCCTACTACTAGAAAAAATGTGTATAGACCAACCAGAGTTTGGAACCCCTTTCTTGATCTACCTATGGGACAACTGGAAGTGGACTGTCCTAGTTAGCTTCTCTGCATTAAATCATGAAAAGACCATAAAATTAGCAAGAAAATTACTCTTAGCCACACATGTAACAGCGCTGGCATTAACTGGCTTAAGTGACTCAATATTCTATGTGGTGCTCATAATGACCAACCTTCTAATAAAGACATTCATATATCTGTTGGGAGTCAGTATCAGCTGGGTCGAAAAAGAGAAAAAGAAGCTGCTAGTAAAGAGGAGATTAATATATAAACATGCTGCAGTCTGTCATCAAGGCGAGAACGAACTAGCTAGCAAGTTCAATAAGATAACCGTGAATGCAGACTTTACCCCATGCAGACTCGAATTGCTACAATTGCTCAGAGCTTTTCTTGTCTCTCTGTGCTTTTCCTATTACAAGCCCCTCTTGTACGCAGAGACCACCTTAACTGTAATAGTGATTGGAGTGCAGGAGTACAACGTAGCAATGGCCCGCGGGCGCAGCATGATTCACAGATTATTAGCCACGGCCTATTACATATATGGCCGCATGCAGGGGGACATGTTCCAGCTTGCCACAGCCCAGTGTCTACTGTCCAGTCCAAGAAAAATCATGAAACACATGATAGAAAATCCGGTTCTCAAGAAGCTCTGGCAAGGGGAAACGGAACTTTTCAACCAAGGTGTCAGTCAGTCCAAAATAGTTAACCCAAGGAAAATAGGGTTGGAGGAACTACACAGAGGCATGTGTGGCCTACCAACTGTAGTGCAAAATTTAGTCATATACGCAAAGAAGAATGACTCCCTTATCCTAGGAGAAGTAGGCTACCCCCCCGGGGACCTCACCAGTGATGGGTGGGAAATTCTAGGCCCTGGCAGAATCCCAAAGATTACCAACGTTGAGTCTGCCAAGATGGACCTGCTCTCCAAACTCATGACTTTCCTGGGGATTGAAACTTCCAGAGTCCCCAGAACCCCAGTCCACTCGACAAGGAAACTATTGAAGATAGTAAGAGGCATGGAAACTGGGTGGGGGTATACTCACGCAGGGGGGGTTAGCAGTGCCAAGCACGTCACAGGTGAGAAGAACTTGATGACTCATATGGAGGGCAGAAAAGGTAAATATATCCTACAATCTCAAGAACATGGTGCCGATGAGGTGGAATACGGGGTTAAGACTGATCAAAAAGCACCCGACAATGCTCTGTGTTACTGCTTCAACCCTGAAGCCACAAATATAAAAGGGGAAACAGGTGCCATGGTGTTCATGAAAAAAATAGGAAAAAAATGGACCCTCGTAACATCAGATGGCAACAAAGCTTATTATAATGTAAATAATCTTAAAGGGTGGTCCGGATTACCAATAATGTTGCACTCCACCGGAGCTATAGTAGGGAGGATTAAGTCAGCCTATTCAGACGAAAATGACCTAGTGGAGGAACTTATTGACTCTAGGACCATCAATAAGAGCAAAGAGACTAACCTGGACCACCTTATTAAGGAATTGGCTGATATGCGGAGGGGGGAGTTCCGCTCAATCACTCTAGGGACGGGCGCCGGAAAAACGACAGAACTGCCCAGACAATACCTCACCACAGTGGGTGCCCATAAGTCGGTATTGGTCCTAGTCCCTTTGAAGGCACCTGCTGAAAGCGTGTGCCGCTTTATGAGGTCCAAATATCCCACTATCAACTTTTCCCTGAGAGTCGGAGAACGGAAAGAAGGGGATGTGAGCAGTGGCATCACCTATGCTACTTACGGTTTCTGTTGCCAGCTTAACCTAATCCAACTCAAGGAATGGGTATCCAGGTACTCGATGGTGTTCTTCGATGAGTACCACACAGCAACCCCAGAACAAATAGCCATAATAAGCAAGATCCACGCCCTGAAAGTTAAGACCAGGATAGTGGCTATGTCCGCAACCCCTCCGGGTACCGTAACAACCGAAGGAAGGAGATTTGACATTGAAGAAGTAGGGGTTGCCACAATAGAGAAAGGAGAGGAACCAAAAAGGGGGCGTATCGCAGTGGCCGGCATGCAGGTCCCGTTAGAAGATCTGACGGGGAAGAATTGCCTGGTGTTTGTGGCAACTAAAGAATCTGCAGAAATGGAGGCCAAAGAATTACGTGCCAAAGGGATAAATGCCACCTACTACTATTCGGGTATAGACCCGAAGACCCTGGAACACGGGATGACCAACCAGCCATACTGCATTGTGGCCACTAATGCCATCGAATCAGGCATAACCTGTCCTGATCTTGACGTGGTCATAGACACTATGCAGAAGTATGAAAAAGTAGTGAATTTCTCAGCAAAGATGCCTTTAATTGTCACCTCACTGGTAAGGAAGAAAATCACCAGGGAAGAACAAGGCCAGAGGAAGGGTCGGGTAGGGAGACAAAAGAAGGGTAAGTACTATTATCCTTCGGGGGTAGTACCGAATGGATCGAAAGATCTAAGCTACCTGATCTTACAGGCCCAGGAGTATGGCGTCTTAGAACAAGTCAACATAACAGAGTACTTCATCACAATGAATGAGGACTGGGGCCTCTATGACGTAGATGAAGTTGAAGTGAGAATACTGGAGAGGATGAATAAGGAGATTTTGCTTCCGCTGGGTATTGTCGAGAAGCAAATCCTAGAAAGGAGCACCCACCCAGAGAAGGTAGCTCTGTTGTACAATAAACTGGTACAGAAAAGCCCTATAGTCTACCCTAGAGTACAGGATGGTGAGGTCAGCAAGGAATATAATACCCACAATCTAGCTGTATATGACAAGCTAAAGGACGTTAATCCACAGGCCATCTATGTCCTGGCTGAAGAGGAAAGGGCCACAGAGATGATGGGCTTAGAATTTGAACAGGATCCGTCTGACTTACAGGACTCAGTAGTCCAGCTTTGTGAAGACATAAAAAGGTATACAAAACTTTCTGGGATTACTGAGAAGCTACTGGTGGGTACGATGGTCGGGTATATAGGATACAAAGCTTTAACTAGAAACCACGTCCCATGGGTTAGCAAAGAATATTCTTATGAGTTGACAGACTCCCCAGACACTTACGAGAACTCATTCGCACCTCTGGATGTGGATGTCCAAAACTCTGGAGAAAACAAGCGCCCAGAGCAACTGGTAGACCACCAACTACGGCAATTACTAGAGATTGGGAAAGACAAGACAATTGGCTTCCTAAAAGGAATTCATGAGTTCACTAGTGGGGCCATACATAGTCCAAAAGCCCTGAGCATATGGGAGAAAATATACCAGTACTTGAAGAAACATCAAGGTGAAATAGTCTCATCAGCGGCGTGGGGCAGCGCAACGGCTCTTCATGACAGCATTAAGTCTAGACTGGGCGACGAGGTCGCCACTGCAGTGATAATTCTTAAGTACCTAGCATTTGGCGAGAGGGAGTTATCTGGACTTACCAGACAAGTTCTGATTGATATCATAGTATACTATATAGTCAACAAGCCCCGGTTTGAAGGAGATGATTATGCGAAGAGAAAGGGAAGAAGGCTAGTCATCGAGGTATTAATGGGAGCACTGGCGACTTACGCAGTATCTAATTTCTGGGGTGTGTCCATTAACAAGGTGTTACAACCAATATCCGATTACTTGCCCTATGCTACCGCCACTCTAGCATTCCTCCGTCCGACCTTTATGGAATCAGCAGTGGTGGTTGCCTCTTCCATATACAGAGCTTTTCTTTCTATTAAGCATGCAGAGAACAGGAGTCTCGTCACACAGGTCGCCTCTGCTGCTCTCGAAGTTATGGGTTTGACCCCAGTATCAGCTGGCCTAGGCGTTTTGCTAGGGCTTGGGTTGTGTGTGCTCCACATGAACATAGACAAGAATGAGGAGAAGAGGACGCTGATACTGAAAATGTTCGTTAAGAACTTCATAGACCAGGCAGCATTAGATGAACTAGACAAATTAGAGCCAGAGAAAATAATCCTCTCACTGCTGGAAGGTATCCAAACCTGCACAAACCCGGTCAGAGCCATCATGATCCTGTACAGGGTGTACTATAAGGGAGAATCATTCACAGAAGCTTTGTCCAAGATGGCTGGAAAGTCTCTCATCGTGATGGTCATCGTGGAGTTCCTAGAATTAACGGGGCAGACCCAGGGGGGGTACATAGATCTTAGCACCAACCTTCTAACCCACTTATTAGAAAAATTGAAAAAAATGGCCAATCTTGCTATTGGGGAGGCAAGAAAGGTTTTGCTACCCATTCCATATCTGTACTGTGAAACCTGGCAATCTGACTCTAGAATCAGAGCCCCGGAATCCTATGACCAAGTGGTAGTGGAATGTAAATGCGGCGCCTTGGCGAGGTATTCCTTCTACCAAGGGGCCCATGAAATGTTAGAAGAGAGAGGGACCAAGTGGTGCAAAAATTTCTTTTTATGGGGACCCAACTTCAACAACCCAGACCCAAAGAGGATGACATTCTATGAGTATGGTCAAGCGAAAAAGTGTCCCGTGACCATCATAGGTGAAGATATAACCTTTGGCAAGTATGGTATATATGTCCAATTTGGCCACAGATTTGATGGGAAAAGATTAATACGGGGCACCACTCATGCAACTATCAGTATGGAGGAATTGCTGGAAATTTTAACAGCTCCAAGCCAAGTGGCTATAGGCAAAGTCAAGTTGACTGACTACTGCAACCAAAAAGGGATAATAGACAGGAAACTGGCTGTAATCGAGGGTGATAAAATACACTTCTGGAAATCACACCGTGGGTCCAAGATTACAGACCAGCTGACTATTGAGAGCTTGACAGACAATCTAGGGGCAGAAATTAGGGACATCACATGGGAGCTGTATACCGGTGGGACGTGTACCGTAAAAGGGGTATCCCTTAGGTCATGTGCACCGGAGCAAAGAAGCAAGGCCACAGTCTTGTGCGATTGCACCGACGTGCTAAGTCCCTGCTACCTAATCAATGGTAGGAAACCATCCCCATTTGACGTCGCAGAGGGCTACGAATGCCATCATCGGAAACCCCGAGCGACATATGAAGATCTGGAGATGGAAGAAATACTGAAGAGGCGCGTCCCTGTATATGACCCCTCTTGTCTGTTTGACACTGACAGCAAATTATTACCTCCTGACACTTACTACTTGGAAGAGGATCAAGAAGACTTCGAGTACGCTCTAAGGTGTTGGGGCCTTGGGGTCTATGTAGTAGACGGGCCCGTTACCTCCCCCCCGAACATAAGAATACACCATAGTTCTACATTACTACTGTTAACACCTGGAGTGGACTCTGAGTTACATCTACAGTATATAAGCTGTTACTCCCACCAGGCAGAGGTTGACATTTTCATCAGGGACCAATTCCTGGAGGGGGAAAACTCCACTGCGGATGTGGATGACTCTCAGGAAAGCAGCGATGAAGGAACAGAAGATGTGGTAGCAGAGGAAGAGGACACATTGTCCATAGCAGAATCTATGCCCCCGTTGGAAGAGGAAGAGGACAACGGGGAAAACATTACCTATGTGGTCGTAAGGGGATTGCAGGAAGAAAGACACACTAGTCATCTTAAATTAAACGATTGGATTAGTGAAAACATTACAGAGCCGCACAGGGTCCAAATTATGCTTGACGGAACAGTGAGGGTCACGATTAAAGAGGGCAAAGTAAAACACCTATTTGGGATATACAGAATTGAAAACACCCTGGAAGCAATGTTCAAGGAGACCATAGCTGATCTTCCTGTAGCTACCCAACCGCCCCGAGGGCCTGTTTATACAGCCAAAGAGCTAGCCCAGGGGAACGTTGCCCCAGTTCAGCCCGCGACAAATTACTATGGAATGATAGAGGGGAGAGGTGACTCGATGACAGCATTCGAAGCTTTGTCTGTCTTGCGAACACAAAAAGTCTTGACCAAAGAAGTCAGGGTAAATACCTACAGGGCACAGGCCTTCCTAAACAAAGTCAAAAAGACTACTGAAGTCAGGGCACCAGAGCTAACACTGAAGCGCTTGCCGGTACTCGGCAAAGTTAATGGGAGGAGGTTGATTAGAGAGGAGACTAACATCCCCAACCAAAGGCTAGCGTCAATCATGACTTCAATAGGGATCAGACTAGAAAAACTGCCAGTGGTCAGAGCAAACACCTCTGGCCCAAAATTTAGGCAATCAATCTTAGAGAAGATGGACAAATATGAAAATGAGCAAGTCCCGGGGCTGCACGAAAAAATGTGGGCGGCTTTCCTGACAACGGCTCGACAAGATCTAAAAAACACATATGAGGAAGTAACATACCCTGAGCTGGAGAATGGAATTAACCGGAAAGGAGCCCCAGGTTTTTTTGAGAAAGAGAGCTCGATAGGGGAAGTATTAGAAAGGAAAGGAAAAATTGATGTTGCCATCCGGGAAATTGAGAATGGTAGTCACTTATATTATGAAACAGCTATGCCAAAAAATGAGAAAAGAGACGTGCTCGACGATTGGCTGTCTGAGGACTTCGTCACATACAAAAAACCACGTGTGATACAGTATCCAGAGGCGGTAACTCGGTTAGCTATCACCAAAATAATGTACAAGTGGGTAAAGCAAAAACCCATAGTGATCCCCGGTTATGAGGGGAAAACCCCAATCTTTGAAATATTTGAAAAGGTCAGTGAGGATTGGGCGCAGTTTAGAAACCCTGTAGCTGTGAGCTTTGACACTAAAGCTTGGGATACTCAAGTGACGAGAGAAGACCTCAGACTGGTTGGACGAATCCAAAAATACTACTATAAAAAGAGATACTGGAAATTCATTGACAATCTTACAGCCATGATGGAGGAAGTGCCAGTGGTAACTGTAGAAGGGGACATGTTCCTCAGAGTAGGTCAGCGCGGGTCTGGGCAACCTGACACCTCGGCGGGCAATTCCATACTAAATGTGCTGACAATGCTGGTCGCCTTTTCTGAATCCACAAATCTACCTATAGCAGCTGCCTGGAAAGCCTGCCGGATCCACGTTTGTGGGGACGACGGTTTCTTAATCACGGAATCAGAACTAGGGAAGAAATTTGCAGAGAAAGGCGTCCCTTTACTAGCAGCATTTGGCAAACCACAGAAAATCACAGAAGGAGCAAGCTTGAAGATAACCAGCAATTTCGACGGGATAGAATTCTGTAGTCACTCCCCTATCAGAGTCCAAACCCCGAATGTGCAGTGGATGCCAGCAAGGCCCACGGCGACGATCCTAGGTAAAATGAGCACTAGGCTGGGTGAAGGTGCCACTAGATCAGGAGAAGAATATGAAAAACAAGTGGCATTCGCATATTTACTAATGTACCCCTGGAACCCGCTGGTTAGGAGAATCAGCCTCCTATTGCTATCAACTACTGACCCAACTGGGAAAGAAGAAACCCCATGCTCCGACGAGGGAGTGAAGTATGTTGGGGATCCCATCGCTGCATACAGGGACGTATGGGGGCATAAGCTAGAGGATGTGGGATACGTTGACCAGCCACAGTTATCCCGGATGAACTACAGCATGACTTACTTGGGGGTCTGGAAACCAAAAACGAGCCAGCGGTTAGTTGAACAGTGCTGCAGATTAGCTGAGAAGAGCAATTGCGTGGTACGTGCTGACTCCCTCGTTAAGAAGAAGGTGAGGGTCACTTATGACCCAGGGATAGGAGTAGCCCAGATCATTCGCAGGTGGGAAGAGTTAGAGTGGACTAGAAGGAGACCTACACTCACTAATGCAAACACAGAGGATGACCTTTTCCTGATCTTATGGAAGAGGCTTGCAAGCTACATTTTCCAGAAAGTGAAATTTATGCAAAAAATGCTCACCCCTTATTAAGTGAGGGGCGTCCAATTAAATATAGCCAGTATCTGGTAAATATAGAATCTGTGTAAATAAAGTTTTCAGCTGCAAGGGGCAAGTGGCCTTACAGGCTGGGGCGATCGCCGCACCCCCCCTTCCACTAGGCGCCTCAACCCCATTCTCTATGGGGTTGTTGTAAATACTTGAATAAAATGGAGTAATACGGGTAATTAACTTACAGGCCAGTATTGCCCCATTTGCTTTGTAGTGGTGACGACCTGTATAGGTCCGATCTAGATGAAGCAAGGGGGCCC
| 16,694
|
OL603844.1
|
Atypical porcine pestivirus
|
Hou,Z., Liu,W., Cao,N., Xu,D., Tian,Y., Huang,Y., Fu,X.
|
Zhongkai University of Agriculture and Engineering, College of Animal Science & Technology
|
China
|
2023-01-15
| null |
Pestivirus scrofae
|
Pestivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 10,989
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Sus scrofa
| null |
2018-03
| null | null |
Atypical porcine pestivirus strain APPV-China/GD-ZK/2018, complete genome
|
CAGGTAAGAGTATAAAATCCGTTGTTTATTAACATGAAGAAGCAGATTACTTATTACTTAAAAAAAGAAAAACAAAGAAACGGGTGGACAGAACTGGTGGTGGGAGAAAGTCACATGAAAATAACTACACTTTCCGGAAGGACCTACCGAGGTACTTGGGAAATGGAGAAGTGGTCAAATCCCTATGGAACCTACTTACCCAGGCCTAGCCCCCAACAACTTACAGCCCTGCACCCACACCCGGTGGTGAACTGCAAGATGATTGAGTACGAGGGGGTGGATCCTGATTATGGTGATTGCCCAAACACAAATGGGGTGTTTATTGACGAAAAAGGTAGAAGGTTTAGTAGTCCTCCATTGGGTATTTGGAAGATAAGACTGGACTACAATGAACTAGTAAATGTAAGCCGACCAATCTTTACTAGCGGAAGAAATTCATACCAGGTTGAAACCTGCAGTGGGGAATTGGCTACCATAACACTGGAGCACGATAGGGTTCTCGTGGACGACTGTAGGGGGTTTTATCAATGGAAACCCAACTGTGAAGGAATGGTGCTTTATGTGAAGACCTGTTCTGATTGGGCAGATCAAGTGGAAAAACAGGAGAAGGAAAAACCTCCGAAACCTCAACGACCACCAAGACGAGACCCACGAAAAGGGTTACAGCCACAAGTCCCCAAAGAAACTGAGATCACGGAAAAAAAGAAACAGCCGAGTGTCACCTTAGTATCAGGGGGGCAAAAAGCCCAAGTCATCTATAAGGGTAGGACCAAGAATAAAAAGACTCCAGATGGGGTTTATAAGTACCCAGGGGCTAAGGAAGGGGATGTAGTGAAAGTTAAGAAAATGCTGAAGAACTGGCACATAGCCCTGGTGATGTGCCTGATATTTTTCGCAAATCCAAGTCTAGCCAAGGTCCAGTGGTTCCTAAAGGATGAGAATTCAACAGGAATAAATCGAGTACTGTGGCAAAGACAGGTAAACAGGTCCCTACATGGAGAATGGCCTAATCAGATCTGTCGCGGAATGCCAAACGAAACCATCACGGACGAGGAGCTACGCAGTCTTGGAATGATAGATACAAGCCCTAGAACAAACTACACTTGCTGCCAATTGCAATACCATGAATGGAAGAAACACGGGTGGTGCAACTATCCACAAAAACAAGTTTGGATTAAGAGAATAGCAGCCTTACAATCTAACCTAACCGGAACTTATGAGGGACCTGAATGTGCAGTCATCTGCCGATTTAATGGCAGTTATAACATAGTGAGACAGGCCAGAGACGAAGTAAGCCCGTTGACAGGGTGTAAAGAAGGATATCCCTTCCTGTTTTCTGGAGAAAGATCTGACACCTCATGTCTAAAACCTCCATCCACTAGTTGGGTTAGACCAGTAAAAATGGATGAGGCATCAGTGGCAGATAGCTTCGCCCATGGAGTAGACAAGGCGATAATATTAATTAGAAAAGGGGCATCAGGAATTATCAACTTTTTAGACACCATTGGGAGATGGTTGCCAGTGGCTGAGGCCGCCATAGTACCATATTGCGAAACCTATACTGTAACAGGGATGTATGTTCATGTGAAGCATTGCCTCCCTAAGGGGCTACCAAAGCATTCAAAAATAATTTCCCCAACGATGATATACCTGGGGGAAGGTGACCCAGCCCATAATATCCAGCATTTGTTTGGCTCAGGCATAGCAAAGTGGGTCCTAGTCTTACTTGGTATCTTGGGTGAGTGGTATGGGGAGTTGGCCTCCACGATATATCTATTACTGGAGTACGGGACTGAATGGTTGGAACATGAAAGCCTAGTCACAGAAGGGTTGATCCCTGGCATCAATATCACAGTAGAGCTCCCCGCTAGTCACACGGTACCAGGCTGGGTGTGGGTCGCTGGCCAGTGGGTTTGTGTGAAACCAGACTGGTGGCCTACACAGATTTGGATTGAAACCATAGTGACAGAGGTATGGCATATACTGAAAATATTGGCATCAGCTTTGGTAAACATAGTCACTGCATTCGTAAACCTAGAGTTAGTCTATCTGGTCATAATATTAGTCAAAATATCAAAGGGGAACTTGATAGGCGCTATATTGTGGTGCCTCTTGCTGTCAGGAGCCGAGGGGTCGTGCCACAGAAGACAAGACTATTACAACATCCAACTGGTCGTCGAGGAAAAAACAGGAATAGAGAAGCGATCCATAATTGGCAAGTGGACTGTGATAACTAGGGAAGGTAGAGAACCAAGGTTAATGGAGCAGATAAATATGGTGTCGAATGAGACCCTATCAGAAACTTATTGCTACAACAGGCTGAATACCAGTAGCTGGGGAAGGCAACCGATAAGACAGAGGGGGTGTGGGCAGACTGTACCCTATTGGCCTGGTGACAACGTCCTTGAGGAGCAATACTACAGCACAGGTTACTGGGTGAATGCAACAGGTGGTTGCCAGTTAAGGGAAGGTGTGTGGCTATCAAGGAAAGGCAACGTGCAGTGTCAGCGTAATGGTACTTCCTTGATGCTGCAACTAGCAATAAAAAAAGAGAACGACACCATGGAAATACCATGCGACCCAGTGGAAACTGAAAGCATGGGCCCAGTAGCACAGGGCACCTGCGTGTACAGCTGGGCAGTTGCCCCAAGAGGGTGGTACTACAACAGGAAGGACGGTTACTGGCTCCAGTACATAAAGAAAAATGACTATCAGTACTGGACTAAGATGCCCACCACTTCGTCTGCTGCTACAATGTATCGCCATCTGCTCCCCCTATTGGTGGCCTGCCTCATGGGCGGTAGAATATCAGTGTGGATTGTGGCAATGCTTCTGTCTCTACAAGTGGAAGCTAGTGAAGTTGGCACCAAGCAATTAGCCGTCACCCTAACTCTATGGAAGATGGATTGGACAGAACTGCTCTTTTACGTCGTCTTAATGCTAGTTGTTAAGGAAGACCTAATAAAGAAAATGGTGACTGCAAGTCTTGTGGCCTTGAAAAACAGCCCGGTGGCCTTGAGCTTTCTTATTGTACTCAGGCTGGTGGGGGGTAGCGAGGCGCTCCCGGTGGGCCTATTGCTAGAAAAAATGTGTATAGACCAACCAGAGTTTGGAACCCCTTTCTTGATCTATCTATGGGACAACTGGAAGTGGACTGTCTTAGTTAGCTTCTCTGCATTAAATCATGAAAAGACTATAAAATTGGCAAGAAAATTACTGTTAGCCACGCATATAACAGCACTGACATTAACTGGTTTAAGTGACTCAATATTCTACGTGGTGCTCATAATGACCAACCTTTTAATAAAGACATTTATATATTTATTGGGAGCCAGTATCAGCTGGGTCGAAAAAGAGAAGAAGAAGTTGCTGGTAAAGAGGAGATTAATATATAAACATGCTGCAATCTGTCATCAAGACGAGAACGAACTAGCCAGCAAGTTCAACAGGATAACTGTGAATGCAGATTTCACCCCATGCAGACTCGAATTGCTACAATTGCTCAGAGCTTTTCTTGTCTCCCTGTGTTTTTCCTACTACAAGCCCCTCTTGTACGCTGAGACCACCTTAACTGTGATAGTGATTGGAGTGCAGGAGTACAACGTAGCAATGGCCCGCGGGCGAAGCATGATTCACAGATTGTTAGCTACGGCCTATTACATATATGGCCGTATACAGGGGGACATGTTCCAGCTCGCTACAGCCCAATGTCTGCTATCCAGCCCAAGGAAAATCATGAAACATATGATAGAAAATCCGATCCTCAAGAAGCTCTGGCAAGGAGAAACTGAACTTTTCAACCAGGGGGTCAGTCAGTCCAGAATAGTCAACCCAAAGAAAATAGGGTTGGAGGAATTACACAAAGGCATGTGTGGCCTACCAACCGTAGTACAAAATTTAGTCATATACGCAAAGAAGAATGACTCCCTTATCTTAGGAGAAGTAGGCTACCCCCCTGGGGACCTCACCAGTGATGGGTGGGAAATCCTAGGCCCTGGCAGAATTCCGAAGATCACCAACGTTGAGTCTGCCAAGATGGACCTGCTCTCTAAACTCATGACCTTCCTGGGGATCGAAACTTCTAGGGTCCCCAGAACCCCAGTCCACTCGACAAGGAAACTACTGAAGATAGTAAGAGGCATGGAAACTGGGTGGGGGTATACTCACGCAGGGGGGGTTAGCAGCGCTAAACATGTCACAGGTGAGAAGAACTTGATGACCCATATGGAGGGCAGAAAAGGTAAATACATCCTACAATCTCAAGAACATGGTGCCGATGAGGTGGAATACGGGGTGAAGACAGATCAAAAAGCACCCGACAATGCTTTGTGTTACTGCTTTAACCCTGAAGCTACAAATATAAAAGGAGAAACAGGTGCCATGGTGTTCATGAAGAGAATAGGAAAGAAATGGACCCTTGTAACATCAGATGGCAATAAAGCTTATTACAATGTAAATAATCTTAAAGGGTGGTCCGGATTACCAATAATGTTGCACTCCACTGGAGCTATAGTAGGGAGGATTAAGTCAGCCTATTCAGACGAAAATGACCTAGTGGAGGAACTTATTGATTCTAGGACCATCAATAAGAGCAAAGAGACTAACCTGGACCACCTTATCAAGGAATTGGCTGATATGCGGAGGGGGGAGTTCCGCTCAATCACCCTAGGAACGGGTGCCGGAAAAACGACAGAACTGCCCAGACAATACCTCACCACAGTAGGTGCCCATAAGTCAGTATTGGTCCTGGTCCCTTTGAAAGCACCTGCTGAAAGTGTGTGCCGCTTTATGAGGTCCAAATACCCCACCATCAACTTTTCCCTGAGAGTCGGAGAACGGAAAGAGGGGGACGTGAGCAGCGGCATCACCTATGCCACTTACGGTTTCTGCTGCCAGCTTAACCTAATCCAACTCAAGGAATGGGTATCTAGGTACTCGATGGTGTTCTTCGATGAGTACCACACAGCGACCCCAGAACAAATAGCCATAATAAGCAAGATCCATGCACTGAAAGTTAAGACCAGGATAGTGGCTATGTCCGCAACCCCTCCGGGCACTGTAACAACCGAAGGAAGAAGATTTGACATTGAAGAAGTAGGGGTTGCCACAATAGAGAAAGGAGAAGAACCAAAAAGGGGGCGCATCGCAGTGGCCGGCATGCAGGTCCCGTTGGAAGACCTGACGGGGAAGAATTGCCTAGTGTTTGTGGCAACTAAGGAATCTGCAGAGATGGAGGCCAAAGAATTACGTGCCAAAGGAATAAATGCCACCTACTACTATTCAGGCATAGACCCAAAGACCCTGGAACATGGGATGACTAACCAGCCATACTGCATTGTGGCCACCAATGCCATCGAGTCAGGTATAACCTGCCCTGATCTTGATGTGGTCATAGACACTATGCAGAAGTACGAAAAAGTAGTGAATTTTTCGGCAAAGATGCCTTTAATTGTTACCTCACTGGTAAGGAAGAAAATCACCAGGGAAGAACAAGGCCAAAGGAAAGGTCGGGTTGGGAGGCAAAAGAAGGGTAAGTACTATTATCCATCGGGTGTGGTACCGAACGGATCGAAAGATCTCAGTTACTTAATTTTGCAGGCTCAGGAGTACGGTGTCTTGGAACAAGTCAACATAACAGAGTACTTCATCACAATGAATGAGGACTGGGGTCTCTATGACGTAGATGAAGTTGAAGTGAGAATACTGGAGAGGATGAATAAGGAGATCCTGCTTCCGCTAGGCATCGTCGAGAAGCAAATCCTAGAAAGGAGCACTCACCCAGAGAAGGTGGCACTGCTGTATAATAAACTGGTACAGAAAAGCCCTATAGTTTACCCTAGAGTGCAGGATGGTGAGGTCAGCAAGGAATATAATACCCACAATTTAGCTGTATATGACAAACTAAAGGATGTAAATCCACAAGCCATCTATGTCCTGGCTGAAGAGGAAAGGGCCACAGAGATGATGGGCCTAGAATTTGAGCAGGACCCATCTGATTTACAGGACTCAGTAGTCCAACTTTGTGAAGACATAAAAAGGTATACAAAACTTTCTGGGATCACTGAGAAGCTACTGGTGGGTACAATGGTCGGGTATATAGGATATAAAGCTTTAACTAGAAACCATGTCCCCTGGGTCAGCAAAGAATACTCTTATGAGTTGACTGACTCCCCAGACACTTACGAAAACTCATTCGCACCTCTGGATGTGGATGTCCAAAACCCTGGGGAAAACAAGCGTCCAGAGCAGCTGGCAGACCATCAACTACGGCAATTACTAGAGATTGGGAAAGACAAGACAATCGGCTTCTTAAAAGGAATTCGTGAGTTCACTAGTGGGGCTATGAATAGTCCAAAAGCCCTGAGCATATGGGAGAAAATATACCAGTACCTGAAGAAACATCAAGGTGAAATCGTCTCATCAGCGGCATGGGGCAGTGCGACGGCTCTCCACGACAGTATCAAGTCTAGACTGGGGGACGAAGTTGCTACCGCAGTGATAATTCTCAAGTACCTAGCATTTGGAGACAGGGAGTTATCTGGACTTACCAGACAGGTCCTGATTGACATCATAGTATACTACATAGTCAACAAGCCTCGGTTTGAAGGAGACGATTATGCAAAGAGAAAGGGAAGAAGGCTAGTCATCGAGGTATTAATGGGAGCACTAGCGACTTACGCAGTGTCCAATTTTTGGGGCGTGTCCATTAACAAGGTGTTACAACCAATATCTGATTACCTGCCCTATGCTACCGCCACTCTAGCATTCCTCCGTCCGACCTTTATGGAATCAGCAGTGGTGGTTGCCTCTTCCATCTACAGAGCCTTCCTTTCTATCAAGCATGCAGAAAACAGGAGTCTCGTCACACAGGTTGCCTCTGCTGCTCTTGAAGTCATGGGCTTGACTCCAGTATCAGCTGGCCTAGGCGTTTTGCTAGGGCTTGGGCTGTGTGTGCTCCACATGAACATAGACAAGAACGAGGAGAAGAGGACTCTGATACTGAAAATGTTCGTCAAGAACTTCATAGACCAGGCAGCATTAGATGAATTGGACAAATTAGAGCCAGAGAAAATAATCCTCTCATTGCTGGAAGGTATTCAAACCTGCACAAACCCGGTCAGAGCCATTATGATCCTGTACAGGGTGTATTATAAGGGAGAATCATTCACGGAAGCCTTGTCCAAGATGGCTGGGAAGTCTCTCATTGTGATGGTCATCGTTGAGTTCCTAGAACTAACGGGGCAGACCCAGGGGGGGTACATAGACCTTAGCACCAACCTTCTAACCCATTTATTAGAAAAATTGAAGAAGATGGCCAATCTTGCTATTGGAGAGGCTAGAAAGGTTTTGCTGCCTATTCCATATCTGTATTGTGAAACCTGGCAGTCTGACCCTAGAATCAGAGCTCCGGAATCCTATGATCAAGTGGTGGTAGAATGTAAATGTGGCGCCCTGGCGAGATATTCCTTCCACCAAGGGGTCCACGAAATGCTGGAAGAGAGAGGGACCAAGTGGTGCAAAAATTTTTTTTTATGGGGACCCAACTTTAACAACCCAGACCCAAAGAGGATGACATTTTATGAGTATGGTCAAGCAAAAAAGTGTCCCGTGACTATCATAGGTGAAGATATAACCTTTGGTAAATATGGCATATATGTCCAATTTGGTCATAGACCTGATGGGAAAAGGTTAATACGGGGCACCACTCATGCAACTATCAGTATGGAAGAACTGCTGGAAATTTTAACGGCCCCAAGTCAAGTGGCTATAGGCAAAGTCAAATTGACTGACTATTGCAACCAAAAAGGGATGATAGATAGGAAACTGGCTGTAATCGAGGGTGATAAAATACACTTCTGGAAATCACACCGTGGGTCCAAGATTACAGACCAGCTGACCATTGAGAGCCTGACAGACGACCTAGGGTCAGAAATTAGGGACATTACATGGGACCTGTATGCAGGCGGGACATGTACCGTAAAAGGGGTTTCCCTTAGGTCATGTGCACGGGAGCAAAGAAGCAAGGCCACAGTCTTATGCGATTGCACCGACGTGCTAAGTCCCTGCTACTTAATCAATGGCAGGAAACCTTCCCCATTTGATGTCGCAGAGGGTTATGAATGCCATCATCGGAAACCCCGAGCGACATATGAAGACCTGGAGATGGAAGAAATACTGAAGAGGCGCGTCCCTGTATATGACCCCTCTTGTCTGTTTGATACTGATAGCAAATTATTACCTCCTGACACTTACTATTTGGAAGAGGACCAGGAAGACTTCGAGTATGCCCTAAGGTGTTGGGGTCTTGGGGTCTATGTAGTAGACGGGCCCGTTACCTCCCCCCCGAGCATAAGAATACACCATAGTTCCACATTGCTATTGTTGACACCTGGAGTGGACTCTGAGTTACATTTACAGTATATAAGCTGTTACTCCCACCAGGCAGAGGTAGACATTTTTGTCAGGGAACAATTCCTAGAAAGGGAAAACTCTACTGCGGACGTGGATGACTCTCTGGGAAGCAGTGATGAAGGAACAGAAGATGTGGCGGCAGAGGAGGAGGACACACTGTCCATAGCAGAATCTATGCCCCCATTGGAAGAAGAAGAGGACAACGGAGAAACTATTACCTATGTGGTCATAAGGGGATTGCAGGAAGAAAGACACATTAGCCACCTTAAATTAAACGACTGGATTAGTGAAAACATTACAGAGCCGCACAAGGTCCAAATTATGCTTGATGGAACAGTGAGAGTCACGATAAAAGAGGGCAAAGTAAAACACCTATTTGGGATATACAGAATTGAAAACACCCTGGAAGCAATGTTCAAGGAGACCATAGCTGATCTTCCTGTAGCCACCCAACCGCCCCGAGGGCCCATTTACACAGCCAAAGAGCTAGCTCAGGGAAACGTTGCCCCGGTCCAGCCCGCAACGAATTACTATGGAATGATAGAGGGGAGGGGTGACTCGATGACAGCATTTGAAGCCTTGTCAGTCCTGCGATCACAAAAAGTCTTGACCAAAGAGGTCAGGGTAAATACCCACAAGGCACAGGCCTTCCTAAACAAGGTTAAAAAGACCACTGAGGTCAGAGCACCAGAGCTAACACTGAAGCGCTTGCTGGTACTCGGCAAAGTGAATGGGAGGAGGTTGATCAGAGAAGAGACCAACATCCCCAACCAAAGGTTAGCGTCTATCATGACATCAATAGGGATCAGACTAGAAAAACTGCCAGTGGTCAGAGCAAACACCTCTGGCCCGAAATTTAGGCAATCAATCCTAGAGAAGATGGATAAGCATGAAAATGAGCAAGTCCCGGGGTTGCACGAAAAAATGTGGGCGGCCTTCCTGGCGACGGCTCGACAAGATTTAAAAAACACATATGAGGAAGTGACCTATCCTGAGTTGGAGAATGGAATCAACCGGAAAGGAGCCCCAGGTTTCTTTGAGAAGGAGAGCTCGATAGGGGAAGTACTGGAAAAGAAAGAAAAAATTGATGTTGCTATCCGGGAAATTGAGAATGGCAGTCACTTATATTATGAAACAGCCATGCCCAAAAATGAGAAAAGAGATGTGCTCGACGATTGGCTGTCTGAGGACTTCGTCACGTACAAAAAGCCACGTGTAATACAGTATCCAGAGGCGGTCACTCGGCTAGCTATCACCAAAATAATGTACAAGTGGGTAAAGCAAAAGCCCGTAGTAATCCCCGGTTATGAGGGGAAAACCCCAATCTTTGAAATATTTGAAAAAGTTAGTGCGGATTGGGCGCAGTTTAGAAACCCTGTAGCTGTGAGTTTTGATACTAAAGCTTGGGATACTCAAGTGACAAGAGAAGACCTCAGACTGGTAGGACGAATCCAAAAATACTACTATAAAAAGAGATACTGGAAATTTATTGATAATCTTACAGCCATGATGGAGGAAGTGCCGGTGGTCACTGTAGAAGGAGACATGTTCCTCAGAGTAGGCCAGCGCGGATCCGGGCAACCTGACACCTCGGCGGGCAATTCCATACTAAATGTGCTGACAATGCTGGTAGCTTTTTCTGAATCTACAAATCTACCTATAGCAGCCGCCTGGAAAGCCTGCCGGATCCACGTCTGTGGGGACGACGGCTTCTTGATTACGGAATTGGAACTAGGGAAGAAATTTGCAGAGAAAGGCGTCCCTTTACTAGCAGCATTTGGTAAACCCCAGAAGATCACAGAAGGAGCAAGCCTAAAGATAACTAGTAATTTTGATGGGATAGAATTCTGTAGTCACTCCCCTATCAGAGTCCAAACCCCGAATGTGCAGTGGATGCCAGCAAGGCCCACGGCGACGATCCTAGGTAAAATGAGTACTAGGCTGGGTGAAGGTGCCACTAGATCAGGAGAAGAATATGAAAAACAAGTGGCATTTGCATACTTACTGATGTACCCTTGGAACCCACTGGTTAGGAGAATCAGCCTCCTACTGCTATCAACTACTGACCCAACTGGGAAAGAAGAAACCCCATGTTCCGACGAGGGAGTGAAGTATGTCGGGGATCCCGTCGCAGCATACAGGGACGTGTGGGGACATAAGCTAGAGGATGTGGGACATGTTGACCAACCACAATTATCCCGGATGAACTACAGCATGACTTACTTGGGGGTTTGGAAACCAAAAACGAGCCAGCGGTTAGTTGAACAGTGCTGCAGATTAGCTGAAAAAAGCAATTGTGTGGTACGCGCTGACTCCCTCATCAAGAAGAAGGTGAAGGTCACATATGACCCAGGGATAGGAGTAGCCCAAATCATCCGCAGGTGGGAAGAGTTAGAGTGGACTAGAAGGAGACCTACACTCACTAATGCAGACACAGAAGATGACCTTTTCCTAGCCTTATGGAAGAGGCTTGCAAGATACATTTTCCAGAAAATGAAATTCATGCAAAAAATGCTCACCCCTTATTAAGCGGGGGGCGTTCAATTAAATACAGCCAGCATCTGGCGAACATAGAAT
| 19,421
|
OL603845.1
|
Atypical porcine pestivirus
|
Hou,Z., Liu,W., Cao,N., Xu,D., Tian,Y., Huang,Y., Fu,X.
|
Zhongkai University of Agriculture and Engineering, College of Animal Science & Technology
|
China
|
2023-01-15
| null |
Pestivirus scrofae
|
Pestivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 10,989
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Sus scrofa
| null |
2017-05
| null | null |
Atypical porcine pestivirus strain APPV-China/GX-WZ/2017, complete genome
|
CAGGTAAGAGTATAAAATCCGTTGTCTATTAACATGGAAAAGCAGATTTCATATTACTTAAAAAAAGAAAAACAAAAAAATGGGTGGACGGAACTGGTGGTAGGAGAAAGTAGTACAAAAATAACTACGCTATCTGGAAAGACCTATCGAGGAACTTGGGAGATGGAGAAACGAACGAACCCTTACGGAACCTATCTCCCCAGACCTAGTCCTCAACAGCTTACAGCCCTACACCCCCACCCAGTGGTGAATTGTAAGGTGGTTGAGTACAAGGGGGTGGACCCTAATTATGGTGATTGCCCGAATACAAATGGGGTATTTATCGACGAAAAGGGTAGAAGGCTGAGCAGCCCCCCATTGGGTATTTGGAAGATAAGACTGGACTATAGTGACCTGGTAAATATAAATAGGCCAATCCCCGCTAGTGGGATGAACTCTTACCGAGTCGAGACATGCAGTGGGGAGTTGGCTATTGTAACACCGCTACATGATAGGGTGCTTGTAGAAGACTACAGGAGACTATATCAATGGAAACCCAACTGTGAAGGGATAGTACTCTATGTGAAAACATGTTCTGATTGGGCAGACCAGGTTGAAAAACAAGAGAGGGAAAGTCCTCCAAAACCCCAGCGACCACCAAGGCGAGACCCACGAAAAGGGTTGCAACCACAAGTCCCCAAAGAGACTGAGGTCACAGAAAAGAAGAAACAACCCAGTGTCACCTTAGTATCGGGGGGGCAGAAGGCCCAAGTTATCTACAAAGGCAAGACTAAGAACAAAAAGACTCCGGATGGAGTCTATAAGTATCCAGGAGCTAAAGAGGGGGACGTAGTGAAGGTCAGGAAGATGTTGAAGAATTGGCATATAGCCTTAGTAATGTACTTGATGTATATCATAACCCCAAGCTTTGCTAAGGTCCAGTGGTTCTTAAAGGATGAAAACTCGACGGGGATCAGTCAGATACTGTGGCAAAGACGAATCAATAGATCTCTGCATGGAGAATGGCCTAACCAGATCTGCCACGGCATGCCGAATGAAACTATCACTGATGAGGAATTACGTAGTCTGGGAATGATAGATACAAGCCCCAGAACAAATTACACCTGTTGCCAGCTGCAATATCATGAGTGGAAGAAACATGGTTGGTGCAACTACCCACAAAAACAGGCTTGGATCAGGAGGATAACAGCCTTACAAGCTAACCTCACTGGAGCTTATGAGGGACCTGAATGTGCTGTCATCTGTCGATTTAATGGCAGCTATAACATAGTAAAACAGGCCAGAGACGAGGTGAGTCCACTGACAGGGTGTAAAGAAGGGCATCCTTTTCTATTTTCTGGTGAAAGATCCGACTCCTCATGCCTGAGGCCTCCTTCCACTAGTTGGGTAAGACCAGTAAAGATGGACGAGGCATCAATGGCCGACGGCTTCGCTCATGGTGTCGACAGGGCAATAATCCTGATTAGAAAAGGGGCATCAGGAATCATCAATTTCTTAGATGCTATTGGGAGGTGGTTACCTATAGCTGAAGCAGCTATAGTACCATATTGTGAAACTTACACCGTGACGGGGATGTACGTCCATGTGAAGAATTGCCTCCCTAGAGGGTTACCTAAGCATTCAAAAATAATTTCCCCGACAATGATATATCTGGGGGAGGGTGACCCAGCCCACAACATTCAGCACTTGTTTGGCTCAGGCATAGCAAAGTGGGTCCTAGTCTTACTTGGGGTTCTGGGTGAATGGTATGGAGAATTGGCCTCTACGATATATCTACTATTAGAGTATGGGTCTGAGTGGTTAGAACATGAAAGCCTGGTCACGGAAGGGTTGATCCCTGGCATTAATATTACAATAGAACTTCCAGCCAGTCATACGGTGCCTGGTTGGATTTGGGTCGCAGGCCAGTGGGTATGCGTGAAGCCAGACTGGTGGCCTACACAGATTTGGATTGAAACCGTGGTAACAGAGGTCTGGCATATACTAAAAATACTGGCATCAGCCCTGGTGAATATAGTCACTGCCTTTGTAAACCTGGAACTGGTCTACCTGGTCATAATATTAGTCAAAATATCAAAGGGGAACCTAATAGGCGCCATACTATGGTGCCTATTACTGTCAGGGGCCGAAGGCTCATGCCACAAAAGACAAGACTATTACAGTCTCCAGTTAGTTGTCGAAGAAAAAACAGGCGTAGAAAAACGATCCGTGGTGGGCAAGTGGACTGTGATAACCAGGGAAGACCGAGAACCAAGATTAATGGAGCAAATAAATATGGTGTCAAATGGTAGCCTGTCAGAAACTTACTGCTATAATAGGCTAAATACCAGTAGTTGGGGACGACAACCGGCAAGACAGAGAGGGTGTGGTCAGACTGTGCCCTATTGGCCTGGTGATAACGTTCTAGAAGAACAATACTATAGTACAGGTTACTGGGTGAACGCAACAGGCGGTTGCCAGCTGAGAGAAGGTGTGTGGCTATCAAGAAAGGGCAATGTACAGTGCCAGCGCAACGGCTCATCCTTAATACTGCAATTGGCGATAAAAGAAGAGAATGACACTATGGAAATACCATGTGATCCTGTGGAAACAGAAAGCATGGGTCCAGTCGCACAGGGCACTTGCGTATATAGCTGGGCATTTGCCCCAAGGGGGTGGTACTATAACAGGAAAGATGGTTATTGGCTCCAGTATATAAAGAAAAACGACTACCAGTACTGGACAAAAATGCCTACCGTCTCATCCGCCGCAACGATGTACCGTCATCTGCTCCCCTTACTTGTAGCTTGCCTCATGGGCGGTAGGATATCAGTGTGGATTGTGGCAATGCTCCTATCTCTGCAGGTGGAAGCTAGCGAAGTAGGTACAAAGCAATTGGCCGTCACGCTGACACTGTGGAAAATGGACTGGACAGAACTACTCTTCTATATTATCATAATGCTAGCCGTTAAGGAAGACCTCATAAAGAAAATAGTAACCGCAAGTCTTGTGGCCTTGAAAAATAGTCCAGTAGCCTTAAGCTTTCTCATTGTGCTCAGGCTTGTAGGAGGCAGTGAAGCGCTCCCAGTGGGTCTACTATTAGAAAAGATGTGCATAGACCAACCGGAATTTGGAACCCCTTTCCTGATCTACCTGTGGGACAATTGGAAGTGGACTGTACTAGTCAGCTTCTCCGCGCTGAATCATGAAAAAACTATAAAACTGGCAAGAAAACTGCTATTGGCAACACACATAACAGCGCTCACATTGACTGGTCTGAGTGACTCAATCTTCTATATGATGCTTATAATGACCAACCTACTAATAAAGATATTCATATACTTATTGGGGGCCAGCATGAATTGGGTTGAGAAAGAAAAAAAGAAGTTGTTAGTCAAGAGGAAATTAATATATAAGAAAGCCGCAGTCTGCAGACAAGGTGAGAATGAGTTAGAGAATAAATTCAACAAGATAACTGTAAATGCGGATTTCACCCCATGCAAACTTGAACTTTTACAACTACTCAGGGCTTTTTTAGTCTCTTTATGTTTCTCCTATTACAAGCCTCTCCTGTATGCAGAGACTACCTTGACTGTTATAGTAATCGGTGTACAGGAGTATAATGTAGCTATGGCCCGCGGGAGAAGCGTGGTCCATAGACTACTAGCCATGGCCTATTACATATATGGCCGCATGCAGGGGGACATGTTCCAGCTTGCCACTGTCCAGTGCCTGTTGTCAAGCCCGAGGAAAATTATGAAACACATGATAGAAAATCCAACACTCAAGAAGCTCTGGCAAGGCGAAACTGAACTTTTCAACCAGGGCGTCAGCCAGTCCAAAATAGTGAATCCAAAGAAAATTGGGCTGGAAGAATTACACAAGGGTATGTGTGGCCTCCCAACTGTAGTGCAAAATTTGGTCATATACGCAAAGAAGAATGACTCTCTTATTTTAGGAGAGCTGGGCTACCCCCCTGGGGACCTCACCAGCGACGGGTGGGAAATTTTAGGTCCTGGCAGAATCCCAAAGATTACTAATGTTGAGTCTGCTAAAATGGACTTGCTCTCCAAACTCATGACCTTCCTGGGGATAGAAAGTTCAAGGGTCCCCAGGACCCCAGTCCACTCAACGAGGAAATTACTGAAAATAGTCAGAGGCTTGGAAACTGGATGGGGGTACACTCACGCAGGGGGGATCAGTAGCGCAAAACACGTGACAGGTGAAAAGAACTTGATGACCCACATGGAGGGTAGGAAGGGCAAGTACATCCTACAATCCCAAGAACATGGTGCTGATGAGGTAGAATATGGAGTAAAAACTGATCAAAAAGCACCAGATAATGCTTTATGCTATTGCTTTAACCCTGAAGCTACAAACATAAAAGGAGAAACGGGAGCCATGGTGTTCATGAAGAAGACAGGAAAAAAATGGACTCTCGTAACATCAGACGGTAATAGAGCTTACTATAATGTAAACAACCTGAAAGGGTGGTCTGGACTACCAATAATGTTGCACTCCACCGGGGCCATAGTAGGGAGGATTAAGTCAGCATATTCAGATGAAAACGACCTGGTGGAGGAACTCATTGACTCCAGAACTATCAGCAAAAGCAATGAGACAAACCTGGACCACCTTATCAAGGAATTGGCAGATATGCGGAGGGGAGAGTTTCGCTCAATTACCCTTGGAACGGGAGCTGGGAAAACTACGGAACTGCCCAGGCAATACCTCGCAACAGTAGGTGCCCATAAGTCTGTGTTAGTTTTAGTCCCTTTAAAAGCACCCGCTGAAAGTGTCTGCCGCTTTATGAGGTCCAAATACCCTACCATCAACTTTTCCTTGAGAGTGGGGGAGCGAAAAGAGGGAGACGTGAGCAGCGGTATCACTTACGCTACTTACGGATTCTGCTGCCAGCTAAACCTGGTACAACTCAAAGAATGGATATCCAGATACTCAATGGTGTTTTTCGATGAATACCACACAGCAACTCCAGAACAAATAGCCATAATAAGTAAGATCCATGCACTGAAAGTCAAGACCAGGATAGTGGCTATGTCAGCGACTCCCCCGGGCACCGTGACGACTGAAGGCAGGAAATTTGATATTGAGGAAGTAGGCGTTGCTACCATAGAGAAAGGAGAGGAACCAAAAAGGGGGCGTATAGCAGTCGCCGGTATGCAGATCCCATTGGAAGACTTGACAGGGAAGAACTGCCTGGTGTTCGTGGCAACCAAAGAAGCTGCGGAGACAGAGGCCAAAGAGCTGCGTGCTAGAGGAATTAATGCCACTTATTACTATTCAGGTATAGACCCAAAAACTCTGGAACATGGGATGATCAATCAACCATATTGTATTGTGGCCACAAATGCTATCGAATCGGGCATAACCTGTCCTGATTTAGATGTGGTCATTGATACTATGCAAAAATACGAAAAGGTAGTGAATTTCTCAGCAAAGATGCCCTTGATTGTCACTTCTTTAGTAAAGAAAAAAATCACTAGGGAAGAACAGGGCCAGAGGAAAGGTCGAGTGGGCAGGCAAAAGAAGGGAAAATATTACTATCCTTCGGGGGTTGTGCCGAATGGGTCAAAAGACCTAAGCTATCTAATCTTGCAGGCTCAAGAGTATGGTGTCTTGGAACAAGTCAATATAACAGAGTATTTCATCATAATGAATGAGGATTGGGGTCTTTATGATGTAGATGAAATAGAGGTGAGAATACTCGAGAGAATGAACAAGGAAATTCTGCTCCCGCTAGGCATCGTGGAGAAGCAAATCCTGGAGAGAAGTACCCACCCGGAAAAAGTGGCACTGTTGTATAACAAATTAGTACAGAAAAACCCTATAGTGTATCCCAGAGTACAGGGGGGTGAGGTTAGCAAAGAATATAATACCCACAATTTGGCCGTATATGACAAGCTAAAAGACGTCAATCCACAGGCCATTTATGTCCTAGCAGAGGAGGAAAGAGCCACAGAGATGATGGGCCTCGAGTTTGAACAAGATCCACCCGACTTACAAGATTCGGTAGTCCAGCTTTGTGAAGATATCAAGAGGTATACAAAACTCTCTGGGATCACAGAGAAATTACTAGTAGGCACGATGGTGGGGTATATCGGATACAAAGCCTTAACCAGAAACCATGTGCCCTGGGTCAGCAAAGAGTACTGCTATGAGCTGACTGATTCACCTGATACTTACGAGAACTCATTTGCACCTTTGGACGTCGATATCCAAAATCCCGGTGAAAGTAAACACCCAGAACAACTGGCAGACCATCAACTGAGGCAATTACTAGAGACTGGGAGAGACAAGGCGATTGACTTTCTAAGAGGAATTCGCGAGTTCACTAGTGGGGCCATAAATAGTCCAAAGGCACTAAGTATATGGGAGAAAATATATCAGTACTTGAGGAAACATCAGGGTGAGATTATCTCATCAGCGGCGTGGGGCAGCGCCACGGCCCTTCATGACAGCATTAAATCTAGGTTGGGAGATGAGGTTGCCACTGCAGTGATAATCCTAAAGTATCTAGCGTTTGGTGAAAGGGAATTGTCCGGACTGACCAGGCAAGTCTTAATTGATATCATAGTGTATTATATAGTTAATAAGCCCCGATTCGAAGGAGATGACTACGCAAAGAGAAAAGGGAGAAGACTGGTCATCGAAGTCTTGATGGGGGCACTGGCAACTTATGCAGTGTCCAATTTTTGGGGCGTGTCCATTAATAAGATACTACAACCAATATCTGATTATCTACCTTATGCTACTGCCACTTTAGCCTTCCTTCGCCCAACTTTCATGGAATCAGCAGTGGTGGTCGCTTCCTCTATCTACAGAGCTTTTCTCTCCATCAAACATGCAGAAAACAGGAGCCTTGTTACGCAGGTCGCCTCTGCCGCTCTCGAAGTCATGGGTCTGACCCCAGTATCAGCCGGCCTAGGCGTCCTGCTAGGGCTCGGGCTGTGTGTACTCCATATGAACATTGACAAAAACGAGGAGAAAAGGACACTGATACTGAAAATGTTCGTCAAAAACTTTATAGACCAGGCGGCACTGGACGAGCTAGACAAACTGGAGCCAGAAAAAATAATCCTCTCATTGCTGGAGGGCATTCAAACTTGCACAAATCCAGTCAGGGCAATCATGATTTTGTATAGGGTGTATTACAAGGGAGAATCGTTCACAGAAGCCTTGTCTAAGATGGCTGGCAAGTCTCTCATTGTGATGGTTATTGTCGAGTTCTTGGAACTGACGGGCCAAACCCAAGGAGGGTACATAGATCTTAGCGCCAATTTGCTGACCTTTCTCCTGGAAAAACTGAAAAAGATGACCAACCTCGCCATTGGGGAAGCCAGAAAGGCCTTACTCCCCATCCCATACCTGTACTGTGAAACCTGGCAGTCTGACGCCAGAATCAAGGCCCCTGAATCCTATGACCAGGTGGTTGTGGAATGCAAATGTGGTGCTTTAGCAAGGTATTCCTTCCGCCATGGGGCTCACGAGATGTTGGAAGAAAAAAGGATCAAGTGGTGTAAGAATTTCTTCTTATGGGGACCTAACTTTCACAACCCGGATCCCAAGAGAATGACGTTTTATGAGTACGGCCAAGCAAAAAAGTGCCCTGTCACCATAATGGGTGAAGACATAACCTTTGGCAAATATGGCATATATGTCAAATTTGGCCATAGGCCTGATGGGAGAAGGTTAATAAGGGGCACTACCCATGCTACCATCAGCAGGGAGGAATTGTTGGAAATCCTAACTGCCCCAAGCCAAGTGGCCATAGGCAAAGTCAAGCTGACCGATTATTGTAATCAAAAAGGAATAATAGACAGGAAACTGGCCGTGCTTGAAGGTGACAAAATACATTTCTGGAAAGCACACCGTGGATCCAAGATCACGGATCAACTCACTATTGAGAGCCTGACGGATGATTTGGGGTCAGAAATCAGGGACATTGTATGGGAGCTGTACACAGGCGGGACATGCACTGTAAAGGGGATATCCCTCAGGTCATGCGCGCCAGATCAAAGAAACAAGGCTATGGTCTTGTGTGATTGCACTGACGTGCTTAGCCCCTGTTACCTAATCAATGGCAGGAAACCATCCCCATTTGACGTCGTGGAAGGTTATGAATGCCACCATCGGAAGCCCCGAGCGACGTATGAGGATTTAGAAATGGAGGAAATACTAAAGAGACGGGTCCCTGTCTACGATCCTCAGTGCCTGTTTGATACAGACAGTAAATTGCTGCCTCCTGATACTTATTACTTGGAAGAAGAYAGAGAAGACTTTGAGTATGCGCTGAGGTGCTGGGGTCTTGGGGTTTATGTAGTAGACGGACCTATCACCTCTCCCCCGGACATAAGAATACACCACAGTTCTGTACTGCTACTGCTGACACCCGGAGCGGACTCTGAGTTACTCTTACAGTACATACGTTGTTATTCTCATCAGGCAGAGGTAGACATCTACGTTAGGGGTCAACTCCTGGATGAGGAAGACACTGCTACGGAGGCGGAAGGCTCTCAGGAAGATAGAGATGAAAGGATGAGTGACGTGGTGACAAAAGATGAGGATGCGTCATCCACAACGGAATCAATGCCCCCACTAGAAGAGGAGGAAGGGGCCGAAGAGCCAATTACCTATGTGGTCGTCAGGGGATTACAAGAAGAAAGATATGTTAGCCATCTTAAATTAAATGACTGGATCAGTGAAAACATCTCAGAGCCGCATAGGGTCCAAATCATGCTTGATGGAACAGTAAGAGTCACAATAAAGGAGGGCAAAGTGAAACATCTGTTTGGGGTCTACAGAATCGAAAACTCCCTAGAAGCAATGTTCAAAGAGACCATAGCTGACCTCCCCACAGCCACCCAGCCGCCCCGAGGGCCAATCTACACGGCCAAAGAGTTGGCCCAAGGGAATATTGCCCCAGTCCAACCTGCAACAAATTATTATGGAATGATAGAGGGGAGAGGGGACCCGATGACGGCGTTTGAAGCCTTATCAGTTCTGCGGTCACAAAAAGTTTCAGCTAAGGAAGTGAAGGTAAGCACCTGCAAGGCACAGGCTTTTCTAAATAAAGTCAGGAAAACCGCTGAGGTCAGGGCATCGGAATTGGCATTAAAACGCCTACCGGCACTCGGTAAAGTAAATGGGAGGAAATTGGTCAGAGAGGAAACCAATATCCCCAACCAAAGGTTGGCATCGATAATGACCTCAATAGGGATTAGGCTAGAAAAACTGCCAGTGGTCAGAGCAAACACCTCTGGCTCTAAGTTCAGGCAATCAATTTTAGAAAAAATGGACAAATATGAAAATGAACAAGTTCCAGGGTTGCATGAGAAAATGTGGGCAGCTTTCCTGGCAACTGCCAGGCAAGATTTAAGAAATACATATGAGGAAGTAACTTATCTTGAACTGGAGACCGGAATCAACCGGAAAGGAGCCCCAGGTTTCTTTGAAAAAGAAAGCTCAATAGGAGAAGTGTTGGAAAGAAAGGAAAAAATTGACGCCGTAATTCAAGAGATTGAAAAAGGTGATCACTTATACTACGAAACAGCCATGCCAAAAAATGAGAAAAGAGACGTGCTTGATGACTGGTTGTCTGAGGATTTCGTCACCTATAAGAAACCACGTGTGATACAGTATCCCGAGGCAGCCACCCGGTTGGCCATCACCAAAATAATGTACAAGTGGGTAAAGCAGAAGCCTATAGTGATCCCCGGTTATGAGGGGAAAACCCCAATTTTTGAAATATTTGAAAAAGTAAGTGCAGATTGGGCTCAGTTCAAAAACCCGGTAGCTGTTAGCTTCGACACCAAAGCCTGGGACACTCAAGTAACAAGGGAAGACCTCAGACTGGTAGGACGGATTCAGAAATACTACTACAAAAAAAAGTATTGGAAATTCATTGACAACTTGACGGCCATGATGGAGGAAGTGCCTGTGATCACTGTAGAAGGAGATATGTTCCTTAGAGTTGGACAGCGCGGGTCCGGACAGCCTGACACCTCAGCAGGCAATTCCATACTAAACGTGCTAACAATGTTGGTAGCCTTCTCCGAATCTACAAATCTGCCCATAGCGGCTGCCTGGAAGGCCTGTCGGATCCACGTCTGCGGGGACGACGGTTTTTTAATTACGGAATCAGAATTAGGGAGGAAATTCGCTGAAAAAGGTGTCCCTCTGCTAGCCGCATTCGGCAAGCCCCAAAAAATCACGGAAGGAGCAAGCCTAAAGATAACCAGCAACTTTGACGGGATAGAGTTCTGTAGTCATTCCCCCATCAGAGTCCAAACACCAAACACAAGGTGGATGCCAGCGAGGCCTACAGCAACAATTTTAGGCAAAATGAGCACTAGGTTGGGTGAGGGTGCCACCAGATCGGGAGAGGAATATGAAAAACAGGTGGCATTTGCATATTTACTGATGTATCCCTGGAACCCACTGGTCAGGAGAATTAGTCTCCTCTTGTTATCGACTACTGACCCAATAGGGAAAGAGGAAACCCCATGCTCCGATGAGGGGGTGAAGTATGTTGGAGACCCTATCGCCGCATACAGGGACGTGTGGGGGCACAAATTAGAGGATGTAGGGCATGTTGACCAGCCGCAGTTATCCCGGATGAACTATAGCATGACTTACTTAGGGATCTGGAAGCCAAAGACGAGCCAGCGGTTAGTTGAACAGTGCTGTCGACTAGCCGAGAAAAGCAATTGTGTGGTACGTGCTGACTCCCTAATTAAGAAAAAGGTCAAGATCACTTATGACCCGGGGATAGGAGCGGCTCAGGTCATTCGTAGGTGGGAGGAGCTTGAGTGGACCAGAAGGAAACCTGAACCCACTAATGCAACTGCAGAAGATGATATCTTCCTAGCCCTGTGGAAGAGATTTTCAAAGTACATTTTTCAGAAAATGAAGTTCATGCAGAGAATGCTCGCCCCTTACTAAGCGGGGGGCGCTCATTTAAATACAACCAGCATCTGGCGAACATAGAAT
| 19,422
|
OL603846.1
|
Atypical porcine pestivirus
|
Hou,Z., Liu,W., Cao,N., Xu,D., Tian,Y., Huang,Y., Fu,X.
|
Zhongkai University of Agriculture and Engineering, College of Animal Science & Technology
|
China
|
2023-01-15
| null |
Pestivirus scrofae
|
Pestivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 10,989
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Sus scrofa
| null |
2018-04
| null | null |
Atypical porcine pestivirus strain APPV-China/JX-YC/2018, complete genome
|
CAGGTAAGAGTATAAAATCCGTTGTTTATTAACATGAAGAAGCAGATTACTTATTACTTAAAAAAAGAAAAACAAAGAAACGGGTGGACAGAACTGGTGGTGGGAGAAAGTCACATGAAAATAACTACACTTTCTGGGAGGACCTACCGAGGTACTTGGGAAATGGAGAAGTGGTCAAATCCTTATGGAACCTACTTACCCAGGCCTAGCCCCCAACAACTTACAGCCTTACACCCACACCCGGTGGTGAATTGCAAGATGATAGAGTACAAGGGGGCGGATCCTGATTATGGTGATTGTCCAAACACAAATGGGGTGTTTATTGACGAAAAAGGTAGAAGGTTTAGTAGTCCTCCATTGGGTATTTGGAAGATAAGACTGGACTACAATGAACTAGTAAATGTAAGCCGACCAATCTTTACTAGCGGAAGAAATTCATACCAGGTTGAAACCTGCAGTGGGGAATTGGCTACCATAACACTGGAGCACGATAGGGTTCTCGTGGACGACTGTAGGGGGTTTTATCAATGGAAACCCAACTGTGAAGGAATGGTGCTTTATGTGAAGACCTGTTCTGATTGGGCAGATCAAGTGGAAAAACAGGAGAAAGAAAAACCTCCGAAACCTCAGCGACCACCAAGACGAGACCCACGAAAAGGGTTGCAGCCACAAGTCCCCAGAGAAACTGAGATCACGGAAAAAAAGAAACAACCGAGTGTTACCTTAGTATCCGGGGGGCAAAAAGCCCAAGTCATCTATAAGGGTAGGACCAAGAATAAAAAGACTCCAGATGGGGTTTATAAGTACCCAGGGGCTAAGGAAGGGGATGTAGTGAAAGTTAAGAAAATGCTGAAGAACTGGCACATAGCCCTGGTGATGTGCCTGATATTTTTCGCAAATCCAAGTCTAGCCAAGGTCCAGTGGTTCCTAAAGGATGAGAATTCAACAGGAATAAATCGAGTACTGTGGCAAAGACAGGTAAACAGGTCCCTACATGGAGAATGGCCTAATCAGATCTGTCGCGGAATGCCAAACGAAACCATCACGGACGAGGAGCTACGCAGTCTTGGAATGATAGATACAAGCCCTAGAACAAACTACACTTGCTGCCAATTGCAATACCATGAATGGAAGAAACACGGGTGGTGTAATTATCCACAAAAACAAGTTTGGATTAAGAGAATAGCAGCCTTACAATCCAACCTAACCGGAGCTTATGAGGGACCTGAATGTGCAGTCATCTGCCGATTTAATGGTAGTTATAACATAGTGAGACAGGCCAGAGACGAAGTAAGCCCGTTGACAGGGTGTAAAGAAGGATATCCCTTCCTGTTTTCTGGAGAAAGATCCGACACCTCATGTCTAAAGCCTCCATCCACTAGTTGGGTCAGACCAGTAAAAATGGATGAGGCATCAGTGGCAGATAGCTTCGCCCATGGAGTAGACAAGGCGATAATATTAATTAGAAAAGGGGCATCAGGAATTATCAACTTTTTAGACACCATTGGGAGATGGTTGCCAGTGGCTGAGGCCGCCATAGTACCATATTGCGAAACCTATACTGTAACAGGGATGTATGTTCATGTGAAGCATTGCCTCCCTAAGGGGCTACCAAAGCATTCAAAAATAATTTCCCCAACGATGATATACCTGGGGGAAGGTGACCCAGCCCATAATATCCAGCATTTGTTTGGCTCAGGCATAGCAAAGTGGGTCCTGGTCCTACTTGGTGTCTTGGGTGAGTGGTATGGGGAGTTGGCCTCCACGATATATCTATTACTGGAGTACGGGACTGAATGGTTGGAACATGAAAGCCTAGTCACAGAAGGGTTGATCCCTGGCATCAATATCACAGTAGAGCTCCCCGCTAGTCACACGGTACCAGGCTGGGTGTGGGTCGCTGGCCAGTGGGTTTGTGTGAAACCAGACTGGTGGCCTACACAGATTTGGATTGAAACCATAGTGACAGAGGTATGGCATATACTGAAAATATTGGCATCAGCTTTGGTAAACATAGTCACTGCATTCGTAAACCTAGAGTTAGTCTATCTGGTCATAATACTAGTCAAAATATCAAAGGGGAACTTGATAGGTGCTGTATTGTGGTGCCTCTTGCTGTCAGGAGCTGAGGGGTCATGCCACAGAAGACAAGACTATTACAACATCCAACTGGTCGTCGAGGAAAAAACAGGAATAGAGAAGCGATCTATAATTGGCAAGTGGACTGTGATAACTAGGGAAGGTAGAGAACCAAGATTAATGGAGCAGATAAATATGGTGTCGAATGAGACCCTATCGGAAACTTACTGCTACAATAGGCTGAATACCAGTAGCTGGGGAAGGCAACCGATAAGACAGAGGGGGTGTGGGCAGACTGTACCCTATTGGCCTGGTGACAACGTCCTTGAGGAGCAATACTACAGCACAGGTTACTGGGTGAATGCAACAGGTGGTTGCCAGTTAAGGGAAGGTGTGTGGCTATCAAGGAAAGGCAACGTGCAGTGTCAGCGTAATGGTACTTCCTTGATGCTGCAACTAGCAATAAAAAAAGAGAACGACACCATGGAAATACCATGCGACCCAGTGGAAACTGAAAGCATGGGCCCAGTAGCACAGGGCACCTGCGTGTACAGCTGGGCAGTTGCCCCAAGAGGGTGGTACTACAACAGGAAAGACGGTTACTGGCTCCAGTACATAAAGAAAAATGACTATCAGTACTGGACTAAGATGCCCACCACTTCGTCTGCTGCCACAATGTATCGTCATCTGCTCCCCCTATTGGTGGCCTGCCTTATGGGCGGTAGAATATCAGTGTGGATTGTGGCAATGCTTCTGTCTCTACAAGTAGAAGCTAGTGAAGTTGGCACCAAGCAATTAGCCGTCACCCTAACTCTATGGAAGATGGATTGGACAGAACTGCTCTTTTACGTCGTCTTAATGCTAGTTGTTAAGGAAGACCTAATAAAGAAAATGGTGACTGCAAGTCTTGTGGCCTTGAAAAACAGCCCGGTGGCCTTGAGCTTTCTTATTGTACTCAGGCTGGTGGGGGGTAGCGAGGCGCTCCCGGTGGGCCTATTGCTAGAAAAAATGTGTATAGACCAACCAGAGTTTGGAACCCCTTTCTTGATCTATCTATGGGACAACTGGAAGTGGACTGTCTTAGTTAGCTTCTCTGCATTAAATCATGAAAAGACTATAAAATTGGCAAGAAAATTACTGTTAGCCACGCATATAACAGCACTGACGTTAACTGGCTTAAGTGACTCAATATTCTACGTAGTGCTCATAATGACCAACCTTCTAATAAAGACATTTATATATCTATTGGGAGCCAGTATCAGCTGGGTCGAAAAAGAGAAAAAGAAGCTGCTGGTAAAGAGGAGATTAATATATAAACATGCTGCAATCTGTCATCAAGACGAGAACGAACTAGCCAGCAAGTTCAACAGGATAACTGTGAATGCAGATTTCACCCCATGCAGACTCGAATTGCTACAATTGCTCAGAGCTTTTCTTGTCTCCCTGTGTTTTTCCTACTACAAGCCCCTCTTGTACGCTGAGACCACCTTAACTGTGATAGTGATTGGAGTGCAGGAGTACAACGTAGCAATGGCCCGCGGGCGAAGCATGATTCACAGATTGTTAGCTACGGCCTATTACATATATGGCCGTATACAGGGGGACATGTTCCAGCTCGCTACAGCCCAATGTCTGCTATCCAGCCCAAGGAAAATCATGAAACATATGATAGAAAATCCAATCCTCAAGAAGCTCTGGCAAGGAGAAACTGAACTTTTCAACCAGGGGGTCAGTCAGTCCAGAATAGTCAACCCAAAGAAAATAGGGTTGGAGGAATTGCACAAAGGCATGTGTGGCCTGCCAACCGTAGTACAAAATTTAGTCATATACGCAAAGAAGAATGACTCCCTTATCTTAGGAGAAGTAGGCTACCCCCCTGGGGACCTCACCAGTGATGGGTGGGAAATCCTAGGCCCTGGCAGAATTCCGAAGATCACCAACGTTGAGTCTGCCAAGATGGACCTGCTCTCTAAACTCATGACCTTCCTGGGGATCGAAACTTCTAGGGTCCCCAGAACCCCAGTCCACTCGACAAGGAAACTACTGAAGATAGTAAGAGGCATGGAAACTGGGTGGGGGTATACTCACGCAGGGGGGGTTAGCAGCGCTAAACATGTCACAGGTGAGAAGAACTTGATGACCCATATGGAGGGCAGAAAAGGCAAATACATCCTACAATCTCAAGAACATGGTGCCGATGAGGTGGAATATGGGGTGAAGACTGACCAAAAAGCACCCGACAATGCTTTGTGTTACTGCTTTAACCCTGAAGCCACGAATATAAAAGGAGAAACAGGTGCCATGGTGTTCATGAAGAGAATAGGAAAAAAATGGACCCTTGTAACATCAGATGGCAATAAAGCTTATTACAATGTAAATAATCTTAAAGGGTGGTCCGGATTACCAATAATGTTGCACTCCACTGGAGCTATAGTAGGGAGGATTAAGTCAGCCTATTCAGACGAAAATGACCTAGTGGAGGAACTTATTGATTCTAGGACCATCAATAAGAGCAAAGAGACTAACCTGGACCACCTTATCAAGGAATTGGCTGATATGCGGAGGGGGGAGTTCCGCTCAATCACCCTAGGAACGGGTGCCGGAAAAACGACAGAACTGCCCAGACAATACCTCACCACAGTAGGTGCCCATAAGTCAGTATTGGTCCTGGTCCCTTTGAAAGCACCTGCTGAAAGTGTGTGCCGCTTTATGAGGTCCAAATACCCCACCATCAACTTTTCCCTGAGAGTCGGAGAACGGAAAGAGGGGGACGTGAGCAGCGGCATCACCTATGCCACTTACGGTTTCTGCTGCCAGCTTAACCTAATCCAACTCAAGGAATGGGTATCTAGGTACTCAATGGTGTTCTTCGATGAGTACCACACCGCGACCCCAGAACAAATAGCCATAATAAGCAAGATCCATGCACTGAAAGTTAAGACCAGGATAGTGGCCATGTCCGCAACCCCTCCAGGCACTGTAACAACCGAAGGAAGAAGATTTGACATTGAAGAAGTAGGGGTTGCCACAATAGAGAAAGGAGAAGAACCAAAAAGGGGGCGCATCGCAGTGGCTGGCATGCAGGTCCCGTTGGAAGACCTGACGGGGAAGAATTGCCTGGTGTTTGTGGCAACTAAGGAATCTGCAGAGATGGAGGCCAAAGAATTGCGTGCCAAAGGGATAAATGCCACCTACTACTATTCAGGCATAGACCCAAAAACCCTGGAACATGGGATGACTAACCAGCCATACTGCATTGTGGCCACCAATGCCATCGAGTCAGGTATAACCTGCCCTGATCTTGATGTGGTCATAGACACTATGCAGAAGTACGAAAAAGTAGTGAATTTTTCGGCAAAGATGCCTTTAATTGTTACCTCACTGGTAAGGAAGAAAATCACCAGGGAAGAACAAGGCCAAAGGAAAGGTCGGGTTGGGAGGCAAAAGAAGGGTAAGTACTATTATCCATCGGGGGTGGTACCGAATGGATCGAAAGATCTCAGCTACTTAATCTTGCAGGCCCAGGAGTATGGTGTCTTGGAACAAGTCAACATAACAGAGTACTTCATCACAATGAATGAGGACTGGGGTCTCTATGACGTAGATGAAGTTGAAGTGAGAATACTGGAGAGGATGAATAAGGAGATCCTGCTTCCGCTAGGCATCGTCGAGAAGCAAATCCTAGAAAGGAGCACTCACCCAGAGAAGGTGGCACTGCTGTATAATAAACTGGTACAGAAAAGCCCTATAGTTTACCCTAGAGTGCAGGATGGTGAGGTCAGCAAGGAATATAATACCCACAATTTAGCTGTATATGACAAACTAAAGGATGTAAATCCACAAGCCATCTATGTCCTGGCTGAAGAGGAAAGGGCCACAGAGATGATGGGCCTAGAATTTGAGCAGGACCCATCTGATTTACAGGACTCAGTAGTCCAGCTCTGTGAAGACATAAAAAGGTATACAAAACTCTCTGGGATCACTGAGAAGCTACTGGTGGGTACAATGGTCGGATATATAGGATACAAAGCTTTGACTAGAAACCATGTCCCCTGGGTCAGCAAAGAATACTCTTATGAGTTGACTGACTCCCCAGACACTTACGAAAACTCATTCGCACCTCTGGATGTGGATGTCCAAAACCCTGGGGAAAACAAGCGTCCAGAGCAGCTGGCAGACCACCAACTACGGCAATTTCTAGAGATTGGGAAAGACAAGACAATCGGCTTCTTAAAAGGAATTCATGAGTTCACTAGTGGGGCTATGAATAGTCCAAAAGCCCTGAGCATATGGGAGAAAATATACCAGTACCTGAAGAAACATCAAGGTGAAATCGTCTCATCAGCGGCATGGGGCAGTGCGACGGCTCTCCACGACAGTATCAAGTCTAGACTGGGGGACGAAGTTGCTACCGCAGTGATAATTCTCAAGTACCTAGCATTTGGAGACAGGGAGTTATCTGGACTTACCAGACAGGTCCTGATTGACATCATAGTATACTACATAGTCAACAAGCCTCGGTTTGAAGGAGACGATTATGCAAAGAGAAAGGGAAGAAGGCTAGTCATCGAGGTATTAATGGGAGCACTAGCGACTTACGCAGTGTCCAATTTTTGGGGCGTGTCCATTAACAAGGTGTTACAACCAATATCTGATTACCTGCCCTATGCTACCGCCACTCTAGCATTCCTCCGTCCGACTTTTATGGAATCAGCAGTGGTGGTTGCCTCTTCCATCTATAGAGCTTTCCTTTCTATCAAGCATGCAGAAAACAGGAGTCTCGTCACACAGGTTGCCTCTGCTGCTCTTGAAGTCATGGGTTTGACTCCAGTATCAGCTGGCCTAGGCGTCTTGCTAGGGCTTGGGCTGTGTGTGCTCCACATGAACATAGACAAGAACGAGGAGAAGAGGACTCTGATACTGAAAATGTTCGTCAAGAACTTCATAGACCAGGCAGCATTAGATGAATTGGACAAATTAGAGCCAGAGAAAATAATCCTCTCATTGCTGGAAGGTATTCAAACCTGCACAAACCCGGTCAGAGCCATTATGATCCTGTACAGGGTGTATTATAAGGGAGAATCATTCACGGAAGCCTTGTCCAAGATGGCTGGGAAGTCTCTCATTGTGATGGTCATCGTTGAGTTCCTAGAACTAACGGGGCAGACCCAGGGAGGGTACATAGACCTTAGCACCAACCTTCTAACCCATTTATTAGAAAAATTGAAGAAGATGGCCAATCTTGCTATTGGAGAGGCTAGAAAGGTTTTGCTGCCTATTCCATATCTGTATTGTGAAACCTGGCAGTCTGACCCTAGAATCAGAGCTCCGGAATCCTATGATCAAGTGGTGGTAGAATGTAAATGTGGCGCCCTGGCGAGATATTCCTTCCACCAAGGGGTCCACGAAATGCTGGAAGAGAGAGGGACCAAGTGGTGCAAAAATTTTTTTTTATGGGGACCCAACTTTAACAACCCAGACCCAAAGAGGATGACATTTTATGAGTATGGTCAAGCAAAAAAGTGTCCCGTGACTATCATAGGTGAAGATATAACCTTTGGTAAATATGGCATATATGTCCAATTTGGTCATAGACCTGACGGGAAAAGGTTAATACGGGGCACTACCCATGCAACTATCAGTATGGAGGAACTGCTGGAAATTTTAACAGCTCCAAGTCAAGTGGCCATAGGCAAAGTCAAATTGACTGACTATTGTAACCAAAAAGGGATAATAGACAGGAAACTGGCTGTAATCGAGGGTGATAAAATACACTTCTGGAAATCACACCGTGGGTCCAAGATTACAGACCAGCTGACCATTGAGAGCCTGACAGACGACCTAGGGTCAGAAATTAGGGACATTACATGGGACCTGTATGCAGGCGGGACATGTACCGTAAAAGGGGTTTCCCTTAGGTCATGTGCACGGGAGCAAAGAAGCAAGGCCACAGTCTTATGCGATTGCACCGACGTGCTAAGTCCCTGCTACTTAATCAATGGCAGGAAACCTTCCCCATTTGATGTCGCAGAGGGTTATGAATGCCATCATCGGAAACCCCGAGCGACATATGAAGACCTGGAGATGGAAGAAATACTGAAGAGGCGCGTCCCTGTATATGACCCCTCTTGTCTGTTTGATACTGATAGCAAATTATTACCTCCTGACACTTACTATTTGGAAGAGGACCAGGAAGACTTCGAGTATGCCCTAAGGTGTTGGGGTCTTGGGGTCTATGTAGTAGACGGGCCCGTTACCTCCCCCCCGAGCATAAGAATACACCATAGTTCCACATTGCTATTGTTGACACCTGGAGTGGACTCTGAGTTACATTTACAGTATATAAGCTGTTACTCCCACCAGGCAGAGGTAGACATTTTTGTCAGGGAACAATTCCTAGAAAGGGAAAACTCTACTGCGGACGTGGATGACTCTCTGGGAAGCAGTGATGAAGGAACAGAAGATGTGGCGGCAGAGGAAGAGGACACACTGTCCATAGCAGAATCTATGCCCCCATTGGAAGAGGAAGAGGACAACGGAGAAAATATTACCTATGTGGTCATAAGGGGATTGCAGGAAGAAAGACACACTAGCCACCTCAAATTAAACGATTGGATCAGCGAAAACATTACAGAGCCGCACAAGGTCCAAATTATGCTTGATGGAACAGTGAGAGTCACGATAAAAGAGGGCAAAGTAAAACACCTATTTGGGATATACAGAATTGAAAACACCCTGGAAGCAATGTTCAAGGAGACCATAGCTGATCTTCCTGTAGCCACCCAACCGCCCCGAGGGCCCATTTACACAGCCAAAGAGCTAGCTCAGGGAAACGTTGCCCCGGTCCAGCCCGCAACGAATTACTATGGAATGATAGAGGGGAGGGGTGACTCGATGACAGCATTTGAAGCCTTGTCAGTCCTGCGATCACAAAAAGTCTTGACCAAAGAGGTCAGGGTAAATACCCACAAGGCACAGGCCTTCCTAAACAAGGTTAAAAAGACCACTGAGGTCAGAGCACCAGAGCTAACACTGAAGCGCTTGCTGGTACTCGGCAAAGTGAATGGGAGGAGGTTGATTAGAGAGGAGACCAACATCCCCAACCAAAGGTTAGCGTCTATCATGACATCAATAGGGATCAGACTAGAAAAACTGCCAGTGGTCAGAGCAAACACCTCTGGCCCGAAATTTAGGCAATCAATCCTAGAGAAGATGGATAAGCATGAAAATGAGCAAGTCCCGGGGTTGCACGAAAAAATGTGGGCGGCCTTCCTGGCGACGGCTCGACAAGATTTAAAAAACACATATGAGGAAGTGACCTATCCTGAGTTGGAGAATGGAATCAACCGGAAAGGAGCCCCAGGTTTCTTTGAGAAGGAGAGCTCGATAGGGGAAGTACTGGAAAAGAAAGAAAAAATTGATGTTGCTATCCGGGAAATTGAGAATGGCAGTCACTTATATTATGAAACAGCCATGCCCAAAAATGAGAAAAGAGATGTGCTCGACGATTGGCTGTCTGAGGACTTCGTCACGTACAAAAAGCCACGTGTAATACAGTATCCTGAGGCGGTCACTCGGCTAGCTATCACCAAAATAATGTACAAGTGGGTAAAACAAAAGCCCGTAGTAATCCCCGGTTATGAGGGGAAAACCCCAATCTTTGAAATATTTGAAAAAGTCAGTGCGGATTGGGCGCAGTTTAGAAACCCTGTAGCTGTGAGTTTTGACACTAAAGCTTGGGATACTCAAGTGACGAGAGAAGACCTCAGACTGGTAGGACGAATCCAAAAATACTACTATAAAAAGAGGTACTGGAAATTCATTGACAATCTTACAGCCATGATGGAGGAAGTGCCGGTGGTCACTGTAGAAGGAGACATGTTCCTCAGAGTAGGCCAGCGCGGATCCGGGCAACCTGACACCTCGGCGGGCAATTCCATACTAAATGTGCTGACAATGCTGGTAGCTTTTTCTGAATCTACAAATCTACCTATAGCAGCCGCCTGGAAAGCCTGCCGGATCCACGTCTGTGGGGACGACGGCTTCTTGATTACGGAATTGGAACTAGGGAAGAAATTTGCAGAGAAAGGCGTCCCTTTACTAGCAGCATTTGGTAAACCCCAGAAGATCACAGAAGGAGCAAGCCTAAAGATAACTAGTAATTTTGATGGGATAGAATTCTGTAGTCACTCCCCTATCAGAGTCCAAACCCCGAATGTGCAGTGGATGCCAGCAAGGCCCACGGCGACGATCCTAGGTAAAATGAGTACTAGGCTGGGTGAAGGTGCCACTAGATCAGGAGAAGAATATGAAAAACAAGTGGCATTTGCATACTTACTGATGTACCCTTGGAACCCACTGGTTAGGAGAATCAGCCTCCTACTGCTATCAACTACTGACCCAACTGGGAAAGAAGAAACCCCATGCTCCGACGAGGGAGTGAAGTATGTCGGGGATCCCATCGCTGCATACAGGGACGTGTGGGGACATAAGCTAGAGGATGTGGGACATGTTGACCAGCCACAATTATCCCGGATGAACTACAGTATGACTTACTTGGGGGTCTGGAAACCAAAAACGAGCCAGCGGTTAGTTGAACAGTGCTGCAGACTAGCTGAAAAAAGCAATTGTGTGGTACGCGCTGACTCCCTCATCAAGAAGAAGGTGAAGGTCACTTATGACCCAGGGATAGGAGTAGCCCAGATCATCCGCAGGTGGGAAGAGTTAGAGTGGACTAGAAGGAGACCTACACCCACTAATGCAGACACAGAAGATGACCTTTTCCTAGCCTTATGGAAGAGGCTTGCAAGATACATTTTCCAGAAAATGAAATTCATGCAAAAAATGCTCACCCCTTATTAAGTGGGGGGCGCTCATTTAAATACAGCCAGCATCTGGCGAACATAGAAT
| 19,423
|
OK564403.1
|
Atypical porcine pestivirus
|
Lamp,B.
|
Justus-Liebig-University Giessen, Institute of Virology
|
Germany
|
2022-07-13
|
AUT-2016_C
|
Pestivirus scrofae
|
Pestivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 11,564
|
GenBank
| null |
Austria
|
Austria
|
Sus scrofa
| null |
2016
| null | null |
Atypical porcine pestivirus isolate AUT-2016_C, complete genome
|
GCATAATGCTTTGATTGGCTGCATTATGTATGGGACATCCTAAATTGTTACTAGTCCTGCGGTGAGTGGGGGAAAGGGGTTAACCAGGCCTCTAGTACCACAGGCACCAATGAACAGGGCAACTCGAACCTGAGAGAGAGGTACCGAACTCTTAAGTCCCGAGTACGGGGCAGACGTCACTGAGTAGTACACCCAAAGACCACCGCTCCTAGGTGTAGGGTCTACTGAGGCTCAGGTGGACGTGGGCGTGCCCAGAGAGAAATCGGTGGTGGACCTGGGGGTCGGGCCCACCATGCCCCTTTAGGGGGGTAGACCTTACTGCTTGATAGAGTGCCGGCGGATGCCTCAGGTAAGAGTATAAAATCCGTTGTTTATCAACATGGAAAAACAGATTGCATATTACTTAAAAAAAGAAAAACAAAGAAATGGGTGGACGGAATTGGTGGTGGGGGAAAGCCATACAAAAATAACCACACTCTCTGGAAAGATCTATCGAGGTACTTGGGAAATGGAGAAACGGTCGAATCCTTACGGAACCTACCTCCCCAGACCTAGTCCTCAACAGCTTACAGCCCTACACCCTCACCCAGTGGTGAATTGTAAGGTGATCGAGTATAAGGAGCTGGACCCTAACTATGGTGACTGCCCGAATACAAACGGGGTGTTCATCGACGAAAAGGGTAGAAGGCTGAGCAGCCCTCCATTAGGTATTTGGAAGATAAGACTGGACTACAGCGACCTGATAAATATAAACAGACCAGCCCCCGCTAGTGGGAAAAACTCTTATCGAGTCGAGACGTGCAGTGGGGAGCTGGCTACTGTAACATCGGTTCATGACAGGGTGCTTGTAGAAGACTGCAGGGGGCTATACCAATGGAAACCCAACTGTGAAGGAATGGTGCTCTATGTGAAAACGTGCTCTGATTGGGCAGATCAGGTGGAAAAACAGGAGAAGGATGACCCCCCAAAACCTCAGCGACCACCGAGGCGAGACCCACGAAAGGGGTTACAACCACAAGTCCCCAAAGAGACTGAGGTCACAGAAAAAAAGAAACAACCTAGCGTTACCTTAGTGTCGGGGGGGCAGAAGGCCCAAGTCATCTATAAAGGCAAGACTAAGAATAAAAAGACTCCGGATGGAATTTATAAGTATCCAGGAGCCAGAGAAGGGGATGTGGTAAAGGTTAGGAAGATGCTGAAGAATTGGCATATAGCTGTAGTAATATACCTGATTTATATCATAACCCCAAGCTTTGCCAAGGTTCAATGGTTCTTGAAGGATGAAAACTCGACGGGGATCAACCAGATACTGTGGCTACGACAGATCAATAGATCCTTGCATGGAGAGTGGCCCAACCAAATCTGCCACGGCATGCCGAATGAAACTATCACAGATGAGGAATTACGTAGTCTGAGAATGATAGATACAAGCCCTAGAACAAACTACACTTGCTGCCAGTTGCAATATCACGAGTGGAAGAAACATGGTTGGTGCAACTATCCACAAAAGCAGACTTGGATTAGGAGGATAACGGCCCTACAAGCTAACCTCACCGGAGTTTATGAGGGACCTGAGTGCGCTGTCATCTGTCGATTTAACGGCAGTTATAACATCGTAAAACAGGCTAGAGACGAGGTGAGTCCACTGACAGGGTGTAAGGAAGGGCACCCTTTCCTATTTTCTGGTGAAAGATCTGACACCTCGTGCCTGAGGCCTCCTTCCACTAGTTGGGTAAGACCAGTGAAGATGGATGAGGCATCAATGGCCGACGGCTTTGCCCATGGGGTTGACAAAGCAATAATACTAATCAGAAAAGGGGCATCAGGAATCATCAATCTCCTAGACACTATTGGGAGGTGGCTACCGGTTGCCGAGGCAACTATAGTGCCATATTGTGAAACTTACACTGTGACAGGGATGTATGTCCATGTGAAGAATTGCCTCCCTAGGGGGCTACCTAAGCATTCGAAAATAATTTCCCCGACAATGATATACCTGGGGGAAGGCGACCCAGCCCATAACATCCAGCACTTATTTGGCTCAGGCATAGCAAAGTGGGTTCTAGTCTTACTCGGAGTTCTGGGTGAGTGGTATGGAGAACTGGCTTCTACAATATACCTACTACTAGAGTATGGGTCTGAGTGGTTGGAACATGAAAGCCTGGTCACGGAAGGGCTGATCCCTGGCATCAATATTACAATAGAACTCCCAGCTAGTCAAACAGTGCCTGGTTGGGTGTGGGTTGCAGGCCAGTGGGTGTGTGTGAAGCCAGACTGGTGGCCTACACAGATCTGGATCGAAACCGTGGTGGCAGAGGCCTGGCATATACTGAAAATACTGGCCTCAGCCCTGGTGAACATAGTCACTGCATTTGTGAACCTGGAATTGGTCTACCTGGCCATAATATTAGTCAAAATATCAAAGGGGAACCTGATAGGCGCCATACTATGGTGCCTATTATTGTCAGGGGCAGAAGGCTCGTGTCATAAAAGACAAGACCATTATAATATCCAGTTAGTTGTCGAAGAAAAGACAGGTGTAGAAAAACGATCCATAATGGGCAAATGGACTGTGATAAGCAGGGAAGGTAGGGAACCAAGATTAATGGAGCAAATAAATATGGTGTCAAATGACAGTTTGTCAGAAATTTACTGCTATAATAGGCTAAACACTAGTAGTTGGGGGCGGCAACCGGCAAGACAGAGAGGGTGCGGTCAGACTGTGCCCTATTGGCCTGGTGACAATGTCCTAGAAGAACAATACTATAGCACAGGTTACTGGGTGAATGCAACAGGCGATTGCCAGCTGAGAGAAGGTGTATGGCTATCAAGAAAGGGTAATGTACAGTGCCAGCGTAATGGCTCATCCTTGATATTACAATTAGCGATAAAGGAAGAGAATGACACTATGGAGATACCATGTGACCCGGTGGAAACAGAAAGCATGGGTCCAGTTGCACAGGGCACCTGCGTGTATAGCTGGGCTTTCGCCCCAAGAGGGTGGTATTATAACAGGAAAGACGGTTACTGGCTTCAGTACATAAAGAAAAACGACTACCAGTACTGGACAAGAATGCCTACGGCCTCATCCGCTACAACGATGTACCGTCATTTGCTCCCCCTACTGGTGGCCTGCCTCATGGGCGGAAGGATATCAGTGTGGATTGTAGCAATGCTCCTATCCCTACAAGTGGAAGCTAGCGAAGTAGGTACTAAGCAACTGGCTGTCACACTGACTCTGTGGAAAATGGACTGGACAGAACTACTCTTTTATATTATTATAATGCTAGCCGTTAAGGAGGAGCTCATTAAAAAAATAGTGACTGCAAGCCTAGTGGCCATAAAAAACAGCCCAGTGGCCTTGAGCTTTCTTATTGTACTCAGGCTTGTGGGGGGCAGTGAAGCACTCCCAGTGGGTCTACTATTAGAAAAGATGTGCATAGACCAGCCGGAGTTTGGAACTCCTTTCCTGATCTACCTGTGGGACAATTGGAAGTGGACTGTACTAGTCAGCTTCTCTGCGCTGAACCATGAAAAAACTATAAAACTGGCAAGAAAGTTGCTATTGGCCACACATATAACAGCGCTCACATTGACTGGTCTGAGTGACTCAATCTTCTACATGATGCTTATAATGACCAACCTACTAATAAAGACATTTATATATCTACTAGGGGCCAGCATAAATTGGGTCGAGAAAGAAAAAAGAAAGTTGCTTGTAAAGAGGAAATTAATATATAAGAAAGCCGCGATTTGCAGTCAGGGTGAGAATGAATTGGGGGATAAATTCAACAGGATAACTGTGAATGCGGATTTCACCCCATGCAAACTTGAACTTTTACAATTACTTAGGGCTTTTTTAGTTTCCTTATGTTTTTCTTATTACAAGCCTCTCCTGTACGCAGAGACCACCTTAACTGTTATAGTAATTGGCGTACAGGAGTACAATGTAGCAATGGCCCGCGGGCGAAGTGTGGTCCACAGGCTACTAGCTATGGCCTACTACATATATGGCCGTATACAGGGTGACATGTTCCAACTCGCCACTGTTCAGTGCCTGTTGTCAAGCCCGAGAAAAATTATGAAACACATGATAGAGAATCCAACTCTCAAGAAGCTCTGGCAAGGCGAGACAGAACTTTTCAACCAGGGTGTCAGCCAGTCCAAAATAGTAAATTCAAGAAAAATTGGGCTGGGGGAATTGCAAAAGGGCATGTGCGGCCTCCCAACTGTAGTACAAAATTTGGTTATATATGCAAAGAAGAATGACTCTCTCATTTTAGGAGAGTTGGGTTACCCCCCAGGGGACCTCACCAATGATGGGTGGGAAATCTTAGGCCCCGGCAGAATACCAAAGATCACTAATGTTGAATCTGCTAAAATGGACTTATTCTCTAAACTTATGACCTTTCTGGGGATTGAAAGTTCAAGAGTCCCCAGAACCCCAGTCCACTCAACAAGGAAATTATTGAAGATAGTAAGAGGCTTGGAAACTGGATGGGGGTACACTCACGCAGGGGGAATCAGTAGCGCAAAACACGTTACAGGTGAAAAGAACTTGATGACCCACATGGAGGGCAGGAAGGGTAAATATATCCTACAATCCCAAGAACATGGAGCTGATGAGGTAGAATATGGAGTAAAAACTGACCAAAAAGCACCCGACAATGCCTTATGCTACTGTTTTAACCCTGAAGCCACAAATATAAAAGGTGAAACGGGAGCCATGGTGTTCATGAAGAAGATAGGGAAAAAATGGACTCTCGTAACATCAGATGGTAACAAAGCCTACTATAATGTAAACAACCTGAAAGGGTGGTCTGGACTACCAATAATGTTGCACTCCACTGGGGCCATAGTAGGGAGGATTAAGTCAGCATATTCAGATGAAAACGACTTGGTGGAGGAACTCATCGACTCCAGGACCATCAGCAAGAGCAATGAGGCAAACCTGGAACACCTTATCAAGGAATTGGCAGATATGCGGAGGGGGGAGTTTCGTTCAATCACCCTTGGAACGGGAGCTGGAAAAACTACAGAGCTGCCTAGGCAATACCTCACAACGGTAGGTGCCCATAAATCTGTGTTGGTGCTAGTCCCCTTAAAAGCACCCGCTGAAAGTGTCTGCCGCTTCATGAGATCCAAATACCCTACCATCAATTTTTCCTTGAGAGTGGGGGAGCGGAAAGAGGGAGACGTGAGCAGCGGCATCACTTACGCTACTTACGGATTCTGCTGCCAACTAAACCTGGTCCAACTTAAAGAATGGATATCCAGGTACTCAATGGTGTTTTTTGACGAATACCATACGGCAACTCCAGAACAGATAGCTATAATAAGCAAGATCCATGCCCTGAAAATCAAAACTAGGATAGTGGCCATGTCAGCAACTCCCCCGGGCACCGTGACGACCGAAGGCAGGAAATTTGATATTGAAGAGGTCGGGGTTGCTACTATAGAGAAAGGAGAGGAACCAAAAAGGGGGCGTATAGCGGTCGCCGGTATGCAGGTGCCGTTGGAAGACTTGACAGGGAAGAACTGCCTGGTATTCGTGGCAACCAAAGAGGCTGCGGAGACAGAGGCCAAAGAACTGCGCACCAGGGGAATCAATGCCACTTACTACTATTCAGGTATAGATCCCAAGACTCTGGAGCATGGGATGACCAATCAGCCATATTGCATTGTGGCCACCAATGCCATCGAATCAGGCATAACCTGTCCTGATTTAGACGTGGTCATAGACACCATGCAGAAGTATGAAAAAGTAGTGAACTTCTCAGCAAAGATGCCCCTGATCGTCACATCATTAGTGAAGAAAAAAATCACCAGGGAGGAACAGGGTCAGAGGAAAGGCCGAGTGGGTAGGCAAAAAAAAGGAAAGTACTACTATCCTTCGGGGGTGGTACCGAATGGATCAAAAGATCTAAGTTATTTAATCCTGCAGGCTCAAGAGTACGGTGTCTTGGAACAAGTGAATATAACAGAGTACTTCATAATAATGAACGAGGACTGGGGTCTTTATGACGTAGATGAGGTAGAGGTAAGAATACTTGAGAGAATGAACAAGGAAATTCTGCTTCCACTAGGTATCGTGGAGAAGCAGATCCTGGAAAGAAGTACTCACCCGGAAAAAGTGGCACTGTTGTACAATAAATTAGTGCAGAAAAACCCTATAGTATACCCTAAAGTACAGGAGGGTGAGGTCAGCAAGGAATACAACACCCATAATCTGGCCGTGTACGACAAACTAAAAGACGTCAACCCACAAGCTATTTATGTCCTAGCTGAAGAGGAGAGAGCCACAGAAATGATGGGCCTCGAGTTCGAACAAGATCCATCTGACTTACAGGACTCGGTAGCCCAGCTTTGCGAAGACATCAAGAGGTATACAAAGCTCTCTGGGATCACTGAAAAATTACTAGTAGGCACAATGGTGGGATATATTGGATACAAAGCCTTAACCAGAAACCACGTGCCCTGGGTCAGCAAAGAGTATTGTTATGAGCTGACTGACTCGCCGGACACTTACGAAAACTCATTCGCACCTCTAGATGTTGACGTCCAAAACCCCAGTGAAGGTAAACACTCAGAGCAACTGGCAGACCATCAACTGAGGCAACTACTAGAGACAGGGAAGGACAAGGTAACTGACTTCCTAAAAGGAATCCGTGAGTTCACCAGTGGGGCCATAAACAGCCCAAAGGCATTGAGTATATGGGAAAAAATTTATCAGTACTTGAGGGAGCATCAGGGCGAGATTATCTCATCAGCGGCATGGGGCAGTGCAACGGCCCTTCACGACAGTATCAAATCTAGACTAGGAGATGAGGTCGCCACTGCAGTAATAATCCTCAAGTACCTAGCATTTGGCGAAAGGGAACTGTCCGGGCTGACTAGGCAAGTTCTAATTGACATCATAGTATATTACATAGTCAATAAGCCCCGGTTTGAAGGAGATGACTATGCTAAGAGAAAGGGAAGAAGGCTAGTTATCGAAGTCTTGATGGGGGCACTGGCGACTTATGCTGTGTCCAATTTTTGGGGCGTGTCCATTAATAAGATACTGCAACCAATATCTGACTATTTACCCTATGCCACTGCCACTCTAGCTTTCCTTCGTCCAACTTTTATGGAATCAGCGGTGGTGGTCGCTTCTTCTATCTACAGAGCTTTCCTTTCCATCAAACATGCGGAAAACCGGAGTCTTGTCACACAAGTCGCTTCTGCTGCCCTTGAAGTCATGGGTCTGACCCCAGTATCAGCCGGCCTAGGCGTTTTGCTAGGGCTCGGGCTGTGTGTGCTCCATATGAACATCGACAAAAACGAGGAGAAGAGGACACTGATACTGAAAATGTTTGTCAAAAACTTTATAGACCAGGCGGCACTAGACGAGTTGGATAAACTGGGACCAGAAAAAATAATCCTCTCATTGTTGGAGGGTATTCAAACTTGCACAAACCCGGTCAGAGCAATCATGATTTTGTACAGGGTGTACTACAAGGGAGAATCATTCACAGAAGCCTTGTCTAGGATGGCTGGCAAGTCTCTTATTGTGATGGTCATTGTCGAGTTCCTGGAACTGACGGGCCAGACCCAAGGGGGGTATATAGATCTTAGTTCCAACTTGCTGACCTTTCTCCTGGAAAAACTAAAAAAAATGACCAACCTCGCCATTGGGGAAGCCAGAAAGGCCTTACTACCTATCCCATACCTGTACTGTGAAACCTGGCAGACCGACGCCAGAATTAAGGCCCCTGAATCCTATGACCAAGTGGTAGTGGAATGCAAATGTGGTGCTTCAGCAAGGTATTCCTTCCACCATGGGGCTCATGAGATATTGGAAGAAAAAAGGACCAAGTGGTGCAAGAACTTCTTCCTATGGGGGCCTAATTTTCATAACCCGGACCCAAAGAGAATGACATTCTATGAATACGGCCAAGCAAAAAAGTGTCCTGTTATCATAATGGGTGAGGACATAACCTTTGGCAAATATGGTATATATGTCAAATTTGGCCATGGCCCTGACGGGAAGAGATCAATAAGGGGCACCACCCACGCCACCATCAGCAGGGAGGAACTGCTGGAGATCCTAACGGCCCCAAGCCAAGTGGCCATAGGCAAAGTCAAGCTGACCGACTACTGCAATCAAAAAGGAGTAATAGACAGGAAACTGGCCGTACTTGAAGGTGACAAAATACATTTTTGGAAAGCACACCGTGGGTCCAAGATCACAGACCAACTCACCATTGAGAGTCTAACAGATGATTTGGGGTCAGAAATCAGGGATATTACATGGGAGTTGTACACAGGCGGGACATGCACCGTAAAGGGGATATCCCTTAGATCGTGTGCACCAGGTCAAAGGAATAAGGCTACGGTCTTGTGTGACTGCACCGACGTGCTTAGCCCTTGCTACCTAATCAACGGCAGGAGACCATCCCCATTCGACGTCGTGGAAGGTTATGAATGCCACCATCGGAAGCCCCGAGCGACGTATGAAGATTTAGAAATGGAAGAAATATTGAAGAGACGGGTTCCTGTTTATGATCCTCTGTGTTTGTTTGACACTGACAGTAAATTGCTGCCCCCTGATACTTATTACTTGGAAGAAGACCAAGAAGACTTCGAGTACGCATTGAGATGCTGGGGCTTAGGGGTATATGTAGCGGACGGACTTGTCACTTCCCCCCCAGATATAAGAATACACCACAGTTCTGTACTACTACTGTTGACACCTGGAGTGGACTCTGATTTGCCCTTACAGTATATACGTTGCTACCCTCATCAGGCAGAGGTGGACATCTATATTAGGAGCCAAATTCTAGAGGAGGAAGACACTGCCACGGAGGCGGAAGCCTCTCAGGAAGATAGTGAAGAAGGGATGGACGACGTGGTAACAGAAGATGAGGATACATCGTCCACAACTGAATCAATGCCCCCACTAGAAGGGGAGGAAGGGGGCGAAGAACCAATCACTTATGTGGTCATCAGAGGATTGCAAGAAGAAAGATACGCCAGCCACCTTAAATTGAGTGACTGGATCAGTGAAAACATTTCGGAGCCACACAGAGTCCAAATCATGCTTGATGGAACAGTGAGAGTCACAATAAAAGAAGGTAAAGTGAAACATCTATTTGGGGTCTACAGAGTTGAAAACTCCCTGGAAGCAATGTTTAAAGAAACCATAGCTGACCTCCCTGTAGCCACTCAACTGCCCCGAGGGCCAATCTATACGGCTAAAGAGTTGGCCCAAGGGAATATTGCCCCAACCCAACCCGCAGTAAATTATTATGGAATGGTAGAAGGGAGAGGTGACCCAATGACAGCATTCGAAGCCTTATCAGTCCTGCGTTCACAAAAAGTCTTAGTCAAGGAAGTGAAGGTGAACACCCGCAGGGCACAGGCTTTTCTAAATAAAGTCAGGAAAACTGCCGAGGTCAGAGCATCGGAATTGACATTAAAATGCTTACCGGTACTCGGGAAAATAAATGGGAGGAAATTGATCAGAGAGGAAACCAACATCCCCAACCAAAGGTTGGCTTCAATAATGACCTCAATAGGAATTAGATTAGAAAAACTGCCAGTGGTCAGAGCAAACACCTCTGGCTCTAAGTTTAGGCAGTCAATTTCAGAAAAAATGGATAAATATGAAAATGAACAAGTTCCGGGGTTACATGAGAAAATGTGGGCAGCTTTTCTGGCAACTGCCAGACAAGATTTAAGAGGTACATATGAGGAAGTAACCTATCTCGAACTGGAGACCGGAATCAACCGGAAAGGAGCCCCAGGTTTCTTTGAAAAAGAAAGCTCAATAGGAGAAGTGCTGGAAAGAAAGGAAAAAATTGACGTCGTGATCCAGGAGATTGAGAAAGGTAACCATCTATACTATGAAACAGCCATGCCAAAAAATGAGAAAAGAGATGTGCTTGATGACTGGTTGTCTGAGGACTTCGTCACTTATAAGAAACCACGTGTGATACAGTACCCTGAGGCAGTCACCAGGCTGGCTATCACCAAAATAATGTACAAGTGGGTGAAGCAGAAGCCTATAGTGATTCCCGGTTATGAGGGGAAAACCCCAATCTTTGAAATATTTGAAAAAGTCAGTGCAGATTGGGCTCAATTCAGAAATCCGGTAGCTGTCAGTTTCGACACCAAAGCTTGGGATACTCAAGTAACGAGGGAAGACCTCAGGTTGGTAGGACGGATACAGAAATACTACTATAAAAAGAAGTATTGGAAATTCATTGATAATTTGACAGCCATGATGGAGGAGGTGCCTGTAGTCACTGTAGAAGGAGACATGTTTCTTAGAGTCGGACAACGCGGGTCCGGACAGCCTGACACCTCAGCAGGCAATTCTATACTAAACGTGCTAACAATGTTAGTAGCTTTCTCTGAATCCACAAACCTGCCCATAGCGGCTGCCTGGAAGGCCTGTCGGATCCACGTCTGTGGGGATGACGGTTTTTTGATCACGGAATCAGAATTAGGGAGGAAATTCGCTGAAAAAGGTGTCCCTCTGTTAGCTGCATTTGGCAAACCCCAAAAAATTATAGAGGGGGCCAGCTTAAAAATAACCAGCAACTTTGACGGGATAGAGTTTTGTAGCCATTCCCCCATCAGAGTCCAAACACCAAACATAAGGTGGATGCCAGCGAGGCCCACAGCGACAATTCTAGGCAAAATGAGTACTAGGCTAGGTGAGGGTGCCACTAGATCAGGGGAAGAATATGAAAAACAGGTGGCATTTGCATATCTACTGATGTACCCCTGGAACCCACTGGTCAGGAGGATCAGCCTTCTATTGCTATCAACTACTGACCCAATAGGGAAAGAAGAAACCCCATGCTCCGATGAGGGGGTAAAGTATGTTGGGGACCCCATAGCTGCATACAGGGACGTATGGGGGCACAAATTAGAGGATATAGGGCATGTTGATCAGCCGCAGTTGTCCCGGATGAACTATAGCATGACTTACTTAGGGATCTGGAAGCCAAAGACGAGTCAGCGGCTAGTCGAACAATGCTGTCGATTGGCCGAGAAAAGCAACTGTGTGGTACGTGCTGATTCCCTAATTAAGAAAAAGGTCAAGATCACTTATGACCCGGGGATAGGAGTGGCTCAGGTCATTCGTAGGTGGGAAGAGCTTGAGTGGACCAGAAGGAGACCTGAATTCACTAATGCAACTGTAGAAGATGATATCTTCTTAGCCCTATGGAAGAGACTCTCAAAGTACATTTTCCAGAAAATAAAGTTCATGCAGAGAATGCTTACCCCTTATTAAGTGGGGGGCGCTCATTCAATTATAACCAGTATCTGGTAAGTATGAGACTTGTATAAATAAAACATATAACTGAAAGGGGCAAGTGGCCATATAGGCTGGGGCGATCGCCGCACCCCCCCCTCACTAGGCGCCTCAACCCCATGTACCATGTGGGTTGTTGTAAATACTTGAATGAATGGAGTAATACGGGTAACAAACTTACAGGCCAGTATTGCCCCATTTGCTTTATAGTGGTGACGACCTGTATAGGTCTGATCTAGATGAAGCAAGGGGGCCC
| 28,867
|
LC700403.1
|
Atypical porcine pestivirus
|
Ikeda,K., Miyazawa,K., Takagi,M., Tomochi,H., Ishii,K., Araki,M., Iwamaru,Y.
|
Tsukuba, Ibaraki 305-0856
|
Japan
|
2022-07-02
| null |
Pestivirus scrofae
|
Pestivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 11,567
|
GenBank
| null |
Japan: Okinawa
|
Japan
|
Sus scrofa
| null |
2021-02-05
| null | null |
Atypical porcine pestivirus OKN/2021 RNA, complete genome
|
GCATAATGCATAAATTGGCTGCATTATGTGCACAACATCCCAAATTGTAACAAGCTCTGTGGTGAGTGGGGGAAAAAGGTTAACCAGGCCTTTAGTACCACAGGCACCAATGTACAGGGCAACTCAAACCTGAGAGAGAGGTACCGAACTCTTAAGCCCCGAGTACGGGGCAGACGTCACCGAGTAGTACACCCAACGACCACCATATTTAGGTGTAGGGTCTACTGAGGCTCGGGTGGACGTGGGCGTGCCCAAAGAGAAATCGGTGGGGGACCTGGGGGTCGGGTCCGCCATACCCCTTATGGGGTAGACCTTACTGCTTGATAGAGTGCCGGCGGATGCCTCAGGTAAGAGTATAAAATCCGTTGTTTATTAACATGAAAGAACAAATCACATATTACTTAAAAAAAGAAAAACAAAGGAATGGGTGGACAGAACTAGTAGTAGGAGAAAGCCATACAAAAATAACCACACTTTCCGGGAGGACCTATCGAGGTACTTGGGAAATGGAGAAACGGCCCAACCCTTATGGAATTTATCTCCCTAGGCCAAACCCCCAACAGCTCACGGCCTTGCACCCACATCCAGTCATAAACTGTAGGATGATGGAGTACAAAGAAGCGGACCCTAATTATGGCGACTGCCCAGACACAAACGGAGTATTCATCGATGAAAAAGGTAGGAAATTTAGTGGCCCTCCTTTAGGCTTTTGGAAGATAAGGCTGGACTACAATGAATTGGTGAATGCCAACAAACCAACTCTCACAAGTAAACAGATTTCTTATCGGGTCGAAACCTGTAGTGGAGAATTAGCCACCGTAGTACCTATACACGGCAGGGTGCTCGTGAATGATTACAGGGGGTTTTACCAATGGAAGCCTAGGTGTGAAGGAATGGTGCTCTACGTAAAAACCTGTTCCGACTGGGCGGACCAAGTGGACAAGCAAGAAAAAGCAAGCCCCCCAAAACCACAAAGACCACCAAGACGAGACCCACGGAAAGGATTGCAGCCTCAAGTTCCCAAAGAAACTGAAATCACAGAAAGAAAAAGACAACCTAGTGTAACTTTAGTGTCTGGGGGGCAGAAGGCCCAGATCATTTATAAAGGTAAGACCAAAAACAAAAAGACCCCGGACGGAGTCTATAAGTACCCAGGGGCTAAAGAAGGGGACGTAGTAAAAGTGAGGAAGATGTTAAAAAACTGGCACTTAGCTCTGGTGATGTGCCTGATATATCTCATAAGTCCAAGCCTTGCAAAAGTCCAATGGTTTTTGAAGGATGAAAACTCAACGGGAATTAACCAGATACTGTGGCAAAGACGGCTTAATAGGTCCTTGCATGGAGAGTGGCCAAACCAAATCTGCCATGGCATGCCAAATGAAACTATCACCGACGAGGAGCTATATAGCTTGGGAATGATAGATACTAGCCCAAGAACGAACTACACCTGCTGCCAATTACAATACCACGAATGGAAGAAACATGGCTGGTGTAATTATCCACAAAAACAAGCATGGATCAGAAGAATAACAGCTTTGCAAGCCAACCTTACTGGGTCCTATGAAGGGCCAGAATGTGCTGTCATATGTCGGTTCAACGGCAGTCATAACATCGTCAGACAAGCCAGGGATGAGGTTAGCCCACTTACAGGATGCAAGGAGGGGCGCCCTTTCCTGTTCGCTGGTGAAAGATCTGAGGCCTCGTGTTTAAGACCGCCTTCCACCAGCTGGGTGAGACCAGTGAAGATGGATGAGGCATCAGTGGCAGACAGTTTTGCCCATGGGGTAGATAAAGTAATAATATTAATTAGAAAAGGGGCTTCAGGAATCGTTAATTTTCTAGACACTATCGGAAGATGGTTGCCAGTGGCTGATGCTATCATTACACCATACTGTGAAACATACACCGTAACGGGGATGTATGTCCATGTTAAGCATTGCCTTCCCAAGGGGTTGCCCAAGCACTCGAAAATAATTTCCCCGACATTGATATACCTGGGAGAAGGCGATCCAGCCCATAATATCCAACATCTATTTGGCTCAGGTATAGCAAAATGGGTTCTAGTGCTACTCGGGGTCTTGGGCGAGTGGTATGGGGAACTAGCCTCAACTATATACTTACTACTGGAGTATGGGACAGAATGGTTGGAACATGAAAACCTGATCACAGAAGGGCTAATACCTGGCATCAATATTACAGTGGAGCTCCCAGCCAGTCATACAGTACCTGGCTGGGTATGGGTCGCAGGCCAGTGGGTGTGCGTAAAGCCAGACTGGTGGCCAACACACATTTGGATCGAAACTGTAGTGGCGGAAGCCTGGCATGTGCTGAGGATACTGGCCTCAGCCTTGGTGAACATAGTTACTGCATTTGTTAACTTAGAATTGGTCTACCTGGTCATAATACTAGTCAAAGTATCAAAAGGCAATTTGATAGGTGCTATCCTATGGTGCCTATTATTGTCAGGGGCCGAAGGGTCGTGTTACAAGAGACAGGACTATTACAGTATCCAGTTAGTTGTCGAGGAAAAAACAGGCATAGAAAAACGGTCCGTAATGGGCAAGTGGACTGTGGTGACTAGAGAGGGTCGAGAGCCAAGACTGATGGAGCAGATCAGCATGGTATCAAACAGTAGTCTGACAGAGACCTACTGCTATAATGAACTAAACACCAGCAGTTGGGGACGACATCCAATGAAACAAAGGGGGTGTGGGCAGACCGTACCCTACTGGCCTGGCGATAATGTCCTTGAAGAACAATACTTCAGCACGGGTTACTGGGTAAATGCCACAGGAGGTTGCCAGTTGAGGGAAGGTGTGTGGCTATCGAGGAAAGGTAATGTCCAGTGCCAACGCAATGGCTCATCCCTGATCCTGCAGTTGGCAATTAAAGAGGAGAATGATACCATGGAAATACCGTGCGACCCGGTGGAAACTGAGAGCATGGGCCCAGTGGCACAGGGCACTTGCGTGTATAGCTGGGCAGTAGCCCCAAGAGGTTGGTATTACAACAAGAAAGATGGTTATTGGCTCCAATATATAAAGAAAAATGACTATCAGTACTGGACAAAAATGCCTGCGGTCTCTTCCGCTGCAACAATGTACCGTCATTTACTACCTTTGTTGGTGGCTTGCCTTATGGGCGGTAGGATTTCAGTATGGTTTGTAGCAATGCTTCTCTCCCTACAAGTGGAGGCCAGTGAGGTGGGGACCAAACAGTTGGCCGTCACCCTAACTATATGGAAGATGGATTGGACGGAATTACTCTTTTACATCATCATAATCCTGTCCGTAAAGGAAGACTTTATAAAGAAGATAGTAACAGCAAGCCTAGTGGCCCTCAAAAATAGCCCAGTAGCCTTGAGCTTCTTAATTGTGCTTAGGCTAGTCGGAGGTAGTGAAGCACTCCCGGTAGGGCTTCTACTAGAAAAAATGTGTATAGACCAGCCAGAGTTTGGGACCCCTTTCCTAATTTACTTATGGGATAATTGGAAGTGGACTGTCTTAGTCAGCTTCTCTGCATTAAATCATGAAAAAACCATAAAGTTAGCAAGGAAACTTTTATTAGCCACACACATCACAGCACTGACGCTGACCGGCCTGAGTGATTCAATTTTTTACGTGATGCTCATAATAACCAATTTGCTAATAAAGACATTCATATACCTACTGGGGGCAAGTATTAACTGGGTAGAGAAGGAAAAAAGGAGGCTGCTAATGAAAAGGAAGCTGATATACAAACAGGCCATAGTTCGCCATCAGGATGGGGATGAACTAGTGAGTAAATTCAACAAAATAGCAATAAACACGGACTTTACTCCGTGTAGGCTTGAACTGCTGCAATTACTCAGAGCTTTTCTGGTTTCTCTATGCTTCTCTTATTACAAACCCCTCCTATATGCGGAAACCACCCTAACTGTCATAGTGATTGGTGTACAAGAGTACAGCATGGCAATGGTCCGTGGGCGAAGTGTGGTCCACAGACTACTAGCCATGGCTTACTATATATATGGTCGCCTGCATGGGGATATGTTCCAGCTCGCCACAATCCAGTGTCTGATGTCGAGTCCAAGAAAAATAATGAAACATATGATAGAAAATCCAACCCTTAAGAAGCTCTGGCAAGGGGAGACAGAGCTATTCAATCAGGGTGTCAACCAGTCTAAAGTAGTGGACCCAAAAAAGATAGGGTTGGTGGAACTGCAAAAAGGTATGTGCGGTTTGCCGACCGCAGTGCAAAACTTGGTCATATACGCAAAGAAGAATGACTCCCTCATCTTGGGAGAGGTGGGTTACCCACCCGGTGACCTCACCATCGACGGGTGGGAAATACTAGGCCCTGGCAGGATCCCAAAAATTACTAATGTAGAGTCCGCTAAGATGGACCTACTCTCAAAACTCATGACTTTTCTGGGGATTGAAAGTTCGAGGGTCCCTAGAACCCCAGTCCACTCAACTAGGAAACTACTGAAGATAGTAAGGGGCATGGAAACCGGGTGGGGGTACACTCATGCAGGGGGAATTAGTAGTGCAAGGCACGTCACTGGTGAGAAAAACCTAATGACTCACATGGAGGGCAGGAAGGGCAAATACATCCTGCAGTCTCAAGAGCATGGTGCTGATGAAATAGAATACGGGGTGAAAACTGATCAGAAAGCACCTGATAATGCCTTGTGCTATTGCTTCAACCCTGAGGCCACAAATATAAAAGGAGAGACAGGGGCTATGGTATTTATGAAGAAAATTGGAAAAAAATGGACTCTCGTGACCTCAGATGGCAACAAAGCTTACTACAATGTAAGTAACTTAAAAGGGTGGTCTGGCCTACCGATAATGCTGCATTCTACTGGAGCAATAGTGGGGAGGATCAAGTCGGCGTACTCAGATGAAAATGACCTGGTGGAAGAGCTAATTGACTCCAGGACCATCAGTAGAAGCAATGAGACAAACCTGGAACACCTTATTAAGGAGTTGGCAAGCATGCGGAGAGGGGAGTTCCGCTCAATCACCCTTGGGACGGGCGCCGGAAAAACCACGGAATTGCCCAGACAATATCTCACAACAGTAGGGACACACAAGTCTGTACTAGTCCTAGTCCCTTTGAAAGCGCCCGCTGAAAGCGTATGTCGCTTTATGAGGTCTAAATATCCCACTATCAATTTCTCCTTAAGGGTGGGGGAGCGAAAAGAAGGGGATGTGAGTAGCGGCGTCACCTATGCTACCTATGGATTTTGCTGTCAGCTCAACCTAGTACAACTCAAGGAATGGGTATCCAGGTACTCAATGGTGTTCTTCGATGAATACCACACGGCAACTCCAGAACAAATAGCCATAATAAGTAAGATCCACGCATTAAAAGTAAAGACCAGAATCGTGGCTATGTCAGCCACTCCCCCAGGAACCGTGACAACAGAAGGTAGAAAATTTGACATAGAAGAAGTGGGGGTCGCCACAATAGAAAAAGGGGAAGAGCCAAAAAGGGGGCGTATAGCGGTGGCCGGCATGCAGGTTCCGTTGGAAGACCTAACAGGGAAGAACTGCCTGGTATTCGTGGCAACCAAAGAGGCTGCAGAGGCGGAAGCTAAAGAACTACGAGCCAGGGGTATCAATGCCACTTACTATTATTCAGGCATAGATCCCAAAACCCTAGAGTATGGGATGACTAACCAACCATACTGTATTGTGGCTACCAACGCCATTGAATCAGGTATAACTTGCCCCGATCTAGATGTGGTCATAGACACTATGCAGAAGTATGAAAAAGTTGTGAATTTTTCAGCAAAGATGCCCTTGATTGTCACTTCGCTGGTGAGGAAGAAAATCACTAGAGAGGAGCAAGGCCAGAGGAAAGGTCGAGTAGGCAGGCAGAAGAAGGGTAAATATTACTATCCATCGGGTGTAGTGTCAAATGGGTCAAAAGACTTGAGTTACTTGATCTTGCAGGCTCAAGAATATGGTGTCTTAGAGCAGGTCAATATAACTGAATACTTCATCATGATGAATGAAGACTGGGGGCTTTATGACGTAGATGAGGTGGAGGTAAGAATACTGGAGAGGATGAATAAAGAAATTCTACTCCCATTAGGTATTGTAGAGAAGCAAATTCTGGAAAGAAGTACCCATCCGGAAAAGGTGGCACTATTGTACAACAAGTTAGTACAGAAAAACCCCATAGTCTACCCCAGGGTGCAGGACGGTGAAATTAGCAAAGAATACAACACCCATAACCTAGCTGTGTATGATAAACTTAAGGACGTTAATCCACAAGCAATTTATGTCCTAGCAGAAGAAGAGAGGGCTACGGAAATGATGGGCCTTGAATTTGAACAAGAGCCATCTGACCTGCCGGATTCAGTAGGCCAACTTTGTGAAGACATCAAGAGGTACACAAAGCTCTCTGGGGTCACTGAAAAGCTGCTAGTTGGCACAATGGTGGGGTACATTGGGTATAAGGCCCTGACTAGAAACCATGTGCCCTGGGTCAGCAAAGAATACTCTTATGAGTTGACAGATTCGCCAGACACTTATGAAAATTCATTTGCACCTTTGGACGTAGATGTCCAGACTCCCAGTGACAGTAAGCATCCAGAGCAACTGGCGGATCATCAGCTGAGACGACTGTTAGAGAATGGGAGAGATAAGGCAGTTGACCTCCTAAAAGAAATTCGTCAGTTCACCAGTGGAGCCATAAACAGCCCAAAAGCATTGAGCATATGGGAGAAAATTTACCAATACTTGAAGAAGCACCAGGGAGAGATTATTTCATCAGCAGCGTGGGGTAGTGCAACAGCCCTCCATGATAGTATTAAATCCAGGTTGGGCGATGAGGTCGCCACAGCAGTAATAATCCTCAAGTATTTAGCATTTGGGGAGAGAGAGCTGCCTGGACTTACTAGACAGGTACTAGTTGACATCATAGTGTATTACATAGTCAACAAGCCCCGGTTCGAAGGAGACGACTATGCAAAAAGGAAAGGGAGAAGACTAGTCGTCGAGGTGTTGATGGGGGCACTGGCAACTTACGCTGTATCCAATTTCTGGGGTGTATCCATTAGTAAAGTGCTACAACCAATATCAGACTACTTGCCCTACGCTACTGCCACTTTGGCCTTCCTACGCCCAACTTTCATGGAATCAGCGGTGGTGGTGGCATCTTCCATCTACAGGGCCTTCCTCTCTATCAAACATGCAGAAAACAGGAGTCTTGTCACGCAGGTCGCCTCGGCTGCCCTCGAGGTCATGGGTTTAACACCAGTGTCAGCTGGTTTAGGTGTCCTGTTAGGGCTTGGATTATGTGTGCTCCATATGAATATAGATAAGAATGAAGAGAAGAGGACACTAATACTGAAAATGTTCGTCAAAAATTTTATAGACCAGGCGGCGTTAGATGAGTTAGACAAACTGGAGCCGGAAAAAATAATTCTCTCATTACTGGAAGGTATCCAGACCTGCACAAATCCGATTAGGGCTGTCATGATTCTGTACAGGGTCTATTACAAGGGAGAATCGTTTACAGAAGCCCTATCTAAGATGGCAGGGAAGTCCCTTATTGTGATGGTCATAGTGGAATTTCTGGAATTGACAGGCCAGACACAGGGAGGGTACATAGACCTCAGTGCTAACTTGTTAACCCTCCTTTTGGAAAAACTGAAAAAGATGACTAACCTCGCCTTAGGGGAAGCCAGGAAGGCCTTACTCCCCATCCCATACCTGTACTGTGAAACCTGGCAGTCCGATGCTAGAATCAGGGCTCCAGAATCCTACGACCAGGTGGTGGTGGAATGTAAATGCGGGGCCTCGGCAAAGTATTCCTTCTGCCATGGAGCTCATGAGATGCTGGAAGAGAAAGGGACCAGGTGGTGTAAAAACTTCTTCCTGTGGGGACCCAACTTTAAACACCCAGACCCAAAAAGGATGACATTTTACGAATATGACCAGGCAAAAAAATGCTCCGTAGCCATTATGGGAGAGGACATAACTTTTGGCAAGTACGGCATATATGTCAAATTCGGCCACAGGCCCGATGGGAAGAGGTTAATACGGGGCACAACCCATGCTACTATTAGTAGGGAGGAGCTATTGGAAATCCTGTCGGCCCCAAGCCAGGTAGCCATAGGCAAAGTCAAATTGACTGATTACTGTAACCAAAAAGGGGTGATGGATAGGAAATTGGCAGTACTCGAAAATGACAAAATACATTTTTGGAAAGCACACCGTGGGTCTAAAATCACGGACCAATTGACCATCGAAAACCTGACGGACGACTTGGGGTCGGAAATTAGAGATATCACATGGGAATTGTACACAGGAGGGACGTGCACTGTGAAAGGGGTATCCCTTAGATCGTGCGCACCAGAGCAAAGGAATAAGGCCACAGTCTTGTGTGACTGCACTGACGTGCTCAGCCCCTGTTATCTAGTTAATGGTAGGAGGCCATCCCCATTCAATGTGGTAGAAGGTTATGAGTGTCACCATCGGAAGCCCCGGGCAACCTATGAAGACCTGGAGATGGAAGAGATATTAAGGAAACGGATCCCTGTATATGATCCTCTTTGTCTATTCGATACCGACAGCAAGCTATTACCCCCCGATACGTACTACCTGGAAGAGGACCTAGAAGACTTTGAATACGCACTAAGGTGTTGGGGTCTTGGGGTCTACGTGGCAGGCGAATCCATAACCTCACCCCCAAACATAAGAATACACCACAGCTCTACACTGTTGTTATTGACCCCCGGAGTGGACTCCGAACTAAATCTACAGTATATACACTGTTACTCCCACCAGGTAGAAGTTGACATATATATCAAGGGCCAACTCCTGGAGGAGGAAGACTCTGCCACGGAGGTCAGCGACCTCCAAGAAAATAGCGGAGGGGAAATGGAAGATGTAATACCGGATGAAGAGGATACATTGTCCACAACTGAATCAATGCCCCCGTTGGAAGAGGGAGACGAGAGTGAAGAGTTGATCACTTACGTGGTTATCAGGGGGTTACAAGAAGAGAGATATGTCAGTCATCTTAAGTTGAATGACTGGATCAGTGAGAATGTCGCGGAGCCTCACAAGGTCCAGGTCATGCTTGATGGAACAGTGAGAGTGACAATAAAGGAGGGGAAAGTCAAACATTTGTTTGGGGTTTTTAGAGTTGAGAACACCCTAGAGGCAATGTTTAAGGAGACCATAGCCAACCTCCCCGTGGCTACCCAACCGCCCCAGGGGCCCATTTATACAGCAAAAGAACTGGCTCAGGGGAATATTGCCCCAGTTCAACCTGCTGCAAATTATTACGGGATGGTTGAGGGAAGAGGCAACCTAATGACAGCATTTGAAGCCCTTTCAGTGTTACGGTCACAAAAGCCTTCTGCCAGAGAAGTAAAGGTGGACACCCGCAGGGCACAGGCCTTCTTAACCAAAGTCAAGAGGGCTACCGAGGTTAAAGCGTCAGAATTGGCACTGAAGCATTTACCGGTGCTCGGCAAAGTAAATGGGAGGAAATTGATTAGAGAGGAGACTAACATTCCTAACCAAAGGTTAGCGTCAATAATGACCTCAGTAGGAATCAGGCTAGAAAAATTACCAGTAGTTAGGGCTAACACCTCTGGTTCTAAATTTAGACAATCAATCTTAGAAAAGATGGACAAACATGAAAACGAACAAGCTCCAGGGCTGCATGAAAAAATGTGGGCAGCATTCCTAGCGACTGCTAGACAAGATTTAAGAAACACATACGAGGAGGTGACCTATTCTGAATTGGAGAATGGGATCAACCGGAAAGGGGCCCCGGGCTTCTTTGAAAAAGAGAGCTCAATAGGGGAGGTGTTAGAAAATAAGGAAAAAATTGACGCTGTCATCCAAGAAATCAAAAATGGTGACCACTTGTACTATGAAACAGCCATGCCAAAAAATGAAAAGAGAGACGTGCTCGACGACTGGCTGTCTGAGGACTTCGTAACTTACAAGAAACCTCGAGTGATACAGTACCCCGAGGCCGTCACCCGGTTAGCAATTACCAAAATAATGTATAAGTGGGTGAAGCAAAAGCCCATAGTGATCCCTGGCTATGAAGGAAAAACTCCAATTTTCGAAATATTTGAAAAAGTCAGCGCAGACTGGGCCCAATTTAGGAACCCTGTCGCTGTCAGTTTCGACACCAAAGCCTGGGATACTCAAGTAACTAGAGAGGACCTCAGACTAGTAGCTAGAATACAGAAATATTACTATAAAAGGAAGTACTGGAAGTTCATTGACAATTTAACTGCCATGATGGAAGAAGTACCTGTAATCACTGTGGAAGGAGACATGTTCCTCAGAGTTGGCCAGCGCGGGTCGGGGCAACCTGACACCTCGGCAGGTAACTCTATACTAAATGTGCTGACAATGTTGGTGGCCTTCTCCGAGTCCACCAACCTACCAATAACGGCTGCCTGGAAAGCCTGTCGGATCCATGTCTGTGGGGATGATGGTTTCCTAATTACGGAAGCAGAACTAGGGAAAAAATTCGCTGAAAAAGGTGTGCCCTTGTTAGCTGCTTTTGGCAAGCCTCAGAAGATCACAGAAGGAGCGAGTTTGAAGATAACCAGTAGTTTTGATGGAATAGAGTTCTGTAGTCATTCCCCCATTAAAGTCCAAACACCAAATGTGCAGTGGATGCCAGCAAGACCAACAGCCACAATCCTAGGGAAAATGAGCACTAGACTAGGTGAAGGCGCCACTAGATCAGGGGAAGAATATGAAAAACAGGTGGCATTCGCATATTTACTTATGTACCCTTGGAACCCACTGGTTAGGAGAATCAGTCTCCTGCTATTATCAACCATTGATCCAATAGGAAAAGAGGAGACCCCATGTTCTGATGAGGGGGTTAAGTATGTGGGGGACCCCATAGCTGCATACAGGGATGTGTGGGGGCATAAATTGGAGGACGTTGGGCATGTCGATCAGCCGCAGCTATCCCGAATGAACTACAGCATGACTTATTTAGGGGTCTGGAAACCAAAGACGAGCCAGCGGTTAGTCGAGCAATGTTGCCGGCTAGCTGAGAAAAGTAACTGTGTAGCTCGTGCTGATTCCCTCGTCAAGAAGAAAGTGAAAATCACTTACGACCCCGGGATAGGGGCAGCCCAGGTTATCCGCAGGTGGGAAGAATTAGAGTGGACCAGAAGGAAACCTGAACTCACCAATGCAAACACAGAGGACGATTTCTTTCTGGTTCTGTGGGAGAGGCTGTCACAATTCGTTTACCAGAAAATGAAGCTCATGAAGAAGATGTTCGCCCCCTACTAGACGGAGGGGCCCACAATAAAATATTGCCAGTATCTGGTATGTATAGAATTAGTGTAAATAAGTATTTTTAATTTAAAAGGGGCAAGTGGCCATACAGGCTGGGGTGATCGCCGAACCCCCCCTTTCACTAGGCGCCTCAACCCCACATGCCATGGGGTTGTTGTAGATACTTGAATAAATGGAGTAATACGGGTAACAAACTTACAGGCCAGTATTGCCTCATTTGCTTTGTAGTGGTGACGACCTGTATAGGTCCGATCTAGATGAAGCAAGGAGGCCCCC
| 29,162
|
MW401769.1
|
Atypical porcine pestivirus
|
Ren,X.J., Hu,Z.H., Qian,P., Chen,H.C., Li,X.M.
|
Huazhong Agricultural University, State Key Laboratory of Agriculture Microbiology
|
China
|
2022-05-02
| null |
Pestivirus scrofae
|
Pestivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 11,360
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Sus scrofa
| null |
2020-11-11
| null | null |
Atypical porcine pestivirus strain CH-HB2020, complete genome
|
TGCTTTGATTGGGTGCATTATGTGTGGGACATCCTAAATTGTCATAAGCCCTGCGGTGAGTGGGGGAAAGGGGTTAACCAGGCCTCTAGTACCACAGGCACCTATGGACAGGGCAACTCAAACCTGAGAGAGAGGTACCGAACTCTTAAGTCCCGAGTACGGGGCAGACGTCACCGAGTAGTACACCCAAAGACCACCATTTCTAGGTGTAGGGTCTACTGAGGCTCGGGTGGACGTGGGCGTGCCCAAAGAGAAATCGGTGGTGGACCTGGGGGTCGGGGCCACCATACCCCGTTATGGGGTAGACCTTACTGCTTGATAGAGTGCCGGCGGATGCCTCGGGTAAGAGTATAAAATCCGTTGTCTATTAACATGGAAAAACAGATTTCATACTATTTAAAAAAAGAAAAACAAAGAAATGGGTGGACGGAACTGGTGGTAGGTGAAAGTAGTACAAAAATAACTACGCTATCTGGAAAGACCTATCGAGGAACTTGGGAGATGGAGAAACGAACGAACCCTTACGGAACCTATCTCCCCAGACCTAGTCCTCAACAGCTCACAGCCCTACACCCCCACCCAGTGGTGAATTGTAAGGTGGTTGAGTACAAGGAGGTGGACCCTAATTATGGTGATTGCCCGAATACAAATGGGGTGTTTATCGACGAAAAGGGTAGAAGGCTGAGCAGTCCTCCATTGGGTATTTGGAAGATAAGACTGGACTATAGCGACCTGGTAAATATAAATAGACCAATCCCCGCTAGTGGGATGAACTCTTACCGAGTCGAGACCTGCAGTGGGGAGATGGCTATTGTAACACCGCTACATGATAGGGTGCTTGTAGAAGACTACAGGGGACTATATCAATGGAAACCCAACTGTGAAGGGATAGTGCTCTATGTGAAAACATGTTCTGATTGGGCAGACCAGGTTGAAAAACAAGAGAGGGAAAGTCCTCCAAAACCCCAGCGACCACCAAGGCGAGACCCACGGAAAGGGTTGCAACCACAAGTCCCCAAAGAGACTGAGGTCACAGAAAAGAAGAAACAACCCAGTGTTACCTTAGTATCAGGGGGGCAGAAGGCCCAAGTTATCTACAAAGGCAAGACTAAGAATAAAAAGACTCCGGATGGAATCTATAAGTATCCAGGAGCCAAAGAGGGGGACGTAGTGAAGGTCAGGAAGATGTTGAAGAATTGGCATATAGCCTTAGTAATGTACCTGATGTATATCATAACCCCAAGCTTTGCTAAGGTCCAGTGGTTCTTAAAGGATGAAAACTCGACAGGGATCAGTCAGATACTGTGGCAAAGACGAATCAATAGATCCCTGCATGGAGAATGGCCTAACCAGATTTGCCACGGCATGCCGAATGAAACTATCACGGATGAGGAATTACGTAGTCTGGGAATGATAGATACAAGCCCCAGAACAAATTACACCTGTTGCCAGCTGCAATATCATGAGTGGAAGAAACATGGTTGGTGCAATTACCCACAAAAACAGGCTTGGATCAGGAGGATAACAGCCTTACAAGCTAACCTCACTGGAGCTTATGAGGGACCTGAATGTGCTGTCATCTGTCGATTTAATGGCAGCCATAACATAGTAAAACAGGCCAGAGACGAGGTGAGTCCACTGACAGGGTGTAAAGAAGGGCACCCTTTCCTATTCTCTGGTGAAAGATCCGACTCCTCATGCCTGAGGCCTCCTTCCACTAGTTGGGTAAGACCAGTAAAGATGGACGAGGTATCAATGGCCGACGGCTTCGCTCATGGTGTCGACAGGGCAATAATCCTGATTAGAAAAGGGGCATCAGGAATCATCAATTTCCTAGATGCTATTGGGAGGTGGTTACCTATAGCTGAAGCAGCTATAGTACCATATTGTGAAACTTACACCGTGACGGGGATGTACGTCCATGTGAAGAATTGCCTCCCTAGAGGGTTACCTAAGCATTCAAAAATAATTTCCCCGACAATGATATATCTGGGGGAGGGTGACCCAGCCCACAACATTCAGCACTTGTTTGGCTCAGGTATAGCAAAGTGGGTCCTAGTCTTACTTGGGGTTCTGGGTGAATGGTATGGAGAATTGGCCTCTACGATATATCTACTATTAGAGTATGGGTCTGAGTGGTTGGAACATGAAAGCCTGGTCACGGAAGGGTTGATCCCTGGCATTAATATTACAATAGAACTCCCAGCCAGTCATACGGTGCCCGGTTGGGTGTGGGTCGCAGGCCAGTGGGTATGCGTGAAGCCAGACTGGTGGCCCACACAGATTTGGATTGAGACCGTGGTAACAGAGGTCTGGCATATACTAAAAATACTGGCATCAGCCCTGGTGAATATAGTCACTGCCTTTGTAAACCTGGAACTGGTCTACCTGGTCATAATATTAGTCAAAATATCAAAGGGGAACCTAATAGGCGCCATACTATGGTGCCTATTACTGTCAGGGGCCGAAGGCTCGTGCCACAAAAGACAAGACTATTACAATCTCCAGTTAGTTGTCGAAGAAAGGACAGGCGTAGAAAAACGGTCCATAATGGGCAAGTGGGCTGTGATAACCAGAGAAGGTCGGGAACCAAAACTAATGGAGCAAATAAAAATAGTGTCGAATAACAGCCTGTCAGAAACTTACTGCTATAATACGCTAAATACTAGCAGTTGGAGGCGGCAACCGGCAAGACAGAGAGGGTGTGGCCAGACTGTGCCCTATTGGCCTGGTGACAACGTCTTAGAAGAACAGTATTACAGCTCAGGCTACTGGGTGAATGCGACGGGCGGTTGCCAGCTGAGAGAAGGTGTGTGGCTGTCAGGAAAGGGCAATGTACAGTGCCAACGCAATGGCTCATCCTTGATACTGCAATTGGCGATAAAAGAAGAGAATGACACTATGGAAATACCATGTGACCCGGTGGAAACAGAAAGCATGGGTCCAGTCGCACAGGGCACTTGCGTGTACAGCTGGGCATTCGCCCCAAGGGGGTGGTACTATAACAGGAAAGATGGTTATTGGCTCCAGTATATAAAGAAAAACGATTACCAGTACTGGACAAAAATGCCTACCGTCTCATCCGCCGCAACGATGTACCGTCATCTGCTCCCCCTACTTGTAGCCTGCCTCATGGGCGGTAGGATATCAGTGTGGATTGTGGCAATGCTCCTATCTCTACAGGTGGAAGCTAGTGAAGTAGGTACCAAGCAATTGGCCGTCACGCTGACACTGTGGAAAATGGACTGGACAGAATTACTCTTCTATATTATCATAATGCTAGCCGTCAAGGAAGAACTCATTAAGAAAATTGTGACTGCAAGTCTTGTGGCCTTGAAAAATAGTCCAGTAGCCTTGAGCTTTCTTATTGTGCTCAGGCTTGTGGGAGGCAGTGAAGCGCTCCCAGTGGGTCTACTATTAGAAAAAATGTGCATAGACCAACCGGAATTTGGAACCCCTTTCCTGATCTACCTGTGGGACAATTGGAAGTGGACTGTACTAGTCAGCTTCTCCGCACTGAATCATGAAAAAACTATAAAACTGGCAAGAAAACTGCTATTGGCAACACACATAACAGCGCTCACATTGACTGGCCTGAGTGACTCAATCTTCTATATGATGCTTATAATGACCAACCTACTAATAAAGATATTCATATACTTATTGGGGGCCAGCATGAATTGGGTCGAGAAAGAAAAAAAGAAGTTGTTAGTTAAGAGGAAATTAATATATAAGAAAGCCGCAGTCTGCAGACAAGGTGAGAATGAGTTAGAGAATAAATTCAACAAGATAACTGTAAATGCGGATTTCACCCCATGTAAACTTGAACTTTTACAACTACTCAGGGCTTTTTTAGTCTCTTTATGTTTCTCTTATTACAAGCCTCTCCTGTATGCCGAGACTACCTTGACTGTTATAGTAATCGGCGTACAGGAGTATAACGTAGCTATGGCCCGCGGGAGAAGCGTGGTCCATAGACTACTAGCCATGGCCTATTACATATATGGCCGCATGCAGGGGGACATGTTCCAGTTAGCCACTGTCCAGTGCCTGTTGTCAAGCCCGAGGAAAATTATGAAACACATGATAGAAAATCCAACACTCAAGAAGCTCTGGCAAGGCGAAACTGAACTTTTCAACCAGGGCGTCAGCCAGTCCAAAATAGTGAATCCAAAGAAAATTGGGCTGGAAGAGTTACACAAGGGTATGTGCGGCCTCCCAACTGTAGTGCAAAATTTGGTCATATACGCAAAGAAGAATGACTCTCTTATTTTGGGAGAGCTGGGTTACCCCCCTGGGGATCTCACCAGCGATGGGTGGGAAATTTTAGGTCCTGGCAGAATCCCAAAGATTACTAATGTTGAGTCTGCTAAAATGGACTTGCTCTCCAAACTCATGACCTTCCTGGGGATAGAAAGTTCAAGGGTCCCCAGGACCCCAGTCCACTCAACGAGGAAATTGCTGAAAATAGTCAGAGGCTTGGAAACTGGATGGGGGTACACTCACGCAGGGGGGATCAGTAGCGCAAAACACGTGACAGGTGAAAAGAACTTGATGACCCACATGGAGGGTAGGAAGGGCAAGTACATCCTACAATCCCAAGAACATGGTGCTGATGAGGTAGAATATGGAGTAAAAACTGATCAAAAAGCACCAGATAATGCCTTGTGCTATTGCTTTAACCCTGAAGCTACAAACATAAAAGGAGAAACGGGAGCCATGGTGTTCATGAAGAAGATAGGAAAAAAATGGACTCTCGTAACATCAGACGGTAATAAAGCTTACTATAATGTAAACAACCTGAAAGGGTGGTCTGGACTACCAATAATGTTGCACTCCACTGGGGCCATAGTGGGGAGGATTAAGTCAGCGTATTCAGATGAAAACGACCTGGTGGAGGAACTCATTGACTCCAGAACTATCAGCAAGAGCAATGAGACAAACCTGGACCACCTTATCAAGGAATTGGCAGATATGCGGAGGGGAGAGTTTCGCTCAATTACTCTTGGAACGGGAGCTGGGAAAACTACGGAACTGCCCAGGCAATACCTCGCAACAGTAGGTGCCCATAAGTCTGTGTTAGTTTTAGTCCCTTTAAAAGCACCCGCTGAAAGTGTCTGCCGCTTTATGAGGTCCAAATACCCTACCATCAACTTTTCCTTGAGAGTGGGGGAGCGAAAAGAGGGAGACGTGAGCAGCGGTATCACTTACGCTACCTACGGATTCTGCTGCCAGCTAAACCTGGTACAACTCAAAGAATGGATATCCAGATACTCAATGGTGTTTTTCGACGAATACCACACAGCAACTCCAGAACAAATAGCCATAATAAGTAAGATCCATGCACTGAAAGTCAAGACCAGGATAGTGGCTATGTCAGCGACTCCCCCGGGCACCGTGACGACTGAAGGCAGGAAATTCGATATTGAGGAGGTTGGCGTTGCTACCATAGAGAAAGGAGAGGAACCAAAAAGGGGGCGTATAGCAGTCGCCGGTATGCAGATCCCATTGGAAGACTTGACAGGGAAGAACTGCCTGGTGTTCGTGGCAACCAAAGAAGCTGCGGAGACAGAGGCCAAAGAATTGCGTACCAAAGGAATTAATGCCACCTACTACTATTCAGGTATAGACCCTAAGACACTGGAACATGGGATGACCAATCAGCCATATTGTATCGTGGCCACTAATGCTATTGAATCAGGCATAACCTGCCCTGATCTAGACGTGGTCATAGATACTATGCAGAAGTATGAAAAGGTAGTAAATTTTTCAGCAAAGATGCCCTTGATTGTCACTTCATTAGTAAAGAAAAAAATCACTAGGGAAGAACAGGGCCAGAGGAAAGGTCGAGTGGGCAGGCAAAAGAAGGGAAAATATTACTATCCTTCGGGGGTTGTGCCGAATGGGTCAAAAGACCTAAGCTATCTAATCTTGCAGGCTCAAGAGTATGGTGTCTTGGAACAAGTCAACATAACAGAATACTTCATCATAATGAATGAGGATTGGGGTCTTTATGATGTAGATGAAATAGAGGTGAGAATACTCGAGAGAATGAACAAGGAAATTCTGCTCCCGCTAGGCATCGTGGAGAAGCAAATCCTGGAAAGAAGTACCCATCCGGAAAAAGTGGCACTGTTGTATAACAAATTAGTACAGAAAAACCCTATAGTGTACCCTAGGGTGCAGGGGGGTGAGGTCAGCAAGGAATATAATACTCATAATCTGGCCGTATACGACAAGCTAAAAGATGTCAACCCACAAGCCATCTATGTCCTAGCTGAAGAGGAGAGAGCCACAGAAATGATGGGCCTCGAGTTTGAACAAGATCCATCTGACTTACAGGACTCAGTAGCTCAGCTTTGTGAAGACATCAAGAGGTATACAAAACTCTCTGGGATCACTGAGAAATTACTAGTAGGTACGATGGTGGGGTATATCGGATACAAAGCCTTAACCAGAAACCATGTGCCCTGGGTCAGTAAAGAGTATTGTTATGAGCTGACTGATTCACCGGATACTTACGAAAACTCATTTGCACCTCTTGATGTCGACGTCCAAAACCCCGGCGAAGGCAAACACCCAGAGCAACTGGCAGACCACCAACTGAGGCAACTACTGGAGACTGGGAGAGACAAGGCTATTGACTTTCTAAGAGGAATTCGCGAGTTTACTAGTGGGGCCATAAATAGTCCAAAGGCACTAAGTATATGGGAGAAAATATATCAGTACTTGAGGAAACATCAGGGTGAGATCATCTCATCAGCGGCGTGGGGCAGCGCCACGGCCCTTCATGACAGTATTAAATCTAGGTTGGGAGATGAGGTTGCCACTGCAGTGATAATCCTAAAGTATCTAGCGTTTGGTGAAAGGGAATTGTCCGGACTGACCAGGCAAGTCTTAATCGATATCATAGTATATTATATAGTCAATAAGCCCCGGTTCGAAGGAGATGACTACGCAAAGAGAAAAGGAAGAAGACTAGTCATTGAAGTCCTGATGGGGGCACTGGCTACTTATGCAGTGTCCAATTTCTGGGGTGTGTCCATTAACAAGATACTGCAACCAATATCTGATTATCTACCCTATGCCACCGCCACTTTGGCTTTCCTCCGTCCAACCTTCATGGAATCAGCAGTGGTGGTCGCTTCCTCTATCTATAGAGCCTTTCTCTCTATCAAACATGCGGAAAACAGGAGTCTTGTCACGCAGGTCGCTTCTGCCGCCCTTGAAGTCATGGGCCTGACTCCAGTATCAGCTGGCCTAGGCGTCTTGCTAGGGCTCGGGCTGTGTGTACTCCATATGAACATTGACAAGAACGAGGAGAAAAGGACACTGATACTGAAAATGTTCGTCAAAAACTTTATAGACCAGGCGGCACTGGACGAGTTAGACAAGCTGGAGCCAGAAAAAATAATCCTCTCATTGCTGGAGGGCATTCAAACTTGCACAAACCCAGTTAGGGCAATTATGATTTTGTATAGGGTGTATTACAAGGGAGAATCGTTTACAGAAGCCTTGTCTAAGATGGCTGGCAAGTCTCTTATTGTGATGGTTATTGTCGAGTTCTTAGAACTGACGGGCCAAACCCAAGGAGGGTACATAGATCTTAGTGCCAATTTGCTGACCTTTCTCCTGGAAAAACTGAAAAAGATGACCAACCTCGCCATCGGGGAAGCCCGAAAGGCTTTACTCCCCATCCCATACCTGTACTGTGAAACCTGGCAGTCTGACACCAGAATCAAGGCCCCTGAATCCTATGACCAGGTGGTAGTGGAATGCAAATGTGGTGCTTTAGCAAGGTATTCCTTCCGCCATGGGGCTCACGAGATGTTGGAAGAAAAAAGGACCAAGTGGTGTAAGAATTTCTTCTTATGGGGACCTAACTTCCACAACCCGGATCCCAAGAGAATGACATTTTATGAGTACGGCCAAGCAAAAAAGTGCCCTATTATCATAATGGGTGAAGACATAACCTTTGGCAAATATGGCATATATGTCAAATTTGGCCATAGGCCTGATGGGAGAAGGTTAATAAGGGGCACTACCCATGCCACCATCAGCAGGGAGGAATTGTTGGAAATCCTAACTGCCCCAAGCCAAGTGGCCATAGGCAAAGTCAAGCTGACCGATTATTGCAATCAAAAAGGAATAATAGACAGGAAACTGGCCGTGCTTGAAGGTGACAAAATACATTTCTGGAAGGCACACCGTGGATCCAAGATCACGGATCAACTCACTACTGAGAGCCTGACGGATGATTTGGGGTCAGAAATCAGGGACATTGTATGGGAGCTGTACACAGGCGGGACGTGCACTGTAAAGGGGATATCCCTCAGGTCATGCGCGCCAGATCAAAGAAACAAGGCCATGGTCCTGTGTGATTGCACTGACGTGCTTAGCCCCTGTTACCTAATCAATGGCAGGAAACCATCTCCATTTGACGTCGTGGAAGGTTATGAATGCCACCATCGGAAGCCCCGAGCGACGTATGAGGATTTAGAAATGGAGGAAATACTAAAGAGACGGGTCCCTGTCTACGATCCTCAGTGCCTGTTTGATACAGACAGTAAATTGCTGCCTCCTGATACTTATTACTTGGAAGAAGACAGAGAAGACTTTGAGTACGCGCTGAGGTGCTGGGGTCTTGGGGTTTATGTAGTAGACGGACCTATCACCTCTCCCCCGGACATAAGAATACACCACAGTTCCGTACTGCTACTGCTGACACCCGGAGCGGACTCTGAGCTACTCTTACAGTACATACGTTGTTATTCTCATCAGGCAGAGGTAGACATCTACGTTAGGGGTCAGCTTCTGGATGAGGAAAACACTGCTATGGAGGCGGAAGGCTCTCAGGAAGATAGAGATGAAAGGATGAGTGACGTGGTGACGAAAGATGAGGACACGTTATCCACAACGGAATCAATGCCCCCACTAGAAGAGGAGGAAGGGGCCGAAGAGCCAATTACCTATGTGGTCGTCAGGGGATTACAAGAAGAAAGATATGTTAGTCATCTTAAATTAAATGACTGGATCAATGAAAACATCTCAGAGCCGCATAGGGTCCAAATCATGCTTGATGGAACAGTAAGAGTCACAATAAAGGAGGGCAAAGTGAAACATCTGTTTGGGGTCTACAGAATCGAAAACTCCCTAGAAGCAATGTTCAAAGAGACCATAGCTAACCTCCCCGTAGCCACCCAACCACCTCGAGGGCCAATCTACACGGCTAAAGAGCTGGCCCAAGGGAATATTGCACCAATCCAACCCGCAGCAAATTATTATGGAATGATAGAGGGGAGAGGTGACCCAATGACAGCATTCGAAGCCTTATCAGCCCTGCGATCACAAAAAGTCTTAGCCAAGGAAGTGAAGGTCAACATCCGCAGGGCACAAGTCTTTTTAAACAAAGTCAGAAGAACTGCTGAGGTCAGAGCATCGGAATTAGTATTAAAATGTTTACCGGTACTCGGTAAAGTAAATGGGAGGAAATTGGTCAGAGAGGAAACCAATATCCCCAACCAAAGGTTGGCATCGATAATGACCTCAATAGGGATTAGGCTAGAAAAACTGCCAGTAGTTAGAGCAAACACCTCTGGCTCTAAGTTCAGGCAATCAATTTTGGAAAAAATGGACAAATATGAAAACGAACAAGTCCCAGGGTTGCATGAGAAAATGTGGGCAGCTTTCCTGGCAACTGCCAGACAAGATTTAAGAAATACATATGAGGAAGTAACTTATCTTGAACTGGAGACCGGAATCAACCGGAAAGGAGCCCCAGGTTTCTTTGAAAAAGAAAGCTCAATAGGAGAAGTGTTGGAAAGAAAGGAAAAAATTGACGCCGTAATTCAAGAGATTGAAAAAGGTGATCACTTATACTACGAAACAGCCATGCCAAAAAATGAGAAAAGAGACGTGCTTGATGACTGGTTGTCTGAGGACTTCGTCACCTATAAGAAACCACGTGTGATACAGTATCCTGAGGCAGCCACTCGGTTGGCCATCACCAAAATAATGTACAAGTGGGTAAAGCAGAAGCCTATAGTGATCCCCGGTTATGAGGGGAAAACCCCAATTTTTGAAATATTTGAAAAAGTAAGTGCAGATTGGGCTCAGTTTAAAAACCCGGTAGCTGTTAGCTTCGACACCAAAGCCTGGGACACTCAAGTAACAAGGGAGGACCTCAGACTGGTAGGACGGATTCAGAAATACTACTACAAGAAAAAGTATTGGAAATTCATTGACAACTTGACGGCCATGATGGAGGAAGTGCCTGTGATCACTGTAGAAGGAGACATGTTCCTTAGAGTTGGACAGCGCGGGTCCGGACAGCCTGACACCTCAGCAGGCAATTCCATGCTAAACGTGCTAACAATGTTGGTAGCCTTCTCCGAATCCACAAATCTGCCCATAGCAGCTGCCTGGAAGGCCTGTCGGATCCACGTCTGCGGGGACGATGGTTTTTTAATTACGGAATCAGAATTAGGGAGGAAATTTGCTGAAAAAGGTGTCCCTCTGCTAGCCGCATTCGGCAAGCCCCAAAAAATCACAGAGGGAGCAAGCCTAAAGATAACCAGCAACTTTGACGGGATAGAGTTCTGTAGTCATTCCCCCATCAGAGTCCAAACACCAAACACAAGGTGGATGCCAGCGAGGCCTACAGCAACAATTTTAGGCAAAATGAGCACTAGGTTGGGTGAGGGTGCCACCAGATCGGGAGAGGAATATGAAAAACAGGTGGCATTTGCATATCTACTGATGTATCCCTGGAACCCACTGGTCAGGAGAATTAGTCTCCTCTTGTTATCGACTACTGACCCAATAGGGAAAGAGGAAACTCCATGCTCCGATGAGGGGGTGAAGTACGTTGGAGACCCTATCGCCGCATACAGGGACGTGTGGGGGCACAAATTAGAGGATGTAGGGCATGTTGACCAGCCGCAGTTATCCCGGATGAACTATAGCATGACTTACTTAGGGATCTGGAAGCCAAAGACGAGCCAGCGGTTAGTCGAACAGTGCTGTCGACTAGCCGAGAAGAGCAATTGTGTGGTACGTGCTGACTCCCTAATTAAGAAAAAGGTCAAGATCACTTATGACCCGGGGATAGGAGCGGCTCAGGTCATTCGTAGGTGGGAAGAGCTTGAGTGGACCAGAAGGAAACCTGAACCCACTAATGCAACTGTAGAAGATGATATCTTCCTAATCCTGTGGAAGAGATTTTCAAAGTACATTTTTCAGAAAATGAAGTTCATGCAGAGAATGCTCGCTCCTTACTAATCGGGGGGCGCTCATTTAATTATAACCAGTATCTGGTAAGTATAAGACTTGTGTAAATAAAACATATAACTGAAAGGGGC
| 30,923
|
LC596433.1
|
Atypical porcine pestivirus
|
Kamiie,M., Nagai,M., Sunaga,F.
|
Sagamihara 252-5201
|
Japan
|
2021-06-09
| null |
Pestivirus scrofae
|
Pestivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 11,567
|
GenBank
| null |
Japan: Gunma, Annaka
|
Japan
|
Sus scrofa
| null |
2020-04-01
| null | null |
Atypical porcine pestivirus Annaka/2020 RNA, complete genome
|
TGCATAATGCAAAAATTGGCTGCATTATGTGCATAACATCCCAAATTGTAATAAGCTCTGTGGTGAGTGGGGGAAAAGGGTTAACCAGGCCTTTAGTACCACAGGCACCAATTAACAGGGCAACTCAAACCTGAGAGAGAGGTACCGAACTCTTAAGCCTCGAGTACGGGGCAGACGTCACCGAGTAGTACACCCAACGACCACCACGTTTAGGTGTAGGGTCTACTGAGGCTCGGGTGGACGTGGGCGTGCCCAAAGAGAAATCGGTGGGGGACCTGGGGGTCGGGTCCGCCATGCCCCTTATGGGGTAGACCTTACTGCTTGATAGAGTGCCGGCGGATGCCTCAGGTAAGAGTATAAAATCCGTTGTTTATTAACATGAAAGAACAAATCACATATTATCTAAAAAAAGAAAAACAAAGGAATGGGTGGACAGAACTAGTAGTGGGAGAAAGCCATATGAAAATAACCACACTTTCCGGGAGGACTTACCGAGGTACCTGGGAAATGGAGAAACGGCCCAACCCTTACGGAATTTACCTCCCTAGGCCAAACCCACAACAGCTTACGGCCTTGCACCCACATCCAGTCGTAAACTGTAGGATGATGGAGTACAAAGAAGCGGACCCTAATTATGGCGACTGCCCAAATACAAACGGAGTATTCATCGATGAAAAAGGCAGGAAATTTAGTGGCCCTCCGTTAGGCTTCTGGAAGATAAGGCTGGACTACAATGATTTGGTGAATGCCAACGAACCAACTCTCACAAGTAAACAGATTTCTTATCGGGTCGAAACTTGCAGTGGAGAATTAGCCACCGTAACACCTATACACGGCAGGGTGCTCGTGAATGATTACAGAGGCTTCTATCAATGGAAGCCTAGGTGTGAAGGAATGGTGCTCTACGTAAAAACCTGTTCCGATTGGGCGGATCAAGTGGATAAGCAAGAAAAAGAAAGCCCCCCAAAACCACAAAGACCACCAAGACGAGACCCACGAAAAGGATTGCAGCCTCAAGTCCCTAAAGAAACCGAAATCACTGAAAAAAAAAGACAGCCTAGTGTGACTTTAGTGTCTGGGGGGCAGAAGGCCCAAATTATTTATAGAGGTAAAACCAAGAACAAAAAGACCCCGGACGGGGTCTATAAGTACCCAGGGGCTAAAGAAGGGGATGTAGTAAGAGTGAAGAAGATGTTAAAGAATTGGCACTTAGCTCTGGTGATGTGCCTGATATATCTCATAAATCCAAGCTTTGCAAAAGTCCAATGGTTTTTGAAGGATGAAAACTCAACGGGAATTAACCAGATATTGTGGCAAAGACGGGTCAATAGGTCCTTGCATGGAGAGTGGCCAAACCAAATCTGCCATGGCATGCCAAATGAAACCATCACCGATGAGGAGCTACATAGCTTGGGAATGATAGACACTAGTCCAAGAACAAACTACACCTGCTGCCAATTACAATACCATGAATGGAAAAAACATGGCTGGTGTAATTACCCACAAAAACAAACATGGATCAGAAGAATTACAGCTTTGCAAGCCAACCTTACTGGGCCCTATGAAGGGCCAGAATGTGCTGTCATATGTCGGTTTAATGGCAGTCATAACATCGTCAGACAGGCCAGGGATGAGGTCAGCCCACTAACAGGATGCAAGGAGGGGCACCCTTTCCTATTCGCTGGTGAAAAATCTGAGGCCTCGTGTTTAAGACCGCCTTCCACTAGCTGGGTAAGACCAGTAAAAATGGATGAGGCTTCAGTGGCAGATAGTTTTGCCCATGGGGTAGATAAAGCAATAATATTAATTAGAAAAGGGGCTTCAGGAATCATCAATTTCTTAGACACCATAGGAAGATGGTTGCCAGTAGCTGATGCTATCATCACACCATACTGTGAAACATACACCGTAACGGGGATGTATGTCCATGCCAAGCATTGCCTTCCTAAGGGGTTGCCCAAGCACTCGAAAATAATTTCCCCGACATTGATATACTTGGGGGAAGGCGATCCAGCCCATAATATCCAACATTTATTTGGCTCAGGAATAGCAAAATGGGTTCTAGTGCTACTCGGAGTTTTGGGCGAGTGGTATGGGGAACTAGCCTCAACTATATATTTACTACTGGAGTATGGGACTGAATGGTTGGAACATGAAAACTTGATCACAGAAGGGCTAATACCTGGCATCAATATTACAGTGGAGCTCCCAGCCAGTCATACAGTACCCGGCTGGGTATGGGTCGCAGGCCAGTGGGTGTGCGTGAAACCAGACTGGTGGCCAACACACATTTGGATCGAAACCGTAGTGGCAGAAGCCTGGCATGTGCTGAGGATACTGGCCTCAGCCTTGGTGAACATAGTCACTGCATTTGTGAACTTAGAATTGGTTTACCTGGTCATAATACTAGTCAAAGTATCAAAAGGCAACTTGATAGGTGCTATTTTATGGTGCCTACTACTGTCGGGGGCTGAAGGGTCATGCTACAAGCGACAAGACTATTACAATATCCAGTTAGTCGTCGAGGAAAAAACAGGCTTGGAAAAACGGTCCGTAATGGGCAAGTGGACTGTGGTGACTAGAGAGGGTCGAGAGCCAAGACTGATGGAACAGATAAGCATGGTATCAAACAGCAGCCTGACAGAGACTTACTGCTATAATGAACTAAACACCAGCAGTTGGGGACGACATCCAATGAAACAAAGGGGATGTGGGCAGACCGTACCCTACTGGCCTGGCGATAATGTCCTTGAAGAACAATACTTCAGCACGGGTTACTGGGTAAATACTACAGGAGGTTGCCAGCTGAGGGAAGGTGTGTGGCTGTCAAGAAAAGGTAGTGTCCAGTGCCAACGCAATGGCTCATCTTTGATCCTACAGTTGGCAGTCAAAGAGGAGAATGATACCATGGAAATACCGTGCGACCCGGTAGAAACCGAGAGCATGGGCCCAGTGACACAGGGTACTTGTGTGTACAGCTGGGCGGTGGCCCCAAGAGGGTGGTATTACAACAGGAAAGATGGTTATTGGCTCCAATATATAAAGAAAGATGACTATCAGTACTGGACAAAAATGCCTGCGGTTTCCTCTGCTGCAACAATATACCGTCATTTACTACCTTTGTTGGTGGCTTGCCTAATGGGTGGTAGGATTTCAGTGTGGATTGTAGCAATGCTTCTCTCCTTACAAGTGGAGGCCAGTGAGGTGGGGACCAAACAGTTGGCCGTCACCCTAACCTTATGGAAGATGGATTGGACGGAACTACTCTTCTACATCATCATAATCCTGTCCGTAAAGGAAGACCTCATAAAGAAGATAGTGACCGCAAGCCTAGTGGCCCTTAAAAATAGCCCAGTAGCCTTGAGCTTTCTAATCGTGCTTAGGCTAGTCGGAGGTAGTGAAGCACTCCCAGTAGGGCTGCTACTAGAAAAAATGTGTATAGACCAGCCAGAGTTTGGGACTCCTTTCCTAATCTACTTATGGGATAATTGGAAGTGGACTGTTTTGGTCAGCTTCTCTGCATTAAATCATGAGAAAACCATAAAGTTAGCAAGAAAACTCTTATTGGCCACACACATAACGGCACTGACGCTAACCGGCTTAAGTGATTCAATTTTTTATATAATGCTCATAATAACCAATCTGCTAATAAAGACATTCATATACCTACTGGGGGCAAGTATTAATTGGGTAGAGAAGGAAAAAAGGAGGCTGCTAGTGAAAAGGAAATTGATATACAAACAGGCCGTAGCTCGCCACCAGGATGGGGACGAACTAGTGAGTAAATTCAACAAAATAACAATAAACACGGACTTTACCCCGTGTAGGCTTGAACTGCTGCAATTACTTAGAGCTTTTCTGGTCTCTCTATGCTTCTCTTATTACAAACCCCTCCTGTATGCGGAGACCACCCTATCTGTCATAGTGATTGGTGTACAAGAGTATAACATAGCAATGGCCCGCGGGCGCAGTGTGGTCCACAGACTACTAGCCATGGCTTACTATATATATGGCCGCCTGCAAGGGGACATGTTCCAGCTTGCCACAATTCAGTGCCTGATGTCGAGTCCAAGAAAAATAATGAAGCACATGATAGAAAATCCAACCCTCAAGAAGCTCTGGCAAGGAGAAACAGAGCTTTTCAACCAGGGTGTCAACCAGTCCAAAGTGGTGGACCCAAAAAAGATAGGGTTGGTAGAACTGCAAAAAGGTATGTGTGGCTTGCCAACCGCAGTGCAAAATTTGGTCATATATGCAAAGAAGAATGACTCCCTCATCTTGGGGGAGGTGGGTTACCCACCCGGAGACCTCACTGTTGACGGGTGGGAAATACTAGGCCCTGGTAGGATCCCAAAAATTACTAATGTAGAGTCCGCCAAGATGGACCTGCTCTCTAAACTCATGACATTCCTGGGGATTGAAAGTTCGAGGGTCCCTAGAACCCCAGTCCACTCAACGAGGAAACTACTGAAGATAGTGAAGGGCATGGAAACTGGGTGGGGGTACACTCATGCAGGGGGAATTAGTAGTGCAAAGCACGTCACTGGTGAGAAAAACCTAATGACTCACATGGAGGGCAGGAAGGGTAAATATATCCTGCAGTCTCAAGAGCACGGTGCTGATGAAGTAGAATATGGGGTGAAAACTGACCAGAAAGCACCTGACAATGCCTTGTGCTATTGCTTTAACCCTGAGGCTACAAACATAAAAGGAGAGACAGGGGCTATGGTATTTATGAAGAAAATAGGGAAAAAATGGACTCTTGTGACCTCAGATGGCAACAAAGCATATTACAATGTGAGTAACTTAAAAGGGTGGTCTGGGCTACCGATAATGCTGCATTCAACTGGAGCAATAGTGGGGAGGATCAAGTCGGCATACTCAGATGAAAATGACCTGGTAGAAGAGTTGATTGACTCTAGGACCATCAGTAGAAGCAATGAAACAAACCTGGAACACCTTATTAAGGAGTTGGCAAGCATGCGGAGAGGGGAGTTCCGCTCAATCACCCTTGGGACAGGCGCCGGAAAAACCACAGAATTACCCAGACAATATCTCACAACAGTAGGGACACATAAGTCTGTTCTAGTTCTAGTCCCTTTGAAAGCGCCCGCTGAAAGTGTATGTCGCTTTATGAGGTCTAAATACCCCACTATCAATTTTTCCTTAAGGGTGGGGGAACGAAAAGAAGGGGATGTGAGTAGCGGTATCACCTATGCCACCTATGGTTTTTGCTGTCAGCTCAACCTAGTACAACTTAAGGAATGGGTGTCTAGATACTCAATGGTGTTCTTCGATGAATACCACACGGCAACACCAGAACAAATAGCCATAATAAGTAAGATCCACGCGTTGAAAGTAAAGACCAGAATTGTGGCTATGTCAGCCACTCCCCCAGGGACTGTGACAACAGAAGGCAGAAAATTTGACATAGAAGAAGTGGGGGTCGCCACAATAGAAAAGGGGGAAGAGCCAAAAAGGGGGCGTATAGCAGTGGCTGGCATGCAGGTCCCGTTAGAAGACTTAACGGGGAAGAACTGCCTGGTATTCGTGGCAACCAAAGAGGCTGCAGAGGTGGAAGCTAAAGAACTACGAGCCAGGGGTATCAATGCCACTTACTATTATTCAGGTATAGACCCAAAAACCCTAGAGTATGGGATGACAAACCAACCATACTGCATTGTGGCTACCAACGCCATTGAATCAGGTATAACTTGCCCCGACTTAGATGTGGTCATAGACACAATGCAGAAGTATGAAAAAGTAGTGAATTTCTCAGCAAAGATGCCCTTAATTGTCACTTCGCTGGTGAGGAAGAAAATCACTAGAGAGGAGCAAGGTCAGAGAAAAGGTCGAGTAGGCAGGCAGAAGAAGGGCAAATACTACTATCCATCGGGTGTGGTGCCAAATGGGTCAAAAGACTTGAGTTACTTGATCTTGCAGGCTCAAGAGTATGGTGTCTTGGAGCAGGTCAATATAACTGAATACTTCATTATAATGAATGAAGACTGGGGGCTCTATGACGTAGATGAGGTGGAAGTGAGAATACTGGAGAGAATGAACAAAGAAATTCTACTCCCATTAGGTATCGTAGAGAAGCAAATTCTGGAAAGAAGTACTCATCCGGAAAAGGTGGCACTATTGTACAATAAGTTAGTACAGAAGAGCCCTATAGTCTACCCCAGGGTGCAGGACGGTGAAATTGGCAAAGAATACAACACCCACAACCTAGCTGTGTATGATAAACTCAAGGACGTCAATCCACAAGCAATTTACGTCCTAGCAGAAGAAGAGAGGGCTACGGAAATGATGGGCCTTGAATTTGAACAAGAGCCATCTGACCTGCCGGATTCAGTGGGTCAACTTTGTGAAGATATCAAGAGGTACACAAAACTCTCTGGGGTTACTGAAAAGCTGCTAGTTGGTACGATGGTAGGGTACATTGGGTATAAGGCCCTGACTAGAAACCACGTGCCCTGGGTCAGCAAAGAATACTCTTATGAGTTGACAGACTCACCAGACACTTATGAAAATTCATTTGCACCTTTGGACGTAGATGTCCAGGCTCCCAGTGACAGTAAACATCCAGAGCAACTGGCGGACCACCAGCTGAGACGATTGCTGGAGAATGGGAGAGATAAGGCAATTGACCTCCTAAAAGAAATTCGTCAGTTCACTAGTGGAGCCGTAAACAGCCCAAAAGCATTAAGCATATGGGAAAAAATTTATCAATACTTGAAGAAGCATCAGGGAGAGATTATTTCATCAGCGGCATGGGGTAGTGCAACAGCCCTCCATGACAGTATTAAATCCAGGTTGGGCGATGAAGTCGCCACAGCAGTAATAATCCTCAAGTATTTAGCATTCGGAGAGAGAGAGCTATCTGGACTTACTAGACAGGTTCTAATTGACATCATAGTGTATTACATAGTTAACAAGCCCCGGTTCGAAGGGGACGACTATGCAAAAAGAAAAGGGAGAAGACTAGTCATTGAGGTGTTGATGGGGGCACTGGCAACTTATGCTGTATCCAATTTCTGGGGGGTATCCATTAGTAAAGTGCTACAACCAATATCAGACTACTTGCCCTACGCCACTGCCACTTTGGCTTTCCTACGCCCAACTTTCATGGAATCAGCGGTGGTGGTGGCATCTTCCATCTACAGGGCCTTCCTTTCTATCAAACATGCAGAGAACAGGAGTCTTGTCACACAGGTCGCCTCGGCTGCCCTCGAAGTCATGGGTTTAACACCAGTGTCAGCCGGTTTAGGCGTCCTGTTAGGGCTTGGACTATGTGTGCTCCATATGAACATAGATAAGAATGAAGAGAAGAGGACACTAATACTGAAAATGTTTGTCAAAAACTTTATAGACCAGGCGGCGTTAGACGAGTTAGACAAACTGGAGCCGGAAAAAATAATTCTCTCATTGCTGGAAGGTATCCAGACCTGCACAAATCCTATCAGGGCTGTCATGATTCTGTACAGGGTCTATTATAAGGGAGAATCATTTACAGAAGCCCTATCTAAGATGGCAGGGAAGTCCCTTATTGTGATGGTCATAGTGGAATTTCTGGAATTGACAGGCCAGACACAGGGAGGGTACATAGACCTCAGTGCTAATCTGTTAACCCTCCTTTTGGAAAAATTGAAAAAGATGACCAACCTCGCTTTGGGGGAGGCCAGGAAAGCCTTACTCCCCATCCCATACTTGTACTGTGAAACCTGGCAGTCCGATACCAGAATCAGGGCCCCAGAATCCTACGACCAGGTGGTGGTGGAATGTAAATGTGGAGCCTCAGCAAAGTATTCCTTTTGCCACGGAGCTCACGAGATGCTGGAAGAGAAGGGGACCAGGTGGGTTAAAAACTTCTTCCTATGGGGACCCAACTTTAAACACCCAGACCCAAAGAGAATGACATTTTACGAATATGACCAGGCAAAAAAATGCTCCGTAGCCATTATAGGTGAGGACATAACTTTTGGCAAGTATGGCATATATGTTAAATTCGGCCACAGGCCTGACGGGAAGAGGTTAATACGGGGCACAACCCATGCCACTATTAGTAGGGAGGAGCTACTAGAAATCCTGTCGGCCCCAAGCCAGGTAGCCATAGGCAAAGTCAAATTGACCGATTATTGTAACCAAAAAGGAATGATAGATAGGAAATTGGCAGTACTTGAAAATGACAAAATACATTTTTGGAAAGCACACCGAGGGTCCAAAATCACGGACCAATTGACCATCGAAAACCTGACGGACGACCTAGGGTCGGAAATTAGAGATATCACATGGGAATTGTATACAGGAGGTACATGCACTGTGAAAGGGGTATCCCTTAGGTCATGCGCACCAGGGCAAAGGAATAAGGCCACAGTCCTGTGTGACTGCACTGACGTGCTCAGCCCCTGCTATCTAGTCAATGGTAGGAGGCCATCCCCATTCAATGTAGTAGAAGGTTATGAATGTCACCATCGGAAGCCCCGGGCAACCTATGAAGATCTGGAGATGGAAGAAATATTAAGGAAACGGATCCCTGTATATGATCCTCTTTGTCTGTTCGACACCGACAGCAAGTTGCTGCCCCCTGACACGTACTACCTGGAAGAGGATCTAGAAGACTTCGAATACGCACTAAGGTGCTGGGGTCTCGGGGTCTATGTGGCAGGCGAATCTATAACCTCACCCCCAAACATAAGAATACACCACAGCTCTACACTGTTGTTGTGTACCCCCGGAGTGGACTCAGAATTAAATTTACAGTACATATATTGTTACTCTCACCAGATGGAAGTTGATATATATATCAAGGGCCAATTCCTGGAGGGGGGAGATACCACCACGGAGGTCAGCGACCTCCAAGAAAACGGCGGAGGGGAAACGGAAGATGCAACACCGGATGAAGAGGATACATTGTCCACAACTGAATCATTGCCCCCGTTGGAAGAGGAAGACGAAAGTGGAGAGTTGATCACTTACGTGGTTATCAGGGGGTTACAAGAAGAGAGGTATGTCAGTCATCTCAAGTTGAATGACTGGATCAGTGAGAATGTCGCGGAGCCTCACAAGGTTCAGGTTATGCTTGATGGAACAGTGAGAGTGACAATAAAAGAGGGCAAAGTTAAACATCTGTTTGGGGTTTTTAGAGTAGAAAACACCCTAGAAGCAATGTTTAAGGAGGCCATAGCCAATCTCCCCGTGGCTACCCAACCGCCCCAGGGGCCCATTTACACAGCAAAAGAACTGGCTCAGGGGAACGTTGCCCCAGTTCAACCTGCTGCAAATTATTACGGGATGGTTGAGGGAAGAGGCAATCTAATGACAGCATTTGAAGCCCTTTCAATGTTACGGTCACAAGAACCTTCGGCCAGAGAAGTAAAAGTGAACACCCGCAGGGCACAGACCTTCTTAACCAAAGTCAAGAGGACTACCGAGGTTAGAGCATCAGAATTGGCACTGAAGCATCTACCGGTGCTCGGCAAAGTAAATGGGAGGAAATTGATTAGAGAGGAAACTAACATTCCTAACCAAAGGTTAGCGTCAATAATGACCTCAGTAGGAATCAGGCTAGAAAAACTACCAGTAGTTAGAGCTAACACCTCTGGTTCTAAATTTAGACAATCAATCTTAGAAAAGATGGACAAACATGAAAACGAACAAGCCCCAGGGTTGCATGAAAAAATGTGGGCAGCATTCCTAGTGACAGCTAGACAAGATTTAAGAGGCACATACGAGGAGGTGACCTATCCTGAGTTGGAGAATGGAATCAACCGGAAAGGGGCCCCGGGCTTCTTTGAAAAAGAGAGTTCAGTAGGGGAGGTGTTGGAAAGTAAGGAAAAAATTGAAGCTGCCATCCAAGAAATCAAAAATGGTGACCACTTGTATTATGAGACAGCCATGCCAAAAAATGAAAAAAGAGACGTGCTTGACGACTGGCTGTCTGAGGACTTCGTAACTTACAAGAAACCGCGAGTGATACAGTACCCCGAGGCTGTCACCCGGTTAGCAATCACCAAAATAATGTACAAGTGGGTGAAGCAAAAGCCCATAGTGATCCCTGGCTATGAAGGAAAAACCCCAATTTTCGAAATATTTGAAAAAGTCAGTGCAGACTGGGCCCAATTTAGGAACCCTGTCGCTGTCAGTTTCGACACCAAAGCCTGGGACACTCAAGTGACCAGAGAAGACCTCAGACTAGTAGCAAGAATACAGAAATATTACTACAAAAGGAAGTACTGGAAGTTTATTGACAATTTAACTGCCATGATGGAAGAAGTACCGGTAATCACTGTGGAAGGAGACATGTTCCTCAGAGTTGGCCAGCGCGGGTCGGGGCAACCTGACACCTCGGCAGGCAACTCTATACTAAATGTGCTGACAATGTTGGTGGCCTTCTCTGAGTCCACCAACCTACCAATAACGGCTGCCTGGAAAGCCTGTCGGATCCATGTCTGTGGGGATGATGGTTTTCTAATTACGGAAGCAGAACTGGGGAAAAAATTCGCCGAAAAAGGCGTTCCCTTGTTAGCCGCTTTTGGTAAGCCTCAGAAGATCATAGAAGGAGCAAGTTTAAAGATAACCAGTAGTTTTGATGGAATAGAGTTTTGTAGTCATTCCCCTATTAAAGTCCAAACACCAAATGTGCAGTGGATGCCAGCAAGACCAACGGCCACAATTTTAGGGAAAATGAGCACTAGACTAGGCGAAGGTGCCACTAGATCAGGGGAAGAATATGAAAAACAGGTGGCATTCGCGTACCTACTTATGTACCCCTGGAACCCGTTGGTTAGGAGAATCAGTCTCCTACTACTATCAACTACTGATCCAATAGGAAAAGAGGAGACCCCATGTTCTGATGAGGGGGTCAAGTATGTGGGGGACCCCATAGCTGCATACAGAGATGTGTGGGGGCATAAACTGGAGGACGTCGGGCATGTCGATCAGCCGCAGCTATCCCGGATGAATTACAGCATGACTTATTTGGGGGTCTGGAAACCGAAGACAAGCCAGCGGCTAGTTGAGCAATGTTGCCGGCTAGCTGAGAAAAGTAACTGCGTAGCACGTGCTGATTCCCTCATCAAGAAGAAAGTGAAAGTCACTTATGACCCCGGGATAGGGGTAGCTCAGGTCATCCGCAGGTGGGAAGAATTAGAGTGGACCAGAAGGAAACCTGAACTTACCAATGCAAACACAGAGGACGATTTCTTTCTGGTTCTGTGGAAGAGACTCTCACAATATGTTTACCAGAAAATGAAGCTCATGCAGAAGATGTTCGCCCCTTACTAGACGGAGGGGCCTACAGTAAAATATTGCCAGTATCTGGTAAGTATAGAATTAGTGTGAATAAGTTTTAATTTAAAAGGGGGCAAGTGGCCATACAGGTTGGGGTGATCGCCGAACCCCCCCCCTTTCGCTAGGCGCCTCAACCTCACATGTCGTGGGGTTGTTGTAAATACTTGAATAAATGGAGTAATACGGGTAACAAACTTACAGGCCAGTATTGCCTCATTTGCTTTGTAGTGGTGACGACCTGTATAGGTCCGATCTAGATGAAGCAAGGAGGCCCC
| 41,604
|
MW183241.1
|
Atypical porcine pestivirus
|
Yuan,F., Feng,Y., Bai,J., Liu,X., Arruda,B., Anbalagan,S., Peddireddi,L.
|
Kansas State University, Kansas State Veterinary Diagnostic Laboratory
|
USA
|
2021-03-09
| null |
Pestivirus scrofae
|
Pestivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 11,567
|
GenBank
| 1
|
USA
|
USA
|
Sus scrofa
| null |
2016
| null | null |
Atypical porcine pestivirus strain USA/023005/2016, complete genome
|
GCAGATATCGGCTGCATTATGTGTGGGACATCCTAAATTGCTATGGGCCCCGTGGTGAGTGGGGGAAAGGGGTTAACCAGGCCCCTAGTACCACAGGCACCGATAGACGGGGTAACTCGAACCTGAGAGAGAGGTACCGAACTCTTAAGTCCCGAGTACGGGGCAGACGTCACCGAGTAGTACACCCAACGACCACCACTCCTAGGTGTAGGGTCTACTGAGGCTCGGGTGGACGTGGGCGCGCCCAAAGAGAAAACGGTGGTGGACCTGGGGGCCGGGGCCACCATGCCCCTTTACGGGGCAGACCTTACTGCTTGATAGAGTGCCGGCGGATGCCTCAGGTAAGAGTATAAAAATCCGTTGTTTATTAACATGGAAAAACAAATCGCATACTACTTAAAAAAAGAAAAACAAACAAATGGATGGACGGAACTGGTGGTAGGGGAAAGTCGTACAAAAATAACTACACTATCTGGAAAAACCTATCGAGGTACTTGGGAAATGGAGAAACGGTCGAATCCCTACGGAACCTATCTCCCCAGACCTAGTCCCCAACAGCTTACAGCCCTACACCCCCACCCAGTAGTGAATTGTAAGGTGGTTGAATACAAGGAGAAGGACCCTAATTATGGTGATTGCCCGAACACAAACGGGGTGTTCATCGACGAAAAAGGCAGAAGGCTGAGTAGCCCTCCATTGGGTATTTGGAAGATAAGATTGGACTACAGCGACTTGGTGAATATAAATAGACAAATCCCTACTGGTGAAAAACACTCTTACCAAGTCGAAACCTGCAGCGGGGAGCTGGCTACTGTAACACTAGCACACAAAAGGGTATTTGTGGAAGACCGCAGGGGATTATACCAATGGAAGCCCAACTGTGAAGGGATGGTGCTTTATGTGAAAACTTGTTCTGATTGGGCAGATCAGGTGGAAAAACAGGAGAAGGAAAGCCCCCCAAAACCTCAGCGACCACCAAGGCGAGACCCCCGAAAAGGGTTACAACCACAAGTCCCCAAAGAGACTGAGGTCACCGAAAAGAAGAGACAACCTAGCGTCACATTAGTATCGGGGGGGCAGAAGGCCCAAGTCATCTACAAAGGCAGGACTAAGAATAAAAAGACCCCGGATGGGGTCTATAAGTACCCGGGAGCTAAAGAAGGGGATGTGACAAAGGTCAAGAAGATGCTGAAGAATTGGCATGTAGCCTTGGTAATATGCCTAATATATATCATAACCCCAGGCTTCGCCAAGGTCCAGTGGTTCTTAAAGGATGAAAACTCGACGGGGATCAGCCAGATACTGTGGCAAAGACAAATCAATAGATCCCTGCATGGAGAATGGCCCAATCAGATCTGCCACGGCATGCCAAATGAAACTATTACGGATGGGGAATTACGCAGCCTGGGAATGATAGACACAAGCCCCAGAACAAACTACACGTGTTGCCAGTTGCAATATCATGAGTGGAAGAAGCATGGTTGGTGTAACTATCCACAAAAACAGGCTTGGATCAGGAGGATAACGGCCTTACAAGCCAACCTCACCGGAGCTTATGAGGGACCCGAGTGCGCTGTCATCTGTCGATTCAACGGCAGTTATAACATCGTAAAACAGGCCAGAGATGAGGTGAGTCCACTGACAGGGTGTAAAGAAGGGTACCCCTTCCTATTCTCTGACGAAAGATCTGACACCTCATGCCTGAGGCCTCCTCCCACTAGTTGGGTAAGACCAGTGAAAATGGATGAGGTCTCAATGGCTGATGGCTTTGCCCATGGAGTTGACAAGGCAATAATACTTATCAGAAAAGGGGCATCAGGAATTATTAATTTCCTAGACACTATTGGGAGGTGGCTACCGGTAGCTGAAGCAACTATAGCACCATATTGTGAAACTTACACCGTAACAGGGATGTATGTCCATGTAAAGAATTGCCTCCCCAGAGGGTTACCTAAGCATTCGAAAATAATTTCCCCAACAATGATATACCTGGGGGAAGGTGACCCAGCCCATAATATTCAGCACCTGTTTGGCTCAGGTATAGCAAAGTGGGTTCTGGTCTTGCTTGGAGTTCTGGGTGAATGGTATGGAGAATTGGCTTCTACAATATACCTGTTACTAGAGTATGGGTCTGAGTGGTTGGAACATGAAAGTCTGACCACAGAAGGGTTGATTCCTGGCATCAATATCACAATAGAACTCCCAGCTAGCCATACAGTGCCTGGTTGGGTGTGGGTCGCAGGCCAGTGGGTATGCGTGAAGCCAGACTGGTGGCCTACACAGATTTGGATCGAGACTGTGGTGGCGGAGGCCTGGCATATACTAAAAATACTGGCATCAGCCTTGGTGAATATAGTCACTGCATTTGTAAACCTGGAATTAGTCTACCTGGTCATAATACTAGTCAAGATATCAAAGGGGAACTTGATTGGCGCCATATTATGGTGCTTACTACTATCAGGGGCTGAAGGCTCTTGCCACAAGAGACAAGACTATTACAATATCCAGTTAGTTGTCAATGAAAAGACAGGCATAGAAAAACGATCTATAGTAGGCAAGTGGACCGTGATAACTAGGGAAGGTAGGGAACCAAGATTGATGGAGCAAATAAACATGGTGTCAAATGATAGCCTGTCAGAGACTTACTGCTATAATAGACTAAATACCAGCAGCTGGAGGCGGCAACCGGTAAAACAGAGAGGGTGTGGTCAAACTGTGCCCTATTGGCCCGGTGACAATGTTCTAGAAGAACAATACTATAGCACAGGTTACTGGGTGAACGCAACAGGTGGTTGCCAGCTGAGAGAAGGTGTATGGCTATCAAGGAAGGGCAATGTACAGTGCCAGCGCAATGGCTCATCCTTGATGCTGCAATTGGCGATAAAAGAGGAAAATGACACTATGGAAATACCATGCGACCCGGTGGAAACAGAAAGCATGGGTCCAGTTGCACAGGGCACTTGTGTGTACAGCTGGGCATTTGCCCCAAGAGGGTGGTACTATAATAGGAAAGACGGTTACTGGCTCCAATATATAAAGAAAAATGACTACCAGTACTGGACAAAAATGCCTGCTGCCTCGTCCGCCGCAACAATGTACCGCCATTTGCTCCCCTTGCTAGTGGCTTGCCTGATGGGCGGCAGGATATCGGTGTGGATTGTGGCAATGCTCCTGTCTCTACAGGTGGAAGCCAGCGAAGTGGGTACTAAGCAACTGGCTGTCACTCTAACTCTGTGGAAAATGGACTGGACAGAACTGCTTTTCTATGTCGTCATAATGCTAGCTGTTAGGGAAGAACTCGTAAAGAAAATAGTGACCGCAAGCCTTGTGGCCCTAAAAAATAGTCCAGTAGCCTTGAGCTTTCTTATTGTTCTCAGGCTTGTGGGGGGCAGTGAAGCACTCCCAGTCGGTTTACTATTAGAAAAGATGTGCATAGACCAACCGGAGTTCGGAACTCCATTCCTGATCTACCTGTGGGACAACTGGAAGTGGACTGTACTAGTTAGCTTCTCTGCACTAAATCATGAAAGAACTATAAAACTGGCAAGAAAACTGTTGTTGGCAACACACATAACAGCGCTAACATTGACCGGTTTGAGTGACTCAATTTTTTATGTGATGCTTATAACGACCAACCTACTAATAAAGACATTCATATACCTACTGGGGGCTAGTATGAATTGGGTTGAGAGAGAAAAAAAGAAGTTACTAGTAAAGAGGAAACTAATATATAAGAAACCCGCAATTTGCAGACAAGATGAGAATGAATTGGAGAATAAATTTAACAAGATAACCGTAAATGCGGATTTCACCCCATGTAAACTTGAACTTTTACAACTGCTCAGGGCCTTTCTAGTCTCTTTATGTTTCTCCTATTACAAGCCTCTCCTGTATGCAGAGACTACCCTAACTGTTATAGTGATTGGCGTACAAGAGTACAATGTAGCTATGGCCCGCGGGCGAAGCGTAGTCCATAGACTACTAGCCATGGCTTACTACATATACGGCCGCATGCAGGGTGATATGTTTCAGCTCGCCACAATCCAGTGCCTGTTGTCGAGTCCGAGGAAAGTCATGAAACACATGATAGAAAATCCAACTCTCAAGAAGCTCTGGCAAGGTGAAACAGAACTTTTTAACCAGGGTGTCAGCCAGTCCAAAATAGTGAACCCAAAGAAAATTGGGCTAGAAGAATTACATAAGGGCATGTGCGGCCTCCCAACTGCTGTGCAAAATTTGGTCATATATGCGAAGAAGAATGACTCTCTTATTTTAGGAGAGTTGGGCTATCCCCCTGGGGACCTCACTAGTGATGGGTGGGAAATACTAGGTCCTGGCAGAATCCCAAAGATTACTAATGTCGAGTCTGCTAAAATGGACTTACTCTCCAAACTCATGACCTTCCTGGGGATTGAAAGCTCAAGGGTCCCCAGGACTCCAGTCCACCCAACAAGGAAATTATTGAAGATAGTAAGAGGCCTGGAAACTGGATGGGGGTACACTCATGCAGGGGGGATAAGCAGCGCAAAACATGTTACAGGTGAAAAAAATCTGATGACCCACATGGAGGGCCGGAAGGGCAAGTATATCCTACAATCCCAAGAACATGGTGCAGATGAGGTAGAATATGGAGTAAAAACTGATCAAAAAGCACCCGACAATGCCCTATGCTACTGCTTTAATCCTGAAGCCACAAATATAAAAGGAGAAACGGGAGCCATGGTGTTCATGAAGAAGATAGGAAAAAAATGGACTCTCGTAACATCAGATGGTAACAAGGCCTATTATAATGTGAACAACCTGAAAGGGTGGTCTGGACTACCAATAATGTTGCACTCTACTGGGGCCATAGTGGGGAGGATAAAGTCAGCATATTCAGATGAAAACGACTTGGTGGAGGAACTTATTGACTCTAGGACTATCAGCAAGAGTAATGAAACAAACCTGGACCACCTTATTAAGGAATTGGCAGATATGCGGAGGGGGGAGTTTCGCTCAATCACCCTTGGAACGGGAGCTGGAAAAACTACAGAACTGCCCAGGCAATACCTCACAACAGTAGGTGCCCATAAAGCTGTGTTGGTCCTAGTCCCTTTGAAAGCACCCGCTGAGAGTGTTTGCCGCTTCATGAGGTCTAAATACCCCACCATCAACTTCTCCTTGAGAGTGGGAGAGCGGAAAGAGGGAGATGTGAGCAGCGGCATCACCTACGCCACCTATGGATTCTGCTGCCAGTTAAATCTGGTTCAACTTAGAGAATGGATATCCAGGTACTCAATGGTGTTCTTCGACGAATACCACACAGCAACTCCAGAACAAATAGCTATAATAAGCAAAATCCATGCATTGAAAGTCAAGACCAGGATAGTGGCTATGTCAGCAACTCCCCCGGGTACCGTGACGACTGAAGGCAGGAAATTTGATATTGAAGAGGTCGGGGTTGCCACTATAGAGAAAGGAGAGGAACCGAAAAGGGGGCGTATAGCGGTCGCCGGTATGCAGGTTCCATTGGAAGACTTGACAGGGAAGAATTGCCTGGTGTTTGTAGCAACCAAAGAAGCAGCGGAGATGGAGGCCAAAGAACTGCGCGCCAGAGGAATCAATGCCACATACTATTATTCGGGTATAGACCCTAAGACTCTGGAACATGGAATGACCAATCAACCATATTGCATCGTGGCCACCAATGCCATCGAATCAGGCATAACCTGCCCAGACTTAGATGTGGTCATAGATACTATGCAGAAGTACGAAAAAGTAGTGAATTTCTCAGCAAAGATGCCCTTGATTGTCACTTCATTAGTAAAGAAGAAAATCACTAGGGAAGAACAGGGCCAGAGGAAAGGTCGAGTGGGTAGGCAAAAAAAAGGGAAATATTACTATCCTTCAGGGGTGGTACCGAATGGATCCAAAGACCTAAGCTACTTAATCCTGCAGGCCCAAGAGTATGGTGTCTTGGAACAAGTCAACATAACAGAGTACTTCATCATAATGAATGAGGACTGGGGTCTTTATGACGTAGATGAGGTAGAGGTGAGAATACTTGAGAGAATGAATAAAGAAATACTGCTTCCGCTAGGCATCGTGGAGAAGCAAATTCTGGAAAGAAGCACTCACCCGGAAAAAGTGGCACTGTTGTATAACAAATTAGTACAGAAAAATCCTATAGTATACCCTAGAGTACAGGAGGGTGAGGTCAGCAAGGAATACAATACCCACAATCTGGCCGTGTACGACAAGTTAAAAGATGTCAACCCACAAGCCATTTATGTCCTAGCTGAAGAGGAGAGAGCCACGGAAATGATGGGCCTTGAGTTTGAACAAGACCCGTCTGATTTACAGGATTCAGTAGCTCAGCTTTGCGAAGACATCAAGAGGTATACAAAACTCTCTGGGATCACTGAGAAATTGCTAGTAGGCACGATGGTGGGATATATTGGATATAAAGCCTTAACCAGAAACCACGTGCCCTGGGTCAGTAAAGAGTATAGTTATGAGCTGACTGACTCACCGGACACTTATGAAAACTCATTTGCACCTTTGGACATAGACGTCCAAAACTCTAATGAAGGTAAACACCCAGAGCAACTGGCTGATCATCAACTGAGGCAATTACTAGAGACTGGGAGAGACAAGGCGATTGACTTCCTGAAAGGAATCCGCGAGTTCACCAGTGGGGCCATAAACAGTCCAAAGGCCTTAAGTATATGGGAGAAAATACATCAATACTTGAGGAAGCATCAGGGTGAGATCATTTCATCAGCGGCATGGGGCAGTGCAACGGCCCTTCACGACAGTATCAAATCCAGGCTAGGAGATGAGGTCGCCACTGCAGTAATAATCCTCAAGTATTTAGCATTTGGTGAAAGAGAGTTGTCCGGACTGACTAGGCAAGTCTTAATTGACATCATAGTATATTATATAGTTAACAAGCCCCGGTTTGAAGGCGATGACTACGCCAAGAGAAAGGGAAGAAGGCTGGTCATTGAAGTCTTGATGGGGGCACTAGCAACTTATGCAGTGTCCAATTTTTGGGGCGTGTCCATTAATAAAATATTGCAACCAATATCTGATTATCTACCCTATGCCACAGCCACTTTAGCTTTCCTTCGCCCAACCTTTATGGAATCAGCAGTGGTAGTCGCTTCTTCTATCTACAGAGCTTTTCTCTCCATCAAACATGCGGAAAACAGGAGTCTTGTTACGCAGGTCGCTTCTGCCGCTCTTGAGGTCATGGGTCTGACCCCAGTATCAGCCGGCCTAGGCGTCTTACTGGGGCTCGGGCTATGTGTGCTCCATATGAACATTGACAAAAACGAGGAGAAAAGGACACTGATACTGAAAATGTTCGTCAAGAACTTCATAGACCAGGCGGCACTAGACGAGTTGGATAAATTGGAGCCAGAAAAAATAATCCTCTCTTTGCTGGAGGGTATTCAAACCTGCACAAACCCGGTTAGAGCAATCATGATCTTGTACAGGGTCTACTACAAGGGAGAGTCATTCACAGAAGCTTTATCTAAGATGGCTGGCAAGTCTCTCATTGTGATGGTCATTGTCGAATTCCTGGAACTGACGGGCCAAACCCAAGGGGGGTATATAGATCTTAGTGCCAATTTACTGACCTTTCTCCTGGAAAAACTGAAAAAGATGACCAACCTCGCCATCGGGGAAGCCAGAAAAGCCTTACTTCCAATTCCATACTTGTACTGTGAAACCTGGCAGTCCGACGCCAGAATCAAGGCCCCTGAATCTTACGACCAAGTGGTAGTGGAATGCAAATGTGGTGCTTCGGCGAGGTACTCCTTCTGCCATGGGGCTCACGAGATATTGGAAGAAAAAAGAACCAGGTGGTGCAAGAACTTCTTCTTATGGGGACCTAATTTTCACAACCCGGACCCAAAGAGGATGACATTCTATGAGTATGGCCAAGCAAAGAAGTGTCCTATTATCATAATGGGAGAAGACATAACCTTCGGCAAATATGGTATATATGTCAAATTTGGCCATAGGCCTGATGGGAGAAGGTTAATAAGGGGCACTACCCACGCTACTATCAGTAGGGAGGAACTACTGGAAATTCTAACAGCCCCAAGCCAAGTAGCCATAGGCAAAGTCAAGCTAACTGATTACTGCAATCAAAAAGGAATAATAGACAGGAAACTGGCTGTACTTGAAGGTGATAAAATACATTTTTGGAAAGCACACCGTGGGTCTAAGATCACAGATCAACTCACTATTGAGAGTTTAACAGATGATTTGGGGGCAGAAATTAGGGACATCACATGGGAACTGTACACGGGCGGGACGTGTACTGTAAAAGGGATATCTCTTAGATCGTGCGCACCAGGCCAAAGAAATAAGGCCACGGTCTTATGTGATTGCACCGACGTGCTTAGTCCCTGCTACCTAGTCAACGGCAGGAGACCATCCCCATTCGACGTCGTGGAAGGTTATGAATGCCACCATCGGAAGCCCCGAGCGACGTATGAAGACTTAGAAATGGAGGAAATACTAAAGAGACGAGTCCCTGTCTACGATCCTCTATGTCTGTTTGATACTGACAGTAAATTGCTACCTCCCGATACCTACTACTTGGAAGAAGACCAAGAAGACTTCGAGTACGCATTGAGGTGCTGGGGTCTCGGGGTTTACGTAGTGGACGGGCCCGTCACTTCTCCTCCGGACATAAGAATACACCATAGTTCTGTACTGCTGCTGTTGACACCTGGAGTGGACTCTGAGTTACCCTTACAGTACATACGTTGTTACTCTCATCAGGCAGAGGTGGACATATACATTAGAGGCCAACTTCTAGAGGAGGAAGACACTGTCACGGAGGTGGAAGGTCCTCGGGAAGATAGTGGTGAAGGGATGGGTGACGTAGCAATAGAAGATGAGGACACATCGTCTACAACAGAGTCAATGCCCCCACTAGAAGGAGAGGAAGGGGGCGAAGAGCTAATTACCTATGTGGTCGTCAGGGGACTGCAAGAAGAAAGATACGCTAGCCATCTTAAGTTAAATGACTGGATCGGTGAAAACATATCGGAGCCACACAGAGTCCAAATCATGCTTGACGGAACAGTGAGAGTCACAATAAAAGAAGGAAAAGTGAAACACCTATTTGGGGTCTACAGAATTGAGAACTCCCTGGAAGCAATGTTTAAAGAGACCATAGCTGACCTCCCCGTAGCCACTCAACCGCCCCGAGGGCCAATTTACACAGCCAAAGAGTTGGCCCAAGGGAATATTGCCCCAACCCAACCCGCAGTAAATTATTATGGAATGATAGAGGGGAGAGGTGACCCAATGACAGCATTCGAAGCCTTATCAGCCTTGCGGTCACAAAAAGCCTTAGTCAAGGAAGTGAGGGTGAATACCCACAGGGCACAAACTTTTTTAAATAAAGTCAGGAGAACTGCTGAGGTCAGAGCACCGGAATTGACATTAAAATGCTTACCGGCACTCGGTAAAGTAAATGGGAGGAAACTGATCAGAGAAGAAACCAACATCCCCAACCAAAGGTTGGCATCAATAATGACCTCGATCGGAATTAGACTAGAAAAACTGCCAGTGGTTAGAGCAAACACCTCTGGCTCTAAGTTCAGGCAGTCAATCTTAGAAAAAATGGATAAATATGAAAATGAACAAGTCCCAGGGTTACATGAGAAGATGTGGGCAGCTTTCCTAGTAACTGCCAGGCAAGATTTAAGAAATACATATGAGGAAGTAACTTATCTTGAACTAGAGACCGGAATCAACCGGAAAGGAGCCCCAGGTTTTTTTGAAAAAGAAAGCTCAATAGGAGAAGTGCTGGAAAGAAAGGAAAAAATTGATGTTGCAATCCAAGAGATCGAAAAAGGCAACCACTTATATTATGAAACAGCCATGCCAAAAAATGAGAAAAGAGATGTGCTTGATGATTGGTTGTCTGAGGACTTTGTCACTTACAAGAAACCACGTGTGATACAGTACCCTGAGGCAGTCACCCGGTTGGCCATCACCAAAATAATGTACAAGTGGGTGAAGCAGAAGCCTATAGTGATTCCCGGTTATGAGGGAAAAACCCCCATCTTCGAAATATTTGAAAAAGTCAGTGCAGATTGGGCCCAGTTCAAAAATCCAGTAGCCGTCAGTTTCGACACCAAAGCCTGGGACACCCAAGTAACAAGAGAAGACCTCAGGCTAGTAGGGCGGATACAGAAATACTACTATAAAAAAAAATATTGGAAATTCATTGACAATTTGACAGCCATGATGGAGGAAGTGCCTGTAATCACTGTAGAAGGAGACATGTTCCTTAGAGTTGGACAGCGCGGGTCCGGACAACCTGACACCTCAGCAGGTAACTCTATACTAAACGTGCTAACAATGTTAGTAGCTTTCTCTGAGTCCACAAATCTGCCCATAGCGGCTGCTTGGAAGGCCTGCCGGATCCACGTCTGTGGAGACGACGGCTTTTTAATTACAGAATCAGAATTAGGGAAGAAATTTGCCGAAAAAGGTGTTCCTCTGTTAGCTGCATTCGGTAAACCCCAAAAAATTATAGAGGGAGCAAGCCTAAAAATAACCAGCAGCTTTGACGGAATAGAGTTTTGCAGTCATTCCCCCATTAGAGTCCAAACACCAAATATAAGGTGGATGCCAGCGAGGCCCACGGCAACAATTCTAGGTAAAATGAGTACTCGGCTGGGAGAGGGTGCTACCAGATCGGGAGAAGAATATGAAAAACAGGTGGCATTCGCATATTTACTAATGTACCCCTGGAACCCACTGGTCAGGAGGATTAGTCTCCTATTGTTATCAACTACTGACCCAATGGGGAAAGAGGAAACCCCATGCTCCGATGAGGGGGTGAAGTATGTTGGGGACCCTATCGCCGCATACAGGGATGTATGGGGACACAAGTTAGAGGACGTAGGGCATGTAGACCAACCGCAGTTGTCCCGGATGAACTATAGCATGACTTACTTAGGGATCTGGAAACCAAAGACAAGCCAGCGGCTAGTCGAACAGTGTTGCCGATTGGCCGAGAAAAGCAATTGTGTGGTGCGTGCCGATTCCCTAATTAAGAAAAAGGTCAAGATCACTTATGACCCGGGGATAGGAGTAGCTCAGGTCATTCGTAGGTGGGAAGAGCTCGAGTGGACCAGAAGGAAACCTGAACTCACTAACGCAACTGTGGAAGATGATATCTTCCTAGTCCTGTGGAAGAGACTTTCAAAGTACATTTTTCAGAAAATGAAGCTCATGCAGAGAATGCTTACCCCTTATTAAGCGGGGGGTGCTCTTTAATTATGACCAGTATCTGGTAAGTGTAAGATTTGTGTAAATAAAATATACAATTTAAAGGGGCAAGTGGCCGTGTAGGCTGGGGCGATCGCCGCACCCCCCCTTTCGCTAGGCGCCTCAACCCCATGTACCATGGGGTTGTTGTAAATACTTGAATAAATGGAGTAATACGGGTAATAAACTTTCAGGCCAGATATCTGCCCCATTTGCTTTATAGTGGTGACGACCTGTATAGGTCTGATCTAGATGAAGCAAGGGGGGGATATCTGCAG
| 43,602
|
MW183242.1
|
Atypical porcine pestivirus
|
Yuan,F., Feng,Y., Bai,J., Liu,X., Arruda,B., Anbalagan,S., Peddireddi,L.
|
Kansas State University, Kansas State Veterinary Diagnostic Laboratory
|
USA
|
2021-03-09
| null |
Pestivirus scrofae
|
Pestivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 11,545
|
GenBank
| 1
|
USA
|
USA
|
Sus scrofa
| null |
2017
| null | null |
Atypical porcine pestivirus strain USA/047310/2017, complete genome
|
GGCCAATTAAAGCATTATGCGTAGGACATCCTAAATTCTTATGAGCCCTGCGGTGAGTGGGGGAAAGGGGTTAACCAGACCTCTAGTACCACAGGCACCAATGGACAGGGCAACTCGAACCTGAGAGAGAGGTACCGAACTCTTAAGCCCCGAGTACGGGGCAGACGTCACCGAGTAGTACACCCAAAGACCACCACTTCTAGGTGTAGGGTCTACTGAGGCTCGGGTGGACGTGGGCGTGCCCAAAGAGAAATCGGTGGTGGACCTGGGGGTCGGGACCACCATGCCCATTTACGGGGTAGACCTCACTGCTTGATAGAGTGCCGGCGGATGCCTCGGGTAAGAGTATAAAATCCGTTGTTTACTAACATGGAAAAACAGATTGCATATTACTTAAAAAAAGAAAAACAAAGAAACGGATGGACGGAACTGGTGGTAGGAGAAAGTCACACAAAAATAACCACGCTTTCTGGAAAGACCTATAGAGGTACTTGGGAAATGGAAAAACGGTCGAATCCTTATGGAACCTATCTCCCCAAACCTAGTCCCCAACAGCTTACAGCCCTACACCCTCACCCAGTGGTGAATTGTAAGGTGGTTGAGTACAGGGAGATGGACCCTAATTATGGTGACTGCCCGAACACAAACGGGGTGTTTATTGACGAAAAGGGTAGAAGGCTGAGCAGCCCTCCATTGGGTATTTGGAAGATAAGATTGGACTATAGTGACCTGGTCAATATAAACAGACCAATTCCCGTCAGTGAGAAAATTTCTTACCGAATCGAGACCTGCAGTGGGGAGCTGGCTACTGTAATACCGGTACACAATAGGGTACTTGTAGAAGATTGCAGGGGGCTATACCAATGGAAACCCAACTGTGAAGGAATTGTGCTCTATGTGAAAACCTGTTCCGACTGGGCAGATCAGGTGGAAAAACAGGAGAAGGAAAGCCCCCCAAAACCACAGAGGCCACCAAGGCGAGACCCACGGAAAAGGTTACAACCACAGGTCCCGAAAGAGGCAGAGGTCACAGAAAAGAAGAGACAACCTAGCGTCACCTTAGTATCGGGGGGGCAGAAAGCCCAAGTCATCTATAAAGGCCGGACCAAGAATAAAAAGACTCCGGATGGAGTCTATAAGTATCCAGGAGCTAAAGATGGGGATGTAGCAAAGGTCAGGAAGATGCTGAAGAATTGGCATATAGCCTTAGTAATGTACCTGATATATATCATAACCCCAGGCTTTGCCAAGGTCCAGTGGTTCTTAAAGGATGAAAACTCGACGGGCATCAACCAGATACTGTGGCGAAGACAGATTAACAGATCTCTGCATGGAGAATGGCCTAATCAGATCTGCCACGGTATGCCGAATGAAACCATCACGGACGAGGAACTACGCAGCCTAGGAATGGTGGATACAAGCCCCAGAACAAACTATACCTGTTGTCAGCTGCAATATCACGAGTGGAAGAAACATGGTTGGTGCAACTATCCACAAAAACAGGCGTGGATTAGGAGGATAACGGCCCTACAAGCCAACCTCACCGGAGCTTACGAGGGACCTGAGTGTGCCGTTGTTTGTCGATTTAACGGCAGTTATAACATCGTAAGACAGGCCAGAGATGAGGTGAGTCCACTGACAGGGTGCAAAGAAGGACACCCCTTCCTATTCTCTGATGAAAGATCCGACACCTCATGCCTGAGGCGCCCTTCCACCAGTTGGGTAAGGCCGGTAAAAATGGACGAAGCATCAGTGGCTGATGGTTTTGCCCATGGGGTTGACAAGGCAATAATACTAATCAGAAAAGGAGCATCAGGAATAATTAATTTCCTGGATACTATCGGGAGGTGGCTGCCGGTAGCTGAAGCAACTATAGTACCATATTGTGAAACTTACACTGTGACAGGGATGTATGTCCATGTGAAGAATTGCCTCCCCAGAGGGTTACCTAAGCATTCAAAAATAATTTCCCCGACAATGATATATCTGGGGGAAGGTGACCCAGCCCATAATATCCATCATTTATTTGGCTCAGGTATAGCAAAGTGGGTCCTGGTCCTACTCGGGATTCTGGGTGAGTGGTATGGGGAATTGGCCTCTACTATATATCTACTACTAGAGTATGGGTCTGAGTGGTTGGAACATGAAAGTCTGGTCACGGAAGGCTTGATCCCCGGCATCAATATTACAATAGAACTTCCGGCTAGTCATACAGTGCCTGGTTGGGTGTGGGTCGCAGGCCAGTGGGTATGTGTAAAGCCAGACTGGTGGCCTACACAGATTTGGATTGAAACTGTAGTGGCAGAAGCCTGGCACATACTAAAAATATTGGCGTCAGCCCTGGTGAACATAATTGCTGCGTTTGTAAACTTGGAATTGGTCTACCTGGTCATAATATTAGTCAAAATATCAAAGGGGAACCTGATAGGTGCTGTACTATGGTGCTTATTACTGTCAGGGGCTGAAGGCTCGTGCTATAAAAGACAAGACTATTACAATATCCAACTAGTTGTTGAAGAAAAAACAGGCGTAGAAAAAAGATCCATAATGGGCAAGTGGACTGTGATAACCAGAGAAGGTCGGGAACCAAGATTGATGGAGCAAATAAATTTGGTCTCAAATGACAGCGTGTCAGAAACTTACTGCTATAATAGGTTAAATACTAGCAGTTGGGGGCGGCAACCGGCAAGACAGAGAGGGTGTGGTCAAACTGTGCCCTACTGGCCTGGTGACAACGTCCTAGAAGAACAATATTATAACACAGGTTACTGGGTAAATGCAACAGGCGGTTGCCAGCTGAGAGAAGGCGTGTGGCTATCAAGAAAAGGTAATGTACAGTGCCAGCGTAACGGCTCATCCTTGATGCTGCAATTGGCGATAAAAGAAGAGAATGACACCATGGAAATACCATGTGACCCAGTGGAAACAGAAAGTATGGGTCCAGTTGCACAGGGCACTTGCGTGTACAGCTGGGCATTTGCCCCAAGAGGGTGGTACTATAATAGGAAAGATGGCTATTGGCTCCAGTACATAAAGAAAAACGACTATCAGTACTGGACAAAAATGCCTGCTGCCTCGTCTGCCGTAACGATGTACCGCCATTTACTACCCTTACTGGTAGCCTGCCTCATGGGCGGCAGGATATCGGTGTGGATTGTGGCAATGCTTCTGTCTTTACAGGTGGAAGCCAGCGAAGTAGGTACCAAACAACTGGCTGTCACGCTAACTTTGTGGAAGATGGACTGGACAGAACTACTCTTCTATATCATTTTAATGCTAGCCGTAAAGGAAGAACTTATAAAAAAATTGGTGACTGCTAGCCTTGTGGCCTTAAAAAATAGTCCAGTAGCCTTGAGCTTTCTTATTGTACTCAGGCTTGTGGGGGGCAGTGAAGCACTCCCAGTAGGTTTACTATTAGAAAAGATGTGCATAGACCAACCGGAGTTTGGAACCCCTTTCCTGGTCTATCTATGGGACAATTGGAAGTGGACTGTGCTAGTCAGCTTTTCCGCACTGAACCATGAAAAAACTATAAAAATAGCAAGAAAACTGCTGTTGGCGACGCACATAACAGCGCTCACATTGACTGGTCTGAGTGATTCAATCTTCTATGTAATGCTTATAATCACCAATGTGTTGATAAAGACATTCATATATCTACTGGGGGCTAGTATGAATTGGGTAGAGAGAGAAAAGAGGAAGTTGCTAGTGAAGAGAAAACTAATATACAAGAAAGCCGCTATCTGCAGCCAGAATGAGAATGAATTGGAGAATAAATTCAACAAGATAACTGTGAACGCGGATTTCACCCCATGCAAGCTTGAACTTTTACAGTTACTCAGGGCTTTTTTAGTCTCTTTATGTTTTTCCTATTACAAGCCTCTCCTGTATGCAGAGACAACCCTAACCGTCATAGTAATTGGTGTACAGGAGTACAACGTAGCTATGGCTCGCGGGCGAAGCGTGGTCCATAGACTGCTAGCCATGGCCTATTACATATATGGCCGCATACAGGGTGACATGTTCCAGCTCGCTACTATCCAGTGCCTGTTGTCAAGCCCGAGGAAAATTATGAAACACATGATAGAAAATCCAACTCTTAAGAAACTCTGGCAAGGCGAAACAGAGCTTTTTAACCAGGGTGTCAGTCAGTCCAAGATAGTGAACCCAAAGAAAATTGGGCTAGAAGAATTACATAAGGGCATGTGTGGCCTCCCAACTGTAGTGCAGAATTTGGTCATATATGCAAAGAAAAATGACTCTCTTATTCTAGGAGAGTTGGGTTACCCCCCTGGGGACCTCACCAGCGATGGGTGGGAAATTTTAGGTCCTGGCAGAATCCCAAAGATTACCAATGTTGAGTCTGCCAAGATGGACTTACTCTCCAAACTAATGACTTTTCTGGGGATCGAAAGCTCAAGGGTCCCCAGGACTCCAGTCCACTCAACAAGAAAATTATTGAAGATAGTAAGGGGCCTGGAAACTGGATGGGGGTACACCCACGCAGGAGGGATAAGTAGCGCAAAACACGTTACAGGTGAAAAGAACTTGATGACCCACATGGAGGGTAGGAAGGGAAAGTATATCCTACAATCCCAAGAACATGGTGCAGATGAGGTAGAATATGGAGTAAAAACCGACCAAAAAGCACCCGATAATGCCTTATGCTACTGCTTTAACCCTGAAGCCACAAACATAAAAGGGGAAACAGGAGCCATGGTGTTCATGAAGAAGATAGGAAAAAAATGGACTCTCGTAACATCAGATGGTAATAAAGCCTATTATAATGTGAACAATCTGAAAGGGTGGTCCGGACTGCCAATAATGTTGCACTCTACCGGGGCCATAGTAGGGAGGATCAAATCAGCGTATTCAGATGAAAACGACTTGGTGGAGGAACTTATTGACTCTAGGACCATTAGCAAGAGCAATGAGACAAACCTGGATCACCTTATCAAGGAATTGGCAGATATGCGGAGGGGGGAGTTCCGCTCGATTACCCTTGGAACGGGTGCCGGAAAAACTACAGAACTGCCCAGGCAATATCTCACAACAGTAGGTGCCCATAAATCCGTGTTGGTCTTAGTCCCTTTAAAAGCACCCGCTGAAAGTGTTTGCCGTTTCATGAGGTCCAAATATCCTACCATCAACTTTTCCTTGAGAGTGGGGGAACGGAAAGAGGGAGACGTGAGCAGCGGTATCACTTACGCTACTTACGGATTCTGTTGCCAGCTGAACCTAGTTCAACTCAAAGAATGGATATCCAGGTACTCAATGGTGTTTTTTGATGAATACCACACAGCAACTCCAGAACAAATAGCTATAATAAGCAAGATCCATGCACTGAAGGTCAAGACCAGGATAGTGGCTATGTCAGCAACCCCCCCGGGCACCGTGACGACCGAAGGCAGGAAGTTTGATATTGAAGAGGTAGGGGTTGCCACTATAGAGAAAGGAGAGGAGCCAAAAAGGGGGCGTATAGCGGTCGCTGGTATGCAGGTCCCACTGGAAGACTTGACAGGGAAAAACTGCCTGGTGTTCGTGGCAACTAAAGAAGCCGCGGAGACGGAGGCTAAAGAACTGCGTACCAGAGGAATTAATGCCACCTACTACTACTCAGGTATAGACCCCAAGACTCTGGAACATGGGATGACCAATCAGCCATACTGTATTGTGGCCACCAATGCCATCGAATCAGGTATAACCTGCCCTGACTTAGACGTGGTCATAGACACCATGCAGAAGTATGAAAAAGTAGTGAATTTCTCAGCGAAGATGCCCTTGATTGTCACTTCATTAGTAAAGAAAAAGATCACCAGGGAAGAACAGGGCCAGAGGAAAGGTCGAGTGGGTAGGCAAAAGAAGGGAAAATATTACTATCCTTCTGGAGTGGTACCAAATGGATCAAAAGATTTGAGCTACTTGATCCTGCAGGCCCAAGAATATGGTGTCTTGGAGCAAGTCAATATAACAGAGTATTTCATCATAATGAATGAGGACTGGGGTCTCTATGACGTAGATGAGGTAGAGGTGAGAATACTTGAGAGAATGAACAAGGAAATTTTGCTCCCGCTAGGCATCGTGGAGAAGCAAATCCTAGAAAGAAGCACTCACCCAGAAAAAGTGGCACTGTTGTATAACAAACTGGTACAGAAAAACCCTATAGTATACCCTAGAGTACAGGAGGGTGAGGTCAGCAAGGAATACAACACCCATAATCTGGCCGTATATGACAAGCTAAAAGATGTCAACCCACAGGCCATTTATGTCCTAGCTGAAGAGGAGAGAGCCACAGAAATGATGGGCCTTGAGTTTGAACAAGATCCATCCGACCTACAGGACTCAGTAGCTCAGCTTTGTGAAGACATCAAGAGGTATACAAAACTCTCTGGGATCACTGAAAAGCTATTAGTAGGCACAATGGTGGGGTACATTGGATACAAAGCCTTAACCAGAAACCACGTGCCCTGGGTCAGTAAAGAGTATTGTTATGAACTGACTGACTCACCAGATACTTACGAAAACTCATTTGCACCTTTGGACGTCGATGTCCAAAACCCCGGTGAAGGAAAACACCCAGAGCAACTGGCAGATCATCAACTGAGGCAACTACTGGAAACTGGGAGAGACAAGGCAATTGACTTCCTAAAAGGCGTCCGCGAGTTCACTAGTGGAGCCATAAACAGCCCAAAGGCACTAAGTATATGGGAGAAAATATATCAGTACTTGAAGAAGCATCAGGGCGAGATCATCTCATCAGCAGCATGGGGTAGTGCAACGGCCCTTCATGACAGTATTAAATCTAGGCTAGGAGATGAGGTCGCTACTGCAGTAATAATCCTCAAGTATTTAGCATTTGGTGAAAGAGAATTGCCTGGGCTAACTAGGCAAGTCCTAATTGACATCATAGTATATTACATAGTCAACAAGCCCCGGTTCGAAGGAGATGACTATGCAAAGAGAAAAGGCAGAAGGCTAGTCATTGAAGTCTTGATGGGGGCACTGGCAACCTATGCAGTGTCCAATTTTTGGGGCGTGTCCATTAACAAGATACTGCAACCAATATCTGACTATTTACCTTATGCCACCGCCACCTTGGCTTTCCTTCGCCCAACCTTCATGGAATCAGCAGTGGTGGTCGCCTCTTCTATCTACAGAGCCTTTCTCTCTATCAAGCATGCAGAAAACAGGAGTCTTGTCACACAAGTCGCTTCCGCCGCCCTTGAAGTAATGGGCCTGACCCCAGTATCAGCTGGCCTAGGCGTTCTGCTAGGGCTTGGGCTGTGTGTGCTCCATATGAACATCGACAAAAATGAGGAGAAAAGGACACTCATACTGAAAATGTTTGTCAAAAACTTTATAGACCAGGCGGCACTAGACGAATTAGACAAACTGGAGCCAGAAAAAATAATCCTATCATTATTGGAAGGCATTCAAACTTGCACAAACCCGGTTAGGGCAATCATGATTTTGTACAGAGTGTACTACAAGGGAGAATCGTTTACAGAAGCTTTGTCTAAGATGGCTGGCAAGTCTCTCATTGTGATGGTCATAGTCGAGTTCCTGGAACTGACGGGCCAAACCCAAGGGGGGTATATAGATCTTAGTGCCAATTTGCTAACCTTTCTCCTGGAAAAACTAAAAAAGATGACTAACCTCGCCATCGGAGAAGCTAGAAAGGCCTTACTTCCTATCCCATACTTGTACTGTGAAACCTGGCAGTCCGACGCCAGAATCAAGGCCCCTGAATCCTATGACCAAGTGGTAGTGGAATGCAAATGTGGTGCTTCAGCAAGGTATTCCTTCCGACATGGGGTTCATGAGATATTGGAAGAAAAAAGGACCAATTGGTGTAAGAATTTCTTTTTATGGGGACCTAATTTCCACAATCCGGACCCAAAAAGGATGACGTTCTATGAGTACGGTCAAGCAAAAAAGTGTCCTGTTATCATAACGGGTGAAGATATAACCTTCGGCAAATATGGCATATATATCAAATTTGGCCATAGGCCTGATGGGGGGAGGTTAATAAGGGGCACCACCCACGCTACTATTAGCAGGGAGGAACTGCTGGAAATCCTAACGGCCCCAAGTCAAGTGGCCATAGGCAAAGTCAAGTTGACTGATTACTGCAATCAAAAAGGAATAATAGACAGGAAACTGGCCGTACTTGAAGGTGACAAGATACATTTTTGGAAGGCACACCGGGGATCCAAGATCACAGACCAACTCACTATTGAGAGTCTGACAGACGATTTGGGGTCAGAAGTCAGGGACATTACATGGGAGCTGTACACAGGTGGGACGTGCACTGTAAAGGGGGTATCTCTCAGATCATGCGCACCTGGTCAAAGAAATAAGGCTACGGTCTTGTGTGATTGCACTGATGTGCTTAGTCCCTGTTACCTAATCAACGGCAGGAGACCGTCCCCATTTGACGTCGTGGAAGGCTATGAATGCCATCACCGTAAGCCCCGAGCGACGTATGAAGACTTAGAAATGGAGGAAATACTAAAGAGGCGGGTTCCAGTCTATGATCCCTTGTGTTTGTTTGACACCGACAGTAAACTGCTGCCTCCTGATACCTACTACCTGGAGGAAGACCAAGAAGACTTTGAGTACGCATTGAGATGCTGGGGCCTCGGGGTTTATGTAGTGGACGGGCCCGTCACTTCTCTCCCAGACATAAGAATACACCACAGTTCTGTGCTACTGTTATTAACACCTGGAGTGGACTCAGAGTTGCCCTTACAGTACATACGTTGTTACCCTCACCAGGCAGAGGTGGACATCTATGTTAGGAGTCAACTTTTGGAGGAGGAAGACACTGCCACGGAGGCGGAAGGTTCTCAGGAAGATAGTGATGAAGGGATGGGTGACGTGGTAATGGAAGATGAGGATACATTGTCCACAACAGAATCAATACCCCCACTAGAAGAGGAGGAAGGGGGCGGGGAGACAATCACCTATGTAGTTATCAGGGGATTACAGGAAGAAAGATACGCTAGTCATCTTAAATTAAATGACTGGATTAGTGAAAACATTTCGGAGCCACACAGAGTCCAAATTATGCTAGACGGAACAGTGAGAGTCACAATAAAAGAGGGCAAAGTGAAACACCTATTTGGGGTCTACAGAATCGAAAACTCCCTAGAAGCAATGTTTAAAGAGACCATAGCCGACCTGCCCGTGGCCACCCAACCGCCCCGAGGGCCAATCTACACGGCTAAAGAGTTGGCCCAAGGGAACATTGCCCCGATCCAACCTGCAGCAAATTATTACGGAATGATAGAAGGGAGAGGTGACCCAATGACAGCATTCGAAGCTTTGTCAGCCCTGCGGTCACAAAAAGTCTTAACTAAGGAAGTGAAGGTGAACACCCGCAGGGCACAAGCTTTTTTAAATAAAGTCAGGAGAACTACTGAGGTCAGAGCATCGGAATTGACATTAAAATGCTTACCGACACTCGGTAAAGTAAATGGGAGAAAATTGATTAGAGAGGAAACCAACATCCCCAACCAAAGGTTGGCATCAATAATGACCTCAATAGGAATTAGACTAGAAAAACTGCCCGTGGTTAGAGCAAACACCTCTGGCTCTAAGTTCCGGCAGTCAATCTTAGAAAAAATGGATAAATATGAAAATGAACAAGCCCCAGGGTTACATGAAAAAATGTGGGCAGCATTCCTGGCAACTGCCAGGCAAGACTTAAGAAACACATATGAGGAAGTAACCTATCTTGAACTGGAGGCCGGAATCAATCGGAAAGGAGCCCCAGGTTTCTTCGAAAAAGAAAGCTCAATAGGAGAAGTGCTGGAAAGAAAGGAAAGAATTGACGTCGTAATCCAAGAGATTGAAAAAGGCAATCACTTATACTATGAAACAGCCATGCCAAAGAATGAGAAAAGAGACGTGCTTGATGATTGGTTGTCTGAGGACTTCGTCACTTATAAAAAACCACGTGTGATACAGTACCCTGAGGCAGTCACCCGGTTGGCCATCACCAAAATAATGTACAAGTGGGTGAAGCAAAAACCTACAGTGATTCCCGGTTATGAGGGAAAAACCCCGATCTTTGAAATATTTGAAAAAGTTAGTGCAGATTGGGCTCAGTTCAAAAATCCGGTGGCTGTCAGCTTCGACACCAAAGCCTGGGACACTCAAGTAACGAGAGAAGACCTCAGGCTGGTAGGGCGGATACAGAAGTATTACTACAAAAAAAAATATTGGAAATTCATTGACAATTTGACGGCCATGATGGAGGAAGTGCCTGTAATCACTGTAGAAGGAGATATGTTCCTCAGAGTTGGACAGCGCGGGTCCGGACAACCTGACACCTCAGCAGGCAATTCCATACTAAATGTGCTGACAATGTTAGTAGCTTTCTCTGAATCCACAAACCTGCCCATAACGGCTGCCTGGAAGGCCTGTCGGATCCACGTTTGTGGTGACGACGGCTTTTTAATCACGGAATCGGAATTGGGGAGGAAATTTGCCGAAAAAGGCGTTCCTCTGTTAGCTGCATTTGGCAAACCTCAAAAAATTATAGAGGGAGCAAGCTTAAAGATAACCAGCAACTTTGACGGAATAGAGTTTTGTAGTCACTCCCCTATTAGAGTCCAAACACCAAACATAAGGTGGATGCCAGCAAGACCCACAGCAACAATTCTAGGCAAAATGAGCACCAGGCTGGGTGAGGGTGCCACTAGGTCGGGAGAAGAATATGAAAAACAGGTGGCATTCGCATATCTACTAATGTACCCCTGGAACCCACTGGTCAGGAGAATTAGCCTCCTATTGTTATCAACTACTGATCCAACGGGGAAAGAGGAAACCCCATGTTCCGATGAGGGGGTGAAGTATGTTGGGGACCCTATCGCTGCATACAGGGATGTATGGGGGCATAAATTAGAGGATGTAGGACATGCTGACCAGCCGCAGTTATCCCGGATGAACTACAGCATGACTTACTTAGGGATCTGGAAGCCAAAGACGAGTCAGCGGCTAGTCGAACAGTGTTGTCGGCTGGCCGAGAAAAGCAATTGTGTGGTACGTGCTGATTCCCTGATTAAGAAAAAGGTTAAGATTACTTATGACCCAGGGATAGGAGCGGCTCAGGTCATTCGTAGGTGGGAAGAGCTTGAGTGGACCAGAAGGAAGCCTGAACCCACTAGTGCGATTGTAGAAGATGATATCTTCCTAGTCCTGTGGAAGAGATTTTCAAAGTACATTTTCCAGAAAATGAAGTTCATGCAGAGAATGCTCACCCCTTATTAAATGGAGGGCGCTCATTCAAATCATAACCAGTATCTGGTAAGTATAAGACTTGTGTAAATAAAACATATAACTGAAAGGGGCAAGTGGCCGTATAGGCTGGGGCGATCGCCGCACCCCCCCCTTCACTAGGCGCCTCAACCCCATGTACCATGGGGTTGTTGTAAATACTTGAATGAATGGAGTAATACGGGTAACAAACTTATAGGCCAGTATTGCCCCATTTGCTTTGTAGTGGTGACGACCTGTATAGGTCTGATCTAGATGAAGC
| 43,603
|
MN080493.1
|
Atypical porcine pestivirus
|
Guo,Z.
|
Henan Academy of Agricultural Sciences, Henan Provincial Key Laboratory of Animal Immunology
|
China
|
2020-07-10
|
APPV-China/HeNLY/2017
|
Pestivirus scrofae
|
Pestivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 11,477
|
GenBank
| null |
China: Henan, Luoyang
|
China
|
Sus scrofa
|
spleen, abdominal cavity
|
2017-12-25
| null | null |
Atypical porcine pestivirus isolate APPV-China/HeNLY/2017, complete genome
|
TGCATAATGCTTCGATTGGCTGCATTATGTGTGGGACATCCTAAATTGTTAAGCGCCCTGCGGTGAGTGGGGGAAAGGGGTTAACCAGGCCTCTAGTACCACAGGCACCATTGGACAGGGCAACTCGAACCTGAGAGAGAGGTACCGAACTCTTAAGCTCCGAGTACGGGGCAGACGTCACCGAGTAGTACACCCAACGACCACCATGTTTAGGTGTAGGGTCTACTGAAGCTCGGGTGGACGTGGGCGTGCCCAAAGAGAAATCGGTGGTGGACCTGGGGGTCGGGCCCACCATGCCCCCCTTACGGGGTAGACCTCACTGCTTGATAGAGTGCCGGCGGATGCCTCAGGTGAGAGTATAAAATCCGTTGTTCGTTAACATGGAAAAACAGATCGCACATTATTTAAAAAAAGAAAAACAAAGAAATGGGTGGACAGAATTGGTAGTAGGAGAAAGCCATACGAAAATAACCACACTCTCTGGAAAAACCTATCGCGGTACCTGGGAAATGGAGAAGCGGTCGAATCCTTACGGAATCTACCTCCCCAGGCCTAGCCCTCGACAGCTCACTGCTATACACCCCCACCCAGTGGTGAATTGCAAGGTAATGGAGTACAAGGAGAGGGACCCTAATTATGGTGACTGCCCGAATACGAATGGGGTATTCATCGATGAAAAGGGTAGAAGACTGAGTAGCCCCCCATTGGGTATCTGGAAGATAAGATTGGACTATGGTGACCTGGTAAATATAAACAGACCAATTCCTGTTAGTGGGAAAAACTCTTATCAAGTCGAGACCTGCAGCGGGGAGCTGGCTACTGTAACACTAGTACACGATAGGGTACTTGTGGAAGACTATAGAGGGCTTTATCAATGGAAACCCAGTTGTGAAGGAATTGTGCTCTATGTGAAAACTTGTTCTGATTGGGCAGACCAGGTGGAAAAACAGGAGAAGGAAAGCCCCCCAAAACCCCAGCGACCACCAAGGCGAGATCCCAGAAAAGGGTTACAACCACAAGTCCCCAAAGAAACTGAAGTCACAGAAAAAAAGAGACAACCTAGTGTCACCTTAGTATCAGGGGGACAGAAGGCCCAAGTCATCTATAAAGGCAGGACTAAAAATAAAAAGACTCCGGATGGAGTCTATAAGTATCCAGGAGCTAGAGAAGGAGATGTGGCAAAGGTCAGGAAGATGCTGAAGAACTGGCATATAGCATTGGTAATGTACTTGATATATATTATAACTCCAAGTTTTGCCAAGGTCCAGTGGTTTTTAAAGGATGAAAATTCGTCGGGGATCAACCAGGTACTATGGCGAAGACAGATTAACAGATCTCTACATGGGGAATGGCCTAACCAGATTTGCCACGGTATGCCAAATGAAACTATCACCGACGAGGAATTACGCAGTCTAGGAATGATAGATACAAGCCCCAGAACAAATTACACTTGTTGTCAGTTACAATATCATGAATGGAAGAAACATGGTTGGTGCAACTATCCGCAAAAACAGGCTTGGATCAGGAGGATAACGGCCCTGCAAGCCAATCTTACCGGAGCTTATGAGGGACCTGAATGCGCTGTCATCTGTCGATTTAACGGAACCTATAATATCGTAAGACAAGCCAGAGATGAGGTGAGTCCATTGACAGGGTGTAAGGAAGGGCACCCTTTTCTATTTTCTGAGGAGAGGTCCGACACCTCATGTTTGAGGCCGCCTTCCACCAGTTGGGTGAGACCAGTGAAAATGGACGAGGCATCAGTGGCTGACAGCTTCGCCCATGGGGTCGACAAGGCCATAATATTAATCAGAAAAGGGGCATCGGGAATTATCAATTTCTTAGATACTATTGGGAGATGGTTACCGGTGACTGAAGCAACTATAGTGCCATATTGCGAAACCTACACTGTGACAGGGATGTATGTCCACGTAAAAAATTGTCTTCCTAGAGGGCTACCTAGACATTCGAAAATAATCTCCCCAACAATGATATACCTGGGGGAAGGTGACCCGGCCCATAACATCCAGCACTTATTCGGCTCAGGTATAGCAAAGTGGGTCCTAGTCTTACTCGGGATCCTGGGTGAGTGGTACGGGGAATTAGCCTCTACAATCTATTTACTACTAGAGTATGGGTCTGAGTGGTTGGAGCACGAAAGCTTGATCACAGAAGGGTTGATCCCGGGTATCAATATTACAATAGAACTCCCGGCTAGCCACACTGTACCTGGTTGGGTGTGGGTCGCGGGCCAGTGGGTATGTGTGAAACCAGATTGGTGGCCCACACAGATTTGGATTGAAACTGTAGTGGCAGAAGCCTGGCACATATTAAAAATCCTAGCATCAGCCTTGGTGAACATAGTTACTGCATTTGTAAACCTAGAACTGGTCTACTTGGTCATAATACTAGTCAAAATATCAAAAGGGAACCTGATAGGTGCTATATTATGGTGCCTATTACTGTCTGGGGCTGAGGGGTCATGTATAAAAAGGCAAGACTACTACAATGTCCAGCTAGTCGTTGAAGAAAAGACAGGCGTAGAAAAAAGATCTATAATGGGCAAGTGGACTGTGATAACTAGGGAAGGCCGAGAACCAAGATTAATGGAACAGATAAATATGGTGTCAAATGAAAGTGTGTTAGAAACTTACTGCTATAATAGGCTCAATACCAGCAGTTGGGGGCGGCGACCGATAAGACAGAGAGGGTGCGGTCAAACAGTGCCCTACTGGCCCGGTGATAATGTCCTAGAAGAACAATACTATAGCATGGGCTACTGGGTGAACGCAACAGGCGGTTGCCAACTTAGGGAAGGCGTATGGCTATCAAGAAAGGGCAATGTGCAGTGCCAGCGTAATGGTTCATCCTTGATGCTGCAATTGGCGATAAAAGAAGACAATGACACCATGGAAATACCGTGCGACCCAGTGGAAACAGAAAGCATGGGCCCAGTTGCGCAGGGTACTTGCGTGTACAGCTGGGCAGTCGCCCCAAGAGGGTGGTACTATAATAGGAAAGATGGTTACTGGCTGCAGTACATAAAGAAAAATGACTACCAGTACTGGACAAAAATGCCTACTGCTTCGTCCGCGGCAACGATGTACCGCCACCTGCTCCCTTTGCTGGTAGCCTGCCTTATGGGCGGCAGGATATCGGTGTGGATTGTTGCAATGCTCCTATCTCTACAGGTGGAAGCTAGTGAAGTGGGCACCAAACAACTGGCCGTCACACTAACTCTATGGAAAATGGACTGGACAGAATTACTTTTCTACATCGTCATAATGCTAGTCGTTAAGGAAGACCTCATAAAGAAAATAGTGACCGCAAGTCTTGTGACCTTAAAAAATAGTCCAGTGGCCTTGAGCTTTCTCATTGTACTCAGGCTTGTGGGGGGCAGCGAAGCACTCCCAGTGGGTTTACTACTAGAAAAAATGTGCATAGACCAACCAGAGTTTGGAACTCCTTTCTTGATCTACCTGTGGGACAATTGGAAATGGACTGTCTTAGTCAGTTTCTCCGCACTAAATCACGAGAAAACTATAAAATTGGCAAGGAAGCTATTATTGGCTACACATATAACAGCGCTCACGTTGACTGGTCTAAGTGATTCAATCTTTTATATCATGCTTATAATTACCAACCTACTAATAAAGATATTCATATATCTATTGGGGGCTAGCATAAATTGGGTCGAGAAAGAAAAAAAGAAGTTGCTGGTAAAGAGGAAGCTAATATATAAGAAAGCCGCAATTTGCAATCGGGACGAGAATGAACTGGAGTACAAATTCAACAAGATAACCGTGAACGCCGATTTCACCCCATGCAAACTTGAATTATTACAACTACTTAGGGCTTTTTTAGTATCCCTGTGTTTTTCCTACTACAAACCTCTCCTGTATGCAGAGACTACCCTAACTGTTATAGTAATTGGTGTACAAGAATACAATGTGGCAATGGCCCGTGGGCGAAGCATGATCCACAGATTACTAGCTATGGCCTACTATATATATGGTCGCATACAGGGTAATACGTTCCAGCTTGCCAGTATCCAGTGCCTGTTGTCAAGCCCAAGGAAAATCATGAAACACATGATAGAAAACCCAACCCTTAGGAAGTTCTGGCAGGGTGAAACAGAGCTTTTCAACCAGGGTGTCAGTCAGTCTAAAATAGTAAACCCAAAGAAAATTGGGCTGGAAGAATTACATAAGGGTATGTGCGGCCTACCAACTGTAGTACAAAATTTGGTCATATATGCAAAGAAGAATGACTCTCTTATCCTAGGAGAATTGGGCTACCCCCCTGGGGACCTCACCAGTGATGGGTGGGAAATTTTAGGCCCCGGCAGGATCCCAAAGATCACTAATGTTGAGTCTGCTAAGATGGACTTACTCTCCAAACTCATGACTTTTCTGGGGATTGAAAGTTCAAGGGTCCCCAGAACCCCAATCCACTCAACAAGGAAATTACTGAAGATAGTGAGAGGCTTGGAAACTGGGTGGGGGTACACTCACGCAGGGGGGATTAGTAGCGCAAAACATGTTACAGGTGAAAAAAACTTAATGACCCACATGGAGGGCAGGAAGGGCAAGTACATCTTACAATCCCAAGAACATGGCGCCGATGAGGTTGAGTATGGAGTAAAAACTGACCAAAAAGCACCCGATAACGCTTTATGCTATTGCTTTAACCCTGAAGCCACAAACATAAAGGGAGAAACAGGGGCCATGGTGTTCATGAAGAAGATAGGAAAAAAATGGACCCTTGTAACATCAGATGGCAACAAAGCCTATTACAATGTAAACAATCTGAAAGGGTGGTCCGGACTACCAATAATGCTGCACTCCACAGGGGCCATAGTAGGGAGGATTAAATCAGCGTATTCAGATGAAAACGACTTGGTGGAGGAGCTTATCGACTCCAGGACTATCAGTAAGAGTAATGAGACAAACCTGGATCACCTTATTAAGGAATTGGCAGATATGCGGAGGGGGGAGTTCCGCTCAATTACCCTTGGAACAGGTGCTGGGAAAACCACAGAACTGCCCAGGCAATACCTCACAACAGTAGGCACTCATAAATCTGTATTAGTCCTGGTCCCTCTAAAAGCACCCGCCGAGAGTGTCTGCCGCTTCATGAGGTCCAAGTACCCCGCCATCAACTTTTCCTTGAGAGTGGGAGAGCGGAAAGAGGGAGACGTGAGTAGCGGCATCACCTATGCTACATACGGATTCTGCTGTCAGCTTAACCTGGTTCAACTCAAAGAGTGGATATCTAGGTACTCAATGGTGTTTTTCGACGAATACCACACGGCAACCCCGGAACAGATAGCTATAATAAGCAAGATCCATGCACTGAAAGTCAAGACCAGAATAGTGGCCATGTCAGCAACTCCCCCGGGTACCGTGACAACTGAAGGCAGGAGATTTGATATCGAAGAAGTTGGGGTTGCCACAATAGAGAAGGGAGAGGAACCAAAAAGGGGGCGTATAGCGGTTGCTGGCATGCAGGTCCCGCTGGAGGATTTGACAGGGAAGAACTGCCTGGTATTCGTGGCAACCAAAGAAGCCGCGGAGACGGAGGCCAAAGAGCTGCGTGCTAGAGGAATTAATGCCACTTATTACTATTCAGGTATAGACCCAAAAACTCTGGAACATGGGATGATCAATCAACCATATTGTATTGTGGCCACAAATGCCATCGAATCGGGCATAACCTGTCCTGATTTAGATGTGGTCATTGATACTATGCAAAAATACGAAAAGGTAGTGAATTTCTCAGCAAAGATGCCCTTGATTGTCACTTCTTTAGTAAAGAAAAAAATCACTAGGGAAGAACAGGGCCAGAGGAAAGGTCGAGTGGGCAGGCAAAAGAAGGGAAAATACTACTATCCTTCGGGAGTGGTACCGAATGGGTCAAAAGACCTAAGCTATCTAATCCTGCAAGCTCAAGAGTATGGCGTCCTGGAACAAGTTAATATAACAGAGTACTTCATGATAATGAATGAGGATTGGGGTCTTTACGACGTGGACGAGGTAGAAGTGAGAATATTGGAGAGAATGAACAAGGAAATTTTGCTTCCGCTAGGCATCGTGGAGAAACAAATCCTGGAAAGAAGCACTCACCCGGAAAAGGTAGCACTGTTGTATAATAAATTAGTACAAAAAAACCCCATAGTATATCCCAGAGTACAGGGGGGTGAGGTTAGCAAAGAATATAATACCCACAATTTGGCCGTATATGACAAGCTAAAAGATGTCAATCCACAGGCCATTTATGTCCTAGCAGAGGAGGAAAGAGCCACAGAGATGATGGGCCTCGAGTTTGAACAAGATCCACCCGACTTACAAGATTCGGTAGTCCAGCTTTGTGAAGATATCAAGAGGTACACAAAACTCTCTGGGATCACTGAGAAATTACTAGTAGGCACAATGGTGGGGTACATAGGATATAAGGCCCTAACCAGAAACCACGTGCCCTGGGTCAGTAAAGAGTACTGCTATGAGCTGACTGATTCACCTGACACTTACGAGAATTCATTTGCACCTTTGGACGTCGACATCCAAAATCCCGGTGAAAGTAAACACCCAGAACAACTGGCAGACCATCAACTGAGGCAATTACTAGAGACCGGGAGAGACAAGGCAATTGATTTCTTAAAAGGAATCCGCGAGTTCACCAGTGGGGTTGTAAATAGTCCAAAAGCACTGAGTCTATGGGAGAAAATATATCAGTACTTGAAGAAACATCAGGGCGAGATCATCTCATCAGCGGCGTGGGGCAGCGCGACGGCCCTTCATGACAGTATCAAATCTAGGTTAGGGGATGAGGTCGCTACTGCAGTAATAATTCTCAAGTATTTAGCATTTGGTGAAAGAGAAATGTCCGGACTGACCAGGCAAGTCTTAATTGATATTATAGTATATTATATAGTCAACAAGCCCCGGTTTGAAGGAGATGACTATGCGAAGAGAAAGGGGAGAAGACTGGTCATCGAAGTCTTGATGGGGGCACTGGCAACTTATGCAGTGTCCAATTTTTGGGGCGTGTCCATTAATAAGATACTACAACCAATATCTGATTATCTACCTTATGCTACTGCCACTTTAGCCTTCCTTCGCCCAACTTTCATGGAATCAGCAGTGGTGGTCGCTTCCTCTATCTACAGAGCTTTTCTCTCCATCAAACATGCAGAAAACAGGAGCCTTGTTACGCAGGTCGCCTCTGCTGCTCTCGAAGTCATGGGTCTGACCCCAGTATCAGCCGGCCTAGGCGTCCTGCTGGGGCTCGGACTGTGTGTGCTTCACATGAACATCGACAAGAATGAGGAGAAGAGGACACTGATATTGAAAATGTTTGTTAAAAACTTTATTGACCAGGCGGCACTAGATGAGTTGGACAAACTGGAGCCGGAAAAAATAATCCTCTCATTGTTGGAGGGTATCCAAACTTGTACAAACCCGATCAGAGCCATCATGATTTTATACAGAGTGTATTACAGGGGAGAGTCATTTACAGAAGCCTTGTCTAAGATGGCTGGTAAGTCTCTCATTGTAATGGTCATTGTCGAGTTCCTAGAACTGACGGGCCAAACTCAGGGAGGATATATAGACCTTAGTGCCAATCTGCTAACTTTTCTTTTGGAAAAACTGAAAAAGATGACCAACCTCGCCATAGGGGAGGCCAGAAAAGCCTTACTCCCTATTCCATACTTGTATTGTGAAACCTGGCAGTCTGACGCAAGAATCAAGGCTCCGGAATCCTATGACCAGGTGTTAGTGGAATGCAAATGCGGTGCTTCTGCAAAATACTCCTTTCACCACGGGGTTCACGAGGTATTGGAAGAAAGAAAGACCAAGTGGTGCAAGAACTTTTTCCTATGGGGACCCAATTTTTCCAACCCGGATCCAAAGAGGATGACATTCTACGAGTACGGTCAAGCAAGGAAGTGCCCCGTGGTCATAATGGGTGAAGACATAACTTTTGGTAAATATGGTATATATGTTAAATTTGGCCATAGGCCTGATGGGAAAAGGTTAATAAGGGGCACCACCCATGCCACCATTAGCAGAGAGGAACTGCTAGAAATCCTAACGGCCCCGAGCCAAGTAGCCATAGGTAAAGTCAAGCTGACAGATTACTGCAATCAAAAGGGAATAATAGATAGGAAACTGGCCGTACTTGAAGGTGACAAAATACATTTCTGGAAAGCCCATCGTGGGTCCAAGATCACGGATCAACTCACCATCGAGAGTCTGACAGATGACTTGGGGTCAGAAATCAGGAATATCACATGGGAGCTGTACACAGGTGGGACATGCACTGTAAAAGGAATATCCCTTAGGTCATGCGCACCAGGGCAGCGAAACAAGGCCACGGTCTTATGCGATTGCACCGACGTGCTGAGCCCCTGCTACCTAATTAATGGCAGGAGACCATCCCCATTTGACATCGTGGAAGGTTATGAATGCCACCATCGAAAACCCCGAGCGACGTGCGAAGACTTAGAGATGGAAGAAATATTGAAGAGACGAGTCCCTGTTTACGATCCTCTTTGTTTGTTCGATATTGACAGTAAACTACTGCCTCCTGACACTTACTACTTGGAAGAAGATCAAGAAGACTTTGAGTATGCACTGAGGTGCTGGGGCCTCGGGGTTTATGTGGTGGACGGGTTTGTTGCTTCTCCCCCAGACATAAGAATACACCACAGCTCCGTCCTACTGCTACTGACACCTGGAACAGACTCTGAGTTACACTTACAATATATACGCTGTTACTCTCACCAGGCAGAGGTGGATATCTACATTAGGGGTCAAATTCTAGAGGAGGAAAACACTGCCATGGAGACGGAAGGCTCTCAAGAGGACAGTGATGAAGGGACAGGTGACGTGGTGGCAGAAGATGAAGACACGTTGTCCACAACGGAATCAATACCCCCGCTAGAAGAGGAAGAAGAAGGTGGGGAGCTAATTACCTATGTGGTTATCAGGGGATTACAAGAAGAAAGATATGCTAGCCATCTCAAATTGAATGATTGGATCAGTGAGAATATTTCGGAACCACACAGAGTCCAAATCATGCTTGATGGAACAGTGAGAGTCACAATAAAGGAGGGCAAAGTGAAACACCTATTTGGGATCTACAGAATCGAAAACTCCCTGGAAGCAATGTTCAAAGAAACCATAGCTGACCTCCCCACAGCCACCCAACCGCCCCGAGGGCCAATCTACACGGCTAAAGAGTTGGCCCAAGGGAATATTGCCCCGGTCCAACCTGCAACAAATTATTATGGAATGATAGAGGGGAGAGGGGACCCGATGACGGCGTTCGAGGCCTTATCAGTCCTGCGGTCACAAAAAGCTTCAGCTAAGGAAGTGAAGGTAAGTACCCGCAAGGCACAGGCTTTCCTAAATAAAGTCAGGAAAACCGCTGAGGTCAGGGCATCGGAATTGGCATTAAAACGCCTACCGGCACTCGGTAAAGTAAATGGGAGGAAACTGATTAGAGAGGAAACTAATATTCCCAATCAAAGGCTAGCATCAATAATGACTTCGATAGGGATCAGATTGGAGAAACTGCCGGTGGTCAGAGCAAATACCTCAGGCTCCAAGTTCAGGCAGTCAATCTTAGAGAAAATGGATAAATTTGAAAATGAACAAGTTCCAGAGTTACATGAGAAGATGTGGGCAGCTTTTCTGGTAACCGCCCGACAAGACTTAAGAAACACATATGAGGAAGTGACTTACCCTGAACTGGAGACCGGAATCAACCGGAAAGGAGCACCAGGTTTCTTTGAAAAAGAAAGCTCAATAGGAGAAGTACTGGAAAGGAAGGAAAAAATTGATGCCGTGATCCGAGAGATTGAAAAAGGTACTCATTTATACTATGAAACGGCCATGCCAAAAAATGAGAAAAGAGATGTGCTTGATGATTGGCTGTCTGAGGATTTCGTCACTTATAAAAAACCACGTGTGATACAGTACCCTGAGGCAGTCACTCGATTGGCCATTACCAAAATAATGTACAATTGGGTAAAGCAGAAACCTATAGTGATCCCCGGTTATGAGGGGAAGACCCCGATTTTTGAAATATTTGAAAAAGTTAGTGCGGATTGGGCCCAGTTCAAAAACCCAGTAGCAGTCAGTTTTGACACCAGGGCCTGGGATACCCAAGTAACAAGAGAAGACCTCAGATTGGTAGGACGGATACAGAAATACTACTACAAAAAGAAATATTGGAAATTCATTGACAATTTGACTGCTATGATGGAGGAAGTGCCCGTAATCACTGTAGAAGGAGACATGTTCCTCAGGGTCGGGCAACGCGGGTCTGGACAGCCTGACACTTCAGCAGGTAATTCCATATTAAACGTGCTGACAATGCTAGTAGCTTTCTCTGAATCCACAAATTTGCCCATAGCAGCTGCCTGGAAGGCCTGTCGTATCCACGTCTGTGGAGACGACGGCTTTCTAATTACGGAATCAGAATTAGGGAGGAAATTCGCCGAAAAAGGTGTCCCTTTGCTAGCCTCATTTGGCAAACCCCAAAAAATCACAGAGGGGGCAAGCTTAAAAATAACTAGCAACTTTGATGGAATAGAGTTTTGTAGCCATTCCCCCATTAGAGTCCAAACACCAAACATAAGGTGGATGCCAGCGAGGCCCACTGCAACAATTCTAGGAAAAATGAGTACCAGACTGGGTGAGGGCGCCACCAGATCGGGAGAAGAGTACGAAAAACAGGTGGCATTTGCATACCTACTGATGTACCCCTGGAACCCACTGATCAGGAGAATCAGCCTCCTATTGCTATCAACTACTGACCCAATAGGGAGGGAGGAAACCCCGTGTTCTGACGAGGGGGTAAAATACGTCGGGGATCCTATTGCCGCATACAGGGACGTATGGGGGCACAAATTAGAGGATGTAGGGCATGTTGATCAGCCGCAGTTATCTCGGATGAACTATAGCATGACTTACTTAGGGATCTGGAAACCAAAAACGAGCCAGCGGCTAGTCGAACAGTGCTGTCGGTTGGCCGAGAAAAATAATTGTGTGGCACGTGCAGATTCCCTAATCAAGAAAAAGGTCAAGATCACCTATGACCCGGGGATAGGAGCGGCTCAAGTCATTCGTAGGTGGGAAGAGCTGGAGTGGACCAGAAGGAAACCCGAATTCACTAACGCAACAGCAGAAGACGACCTCTTCCTGATCCTTTTTAAGAGACTTTCAAAGTACATTTTCCAGAAAATTAAGTTCATGCAGAAAATGCTCACCCCTTATTAAGTAGGGGCTGCTTACTTAAATATAGCCAGTATCTGGCAAGTATAAGACTTATGTAAATAAAATATATAACTGAAAGGGGCAAGTGGCCGTATAGGCTGGGGCGATCGCCGTACCCCCCCTTTACCAGGCGCCTCAACCCCATGTACCATGGGGTTGTTGTAAATACTTGAATGAATGGAGTAATACGTA
| 48,470
|
MK948872.1
|
Atypical porcine pestivirus
|
Zhou,X., Shi,J., Si,G., Li,J., Liang,W., Liu,B., Feng,J., Yu,L., Wei,L., Xiong,J., Xie,Y., Cai,W., Li,G., Zhai,S., He,D.
|
South China Agricultural University, College of Veterinary Medicine
|
China
|
2020-06-30
|
APPV/CNYJ/2018
|
Pestivirus scrofae
|
Pestivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 10,908
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Sus scrofa
| null |
2018
| null | null |
Atypical porcine pestivirus isolate APPV/CNYJ/2018, complete genome
|
ATGAAGAAGCAGATTACTTATTACTTAAAAAAAGAAAAACAAAGAAACGGGTGGACAGAACTGGTGGTGGGAGAAAGTCACATGAAAATAACTACACTTTCCGGAAGGACCTACCGAGGTACTTGGGAAATGGAGAAGTGGTCAAATCCCTATGGAACCTACTTACCCAGGCCTAGCCCCCAACAACTTACAGCCCTGCACCCACACCCGGTGGTGAACTGCAAGATGATTGAGTACAAGGGGGTGGATCCTGATTATGGTGATTGCCCAAACACAAATGGGGTGTTTATTGACGAAAAAGGTAGAAGGTTTAGTAGTCCTCCATTGGGTATTTGGAAGATAAGACTGGACTACAATGAACTAGTAAATGTAAGCCGACCAATCTTTACTAGCGGAAGAAATTCATACCAGGTTGAAACCTGCAGTGGGGAATTGGCTACCATAACACTGGAGCACGATAGGGTTCTCGTGGACGACTGTAGGGGGTTTTATCAATGGAAACCCAACTGTGAAGGAATGGTGCTTTATGTGAAGACCTGTTCTGATTGGGCAGATCAAGTGGAAAAACAGGAGAAGGAAAAACCTCCGAAACCCCAACGACCACCAAGACGAGACCCACGAAAAGGGTTACAGCCACAAGTCCCCAAAGAAACTGAGATCATGGAAAAAAAGAAACAGCCGAGTGTCACCTTAGTATCGGGGGGGCAAAAAGCCCAAGTCATCTATAAGGGTAGGACCAAGAATAAAAAGACTCCAGATGGGGTTTATAAGTACCCAGGGGCTAAGGAAGGGGATGTAGTGAAAGTTAAGAAAATGCTGAAGAACTGGCACATAGCCCTGGTGATGTGCCTGATATTTTTCGCAAATCCAAGTCTAGCCAAGGTCCAGTGGTTCCTAAAGGATGAGAATTCAACAGGAATAAATCGAGTACTGTGGCAAAGACAGGTAAACAGGTCCTTACATGGAGAATGGCCTAATCAGATCTGTCGCGGAATGCCAAACGAAACCATCACGGACGAGGAGCTACGCAGTCTTGGAATGATAGATACAAGCCCTAGAACAAACTACACTTGCTGCCAATTGCAATACCATGAATGGAAGAAACACGGGTGGTGCAACTATCCACAAAAACAAGTTTGGATTAAGAGAATAGCAGCCTTACAATCTAACCTAACCGGAACTTATGAGGGACCTGAATGTGCAGTCATCTGCCGATTTAATGGCAGTTATAACATAGTGAGACAGGCCAGAGACGAAGTAAGCCCGTTGACAGGGTGTAAAGAAGGATATCCCTTCCTGTTTTCTGGAGAAAGATCTGACACCTCATGTCTAAAACCTCCATCCACTAGTTGGGTTAGACCAGCAAAAATGGATGAGGCATCAGTGGCAGATAGCTTCGCCCATGGAGTAGACAAGGCGATAATATTAATTAGAAAAGGGGCATCAGGAATTATCAACTTTTTAGACACCATTGGGAGATGGTTGCCAGTGGCTGAGGCCGCCATAGTACCATATTGCGAAACCTATACTGTAACAGGGATGTATGTCCATGTGAAGCATTGCCTCCCTAAGGGGCTACCAAAGCATTCAAAAATAATTTCCCCAACGATGATATACCTGGGGGAAGGTGACCCAGCCCATAATATCCAGCATTTGTTTGGCTCAGGCATAGCAAAGTGGGTCCTAGTCTTACTTGGTATCTTGGGTGAGTGGTATGGGGAGTTGGCCTCCACGATATATCTATTACTGGAGTACGGGACTGAATGGTTGGAACATGAAAGCCTAGTCACAGAAGGGTTGATCCCTGGCATCAATATCACAGTAGAGCTCCCCGCTAGTCACACGGTACCAGGCTGGGTGTGGGTCGCTGGCCAGTGGGTATGCGTGAAACCAGACTGGTGGCCTACACAGATTTGGATTGAAACCATAGTGACAGAGGTATGGCATATACTGAAAATATTGGCATCAGCTTTGGTAAACATAGTCACTGCATTCGTAAACCTAGAGTTAGTCTATCTGGTCATAATATTAGTCAAAATATCAAAGGGGAACTTGATAGGCGCTATATTGTGGTGCCTCTTGCTGTCAGGAGCCGAGGGGTCGTGCCACAGAAGACAAGACTATTACAACATCCAACTGGTCGTCGAGGAAAAAACAGGAATAGAGAAGCGATCCATAATTGGCAAGTGGACTGTGATAACTAGGGAAGGTAGAGAACCAAGGTTAATGGAGCAGATAAATATGGTGTCGAATGAGACCCTATCAGAAACTTATTGCTACAACAGGCTGAATACCAGTAGCTGGGGAAGGCAACCGATAAGACAGAGGGGGTGTGGGCAGACTGTACCCTATTGGCCTGGTGACAACGTCCTTGAGGAGCAATACTACAGCACAGGTTACTGGGTGAATGCAACAGGTGGTTGCCAGTTAAGGGAAGGTGTGTGGCTATCAAGGAAAGGCAACGTGCAGTGTCAGCGTAATGGTACTTCCTTGATGCTGCAACTAGCAATAAAAGAAGAGAACGACACCATGGAAATACCATGCGACCCAGTGGAAACTGAAAGCATGGGCCCAGTAGCACAGGGCACCTGCGTGTACAGCTGGGCAGTTGCCCCAAGAGGGTGGTACTACAACAGGAAGGACGGTTACTGGCTCCAGTACATAAAGAAAAATGACTATCAGTACTGGACTAAGATGCCCACCACTTCGTCTGCTGCTACAATGTATCGCCATCTGCTCCCCCTATTGGTGGCCTGCCTCATGGGCGGTAGAATATCAGTGTGGATTGTGGCAATGCTTCTGTCTCTACAAGTGGAAGCTAGTGAAGTTGGCACCAAGCAATTAGCCGTCACCCTAACTCTATGGAAGATGGATTGGACAGAACTGCTCTTTTACGTCGTCATAATGCTAGTTGTTAAGGAAGACCTAATAAAGAAAATGGTGACTGCAAGTCTTGTGGCCTTGAAAAACAGCCCGGTGGCCTTGAGCTTTCTTATTGTACTCAGGCTGGTGGGGGGTAGCGAGGCGCTCCCGGTGGGCCTATTGCTAGAAAAAATGTGTATAGACCAACCAGAGTTCGGAACCCCTTTCTTGATCTATCTATGGGACAACTGGAAGTGGACTGTCTTAGTTAGCTTCTCTGCATTAAATCATGAAAAGACTATAAAATTGGCAAGAAAATTACTGTTAGCCACGCATATAACAGCACTGACATTAACTGGTTTAAGTGACTCAATATTCTACGTGGTGCTCATAATGACCAACCTTTTAATAAAGACATTTATATATTTATTGGGAGCCAGTATCAGCTGGGTCGAAAAAGAGAAGAAGAAGTTGCTGGTAAAGAGGAGATTAATATATAAACATGCTGCAATCTGTCATCAAGACGAGAACGAACTAGCCAGCAAGTTCAACAGGATAACTGTGAATGCAGATTTCACCCCATGCAGACTCGAATTGCTACAATTGCTCAGAGCTTTTCTTGTCTCCCTGTGTTTTTCCTACTACAAGCCCCTCTTGTACGCTGAGACCACCTTAACTGTGATAGTGATTGGAGTGCAGGAGTACAACGTAGCAATGGCCCGCGGGCGAAGCATGATTCACAGATTGTTAGCTACGGCCTATTACATATATGGCCGTATACAGGGGGACATGTTCCAGCTCGCTACAGCCCAATGTCTGCTATCCAGCCCAAGGAAAATCATGAAACATATGATAGAAAATCCGATCCTCAAGAAGCTCTGGCAAGGAGAAACTGAACTTTTCAACCAGGGGGTCAGTCAGTCCAGAATAGTCAACCCAAAGAAAATAGGGTTGGAGGAATTACACAAAGGCATGTGTGGCCTACCAACCGTAGTACAAAATTTAGTCATATACGCAAAGAAGAATGACTCCCTTATCTTAGGAGAAGTAGGCTACCCCCCTGGGGACCTCACCAGTGATGGGTGGGAAATCCTAGGCCCTGGCAGAATCCCGAAGATCACCAACGTTGAGTCTGCCAAGATGGACCTGCTCTCTAAACTCATGACCTTCCTGGGGATCGAAACTTCTAGGGTCCCCAGAACCCCAGTCCACTCGACAAGGAAACTACTGAAGATAGTAAGAGGCATGGAAACTGGGTGGGGGTATACTCACGCAGGGGGGGTTAGCAGCGCTAAACATGTCACAGGTGAGAAGAACTTGATGACCCATATGGAGGGCAGAAAAGGTAAATACATCCTACAATCTCAAGAACATGGTGCCGATGAGGTGGAATACGGGGTGAAGACAGATCAAAAAGCACCCGACAATGCTTTGTGTTACTGCTTTAACCCTGAAGCTACAAATATAAAAGGAGAAACAGGTGCCATGGTGTTCATGAAGAGAATAGGAAAGAAATGGACCCTTGTAACATCAGATGGCAATAAAGCTTATTACAATGTAAATAATCTTAAAGGGTGGTCCGGATTACCAATAATGTTGCACTCCACTGGAGCTATAGTAGGGAGGATTAAGTCAGCCTATTCAGACGAAAATGACCTAGTGGAGGAACTTATTGATTCTAGGACCATCAATAAGAGCAAAGAGACTAACCTGGACCACCTTATCAAGGAATTGGCTGATATGCGGAGGGGGGAGTTCCGCTCAATCACCCTAGGAACGGGTGCCGGAAAAACGACAGAACTGCCCAGACAATACCTCACCACAGTAGGTGCCCATAAGTCAGTATTGGTCCTGGTCCCTTTGAAAGCACCTGCTGAAAGTGTGTGCCGCTTTATGAGGTCCAAATACCCCACCATCAACTTTTCCCTGAGAGTCGGAGAACGGAAAGAGGGGGACGTGAGCAGCGGCATCACCTATGCCACTTACGGTTTCTGCTGCCAGCTTAACCTAATCCAACTCAAGGAATGGGTATCTAGGTACTCGATGGTGTTCTTCGATGAGTACCACACAGCGACCCCAGAACAAATAGCCATAATAAGTAAGATCCATGCACTGAAAGTTAAGACCAGGATAGTGGCTATGTCCGCAACCCCTCCGGGCACTGTAACAACCGAAGGAAGAAGATTTGACATTGAAGAAGTAGGGGTTGCCACAATAGAGAAAGGAGAAGAACCAAAAAGGGGGCGCATCGCAGTGGCCGGCATGCAGGTCCCGTTGGAAGACCTGACGGGGAAGAATTGCCTAGTGTTTGTGGCAACTAAGGAATCTGCAGAGATGGAGGCCAAAGAATTACGTGCCAAAGGAATAAATGCCACCTACTACTATTCAGGCATAGACCCAAAGACCCTGGAACATGGGATGACTAACCAGCCATACTGCATTGTGGCCACTAATGCCATCGAGTCAGGTATAACCTGCCCTGATCTTGATGTGGTCATAGACACTATGCAGAAGTACGAAAAAGTAGTGAATTTTTCGGCAAAGATGCCTTTAATTGTTACCTCACTGGTAAGGAAGAAAATCACCAGGGAAGAACAAGGCCAGAGGAAAGGTCGGGCTGGGAGGCAAAAGAAGGGTAAGTACTATTATCCATCGGGTGTGGTACCGAACGGATCGAAAGATCTCAGTTACTTAATTTTGCAGGCTCAGGAGTACGGTGTCTTGGAACAAGTCAACATAACAGAGTACTTCATCACAATGAATGAGGACTGGGGTCTCTATGACGTAGATGAAGTTGAAGTGAGAATACTGGAGAGGATGAATAAGGAGATCCTGCTTCCGCTAGGCATCGTCGAGAAGCAAATCCTAGAAAGGAGCACTCACCCAGAGAAGGTGGCACTGCTGTATAATAAACTGGTACAGAAAAGCCCTATAGTTTACCCTAGAGTGCAGGATGGTGAGGTCAGCAAGGAATATAATACCCACAATTTAGCTGTATATGACAAACTAAAGGATGTAAATCCACAAGCCATCTATGTCCTGGCTGAAGAGGAAAGGGCCACAGAGATGATGGGCCTAGAATTTGAGCAGGACCCATCTGATTTACAGGACTCAGTAGTCCAACTTTGTGAAGACATAAAAAGGTATACAAAACTTTCTGGGATCACTGAGAAGCTACTGGTGGGTACAATGGTCGGGTATATAGGATACAAAGCTTTAACTAGAAACCATGTCCCCTGGGTCAGCAAAGAATACTCTTATGAGTTGACTGACTCCCCAGACACTTACGAAAACTCATTCGCACCTCTGGATGTGGATGTCCAAAACCCTGGGGAAAACAAGCGTCCAGAGCAGCTGGCAGACCATCAACTACGGCAATTACTAGAGATTGGGAAAGACAAGACAATCGGCTTCTTAAAAGGAATTCGTGAGTTCACTAGTGGGGCTATGAATAGTCCAAAAGCCCTGAGCATATGGGAGAAAATATACCAGTACCTGAAGAAACATCAAGGTGAAATCGTCTCATCAGCGGCATGGGGCAGTGCGACGGCTCTCCACGACAGTATCAAGTCTAGACTGGGGGACGAAGTTGCTACCGCAGTGATAATTCTCAGGTACCTAGCATTTGGAGACAGGGAGTTATCTGGACTTACCAGACAAGTCCTGATTGACATCATAGTATACTACATAGTCAACAAGCCTCGGTTTGAAGGAGACGATTATGCAAAGAGAAAGGGAAGAAGGCTAGTCATCGAGGTATTAATGGGAGCACTAGCGACTTACGCAGTGTCCAATTTTTGGGGCGTGTCCATTAACAAGGTGTTACAACCAATATCTGATTACCTGCCCTATGCTACCGCCACTCTAGCATTCCTCCGTCCGACCTTTATGGAATCAGCAGTGGTGGTTGCCTCTTCCATCTACAGAGCCTTCCTTTCTATCAAGCATGCAGAAAACAGGAGTCTCGTCACACAGGTTGCCTCTGCTGCTCTTGAAGTCATGGGCTTGACTCCAGTATCAGCTGGCCTAGGCGTTTTGCTAGGGCTTGGGCTGTGTGTGCTCCACATGAACATAGACAAGAACGAGGAGAAGAGGACTCTGATACTGAAAATGTTCGTCAAGAACTTCATAGACCAGGCAGCATTAGATGAATTGGACAAATTAGAGCCAGAGAAAATAATCCTCTCATTGCTGGAAGGTATTCAAACCTGCACAAACCCGGTCAGAGCCATTATGATCCTGTACAGGGTGTATTATAAGGGAGAATCATTCACGGAAGCCTTGTCCAAGATGGCTGGGAAGTCTCTCATTGTGATGGTCATCGTTGAGTTCCTAGAACTAACGGGGCAGACCCAGGGGGGGTACATAGACCTTAGCACCAACCTTCTAACCCATTTATTAGAAAAATTGAAGAAGATGGCCAATCTTGCTATTGGAGAGGCTAGAAAGGTTTTGCTGCCTATTCCATGTCTGTATTGTGAAACCTGGCAGTCTGACCCTAGAATCAGAGCTCCGGAATCCTATGATCAAGTGGTGGTAGAATGTAAATGTGGCGCCCTGGCGAGATATTCCTTCCACCAAGGGGTCCACGAAATGCTGGAAGAGAGAGGGACCAAGTGGTGCAAAAATTTTTTTTTATGGGGACCCAACTTTAACAACCCAGACCCAAAGAGGATGACATTTTATGAGTATGGTCAAGCAAAAAAGTGTCCCGTGACTATCATAGGTGAAGATATAACCTTTGGTAAATATGGCATATATGTCCAATTTGGTCATAGACCTGATGGGAAAAGGTTAATACGGGGCACCACTCAAGCAACTATCAGTATGGAAGAACTGCTGGAAATTTTAACGGCCCCAAGTCAAGTGGCTATAGGCAAAGTCAAATTGACTGACTATTGCAACCAAAAAGGGATGATAGATAGGAAACTGGCTGTAATCGAGGGTGATAAAATACACTTCTGGAAATCACACCGTGGGTCCAAGATTACAGACCAGCTGACCATTGAGAGCCTGACAGACGACCTAGGGTCAGAAATTAGGGACATTACATGGGAACTGTATGCAGGCGGGACATGTACCGTAAAAGGGGTTTCCCTTAGGTCATGTGCACCGGAGCAAAGAAGCAAGGCCACAGTCTTATGCGATTGCACCGACGTGCTAAGTCCCTGCTACTTAATCAATGGCAGGAAACCTTCCCCATTTGATGTCGCAGAGGGTTATGAATGCCATCATCGGAAACCCCGAGCGACATATGAAGACCTGGAGATGGAAGAAATACTGAAGAGGCGCGTCCCTGTATATGACCCCTCTTGTCTGTTTGATACTGATAGCAAATTATTACCTCCTGACACTTACTATTTGGAAGAGGACCAGGAAGACTTCGAGTATGCCCTAAGGTGTTGGGGCCTTGGGGTCTATGTAGTAGACGGGCCCGTTACCTCCCCCCCGAGCATAAGAATACACCATAGTTCCACATTGCTATTGTTGACACCTGGAGTGGACTCTGAGTTACATTTACAGTATATAAGCTGTTACTCCCACCAGGCAGAGGTAGACATTTTTGTCAGGGAACAATTCCTAGAAAGGGAAAACTCTACTGCGGACGTGGATGACTCTCTGGGAAGCAGTGATGAAGGAACAGAAGATGTGGCGGCAGAGGAGGAGGACACACTGTCCATAGCAGAATCTATGCCCCCATTGGAAGAAGAAGAGGACAACGGAGAAACTATTACCTATGTGGTCATAAGGGGATTGCAGGAAGAAAGACACATTAGCCACCTTAAATTAAACGACTGGATTAGTGAAAACATTACAGAGCCGCACAAGGTCCAAATTATGCTTGATGGAACAGTGAGAGTCACGATAAAAGAGGGCAAAGTAAAACACCTATTTGGGATATACAGAATTGAAAACACCCTGGAAGCAATGTTCAAGGAGACCATAGCTGATCTTCCTGTAGCCACCCAACCGCCCCGAGGGCCCATTTACACAGCCAAAGAGCTAGCTCAGGGAAACGTTGCCCCGGTCCAGCCCGCAACGAATTACTATGGAATGATAGAGGGGAGGGGTGACTCGATGACAGCATTTGAAGCCTTGTCAGTCCTGCGATCACAAAAAGTCTTGACCAAAGAGGTCAGGGTAAATACCCACAGGGCACAGGCCTTCCTAAACAAGGTTAAAAAGACCACTGAGGTCAGAGCACCAGAGCTAACACTGAAGCGCTTGCCGGTACTCGGCAAAGTGAATGGGAGGAGGTTGATCAGAGAAGAGACCAACATCCCCAACCAAAGGTTAGCGTCTATCATGACATCAATAGGGATCAGACTAGAAAAACTGCCAGTGGTCAGAGCAAACACCTCTGGCCCGAAATTTAGGCAATCAATCCTAGAGAAGATGGATAAGCATGAAAATGAGCAAGTCCCGGGGTTGCACGAAAAAATGTGGGCGGCCTTCCTGGCGACGGCTCGACAAGATTTAAAAAACACATATGAGGAAGTGGCCTATCCTGAGTTGGAGAATGGAATCAACCGGAAAGGAGCCCCAGGTTTCTTTGAGAAGGAGAGCTCGATAGGGGAAGTACTGGAAAAGAAAGAAAAAATTGATGTTGCTATCCGGGAAATTGAGAATGGCAGTCACTTATATTATGAAACAGCCATGCCCAAAAATGAGAAAAGAGATGTGCTCGACGATTGGCTGTCTGAGGACTTCGTCACGTACAAAAAGCCACGTGTAATACAGTATCCAGAGGCGGTCACTCGGCTAGCTATCACCAAAATAATGTACAAGTGGGTAAAGCAAAAGCCCGTAGTAATCCCCGGTTATGAGGGGAAAACCCCAATCTTTGAAATATTTGAAAAAGTTAGTGCGGATTGGGCGCAGTTTAGAAACCCTGTAGCTGTGAGTTTTGATACTAAAGCTTGGGATACTCAAGTGACAAGAGAAGACCTCAGACTGGTAGGACGAATCCAAAAATACTACTATAAAAAGAGATATTGGAAATTTATTGATAATCTTACAGCCATGATGGAGGAAGTGCCGGTGGTCACTGTAGAAGGAGACATGTTCCTCAGAGTAGGCCAGCGCGGATCCGGGCAACCTGACACCTCGGCGGGCAATTCCATACTAAATGTGCTGACAATGCTGGTAGCTTTTTCTGAATCTACAAATCTACCTATAGCAGCCGCCTGGAAAGCCTGCCGGATCCACGTCTGTGGGGACGACGGCTTCTTGATTACGGAATTAGAACTAGGGAAGAAATTTGCAGAGAAAGGCGTCCCTTTACTAGCAGCATTTGGTAAACCCCAGAAGATCACAGAAGGAGCAAGCCTAAAGATAACTAGTAATTTTGATGGGATAGAATTCTGTAGTCACTCCCCTATCAGAGTCCAAACCCCGAATGTGCAGTGGATGCCAGCAGGGCCCACGGCGACGATCCTAGGTAAAATGAGTACTAGGCTGGGTGAAGGTGCCACTAGATCAGGAGAAGAATATGGAAAACAAGTGGCATTTGCATACTTACTGATGTACCCTTGGAACCCACTGGTTAGGAGAATCAGCCTCCTACTGCTATCAACTACTGACCCAACTGGGAAAGAAGAAACCCCATGTTCCGACGAGGGAGTGAAGTATGTCGGGGATCCCGTCGCAGCATACAGGGACGTGTGGGGACATAAGCTAGAGGATGTGGGACATGTTGACCAACCACAATTATCCCGGATGAACTACAGCATGACTTACTTGGGGGTTTGGAAACCAAAAACGAGCCAGCGGTTAGTTGAACAGTGCTGCAGATTAGCTGAAAAAAGCAATTGTGTGGTACGCGCTGACTCCCTCATCAAGAAGAAGGTGAAGGTCACATATGACCCAGGGATAGGAGTAGCCCAGATCATCCGCAGGTGGGAAGAGTTAGAGTGGACTAGAAGGAGACCTACACTCACTAATGCAGACACAGAAGATGACCTTTTCCTAGCCTTATGGAAGAGGCTTGCAAGATACATTTTCCAGAAAATGAAATTCATGCAAAAAATGCTCACCCCTTATTAA
| 48,750
|
MK948873.1
|
Atypical porcine pestivirus
|
Zhou,X., Shi,J., Si,G., Li,J., Liang,W., Liu,B., Feng,J., Yu,L., Wei,L., Xiong,J., Xie,Y., Cai,W., Li,G., Zhai,S., He,D.
|
South China Agricultural University, College of Veterinary Medicine
|
China
|
2020-06-30
|
APPV/CNGL/2017
|
Pestivirus scrofae
|
Pestivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 10,908
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Sus scrofa
| null |
2017
| null | null |
Atypical porcine pestivirus isolate APPV/CNGL/2017, complete genome
|
ATGGAAAAGCAGATTTCATATTACTTAAAAAAAGAAAAACAAAGAAATGGGTGGACGGAACTGGTAGTAGGAGAAAGTAGTACAAAAATAACTACGCTATCTGGAAAGACCTATCGAGGAACTTGGGAGATGGAGAAACGAACGAACCCTTACGGAACCTATCTCCCCAGACCTAGTCCTCAACAGCTTACAGCCCTACACCCCCACCCAGTGGTGAATTGTAAGGTGGTTGAGTACAAGGAGGTGGACCCTAATTATGGTGACTGCCCGAATACAAATGGGGTGTTTATCGACGAAAAGGGTAGAAGGCTGAGCAGCCCCCCATTGGGTATTTGGAAGATAAGACTGGACTATAGCGACCTGGTAAATATAAATAGACCAATCCCCGCTAGTGGGATGAACTCTTACCGAGTCGAGACCTGCAGTGGGGAGTTGGCTATTGTAACACCGCTACATGATAGGGTGCTTGTAGAAGACTACAGGAGACTATATCAATGGAAACCCAACTGTGAAGGGATAGTGCTCTACGTGAAAACATGTTCTGATTGGGCAGACCAGGTTGAAAAACAAGAGAGGGAAAGTCCTCCAAAACCCCAGCGACCACCAAGGCGAGACCCACGAAAAGGGTTGCAACCACAAGTCCCTAAAGAGACTGAGGTCACAGAAAAGAAGAAACAACCCAGTGTTACCTTAGTATCGGGGGGGCAGAAGGCCCAAGTTATCTACAAAGGCAAGACTAAGAATAAAAAGACTCCAGATGGAGTCTATAAGTATCCAGGAGCTAAAGAGGGGGACGAAGTGAAGGTCAGGAAGATGTTGAAGAATTGGCATATAGCCTTAGTAATGTACCTGATGTATATCATAACCCCAAGCTTTGCTAAGGTTCAGTGGTTCTTAAAGGATGAAAACTCGACGGGGATCAGTCAGATACTGTGGCAAAGACGAATCGATAGATCCCTGCATGGAGAATGGCCTAACCAGATCTGCCACGGCATGCCGAATGAAACTATCACGGATGAGGAATTACGTAGTCTGGGAATGATAGACACAAGCCCCAGAACAAATTACACCCGTTGTCAGCTGCAATATCATGAGTGGAAGAAACATGGTTGGTGCAACTACCCACAAAAACAGGCTTGGATCAGGAGGATAACAGCCTTACAAGCTAACCTCACTGGAGCTTATGAGGGACCTGAATGTGCTGTCATCTGTCGATTTAATGGCAGCTATAACATAGTAAAACAGGCCAGAGACGAGGTGAGTCCACTGACAGGGTGTAAAGAAGGACACCCTTTCCTATTCTCTGGTGAAAGATCCGACTCCTCATGCCTGAGGCCTCCTTCCACTAGTTGGGTAAGACCAGTAAAGATGGACGAGGCATCAATGGCCGACGGTTTCGCTCATGGTGTCGACAGGGCAATAATCCTGATTAGGAAAGGGGCATCAGGAATCGTCAATTTTTTAGATGCTATTGGGAGGTGGTTACCTATAGCTGAAGCCGCTATAGTACCATATTGTGAAACTTACACCGTGACGGGGATGTACGTCCATGTGAAGAATTGCCTCCCTAGAGGGTTACCTAAGCATTCAAAAATAATTTCCCCGACAATGATATATCTGGGGGAGGGTGACCCAGCCCACAATATTCAGCACTTGTTTGGCTCAGGTATAGCAAAGTGGGTCCTAGTCTTACTTGGGGTTCTGGGTGAATGGTATGGAGAATTGGCCTCTACGATATATCTACTATTAGAGTATGGGTCTGAGTGGTTGGAACATGAAAGCCTGGTCACGGAAGGGTTGATCCCTGGCATTAATATTACAATAGAACTCCCAGCCAGTCATACGGTGCCCGGTTGGGTTTGGGTCGCAGGCCAGTGGGTATGTGTGAAGCCAGACTGGTGGCCTACACAGATTTGGATTGAAACCGTGGTAACAGAGGTCTGGCATATACTAAAAATACTGGCATCAGCCCTGGTGAATATAGTCACTGCCTTTGTAAACCTGGAACTGGTCTACCTGGTCATAATATTAGTCAAAATATCAAAGGGGAACCTAATAGGCGCCATACTATGGTGCCTATTACTGTCAGGGGCCGAAGGCTCATGCTACAAAAGACAAGACTATTACAATCTCCAGTTAGTTGTCGAAGAAAAGACAGGCGTAGAAAAACGATCCATAGTGGGCAAGTGGACTGTGATAACCAGAGAAGGTCGGGAACCAAAATTAATGGAGCAAATAAACATGGTGTCAAATGACAGCCTGTCAGAAACTTACTGCTATAATACGCTAAATACTAGCAGTTGGAGGCAGCAACCGGCAAGACAGAGAGGGTGTGGTCAGACTGTGCCCTATTGGCCTGGTGACAATGTCTTAGAAGAACAGTATTATAGCTCAGGCTACTGGGTGAATGCGACAGGCGGTTGCCAGCTGAGAGAAGGCGTATGGCTGTCAAGAAAGGGCAATGTACAGTGCCAACGCAATGGCTCATCCTTGATACTGCAATTGGCGATAAAAGAAGAGAATGACACTATGGAAATACCATGTGACCCGGTGGAAACAGAAAGCATGGGTCCAGTCGCACAGGGCACTTGCGTGTACAGCTGGGCATTTGCCCCAAGGGGGTGGTACTATAACAGGAAAGATGGTTATTGGCTCCAGTATATAAAGAAAAACGACTACCAGTACTGGACAAAAATGCCTACCGTCTCATCCGCCGCAACGATGTACCGTCATCTGCTCCCCTTACTTGTAGCCTGCCTCATGGGCGGTAGGATATCAGTGTGGATTGTGGCAATGCTCCTATCTCTACAGGTGGAAGCTAGCGAAGTAGGTACCAAGCAATTGGCCGTCACGCTGACACTGTGGAAAATGGACTGGACAGAATTACTCTTCTATATTATCATAATGCTAGCCGTCAAGGAAGAACTTATTAAGAAAATTGTGACTGCAAGTCTTGTGGCCTTGAAAAACAGTCCAGTTGCCTTGAGCTTTCTTATTGTGCTCAGGCTTGTAGGAGGCAGTGAAGCGCTCCCAGTGGGTCTACTATTAGAAAAAATGTGCATAGACCAACCGGAATTTGGAACCCCTTTCCTGATCTACCTGTGGGACAATTGGAAGTGGACTGTACTAGTCAGCTTCTCCGCACTGAATCATGAAAAAACTATAAAACTGGCAAGAAAACTGCTATTGGCAACACACATAACAGCGCTCACATTGACTGGTCTGAGTGACTCAATCTTCTATATGATGCTCATAATGACCAACCTACTAATAAAGATATTCATATACTTATTGGGGGCCAGCATGAATTATTACGAGAAAGAAAAAAAGAAGCTGTTAGTCAAGAGGAAATTAATATATAAGAAAGCCGCAGTTTGTAGACAAGGTGAGAATGAGTTAGAGAATAAATTCAACAAGATAACTGTAAATGCGGATTTCACCCCATGCGAACTTGAACTTTTACAACTACTCAGGGCTTTTTTAGTCTCTTTATGTTTCTCCTATTACAAGCCTCTCCTGTATGCAGAGACCACCTTGACTGTTATAGTAATCGGCGTACAGGAGTATAACGTAGCTATGGCCCGCGGGAGAAGCGTGGTCCATAGACTACTAGCCATGGCCTATTACATATATGGCCGCATGCAGGGGGACATGTTCCAGCTTGCCACTGTCCAGTGCCTGTTGTCAAGCCCGAGGAAAATTATGAAACACATGATAGAAAATCCAACACTCAAGAAGCTCTGGCAAGGCGAAACTGAACTTTTCAACCAGGGCGTCAGCCAGTCCAAAATAGTGAATCCAAAGAAAATTGGGCTGGAAGAATTACACAAGGGTATGTGCGGTCTCCCAACTGTAGTGCAAAATTTGGTCATATACGCAAAGAAGAATGACTCTCTTATTTTAGGAGAACTGGGTTACCCCCCTGGGGACCTCACCAACGATGGGTGGGAAATTTTAGGTCCTGGCGGAATCCCAAAGATTACTAACGTTGAGTCTGCTAAAATGGACTTGCTTTCCAAACTCATGACCTTCCTGGGGATAGAAAGTTCAAGGGTCCCCAGGACCCCAGTCCACTCAACGAGGAAATTACTGAAAATAGTCAGAGGCTTGGAAACTGGATGGGGGTACACTCACGCAGGGGGGATCAGTAGCGCAAAACACGTGACAGGTGAAAAGAACTTGATGACCCACATGGAGGGTAGGAAGGGCAAGTACATCCTACAATCCCAAGAACATGGTGCTGATGAGGTAGAATATGGAGTAAAAACTGATCAAAAAGCACCAGATAATGCTTTATGCTACTGCTTTAACCCTGAAGCTACAAACATAAAAGGAGAAACGGGAGCCATGGTGTTCATGAAGAAGATAGGAAAAAAATGGACTCTCGTAACATCAGACGGTAATAAAGCTTACTATAATGTAAACAACCTGAAAGGGTGGTCTGGACTACCAATAATGTTGCACTCCACCGGGGCCATAGTAGGGAGGATTAAGTCAGCGTATTCAGATGAAAACGACCTGGTGGAGGAACTCATTGACTCCAGAACTATCAGCAAGAGCAATGAGACAAACCTGGACCACCTTATCAAGGAATTGGCAGATATGCGGAGGGGAGAGTTTCGTTCAATCACCCTTGGAACGGGAGCTGGGAAAACTACGGAACTGCCCAGGCAATACCTCGCAACAGTAGGTGCCCATAAGTCTGTGTTAGTCTTAGTCCCTTTAAAAGCACCCGCTGAAAGTGTCTGCCGCTTCATGAGGTCCAAATACCCTACCATCAACTTTTCCTTGAGAGTGGGGGAGCGAAAAGAGGGAGACGTGAGCAGCGGCATCACTTACGCTACTTACGGATTCTGCTGCCAGCTAAACCTGGTACAACTCAAAGAATGGATATCCAGATACTCAATGGTGTTTTTCGATGAATACCACACAGCAACTCCAGAACAAATAGCCATAATAAGTAAGATCCATGCACTGAAAGTCAAGACCAGGATAGTGGCTATGTCAGCGACTCCCCCGGGCACCGTGACGACTGAAGGCAGGAAATTTGATATTGAGGAGGTTGGCGTTGCTACCATAGAGAAAGGAGAAGAACCAAAAAGGGGGCGTATAGCAGTCGCCGGTATGCAGATCCCATTGGAAGACTTGACAGGGAAGAACTGCCTGGTGTTCGTGGCAACAAAAGAAGCTGCGGAGACAGAGGCCAAAGAATTGCGTACCAAAGGAATTAATGCCACCTACTACTATTCAGGTATAGACCCTAAGACACTGGAACATGGGATGACCAATCAGCCATATTGTATCGTGGCCACTAATGCTATTGAATCAGGCATAACCTGCCCTGATCTAGACGTGGTCATAGATACTATGCAGAAGTATGAAAAGGTAGTGAATTTCTCAGCAAAGATGCCCTTGATTGTCACTTCATTAGTAAAGAAGAAAATTACCAGGGAAGAACAGGGCCAGAGGAAAGGTCGAGTAGGCAGGCAAAAGAAGGGAAAATATTACTATCCTTCGGGGGTTGTGCCGAATGGGTCAAAAGACCTAAGCTATCTAATCTTGCAGGCTCAAGAGTATGGTGTCTTGGAACAAGTCAATATAACAGAGTACTTCATCATAATGAATGAAGATTGGGGTCTTTATGATGTGGATGAAATAGAGGTGAGAATACTCGAGAGAATGAACAAGGAAATTCTGCTCCCGCTAGGCATCGTGGAGAAGCAAATCCTGGAAAGAAGTACCCACCCGGAAAAAGTGACACTGTTGTATAACAAATTAGTACAGAAAAACCCTATAGTGTACCCTAGGGTGCAGGAGGGTGAGGTCAGCAAAGAATATAATACTCATAATCTGGCCGTATACGACAAGCTAAAAGATGTCAACCCACAAGCCATTTATGTCCTAGCTGAAGAGGAGAGAGCCACAGAAATGATGGGCCTCGAGTTTGAACAAGATCCATCTGACTTACAGGACTCAGTAGCTCAGCTTTGTGAAGACATCAAGAGGTATACAAAACTCTCTGGGATCACTGAGAAATTACTAGTAGGCACGATGGTGGGGTATATCGGATACAAAGCCTTAACCAGAAACCATGTGCCCTGGGTCAGTAAAGAGTATTGTTATGAGCTGACTGATTCACCGGATACTTACGAAAACTCATTTGCACCTCTTGATGTCGACGTCCAAAACCCCGGCGAAGGCAAACACCCAGAGCAACTGGCAGACCACCAACTGAGGCAACTACTGGAGACTGGGAGAGACAAGGCGATTGACTTTCTAAGAGGAATTCGCGAGTTTACTAGTGGGGCCATAAATAGTCCAAAGGCACTAGGTATATGGGAGAAAATATATCAGTACTTGAAGAAACATCAGGGTGAGATCATCTCATCAGCGGCGTGGGGCAGCGCCACGGCCCTTCATGACAGTATTAAATCTAGGTTGGGAGATGAGGTTGCCACTGCAGTGATAATCCTAAAGTATCTAGCGTTTGGTGAAAGGGAATTGTCCGGACTGACCAGGCAAGTCTTAATTGATATCATAGTATATTATATAGTTAATAAGCCCCGATTCGAAGGAGATGACTACGCAAAGAGAAAAGGAAGAAGACTAGTCATTGAAGTACTGATGGGGGCACTGGCCACTTATGCAGTGTCCAATTTCTGGGGCGTGTCCATTAACAAGATACTGCAACCAATATCTGATTATCTACCCTATGCCACCGCCACTTTGGCTTTCCTCCGTCCAACCTTCATGGAATCAGCAGTGGTGGTCGCCTCCTCTATCTACAGAGCCTTTCTCTCCATCAAACATGCGGAAAACAGGAGTCTTGTCACGCAGGTCGCTTCTGCCGCCCTTGAAGTCATGGGCCTGACTCCAGTATCAGCTGGCTTAGGCGTCTTACTAGGGCTCGGGCTGTGTGTACTCCATATGAACATTGACAAAAACGAGGAGAAAAGGACACTGATACTGAAAATGTTTGTCAAAAACTTTATAGACCAGGCGGCACTGGACGAGTTAGACAAACTGGAGCCAGAAAAAATAATCCTCTCATTGCTGGAGGGCATTCAAACTTGCACAAATCCAGTCAGGGCAATCATGATTTTGTATAGGGTGTATTACAAGGGAGAATCGTTTACAGAAGCCTTGTCTAAGATGGCTGGCAAGTCTCTTATTGTGATGGTTATTGTCGAGTTCTTGGAACTGACGGGCCAAACCCAAGGAGGGTACATAGATCTTAGTGCCAATTTGCTGACCTTTCTCCTGGAAAAACTGAAAAAGATGACCAACCTCGCCATCGGGGAAGCCAGAAAGGCCTTACTCCCCATCCCATACCTGTACTGTGAAACCTGGCAGTCTGACGCCAGAATCAAGGCCCCTGAATCCTATGACCAGGTGGTAGTGGAATGCAAATGTGGTGCTTTAGCAAGGTATTCCTTCCGCCATGGGGTTCACGAGATGTTGGAAGAAAAAAGGACCAAGTGGTGTAAGAATTTCTTCTTATGGGGACCTAACTTTCACAACCCGGATCCCAAGAGAATGACATTTTATGAGTACGGCCAAGCAAAAAAGTGCCCTGTCATCATAATGGGTGAAGACATAACCTTTGGCAAATATGGCATATATGTCAAATTTGGCCATAGGCCTGATGGGAGAAGGTTAATAAGGGGCACTACCCATGCTACCATCAGCAGGGAGGAATTGTTGGAAATCCTAACTGCCCCAAGCCAAGTGGCCATAGGTAAAGTCAAGCTGACCGATTATTGTAGTCAAAAAGGAATAATAGACAGGAAACTGGCCGTGCTTGAAGGTGACAAAATACATTTCTGGAAAGCACACCGTGGATCCAAGATCACGGATCAACTCACTATTGAGAGCCTCACGGATGATTTGGGGTCAGAAATCAGGGACATTGTATGGGAGCTGTACACAGGCGGGACGTGCACTGTAAAGGGGATATCCCTCAGGTCATGCGCGCCAGATCAAAGAAACAAGGCCATGGTCTTGTGTGATTGCACTGACGTGCTTAGCCCCTGTTACCTAATCAATGGCAGGAAACCATCCCCATTTGACGTCGTGGAAGGTTATGAATGCCACCATCGGAAGCCCCGAGCGACGTATGAGGATTTAGAAATGGAGGAAATACTAAAGAGACGGGTCCCTGTCTACGATCCTCAGTGCCTGTTTGATACAGACAGTAAATTGCTGCCTCCTGATACTTATTACTTGGAAGAAGACAGAGAAGACTTTGAGTATGCGCTGAGGTGCTGGGGTTTTGGGGTTTATGTAGTAGACGGACCTATCACCTCTCCCCCGGACATAAGAATACACCACAGTTCCGTGCTGCTACTGCTGACACCCGGAGTGGACTCTGAGTTACTCTTACAGTACATACGTTGTTATTCTCATCAGGCAGAGGTAGACATCTACGTTAGGGGTCAACTTGTGGATGAGGAGGACACTGCTACGGAGGCGGAAGGCTCTCAAGAAGACAGAGATGAAAGGATGAGTGACGTGGTGACAAAAGATGAGGATGCGTCATCCACAACGGAGTCAATGCCCCCACTAGAAGAGGAGGAAGGGGCCGAAGAGCCAATTACCTATGTGATCGTCAGGGGATTACAAGAAGAAAGATATGTTAGCCATCTTAAATTAAATGACTGGATCAGTGAAAACATCTCAGAGCCGCATAGGGTCCAAATCATGCTTGATGGAACAGTAAGAGTCACAATAAAGGAGGGCAAAGTGAAACATCTGTTTGGGGTCTACAGAATCGAAAACTCCCTAGAAGCAATGTTCAAAGAGACCATAGCCAACCTCCCCGTAGCCACCCAACCACCTCGAGGGCCAATCTACACGGCTAAAGAGTTGGCCCAAGGGAATATTGCACCTATCCAACCCGCAGCAAATTACTATGGAATGATAGAGGGGAGAGGTGACCCAATGACAGCATTCGAAGCCTTATCGGCCCTGCGATCACAAAAAGTCTTAGCCAAGGAAGTGAAGGTTAACATCCGCAGGGCACAAGTTTTTTTAAACAAAGTCAGAAGAACTGCTGAGGTCAGAGCATCGGAATTAATATTAAAATGTTTACCGGTACTCGGTAAAGTAAATGGGAGGAAATTGGTCAGAGAGGAAACCAATATCCCCAACCAAAGGTTGGCATCGATAATGACCTCAATAGGGATTAGGCTAGAAAAACTGCCAGTGGTTAGAGCAAACACCTCCGGCTCTAAGTTCAGGCAATCAATTTTAGAAAAAATGGACAAATATGAAAATGAACAAGTTCCAGGGTTGCATGAGAAAATGTGGGCAGCTTTCCTGGCAACTGCCAGACAAGATTTAAGAAATACATATGAGGAAGTGACTTATCTTGAACTGGAGACCGGAATCAACCGGAAAGGAGCCCCAGGTTTCTTTGAAAAAGAAAGCTCAATAGGAGAAGTGTTGGAAAGAAAGGAAAAAATTGACGCCGTAATTCAAGAGATTGAAAAAGGTGATCACTTATACTACGAAACAGCCATGCCAAAAAATGAGAAAAGAGACGTGCTTGATGACTGGTTGTCTGAGGACTTCGTCACCTATAAGAAACCACGTGTGATACAGTATCCTGAGGCAGCCACCCGGTTGGCCATCACCAAAATAATGTACAAGTGGGTAAAGCAGAAGCCTATAGTGATCCCCGGTTATGAGGGGAAAACCCCAATTTTTGAAATATTTGAAAAAGTAAGTGCAGATTGGGCTCAGTTTAAGAACCCGGTAGCTGCTAGCTTCGACACCAAAGCCTGGGACACTCAAGTAACAAGGGAGGACCTCAGACTGGTAGGACGGATTCAGAAATACTACTACAAAAAAAAGTATTGGAAATTCATTGACAACTTGACGGCCATGATGGAGGAAGTGCCTGTGATCACTGTAGAAGGAGATATGTTCCTTAGAGTTGGACAGCGCGGGTCCGGACAGCCTGACACCTCAGCAGGCAGTTCCATACTAAACGTGCTAACAATGTTGGTAGCCTTCTCCGAATCCACAAATCTGCCCATAGCAGCTGCCTGGAAGGCCTGTCGGATCCACGTCTGCGGGGACGACGGTTTTTTAATTACGGAATCAGAATTAGGGAGGAAATTCGCTGAAAAAGGTGTCCCTCTGCTAGCCGCATTCGGCAAGCCCCAAAAAATTACAGAGGGAGCAAGCCTAAAGATAACCAGCAACTTTGACGGGATAGAGTTCTGTAGTCATTCCCCCATCAGAGTCCAAACACCAAACACAAGGTGGATGCCAGCGAGGCCTACAGCAACAATTTTAGGCAAAATGAGCACTAGGTTGGGTGAGGGTGCCACCAGATCAGGAGAGGAATATGAAAAACAGGTGGCATTTGCATATCTACTGATGTATCCCTGGAACCCACTGGTCAGGAGGATTAGTCTCCTCTTGTTATCGACTACTGACCCAATAGGGAAAGAGGAAACCCCATGCTCCGATGAGGGGGTAAAGTATGTTGGAGACCCTATCGCTGCATACAGGGACGTGTGGGGGCACAAATTAGAGGATGTAGGGCATGTTGACCAGCCGCAGTTATCCCGGATGAACTATAGCATGACTTACTTAGGGATCTGGAAGCCAAAGACGAGCCAGCGGTTAGTCGAACAGTGCTGTCGACTGGCCGAGAAAAGCAATTGTGTGGTACGTGCTGACTCCCTAATTAAGAAAAAGGTCAAGATCACTTATGACCCGGGGATAGGAGCGGCTCAGGTCATTCGTAGGTGGGAAGAGCTTGAGTGGACCAGAAGGAAACCTGAACCCACTAATGCAACTGTAGAAGATGATATCTTCCTAACCCTGTGGAAGAGATTTTCAAAGTACATTTTTCAGAAAATGAAGTTCATGCAGAGAATGCTCGCCCCTTACTAA
| 48,751
|
MH307700.1
|
Atypical porcine pestivirus
|
Jin,H.
|
CAU, CVM
|
China
|
2019-12-10
| null |
Pestivirus scrofae
|
Pestivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 11,556
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Sus scrofa
| null |
2017-03-31
| null | null |
Atypical porcine pestivirus, complete genome
|
TAATGCTTTGATTGGCTGCATTATGTGTGGGACATCCTAAATTGTTAAGCGCCCTGCGGTGAGTGGGGGAAAGGGGTTAACCAGGCCTCTAGTACCACAGGCACCATTGGACAGGGCAACTCGAACCTGAGAGAGAGGTACCGAACTCTTAAGCTCCGAGTACGGGGCAGACGTCACCGAGTAGTACACCCAACGACCACCATGTTTAGGTGTAGGGTCTACTGAAGCTCGGGTGGACGTGGGCGTGCCCAAAGAGAAATCGGTGGTGGACCTGGGGGTCGGGCCCACCATGCCCCTCTTACGGGGTAGACCTCACTGCTTGATAGAGTGCCGGCGGATGCCTCAGGTGAGAGTATAAAATCCGTTGTTCGTTAACATGGAAAAACAGATCGCATATTATTTAAAAAAAGAAAAACAAAGAAATGGGTGGACAGAATTGGTAGTAGGAGAAAGCCATACGAAAATAACCACACTCTCTGGAAAAACCTATCGCGGTACTTGGGAAATGGAGAAGCGGTCGAATCCTTACGGAATCTACCTCCCCAGGCCTAGCCCTCGACAGCTCACCGCTATACACCCCCACCCAGTGGTGAATTGCAAGGTAATGGAGTACAAGGAGAGGGACCCTAATTATGGTGACTGCCCGAATACGAATGGGGTATTCATCGATGAAAAGGGCAGAAGACTGAGTAGCCCCCCATTGGGTATCTGGAAGATAAGATTGGACTATGGTGACCTGGTAAATATAAACAGACCAATTCCTGTTAGTGGGAAAAACTCTTATCAAGTCGAGACCTGCAGCGGGGAGCTGGCTACTGTAACACTAGTACACGATAGGGTACTTGTGGAAGACTATAGAGGGCTTTATCAATGGAAACCCAGTTGTGAAGGAATTGTGCTCTATGTGAAAACTTGTTCTGATTGGGCAGACCAGGTGGAAAAACAGGAGAAGGAAAGCCCCCCAAAACCCCAGCGACCACCAAGGCGAGATCCCAGAAAAGGGTTACAACCACAAGTCCCCAAAGAAACTGAAGTCACAGAAAAAAAGAGACAACCTAGTGTCACCTTAGTATCAGGGGGACAGAAGGCCCAAGTCATCTATAAAGGCAGGACTAAAAATAAAAAGACTCCGGATGGAGTCTATAAGTATCCAGGAGCTAGAGAAGGAGATGTGGCAAAGGTCAGGAAGATGCTGAAGAACTGGCATATAGCATTAGTAATGTACTTGATATATATTATAACTCCAAGTTTTGCCAAGGTCCAGTGGTTTTTAAAGGATGAAAATTCGTCGGGGATCAACCAGGTACTATGGCGAAGACAGATTAACAGATCTCTACATGGGGAATGGCCTAACCAGATTTGCCACGGTATGCCAAATGAAACTATCACCGACGAGGAATTACGCAGTCTAGGAATGATAGATACAAGCCCCAGAACAAATTACACTTGTTGTCAGTTACAATATCATGAATGGAAGAAACATGGTTGGTGCAACTATCCGCAAAAACAGGCTTGGATCAGGAGGATAACGGCCCTGCAAGCCAATCTTACCGGAGCTTATGAGGGACCTGAATGCGCTGTCATCTGTCGATTTAACGGAACCTATAATATCGTAAGACAAGCTAGAGATGAGGTGAGTCCATTGACAGGGTGTAAGGAAGGGCACCCTTTTCTATTTTCTGAGGAGAGGTCCGACACCTCATGCTTGAGGCCGCCTTCCACCAGTTGGGTGAGACCAGTGAAAATGGACGAGGCATCAGTGGCTGACAGCTTCGCCCATGGGGTCGACAAGGCCATAATATTAATCAGAAAAGGGGCATCGGGAATTATCAATTTCTTAGATACTATTGGGAGATGGTTACCGGTGACTGAAGCAACTATAGTGCCATATTGCGAAACCTACACTGTGACAGGGATGTATGTCCACGTAAAAAATTGTCTTCCTAGAGGGCTACCTAGACATTCGAAAATAATCTCCCCAACAATGATATACCTGGGGGAAGGTGACCCGGCCCATAACATCCAGCACCTATTCGGCTCAGGTATAGCAAAGTGGGTCCTAGTCTTACTCGGGATCCTGGGTGAGTGGTACGGGGAATTAGCCTCTACAATCTACTTACTACTAGAGTATGGGTCTGAGTGGTTGGAGCACGAAAGCTTGATCACAGAAGGGTTGATCCCGGGTATCAATATTACAATAGAACTCCCGGCTAGCCACACTGTACCTGGTTGGGTGTGGGTCGCGGGCCAGTGGGTATGTGTGAAACCAGATTGGTGGCCCACACAGATTTGGATTGAAACCGTAGTGGCAGAAGCCTGGCACATATTAAAAATCCTAGCATCAGCCTTGGTGAACATAGTTACTGCATTTGTAAACCTAGAACTGGTCTACTTGGTCATAATACTAGTTAAAATATCAAAAGGGAACCTGATAGGTGCTATATTATGGTGCCTATTACTGTCTGGGGCTGAGGGGTCATGTATAAAAAGGCAAGACTACTACAATGTCCAGCTAGTCGTTGAAGAAAAGACAGGCGTAGAAAAAAGATCTATAATGGGCAAGTGGACTGTGATAACTAGGGAAGGCCGAGAACCAAGATTAATGGAACAGATAAATGTGGTGTCAAATGAAAGTGTGTTAGAAACTTACTGCTATAATAGGCTCAATACCAGCAGTTGGGGGCGGCGACCGATAAGACAGAGAGGGTGCGGTCAAACAGTGCCCTACTGGCCCGGTGATAATGTCCTAGAAGAACAATACTATAGCATGGGCTACTGGGTGAACGCAACAGGCGGTTGCCAACTTAGGGAAGGCGTATGGCTATCAAGAAAGGGCAATGTGCAGTGCCAGCGTAATGGTTCATCCTTGATGCTGCAATTGGCGATAAAAGAAGACAATGACACCATGGAAATACCGTGCGACCCAGTGGAAACAGAAAGCATGGGCCCAGTTGCGCAGGGTACTTGCGTGTACAGCTGGGCAGTCGCCCCAAGAGGGTGGTACTATAATAGGAAAGATGGTTACTGGCTGCAGTACATAAAGAAAAATGACTACCAGTACTGGACAAAAATGCCTACTGCTTCGTCCGCGGCAACGATGTACCGCCACCTGCTCCCTTTGCTGGTAGCCTGCCTTATGGGCGGCAGGATATCAGTGTGGATTGTTGCAATGCTCCTATCTCTACAGGTGGAAGCTAGTGAAGTGGGCACCAAACAACTGGCCGTCACACTAACTCTATGGAAAATGGACTGGACAGAATTACTTTTCTACATCGTCATAATGCTAGTCGTTAAGGAAGACCTCATAAAGAAAATAGTGACCGCAAGTCTCGTGACCTTAAAAAATAGTCCAGTGGCCTTGAGCTTTCTCATTGTACTCAGGCTTGTGGGGGGCAGTGAAGCACTCCCAGTGGGTTTACTACTAGAAAAAATGTGCATAGACCAACCAGAGTTTGGAACTCCTTTCTTGATCTACCTGTGGGACAATTGGAAATGGACTGTCTTAGTCAGTTTCTCCGCACTAAATCACGAGAAAACTATAAAATTGGCAAGGAAGCTATTATTGGCTACACATATAACAGCGCTCACGTTGACTGGTCTAAGTGATTCAATCTTTTATATCATGCTTATAATTACCAACCTACTAATAAAGATATTCATATATCTATTGGGGGCTAGCATAAATTGGGTCGAGAAAGAAAAAAAAAAGTTGCTGGTAAAGAGGAAGCTAATATATAAAAAAGCCGCAATTTGCAATCGGGACGAGAATGAACTGGAGTACAAATTCAACAAGATAACCGTGAACGCCGATTTCACCCCATGCAAACTTGAATTATTACAACTACTTAGGGCTTTTTTAGTATCCCTGTGTTTTTCCTACTACAAACCTCTCCTGTATGCAGAGACTACCCTAACTGTTATAGTAATTGGTGTACAAGAATACAATGTGGCAATGGCCCGTGGGCGAAGCATGGTCCACAGATTACTAGCTATGGCCTACTATATATATGGTCGCATACAGGGTAATACGTTCCAGCTTGCCAGTATCCAGTGCCTGTTGTCAAGCCCAAGGAAAATCATGAAACACATGATAGAAAACCCAACCCTTAGGAAGTTCTGGCAGGGTGAAACAGAGCTTTTCAACCAGGGTGTCAGTCAGTCTAAAATAGTAAACCCAAAGAAAATTGGGCTGGAAGAATTACATAAGGGTATGTGCGGCCTACCAACTGTAGTACAAAATTTGGTTATATATGCAAAGAAGAATGACTCTCTTATCCTAGGAGAATTGGGCTACCCCCCTGGGGACCTCACCAGTGATGGGTGGGAAATTTTAGGCCCCGGCAGAATCCCAAAGATTACCAATGTTGAGTCTGCTAAGATGGACTTACTCTCCAAACTCATGACTTTTCTGGGGATTGAAAGTTCAAGGGTTCCCAGAACCCCAATCCACTCAACAAGGAAATTACTGAAGATAGTGAGAGGCTTGGAAACTGGGTGGGGGTACACTCACGCAGGGGGGATTAGTAGCGCAAAACATGTTACAGGTGAAAAAAACTTAATGACCCACATGGAGGGCAGGAAGGGCAAGTACATCTTACAATCCCAAGAACATGGCGCCGATGAAGTTGAGTATGGAGTAAAAACTGACCAAAAAGCACCCGATAACGCTTTATGCTACTGCTTTAACCCTGAAGCCACAAACATAAAGGGAGAAACAGGGGCCATGGTGTTCATGAAGAAGATAGGAAAAAAATGGACCCTTGTAACATCAGATGGCAACAAAGCCTATTACAATGTAAACAATCTGAAAGGGTGGTCCGGATTACCAATAATGCTGCACTCCACAGGGGCCATAGTAGGGAGGATTAAATCAGCGTATTCAGATGAAAACGACTTGGTGGAGGAGCTTATCGACTCCAGGACTATCAGTAAGAGTAATGAGACAAACCTGGATCACCTTATTAAGGAATTGGCAGATATGCGGAGGGGGGAGTTCCGCTCAATTACCCTTGGAACAGGTGCTGGGAAAACCACAGAACTGCCCAGGCAATACCTCACAACAGTAGGCACTCATAAATCTGTATTAGTCCTGGTCCCTCTAAAAGCACCCGCCGAGAGTGTCTGCCGCTTCATGAGGTCCAAGTACCCCGCCATCAACTTTTCCTTGAGAGTGGGAGAGCGGAAAGAGGGAGACGTGAGTAGCGGCATCACCTATGCTACTTACGGATTCTGCTGTCAGCTTAACCTGGTTCAACTCAAAGAGTGGATATCTAGGTACTCAATGGTGTTTTTCGACGAATACCACACGGCAACCCCGGAACAGATAGCTATAATAAGCAAGATCCATGCACTGAAAGTCAAGACCAGAATAGTGGCCATGTCAGCAACTCCCCCGGGTACCGTGACAACTGAAGGCAGGAGATTTGATATCGAAGAAGTTGGGGTTGCCACAATAGAGAAGGGAGAGGAACCAAAAAGGGGGCGTATAGCGGTTGCTGGCATGCAGGTCCCGCTGGAGGATTTGACAGGGAAGAACTGCCTGGTATTCGTGGCAACCAAAGAAGCCGCGGAGACGGAGGCCAAAGAGCTGCGTGCTAGAGGAATTAATGCCACTTATTACTATTCAGGTATAGACCCAAAAACTCTGGAACATGGGATGATCAATCAACCATATTGTATTGTGGCCACAAATGCTATCGAATCGGGCATAACCTGTCCTGATTTAGATGTGGTCATTGATACTATGCAAAAATACGAAAAGGTAGTGAATTTCTCAGCAAAGATGCCCTTGATTGTCACTTCTTTAGTAAAGAAAAAAATCACTAGGGAAGAACAGGGCCAGAGGAAAGGTCGAGTGGGCAGGCAAAAGAAGGGAAAATACTACTATCCTTCGGGAGTGGTACCGAATGGATCAAAAGACCTAAGCTATCTAATCCTGCAAGCTCAAGAGTATGGCGTCCTGGAACAAGTTAATATAACAGAGTACTTCATGATAATGAATGAGGATTGGGGTCTTTACGACGTGGACGAGGTAGAAGTGAGAATATTGGAGAGAATGAACAAGGAAATTTTGCTTCCGCTAGGCATCGTGGAGAAACAAATCCTGGAAAGAAGCACTCACCCGGAAAAGGTAGCACTGTTGTATAATAAATTAGTACAAAAAAACCCCATAGTATATCCCAGAGTACAGGGGGGTGAGGTTAGCAAAGAATATAATACCCACAATTTGGCCGTATATGACAAGCTAAAAGACGTCAATCCACAGGCCATTTATGTCCTAGCAGAGGAGGAAAGAGCCACAGAGATGATGGGCCTCGAGTTTGAACAAGATCCACCCGACTTACAAGATTCGGTAGTCCAGCTTTGTGAAGATATCAAGAGGTACACAAAACTCTCTGGGATCACTGAGAAATTACTAGTAGGCACAATGGTGGGGTACATAGGATATAAAGCCCTAACCAGAAACCACGTGCCCTGGGTCAGTAAAGAGTACTGCTATGAGCTGACTGATTCACCTGACACTTATGAGAACTCATTTGCACCTTTGGACGTCGACATCCAAAATCCCGGTGAAAGTAAACACCCAGAACAACTGGCAGACCATCAACTGAGGCAATTACTAGAGACCGGGAGAGACAAGGCAATTGATTTCTTAAAAGGAATCCGCGAGTTCACCAGTGGGGTTGTAAATAGTCCAAAGGCACTGAGTCTATGGGAGAAAATATATCAGTACTTGAAGAAACATCAGGGCGAGATCATCTCATCAGCGGCGTGGGGCAGCGCGACGGCCCTTCATGACAGTATCAAATCTAGGTTAGGGGATGAGGTCGCTACTGCAGTAATAATTCTCAAGTATTTAGCATTTGGTGAAAGAGAAATGTCCGGACTGACCAGGCAAGTCTTAATTGATATTATAGTATATTATATAGTCAACAAGCCCCGGTTTGAAGGAGATGACTATGCGAAGAGAAAGGGGAGAAGACTGGTCATCGAAGTCTTGATGGGGGCACTGGCAACTTATGCAGTGTCCAATTTTTGGGGCGTGTCCATTAATAAGATACTACAACCAATATCTGATTATCTACCTTATGCTACTGCCACTTTAGCCTTCCTTCGCCCAACTTTCATGGAATCAGCAGTGGTGGTCGCTTCCTCTATCTACAGAGCTTTTCTCTCCATCAAACATGCAGAAAACAGGAGCCTTGTTACGCAGGTCGCCTCTGCCGCTCTCGAAGTCATGGGTCTGACCCCAGTATCAGCCGGCCTAGGCGTCCTGCTGGGGCTCGGACTGTGTGTGCTTCACATGAACATCGACAAGAATGAGGAGAAGAGGACACTGATATTGAAAATGTTTGTTAAAAACTTTATTGACCAGGCGGCACTAGATGAGTTAGACAAACTGGAGCCGGAAAAAATAATCCTCTCATTGTTGGAGGGTATCCAAACTTGTACAAACCCGATCAGAGCCATCATGATTTTATACAGAGTGTATTACAGGGGAGAGTCATTTACAGAAGCCTTGTCTAAGATGGCTGGTAAGTCTCTCATTGTAATGGTCATTGTCGAGTTCCTAGAACTGACGGGCCAAACTCAGGGAGGATATATAGACCTTAGTGCCAATCTGCTAACTTTTCTTTTGGAAAAACTGAAAAAGATGACCAACCTCGCCATAGGGGAGGCCAGAAAAGCCTTACTCCCTATTCCATACTTGTATTGTGAAACCTGGCAGTCTGACGCAAGAATCAAGGCTCCGGAATCCTATGACCAGGTGTTAGTGGAATGCAAATGCGGTGCTTCTGCAAAATACTCCTTTCACCACGGGGTTCACGAGGTATTGGAAGAAAGAAAGACCAAGTGGTGCAAGAACTTCTTCCTATGGGGACCTAATTTTTCCAACCCGGATCCAAAGAGGATGACATTCTATGAGTACGGTCAAGCAAGGAAGTGCCCCGTGGTCATAATGGGTGAAGACATAACTTTTGGTAAATATGGTATATATGTTAAATTTGGCCATAGGCCTGATGGGAAAAGGTTAATAAGGGGCACCACCCATGCCACCATTAGCAGAGAGGAACTGCTAGAAATCCTAACGGCCCCGAGCCAAGTAGCCATAGGTAAAGTCAAGCTGACAGATTACTGCAATCAAAAGGGAATAATAGATAGGAAACTGGCCGTACTTGAAGGTGACAAAATACATTTCTGGAAAGCCCATCGTGGGTCCAAGATCACGGATCAACTCACCATCGAGAGTCTGACAGATGACTTGGGGTCAGAAATCAGGAATATCACATGGGAGCTGTACACAGGTGGGACATGCACTGTAAAAGGAATATCCCTTAGGTCATGCGCACCAGGGCAGCGAAACAAGGCCACGGTCTTATGCGATTGCACCGACGTGCTGAGCCCCTGCTACCTAATTAATGGCAGGAGACCATCCCCATTTGACATCGTGGAAGGTTATGAATGCCACCATCGAAAACCCCGAGCGATGTGCGAAGACTTAGAGATGGAAGAAATATTGAAGAGACGAGTCCCTGTTTACGATCCTCTTTGTTTGTTCGATATTGACAGTAAACTACTGCCTCCTGACACTTACTACTTGGAAGAAGATCAAGAAGACTTTGAGTATGCACTGAGGTGCTGGGGTCTCGGGGTTTATGTAGTGGACGGGTTTGTTGCTTCTCCCCCAGACATAAGAATACACCACAGCTCCGTCCTACTGCTACTGACACCTGGAACAGACTCTGAGTTACACTTACAATATATACGCTGTTACTCTCACCAGGCAGAGGTGGATATCTACATTAGGGGTCAAATTCTAGAGGAGGAAAACACTGCCATGGAGGCGGAAGGCTCTCAAGAGGACAGTGATGAAGGGACAGGTGACGTGGTGGCAGAAGATGAAGACGCGTTGTCCACAACGGAATCAATGCCCCCGCTAGAAGAGGAAGAAGAAGGTGGGGAGCTAATTACCTATGTGGTTATCAGGGGATTACAAGAAGAAAGATATGCTAGCCATCTCAAATTGAATGATTGGATCAGTGAGAATGTTTCGGAACCACACAGAGTCCAAATCATGCTTGATGGAACAGTGAGAGTCACAATAAAAGAGGGCAAAGTGAAACACCTATTTGGAATCTACAGAATCGAAAACTCCCTGGAAGCAATGTTCAAAGAGACCATAGCTGACCTCCCCACAGCCACCCAACCGCCCCGAGGGCCAATCTACACGGCTAAAGAGTTGGCCCAAGGGAATATTGCCCCAGTCCAACCTGCAACAAATTATTATGGAATGATAGAGGGGAGAGGGGACCCGATGACGGCGTTCGAAGCCTTATCAGTTCTGCGGTCACAAAAAGCTTCAGCTAAGGAAGTGAAGGTAAGTACCCGCAAGGCACAGGCTTTCCTAAATAAAGTCAGGAAAACCGCTGAGGTCAGGGCATCGGAATTGGCATTAAAACGCCTACCGGCACTCGGTAAAGTAAATGGGAGGAAACTGATTAGAGAGGAAACTAATATTCCCAATCAAAGGCTAGCATCAATAATGACTTCGATAGGGATCAGATTGGAGAAACTGCCGGTGGTCAGAGCAAATACCTCAGGCTCCAAGTTCAGGCAGTCAATCTTAGAGAAAATGGATAAATTTGAAAATGAACAAGTTCCAGAGTTACATGAGAAGATGTGGGCAGCTTTTCTGGTAACCGCCCGACAAGACTTAAGAAACACATATGAGGAAGTGACTTACCCTGAACTGGAGACCGGAATCAACCGGAAAGGAGCACCAGGTTTCTTTGAAAAAGAAAGTTCAATAGGAGAAGTACTGGAAAGGAAGGAAAAAATTGATGCCGTGATCCGAGAGATTGAAAAAGGTACTCATTTATACTATGAAACGGCCATGCCAAAAAATGAGAAAAGAGATGTGCTTGATGATTGGCTGTCTGAGGATTTCGTCACTTATAAAAAACCACGTGTGATACAGTACCCTGAGGCAGTCACCCGATTGGCCATTACCAAAATAATGTACAATTGGGTAAAGCAGAAACCTATAGTGATCCCCGGTTATGAGGGGAAGACCCCGATTTTTGAAATATTTGAAAAAGTTAGTGCGGATTGGACCCAGTTCAAAAACCCAGTAGCAGTCAGTTTTGACACCAGGGCCTGGGATACCCAAGTAACAAGAGAAGACCTCAGATTGGTAGGACGGATACAGAAATACTACTACAAAAAGAAATATTGGAAATTCATTGACAATTTGACTGCTATGATGGAGGAAGTGCCCGTAATCACTGTAGAAGGAGACATGTTCCTCAGGGTCGGGCAACGCGGGTCTGGACAGCCTGACACCTCAGCAGGTAATTCCATATTAAACGTGCTGACAATGCTAGTAGCTTTCTCTGAATCCACAAATTTGCCCATAGCAGCTGCCTGGAAGGCCTGTCGTATCCACGTCTGTGGAGACGACGGCTTTCTAATTACGGAATCAGAATTAGGGAGGAAATTCGCCGAAAAAGGTGTCCCTTTGCTAGCCTCATTTGGCAAACCCCAAAAAATCACAGAGGGGGCAAGCTTAAAAATAACTAGCAACTTTGATGGAATAGAGTTTTGTAGCCATTCCCCCATTAGAGTCCAAACACCAAACATAAGGTGGATGCCAGCGAGGCCCACTGCAACAATTCTAGGAAAAATGAGTACCAGACTGGGTGAGGGCGCCACCAGATCGGGAGAAGAGTACGAAAAACAGGTGGCATTTGCATACCTACTGATGTACCCCTGGAACCCACTGATCAGGAGAATCAGCCTCCTATTGCTATCAACTACTGACCCAATAGGGAGGGAGGAAACCCCGTGTTCTGACGAGGGGGTAAAATACGTCGGGGATCCTATTGCCGCATACAGGGACGTATGGGGGCACAAATTAGAGGATGTAGGGCATGTTGATCAGCCGCAGTTATCTCGGATGAACTATAGCATGACTTACTTAGGGATCTGGAAACCAAAAACGAGCCAGCGGCTAGTCGAACAGTGCTGTCGGTTGGCCGAGAAAAACAATTGTGTGGCACGTGCAGATTCCCTAATCAAGAAAAAGGTCAAGATCACTTATGACCCGGGGATAGGAGCGGCTCAAGTCATTCGTAGGTGGGAAGAGCTGGAGTGGACCAGAAGGAAACCCGAATTCACTAACGCAACAGCAGAAGACGACCTCTTCCTGACCCTTTTTAAGAGACTTTCAAAGTACATTTTCCAGAAAATTAAGTTCATGCAGAAAATGCTCACCCCTTATTAAGTAGGGGCCGCTTACTTAAATATAGCCAGTATCTGGCAAGTATAAGACTTGTGTAAATAAAATATATAACTGAAAGGGGCAAGTGGCCGTATAGGCTGGGGCGATCGCCGTACCCCCCCTTTACCAGGCGCCTCAACCCCATGTACCATGGGGTTGTTGTAAATACTTGAATGAATGGAGTAATACGGGTAATATACTTACAGGCCAGTATTGCCCCATTTGCTTTATAGTGGTGACGACCTGTATAGGTCCGATCTAGATGAAGCAAGGGG
| 57,674
|
MN584737.1
|
Atypical porcine pestivirus
|
Yan,H., Wang,X., Wang,G.
|
South China University of Technology, School of Food Science and Engineering
|
China
|
2019-11-18
|
GD-CT4
|
Pestivirus scrofae
|
Pestivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 11,101
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Sus scrofa
| null |
2018
| null | null |
Atypical porcine pestivirus isolate GD-CT4, complete genome
|
GGCGGATGCCTCGGGTAAGAGTATAAAATCCGTTGTTCATTAACATGAAAGAACAAATTACATATTACTTAAAAAAAGAAAAGCAAAGAAATGGGTGGACAGAACTGGTAGTAGGGGAAAGCCATACGAAGATAACTACACTCTCCGGGAGGACCTATCGAGGTACTTGGGAAATGGAGAAACGGTCCAACCCTTACGGGATCTACTTCCCTAGGCCAAGTCCTCAACAGCTTACGGCCTTGCACCCACACCCAGTCGTGAACTGTAGGATGATAGAGTACAAAGAAGCTGACCCTAACTATGGCGACTGCCCAAACACAAATGGAGTATTCATAGATGAAAAAGGCAGGAAATTTAGCGGACCCCCGTTGGGTCTCTGGAAGATAAGACTGGACTACTATGACTTGGTGAATGCTAAAAGGCCGACTTTCACAAGTGAACAGATCTCTTACCAAGTCGAAACCTGTAGTGGGGAGCTGGCCACCGTAACACCTATACACGGCAGGGTGTTTGTGAATGACTACAGGAGATTTTATCAATGGAAACCTAGGTGTGAAGGGATGGTGCTCTACGTGAAAACCTGTTCCGACTGGGCAGATCAAGTAGACAAACAAGAGAAAGAAAGCCCCCCGAAACCACAGAGACCACCGAGACGAGACCCACGGAAAGGGTTGCAGCCGCAAGTCCCCAAAGAAACCGAAATCACAGAGAAAAAGAGACAACCTAGCGTAACTTTAGTGACTGGGGGGCAGAAGGCTCAGATCATTTATAAAGGCAAGACCAAAAATAAAAAGACCCCGGACGGGGTCTATAAGTACCCAGGAGCTAAAGAAGGGGATGTAGTAAAGGTGAGGAAGATGTTAAAAAATTGGCACCTAGCTCTGGTAATGTGTCTGATATATCTTATAAATCCAAGCCTTGCAAAGGTTCAATGGTTTTTGAAGGATGAAAACTCGACAGGAATCAATCAGATATTGTGGCAAAGACGGGTCAACAGGTCCTTGCATGGAGAATGGCCAAACCAAATCTGTCATGGCATGCCAAATGAAACCATTACAGATGAGGAGTTACATAGCCTAGGGATGATAGACACCAGCCCAAGAACAAACTATACCTGCTGCCAACTACAATACCATGAATGGAAGAAACATGGCTGGTGTAATTATCCGCAAAAACAAGCATGGATCAGAAGAATAACAGCCTTACAATCCAACCTTACTGGGGCCTATGAAGGACCAGAATGTGCTGTCATATGTCGGTTTAACGGCAGTCACAATATCGTAAGGCAAGCCAGGGATGAGGTTAGCCCACTTACAGGATGCAAGGAGGGGCACCCCTTTCTATTCTCCGGTGAAAGATCTGAGGCTTCGTGCTTAAGACCGCCTTCCACTAGTTGGGTGAGACCAGTGAAAATGGACGAGGCTTCAGTGGCGGATAGTTTTGCCCATGGGGTAGATAGAGCAATAATATTAATTAGAAAAGGGGCTTCGGGAATTATAAATTTCTTAGACACTATTGGGAGGTGGCTGCCAGTAACCGATGCCACTATCACACCATACTGTGAAACTTACACCGTAACGGGGATGTATGTTCATGTCAAGCATTGCCTTCCTAGGGGGCTACCTAAGCACTCGAAAATAATCTCCCCAACGCTGATATACCTAGGAGAAGGCGATCCAGCCCATAATATCCAACATTTATTCGGCTCAGGCATAGCAAAATGGGTTCTAGTACTGCTCGGGGTTTTGGGTGAATGGTATGGGGAACTAGCCTCAACAATATATTTAATACTCGAGTATGGCACTGAGTGGTTAGAACATGAAAACCTGGTTACAGAAGGGCTAATACCTGGCATCAATATCACGGTGGAGCTTCCTGCTAGCCATACGGTACCCGGCTGGGTATGGGTCGCGGGTCAGTGGGTATGTGTGAAACCAGATTGGTGGCCTACGCACATCTGGATCGAAACCGTGGTGGCAGAAGCTTGGCATGTGTTAAAGATACTAGCCTCGGCCTTGGTCAATATAGTTACTGCATTTGTGAACTTGGAATTGGTTTACCTGGTCATAATATTGGTCAAAGTATCAAAGGGTAACTTGATCGGAGCTATCCTGTGGTGCCTATTACTGTCAGGGGCCGAAGGATCATGCCATAAGCGACAGGACTATTATAATGTCCAATTAGTCGTTGACGAAAAAACGGGCATAGAAAAACGGTCAATAATGGGCAAATGGACCGTAGTGACCAAAGAGGGTCGGGAGCCAAGATTAATGGAACAGATAAAAATGGTATCAAATAGCAGTCTGACAGAAACTTACTGCTACAATGAACTAAACACCAGCAGCTGGGGGCGACACCCAATGAAACAGAGGGGGTGTGGGCAAACTGTACCCTATTGGCCTGGTGACAATGTTCTCGAAGAACAATACTTCAGCACGGGTTACTGGGTGAATGCCACAGGAGGTTGCCAGTTGAGGGAAGGTGTGTGGCTATCAAGAAAGGGCGGTGTCCAGTGCCAACGTAACGGCTCATCTTTGATCCTGCAGTTGGCAATCAAGGAGGAAAATGATACCATGGAGATACCGTGTGACCCGGTAGAAACCGAAAGCATGGGCCCGGTGGCACAGGGCACTTGCGTGTATAGTTGGGCAGTAGCTCCAAGAGGATGGTACTACAACAGGAAGGATGGCTATTGGCTCCAATATATAAAGAAAAATGACTATCAGTACTGGACAAAAATGCCCGCGACTTCGTCCGCTGCAACAATGTACCGGCATTTACTACCTTTGTTAGTGGCTTGCCTTATGGGCGGTAGGATTTCAGTATGGATTGTAGCAATGCTTCTATCCCTACAGGTGGAGGCCAGCGAGGTAGGAACCAAACAGTTGGCCGTCACCCTAACTCTGTGGAAGATGGATTGGACAGAGTTGCTCTTTTACATTATTATAATCCTGTCCATAAAGGAAGACCTCATAAAGAAGATAGTGACAGCAAGTCTAGTGGCTCTCAAAAATAGCCCAGTAGCCTTAAGCTTCCTAATTGTACTTAGGTTAGTCGGAGGTAGTGAAGCACTCCCAGTAGGGCTACTACTAGAAAAAATGTGTATAGACCAGCCAGAGTTTGGAACCCCTTTCCTAATTTACTTGTGGGACAATTGGAAGTGGACTGTCTTAGTCAGCTTCTCCGCATTAAACCACGAAAAGACCATTAGACTAGCAAGGAAACTCTTATTAGCTACACATATAACTGCACTGACATTGACTGGTCTAAGTGATTCAATTTTTTACGTAATGCTCATAATAACCAATTTACTGATAAAGACCTTCATATATCTACTGGGGGCCGGCATTAACTGGGTGGAGAAAGAAAAAAGGAGGCTGCTAGTGAAAAGGAAGCTGATATACAAACAAGCCGTGGTTTGCCATCAAGATGAGGATGAACTAGTGAGCAAATTTAACAAAGTAACAATAAACACGGACTTCACCCCATGTAGGCTTGAACTGTTGCAACTGCTCAGAGCTTTCTTGGTTTCCCTATGTTTCTCTTACTACAAACCCCTCCTATATGCGGAGACCACCTTAACCGTCATAGTGATTGGCGTACAAGAGTACAACCTGGCCATGGCCCGTGGGCGAAGTGCAGTCCACAGGCTATTAGCTATGGCTTACTACATATATGGTCGCCTGCAGGGGGACATGTTTCAGCTCGCTACGATCCAGTGTCTGATGTCGAGTCCAAGAAAGATAATGAAACACATGATAGAAAACCCAATCCTCAAGAAGCTCTGGCAAGGAGAAACAGAGCTTTTCAACCAGGGTGTTAACCAGTCTAAAATAGTAAACCCAAAAAAGATAGGGTTGGTAGAATTGCAAAAAGGTATGTGTGGCTTGCCGACTGCAGTGCAAAACTTGGTCATATATGCAAAGAAGAATGACTCCCTCATTCTAGGAGAGGTGGGTTATCCGCCTGGAGACCTCACCATTGACGGGTGGGAAATACTAGGCCCTGGCAGGATCCCAAAAATCACTAACGTAGAGTCCGCTAAGATGGACCTACTATCTAAACTAATGACATTCCTGGGGATTGAAAGTTCGAGGGTCCCTAGAACCCCAGTCCATTCCACTAGGAAACTACTGAAGATAGTAAGAGGCATGGAAACTGGGTGGGGGTACACCCATGCTGGAGGAATTAGTAGTGCGAGGCATGTCACCGGTGAGAAGAACCTAATGACACATATGGAGGGCAGGAAGGGCAAGTATATCCTGCAGTCTCAAGAACATGGTGCTGATGAGGTGGAATATGGGGTGAAGACTGACCAGAAAGCACCCGACAATGCATTGTGCTATTGTTTTAATCCTGAAGCTACAAATATAAAGGGAGAGACAGGGGCCATGGTATTCATGAAGAAAATAGGAAAAAAGTGGACTCTCGTAACCTCAGATGGCAACAAAGCTTACTACAATGTAAGCAACTTAAAAGGGTGGTCTGGACTACCGATAATGCTGCACTCTACTGGAGCAATCGTAGGGAGGATCAAGTCGGCGTATTCGGATGAAAATGATCTGGTGGAGGAGCTGATCGACTCCAGGACCATCAGTAAAAGCAATGAGACAAATCTAGATCATCTTATTAAGGAGTTGGCAAGCATGCGGAGAGGGGAGTTCCGCTCAATCACCCTTGGGACGGGCGCCGGAAAAACTACAGAACTACCCAGACAATACCTCACAACAGTGGGGACACACAAGTCCGTGCTGGTCTTAGTCCCTTTGAAAGCGCCTGCTGAAAGTGTATGTCGCTTTATGAGGTCTAAATACCCCACTATCAATTTTTCCTTAAGGGTAGGGGAGCGAAAGGAAGGGGATGTGAGTAGCGGCGTCACCTATGCCACTTATGGATTCTGCTGCCAGCTCAACCTAGTGCAACTCAAGGAATGGATATCCAGGTACTCAATGGTGTTCTTCGATGAATACCATACGGCAACTCCAGAACAAATAGCCATAATAAGCAAAATCCATGCATTGAAAGTAAAGACCAGGATTGTGGCTATGTCAGCCACCCCCCCGGGCACTGTGACAACAGAAGGTAGAAAATTTGACATAGAAGAAGTGGGGGTTGCCACAATAGAAAAAGGGGAAGAGCCAAAAAGAGGGCGTATAGCAGTGGCCGGCATGCAGGTTCCGTTAGAAGACTTAACAGGGAAAAATTGCCTGGTGTTCGTGGCAACTAAAGAGGCCGCAGAGACGGAAGCTAAAGAACTACGTGCCAGGGGCATCAACGCCACCTACTATTACTCTGGCATAGATCCCAAAACCCTGGAGTACGGTATGACAAACCAACCGTACTGTATTGTGGCCACCAACGCTATTGAATCAGGTATAACCTGCCCCGACTTGGACGTGGTCATAGACACCATGCAAAAGTATGAAAAAGTAGTGAATTTCTCAGCAAAAATGCCCTTAATTGTCACTTCGCTGGTGAGGAAGAAAATCACTAGAGAGGAGCAAGGCCAGAGGAAAGGCCGAGTAGGCAGGCAAAAGAAGGGTAAATACTATTATCCATCGGGCGTAGTGCCGAATGGGTCAAAAGACTTGAGTTATTTGATCTTGCAGGCCCAAGAATATGGTGTCTTGGAGCAGGTCAATATAACAGAATATTTCATCATAATGAATGAGGACTGGGGGCTTTATGACGTAGATGAGGTGGAAGTGAGAATATTGGAGAGAATGAATAAAGAAATCTTACTCCCGCTAGGTATTGTGGAGAAGCAAATCTTGGAAAGAAGCACCCACCCGGAAAAAGTGGCATTATTGTACAACAAGCTAGTACAGAAAAACCCTATAGTTTACCCAAGGGTTCAGGACGGTGAGGTTGGCAAAGAATACAATACCCACAACCTAGCCGTGTATGACAAACTTAAGGACGTTAACCCACAGGCAATATATGTCTTAGCAGAGGAAGAAAGGGCTACGGAAATGATGGGCCTTGAATTTGAGCAGGAGCCTTCTGACCTGCCGGATTCAGTAGGCCAACTTTGTGAAGACATAAAGAGGTACACAAAACTTTCTGGAATTACTGAAAAATTGCTAGTTGGTACTATGGTAGGGTATATTGGATACAAGGCCCTAACCAGAAATCATGTGCCCTGGGTTAGTAAAGAGTATTCTTATGAGTTGACGGATTCACCAGACACTTATGAAAATTCATTTGCACCTTTGGACATAGACGTCCAGACCCCCAGTGATAGCAAACACCCGGAACAACTGGCGGACCACCAGTTAAGACGACTGTTGGAGAATGGGAAGGACAAGGCAATCGACCTCTTAAAAGAAATCCGCCAGTTTACCAGTGGAGTCATAAACAGCCCAAAAGCATTAAGCATATGGGAGAAAATTTACCAATACTTGAATAAGCACCAGGGGGAGATCATTTCATCAGCGGCATGGGGTAGTGCAACAGCCCTTCATGACAGTATCAAATCTAGGCTGGGGGATGAGGTCGCCACAGCAGTGATAATCCTCAAGTATTTAGCATTTGGAGAAAGAGAGTTGTCTGGGCTTACTAGACAAGTCTTAATTGATATTATAGTATATTATATAGTCAACAAGCCCCGGTTTGAGGGGGATGACTATGCAAAAAGAAAAGGGAGAAGACTAGTCATTGAGGTGTTGATGGGGGCACTAGCAACCTATGCTGTATCCAACTTTTGGGGCGTGTCTATCAATAAAGTGTTGCAACCAATATCTGACTACTTGCCCTACGCCACTGCCACTCTGGCTTTCCTACGTCCAACTTTTATGGAATCAGCAGTGGTGGTGGCGTCTTCTATCTACAGGGCCTTCCTTTCCATCAAACATGCAGAGAACAGGAGTCTCATTACGCAGGTCGCCTCGGCTGCCCTTGAAGTCATGGGCTTAACACCAGTATCGGCTGGTTTAGGCGTCCTGCTGGGACTTGGACTATGTGTGCTTCACATGAACATAGATAAGAACGAAGAAAAGAGGACACTAATACTGAAGATGTTCGTCAAAAACTTCATAGACCAGGCGGCGTTAGACGAGCTAGACAAACTAGAGCCGGAAAAAATAATCCTCTCACTGCTGGAAGGCATCCAGACTTGCACAAATCCTGTCAGAGCTGTCATGATTCTGTATAGGGTCTATTACAAAGGGGAATCATTTACAGAAGCCCTTTCTAGGATGGCAGGGAAATCCCTTATTGTGATGGTATTAGTGGAATTTCTAGAATTGACAGGCCAAACCCAAGGGGGGTATATAGACCTCAGTGCCAACTTATTAACCTTTCTTTTGGAAAAACTGAAAAAGATGACCAATCTTGCTTTAGGGGAGGCCAGGAAAGCCTTACTCCCCATCCCATACCTGTACTGTGAAACCTGGCAGTCCGACGCCAGAATCAGAGCCCCAGACTCTTACGACCAGGTGGTGGTGGAATGCAAATGTGGGGCCTCGGCGAGGTATTCCTTTTGTCATGGAGTCTACGAGATGCTTGAAGAGAAAGGAACCAGGTGGTGTAAAAACTTCTTCTTATGGGGACCTAACTTTAAAAACCCGGACCCAAAAAGGATGACATTCTACGAATACGACCAAGCAAAAAAATGTCCTGTAACCATTGTGGGTGAGGACATAACTTTCGGCAAGTATGGCATATATGTCAAATTTGGCCATGGACCTGATGGGAAAAGGTTAATACGGGGCACAACCCATGCCACTATTAGCAGGGAGGAGCTATTAGAAATCCTGTCGGCCCCAAGCCAAGTCGCCATAGGCAAAGTCAAATTGACCGATTATTGCAACCAAAAAGGACTGATAGATAGGAAATTGGCAGTACTTGAGAATGATAAAATACACTTTTGGAGAGCACACCGAGGGTCTAAAATCACCGATCAATTAACCATTGAAAATTTAACGGACGACTTGGGATCGGAAATTAGAGACATTACGTGGGAACTGTACGCAGGGGGGACATGTACTGTGAGAGGGGTATCCCTTAGGTCGTGCGCACCAGGGCAAAGGAACAAGGCCACAGTCTTATGTGATTGCACTGACGTGCTTAGCCCCTGTTATCTAGTTAATGGTAGGAAACCATCTCCATTCAATGTGGTAGAAGGTTATGAATGTCACCATCGGAAGCCCCGGGCTACCTATGAAGACCTAGAGATGGAAGAAATATTAAGGAAACGAGTCCCTGTGTATGATCCCCTTTGTCTGTTTGACACCGACAGCAAGCTGCTGCTCCCAGACACGTACTACCTGGAAGAAGACCAAGAAGACTTTGAATATGCACTAAGGTGCTGGGGTCTTGGGGTCTATGTAGCTGGCGAACCCATGACCTCACCTCCAAATATAAGAATACACCACAGCTCTACACTGTTACTATTGACCCCCGGAGTGGACTCCGAATTAAATCTACAGTACATACACTGTTACTCCCACCAGGTAGAAGTTGACGTATACGTCAAGGGCCAACTTCTGGAGGAGGGAGACACTACCACGGAGGTCAGCGACCCCCGAGAAGATAGTGGAGGGGGGACAGAAGATGCAATATTGGATGAAGAGGATACATTGTCCACAACCGAGTCAATGCCTCCGCTAGAAGAAGAAGAGGGGAGTGAAGAGTTGATCACTTATGTGGTCATTAGGGGGCTACAAGAAGAGAGATACACCAGTCATCTTAAGTTGAATGATTGGATCAGTGAGAATGTCACGGAGCCGCACAAGGTTCAGATTATGCTTGACGGGACAGTGAGAGTGACAATAAAAGAGGGTAAAGTCAAGCACCTGTTTGGGGTCTTTAGGGTGGAGAACACCCTAGAAGCAATGTTTAAGGAGACTATAGCTGACCTTCCTGTAGCTACCCAACCGCCCCAAGGGCCCATTTATACAGCTAGAGAACTGGCTCAGGGGAACATTGCCCCAATCCAACCCGCAGTAAACTACTACGGGATGGTTGAGGGAAGAGGCGGCCCAATGACAGCATTTGAAGCTTTATCAGTGTTACGGTCGCAAAAAACCCTAGCCAGAGAAGTAAAAGTGAACACCCGTAGAGCACAGACCTTCTTGAATAAAGTTAAGAGGGCCACCGAGGTCAAAGCATCAGAATTGGCATTAAAGCATTTACCGGTGCTTGGCAAAGTAAATGGGAGGAAACTGATTAGGGAGGAGACCAATATTCCTAACCAAAGGCTAGCGTCAATAATGACCTCAGTAGGAATCAGATTAGAAAAATTGCCAGTTGTCAGGGCTAACACCTCTGGCTCCAAATTTAGACAGTCAATTTTAGAAAAAATGGACAAACATGAAAATGAGCAAGTCCCAGGGCTGCACGAAAAAATGTGGGCTGCATTCCTAGTGACTGCTAGACAAGATTTAAGAAACACATACGAGGAAGTAACCTACTCTGAGTTGGAGAACGGGATCAACCGGAAAGGAGCCCCGGGTTTCTTTGAAAAAGAGAGTTCAATAGGGGAGGTATTGGAGAGTAAGGACAGAATTGAAACTGTCATCCAAGAAATCAAAAATGGCAACCACTTGTACTATGAGACAGCCATGCCAAAAAACGAAAAAAGAGATGTGCTTGATGACTGGCTGTCAGAGGATTTCGTAACTTACAAGAAACCGCGAGTGATACAGTACCCCGAGGCTGTCACCCGGTTAGCCATCACTAAAATAATGTATAAGTGGGTGAAGCAAAAGCCCATAGTGATCCCTGGCTATGAAGGAAAAACTCCAATTTTTGAAATATTCGAAAAAGTCAGTGCAGACTGGGCCCAATTCAGAAACCCTGTCGCTGTCAGTTTCGATACCAAAGCCTGGGATACTCAAGTAACGAGAGAAGACCTCAGACTGGTAGCAAGGATACAGAAGTATTATTACAAAAAGAAGTACTGGAAGTTCATCGACAACTTAACTGCCATGATGGAGGAAGTACCTGTGATTACTGTGGAAGGGGACATGTTCCTCAGGGTCGGCCAGCGCGGGTCAGGACAACCCGACACCTCGGCAGGTAACTCTATACTGAATGTGCTGACAATGCTGGTGGCTTTCTCAGAGTCCACCAACCTGCCAATAACGGCTGCCTGGAAAGCTTGCCGGATCCATGTCTGTGGGGATGACGGTTTCCTAATTACTGAAGCAGAATTAGGCAGAAAATTCGCTGAAAAAGGCGTACCCTTGTTAGCTGCTTTTGGCAAACCTCAAAAGATCATAGAAGGAGCAAGTTTAAAGATAACCAGCAGTTTTGATGGAATAGAGTTTTGTAGCCACTCTCCTATTAAAGTCCAAACACCAAATGTGCAGTGGATGCCAGCAAGACCAACAGCCACAATCTTAGGGAAAATGAGCACTAGACTAGGCGAGGGGGCCACAAGATCAGGGGAAGAATATGAAAAACAGGTGGCATTTGCATACTTACTCATGTACCCTTGGAATCCATTAGTTAGAAGAATTAGTCTCTTACTATTATCAACTACTGATCCAATAGGAAAAGAGGAAACCCCATGTTCTGATGAAGGAGTGAAGTACGTGGGGGACCCCATAGCTGCATACAGGGACGTGTGGGGGCACAAATTGGAGGACGTCGGGCATGTCGACCAGCCGCAGTTATCCCGGATGAATTACAGCATGACTTACTTGGGGGTCTGGAAGCCGAAGACGAGCCAGCGGCTAGTCGAACAATGCTGCCGACTAGCTAAAGAAAACAACTGCGTGGCACGTGCTGATTCCCTCATTAAGAAGAAAGTGAAAGTTACTTATGATCCCGGGATAGGGGCAGCTCAGGTCATCCGTAGGTGGGAAGAATTAGAGTGGACCAGAAGGAAACCTGAACTCACCAGTGTAAATGCAGAAGACGACCTCTTTTTGATTCTGTGGAAGAGACTGTCAGAATACGTCTACCAGAAAATGAAGCTCATGCAGAAGATGTTCTCCCCCTACTAGACGGAGGGGCACACAATAAAAATTTTTGCTAGTATCTGGTGGGTGTAGAATCAGTGTAAATAAGATTTTAATTTAAAAAGGGGCAAGTGGCCATACAGGCTGGGGCAATCGCCGTTCCCCCCCTTACTAGGCGCCTCACCCCACAGTCG
| 58,226
|
MK347474.1
|
Atypical porcine pestivirus
|
Xie,Y., He,D.
|
South China Agricultural University, College of Veterinary Medicine
|
China
|
2019-05-25
|
GD-LDCT1
|
Pestivirus scrofae
|
Pestivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 11,089
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Sus scrofa
| null |
2018
| null | null |
Atypical porcine pestivirus isolate GD-LDCT1, complete genome
|
GGCGGATGCCTCGGGTAAGAGTATAAAATCCGTTGTTCATTAACATGAAAGAACAAATTACATATTACTTAAAAAAAGAAAAGCAAAGGAATGGGTGGACAGAACTAGTAGTAGGGGAAAGCCATACGAAGATAACCACACTCTCCGGGAGGACCTATCGAGGTACTTGGGAGATGGAGAAACGGTCCAACCCTTACGGAATCTACTTCCCTAGGCCAAGTCCTCAACAGCTTACGGCCTTGCACCCACACCCAGTCGTGAACTGTAGGATGATAGAGTACAAAGAAGCTGACCCTAACTATGGCGACTGCCCAAACACAAATGGAGTATTCATAGATGAAAAAGGCAGGAAATTTAGCGGACCCCCGTTGGGTCTCTGGAAGATAAGACTGGACTACTATGACTTGGTGAATGTTAAAAGGCCAACTTTCACAAGTGAACAGATCTCTTACCAAGTCGAAACCTGTAGTGGGGAGCTGGCCACCGTAACACCTACACACGGCAGGGTGTTCGTGGATGACTACAGGAGATTTTATCAATGGAAACCTAGGTGTGAAGGGATGGTGCTCTACGTGAAAACCTGCTCCGACTGGGCAGATCAAGTAGACAAACAAGAGAAAGAAAGCCCCCCGAAACCACAGAGACCACCGAGACGAGACCCACGGAAAGGGTTGCAGCCGCAAGTCCCCAAAGAAACCGAAATCACAGAGAAAAAGAGACAACCTAGCGTAACTTTAGTGGCTGGGGGGCAGAAGGCTCAGATCATTTATAAAGGCAAGACCAAAAATAAAAAGACCCCGGACGGGGTCTATAAGTACCCAGGAGCTAAAGAAGGGGATGTAGTGAAGGTGAGGAAGATGTTAAAAAATTGGCACCTAGCTCTGGTAATGTGTCTGATATATCTTATAAATCCAAGCCTTGCAAAGGTTCAATGGTTTTTGAAGGATGAAAACTCGACAGGAATTAATCAGATATTGTGGCAAAGACGGGTCAACAGGTCCTTGCATGGAGAATGGCCAAACCAAATCTGTCATGGCATGCCAAATGAAACCATCACAGATGAGGAGTTACATAGCCTAGGGATGATAGACACCAGCCCAAGAACAAACTATACCTGCTGCCAACTACAATACCATGAATGGAAGAAACATGGCTGGTGTAATTATCCGCAAAAACAAGCATGGATCAGAAGAATAACAGCTTTACAATCCAACCTTACTGGGGCCTATGAAGGACCAGAATGTGCTGTCATATGTCGGTTTAACGGCAGTCACAACATCGTAAGGCAAGCCAGGGATGAGGTTAGCCCACTTACAGGATGCAAGGAGGGGCACCCTTTTCTATTCTCCGGTGAAAGATCTGAGGCTTCGTGCTTAAGACCGCCTTCCACTAGTTGGGTGAGACCAGTGAAAATGGACGAGGCTTCAGTGGCGGACAGTTTTGCCCATGGGGTAGATAAAGCAATAATATTAATTAGAAAAGGGGCTTCGGGAATCATAAATTTCTTAGACACTATTGGGAGGTGGCTGCCAGTAACCGATGCCACTATCATACCATACTGTGAAACTTACACCGTAACGGGGATGTATGTTCATGTCAAGCATTGCCTTCCTAGGGGGCTACCCAAGCACTCGAAAATAATCTCCCCAACGTTGATATACCTAGGAGAAGGCGATCCAGCCCATAATATCCAACATTTATTCGGCTCAGGCATAGCAAAATGGGTTCTAGTGCTGCTCGGGGTTTTGGGTGAATGGTATGGGGAACTAGCCTCAACAATATATTTAATACTCGAGTATGGCACTGAGTGGCTAGAACATGAAAACCTGGTCACAGAAGGGCTAATACCTGGCATCAATATCACGGTGGAGCTTCCTGCCAGCCATACGGTACCCGGCTGGGTATGGGTCGCGGGCCAGTGGGTATGCGTGAAACCAGATTGGTGGCCTACGCACATCTGGATCGAAACCGTGGTGGCAGAAGCTTGGCATGTGTTAAAGATACTAGCCTCGGCCTTGGTCAATATAGTTACTGCATTTGTGAACTTGGAATTGATTTACCTGGTCATAATATTGGTCAAAGTATCAAAGGGTAACTTGATCGGAGCTATCCTGTGGTGCCTATTACTGTCAGGGGCCGAAGGATCATGCCATAAGCGACAGGACTATTATAATGTTCAATTAGTCGTTGACGAAAAAACGGGCATAGAAAAACGGTCAATAATGGGCAAATGGACCGTAGTGACCAAAGAAGGTCGAGAGCCAAGATTAATGGAACAGATAAAAATGGTATCAAATAGCAGTCTAACAGAAACTTACTGCTACAATGAACTAAACACCAGCAGCTGGGGGCGATACCCAATGAAACAGAGGGGGTGTGGGCAAACTGTACCCTATTGGCCTGGTGACAATGTTCTCGAAGAACAATACTTCAGCACGGGTTACTGGGTGAATGCCACAGGAGGTTGCCAGTTGAGGGAAGGTGTGTGGCTATCAAGAAAGGGCGGTGTCCAGTGCCAACGTAACGGCTCATCTTTGATCCTGCAGTTGGCAATCAAGGAGGAAAATGACACCATGGAGATACCGTGTGACCCGGTAGAAACCGAAAGCATGGGCCCGGTGGCACAGGGCACTTGCGTGTATAGTTGGGCAGTAGCTCCAAGAGGATGGTACTACAACAGGAAGGATGGCTATTGGCTCCAATATATAAAGAAAAATGGCTACCAATACTGGACAAAAATGCCCGCGGCTTCGTCCGCTGCAACAATGTACCGGCATTTACTACCTTTGTTGGTGGCTTGCCTTATGGGCGGTAGGATTTCAGTATGGATTGTAGCAATGCTTCTATCCCTACAGGTGGAGGCCAGCGAGGTAGGAACCAAACAGTTGGCCGTCACCCTAACTCTATGGAAGATGGATTGGACAGAGTTGCTCTTTTACATTATTATAATCTTGTCCATAAAGGAAGACCTCATAAAGAAGATAGTGACAGCAAGTCTAGTGGCTCTCAAAAATAGCCCAGTAGCCTTAAGCTTCCTAATTGTACTTAGGCTAGTCGGAGGTAGTGAAGCACTCCCAGTAGGGCTACTACTAGAAAAAATGTGTATAGACCAGCCAGAGTTTGGAACCCCTTTTCTAATTTACTTGTGGGACAATTGGAAGTGGACTGTCTTAGTCAGCTTCTCCGCATTAAACCACGAAAAGACCATTAGATTAGCAAGGAAACTTTTATTAGCTACACATATAACTGCACTGACATTGACCGGCCTAAGTGATTCAATTTTTTACGTAATGCTCATAATAACCAATTTACTGATAAAGACATTCATATATCTACTGGGGGCCGGCATTAACTGGGTGGAGAAAGAAAAAAGGAGGCTGCTAGTGAAAAGGAAGCTGATATACAAACAAGCCGTAGTTTGCCATCAAGATGAGAATGAACTAGTGAGCAAATTTAACAAAATAACAATAAACACGGACTTCACCCCATGTAGGCTTGAACTGCTGCAACTGCTCAGAGCTTTCTTGGTTTCCCTATGTTTCTCTTACTACAAACCCCTCCTATATGCGGAGACCACCTTAACCGTCATAGTGATTGGCGTACAAGAGTACAATCTGGCCATGGCCCGTGGGCGAAGTGCAGTCCACAGGCTATTAGCTATGGCTTACTACATATATGGTCGTCTGCAGGGGGACATGTTTCAGCTCGCTACGATCCAGTGTCTGATGTCGAGTCCAAGAAAGATAATGAAACACATGATAGAAAACCCAATCCTTAAGAAGCTCTGGCAAGGAGAAACAGAGCTTTTCAACCAGGGTGTCAACCAGTCTAAAATAGTAAACCCAAAAAAGATAGGGTTGGTAGAATTGCAAAAAGGTATGTGTGGCTTGCCGACTGCAGTACAAAACTTGGTCATATATGCAAAGAAGAATGACTCCCTCATTCTAGGAGAGGTGGGTTATCCGCCTGGAGACCTCACCATTGACGGGTGGGAAATACTAGGCCCTGGCAGGATCCCAAAAATCACTAACGTAGAGTCCGCTAAGATGGACCTACTATCTAAACTAATGACATTCCTGGGGATTGAAAGTTCGAGGGTCCCTAGAACCCCAGTCCACTCCACTAGGAAACTACTGAAGATAGTAAGAGGCATGGAAACTGGGTGGGGGTACACCCATGCCGGAGGAATTAGTAGTGCGAGGCATGTCACCGGTGAGAAGAACCTAATGACACACATGGAGGGCAGGAAGGGCAAGTATATCCTGCAGTCTCAAGAACATGGTGCTGATGAGGTGGAATATGGGGTGAAGACTGACCAGAAAGCACCCGACAATGCATTGTGCTATTGTTTTAATCCTGAAGCTACAAATATAAAGGGAGAGACAGGGGCCATGGTATTCATGAAGAAAATAGGAAAAAAGTGGACTCTCGTAACCTCAGATGGCAACAAAGCTTACTACAATGTAAGCAACTTAAAAGGGTGGTCTGGACTACCGATAATGCTGCACTCTACTGGAGCAATCGTAGGGAGGATCAAGTCGGCGTATTCAGATGAAAATGATCTGGTGGAAGAGCTGATTGACTCCAGGACCATCAGTAAAAGTAATGAGACAAGTCTAGATCATCTTATTAAGGAGTTGGCAAGCATGCGGAGAGGGGAGTTCCGCTCAATCACCCTTGGGACGGGCGCCGGAAAAACTACAGAACTACCCAGACAATACCTCACAACAGTGGGGACACATAAGTCCGTGCTGGTCTTAGTCCCTTTGAAAGCGCCTGCTGAAAGTGTATGTCGCTTTATGAGGTCTAAATACCCCACTATCAATTTTTCCTTAAGGGTAGGGGAGCGAAAGGAAGGGGATGTGAGTAGCGGCGTCACCTATGCTACTTATGGATTCTGCTGCCAGCTCAACCTAGTGCAACTCAAGGAATGGATATCCAGGTATTCAATGGTGTTCTTCGATGAATACCATACGGCAACTCCAGAACAAATAGCCATAATAAGCAAAATCCATGCATTGAAAGTAAAGACCAGGATTGTGGCTATGTCAGCCACCCCCCCGGGCACTGTGACAACAGAAGGTAGAAAATTTGACATAGAAGAAGTGGGGGTAGCCACAATAGAAAAAGGGGAAGAGCCAAAAAGAGGGCGTATAGCAGTGGCCGGCATGCAGGTTCCGTTAGAAGACTTAACAGGGAAAAATTGCCTGGTGTTCGTGGCAACTAAAGAGGCTGCAGAGACGGAAGCTAAAGAACTACGTGCCAGGGGCATCAACGCCACCTACTATTACTCTGGCATAGATCCCAAAACCCTGGAGCACGGTATGACAAACCAACCGTACTGTATTGTGGCCACCAACGCTATTGAATCAGGTATAACCTGCCCCGACTTGGACGTGGTCATAGACACCATGCAGAAGTATGAAAAAGTAGTGAATTTTTCAGCAAAGATGCCCTTAATTGTCACTTCGCTGGTGAGGAAGAAAATCACTAGAGAGGAGCAAGGCCAGAGGAAAGGCCGAGTAGGCAGGCAAAAGAAGGGTAAATACTATTATCCATCGGGCGTAGTGCCGAATGGGTCAAAAGACTTGAGTTATTTGATCTTGCAGGCCCAAGAATATGGTGTCTTGGAGCAGGTCAATATAACAGAATATTTCATCATAATGAATGAGGACTGGGGGCTTTATGACGTAGATGAGGTGGAAGTGAGAATATTGGAGAGAATGAATAAAGAAATCTTACTCCCGCTAGGTATTGTGGAGAAGCAAATCCTGGAAAGAAGCACCCACCCGGAAAAAGTGGCATTATTGTACAACAAGCTAGTACAGAAAAACCCTATAGTTTACCCAAGGGTTCAGGACGGTGAGATTGGCAAAGAATACAATACCCACAACCTAGCCGTGTATGACAAACTTAAGGACGTTAATCCACAGGCAATATATGTCTTAGCAGAGGAAGAAAGGGCTACAGAAATGATGGGCCTTGAATTTGAGCAGGAGCCTTCTGACCTGCCGGATTCAGTAGGCCAACTTTGTGAAGACATAAAGAGGTACACAAAACTTTCTGGAATTACTGAAAAATTGCTAGTTGGTACGATGGTGGGGTATATTGGATACAAGGCCCTAACCAGAAATCATGTGCCCTGGGTTAGTAAAGAGTATTCTTATGAGTTGACGGATTCACCAGACACTTATGAAAATTCATTTGCACCTTTGGACATAGATGTCCAGACTCCCAGTGATAGCAAACACCCGGAACAACTGGCGGACCACCAGTTAAGACGACTGTTGGAGAATGGGAAGGACAAGGCAATCGACCTCTTAAAAGAAATCCGCCAGTTCACCAGTGGAGTCATAAACAGCCCAAAAGCATTAAGCATATGGGAGAAAATTTACCAATACTTGAATAAGCACCAGGGGGAGATCATTTCATCAGCGGCATGGGGTAGTGCAACAGCCCTTCATGACAGCATCAAATCTAGGCTGGGGGATGAGGTCGCCACAGCAGTGATAATCCTCAAGTATTTAGCATTTGGAGAAAGAGAGTTGTCTGGGCTTACTAGACAGGTCTTAATTGACATTATAGTATATTATATAGTCAACAAGCCCCGGTTTGAGGGGGATGACTATGCAAAAAGAAAAGGGAGAAGACTAGTCATTGAGGTGTTGATGGGGGCACTAGCAACCTATGCTGTATCCAATTTTTGGGGCGTATCTATCAATAAAGTGTTGCAACCAATATCTGACTACTTGCCCTACGCCACTGCCACTCTGGCTTTCCTACGCCCAACTTTTATGGAATCAGCAGTGGTGGTGGCGTCTTCTATCTACAGGGCCTTCCTTTCCATCAAACATGCAGAGAACAGGAGTCTTGTTACGCAGGTCGCCTCGGCTGCCCTTGAAGTCATGGGCTTAACACCAGTATCGGCTGGCTTAGGCGTCCTGCTGGGGCTTGGACTATGTGTGCTTCACATGAACATAGATAAGAACGAAGAAAAGAGGACACTAATACTGAAGATGTTCGTCAAAAACTTCATAGACCAGGCGGCGTTAGACGAGCTAGACAAACTGGAGCCGGAAAAAATAATCCTCTCACTGCTGGAAGGCATCCAGACTTGCACAAATCCTGTCAGAGCTGTCATGATTCTGTATAGGGTCTATTACAAAGGGGAATCATTTACAGAAGCCCTTTCTAGGATGGCAGGGAAATCCCTTATTGTGATGGTTTTAGTGGAATTTCTAGAATTGACAGGCCAAACCCAAGGGGGGTACATAGACCTCAGTGCCAACTTATTGACCTTTCTTTTGGAAAAACTGAAAAAGATGACCAATCTTGCTTTAGGGGAGGCCAGGAAAGCCTTACTCCCCATCCCATACCTGTACTGTGAAACCTGGCAGTCCGACGCCAGAATCAGAGCCCCAGACTCTTACGACCAGGTGGTGGTGGAATGCAAATGCGGGGCCTCGGCGAGGTATTCCTTTTGTCATGGAGTCTACGAGATGCTTGAAGAGAAAGGGACCAGGTGGTGTAAAAACTTCTTCTTATGGGGACCTAACTTTAAAAACCCGGACCCAAAAAGGATGACATTCTACGAATACGACCAAGCAAAAAAATGTCCTGTAACCATTGCGGGTGAGGACATAACTTTTGGCAAGTATGGCATATATGTCAAATTTGGCCATGGACCTGATGGGAAAAGGTTAATACGGGGCACAACCCATGCCACTATTAGCAGGGAGGAGCTATTAGAAATCCTGTCGGCCCCAAGCCAAGTCGCCATAGGCAAAGTCAAATTGACCGATTATTGCAACCAAAAAGGACTAATAGATAGGAAATTGGCAGTACTTGAGAATGATAAAATACACTTTTGGAGAGCACACCGAGGGTCTAAAATCACCGATCAATTAACCATTGAAAATTTAACGGACGACTTGGGATCGGAAATTAGAGACATTACGTGGGAACTGTACGCAGGGGGGACATGTACTGTGAGAGGGGTATCCCTTAGGTCGTGCGCACCAGGGCAAAGGAACAAGGCCACAGTCTTATGTGATTGCACTGATGTGCTTAGCCCCTGTTATCTAGTCAATGGTAGGAAACCATCCCCATTCAACGTGGTAGAAGGTTATGAATGTCACCATCGGAAGCCCCGGGCAACCTATGAAGACCTAGAGATGGAAGAAATATTAAGGAAACGAGTCCCTGTGTATGATCCCCTTTGCCTGTTTGACACCGACAGCAAGCTGCTGCCCCCAGACACGTACTACCTGGAAGAAGACCAAGAAGACTTCGAATATGCACTAAGGTGCTGGGGTCTTGGGGTCTATGTAGCTGGCGAACCCATGACCTCACCTCCAAACATAAGGATACACCACAGCTCTACACTGTTACTATTGACCCCCGGAGTGGACTCCGAATTCAATCTACAGTACATACACTGTTACTCCCACCAGGTAGAAGTTGACGTATACGTTAAGGGCCAACTTCTGGAGGAGGGAGACACTACCACGGAGGACAGCGACCTCCGAGAAGATAGCGGAGGGGGGACAGAACATGCAATATTGGATGAAGAGGATACATTGTCCACAACCGAGTCAATGCCTCCGCTAGAAGAAGAAGAGGGGAGTGAAGAGTTGATCACTTATGTGGTCATTAGGGGGCTACAAGAAGAGAGATACACCAGTCATCTTAAGTTGAATGATTGGATCAGTGAGAATGTCACAGAGCCGCACAAGGTTCAGATTATGCTTGACGGGACAGTGAGAGTGACAATAAAAGAAGGTAAAGTCAAGCACCTGTTTGGGGTCTTTAGGGTGGAGAACACCCTAGAAGCAATGTTTAAGGAGACTATAGCTGACCTTCCTGTAGCCACCCAACCGCCCCAAGGGCCCATTTATACAGCTAGAGAACTGGCTCAGGGGAACATTGCCCCAATCCAACCCGCAGTAAACTACTACGGGATGGTTGAGGGAAGGGGCGGCCCAATGACAGCATTTGAAGCTCTATCAGTGTTACGGTCGCAAAAAACTCTAGCCAGAGAAGTAAAAGTGAACACCCGTAGAGCACAGACCTTCTTGAATAAAGTTAAGAGGGCCACCGAGGTCAAAGCATCAGAATTGGCATTAAAGCATTTACCGGTGCTTGGCAAAGTAAATGGGAGGAAATTGATTAGGGAGGAGACCAATATTCCTAACCAAAGGCTAGCGTCAATAATGACATCAGTAGGAATCAGATTAGAAAAATTGCCAGTTGTCAGGGCCAACACCTCTGGCTCCAAATTTAGACAGTCAATTTTAGAAAAAATGGACAAACATGAAAATGAGCAAGTCCCAGGGCTGCACGAAAAAATGTGGGCTGCATTCCTAGTGACTGCTAGACAAGATTTAAGAAACACATACGAGGAAGTAACCTACTCTGAGTTGGAGAACGGGATCAACCGGAAAGGAGCCCCGGGTTTCTTTGAAAAAGAGAGTTCAATAGGGGAGGTGTTGGAGAGTAAGGACAAAATTGAAACTGTCATCCAAGAAATCAAAAATGGCAACCACTTGTACTATGAGACAGCCATGCCAAAAAACGAAAAAAGAGATGTGCTTGATGACTGGCTGTCTGAGGATTTCGTAACTTACAAGAAACCGCGAGTGATACAGTACCCCGAGGCTGTCACCCGGTTAGCCATCACTAAAATAATGTATAAGTGGGTGAAGCAAAAGCCCATAGTGATCCCTGGCTATGAAGGAAAAACTCCAATTTTTGAAATATTCGAAAAAGTCAGCGCGGACTGGGCCCAATTCAGGAACCCTGTCGCTGTCAGTTTCGATACCAAAGCCTGGGATACTCAAGTAACGAGAGAAGACCTCAGACTGGTAGCAAGGATACAGAAGTATTATTACAAAAAGAAGTACTGGAAGTTCATCGACAACTTAACTGCCATGATGGAGGAAGTACCTGTGATCACTGTGGAAGGGGACATGTTCCTCAGGGTCGGCCAGCGCGGGTCAGGACAACCCGACACCTCGGCAGGTAACTCTATACTGAATGTGCTGACAATGCTGGTGGCTTTCTCAGAGTCCACCAACCTGCCAATAACGGCTGCCTGGAAAGCTTGCCGGATCCATGTCTGTGGGGATGACGGTTTCCTAATTACGGAAGCAGAATTAGGCAAAAAATTCGCTGAAAAAGGCGTACCCTTGTTAGCTGCTTTTGGCAAACCTCAAAAGATCATAGAAGGAGCAAGTTTAAAGATAACCAGCAGTTTTGATGGAATAGAGTTTTGTAGCCACTCTCCTATTAAAGTCCAAACACCAAATGTGCAGTGGATGCCAGCACGACCAACAGCCACAATCTTAGGGAAAATGAGCACTAGACTAGGCGAGGGCGCCACAAGATCAGGGGAAGAATATGAAAAACAGGTGGCATTTGCATACTTACTCATGTACCCTTGGAATCCATTAGTTAGAAGAATCAGTCTCTTACTATTATCAACTACTGACCCAATAGGAAAAGAGGAAACCCCATGTTCTGATGAAGGAGTGAAGTATGTGGGGGACCCCATAGCTGCATACAGGGACGTGTGGGGGCACAAACTGGAGGACGTCGGGCATGTCGACCAGCCGCAGTTATCCCGGATGAATTACAGCATGACTTACTTGGGGGTCTGGAAGCCGAAGACGAGCCAGCGGCTAGTCGAACAATGCTGCCGGCTAGCTAAAGAAAACAACTGCGTGGCACGTGCTGATTCCCTCATTAAGAAGAAAGTGAAAGTTACCTATGATCCCGGGATAGGGGCAGCTCAGGTCATCCGTAGGTGGGAAGAATTAGAGTGGACCAGAAGGAAACCTGAACTCACCAGTGTAAACGCAGAAGACGACCTCCTTTTGATCCTGTGGAAGAGACTGTCAGAATACGTCTACCAGAAAATGAAGCTCATGCAGAAGATGTTCTCCCCCTACTAGACGGAGGGGCACACAATTTTAATTTTTGCCAGTATCTGGTGGGTGTAGGATTTGTGTAAATAAGATTTTTATTTGAAAGGGGCAGGTGGCCGTACAGGCTGGGGCGATCGCCGTATCCCCCCTTTGCTAGGCGCCTT
| 62,667
|
MK347475.1
|
Atypical porcine pestivirus
|
Xie,Y., He,D.
|
South China Agricultural University, College of Veterinary Medicine
|
China
|
2019-05-25
|
GD-YJHSEY2N
|
Pestivirus scrofae
|
Pestivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 11,043
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Sus scrofa
| null |
2017
| null | null |
Atypical porcine pestivirus isolate GD-YJHSEY2N, complete genome
|
GGCGGATGCCTCGGGTAAGAGTATAAAATCCGTTGTTTTTAACATGAAGAAGCAGATTACATATTACTTAAAAAAAGAAAAACAAAGAAACGGGTGGACGGAACTGGTGGTGGGAGAAAGTCACATGAAAATAACCACACTCTCTGGGAGGACCTACCGAGGTACTTGGGAAATGGAGAAGTGGTCAAATCCTTATGGAACCTACTTACCCAGGCCTAGCCCCCAACAACTTACAGCCTTACACCCACACCCGGTGGTGAACTGCAAGATGATAGAGTACAAGGGGGTGGATCCTGATTATGGTGATTGTCCAAACACAAATGGGGTGTTTATTGACGAAAAAGGTAGAAGGTTTAGTAGTCCTCCATTGGGTATTTGGAAGATAAGACTGGACTACAATGAACTGGTAAATGCAAGTAGACCAGTCTTTACCAGCGGAAGAAATTTATACCAGGTTGAAACCTGCAGTGGGGAATTGGCCACCATAATACTGGAGCACGACAGGGTTCTCGTGGACGACTGTAGGGGGTTTTATCAATGGAAACCCAACTGTGAAGGAATGGTGCTTTATGTGAAGACCTGTTCTGATTGGGCAGATCAAGTGGAAAAACAAGAGAAGGAAAAACCTCCGAAACCTCAGCGACCACCAAGACGAGACCCACGAAAAGGGTTGCAGCCACAAGTCCCCAAAGAAACTGAAATCACGGAGAAAAAGAAACAACCGAGCGTCACCTTAGTATCGGGGGGGCAAAAAGCTCAGGTCATCTATAAGGGTAAGACCAAGAATAAAAAGACCCCGGATGGGGTTTATAAGTACCCGGGGGCTAAGGAAGGGGATGTAGTGAAAGTCAAGAAAATGCTGAAGAACTGGCACATAGCCCTGGTGATGTGCCTAATATTTTTCGCAAACCCAAGTTTAGCCAAGGTCCAGTGGTTCCTAAAGGATGAGAATTCAACAGGAATAAATCAAGTACTGTGGCAAAGACAGGTAAACAGGTCCCTACATGGAGAATGGCCTAACCAGATCTGTCGTGGAATGCCAAACGAAACCATTACGGACGAGGAGCTACGCAGTCTTGGGATGATAGATACAAGCCCTAGAACAAACTATACTTGCTGCCAATTGCAATACCATGAATGGAAGAAACACGGGTGGTGTAATTATCCACAAAAACAAGTTTGGATTAAGAGAATAGCAGCCTTACAATCCAACCTAACCGGAGCTTATGAGGGACCTGAATGTGCAGTCATCTGCCGATTTAATGGTAGTTATAACATAGTGAGACAGGCCAGAGACGAAGTAAGCCCGTTGACAGGGTGTAAAGAAGGATATCCCTTCCTGTTTTCTGGAGAAAGATCCGACACCTCATGTCTAAAGCCTCCATCCACTAGTTGGGTCAGACCAGTAAAAATGGATGAGGCATCAGTGGCAGATAGCTTCGCCCATGGAGTAGACAAGGCGATAATATTAATTAGAAAAGGGGCGTCAGGAATCATCAACTTTTTAGACACCATTGGGAGGTGGCTGCCAGTGGCTGAAGCCGCCATAGTACCATATTGTGAAACTTACACTGTAACAGGGATGTACGTTCATGTGAAGCATTGCCTCCCTAAGGGGCTACCAAAGCATTCAAAAATAATTTCCCCAACAATGATATACCTGGGGGAAGGTGACCCAGCCCATAATATCCAGCATTTGTTTGGCTCAGGCATAGCAAAGTGGGTCCTAGTCTTACTTGGTGTCTTGGGTGAGTGGTATGGGGAGTTGGCCTCCACGATATATCTGCTACTGGAGTACGGGACTGAATGGTTGGAACATGAAAGTCTAGTCACGGAAGGGTTGATCCCTGGCATCAATATCACAGTAGAGCTCCCCGCTAGTCACACGGTACCAGGTTGGGTGTGGGTCGCTGGCCAGTGGGTATGCGTGAAACCAGATTGGTGGCCTACACAGATTTGGATTGAAACCATAGTGACAGAGGTATGGCATATACTGAAAATATTGGCATCAGCTTTGGTAAATATAGTCACTGCATTCGTAAACCTAGAGTTAGTCTATCTGGTCATAATACTAGTCAAAATATCAAAGGGGAACTTGATAGGTGCTGTATTGTGGTGCCTCTTGCTGTCAGGAGCTGAGGGGTCATGCCACAGAAGACAAGACTATTACAACATCCAACTGGTTGTCGAGGAAAAAACAGGAATAGAGAAGCGATCCATAATTGGCAAGTGGACTGTGATAACTAGGGAAGGTAGAGAACCAAGATTAATGGAGCAGATAAATATGGTGTCGAATGAGACCCTATCAGAAACTTACTGCTACAATAGGCTGAATACCAGTAGCTGGGGACGGCAGCCGATAAGACAGAGGGGGTGCGGGCAAACTGTACCCTATTGGCCTGGTGACAACGTCCTTGAAGAGCAATACTACAGCACAGGTTACTGGGTGAATGCAACAGGTGGTTGCCAGTTAAGGGAAGGTGTATGGCTATCAAGAAAAGGCAACGTGCAGTGTCAGCGTAATGGTACTTCCTTGATGCTGCAACTAGTGATAAAAGAAGAGAACGACACCATGGAAATACCATGTGATCCAGTGGAAACTGAAAGCATGGGCCCAGTAGCACAGGGCACCTGTGTGTACAGCTGGGCAGTTGCCCCAAGAGGGTGGTACTACAACAAGAAAGACGGTTACTGGCTCCAGTACATAAAGAAAAATGACTATCAGTACTGGACCAAGATGCCCACCACTTCGTCTGCTGCCACAATGTATCGTCATCTGCTCCCCCTATTGGTGGCCTGCCTTATGGGCGGTAGAATATCAGTGTGGATTGTGGCAATGCTTCTGTCTCTACAAGTGGAAGCTAGTGAAGTTGGCACCAAGCAATTAGCCGTTACCCTAACTCTATGGAAGATGGATTGGACAGAACTGCTCTTTTACATCGTCATAATGCTAGTTGTCAAGGAAGACCTTATAAAGAAAATGGTGACTGCAAGTCTCGTGGCCTTGAAAAACAGCCCGGTTGCCTTGAGCTTTCTTATTGTACTCAGGCTGGTGGGGGGTAGCGAGGCGCTCCCGGTGGGTCTATTATTAGAAAAGATGTGCATAGACCAACCAGAGTTTGGAACCCCTTTCTTGATCTATCTATGGGACAACTGGAAGTGGACTGTCTTAGTTAGCTTCTCTGCATTAAACCACGAAAAGACCATAAAATTAGCAAGAAAATTACTGTTAGCCACGCACATAACAGCACTGACATTAACTGGCTTAAGTGACTCAATATTCTACGTGGTGCTCATAATGACCAACCTTCTAATAAAGACATTTATATATCTATTGGGAGCCAGTATCAGCTGGGTCGAAAAAGAGAAAAAGAAGCTGCTAGTAAAGAGGAGATTAATATATAAACATGCTGCAATCTGTCATCAAGACGAGAACGAACTAGCCAGCAAGTTCAACAGGATAACTGTGAATGCAGATTTCACCCCATGCAGACTCGAATTGCTACAATTGCTCAGAGCTTTCCTTGTCTCCCTATGTTTTTCCTATTACAAACCCCTCTTGTACGCAGAGACCACCTTAACTGTGATAGTGATTGGAGTGCAGGAGTACAACGTAGCAATGGCCCGCGGGCGTAGCATGATTCACAGATTGTTAGCTACGGCCTATTACATATATGGCCGTATACAGGGGGACATGTTCCAGCTCGCTACAGCCCAATGTCTGCTATCCAGTCCAAGGAAAATCATGAAACACATGATAGAAAATCCGATCCTCAAGAAGCTCTGGCAAGGAGAAACGGAACTTTTCAACCAGGGGGTCAGTCAGTCCAGAATAGTCAACCCAAAGAAAATAGGGTTGGAGGAATTGCACAAAGGCATGTGTGGCCTGCCAACCGTAGTACAAAATTTAGTCATATACGCAAAGAAGAATGACTCCCTTATCTTAGGAGAAGTAGGCTACCCCCCTGGGGACCTCACTAGTGATGGGTGGGAAATTCTAGGCCCTGGCAGAATTCCGAAGATTACCAACGTTGAGTCTGCCAAGATGGACCTGCTCTCTAAACTTATGACCTTCCTGGGGATCGAAACCTCCAGGGTCCCCAGAACCCCAGTCCACTCGACAAGGAAACTATTGAAGATAGTAAGAGGCATGGAAACTGGGTGGGGGTATACTCACGCAGGGGGGGTTAGCAGTGCCAAACATGTCACAGGTGAGAAGAACTTGATGACTCATATGGAGGGCAGAAAGGGTAAATATATCCTACAATCTCAAGAACATGGTGCCGATGAGGTGGAATACGGGGTGAAGACTGATCAAAAGGCACCCGACAATGCTTTGTGTTACTGCTTTAACCCTGAAGCCACAAATATAAAAGGAGAAACAGGTGCCATGGTGTTCATGAAGAAAATAGGAAAAAAATGGACCCTTGTAACATCAGATGGCAATAAAGCTTATTATAATGTAAATAACCTTAAGGGGTGGTCCGGATTACCAATAATGCTGCACTCTACCGGAGCTATAGTAGGGAGGATTAAGTCAGCTTATTCAGACGAAAATGACCTAGTGGAGGAACTTATTGACTCTAGGACCATCAATAAGAGCAAAGAGACTAACCTGGACCACCTTATCAAGGAATTGGCTGATATGCGGAGGGGGGAGTTCCGCTCAATCACTCTAGGAACGGGTGCCGGAAAAACGACAGAACTGCCCAGACAATACCTCACCACAGTAGGTGCCCATAAGTCGGTATTGGTTCTGGTTCCTTTGAAAGCACCTGCTGAAAGCGTGTGCCGCTTTATGAGATCCAAATATCCCACTATCAACTTTTCCCTGAGAGTCGGAGAACGGAAAGAGGGGGACGTGAGCAGTGGCATCACCTATGCCACTTACGGTTTCTGCTGCCAGCTCAACCTAACCCAACTCAAGGAATGGGTGTCTAGGTACTCGATGGTGTTCTTCGATGAGTACCACACAGCGACCCCAGAACAAATAGCCATAATAAGCAAGATCCACGCACTGAAAGTTAAGACTAGGATAGTGGCCATGTCCGCAACCCCTCCAGGCACTGTAACAACCGAAGGAAGAAGATTTGACATTGAAGAAGTAGGGGTTGCCACAATAGAGAAAGGAGAAGAACCAAAAAGGGGGCGCATCGCAGTGGCTGGCATGCAGGTCCCGTTGGAAGACCTGACGGGGAAGAATTGCCTGGTGTTTGTGGCAACTAAGGAATCTGCAGAGATGGAGGCCAAAGAATTGCGTGCCAAAGGGATAAATGCCACCTACTACTATTCAGGCATAGACCCAAAAACCCTGGAACATGGGATGACTAACCAGCCATACTGCATTGTGGCCACCAATGCCATCGAATCAGGCATAACCTGCCCGGATCTTGACGTGGTCATAGACACTATGCAGAAGTACGAGAAAGTAGTGAATTTCTCAGCAAAGATGCCTTTAATTGTCACCTCACTGGTAAGGAAGAAAATCACCAGGGAAGAACAAGGCCAGAGGAAAGGTCGGGTTGGGAGGCAAAAGAAGGGTAAGTACTATTACCCATCGGGGGTGGTACCAAATGGATCGAAAGATCTCAGTTACTTAATCTTGCAGGCCCAGGAGTATGGTGTCTTGGAACAAGTTAACATAACAGAGTACTTCATCACAATGAATGAGGACTGGGGTCTCTATGACGTAGATGAAGTTGAAGTGAGAATACTGGAGAGGATGAATAAGGAGATCTTGCTTCCGCTGGGCATCGTCGAGAAGCAAATCCTAGAAAGGAGCACTCACCCAGAGAAGGTGGCACTGCTGTATAACAAACTGGTACAGAAAAGCCCTATAGTCTACCCTAGAGTACAGGATGGTGAGGTCAGCAAGGAATACAATACCCACAATTTAGCTGTATATGACAAACTAAAGGATGTAAATCCACAAGCCATCTATGTCCTGGCTGAAGAGGAAAGGGCCACAGAGATGATGGGCCTAGAATTTGAGCAGGACCCATCTGATTTACAGGACTCAGTAGTCCAGCTCTGTGAAGACATAAAAAGGTATACAAAACTCTCTGGGATCACTGAGAAGCTACTGGTGGGTACAATGGTCGGATATATAGGATACAAAGCTTTAACTAGAAACCATGTCCCCTGGGTCAGCAAAGAATACTCTTATGAGTTGACTGACTCCCCAGACACATACGAGAACTCATTCGCACCTCTGGATGTGGACGTCCAAAACCCTGGGGAAAACAAGCGTCCAGAGCAGCTGGCAGACCATCAACTACGGCAATTATTAGAGATTGGGAAAGATAAGACAATCGGCTTCTTAAAAGGAATTCATGAGTTCACTAGCGGGGCTATAAATAGTCCAAAAGCCCTGAGTATATGGGAGAAAATATACCAGTACTTGAAGAAACATCAAGGCGAAATCGTCTCATCAGCGGCATGGGGCAGTGCAACGGCTCTCCACGACAGTATCAAGTCTAGACTGGGGGACGAAGTTGCTACCGCAGTGATAATTCTCAAGTATCTAGCATTTGGAGAGAGGGAGTTATCTGGACTTACCAGACAGGTCCTGATTGACATCATAGTATACTACATAGTCAACAAGCCCCGTTTTGAAGGAGATGATTATGCAAAGAGAAAGGGAAGAAGGCTAGTCATTGAGGTATTAATGGGAGCACTGGCGACTTACGCAGTGTCCAATTTTTGGGGCGTGTCCATTAACAAGGTGTTACAACCAATATCTGATTACCTGCCCTATGCTACCGCCACTCTAGCATTCCTCCGTCCGACCTTTATGGAATCAGCAGTGGTGGTTGCCTCTTCCATCTACAGAGCTTTCCTTTCTATCAAGCATGCTGAGAACAGGAGTCTTGTCACACAGGTTGCCTCTGCTGCTCTTGAAGTCATGGGTCTAACTCCAGTGTCAGCTGGCCTGGGCGTCTTGCTAGGGCTTGGGTTGTGTGTGCTCCACATGAACATAGACAAGAATGAGGAGAAGAGGACTCTGATACTGAAAATGTTCGTCAAGAACTTCATAGACCAGGCAGCATTAGATGAATTGGACAAATTAGAGCCAGAGAAAATAATCCTCTCACTGCTGGAAGGTATTCAAACCTGCACAAACCCGGTCAGAGCCATTATGATCCTGTACAGGGTGTATTATAAGGGAGAATCATTCACAGAAGCCTTGTCCAAGATGGCTGGGAAGTCTCTCATTGTGATGGTCATCGTTGAGTTCCTAGAACTAACGGGGCAGACCCAAGGAGGGTACATAGACCTTAGCACCAACCTTCTAACCCACCTATTAGGAAAATTGAAAAAGATGGCCAATCTTGCTATTGGGGAGGCTAGAAAGGTTTTGCTGCCTATTCCATACCTGTATTGTGAAACTTGGCAGTCTGACCCTAGAATCAGAGCTCCGGAATCCTATGATCAAGTGGTAGTAGAATGTAAATGCGGCGCCTTGGCGAGATATTCCTTCCACCAAGGGGCCCATGAAATGCTGGAAGAGAGAGGGACCAAGTGGTGCAAAAATTTTTTCTTATGGGGACCCAACTTTAACAACCCAGACCCAAAGAGGATGACATTTTACGAGTATGGTCAAGCAAAAAAGTGTCCCGTGACTATCATAGGTGAAGACATAACCTTTGGTAAATATGGCATATATGTCCAATTTGGTCATAGACCTGATGGGAAAAGGTTAATACGGGGCACCACTCATGCAACCATCAGTATGGAGGAACTGCTGGAAATTTTAACGGCTCCAAGTCAAGTGGCTATAGGCAAAGTTAAATTGACTGACTATTGTAATCAAAAAGGGATAATAAACAGGAAACTGGCTGTAATTGAGGGTGACAAAATACACTTCTGGAAATCACACCGTGGGTCCAAGATTACAGACCAGCTGACCATTGAGAGCCTGACAGACGACCTAGGGTTAGAAATTAGGGATATTACATGGGAGCTGTATGCAGGTGGGACGTGTACCGTAAAAGGGATATCCCTTAGGTCATGTGCACCGGAGCAAAGAAGCAAGGCCACAGTCTTGTGCGACTGCACCGACGTGCTAAGCCCCTGCTACCTAATTAATGGCAGGAAACCTTCCCCATTTGATGTCGCAGAGGGTTATGAATGCCATCATCGGAAACCCCGAGCGACATATGAAGATCTGGAGATGGAAGAAATACTGAAGAGGCGGGTTCCTGTATATGACCCCTCTTGTCTGTTTGACACTGATAGCAAATTATTACCTCCTGACACTTACTATTTGGAAGAGGACCAAGAAGACTTCGAGTATGCTCTAAGGTGTTGGGGCCTTGGGGTCTATGTAGTAGACGGGCCCGTTACCTCCCCCCCGAGCATAAGAATACACCATAGTTCCACATTGCTATTGTTGACACCTGGAGTGGACTCTGAGTTACATCTACAGTATATAAGCTGTTACTCCCACCAGGCAGAGGTTGACATTTTTGTCAGGGACCAATTCCTAGAAGGGGAAAACTCTACTGCGGATGTGGATGGCTCTCAGGGAAGCAGTGATGAAGGAACAGAAGATGTGGCGGCAGAGGAAGAGGACACACTGTCCATAGCAGAATCTATGCCCCCATTGGAAGAGGAAGAGGACAACGGAGAAACTATCACCTACGTGGTCATAAGGGGATTGCAGGAAGAAAGACACACTAGCCACCTTAAATTAAACGATTGGATTAGTGAAAACATTACGGAGCCGCACAAGGTCCAAATTATGCTTGATGGAACAGTGAGAGTCACGATAAAAGAGGGCAAAGTAAAACACCTATTTGGGATATACAGAATTGAAAACACCCTGGAAGCAATGTTCAAGGAGACTATAGCTGATCTTCCTGTAGCCACCCAACCGCCCCGAGGGCCCATTTACACGGCCAAAGAATTAGCCCAGGGAAATGTTGCCCCAGTCCAACCCGCAACAAATTACTATGGAATGATAGAGGGGAGGGGTGACTCGATGACAGCATTCGAAGCCTTGTCGGTCCTGCGATCACAAAAAGTCTTGACAAAAGAGGTCAGAGTAAATACCCACAGGGCACAGGCCTTCCTAAATAAAGTAAAAAAGACCACTGAGGTCAGAGCACCAGAGTTAACACTGAAGCGCTTGCCGGTGCTCGGCAAAGTGAATGGGAGGAGGTTGATTAGAGAGGAGACTAACATCCCCAACCAAAGGCTAGCATCTATCATGACATCAATAGGGATCAGACTAGAGAAACTGCCAGTGGTCAGGGCAAACACCTCTGGCCCAAAATTTAGGCAATCGATCCTAGAGAAGATGGACAAGTATGAAAATGAGCAAGTCCCGGGTTTGCACGAAAAAATGTGGGCGGCCTTCCTGACAACGGCTCGACAAGATTTAAAAAACACATATGAGGAAGTGACCTATCCTGAGTTAGAGAATGGAATCAACCGGAAAGGAGCCCCAGGTTTCTTTGAGAAAGAGAGCTCGATAGGGGAAGTACTAGAAAGGAAAGAAAAAATTGATGTCGCTATCCGGGAAATTGAGAATGGCAGTCACTTATATTATGAAACAGCCATGCCCAAAAATGAGAAAAGAGATGTGCTCGACGATTGGCTGTCTGAGGACTTCGTCACATACAAAAAGCCACGTGTGATACAGTATCCAGAGGCGGTCACTCGTCTAGCTATCACCAAAATAATGTACAAGTGGGTAAAGCAAAAGCCCGTAGTAATCCCCGGCTATGAGGGGAAAACCCCAATCTTTGAAATATTTGAAAAAGTTAGTGCGGACTGGGCGCAGTTTAGGAACCCTGTAGCTGTGAGTTTTGACACTAAAGCTTGGGATACTCAGGTGACGAGGGAAGACCTCAGATTGGTAGGACGGATCCAAAAATACTACTATAAAAAGAGATACTGGAAATTCATTGACAATCTTACAGCCATGATGGAGGAAGTGCCGGTTGTCACCGTAGAAGGGGACATGTTCCTCAGAGTAGGCCAACGCGGGTCCGGGCAACCTGACACCTCGGCGGGCAATTCCATACTAAATGTGCTGACAATGCTGGTAGCTTTTTCTGAATCTACAAATCTACCTATAGCAGCTGCCTGGAAAGCCTGCCGGATTCACGTTTGTGGAGACGACGGCTTCTTGATTACAGAATTGGAACTGGGGAAGAAATTTGCAGAGAAAGGCGTCCCTTTACTAGCAGCATTTGGCAAACCCCAGAAAATCACAGAAGGAGCAAGCCTAAAGATAACCAGTAATTTTGATGGGATAGAATTCTGTAGTCACTCTCCTATCAGAGTCCAAACTCCGAATGTGCAGTGGATGCCAGCAAGGCCCACGGCGACAATCCTAGGTAAGATGAGTACTAGGCTGGGTGAAGGTGCCACTAGATCAGGAGAAGAATATGAAAAACAAGTGGCATTTGCATACTTACTGATGTACCCTTGGAACCCACTGGTCAGGAGAATCAGCCTCTTATTGCTATCTACTACTGACCCAATTGGGAAAGAAGAAACCCCATGTTCCGACGAGGGAGTGAAGTATGTCGGGGATCCCATCGCTGCATACAGGGACGTGTGGGGACATAAGCTAGAGGATGTGGGACATGTTGACCAGCCACAATTATCCCGGATGAACTACAGTATGACTTACTTGGGGGTCTGGAAACCAAAAACGAGCCAGCGGTTAGTTGAACAGTGCTGCAGATTAGCTGAAAAAAACAACTGTGTGGTACGTGCTGACTCCCTCATCAAGAAAAAGGTGAAGGTCACTTACGACCCAGGGATAGGAGTAGCCCAGATCATCCGCAGGTGGGAAGAGTTAGAGTGGACTAGAAGGAGACCTACACTCACTAATTTAGACACAGAAGATGACCTTTTCCTAGTCTTATGGAAGAGGCTTGCAAGATACATTTTTCAGAAAGTGAAGTTCATGCAAAAAATGCTCACCCCTTATTAAGCGGGGGGCGTTCCATTAAATATAGCCAGTATCTGGCGAACATAGAACCTGTGTAAATAAAATTTGCAACTGAAAGGGGCAAGTGGCCGTAT
| 62,668
|
MK347476.1
|
Atypical porcine pestivirus
|
Xie,Y., He,D.
|
South China Agricultural University, College of Veterinary Medicine
|
China
|
2019-05-25
|
GD-YJHSEY3N
|
Pestivirus scrofae
|
Pestivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 11,043
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Sus scrofa
| null |
2017
| null | null |
Atypical porcine pestivirus isolate GD-YJHSEY3N, complete genome
|
GGCGGATGCCTCGGGTAAGAGTATAAAATCCGTTGTTTTTAACATGAAGAAGCAGATTACATATTACTTAAAAAAAGAAAAACAAAGAAACGGGTGGACGGAACTGGTGGTGGGAGAAAGTCACATGAAAATAACCACACTCTCTGGGAGGACCTACCGAGGTACTTGGGAAATGGAGAAGTGGTCAAATCCTTATGGAACCTACTTACCCAGGCCTAGCCCCCAACAACTTACAGCCTTACACCCACACCCGGTGGTGAACTGCAAGATGATAGAGTACAAGGGGGTGGATCCTGATTATGGTGATTGTCCAAACACAAATGGGGTGTTTATTGACGAAAAAGGTAGAAGGTTTAGTAGTCCTCCATTGGGTATTTGGAAGATAAGACTGGACTACAATGAACTGGTAAATGCAAGTAGACCAGTCTTTACCAGCGGAAGAAATTTATACCAGGTTGAAACCTGCAGTGGGGAATTGGCCACCATAATACTGGAGCACGACAGGGTTCTCGTGGACGACTGTAGGGGGTTTTATCAATGGAAACCCAACTGTGAAGGAATGGTGCTTTATGTGAAGACCTGTTCTGATTGGGCAGATCAAGTGGAAAAACAAGAGAAGGAAAAACCTCCGAAACCTCAGCGACCACCAAGACGAGACCCACGAAAAGGGTTGCAGCCACAAGTCCCCAAAGAAACTGAAATCACGGAGAAAAAGAAACAACCGAGCGTCACCTTAGTATCGGGGGGGCAAAAAGCTCAGGTCATCTATAAGGGTAAGACCAAGAATAAAAAGACCCCGGAAGGGGTTTATAAGTACCCGGGGGCTAAGGAAGGGGATGTAGTGAAAGTCAAGAAAATGCTGAAGAACTGGCACATAGCCCTGGTGATGTGCCTAATATTTTTCGCAAACCCAAGTTTAGCCAAGGTCCAGTGGTTCCTAAAGGATGAGAATTCAACAGGAATAAATCAAGTACTGTGGCAAAGACAGGTAAACAGGTCCCTACATGGAGAATGGCCTAACCAGATCTGTCGTGGAATGCCAAACGAAACCATTACGGACGAGGAGCTACGCAGTCTTGGGATGATAGATACAAGCCCTAGAACAAACTATACTTGCTGCCAATTGCAATACCATGAATGGAAGAAACACGGGTGGTGTAATTATCCACAAAAACAAGTTTGGATTAAGAGAATAGCAGCCTTACAATCCAACCTAACCGGAGCTTATGAGGGACCTGAATGTGCAGTCATCTGCCGATTTAATGGTAGTTATAACATAGTGAGACAGGCCAGAGACGAAGTAAGCCCGTTGACAGGGTGTAAAGAAGGATATCCCTTCCTGTTTTCTGGAGAAAGATCCGACACCTCATGTCTAAAGCCTCCATCCACTAGTTGGGTCAGACCAGTAAAAATGGATGAGGCATCAGTGGCAGATAGCTTCGCCCATGGAGTAGACAAGGCGATAATATTAATTAGAAAAGGGGCGTCAGGAATCATCAACTTTTTAGACACCATTGGGAGGTGGCTGCCGGTGGCTGAAGCCGCCATAGTACCATATTGTGAAACTTATACTGTAACAGGGATGTACGTTCATGTGAAGCATTGCCTCCCTAAGGGGCTACCAAAGCATTCAAAAATAATTTCCCCAACAATGATATACCTGGGGGAAGGTGACCCAGCCCATAATATCCAGCATTTGTTTGGCTCAGGCATAGCAAAGTGGGTCCTAGTCTTACTTGGTGTCTTGGGTGAGTGGTATGGGGAGTTGGCCTCCACGATATATCTGCTACTGGAGTACGGGACTGAATGGTTGGAACATGAAAGTCTAGTCACGGAAGGGTTGATCCCTGGCATCAATATCACAGTAGAGCTCCCCGCTAGTCACACGGTACCAGGTTGGGTGTGGGTCGCTGGCCAGTGGGTATGCGTGAAACCAGATTGGTGGCCTACACAGATTTGGATTGAAACCATAGTGACAGAGGTATGGCATATACTGAAAATATTGGCATCAGCTTTGGTAAATATAGTCACTGCATTCGTAAACCTAGAGTTAGTCTATCTGGTCATAATACTAGTCAAAATATCAAAGGGGAACTTGATAGGTGCTGTATTGTGGTGCCTCTTGCTGTCAGGAGCTGAGGGGTCATGCCACAGAAGACAAGACTATTACAACATCCAACTGGTTGTCGAGGAAAAAACAGGAATAGAGAAGCGATCCATAATTGGCAAGTGGACTGTGATAACTAGGGAAGGTAGAGAACCAAGATTAATGGAGCAGATAAATATGGTGTCGAATGAGACCCTATCAGAAACTTACTGCTACAATAGGCTGAATACCAGTAGCTGGGGACGGCAGCCGATAAGACAGAGGGGGTGCGGGCAAACTGTACCCTATTGGCCTGGTGACAACGTCCTTGAAGAGCAATACTACAGCACAGGTTACTGGGTGAATGCAACAGGTGGTTGCCAGTTAAGGGAAGGTGTATGGCTATCAAGAAAAGGCAACGTGCAGTGTCAGCGTAATGGTACTTCCTTGATGCTGCAACTAGTGATAAAAGAAGAGAACGACACCATGGAAATACCATGTGATCCAGTGGAAACTGAAAGCATGGGCCCAGTAGCACAGGGCACCTGTGTGTACAGCTGGGCAGTTGCCCCAAGAGGGTGGTACTACAACAAGAAAGACGGTTACTGGCTCCAGTACATAAAGAAAAATGACTATCAGTACTGGACCAAGATGCCCACCACTTCGTCTGCTGCCACAATGTATCGTCATCTGCTCCCCCTATTGGTGGCCTGCCTTATGGGCGGTAGAATATCAGTGTGGATTGTGGCAATGCTTCTGTCTCTACAAGTGGAAGCTAGTGAAGTTGGCACCAAGCAATTAGCCGTTACCCTAACTCTATGGAAGATGGATTGGACAGAACTGCTCTTTTACATCGTCATAATGCTAGTTGTCAAGGAAGACCTTATAAAGAAAATGGTGACTGCAAGTCTCGTGGCCTTGAAAAACAGCCCGGTTGCCTTGAGCTTTCTTATTGTACTCAGGCTGGTGGGGGGTAGCGAGGCGCTCCCGGTGGGTCTATTATTAGAAAAGATGTGCATAGACCAACCAGAGTTTGGAACCCCTTTCTTGATCTATCTATGGGACAACTGGAAGTGGACTGTCTTAGTTAGCTTCTCTGCATTAAACCACGAAAAGACCATAAAATTAGCAAGAAAATTACTGTTAGCCACGCATATAACAGCACTGACATTAACTGGCTTAAGTGACTCAATATTCTACGTGGTGCTCATAATGACCAACCTTCTAATAAAGACATTTATATATCTATTGGGAGCCAGTATCAGCTGGGTCGAAAAAGAGAAAAAGAAGCTGCTAGTAAAGAGGAGATTAATATATAAACATGCTGCAATCTGTCATCAAGACGAGAACGAACTAGCCAGCAAGTTCAACAGGATAACTGTGAATGCAGATTTCACCCCATGCAGACTCGAATTGCTACAATTGCTCAGAGCTTTCCTTGTCTCCCTATGTTTTTCCTATTACAAACCCCTCTTGTACGCAGAGACCACCTTAACTGTGATAGTGATTGGAGTGCAGGAGTACAACGTAGCAATGGCCCGCGGGCGTAGCATGATTCACAGATTGTTAGCTACGGCCTATTACATATATGGCCGTATACAGGGGGACATGTTCCAGCTCGCTACAGCCCAATGTCTGCTATCCAGTCCAAGGAAAATCATGAAACACATGATAGAAAATCCGATCCTCAAGAAGCTCTGGCAAGGAGAAACGGAACTTTTCAACCAGGGGGTCAGTCAGTCCAGAATAGTCAACCCAAAGAAAATAGGGTTGGAGGAATTGCACAAAGGCATGTGTGGCCTGCCAACCGTAGTACAAAATTTAGTCATATACGCAAAGAAGAATGACTCCCTTATCTTAGGAGAAGTAGGCTACCCCCCTGGGGACCTCACTAGTGATGGGTGGGAAATTCTAGGCCCTGGCAGAATTCCGAAGATTACCAACGTTGAGTCTGCCAAGATGGACCTGCTCTCTAAACTTATGACCTTCCTGGGGATCGAAACCTCCAGGGTCCCCAGAACCCCAGTCCACTCGACAAGGAAACTATTGAAGATAGTAAGAGGCATGGAAACTGGGTGGGGGTATACTCACGCAGGGGGGGTTAGCAGTGCCAAACATGTCACAGGTGAGAAGAACTTGATGACTCATATGGAGGGCAGAAAGGGTAAATATATCCTACAATCTCAAGAACATGGTGCCGATGAGGTGGAATACGGGGTGAAGACTGATCAAAAGGCACCCGACAATGCTTTGTGTTACTGCTTTAACCCTGAAGCCACAAATATAAAAGGAGAAACAGGTGCCATGGTGTTCATGAAGAAAATAGGAAAAAAATGGACCCTTGTAACATCAGATGGCAATAAAGCTTATTATAATGTAAATAACCTTAAGGGGTGGTCCGGATTACCAATAATGCTGCACTCTACCGGAGCTATAGTAGGGAGGATCAAGTCAGCTTATTCAGACGAAAATGACCTAGTGGAGGAACTTATTGACTCTAGGACCATCAATAAGAGCAAAGAGACTAACCTGGACCACCTTATCAAGGAATTGGCTGATATGCGGAGGGGGGAGTTCCGCTCAATCACTCTAGGAACGGGTGCCGGAAAAACGACAGAACTGCCCAGACAATACCTCACCACAGTAGGTGCCCATAAGTCGGTATTGGTTCTGGTTCCTTTGAAAGCACCTGCTGAAAGCGTGTGCCGCTTTATGAGATCCAAATATCCCACTATCAACTTTTCCCTGAGAGTCGGAGAACGGAAAGAGGGGGACGTGAGCAGTGGCATCACCTATGCCACTTACGGTTTCTGCTGCCAGCTCAACCTAACCCAACTCAAGGAATGGGTGTCTAGGTACTCGATGGTGTTCTTCGATGAGTACCACACAGCGACCCCAGAACAAATAGCCATAATAAGCAAGATCCACGCACTGAAAGTTAAGACTAGGATAGTGGCCATGTCCGCAACCCCTCCAGGCACTGTAACAACCGAAGGAAGAAGATTTGACATTGAAGAAGTAGGGGTTGCCACAATAGAGAAAGGAGAAGAACCAAAAAGGGGGCGCATCGCAGTGGCTGGCATGCAGGTCCCGTTGGAAGACCTGACGGGGAAGAATTGCCTGGTGTTTGTGGCAACTAAGGAATCTGCAGAGATGGAGGCCAAAGAATTGCGTGCCAAAGGGATAAATGCCACCTACTACTATTCAGGCATAGACCCAAAAACCCTGGAACATGGGATGACTAACCAGCCATACTGCATTGTGGCCACCAATGCCATCGAATCAGGCATAACCTGCCCGGATCTTGACGTGGTCATAGACACTATGCAGAAGTACGAGAAAGTAGTGAATTTCTCAGCAAAGATGCCTTTAATTGTCACCTCACTGGTAAGGAAGAAAATCACCAGGGAAGAACAAGGCCAGAGGAAAGGTCGGGTTGGGAGGCAAAAGAAGGGTAAGTACTATTACCCATCGGGGGTGGTACCAAATGGATCGAAAGATCTCAGTTACTTAATCTTGCAGGCCCAGGAGTATGGTGTCTTGGAACAAGTTAACATAACAGAGTACTTCATCACAATGAATGAGGACTGGGGTCTCTATGACGTAGATGAAGTTGAAGTGAGAATACTGGAGAGGATGAATAAGGAGATCTTGCTTCCGCTGGGCATCGTCGAGAAGCAAATCCTAGAAAGGAGCACTCACCCAGAGAAGGTGGCACTGCTGTATAACAAACTGGTACAGAAAAGCCCTATAGTCTACCCTAGAGTACAGGATGGTGAGGTCAGCAAGGAATACAATACCCACAATTTAGCTGTATATGACAAACTAAAGGATGTAAATCCACAAGCCATCTATGTCCTGGCTGAAGAGGAAAGGGCCACAGAGATGATGGGCCTAGAATTTGAGCAGGACCCATCTGATTTACAGGACTCAGTAGTCCAGCTCTGTGAAGACATAAAAAGGTATACAAAACTCTCTGGGATCACTGAGAAGCTACTGGTGGGTACAATGGTCGGATATATAGGATACAAAGCTTTAACTAGAAACCATGTCCCCTGGGTCAGCAAAGAATACTCTTATGAGTTGACTGACTCCCCAGACACATACGAGAACTCATTCGCACCTCTGGATGTGGACGTCCAAAACCCTGGGGAAAACAAGCGTCCAGAGCAGCTGGCAGACCATCAACTACGGCAATTATTAGAGATTGGGAAAGATAAGACAATCGGCTTCTTAAAAGGAATTCATGAGTTCACTAGCGGGGCTATAAATAGTCCAAAAGCCCTGAGTATATGGGAGAAAATATACCAGTACTTGAAGAAACATCAAGGCGAAATCGTCTCATCAGCGGCATGGGGCAGTGCAACGGCTCTCCACGACAGTATCAAGTCTAGACTGGGGGACGAAGTTGCTACCGCAGTGATAATTCTCAAGTATCTAGCATTTGGAGAGAGGGAGTTATCTGGACTTACCAGACAGGTCCTGATTGACATCATAGTATACTACATAGTCAACAAGCCCCGTTTTGAAGGAGATGATTATGCAAAGAGAAAGGGAAGAAGGCTAGTCATTGAGGTATTAATGGGAGCACTGGCGACTTACGCAGTGTCCAATTTTTGGGGCGTGTCCATTAACAAGGTGTTACAACCAATATCTGATTACCTGCCCTATGCTACCGCCACTCTAGCATTCCTCCGTCCGACCTTTATGGAATCAGCAGTGGTGGTTGCCTCTTCCATCTACAGAGCTTTCCTTTCTATCAAGCATGCTGAGAACAGGAGTCTTGTCACACAGGTTGCCTCTGCTGCTCTTGAAGTCATGGGTCTAACTCCAGTGTCAGCTGGCCTGGGCGTCTTGCTAGGGCTTGGGTTGTGTGTGCTCCACATGAACATAGACAAGAATGAGGAGAAGAGGACTCTGATACTGAAAATGTTCGTCAAGAACTTCATAGACCAGGCAGCATTAGATGAATTGGACAAATTAGAGCCAGAGAAAATAATCCTCTCACTGCTGGAAGGTATTCAAACCTGCACAAACCCGGTCAGAGCCATTATGATCCTGTACAGGGTGTATTATAAGGGAGAATCATTCACAGAAGCCTTGTCCAAGATGGCTGGGAAGTCTCTCATTGTGATGGTCATCGTTGAGTTCCTAGAACTAACGGGGCAGACCCAAGGAGGGTACATAGACCTTAGCACCAACCTTCTAACCCACCTATTAGGAAAATTGAAAAAGATGGCCAATCTTGCTATTGGGGAGGCTAGAAAGGTTTTGCTGCCTATTCCATACCTGTATTGTGAAACTTGGCAGTCTGACCCTAGAATCAGAGCTCCGGAATCCTATGATCAAGTGGTAGTAGAATGTAAATGCGGCGCCTTGGCGAGATATTCCTTCCACCAAGGGGCCCATGAAATGCTGGAAGAGAGAGGGACCAAGTGGTGCAAAAATTTTTTCTTATGGGGACCCAACTTTAACAACCCAGACCCAAAGAGGATGACATTTTACGAGTATGGTCAAGCAAAAAAGTGTCCCGTGACTATCATAGGTGAAGACATAACCTTTGGTAAATATGGCATATATGTCCAATTTGGTCATAGACCTGATGGGAAAAGGTTAATACGGGGCACCACTCATGCAACCATCAGTATGGAGGAACTGCTGGAAATTTTAACGGCTCCAAGTCAAGTGGCTATAGGCAAAGTTAAATTGACTGACTATTGTAATCAAAAAGGGATAATAAACAGGAAACTGGCTGTAATTGAGGGTGACAAAATACACTTCTGGAAATCACACCGTGGGTCCAAGATTACAGACCAGCTGACCATTGAGAGCCTGACAGACGACCTAGGGTCAGAAATTAGGGATATTACATGGGAGCTGTATACAGGTGGGACGTGTACCGTAAAAGGGATATCCCTTAGGTCATGTGCACCGGAGCAAAGAAGCAAGGCCACAGTCTTGTGCGACTGCACCGACGTGCTAAGCCCCTGCTACCTAATTAATGGCAGGAAACCTTCCCCATTTGATGTCGCAGAGGGTTATGAATGCCATCATCGGAAACCCCGAGCGACATATGAAGATCTGGAGATGGAAGAAATACTGAAGAGGCGGGTTCCTGTATATGACCCCTCTTGTCTGTTTGACACTGATAGCAAATTATTACCTCCTGACACTTACTATTTGGAAGAGGACCAAGAAGACTTCGAGTATGCTCTAAGATGTTGGGGCCTTGGGGTCTATGTAGTAGACGGGCCCGTTACCTCCCCCCCGAGCATAAGAATACACCATAGTTCCACATTGCTATTGTTGACACCTGGAGTGGACTCTGAGTTACATCTACAGTATATAAGCTGTTACTCCCACCAGGCAGAGGTTGACATTTTTGTCAGGGACCAATTCCTAGAAGGGGAAAACTCTACTGCGGATGTGGATGGCTCTCAGGGAAGCAGTGATGAAGGAACAGAAGATGTGGCGGCAGAGGAAGAGGACACACTGTCCATAGCAGAATCTATGCCCCCATTGGAAGAGGAAGAGGACAACGGAGAAACTATCACCTACGTGGTCATAAGGGGATTGCAGGAAGAAAGACACACTAGCCACCTTAAATTAAACGATTGGATTAGTGAAAACATTACGGAGCCGCACAAGGTCCAAATTATGCTTGATGGAACAGTGAGAGTCACGATAAAAGAGGGCAAAGTAAAACACCTATTTGGGATATACAGAATTGAAAACACCCTGGAAGCAATGTTCAAGGAGACTATAGCTGATCTTCCTGTAGCCACCCAACCGCCCCGAGGGCCCATTTACACGGCCAAAGAATTAGCCCAGGGAAATGTTGCCCCAGTCCAACCCGCAACAAATTACTATGGAATGATAGAGGGGAGGGGTGACTCGATGACAGCATTCGAAGCCTTGTCGGTCCTGCGATCACAAAAAGTCTTGACAAAAGAGGTCAGAGTAAATACCCACAGGGCACAGGCCTTCCTAAATAAAGTAAAAAAGACCACTGAGGTCAGAGCACCAGAGTTAACACTGAAGCGCTTGCCGGTGCTCGGCAAAGTGAATGGGAGGAGGTTGATTAGAGAGGAGACTAACATCCCCAACCAAAGGCTAGCATCTATCATGACATCAATAGGGATCAGACTAGAGAAACTGCCAGTGGTCAGGGCAAACACCTCTGGCCCAAAATTTAGGCAATCGATCCTAGAGAAGATGGACAAGTATGAAAATGAGCAAGTCCCGGGTTTGCACGAAAAAATGTGGGCGGCCTTCCTGACAACGGCTCGACAAGATTTAAAAAACACATATGAGGAAGTGACCTATCCTGAGTTAGAGAATGGAATCAACCGGAAAGGAGCCCCAGGTTTCTTTGAGAAAGAGAGCTCGATAGGGGAAGTACTAGAAAGGAAAGAAAAAATTGATGTCGCTATCCGGGAAATTGAGAATGGCAGTCACTTATATTATGAAACAGCCATGCCCAAAAATGAGAAAAGAGATGTGCTCGACGATTGGCTGTCTGAGGACTTCGTCACATACAAAAAGCCACGTGTGATACAGTATCCAGAGGCGGTCACTCGTCTAGCTATCACCAAAATAATGTACAAGTGGGTAAAGCAAAAGCCCGTAGTAATCCCCGGCTATGAGGGGAAAACCCCAATCTTTGAAATATTTGAAAAAGTTAGTGCGGACTGGGCGCAGTTTAGGAACCCTGTAGCTGTGAGTTTTGACACTAAAGCTTGGGATACTCAGGTGACGAGGGAAGACCTCAGATTGGTAGGACGGATCCAAAAATACTACTATAAAAAGAGATACTGGAAATTCATTGACAATCTTACAGCCATGATGGAGGAAGTGCCGGTTGTCACCGTAGAAGGGGACATGTTCCTCAGAGTAGGCCAACGCGGGTCCGGGCAACCTGACACCTCGGCGGGCAATTCCATACTAAATGTGCTGACAATGCTGGTAGCTTTTTCTGAATCTACAAATCTACCTATAGCAGCTGCCTGGAAAGCCTGCCGGATTCACGTTTGTGGAGACGACGGCTTCTTGATTACAGAATTGGAACTGGGGAAGAAATTTGCAGAGAAAGGCGTCCCTTTACTAGCAGCATTTGGCAAACCCCAGAAAATCACAGAAGGAGCAAGCCTAAAGATAACCAGTAATTTTGATGGGATAGAATTCTGTAGTCACTCTCCTATCAGAGTCCAAACTCCGAATGTGCAGTGGATGCCAGCAAGGCCCACGGCGACAATCCTAGGTAAGATGAGTACTAGGCTGGGTGAAGGTGCCACTAGATCAGGAGAAGAATATGAAAAACAAGTGGCATTTGCATACTTACTGATGTACCCTTGGAACCCACTGGTCAGGAGAATCAGCCTCTTATTGCTATCTACTACTGACCCAATTGGGAAAGAAGAAACCCCATGTTCCGACGAGGGAGTGAAGTATGTCGGGGATCCCATCGCTGCATACAGGGACGTGTGGGGACATAAGCTAGAGGATGTGGGACATGTTGACCAGCCACAATTATCCCGGATGAACTACAGTATGACTTACTTGGGGGTCTGGAAACCAAAAACGAGCCAGCGGTTAGTTGAACAGTGCTGCAGATTAGCTGAAAAAAACAACTGTGTGGTACGTGCTGACTCCCTCATCAAGAAAAAGGTGAAGGTCACTTACGACCCAGGGATAGGAGTAGCCCAGATCATCCGCAGGTGGGAAGAGTTAGAGTGGACTAGAAGGAGACCTACACTCACTAATTTAGACACAGAAGATGACCTTTTCCTAGTCTTATGGAAGAGGCTTGCAAGATACATTTTTCAGAAAGTGAAGTTCATGCAAAAAATGCTCACCCCTTATTAAGCGGGGGGCGTTCCATTAAATATAGCCAGTATCTGGCGAACATAGAACCTGTGTAAATAAAATTTGCAACTGAAAGGGGCAAGTGGCCGTAT
| 62,669
|
MH221022.1
|
Atypical porcine pestivirus
|
Li,Y.
|
South China Agricultural University, College of Animal Science
|
China
|
2019-04-30
|
APPV-China/GD-GL/2016
|
Pestivirus scrofae
|
Pestivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 11,043
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Sus scrofa
|
brain
|
2016-04
| null | null |
Atypical porcine pestivirus isolate APPV-China/GD-GL/2016, complete genome
|
GGCGGATGCCTCAGGTAAGAGTATAAAATCCGTTGTTTTTAACATGAAGAAGCAGATTACATACTACTTAAAAAAAGAAAAACAAAGAAACGGGTGGACAGAACTGGTGGTGGGAGAAAGTCACACGAAAATAACCACACTTTCTGGGAGGACCTACCGAGGTACTTGGGAAATGGAGAAGTGGTCAAATCCTTATGGAACCTACTTACCCAGGCCTAGCCCCCAACAACTTACAGCCTTACACCCACACCCGGTGGTGAATTGCAAGATGATAGAGTACAAGGGGGCGGATCCTGATTATGGTGATTGTCCAAACACAAATGGGGTGTTTATTGACGAAAAAGGTAGAAGGTTTAGTGGTCCTCCATTGGGTATTTGGAAGATAAGACTGGATTACAATGAACTGGTAAATGTAAGTAGACCAATCTTTACCAGCGGAAGAAAATCATACCAAGTTGAAACCTGCAGTGGGGAATTGGCCACCATAATACTGGAGCACGACAGGGTTCTCGTGGACGACTGTAGGGGGTTTTATCAATGGGCACCCAACTGTGAAGGAATGGTGCTTTATGTGAGGACCTGTTCTGATTGGGCAGATCAAGTGGAAAAACAGGAGAAGGAAAAACCTCCGAAACCTCAGCGACCACCAAGACGAGACCCACGAAAAGGGTTACAGCCACAAGTCCCCAAAGAAACTGAGATCACGGAAAAAAAGAAACAACCGAGCGTTACCTTAGTATCGGGGGGGCAAAAAGCTCAGGTCATCTACAAGGGTAAGACCAAGAATAAAAAGACTCCGGATGGGGTTTATAAGTACCCAGGGGCTAAGGAAGGGGATGTAGTAAAAGTCAAGAAAATGTTGAAGAACTGGCACATAGCCCTGGTGATGTGCCTAATATTTTTTGCAAACCCAAGTTTAGCCAAGGTCCAGTGGTTCCTAAAGGATGAGAATTCAACAGGAATAAATCAAGTACTGTGGCAAAGACAGGTAAACAGGTCCCTACATGGAGAGTGGCCCAACCAGATCTGTCGTGGAATGCCAAACGAAACCATCACGGACGAGGAGCTACGCAGTCTTGGAATGATAGATACAAGCCCTAGAACAAACTACACTTGCTGCCAATTGCAATACCATGAATGGAAGAAACACGGGTGGTGCAACTATCCACAAAAACAAGTTTGGATCAAGAGAATAGCAGCTTTACAATCCAACCTAACTGGAGCTTATGAGGGACCTGAATGTGCAGTCATCTGCCGATTTAATGGTAGTTATAACATAGTGAGACAGGCCAGAGACGAAGTAAGCCCGTTAACAGGGTGTAAAGAAGGATATCCCTTCCTGTTTTCTGGAGAAAGATCTGACACCTCATGTCTAAAACCTCCATCCACTAGTTGGGTCAGACCAGCAAAAATGGATGAGGCATCAGTGGCAGACAGCTTCGCCCATGGAGTAGACAAGGCAATAATATTAATTAGAAGAGGGGCATCAGGAATCATCAACTTTTTAGACACCATTGGGAGGTGGCTGCCAGTGGCTGAAGCCGCCATAGTACCATATTGTGAAACCTATACTGTAACAGGGATGTACATTCATGTGAAGCATTGCCTCCCCAAGGGGCTACCAAAGCATTCAAAAATAATTTCCCCAACGATGATATACCTGGGGGAAGGTGACCCAGCTCACAATATCCAGCATTTGTTTGGCTCAGGCATAGCAAAGTGGGTCCTAGTCTTACTTGGTGTCATGGGTGAGTGGTATGGGGAGCTGGCCTCTACGATATATCTGCTACTGGAGTACGGGACTGAATGGTTGGAGCATGAAAGTCTAGTCACGGAAGGGTTGATCCCTGGCATCAATATCACAGTAGAGCTCCCCGCTAGTCACACGGTACCAGGTTGGGTGTGGGTCGCTGGCCAGTGGGTGTGCGTGAAACCAGATTGGTGGCCTACACAGGTGTGGATTGAAACCATAGTGACAGAGGTATGGCATATACTGAAAATATTGGCATCAGCTTTGGTAAATATAGTCACTGCATTCGTAAACCTAGAGTTAGTCTACCTGGTTATAATACTAGTCAAAATATCAAAGGGGAACTTGATAGGTGCCATATTATGGTGCCTCTTGCTGTCAGGAGCTGAGGGGTCATGCTACAGAAGACAAGACTATTACAACATCCAACTGGTCGTCGAGGAAAAGACAGGAATAGAGAAGCGATCTATAATTGGCAAGTGGACTGTGATAACTAGGGAAGGTAGAGAACCAAGATTAATGGAGCAGATAAATATGGTGTCAAATGGGACCCTATCAGAAACTTACTGCTACAATAGGCTGAATACCAGTAGTTGGGGACGGCAACCGATAAGACAGAGGGGGTGCGGGCAAACTGTACCCTATTGGCCTGGTGACAACGTCCTTGAAGAGCAATACTACAGCACAGGTTACTGGGTGAATTCAACAGGTGGTTGCCAATTAAGGGAAGGTGTGTGGCTATCAAGGAAAGGCAACGTGCAGTGTCAGCGTAATGGTACTTCCTTGATGCTGCAACTAGCGATAAAAGAAGAGAACGACACCATGGAAATACCATGTGACCCAGTGGAAACTGAAAGCATGGGCCCAGTAGCACAGGGCACCTGCGTGTACAGCTGGGCAGTTGCCCCAAGAGGGTGGTACTACAACAGGAAAGACGGTTACTGGCTCCAGTACATAAAGAAAGATGACTATCAGTACTGGACTAAGATGCCCACCACTTCGTCTGCTGCCACAATGTATCGTCATCTGCTCCCCCTATTGGTGGCCTGCCTTATGGGCGGTAGAATATCAGTGTGGATTGTGGCAATGCTTCTGTCTCTACAAGTAGAAGCTAGTGAAGTTGGCACCAAGCAATTAGCCGTCACCCTAACTCTATGGAAGATGGATTGGACAGAACTGCTCTTTTACGTCGTCATAATGCTAGTTGTCAAGGAAGACCTTATAAGGAAAATGGTGACTGCAAGTCTCGTGGCCTTGAAAAACAGCCCGGTGGCCTTGAGTTTTCTTATTGTACTCAGGCTGGTGGGGGGTAGCGAGGCGCTCCCGGTGGGCCTGTTACTAGAAAAAATGTGTATAGACCAACCAGAGTTTGGAACCCCTTTTTTGATCTACCTATGGGACAACTGGAAGTGGACTGTGTTAGTTAGCTTCTCTGCATTAAATCACGAAAAGACCATAAAATTAGCAAGAAAATTACTGTTAGCCACGCATATAACAGCACTGACATTAACTGGCTTAAGTGACTCAATATTCTACGTGGTGCTCATAATGACTAACCTTCTAATAAAGATATTTATATATCTATTGGGAGCCAGTATCAGCTGGGTCGAAAAAGAGAAAAAGAAGCTGCTAGTAAAGAGGAGATTAATATATAAACATGCTGCAATCTGTCATCAAGACGAGAACGAACTAGCCAGTAAGTTCAACAGGATAACTGTGAATGCAGATTTCACCCCATGTAGACTCGAATTGCTACAATTGCTCAGAGCTTTCCTTGTCTCCCTGTGTTTTTCCTATTACAAGCCCCTCTTGTACGCAGAGACCACCTTAACTGTGATAGTAATTGGAGTGCAGGAGTACAACGTAGCAATGGCCCGCGGGCGAAGCATGATCCACAGATTGTTAGCTACGGCCTATTACATATATGGCCGTATACAGGGGGACATGTTCCAGCTCGCTACAGCCCAATGTCTGCTATCCAGTCCAAGGAAAATCATGAAACATATGATAGAAAATCCAATCCTCAAGAAGCTCTGGCAAGGAGAAACGGAACTTTTCAATCAGGGGGTCAGTCAGTCCAGAATAGTCGACCCAAAGAAAATAGGGTTGGAGGAATTACACAAAGGCATGTGTGGCCTACCAACCGTAGTACAAAATTTAGTCATATACGCAAAGAAGAATGACTCCCTTATCTTAGGAGAAGTAGGCTACCCCCCTGGGGACCTCACCAGTGATGGGTGGGAAATTCTAGGCCCTGGCAGAATTCCGAAGATTACCAACGTTGAGTCTGCCAAGATGGACCTGCTCTCTAAACTCATGACCTTCCTGGGGATTGAAACTTCTAGGGTCCCCAGAACCCCGGTCCACTCGACAAGGAAACTACTGAAGATAGTAAGAGGCATGGAAACTGGGTGGGGGTATACTCACGCAGGGGGGGTTAGCAGTGCTAAACATGTCACAGGTGAGAAGAACTTGATGACCCATATGGAGGGCAGAAAAGGCAAATATATCCTACAATCCCAAGAACATGGTGCCGATGAGGTGGAATACGGGGTGAAGACTGATCAAAAAGCACCCGACAATGCTTTGTGTTACTGCTTTAATCCTGAAGCCACAAATATAAAAGGAGAAACAGGTGCCATGGTGTTTATGAAGAAAATAGGAAAAAAATGGACCCTTGTAACATCAGATGGCAATAAAGCTTATTATAATGTAAATAATCTCAAAGGGTGGTCCGGATTACCAATAATGCTGCACTCCACCGGAGCTATAGTAGGGAGGATTAAATCAGCCTATTCAGACGAAAATGACCTAGTGGAGGAACTTATTGATTCTAGGACTATCAATAAGAGTAAAGAGACTAACCTGGACCACCTTATCAAGGAATTGGCTGATATGCGGAGGGGGGAGTTCCGCTCAATCACTCTAGGAACGGGTGCTGGAAAAACGACAGAACTGCCCAGACAATACCTCACTACAGTAGGTGCCCATAAGTCGGTATTAGTTCTGGTTCCTTTGAAAGCACCTGCTGAAAGCGTGTGCCGCTTTATGAGGTCCAAATACCCCACTATCAACTTTTCCCTAAGAGTCGGAGAACGGAAAGAGGGGGACGTGAGCAGTGGCATCACCTATGCCACTTACGGTTTCTGCTGCCAGCTCAACCTAATCCAGCTCAAGGAATGGGTGTCTAGGTACTCGATGGTGTTCTTCGATGAGTACCACACAGCGACCCCAGAACAAATAGCCATAATAAGCAAGATCCATGCACTGAAAGTTAAGACCAGGATAGTAGCCATGTCCGCAACCCCTCCGGGCACTGTAACAACCGAAGGAAGAAGATTTGACATTGAAGAAGTAGGGGTTGCCACAATAGAGAAAGGAGAAGAACCAAAAAGGGGGCGCATCGCAGTGGCCGGTATGCAGGTCCCTTTGGAAGACCTGACGGGGAAGAATTGCCTGGTATTTGTGGCAACTAAGGAATCTGCAGAGATGGAGGCCAAAGAATTACGTGCCAAAGGAATAAATGCCACCTACTACTATTCAGGCATAGACCCAAAGACACTGGAACATGGGATGACTAACCAGCCATACTGCATTGTGGCCACCAATGCCATTGAATCAGGTATAACCTGCCCTGACCTTGACGTGGTCATTGACACTATGCAGAAGTACGAAAAAGTAGTGAATTTCTCAGCAAAGATGCCTTTAATTGTCACCTCACTGGTAAGGAAGAAAATCACTAGGGAAGAACAAGGCCAGAGGAAAGGTCGGGTTGGGAGGCAAAAGAAGGGTAAGTACTATTATCCATCGGGGGTGGTACCGAATGGATCGAAAGATCTCAGCTACTTAATCTTGCAGGCCCAGGAGTATGGTGTCTTGGAACAAGTCAACATAACAGAGTACTTCATCACAATGAATGAGGACTGGGGTCTCTATGACGTAGATGAAGTTGAAGTGAGAATACTTGAGAGGATGAATAAGGAGATCTTGCTTCCGCTGGGCATAGTCGAGAAGCAAATCCTAGAAAGGAGCACTCACCCAGAGAAGGTGGCACTGCTGTATAATAAACTGGTACAGAAAAGCCCTATAGTCTACCCTAGAGTACAGGATGGTGAGGTCAGCAAGGAATACAATACCCACAATTTAGCTGTATATGACAAACTAAAGGATGTAAATCCACAAGCTATCTATGTCCTGGCTGAAGAGGAAAGGGCCACAGAGATGATGGGCCTAGAATTTGAGCAGGACCCATCTGATTTACAGGACTCAGTAGTCCAGCTCTGTGAAGACATAAAAAGGTATACAAAACTCTCTGGGATCACTGAGAAGCTGCTGGTGGGTACAATGGTCGGGTATATAGGATACAAAGCTTTAACTAGGAACCATGTCCCCTGGGTCAGCAAAGAATACTCTTATGAGTTGACTGACTCCCCAGACACTTACGAGAACTCATTCGCACCTCTGGATGTGGACGTCCAAAACCCTGGGGAAAACAAGCGTCCAGAGCAGCTGGCAGACCATCAACTACGGCAATTGCTAGAGATTGGGAAAGACAAGACAATCGGCTTCTTAAAAGGGATTCATGAGTTTACTAGTGGGGCTATAAATAGTCCAAAAGCCCTGAGTATATGGGAGAAAATATACCAGTACTTGAAGAAACATCAAGGTGAAATTGTCTCATCAGCGGCATGGGGCAGTGCAACGGCTCTCCACGACAGTATCAAGTCTAGACTGGGGGACGAAGTTGCTACCGCAGTGATAATTCTCAAGTACCTAGCATTTGGAGAGAGGGAGTTATCTGGACTTACCAGACAGGTCCTGATTGACATCATAGTATACTACATAGTCAACAAGCCCCGATTTGAAGGAGACGATTATGCAAAGAGAAAGGGAAGAAGGCTAGTCATCGAGGTATTAATGGGAGCACTGGCGACTTATGCGGTGTCCAATTTTTGGGGCGTGTCTATTAACAAGGTGTTACAACCAATATCTGATTACCTGCCCTATGCTACCGCTACTCTAGCATTCCTTCGTCCGACTTTTATGGAATCAGCAGTGGTGGTTGCCTCCTCCATTTACAGAGCCTTCCTTTCTATCAAGCATGCAGAGAACAGGAGTCTCGTCACACAGGTCGCCTCTGCTGCTCTCGAAGTCATGGGTTTGACCCCAGTGTCAGCTGGCCTAGGCGTTCTGCTAGGGCTTGGGTTGTGTGTGCTCCACATGAACATAGACAAGAATGAGGAAAAGAGGACTCTGATACTGAAAATGTTCGTCAAGAACTTCATAGACCAGGCAGCATTAGATGAATTGGACAAATTAGAGCCAGAGAAAATAATCCTCTCACTGCTGGAAGGTATTCAAACCTGCACAAACCCGGTCAGAGCCATTATGATCCTGTACAGGGTGTATTATAAGGGAGAATCATTCACAGAAGCCTTGTCCAAGATGGCTGGGAAGTCTCTCATTGTGATGGTCATCGTTGAGTTCCTAGAACTAACGGGGCAGACCCAGGGAGGGTACATAGACCTTAGCACCAACCTTCTAACCCACTTATTAGAAAAATTGAAAAAGATGGCCAATCTTGCCATTGGGGAGGCTAGAAAGGTTTTGCTGCCTATTCCATATCTGTATTGTGAAACCTGGCAGTCTGATCCTAGAATCAGAGCTCCGGAATCCTATGACCAAGTGGTGGTAGAATGTAAATGTGGCGCCTTGGCGAGATATTCCTTCCACCAAGGGGCCCATGAAATGCTGGAAGAGAGAGGGACCAAGTGGTGCAAAAATTTCTTTTTATGGGGACCCAACTTCAACAACCCAGACCCAAAGAGGATGACATTTTACGAGTATGGTCAAGCAAAAAAGTGTCCCGTGACTATCGTAGGTGAAGACATAACCTTTGGTAAATATGGCATATATGTCCAATTTGGCCATAGACCTGATGGGAAAAGGTTAATACGGGGCACCACTCACGCAACTATCAGCATGGAGGAACTGCTGGAAATTTTAACGGCCCCAAGTCAAGTGGCTATAGGTAAAGTTAAATTGACTGACTATTGTAACCAAAAAGGGATAATAGACAGGAAACTGGCCGTAATTGAGGGTGATAAAATACACTTCTGGAAATCACACCGTGGGTCCAAGATTACAGACCAGTTGACCATTGAGAGCCTGACAGACGACCTAGGGTCAGAAATTAGGGACATTACATGGGAGCTGTATGCAGGTGGGACGTGTACCGTAAAAGGGATATCCCTTAGGTCATGTGCACCGGAGCAAAGAAGCAAGGCCACAGTTTTGTGCGATTGCACCGACGTGCTAAGCCCCTGCTACCTAATTAATGGCAGGAAACCTTCCCCATTTGATGTCGCAGAGGGTTATGAATGCCATCATCGAAAACCCCGAGCGACATATGAAGACCTGGAGATGGAAGAAATACTGAAGAGGCGCGTTCCTGTATATGACCCCTCTTGTCTGTTTGATACTGATAGCAAATTATTACCTCCTGACACTTACTATTTGGAAGAGGATCAAGAAGACTTCGAGTATGCTCTAAGGTGTTGGGGCCTTGGGGTCTATGTAGTAGACGGGCCCGTTACCTCCCCCCCGAGCGTAAGAATACACCATAGTTCCACATTGCTATTGTTGACACCTGGAGTGGACTCTGAGTTACATTTACAGTATATAAGCTGTTACTCCCACCAGGCAGAGGTTGACATTTTTGTCAGGGACCAACTCCTAGAAGGGGAAAAACTCTCTGCGGATATGGATGACCCTCAGGGAAGCAGTGACGAAGGAACAGAAGATGTGGCGGCAGAGGAAGAGGACACACTGTCCATAGCAGAATCTATGCCCCCATTGGAAGAGGAAGAGGACAACGGAGAAAATATTACCTATGTGGTCATAAGGGGATTGCAGGAAGAAAGATACACTAGCCACCTCAAATTAAACGATTGGATCAGCGAAAACATTACAGAGCCGCACAAGGTCCAAATTATGCTAGATGGAACAGTGAGAGTCACGATAAAAGAGGGCAAAGTAAAACACCTATTTGGGATATACAGAATTGAAAACACCCTGGAAGCAATGTTCAAGGAGACTATAGCTGATCTTCCTGTAGCCACCCAACCACCCCGAGGGCCCATTTACACGGCCAAAGAGCTAGCTCAGGGAAATGTTGCCCCAGTCCAGCCCGCAACAAATTACTATGGAATGATAGAGGGGAGGGGTGACTTGATGACAGCATTTGAAGCCTTGTCGGTCCTGCGATCACAAAAAGTCCTTACCAAAGAGGTCAGGGTAAATACCCACAGGGCACAGGCCTTCCTAAACAAAGTCAAAAAGACCACTGAGGTTAGAGCACCAGAGTTAACACTGAAGCGCTTGCCGGTACTCGGCAAAGTGAATGGGAGGAGGTTGATTAGAGAGGAGACCAACATCCCCAACCAAAGACTAGCAACTATCATGACATCAATAGGGATCAGACTAGAAAAATTGCCAGTGGTCAGAGCAAACACCTCTGGCCCAAAATTTAGGCAATCAATTCTAGAGAAGATGGACAAGTATGAAAATGAGCAAGTCCCGGGGTTGCACGAAAAAATGTGGGCGGCCTTCCTGACAACGGCTCGACAAGATTTAAAAAACACATATGAGGAAGTGACCTATCCTGAGTTGGAGAATGGAATCAACCGGAAAGGAGCCCCAGGTTTCTTTGAGAAAGAGAGCTCGATAGGGGAAGTACTAGAAAGGAAAGGAAAAATTGATGCCGCTATCCGGGAAATTGAGGATGGCAGTCACTTATATTATGAAACAGCCATGCCCAAAAATGAGAAAAGAGATGTGCTCGACGATTGGCTGTCTGAGGACTTCGTCACATACAAAAAGCCACGTGTGATACAGTATCCAGAGGCGGTCACTCGGCTAGCTATCACCAAAATAATGTACAAGTGGGTAAAGCAAAAGCCCGTAGTAATCCCCGGCTATGAGGGGAAAACCCCAATCTTTGAAATATTTGAAAAAGTTAGTGCGGATTGGGCGCAGTTTAGAAACCCTGTAGCTGTGAGTTTTGACACTAAAGCTTGGGACACTCAAGTGACGAGGGAAGACCTCAGACTGGTAGGACGGATCCAAAAATACTACTATAAAAAGAGATACTGGAAATTCATTGACAATCTTACAGCCATGATGGAGGAAGTGCCGGTGGTCACCGTAGAAGGGGACATGTTCCTCAGAGTAGGCCAGCGCGGGTCCGGGCAACCTGACACCTCGGCGGGCAATTCCATACTAAATGTGCTGACAATGCTGGTAGCTTTTTCTGAATCTACAAATCTACCTATAGCAGCTGCCTGGAAAGCCTGCCGGATCCACGTTTGTGGGGACGACGGCTTCTTGATCACGGAATTGGAACTAGGGAAGAAATTTGCAGAGAAAGGCGTTCCTTTACTAGCGGCATTTGGCAAACCCCAGAAGATCACAGAAGGAGCAAGCCTAAAGATAACCAGTAGTTTTGATGGGATAGAATTCTGTAGTCACTCCCCTATCAGAGTCCAAACTCCGAATGTGCAGTGGATGCCAGCAAGGCCCACAGCGACAATTCTAGGTAAAATGAGTACTAGGCTGGGTGAAGGTGCCACTAGATCAGGAGAAGAATATGAAAAACAAGTGGCTTTTGCATACTTACTGATGTACCCTTGGAACCCACTGGTCAGGAGAATCAGCCTCCTATTGTTATCAACCACTGACCCAATTGGGAAGGAAGAAACCCCATGTTCTGACGAGGGAGTGAAGTATGTCGGGGATCCCATCGCTGCATACAGGGACGTGTGGGGACATAAGCTAGAGGATGTGGGACATGTCGACCAGCCACAATTATCCCGGATGAACTACAGCATGACTTACTTGGGGGTCTGGAAACCAAAAACGAGCCAGCGGTTAGTTGAACAGTGCTGCAGACTAGCTGAAAAAAGCAATTGTGTGGTACGCGCTGACTCCCTCATCAAGAAGAAGGTGAAGGTCACTTATGACCCAGGGATAGGAGTAGCCCAGATCATCCGCAGGTGGGAAGAGTTAGAGTGGACTAGAAGGAGACCTACACCCACTAATGTAGACACAGAAGATGACCTTTTCCTAACCTTATGGAAGAGGCTTGCAAGATACATTTTCCAGAAAATGAAATTCATGCAAAAAATGCTTACCCCTTATTAAGCGGGAGGCGTTCAACTAAATACAGCCAGCATCTGGCGAACATAGAACCTGTGTAAACAAGATTTGCAACTGAAAGGGGCAAGTGGCCGTAT
| 62,994
|
NC_030653.1
|
Atypical porcine pestivirus 1
|
Postel,A., Hansmann,F., Baechlein,C., Fischer,N., Alawi,M., Grundhoff,A., Derking,S., Tenhundfeld,J., Pfankuche,V.M., Herder,V., Baumgartner,W., Wendt,M., Becher,P.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2016-07-25
|
Bavaria S5/9
|
Pestivirus scrofae
|
Pestivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 10,908
|
RefSeq
| 1
|
Germany
|
Germany
|
Sus scrofa
| null |
2015
| null |
PRJNA485481
|
Atypical porcine pestivirus 1 isolate Bavaria S5/9 polyprotein gene, complete cds
|
ATGGAAAAACAGATTGCATATTATTTAAAAAAAGAAAAACAAAGAAATGGGTGGACGGAACTGGTAGTAGGAGAAAGCCATACAAAAATAACCACACTCTCTGGAAAGATCTATCGAGGTACTTGGGAAATGGAGAAACGACCGAATCCTTACGGAACCTATCTTCCTAGACCTAACCCCCAACAGCTCACAGCCCTACACCCCCACCCGGTGGTGAATTGTAGGGTGACTGAGTATAAGGGGCTGGACCCCAATTATGGTGATTGCCCGAATACAAACGGGGTGTTCATCGACGAAAAAGGTAGAAGGCTGAGCAGTCCTCCATTGGGTATTTGGAAGATAAGACTAGACTACAGCGATCTGGTAAATATAAACAGACCAGCTCCCGCTAGCGGGAAAAACTCTTATCGAGTCGAGACCTGCAGTGGGGAACTAGCTACTATAACACCGGTACACGATAGGGTACTTGTAGAAGACTGCAGGGGGCTATACCAATGGAAACCCAACTGTGAAGGGATGGTGCTCTATGTGAAAACTTGCTCTGATTGGGCGGATCAGGTGGAAAAACAAGAAAGGGGAAACCCCCCAAAACCTCAGCGACCACCGAGGCGAGACCCACGAAAAGGGTTACAACCACAAGTCCCTAAAGAGACTGAGGTCACAGAAAAGAAGAGACAACCCAGCGTCACCTTAGTATCGGGGGGGCAGAAGGCCCAAGTCATCTATAAAGGTAAGACTAAGAATAAAAAGACTCCGAATGGAGTCTATAAGTATCCAGGAGCCAGAGAAGGGGACGTGGTAAAGGTTAAGAAGATGCTGAAGAATTGGCATATAGCTGTAGTAATGTACCTGATTTATATCATAACCCCAAGCTTTGCCAAGGTCCAGTGGTTCTTAAAGGATGAGAACTCAACGGGGATCAACCAGATACTGTGGCAGAGACAGATCAATAGATCCCTGCATGGAGAATGGCCCAACCAGATCTGCCATGGCATGCCGAATGAAACCATCACGGATGAGGAATTACGCAGCTTGGGAATGATAGATACAAGTCCCAGAACAAACTACACTTGTTGCCAGTTACAATATCATGAGTGGAAGAAACATGGTTGGTGCAACTATCCACAAAAACAGACTTGGATTAGGAGGATAACAGCCCTACAAGCTAACCTCACCGGAGCTTATGAGGGACCTGAGTGCGCTGTCATCTGTCGATTTAATGGCAGCTATAACATCGTAAAACAGGCCAGAGACGAGGTGAGTCCACTGACAGGGTGTAAGGAGGGGCACCCTTTCCTATTTTCTGGTAAGAGATCCGACACTTCGTGCCTGAGGCCTCCTTCCACTAGTTGGGTCAGACCAGTGAAGATGGACGAGGCATCAATGGCCGACGGCTTTGCCCATGGGGTTGACAAGGCAATAATACTGATTAGAAAAGGGGCATCAGGAATCATTAATTTCCTAGACACCATTGGGAGGTGGCTACCAGTAGCCGAAGCAACTATAATACCATATTGTGAAACTTACACTGTGACAGGGATGTATGTCCATGTGAAGAATTGCCTCCCCAGAGGGTTACCTAAGCACTCAAAAATAATTTCCCCGACAATGATATACCTGGGGGAAGGTGACCCAGCCCATAACATCCAGCACTTGTTTGGCTCAGGTATAGCAAAATGGGTTCTAGTCTTACTCGGGGTTCTGGGTGAGTGGTATGGAGAGTTGGCCTCTACAATATACTTACTACTAGAGTATGGATCTGAGTGGTTGGAACATGAAAGCTTGATTACGGAAGGGTTGATCCCTGGCATCAATATCACGATAGAACTCCCAGCCAGTCAAACAGTGCCTGGTTGGGTGTGGGTCGCAGGCCAGTGGGTATGTGTGAAGCCAGACTGGTGGCCCACACAGATTTGGATAGAAACCGTGGTGGCAGAGGCCTGGCATATATTAAAAATACTGGCATCAGCCCTTGTGAATATAGTCACTGCATTTGTAAACCTGGAACTGGTCTACCTAGTCATAATATTAGTCAAAATATCAAAGGGGAACCTAATAGGCGCCATATTATGGTGCCTGTTATTGTCAGGGGCTGAAGGCTCGTGCCACATAAGACAAGACTATTACAACATCCAGTTAGTTGTCGAAGAAAAAACAGGTGTAGAAAAACGATCCATAATGGGCAAATGGTCCGTGATAACCAGGGAAGGTCGGGAACCAAAATTAATGGAGCAAATAAATATAGTGTCCAATAATAGCCTGTCAGAAACTTATTGCTATAATAGGCTAAATACCAGTAGCTGGGGGCGGCAACCGGCAAGACAGAGAGGGTGTGGTCAGACCGTACCCTATTGGCCTGGTGACAATGTCCTGGAAGAACAATATTATAGTACAGGTTACTGGGTGAACGCAACGGGCGGTTGCCAGCTGAGAGAAGGTGTGTGGCTATCAAGAAAAGGCAATGTACAGTGCCAGCGAAATGGCTCATCCTTGATACTGCAATTAGCAATAAAAGAAGAGAATGACACTATGGAAATACCATGTGACCCGGTGGAAACAGAAAGCATGGGTCCAGTTGCACAGGGCACTTGCGTATATAGCTGGGCATTCGCCCCAAGAGGGTGGTATTATAATAGGAAAGACGGTTATTGGCTTCAGTACATAAAGAAAAACGACTACCAGTACTGGACAAAAATGCCTACTGCCTCGTCCGCTGCGACAATGTACCGCCATTTGCTTCCCTTACTGGTGGCCTGCCTCATGGGTGGCAGGATATCGGTGTGGATTGTAGCAATGCTCCTATCTCTACAGGTGGAAGCTAGCGAAGTGGGTACCAAGCAACTGGCTGTCACACTAACTCTGTGGAAAATGGACTGGACAGAACTACTTTTTTATATTGTCATAATGCTAGCTGTCAAGGAAGAACTCATAAAGAAAGTAGTGACTGCCAGCCTAGTGGCCTTAAAAAATAGTCCAGTGGCCCTGAGCTTTCTTATTGTACTCAGGCTTGTGGGGGGCAGTGAAGCACTCCCAGTGGGTTTGCTGTTAGAAAAGATGTGCATAGACCAACCGGAGTTTGGAACCCCCTTCCTGATCTACCTGTGGGATAATTGGAAGTGGACTGTACTAGTCAGCTTCTCCGCGCTGAACCATGAAAAAACTATAAAACTGGCAAGAAAACTGTTACTGGCCACACATATAACAGCGCTCACATTGACTGGTCTGAGTGATTCAATCTTCTACATGATGCTTATAATGACCAACTTACTAATAAAAACATTCATATATCTACTGGGGGCCAGCATAAATTGGGTCGAGAAAGAAAAAAGAAAATTGCTGGTAAAGAGGAAATTAATATATAAGAAAGCCGCAATTTGTAATCAGGAAGAGAATGAATTGGAGAATAAATTTAACAGGATAACTGTAAATGCGGATTTCACCCCATGCAAACTTGAACTCTTACAATTACTTAGGGCTTTTTTAGTCTCTTTATGTTTTTCCTATTACAAGCCTCTCCTGTATGCAGAGACCACCCTAACTGTTATAGTAATTGGCGTACAAGAGTACAATGTAGCAATAGCCCGTGGGCGAAGTGTGATCCATAGACTACTAGCCATGGCCTACTACGTATATGGCCGCATACAGGGTGACATGTTCCAACTCGCCACTATCCAGTGCCTGTTGTCAAGCCCGAGGAAAATTATGAAACACATGATAGAAAATCCAACTCTTAAGAAGCTCTGGCAAGGCGAAACAGAACTTTTTAACCAGGGTGTCAGCCAGTCCAAAATAGTGAATCCGAGGAAAATTGGGCTGGAGGAATTACATAAGGGCATGTGCGGCCTCCCAACTGTAGTGCAAAACCTGGTCATATATGCAAAGAAGAATGACTCTCTCATTCTAGGAGAGTTGGGTTACCCCCCTGGGGACCTCACCAGTGATGGGTGGGAAATTTTAGGCCCTGGCAGAATCCCAAAAATCACCAACGTTGAGTCTGCTAAAATGGACTTACTCTCCAAACTCATGACCTTTCTGGGGATTGAAAGCTCAAGGGTCCCCAGAACCCCAGTCCACTCAACTAGGAAATTATTAAAGATAGTAAGAGGCCTGGAAACTGGATGGGGGTACACTCATGCAGGAGGAATCAGTAGCGCGAAACACGTGACAGGCGAGAAGAACTTGATGACCCACATGGAGGGTAGGAAGGGCAAGTATATCCTACAATCCCAAGAACATGGTGCCGATGAGGTAGAATATGGAGTAAAAACTGACCAAAAAGCACCCGACAATGCCTTATGCTACTGCTTCAACCCTGAAGCCACAAACATAAAAGGTGAAACGGGAGCCATGGTGTTCATGAAGAAGATAGGAAAAAAATGGACTCTCGTAACATCAGATGGTAATAAAGCCTATTATAACGTAAACAACCTGAAAGGGTGGTCTGGACTACCAATAATGTTGCACTCCACCGGGGCCATAGTAGGGAGGATTAAGTCAGCATATTCGGATGAAAACGACTTGGTGGAGGAACTTATCGACTCCAGGACCATCAGCAAGAGCAATGAGGCAAACCTGGATCACCTTATCAAGGAACTGGCAAATATGCGGAGGGGGGAGTTTCGCTCAATTACTCTTGGAACGGGAGCTGGGAAAACTACCGAGCTGCCCAGGCAATACCTCACAACAGTAGGAGCCCATAAATCTGTGTTGGTCCTAGTCCCCTTAAAAGCACCCGCTGAAAGTGTCTGCCGCTTCATGAGATCCAAATACCCTACCATCAATTTTTCCTTGAGAGTGGGGGAGCGGAAAGAGGGAGACGTGAGTAGCGGCATCACTTACGCTACTTACGGATTCTGCTGTCAGCTAAACCTGGTCCAACTCAAAGAGTGGATATCCAGGTACTCAATGGTGTTTTTTGACGAATACCATACGGCTACTCCAGAACAGATAGCTATAATAAGCAAGATCCATGCCCTAAAAATCAAAACTAGGATAGTGGCCATGTCAGCAACCCCCCCGGGCACCGTGACAACTGAAGGCAGGAAATTTGATATTGAAGAGGTCGGGGTTGCTACTATAGAGAAAGGAGAGGAACCAAAAAGGGGGCGTATAGCAGTCGCCGGTATGCAGGTACCGTTGGAAGACTTGACAGGGAAGAACTGCCTGGTGTTCGTAGCAACTAAAGAGGCCGCGGAGACAGAAGCCAAAGAACTGCGCACCAGGGGAATTAATGCCACTTACTACTATTCAGGTATAGATCCTAAGACTCTAGAGCATGGGATGACCAATCAGCCATATTGTATTGTGGCCACTAATGCCATCGAATCAGGTATAACCTGTCCTGATTTAGACGTGGTCATAGACACCATGCAGAAGTATGAAAAAGTAGTGAATTTCTCCGCAAAGATGCCCCTGATTGTCACGTCGTTAGTAAAGAAAAAAATCACCAGGGAAGAACAGGGCCAGAGGAAAGGCCGAGTGGGTAGGCAAAAGAAAGGAAAATACTACTATCCTTCGGGGGTGGTACCGAATGGATCAAAAGACCTAAGCTATTTAATCCTGCAGGCTCAAGAGTATGGCGTTTTGGAACAAGTGAATATAACAGAGTACTTCATCATAATGAATGAGGACTGGGGTCTTTATGATGTAGATGAGGTGGAGGTGAGAATACTTGAGAGAATGAATAAGGAAATCCTGCTCCCACTAGGTATCGTGGAGAAGCAAATCCTGGAAAGAAGTACTCACCCAGAAAAAGTAGCACTGTTGTACAATAAATTAGTGCAGAAAAGCCCCATAGTATACCCTAAAGTACAGGAGGGTGAGGTTAGCAAGGAATACAACACCCATAATCTGGCCGTATACGACAAGCTAAAAGATGTCAACCCACAAGCTATTTACGTCCTGGCTGAAGAAGAGAGAGCCACTGAAATGATGGGCCTCGAGTTTGAACAAGATCCATCTGACTTACAGGATTCGGTGGCCCAGCTTTGTGAAGATATCAAGAGGTATACAAAGCTCTCTGGGATTACTGAGAAATTACTAGTAGGCACGATGGTGGGGTATATCGGATACAAAGCCTTAACCAGAAATCACGTGCCCTGGGTCAGTAAAGAGTATTGTTATGAGCTGACTGATTCACCGGATACTTACGAAAACTCGTTTGCACCTCTGGACGTCGACGTCCAAAACCCCAGTGAGGGCAAACACCCAGAGCAACTGGCAGACCACCAACTGAGGCAACTACTAGAGACTGGGAGAGACAAGGCAATTGATTTCCTAAAAGGTATCCGCGAGTTCACCAGCGGGGCCATAAACAGTCCAAAGGCACTAAGTATATGGGAAAAAATTTATCAGTACTTGAGGAAGCATCAGGGCGAGATTGTCTCATCAGCGGCATGGGGCAGTGCAACGGCCCTTCACGACAGTATCAAATCTAGGCTAGGGGATGAAGTTGCCACTGCAGTAATAATCCTCAAGTATCTGGCATTTGGTGAAAGAGAGCTGTCTGGGCTGACTAGGCAAGTCCTAATTGACATCATAGTATATTATATAGTCAACAAGCCCCGGTTCGAAGGAGACGACTACGCAAAGAGAAAGGGAAGAAGGCTAGTCGTTGAAGTCTTGATGGGGGCACTGGCGACTTATGCAGTGTCCAATTTTTGGGGCGTGTCCATCAACAAGATACTGCAACCAATATCTGATTATTTACCCTACGCCACCGCTACTTTGGCTTTCCTTCGTCCAACCTTCATGGAATCAGCAGTGGTGGTCGCTTCCTCTATCTACAGGGCTTTTCTCTCCATCAAACATGCGGAAAACAGGAGTCTTGTCACGCAGGTCGCTTCTGCTGCCCTTGAAGTCATGGGTTTGACCCCAGTATCAGCCGGCCTAGGCGTCTTGCTAGGGCTCGGGCTGTGTGTGCTCCATATGAACATCGACAAAAACGAGGAGAAAAGGACACTGATACTGAAAATGTTTGTCAAAAACTTTATAGACCAGGCGGCACTGGACGAGTTAGATAAACTAGAGCCAGAAAAAATAATCCTCTCATTGTTGGAGGGTATTCAAACTTGCACAAACCCGGTCAGAGCAATCATGATTTTGTATAGGGTGTATTACAAAGGAGAATCATTCACAGAAGCCCTGTCTAGGATGGCTGGCAAATCTCTCATTGTGATGGTCATTGTCGAGTTTCTGGAACTGACGGGCCAGACCCAAGGGGGGTATATAGATCTTAGTTCCAACTTGCTGACCTTTCTCCTGGAAAAACTGAAAAAGATGACCAACCTTGCCATCGGGGAAGCCAGAAAGGCCTTACTTCCTATTCCATACTTGTACTGTGAAACCTGGCAGACCGATGCCAGAATCAAGGCCCCTGAATCCTATGACCAAGTGGTGGTGGAATGCAAATGTGGTGCTTCAGCAAGGTATTCCTTCCACCATGGGGCTCATGAGATATTGGAAGAAAAAAAGACCAAGTGGTGCAAGAATTTCTTCCTATGGGGACCTAATTTTCACAACCCAGACCCAAAGAGAATGACATTTTATGAGTACGGTCAAGCAAAAAAGTGTCCTGTCATCATAATGGGTGAAGACATAACCTTCGGCAAATATGGTATATATGTCAAATTTGGCCATAGGTCTGATGGGAAGAGGCTAATAAGAGGCACCACCCACGCTACTATCAGTAGGGAGGAACTACTGGAGATCTTAACGGCCCCAAGCCAAGTGGCCATAGGCAAAGTCAAGCTGACTGATTACTGCAATCAAAAAGGAATAATAGACAGGAAATTGGCCGTACTTGAAGGTGACAAAATACATTTTTGGAAAGCACACCGTGGATCCAAGATCACAGATCAACTCACCATTGAGAGTCTGACAGATAATTTGGGGTCGGAAATTAGGGATATTACATGGGAGCTGTACACAGGTGGAACGTGCACCGTAAAAGGGATATCCCTTAGATCGTGCGCACCAGATCAAAGAAATAAGGCTATGGTCTTGTGTGATTGCACCGATGTGCTTAGCCCTTGCTACCTAGTCAACGGCAGGAGACCATCCCCATTTGACGTTGTGGAAGGTTATGAATGCCACCATCGGAAGCCCCGAGCGACGTATGAAGACCTAGAAATGGAGGAAATACTAAAGAGACGAGTCCCTGTTTACGATCCTTTGTGTTTGTTTGACACTGATAGTAAAATACTGCCTCCTGATACTTACTACTTGGAAGAAGACCAAGAAGACTTTGAGTACGCATTGAGATGCTGGGGCCTGGGGGTTTATGTGGCGGACGGGCCCGTCACTTCACCCCCGGACATAAGAATACACCACAGTTCTATATTGCTACTGTTGACACCTGGAGTGGACTCTGAGCTACCCTTACAGTATATACGTTGCTACCCTCATCAAGCAGAGGTGGACATCTATGTCAGGGGCCAGCTCCTAGAGGAGGAAGACACTGCCACGGAGGCGGAAGGCTCTCAGGAAGATGGTGAAGAAGGGATGGGTGACATGGTAACAGAAGATGAGGATATATTGTCCACAACTGAATCAATGCCCCCACTAGAAGGGGAGGAAGGAGGCGAAGAACCAATTACTTATGTGGTCATCAGGGGATTACAAGAAGAGAGATACACTAGTCACCTTAAATTAAGCGACTGGATCAGTGAAAACATCTCGGAGCCACACAGGGTCCAAATCATGCTTGATGGAACAGTGAGGGTCACAATAAAAGAGGGCAAAGTGAAACACCTATTTGGGGTCTACAGAGTCGAAAACTCCCTGGAAGCAATGTTTAAAGAGACCATAGCTGACCTCCCTGTAGCCACTCGACCGCCCCGAGGGCCAATCTACACGGCCAAAGAGTTGGCCCAAGGGAATATTGCCCCTATCCAACCCGCAGTGAATTATTATGGAATGGTAGAAGGGAGAGGTGACCCAATGACTGCATTCGAAGCCTTATCAGTCCTGCGTTCACAAAAAGTCTTAGTCAAGGAAGTGAAGGTGAATACCCGCAGGGCACAAGCTTTTTTAAATAAAATCAGGGAAACTGCCGAGGTCAAAGCACCGGAATTAACACTTAAATGCTTACCAGCACTCGGGAAAATAAACGGGAGGAAATTGATCAGAGAGGAAACCAACATCCCCAACCAAAGGTTGGCATCAATAATGACCTCAATAGGAATTAGACTAGAGAAACTGCCAGTGGTTAGAGCAAACACCTCTGGTTCTAAGTTTAGGCAGTCAATCCTAGAAAAAATGGATAAATATGAAAATGAACAAGTCCCGGGGTTACATGAGAAAATGTGGGCAGCTTTTCTGGCAACTGCCAGGCAAGACTTAAGAGGCACATATGAGGAAGTAACCTATCTTGAACTGGAGACCGGAATCAACCGGAAAGGAGCCCCAGGTTTCTTTGAAAAGGAAAATTCAATAGGAGAAGTGCTGGAAAGAAAGGAAAGAATTGACGGCGTGATCCAGGAGATTGAAAAAGGCAACCATTTATACTATGAAACAGCTATGCCAAAAAATGAGAAAAGGGATGTGCTTGATGATTGGTTATCTGAGGACTTCGTCACTTATAAGAAACCACGTGTGATACAGTACCCTGAGGCAGTTACCAGGTTGGCCATCACCAAAATTATGTACAAGTGGGTAAAGCAGAAGCCTATAGTGATTCCCGGCTATGAGGGGAAAACCCCGATCTTTGAAATATTTGAAAAAGTCAGTGCAGATTGGGCTCAGTTCAGAAATCCGGTAGCCGTTAGCTTCGACACCAAAGCCTGGGACACTCAAGTAACGAGGGAAGACCTCAGGCTGGTAGGACGGATACAGAAATACTACTATAAAAAGAGGTATTGGAAATTCATTGACAACTTGACAGCCATGATGGAGGAAGTGCCTGTAGTCACTGTAGAAGGAGACATGTTCCTCAGAGTCGGACAACGCGGGTCCGGACAGCCTGACACCTCAGCAGGCAATTCTATATTGAATGTGCTGACAATGTTAGTAGCTTTTTCTGAATCCACAAACTTGCCCATAGCGGCTGCCTGGAAGGCCTGTCGGATCCACGTCTGTGGGGATGACGGTTTCCTGATTACGGAATCAGAATTAGGGAGGAAATTCGCTGAAAAAGGTGTCCCTTTGTTAGCTGCATTCGGCAAACCCCAAAAAATTACAGAGGGAGCAAGCCTAAAGGTAACCAGCAACTTTGATGGAATAGAGTTTTGCAGCCACTCCCCCATCAGAGTCCAAACACCAAATATAAGGTGGATGCCAGCGAGACCCACAGCAACAATTCTAGGCAAAATGAGTACTAGGTTGGGTGAGGGTGCCACTAGATCAGGAGAAGAATATGAAAAACAGGTGGCGTTTGCGTATCTACTGATGTACCCTTGGAACCCACTGGTCAGGAGAATCAGCCTCCTATTGCTATCGACCACTGACCCAATGGGGAAAGAGGAAACCCCATGCTCCGATGAGGGGGTAAAGTATGTCGGGGACCCCATAGCCGCATACAGGGACGTATGGGGGCATAAGTTAGAGGATATAGGGCATGTTGACCAACCGCAGTTATCCCGGATGAACTATAGCATGACTTACCTAGGGATCTGGAAACCAAAGACGAGCCAGCGGCTAGTCGAACAGTGCTGTCGACTGGCTGAGAAAAGCAATTGTGTGGTGCGTGCTGATTCCCTAATTAAGAAAAAGGTCAAGATCACTTATGACCCGGGGATAGGAGTGGCTCAGGTCATTCGTAGGTGGGAAGAGCTCGAGTGGACCAGAAGGAAACCCGAATTCACTAATGCAACTGGAGAAGATGATATCTTCCTAGCCTTGTGGAAGAGACTCTCAAAGTACATTTTCCAGAAAATAAAGTTCATGCAGAGAATGCTCACCCCTTATTAA
| 5,525
|
MZ542765.1
|
Atypical porcine pestivirus 1
|
Ren,X.J., Hu,Z.H., Qian,P., Chen,H.C., Li,X.M.
|
Huazhong Agricultural University, State Key Laboratory of Agriculture Microbiology
|
China
|
2022-05-02
| null |
Pestivirus scrofae
|
Pestivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 11,454
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Sus scrofa
| null |
2021-02-06
| null | null |
Atypical porcine pestivirus 1 strain CH-HB2021, complete genome
|
TGCTTTGATTGGCTGCATTATGTGTGGGACATCCTAAATTGTCATAAGCCCTGCGGTGAGTGGGGGAAAGGGGTTAACCAGGCCTCTAGTACCACAGGCACCTATGGACAGGGCAACTCAAACCTGAGAGAGAGGTACCGAACTCTTAAGTCCCGAGTACGGGGCAGACGTCACCGAGTAGTACACCCAAAGACCACCATTTCTAGGTGTAGGGTCTACTGAGGCTCGGGTGGACGTGGGCGTGCCCAAAGAGAAATCGGTGGTGGACCTGGGGGTCGGGGCCACCATACCCCGTTATGGGGTAGACCTTACTGCTTGATAGAGTGCCGGCGGATGCCTCGGGTAAGAGTATAAAATCCGTTGTCTATTAACATGGAAAAACAGATTTCATACTATTTAAAAAAAGAAAAACAAAGAAATGGGTGGACGGAACTGGTGGTAGGTGAAAGTAGTACAAAAATAACTACGCTATCTGGAAAGACCTATCGAGGAACTTGGGAGATGGAGAAACGAACGAACCCTTACGGAACCTATCTCCCCAGACCTAGTCCTCAACAGCTCACAGCCCTACACCCCCACCCAGTGGTGAATTGTAAGGTGGTTGAGTACAAGGAGGTGGACCCTAATTATGGTGATTGCCCGAATACAAATGGGGTGTTTATCGACGAAAAGGGTAGAAGGCTGAGCAGTCCTCCATTGGGTATTTGGAAGATAAGACTGGACTATAGCGACCTGGTAAATATAAATAGACCAATCCCCGCTAGTGGGATGAACTCTTACCGAGTCGAGACCTGCAGTGGGGAGATGGCTATTGTAACACCGCTACATGATAGGGTGCTTGTAGAAGACTACAGGGGACTATATCAATGGAAACCCAACTGTGAAGGGATAGTGCTCTATGTGAAAACATGTTCTGATTGGGCAGACCAGGTTGAAAAACAAGAGAGGGAAAGTCCTCCAAAACCCCAGCGACCACCAAGGCGAGACCCACGGAAAGGGTTGCAACCACAAGTCCCCAAAGAGACTGAGGTCACAGAAAAGAAGAAACAACCCAGTGTTACCTTAGTATCAGGGGGGCAGAAGGCCCAAGTTATCTACAAAGGCAAGACTAAGAATAAAAAGACTCCGGATGGAATCTATAAGTATCCAGGAGCCAAAGAGGGGGACGTAGTGAAGGTCAGGAAGATGTTGAAGAATTGGCATATAGCCTTAGTAATGTACCTGATGTATATCATAACCCCAAGCTTTGCTAAGGTCCAGTGGTTCTTAAAGGATGAAAACTCGACAGGGATCAGTCAGATACTGTGGCAAAGACGAATCAATAGATCCCTGCATGGAGAATGGCCTAACCAGATTTGCCACGGCATGCCGAATGAAACTATCACGGATGAGGAATTACGTAGTCTGGGAATGATAGATACAAGCCCCAGAACAAATTACACCTGTTGCCAGCTGCAATATCATGAGTGGAAGAAACATGGTTGGTGCAATTACCCACAAAAACAGGCTTGGATCAGGAGGATAACAGCCTTACAAGCTAACCTCACTGGAGGCTATGAGGGACCTGAATGTGCTGTCATCTGTCGATTTAATGGCAGCCATAACATAGTAAAACAGGCCAGAGACGAGGTGAGTCCACTGACAGGGTGTAAAGAAGGGCACCCTTTCCTATTCTCTGGTGAAAGATCCGACTCCTCATGCCTGAGGCCTCCTTCCACTAGTTGGGTAAGACCAGTAAAGATGGACGAGGTATCAATGGCCGACGGCTTCGCTCATGGTGTCGACAGGGCAATAATCCTGATTAGAAAAGGGGCATCAGGAATCATCAATTTCCTAGATGCTATTGGGAGGTGGTTACCTATAGCTGAAGCAGCTATAGTACCATATTGTGAAACTTACACCGTGACGGGGATGTACGTCCATGTGAAGAATTGCCTCCCTAGAGGGTTACCTAAGCATTCAAAAATAATTTCTCCGACAATGATATATCTGGGGGAGGGTGACCCAGCCCACAACATTCAGCACTTGTTTGGCTCAGGTATAGCAAAGTGGGTCCTAGTCTTACTTGGGGTTCTGGGTGAATGGTATGGAGAATTGGCCTCTACGATATATCTACTATTAGAGTATGGGTCTGAGTGGTTGGAACATGAAAGCCTGGTCACGGAAGGGTTGATCCCTGGCATTAATATTACAATAGAACTCCCAGCCAGTCATACGGTGCCCGGTTGGGTGTGGGTCGCAGGCCAGTGGGTATGCGTGAAGCCAGACTGGTGGCCCACACAGATTTGGATTGAAACCGTGGTAACAGAGGTCTGGCATATACTAAAAATACTGGCATCAGCCCTGGTGAATATAGTCACTGCCTTTGTAAACCTGGAACTGGTCTACCTGGTCATAATATTAGTCAAAATATCAAAGGGGAACCTAATAGGCGCCATACTATGGTGCCTATTACTGTCAGGGGCCGAAGGCTCGTGCCACAAAAGACAAGACTATTACAATCTCCAGTTAGTTGTCGAAGAAAGGACAGGCGTAGAAAAACGGTCCATAATGGGCAAGTGGGCTGTGATAACCAGAGAAGGTCGGGAACCAAAACTAATGGAGCAAATAAAAATAGTGTCGAATAACAGCCTGTCAGAAACTTACTGCTATAATACGCTAAATACTAGCAGTTGGAGGCGGCAACCGGCAAGACAGAGAGGGTGTGGCCAGACTGTGCCCTATTGGCCTGGTGACAACGTCTTAGAAGAACAGTATTACAGCTCAGGCTACTGGGTGAATGCGACGGGCGGTTGCCAGCTGAGAGAAGGTGTGTGGCTGTCAGGAAAGGGCAATGTACAGTGCCAACGCAATGGCTCATCCTTGATACTGCAATTGGCGATAAAAGAAGAGAATGACACTATGGAAATACCATGTGACCCGGTGGAAACAGAAAGCATGGGTCCAGTCGCACAGGGCACTTGCGTGTACAGCTGGGCATTCGCCCCAAGGGGGTGGTACTATAACAGGAAAGATGGTTATTGGCTCCAGTATATAAAGAAAAACGATTACCAGTACTGGACAAAAATGCCTACCGTCTCATCCGCCGCAACGATGTACCGTCATCTGCTCCCCCTACTTGTAGCCTGCCTCATGGGCGGTAGGATATCAGTGTGGATTGTGGCAATGCTCCTATCTCTACAGGTGGAAGCTAGTGAAGTAGGTACCAAGCAATTGGCCGTCACGCTGACACTGTGGAAAATGGACTGGACAGAATTACTCTTCTATATTATCATAATGCTAGCCGTCAAGGAAGAACTCATTAAGAAAATTGTGACTGCAAGTCTTGTGGCCTTGAAAAATAGTCCAGTAGCCTTGAGCTTTCTTATTGTGCTCAGGCTTGTGGGAGGTAGTGAAGCGCTCCCAGTGGGTCTACTATTAGAAAAAATGTGCATAGACCAACCGGAATTTGGAACCCCTTTCCTGATCTACCTGTGGGACAATTGGAAGTGGACTGTACTAGTCAGCTTCTCCGCACTGAATCATGAAAAAACTATAAAACTGGCAAGAAAACTGCTATTGGCAACACACATAACAGCGCTCACATTGACTGGCCTGAGTGACTCAATCTTCTATATGATGCTTATAATGACCAACCTACTAATAAAGATATTCATATACTTATTGGGGGCCAGCATGAATTGGGTCGAGAAAGAAAAAAAGAAGTTGTTAGTTAAGAGGAAATTAATATATAAGAAAGCCGCAGTCTGCAGACAAGGTGAGAATAAGTTAGAGAATAAATTCAACAAGATAACTGTAAATGCGGATTTCACCCCATGTAAACTTGAACTTTTACAACTACTCAGGGCTTTTTTAGTCTCTTTATGTTTCTCTTATTACAAGCCTCTCCTGTATGCCGAGACTACCTTGACTGTTATAGTAATCGGCGTACAGGAGTATAACGTAGCTATGGCCCGCGGGAGAAGCGTGGTCCATAGACTACTAGCCATGGCCTATTACATATATGGCCGCATGCAGGGGGACATGTTCCAGTTAGCCACTGTCCAGTGCCTGTTGTCAAGCCCGAGGAAAATTATGAAACACATGATAGAAAATCCAACACTCAAGAAGCTCTGGCAAGGCGAAACTGAACTTTTCAACCAGGGCGTCAGCCAGTCCAAAATAGTGAATCCAAAGAAAATTGGGCTGGAAGAGTTACACAAGGGTATGTGCGGCCTCCCAACTGTAGTGCAAAATTTGGTCATATACGCAAAGAAGAATGACTCTCTTATTTTAGGAGAGCTGGGTTACCCCCCTGGGGATCTCACCAGCGATGGGTGGGAAATTTTAGGTCCTGGCAGAATCCCAAAGATTACTAATGTTGAGTCTGCTAAAATGGACTTGCTCTCCAAACTCATGACCTTCCTGGGGATAGAAAGTTCAAGGGTCCCCAGGACCCCAGTCCACTCAACGAGGAAATTGCTGAAAATAGTCAGAGGCTTGGAAACTGGATGGGGGTACACTCACGCAGGGGGGATCAGTAGCGCAAAACACGTGACAGGTGAAAAGAACTTGATGACCCACATGGAGGGTAGGAAGGGCAAGTACATCCTACAATCCCAAGAACATGGTGCTGATGAGGTAGAATATGGAGTAAAAACTGATCAAAAAGCACCAGATAATGCCTTGTGCTATTGCTTTAACCCTGAAGCTACAAACATAAAAGGAGAAACGGGAGCCATGGTGTTCATGAAGAAGATAGGAAAAAAATGGACTCTCGTAACATCAGACGGTAATAAAGCTTACTATAATGTAAACAACCTGAAAGGGTGGTCTGGACTACCAATAATGTTGCACTCCACTGGGGCCATAGTGGGGAGGATTAAGTCAGCGTATTCAGATGAAAACGACCTGGTGGAGGAACTCATTGACTCCAGAACTATCAGCAAGAGCAATGAGACAAACCTGGACCACCTTATCAAGGAATTGGCAGATATGCGGAGGGGAGAGTTTCGCTCAATTACTCTTGGAACGGGAGCTGGGAAAACTACGGAACTGCCCAGGCAATACCTCGCAACAGTAGGTGCCCATAAGTCTGTGTTAGTTTTAGTCCCTTTAAAAGCACCCGCTGAAAGTGTCTGCCGCTTTATGAGGTCCAAATACCCTACCATCAACTTTTCCTTGAGAGTGGGGGAGCGAAAAGAGGGAGACGTGAGCAGCGGTATCACTTACGCTACCTACGGATTCTGCTGCCAGCTAAACCTGGTACAACTCAAAGAATGGATATCCAGATACTCAATGGTGTTTTTCGACGAATACCACACAGCAACTCCAGAACAAATAGCCATAATAAGTAAGATCCATGCACTGAAAGTCAAGACCAGGATAGTGGCTATGTCAGCGACTCCCCCGGGCACCGTGACGACTGAAGGCAGGAAATTCGATATTGAGGAGGTTGGCGTTGCTACCATAGAGAAAGGAGAGGAACCAAAAAGGGGGCGTATAGCAGTCGCCGGTATGCAGATCCCATTGGAAGACTTGACAGGGAAGAACTGCCTGGTGTTCGTGGCAACCAAAGAAGCTGCGGAGACAGAGGCCAAAGAATTGCGTACCAAAGGAATTAATGCCACCTACTACTATTCAGGTATAGACCCTAAGACACTGGAACATGGGATGACCAATCAGCCATATTGTATCGTGGCCACTAATGCTATTGAATCAGGCATAACCTGCCCTGATCTAGACGTGGTCATAGATACTATGCAGAAGTATGAAAAGGTAGTAAATTTTTCAGCAAAGATGCCCTTGATTGTCACTTCATTAGTAAAGAAAAAAATCACTAGGGAAGAACAGGGCCAGAGGAAAGGTCGAGTGGGCAGGCAAAAGAAGGGAAAATATTACTATCCTTCGGGGGTTGTGCCGAATGGGTCAAAAGACCTAAGCTATCTAATCTTGCAGGCTCAAGAGTATGGTGTCTTGGAACAAGTCAACATAACAGAATACTTCATCATAATGAATGAGGATTGGGGTCTTTATGATGTAGATGAAATAGAGGTGAGAATACTCGAGAGAATGAACAAGGAAATTCTGCTCCCGCTAGGCATCGTGGAGAAGCAAATCCTGGAAAGAAGTACCCACCCGGAAAAAGTGGCACTGTTGTATAACAAATTAGTACAGAAAAACCCTATAGTGTACCCTAGGGTGCAGGGGGGTGAGGTCAGCAAGGAATATAATACTCATAATCTGGCCGTATACGACAAGCTAAAAGATGTCAACCCACAAGCCATCTATGTCCTAGCTGAAGAGGAGAGAGCCACAGAAATGATGGGCCTCGAGTTTGAACAAGATCCATCTGACTTACAGGACTCAGTAGCTCAGCTTTGTGAAGACATCAAGAGGTATACAAAACTCTCTGGGATCACTGAGAAATTACTAGTAGGTACGATGGTGGGGTATATCGGATACAAAGCCTTAACCAGAAACCATGTGCCCTGGGTCAGTAAAGAGTATTGTTATGAGCTGACTGATTCACCGGATACTTACGAAAACTCATTTGCACCTCTTGATGTCGACGTCCAAAACCCCGGCGAAGGCAAACACCCAGAGCAACTGGCAGACCACCAACTGAGGCAACTACTGGAGACTGGGAGAACCAAGGTTATTGACTTTTTAAGAGGAATTCGGGAGTTTACTAGTGGGGCCATAAATAGTCCAAAGGCACTAAGTATATGGGAGAAAATATATCAGTACTTGAGGAAACATCAGGGTGAGATCATCTCATCAGCGGCGTGGGGCAGCGCCACGGCCCTTCATGACAGTATTAAATTTAGGTTGGGAGATGAGGTTGCCACTGCAGTGATAATCCTAAAGTATCTAGCGTTTGGTGAAAGGGAATTGTCCGGACTGACCAGGCAAGTCTTAATCGATATCATAGTATATTATATAGTCAATAAGCCCCGGTTCGAAGGAGATGACTACGCAAAGAGAAAAGGAAGAAGACTAGTCATTGAAGTCCTGATGGGGGCACTGGCTACTTATGCAGTGTCCAATTTCTGGGGTGTGTCCATTAACAAGATACTGCAACCAATATCTGATTATCTACCCTATGCCACCGCCACTTTGGCTTTCCTCCGTCCAACCTTCATGGAATCAGCAGTGGTGGTCGCTTCCTCTATCTATAGAGCCTTTCTCTCTATCAAACATGCGGAAAACAGGAGTCTTGTCACGCAGGTCGCTTCTGCCGCCCTTGAAGTCATGGGCCTGACTCCAGTATCAGCTGGCCTAGGCGTCTTGCTAGGGCTCGGGCTGTGTGTACTCCATATGAACATTGACAAGAACGAGGAGAAAAGGACACTGATACTGAAAATGTTCGTCAAAAACTTTATAGACCAGGCGGCACTGGACGAGTTAGACAAGCTGGAGCCAGAAAAAATAATCCTCTCATTGCTGGAGGGCATTCAAACTTGCACAAACCCAGTTAGGGCAATTATGATTTTGTATAGGGTGTATTATAAGGGAGAATCGTTTACAGAAGCCTTGTCTAAGATGGCTGGCAAGTCTCTTATTGTGATGGTTATTGTCGAGTTCTTAGAACTGACGGGCCAAACCCAAGGAGGGTACATAGATCTTAGTGCCAATTTGCTGACCTTTCTCCTGGAAAAACTGAAAAAGATGACCAACCTCGCCATCGGGGAAGCCCGAAAGGCTTTACTCCCCATCCCATACCTGTACTGTGAAACCTGGCAGTCTGACACCAGAATCAAGGCCCCTGAATCCTATGACCAGGTGGTAGTGGAATGCAAATGTGGTGCTTTAGCAAGGTATTCCTTCCGCCATGGGGCTCACGAGATGTTGGAAGAAAAAAGGACCAAGTGGTGTAAGAATTTCTTCTTATGGGGACCTAACTTTCACAACCCGGATCCCAAGAGAATGACATTTTATGAGTACGGCCAAGCAAAAAAGTGCCCTATTATCATAATGGGTGAAGACATAACCTTTGGCAAATATGGCATATATGTCAAATTTGGCCATAGGCCTGATGGGAGAAGGTTAATAAGGGGCACTACCCATGCCACCATCAGCAGGGAGGAATTGTTGGAAATCCTAACTGCCCCAAGCCAAGTGGCCATAGGCAAAGTCAAGCTGACCGATTATTGCAATCAAAAAGGAATAATAGACAGGAAATTGGCCGTGCTTGAAGGTGACAAAATACATTTCTGGAAGGCACACCGTGGATCCAAGATCACGGATCAACTCACTACTGAGAGCCTGACGGATGATTTGGGGTCAGAAATCAGGGACATTGTATGGGAGCTGTACACAGGCGGGACGTGCACTGTAAAGGGGATATCCCTCAGGTCATGCGCGCCAGATCAAAGAAACAAGGCCATGGTCCTGTGTGATTGCACTGACGTGCTTAGCCCCTGTTACCTAATCAATGGCAGGAAACCATCTCCATTTGACGTCGTGGAAGGTTATGAATGCCACCATCGGAAGCCCCGAGCGACGTATGAGGATTTAGAAATGGAGGAAATACTAAAGAGACGGGTCCCTGTCTACGATCCTCAGTGCCTGTTTGATACAGACAGTAAATTGCTGCCTCCTGATACTTATTACTTGGAAGAAGACAGAGAAGACTTTGAGTACGCGCTGAGGTGCTGGGGTCTTGGGGTTTATGTAGTAGACGGACCTATCACCTCTCCCCCGGACATAAGAATACACCACAGTTCCGTACTGCTACTGCTGACACCCGGAGCGGACTCTGAGCTACTCTTACAGTACATACGTTGTTATTCTCATCAGGCAGAGGTAGACATCTACGTTAGGGGTCAGCTTCTGGATGAGGAAAACACTGCTATGGAGGCGGAAGGCTCTCAGGAAGATAGAGATGAAAGGATGAGTGACGTGGTGACGAAAGATGAGGACACGTTATCCACAACGGAATCAATGCCCCCACTAGAAGAGGAGGAAGGGGCCGAAGAGCCAATTACCTATGTGGTCGTCAGGGGATTACAAGAAGAAAGATATGTTAGTCATCTTAAATTAAATGACTGGATCAATGAAAACATCTCAGAGCCGCATAGGGTCCAAATCATGCTTGATGGAACAGTAAGAGTCACAATAAAGGAGGGCAAAGTGAAACATCTGTTTGGGGTCTACAGAATCGAAAACTCCCTAGAAGCAATGTTCAAAGAGACCATAGCTAACCTCCCCGTAGCCACCCAACCACCTCGAGGGCCAATCTACACGGCTAAAGAGCTGGCCCAAGGGAATATTGCACCAATCCAACCCGCAGCAAATTATTATGGAATGATAGAGGGGAGAGGTGACCCAATGACAGCATTCGAAGCCTTATCAGCCCTGCGATCACAAAAAGTCTTAGCCAAGGAAGTGAAGGTCAACATCCGCAGGGCACAAGTCTTTTTAAACAAAGTCAGAAGAACTGCTGAGGTCAGAGCATCGGAATTAGTATTAAAATGTTTACCGGTACTCGGTAAAGTAAATGGGAGGAAATTGGTCAGAGAGGAAACCAATATCCCCAACCAAAGGTTGGCATCGATAATGACCTCAATAGGGATTAGGCTAGAAAAACTGCCAGTAGTTAGAGCAAACACCTCTGGCTCTAAGTTCAGGCAATCAATTTTAGAAAAAATGGACAAATATGAAAACGAACAAGTCCCAGGGTTGCATGAGAAAATGTGGGCAGCTTTCCTGGCAACTGCCAGACAAGATTTAAGAAATACATATGAGGAAGTAACTTATCTTGAACTGGAGACCGGAATCAACCGGAAAGGAGCCCCAGGTTTCTTTGAAAAAGAAAGCTCAATAGGAGAAGTGTTGGAAAGAAAGGAAAAAATTGACGCCGTAATTCAAGAGATTGAAAAAGGTGATCACTTATACTACGAAACAGCCATGCCAAAAAATGAGAAAAGAGACGTGCTTGATGACTGGTTGTCTGAGGACTTCGTCACCTATAAGAAACCACGTGTGATACAGTATCCTGAGGCAGCCACTCGGTTGGCCATCACCAAAATAATGTACAAGTGGGTAAAGCAGAAGCCTATAGTGATCCCCGGTTATGAGGGGAAAACTCCAATTTTTGAAATATTTGAAAAAGTAAGTGCAGATTGGGCTCAGTTTAAAAACCCGGTAGCTGTTAGCTTCGACACCAAAGCCTGGGACACTCAAGTAACAAGGGAGGACCTCAGACTGGTAGGACGGATTCAGAAATACTACTACAAGAAAAAGTATTGGAAATTCATCGACAACTTGACGGCCATGATGGAGGAAGTGCCTGTGATCACTGTAGAAGGAGACATGTTCCTTAGAGTTGGACAGCGCGGGTCCGGACAGCCTGACACCTCAGCAGGCAATTCCATGCTAAACGTGCTAACAATGTTGGTAGCCTTCTCCGAATCCACAAATCTGCCCATAGCAGCTGCCTGGAAGGCCTGTCGGATCCACGTCTGCGGGGACGATGGTTTTTTAATTACGGAATCAGAATTAGGGAGGAAATTTGCTGAAAAAGGTGTCCTTCTGCTAGCCGCATTCGGCAAGCCCCAAAAAATCACAGAGGGAGCAAGCCTAAAGATAACCAGCAACTTTGACGGGATAGAGTTCTGTAGTCATTCCCCCATCAGAGTCCAAACACCAAACACAAGGTGGATGCCAGCGAGGCCTACAGCAACAATTTTAGGCAAAATGAGCACTAGGTTGGGTGAGGGTGCCACCAGATCGGGAGAGGAATATGAAAAACAGGTGGCATTTGCATATCTACTGATGTATCCCTGGAACCCACTGGTCAGGAGAATTAGTCTCCTCTTGTTATCGACTACTGACCCAATAGGGAAAGAGGAAACTCCATGCTCCGATGAGGGGGTGAAGTACGTTGGAGACCCTATCGCCGCATACAGGGACGTGTGGGGGCACAAATTAGAGGATGTAGGGCATGTTGACCAGCCGCAGTTATCCCGGATGAACTATAGCATGACTTACTTAGGGATCTGGAAGCCAAAGACGAGCCAGCGGTTAGTCGAACAGTGCTGTCGACTAGCTGAGAAGAGCAATTGTGTGGTACGTGCTGACTCCCTAATTAAGAAAAAGGTCAAGATCACTTATGACCCGGGGATAGGAGCGGCTCAGGTCATTCGTAGGTGGGAAGAGCTTGAGTGGACCAGAAGGAAACCTGAACCCACTAATGCAACTGTAGAAGATGATATCTTCCTAATCCTGTGGAAGAGATTTTCAAAGTACATTTTTCAGAAAATGAAGTTCATGCAGAGAATGCTCGCTCCTTACTAATCGGGGGGCGCTCATTTAATTATAACCAGTATCTGGTAAGTATAAGACTTGTGTAAATAAAACATATAACTGAAAGGGGCAAGTGGCCATACAGGCTGGGGCGATCGCCGTTCCCCCCCTTTACTAGGCGCCTCATCCCCATGTACCATGGGGTTGTTGTAAATACTTGAATGA
| 30,924
|
MK216749.1
|
Atypical porcine pestivirus 1
|
Yan,X.L., Li,Y.Y., He,L.L., Wu,J.L., Tang,X.Y., Chen,G.H., Mai,K.J., Wu,R.T., Li,Q.N., Chen,Y.H., Sun,Y., Ma,J.Y., Xiaoling,Y., Yiyun,L., Lili,H., Jiaoling,W., Xiaoyu,T., Guihua,C., Kaijie,M., Ruiting,W., Qianniu,L., Yonghui,C., Yuan,S., Jingyun,M.
|
South China Agricultural University, College of Animal Science
|
China
|
2019-06-22
|
AH-GL-2017.04
|
Pestivirus scrofae
|
Pestivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 11,509
|
GenBank
| 1
|
China
|
China
|
Sus scrofa
| null |
2017-04
| null | null |
Atypical porcine pestivirus 1 isolate AH-GL-2017.04, complete genome
|
ATATGGGGCATAATGCATAGATTGGCTGCATTATGTGTATAACATCCCAAATTGCCATAGGCTCTGTGGTGAGTGGGGGAAAGGGGTTAACCAGGCCTCTAGTACCACAGGCACCATTTAACAGGGCAACTCAAACCTGAGAGAGAGGTACCGAACTCTTAAGCCTCGAGTACGGGGCAGACGTCACCGAGTAGTACACCCAACGACCACCACATTTAGGTGTAGGGTCTACTGAGGCTCGGGTGGACGTGGGCATGCCCAAAGAGAAAACGGTGGGGGACCTGGGGGTCGGGTCCGCCATGCCCCTCAATGGGGTAGACCTTACTGCTTGATAGAGTGCCGGCGGATGCCTCAGGTAAGAGTATAAAATCCGTTGTTTATTAACATGAAAGAACAAATTACATATTACTTAAAAAAAGAAAAACAAAGGAATGGGTGGACAGAACTAGTAGTAGGGGAAAGCCATACGAAGATAACCACACTCTCCGGGAGGACCTATCGAGGTACTTGGGAAATGGAGAAACGGTCCAACCCTTACGGAATCTACTTCCCTAGGCCAAGTCCTCAACAGCTTACGGCCTTGCATCCACACCCAGTCGTGAACTGTAGGATGATAGAGTACAAAGAAGCTGACCCTAACTATGGCGACTGCCCAAACACAAATGGAGTATTCATAGATGAAAAAGGCAGGAAATTTAGCGGACCCCCGTTGGGTCTCTGGAAGATAAGACTGGACTACTATGACTTGGTGAATGCTAAAAGGCCAACTTTCACAAGTGAACAGATCTCTTATCAAGTCGAAACCTGTAGTGGGGAGCTGGCCACCGTAACACCTACACGCGGCAGGGTGTTTGTGAATGACTACAGGAGATTTTATCAGTGGAAACCTAGGTGTGAAGGGATGGTGCTCTACGTGAAAACCTGTTCCGACTGGGCAGATCAAGTAGACAAACAAGAGAAAGAAAGCCCCCCGAAACCACAGAGACCACCGAGACGAGACCCACGGAAAGGGTTGCAGCCGCAAGTCCCCAAAGAAACCGAAATCACAGAGAAAAAGAGACAACCTAGCGTAACTTTAGTGACTGGGGGGCAGAAGGCTCAGATCATTTATAAAGGCAAGACCAAAAATAAAAAGACCCCGGACGGGGTCTATAAGTACCCAGGAGCTAAAGAAGGGGATGTAGTAAAGGTGAGGAAGATGTTAAAAAATTGGCACCTAGCTCTTGTAATGTGTCTGATATATCTTATAAATCCAAGCCTTGCAAAGGTTCAATGGTTTTTGAAGGATGAAAACTCGACAGGAATCAATCAGATATTGTGGCAAAGACGGGTCAACAGGTCCTTGCATGGAGAATGGCCAAACCAAATCTGTCATGGCATGCCAAATGAAACCATTACAGATGAGGAGTTACATAGCCTAGGGATGATAGACACTAGCCCAAGAACAAACTATACCTGCTGCCAACTACAATACCATGAATGGAAGAAACATGGCTGGTGTAATTATCCGCAAAAACAAGCATGGATCAGAAGAATAACAGCTTTACAATCCAACCTTACTGGGGCCTATGAAGGACCAGAATGTGCTGTCATATGTCGGTTTAACGGCAGTCACAACATCGTAAGGCAAGCCAGGGATGAGGTTAGCCCACTTACAGGATGCAAGGAGGGGCACCCTTTTCTATTCTCCGGTGAAAGATCTGAGGCTTCGTGCTTAAGACCGCCTTCCACTAGTTGGGTGAGACCAGTGAAAATGGACGAGGCTTCAGTGGCGGACAGTTTTGCCCATGGGGTAGATAAAGCAATAATATTAATTAGAAAAGGGGCTTCGGGAATTATAAATTTCTTAGACACTATTGGGAGGTGGCTGCCAGTAACCGATGCCACTATCATACCATACTGTGAAACTTACACCGTAACGGGGATGTATGTTCATGTCAAGCATTGCCTTCCTAGGGGGTTACCCAAGCACTCGAAGATAATCTCCCCAACGTTGATATACCTAGGAGAAGGCGATCCAGCCCATAATATCCAACATTTATTCGGCTCAGGCATAGCAAAATGGGTTCTAGTGCTGCTCGGGGTTTTGGGTGAATGGTATGGGGAACTAGCCTCAACAATATATTTAATACTCGAGTATGGCACTGAGTGGTTAGAACATGAAAACCTGGTCACAGAAGGGCTAATACCTGGCATCAATATAACGGTGGAGCTTCCTGCCAGTCATACGGTACCCGGCTGGGTATGGGTCGCGGGTCAGTGGGTATGTGTGAAACCAGATTGGTGGCCTACGCACATCTGGATCGAAACCGTGGTGGCAGAAGCTTGGCATGTGTTAAAGATACTAGCCTCGGCCTTGGTCAATATAGTTACTGCATTTGTGAACTTGGAATTGGTTTACCTGGTCATAATATTGGTCAAAGTATCAAAGGGTAACTTGATCGGAGCTATCCTGTGGTGCCTATTACTGTCAGGGGCCGAAGGATCATGCCATAAGCGACAGGACTATTATAATGTCCAATTAGTCGTTGACGAAAAAACGGGCATAGAAAAACGGTCAATAATAGGCAAATGGACCGTAGTGACCAAAGAGGGTCGGGAGCCAAGATTAATGGAACAGATAAATGTGGTATCAAATAGCAGACTGACAGAAATTTACTGCTACAATGAACTAAACACCAGCAGCTGGGGGCGACACCCAATGAAACAGAGGGGGTGTGGGCAAACTGTACCCTATTGGCCTGGTGACAATGTTCTCGAAGAACAATACTTCAGCACGGGTTACTGGGTGAATGCCACAGGAGGTTGCCAGTTGAGGGAAGGTGTGTGGCTATCAAGAAAGGGCGGTGTCCAGTGCCAACGTAACGGCTCATCTTTGATCCTGCAGTTGGCAATCAAGGAGGAAAATGACACCATGGAGATACCGTGTGACCCGGTAGAAACCGAAAGCATGGGCCCGGTGGCACAGGGCACTTGCGTGTATAGTTGGGCAGTAGCTCCAAGAGGATGGTACTACAACAGGAAGGATGGCTATTGGCTCCAATATATAAAGAAAAATGACTATCAGTACTGGACAAAAATGCCCGCGGCTTCGTCCGCTGCAACAATGTACCGGCATTTACTACCTCTGTTGGTGGCTTGCCTTATGGGCGGTAGAATTTCAGTATGGATTGTAGCAATGATTCTATCCCTACAGGTGGAGGCCAGCGAGGTAGGAACCAAACAGTTGGCCGTCACTCTAACTCTATGGAAGATGGATTGGACAGAGTTGCTCTTTTACATTATTATAATCCTGTCCATAAAGGAAGACCTCATAAAGAAGATAGTGACAGCAAGTCTAGTGGCTCTCAAAAATAGCCCAGTAGCCTTAAGCTTCCTAATTGTACTTAGGCTAGTCGGAGGTAGTGAAGCACTCCCAGTAGGGCTACTACTAGAAAAAATGTGTATAGACCAGCCAGAGTTTGGAACCCCTTTTCTAATTTACTTGTGGGACAACTGGAAGTGGACTGTCTTAGTCAGCTTCTCCGCATTAAACCACGAAAAGACCATTAGATTAGCGAGGAAACTCTTATTAGCTACACATATAACTGCACTGACATTGACTGGTCTAAGTGATTCAATTTTTTACGTAATGCTCATAATAACCAATTTACTGATAAAGACATTCATATATCTACTGGGGGCCGGCATTAACTGGGTGGAGAAAGAAAAAAGGAGGCTGCTAGTGAAAAGGAAGCTGATATACAAACAAGCCGTAGTTTGCCATCAAGATGAGGATGAACTAGTGAGCAAATTTAACAAAATAACAATAAACACGGACTTCACCCCATGTAGGCTTGAACTGCTGCAACTGCTCAGAGCTTTCTTAGTTTCCCTATGTTTCTCTTACTACAAACCCCTCCTATATGCGGAGACCACCTTGACCGTCATAGTGATTGGCGTACAAGAGTACAATATGGCCATGGCCCGTGGGCGAAGTGCAGTCCACAGGCTATTAGCTATGGCTTACTACATATATGGTCGCCTGCAGGGGGACATGTTTCAGCTCGCTACGATCCAGTGTTTGATGTCGAGTCCAAGAAAGATAATGAAACACATGATAGAAAACCCAATCCTCAAGAAGATCTGGCAAGGAGAAACAGAGCTTTTCAACCAGGGTGTCAACCAGTCTAAAATAGTAAACCCAAAAAAGATAGGGTTGGTAGAATTGCAAAAAGGTATGTGTGGCTTGCCGACTGCAGTTCAAAACTTGGTCATATATGCAAAGAAGAATGACTCCCTCATTCTAGGAGAGGTAGGTTATCCGCCTGGAGACCTCACCATTGACGGGTGGGAAATACTAGGCCCTGGCAGGATCCCAAAAATCACTAACGTAGAGTCCGCTAAGATGGACCTACTATCTAAACTAATGACATTCCTGGGGATTGAAAGTTCGAGGGTCCCTAGAACCCCAGTCCACTCCACTAGGAAACTACTGAAGATAGTAAGAGGCATGGAAACTGGGTGGGGGTACACCCATGCTGGAGGAATTAGTAGTGCGAGGCATGTCACCGGTGAGAAGAACCTAATGACACACATGGAGGGCAGGAAGGGCAAGTATATCCTGCAGTCTCAAGAACATGGTGCTGATGAGGTGGAATATGGGGTGAAGACTGACCAGAAAGCACCCGACAATGCATTGTGCTATTGTTTTAATCCTGAAGCTACAAATATAAAGGGAGAGACAGGGGCCATGGTATTCATGAAGAAAATAGGAAAAAAGTGGACTCTCGTAACCTCAGATGGCAACAAAGCTTACTACAATGTAAGCAACTTAAAAGGGTGGTCTGGACTACCGATAATGTTGCACTCTACTGGAGCAATCGTAGGGAGGATCAAGTCGGCGTATTCAGATGAAAATGATCTGGTGGAAGAGCTGATTGACTCCAGGACCATCAGTAAAAGCAATGAGACAAATCTAGATCATCTTATTAAGGAGTTGGCAAGTATGCGGAGAGGGGAGTTCCGCTCAATCACCCTTGGGACGGGCGCCGGAAAAACCACAGAACTACCCAGACAATACCTCACAACAGTGGGGACACATAAGTCCGTGCTGGTCTTAGTCCCTTTGAAAGCGCCTGCTGAAAGTGTATGTCGCTTTATGAGGTCTAAATACCCCACTATCAATTTTTCCTTAAGGGTAGGGGAGCGAAAGGAAGGGGATGTGAGTAGCGGCGTCACCTATGCCACTTATGGATTCTGCTGCCAGCTCAACCTAGTGCAACTCAAGGAATGGATATCCAGGTACTCAATGGTGTTCTTCGATGAATACCATACGGCAACTCCAGAACAAATAGCCATAATAAGCAAAATCCATGCATTGAAAGTAAAGACCAGGATTGTGGCTATGTCAGCCACCCCCCCGGGCACTGTGACAACAGAAGGTAGAAAATTCGATATAGAAGAAGTGGGGGTTGCCACAATAGAAAAAGGGGAAGAGCCAAAAAGAGGGCGTATAGCAGTGGCCGGCATGCAGGTTCCGTTAGAAGACTTAACAGGGAAAAACTGCCTGGTGTTCGTGGCAACTAAAGAGGCCGCGGAGACGGAAGCTAAAGAACTACGTGCCAGGGGCATCAACGCCACCTACTATTACTCTGGCATAGATCCCAAAACCCTGGAGTACGGTATGACGAACCAACCGTACTGTATTGTGGCCACCAACGCTATTGAATCAGGTATAACCTGCCCCGACCTGGACGTGGTCATAGACACCATGCAAAAGTATGAAAAAGTAGTGAATTTCTCAGCAAAGATGCCCTTAATTGTCACTTCGCTGGTGAGGAAGAAAATCACTAGAGAGGAGCAAGGCCAGAGGAAAGGCCGAGTAGGCAGGCAAAAGAAGGGTAAATACTATTACCCATCGGGCGTAGTGCCGAATGGGTCAAAAGACTTGAGTTATTTGATCTTGCAGGCCCAAGAATATGGTGTCTTGGAGCAGGTCAACATAACAGAATATTTCATCATAATGAATGAGGACTGGGGGCTTTATGACGTAGATGAGGTGGAAGTGAGAATATTGGAGAGAATGAATAAAGAAATCTTACTCCCGCTAGGTATTGTGGAGAAGCAAATCCTGGAAAGAAGCACTCACCCGGAAAAAGTGGCATTATTGTACAACAAGCTAGTACAGAAAAACCCTATAGTTTACCCAAGGGTTCAGGACGGTGAGATTGGCAAAGAATACAATACCCACAACCTAGCCGTGTATGACAAACTTAAGGACGTTAACCCACAGGCAATATATGTCTTAGCAGAGGAAGAAAGGGCTACGGAAATGATGGGCCTTGAATTTGAGCAGGAGCCTTCTGACCTGCCGGATTCAGTAGGCCAACTTTGTGAAGACATAAAGAGGTACACAAAACTTTCTGGAATTACTGAAAAATTGCTAGTTGGTACGATGGTGGGGTATATTGGATACAAGGCCCTAACCAGAAATCATGTGCCCTGGGTTAGTAAAGAGTATTCTTATGAGTTGACGGATTCACCAGACACTTATGAAAATTCATTTGCACCTTTGGACATAGATGTCCAGACTCCCAGTGATAGCAAACACCCGGAACAACTGGCGGACCACCAGTTAAGACGACTGTTGGAGAACGGGAAGGACAAGGCAATCGACCTCTTAAAAGAAATCCGCCAGTTCACCAGTGGAGTCATAAACAGCCCAAAAGCATTAAGCATATGGGAGAAAATTTACCAATACTTGAATAAGCACCAGGGGGAGATCATTTCATCAGCGGCATGGGGTAGTGCAACAGCCCTTCATGACAGTATCAAATCTAGGCTGGGGGATGAGGTCGCCACAGCAGTGATAATCCTCAAGTATTTAGCATTTGGAGAGAGAGAGTTGTCTGGGCTCACTAGACAAGTCTTAATTGATATTATAGTATATTATATAGTCAACAAGCCCCGGTTTGAGGGGGATGACTATGCAAAAAGAAAAGGGAGGAGACTAGTCATTGAGGTGTTGATGGGGGCACTAGCAACCTATGCTGTATCCAACTTTTGGGGCGTATCTATCAATAAAGTGTTGCAACCAATATCTGACTACTTGCCCTACGCCACTGCCACTCTGGCTTTCCTACGCCCAACTTTTATGGAATCAGCAGTGGTGGTGGCGTCTTCTATCTACAGGGCCTTCCTTTCCATCAAACATGCAGAGAACAGGAGTCTTGTCACGCAGGTCGCCTCGGCTGCCCTTGAAGTCATGGGCTTGACACCAGTATCGGCTGGTTTAGGCGTCCTGTTGGGACTTGGACTATGTGTGCTTCACATGAACATAGATAAGAACGAAGAAAAAAGGACACTAATACTGAAGATGTTCGTCAAAAACTTCATAGACCAGGCGGCGTTAGACGAGCTGGACAAACTGGAGCCGGAAAAAATAATCCTCTCACTGCTGGAAGGCATCCAGACTTGCACAAATCCTGTCAGAGCTGTCATGATTCTGTATAGGGTCTATTACAAAGGGGAATCATTTACAGAAGCCCTTTCTAGGATGGCAGGGAAATCCCTTATTGTGATGGTTTTAGTGGAATTTCTAGAATTGACAGGCCAAACCCAAGGGGGGTACATAGACCTCAGTGCCAACTTATTAACCTTTCTTTTGGAAAAACTGAAAAAGATGACCAATCTTGCTTTAGGGGAGGCCAGGAAAGCCTTACTCCCCATCCCATACCTGTACTGTGAAACCTGGCAGTCCGACGCCAGAATCAGAGCCCCAGACTCTTACGACCAGGTGGTGGTGGAATGCAAATGCGGGGCCTCGGCGAGGTATTCCTTTTGTCATGGAGTCTACGAGATGCTTGAAGAGAAAGGGACCAGGTGGTGTAAAAACTTCTTCTTATGGGGACCTAACTTTAAAAACCCGGACCCAAAAAGGATGACATTCTACGAATATGACCAAGCAAAAAAATGTCCTGTAACCATTGCGGGTGAGGACATAACTTTTGGCAAGTATGGCATATATGTCAAATTTGGCCATGGACCTGATGGGAAAAGGTTAATACGGGGCACAACCCATGCCACTATTAGCAGGGAGGAGCTATTAGAAATCCTGTCGGCCCCAAGCCAAGTCGCCATAGGCAAAGTCAAATTGACCGATTATTGCAACCAAAAAGGACTGATAGATAGGAAATTGGCAGTACTTGAGAATGATAAAATACACTTTTGGAGAGCACACCGAGGGTCTAAAATTACCGATCAATTAACCATTGAAAATTTAACGGACGATTTGGGATCGGAAATTAGAGACATTACGTGGGAACTGTACGCAGGGGGGACATATACTGTGAGAGGGGTATCCCTTAGGTCGTGCGCACCAGGGCAAAGGAACAAGGCCACAGTCTTATGTGATTGCACTGACGTGCTTAGCCCCTGTTATCTAGTCAATGGTAGGAAACCATCTCCATTCAACGTGGTAGAAGGTTATGAATGTCACCATCGGAAGCCCCGGGCAACCTATGAAGACCTAGAGATGGAAGAAATATTAAGGAAACGAGTCCCTGTGTATGATCCCCTTTGTCTGTTTGACACCGACAGCAAGCTGCTGCTCCCAGACACGTACTACCTGGAAGAAGACCAAGAAGACTTCGAATATGCACTAAGGTGCTGGGGTCTTGGGGTCTATGTAGCTGGCGAACCCATGACCTCACCTCCAAACATAAGAATACACCACAGCTCTACACTGTTACTATTGACCCCCGGAGTGGACTCCGAATTAAATCTACAGTACATACACTGTTACTCCCACCAGGTAGAAGTTGACGTATACGTTAAGGCCCAACTTCTGGAGGAGGGAGACACTACCACGGAGGTCAGCGACCTCCAAGAAGATAGCGGAGGGGGGACAGAAGATGCAATATTGGATGAAGAGGATACATTGTCCACAACCGAGTCAATGCCTCCGCTAGAAGAAGAAGAGGGGAGTGAAGAGTTGATCACTTATGTGGTCATTAGGGGGCTACAAGAAGAGAGATATACCAGTCATCTTAAGTTGAATGATTGGATCAGTGAGAATGTCACAGAGCCGCACAAGGTTCAGATTATGCTTGACGGGACAGTGAGAGTGACAATAAAAGAGGGTAAAGTCAAGCACCTGTTCGGGGTCTTTAGGGTGGAGAACACCCTAGAAGCAATGTTTAAGGAGACTATAGCTGACCTTCCTGTAGCTACCCAACCGCCCCAAGGGCCCATTTATACAGCCAGAGAACTGGCTCAGGGGAACATTGCCCCAATCCAACCCGCAGTAAACTACTACGGGATGGTTGAGGGAAGAGGCGGCCCAATGACAGCATTTGAAGCTCTATCAGTGTTACGGTCGCAAAAAACTCTAGCCAGAGAAGTAAAAGTGAACACCCGTAGAGCACAGACCTTCTTGAATAAAGTCAAGAGGGCCACCGAGGTCAAAGCATCAGAATTGGCATTAAAGCATTTACCGGTGCTTGGCAAAGTAAATGGGAGGAAATTGATTAGGGAGGAGACCAATATTCCTAACCAAAGGCTAGCGTCAATAATGACCTCAGTAGGAATCAGATTAGAAAAATTGCCAGTTGTCAGGGCCAACACCTCTGGCTCCAAATTTAGACAGTCAATTTTAGAAAAAATGGACAAACATGAAAATGAGCAAGTCCCAGGGCTGCATGAAAAAATGTGGGCTGCATTCCTGGTGACTGCTAGACAAGATCTAAGAAACACATACGAGGAAGTAACCTACTCTGAGTTGGAGAACGGGATCAACCGGAAAGGAGCCCCGGGTTTCTTTGAAAAAGAGGGTTCAATAGGGGAGGTGTTGGAGAGTAAGGACAAAATTGAAACTGTCATCCAAGAAATCAAAAATGGCAACCACTTGTACTATGAGACAGCCATGCCAAAAAACGAAAAAAGAGATGTGCTTGATGACTGGCTGTCTGAGGATTTCGTAACTTACAAGAAACCGCGAGTGATACAGTACCCCGAGGCTGTCACCCGGTTAGCCATCACTAAAATAATGTATAAGTGGGTGAAGCAAAAGCCTATAGTGATCCCTGGCTATGAAGGAAAAACTCCAATTTTTGAAATATTCGAAAAAGTCAGCGCAGACTGGGCCCAATTCAGGAACCCTGTCGCTGTCAGTTTCGATACCAAAGCCTGGGATACTCAAGTAACGAGAGAAGACCTCAGACTGGTAGCAAGGATACAGAAGTATTATTACAAAAAGAAGTACTGGAAGTTCATCGACAACTTAACTGCCATGATGGAGGAAGTACCTGTGATCACTGTGGAAGGGGACATGTTCCTCAGGGTCGGCCAGCGCGGGTCAGGACAACCCGACACCTCGGCAGGTAACTCTATACTGAATGTGCTGACAATGCTGGTGGCTTTCTCAGAGTCCACCAACCTGCCAATAACGGCTGCCTGGAAAGCTTGCCGGATCCATGTCTGTGGGGATGACGGTTTCCTAATTACGGAAGCAGAATTAGGTAGAAAATTCGCTGAAAAAGGCGTACCCTTGTTAGCTGCTTTTGGCAAACCTCAAAAGATCATAGAAGGAGCAAGTTTAAAGATAACCAGCAGTTTTGATGGAATAGAGTTTTGTAGCCACTCTCCTATTAAAGTTCAAACACCAAATGTGCAGTGGATGCCAGCAAGACCAACAGCCACAATCTTAGGGAAAATGAGCACTAGACTAGGCGAGGGCGCCACAAGATCAGGGGAAGAATATGAAAAACAGGTGGCATTTGCATACTTACTCATGTACCCTTGGAATCCATTAGTTAGAAGAATCAGTCTCTTACTATTATCAACTACTGATCCAATAGGAAAAGAGGAAACCCCATGTTCTGATGAAGGAGTGAAGTATGTGGGGGACCCCATAGCTGCATACAGGGACGTGTGGGGGCACAAACTGGAGGACGTCGGGCATGTCGACCAGCCGCAGTTATCCCGGATGAATTACAGCATGACTTACTTGGGGGTCTGGAAGCCGAAGACGAGCCAGCGGCTAGTCGAACAATGCTGCCGGCTAGCTAAAGAAAACAACTGCGTGGCACGTGCTGATTCCCTCATTAAGAAGAAAGTGAAAGTCACTTATGATCCCGGGATAGGGGCAGCTCAGGTCATCCGTAGGTGGGAAGAATTAGAGTGGACCAGAAGGAAACCTGAACTCACCAGTGTAAACGCAGAAGACGACCTCCTTTTGATCCTGTGGAAGAGACTGTCAGAATACGTCTACCAGAAAATGAAGCTCATGCAGAAGATGTTCTCCCCCTACTAGACGGAGGGGCACACAATAAAAATTTTTGCCAGTATCTGGTGGGTGTAGAATCAGTGTAAATAAGATTTTAATTTAAAAAGGGGCAAGTGGCCATACAGGCTGGGGTAATCGCCGTTCCCCCCCTTTACTAGGCGCCTCAACCCCACATGTCGTGGGGTTGTTGTAAATACTTGAATAAATGGAGTAATACGGGTAATAAACTTAAAGGCCAGTATT
| 62,109
|
MK216750.1
|
Atypical porcine pestivirus 1
|
Yan,X.L., Li,Y.Y., He,L.L., Wu,J.L., Tang,X.Y., Chen,G.H., Mai,K.J., Wu,R.T., Li,Q.N., Chen,Y.H., Sun,Y., Ma,J.Y., Xiaoling,Y., Yiyun,L., Lili,H., Jiaoling,W., Xiaoyu,T., Guihua,C., Kaijie,M., Ruiting,W., Qianniu,L., Yonghui,C., Yuan,S., Jingyun,M.
|
South China Agricultural University, College of Animal Science
|
China
|
2019-06-22
|
AH-GL-2018.01
|
Pestivirus scrofae
|
Pestivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 11,509
|
GenBank
| 1
|
China
|
China
|
Sus scrofa
| null |
2018-01
| null | null |
Atypical porcine pestivirus 1 isolate AH-GL-2018.01, complete genome
|
ATATGGGGCATAATGCATAGATTGGCTGCATTATGTGTATAACATCCCAAATTGCCATAGGCTCTGTGGTGAGTGGGGGAAAGGGGTTAACCAGGCCTCTAGTACCACAGGCACCATTTAACAGGGCAACTCGAACCTGAGAGAGAGGTACCGAACTCTTAAGCCTCGAGTACGGGGCAGACGTCACCGAGTAGTACACCCAACGACCACCACATTTAGGTGTAGGGTCTACTGAGGCTCGGGTGGACGTGGGCATGCCCAAAGAGAAAACGGTGGGGGACCTGGGGGTCGGGTCCGCCATGCCCCTCAATGGGGTAGACCTTACTGCTTGATAGAGTGCCGGCGGATGCCTCAGGTAAGAGTATAAAATCCGTTGTTTATTAACATGAAAGAACAAATTACATATTACTTAAAAAAAGAAAAACAAAGGAATGGGTGGACAGAACTAGTAGTAGGGGAAAGCCATACGAAGATAACCACACTCTCCGGGAGGACCTATCGAGGTACTTGGGAAATGGAGAAACGGTCCAACCCTTACGGAATCTACTTCCCTAGGCCAAGTCCTCAACAGCTTACGGCCTTGCATCCACACCCAGTCGTGAACTGTAGGATGATAGAGTACAAAGAAGCTGACCCTAACTATGGCGACTGCCCAAACACAAATGGAGTATTCATAGATGAAAAAGGCAGGAAATTTAGCGGACCCCCGTTGGGTCTCTGGAAAATAAGACTGGACTACTATGACTTGGTGAATGCTAAAAGGCCAACTTTCACAAGTGAACAGATCTCTTATCAAGTCGAAACCTGTAGTGGGGAGCTGGCCACCGTAACACCTACACACGGCAGGGTGTTTGTGAATGACTACAGGAGATTTTATCAGTGGAAACCTAGGTGTGAAGGGATGGTGCTCTACGTGAAAACCTGTTCCGACTGGGCAGATCAAGTAGACAAACAAGAGAAAGAAAGCCCCCCGAAACCACAGAGACCACCGAGACGAGACCCACGGAAAGGGTTGCAGCCGCAAGTCCCCAAAGAAACCGAAATCACAGAGAAAAAGAGACAACCTAGCGTAACTTTAGTGACTGGGGGGCAGAAGGCTCAGATTATTTATAAAGGCAAGACCAAAAATAAAAAGACCCCGGACGGGGTCTATAAGTACCCAGGAGCTAAAGAAGGGGATGTAGTAAAGGTGAGGAAGATGTTAAAAAATTGGCACCTAGCTCTTGTAATGTGTCTGATATATCTTATAAATCCAAGCCTTGCAAAGGTTCAATGGTTTTTGAAGGATGAAAACTCGACAGGAATCAATCAGATATTGTGGCAAAGACGGGTCAACAGGTCCTTGCATGGAGAATGGCCAAACCAAATCTGTCATGGCATGCCAAATGAAACCATTACAGATGAGGAGTTACATAGCCTAGGGATGATAGACACTAGCCCAAGAACAAACTATACCTGCTGCCAACTACAATACCATGAATGGAAGAAACATGGCTGGTGTAATTATCCGCAAAAACAAGCATGGATCAGAAGAATAACAGCTTTACAATCCAACCTTACTGGGGCCTATGAAGGACCAGAATGTGCTGTCATATGTCGGTTTAACGGCAGTCACAACATCGTAAGGCAAGCCAGGGATGAGGTTAGCCCACTTACAGGATGCAAGGAGGGGCACCCTTTTCTATTCTCCGGTGAAAGATCTGAGGCTTCGTGCTTAAGACCGCCTTCCACTAGTTGGGTGAGACCAGTGAAAATGGACGAGGCTTCAGTGGCGGACAGTTTTGCCCATGGGGTAGATAAAGCAATAATATTAATTAGAAAAGGGGCTTCGGGAATCGTAAATTTCTTAGACACTATTGGGAGGTGGCTGCCAGTAACCGATGCCACTATCATACCATACTGTGAAACTTACACCGTAACGGGGATGTATGTTCATGTCAAGCATTGCCTTCCTAGGGGGTTACCCAAGCACTCGAAGATAATCTCCCCAACGTTGATATACCTAGGAGAAGGCGATCCAGCCCATAATATCCAACATTTATTCGGCTCAGGCATAGCAAAATGGGTTCTAGTGCTGCTCGGGGTTTTGGGTGAATGGTATGGGGAACTAGCCTCAACAATATATTTAATACTCGAGTATGGCACTGAGTGGTTAGAACATGAAAACCTGGTCACAGAAGGGCTAATACCTGGCATCAATATAACGGTGGAGCTTCCTGCCAGTCATACGGTACCCGGCTGGGTATGGGTCGCGGGTCAGTGGGTATGTGTGAAACCAGATTGGTGGCCTACGCACATCTGGATCGAAACCGTGGTGGCAGAAGCTTGGCATGTGTTAAAGATACTAGCCTCGGCCTTGGTCAATATAGTTACTGCATTTGTGAACTTGGAATTGGTTTACCTGGTCATAATATTGGTCAAAGTATCAAAGGGTAACTTGATCGGAGCTATCCTGTGGTGCCTATTATTGTCAGGGGCCGAAGGATCATGCCATGAGCGACAGGACTATTATAATGTCCAATTAGTCGTTGACGAAAAAACGGGCATAGAAAAACGGTCAATAATAGGCAAATGGACCGTAGTGACCAAAGAGGGTCGGGAGCCAAGATTAATGGAACAGATAAATGTGGTATCAAATAGCAGACTGACAGAAACTTACTGCTACAATGAACTAAACACCAGCAGCTGGGGGCGACACCCAATGAAACAGAGGGGGTGTGGGCAAACTGTACCCTATTGGCCTGGTGACAATGTTCTCGAAGAACAATACTTCAGCACGGGTTACTGGGTGAATGCCACAGGAGGTTGCCAGTTGAGGGAAGGTGTGTGGCTATCAAGAAAGGGCGGTGTCCAGTGCCAACGTAACGGCTCATCTTTGATCCTGCAGTTGGCAATCAAGGAGGAAAATGACACCATGGAGATACCGTGTGACCCGGTAGAAACCGAAAGCATGGGCCCGGTGGCACAGGGCACTTGCGTGTATAGTTGGGCAGTAGCTCCAAGAGGATGGTACTATAACAGGAAGGATGGCTATTGGCTCCAATATATAAAGAAAAATGACTATCAGTACTGGACAAAAATGCCCGCGGCTTCGTCCGCTGTAACAATGTACCGGCATTTACTACCTTTGTTGGTGGCTTGCCTTATGGGCGGTAGAATTTCAGTATGGATTGTAGCAATGATTCTATCCCTACAGGTGGAGGCCAGCGAGGTAGGAACCAAACAGTTGGCCGTCACTCTAACTCTATGGAAGATGGATTGGACAGAGTTGCTCTTTTACATTATTATAATCCTGTTCATAAAGGAAGACCTCATAAAGAAGATAGTGACAGCAAGTCTAGTGGCTCTCAAAAATAGCCCAGTAGCCTTAAGCTTCCTAATTGTACTTAGGCTAGTCGGAGGTAGTGAAGCACTCCCAGTAGGGCTACTACTAGAAAAAATGTGTATAGACCAGCCAGAGTTTGGAACCCCTTTTCTAATTTACTTGTGGGACAACTGGAAGTGGACTGTCTTAGTCAGTTTCTCCGCATTAAACCACGAAAAGACCATTAGATTAGCGAGGAAACTCTTATTAGCTACACATATAACTGCACTGACATTGACTGGTCTAAGTGATTCAATTTTTTACGTAATGCTCATAATAACCAATTTACTGATAAAGACATTCATATATCTACTGGGGGCCGGCATTAACTGGGTGGAGAAAGAAAAAAGGAGGCTGCTAGTGAAAAGGAAGCTGATATACAAACAAGCCGTAGTTTGCCATCAAGATGAGGATGAACTAGTGAGTAAATTTAACAAAATAACAATAAACACGGACTTCACCCCATGTAGGCTTGAACTGCTGCAACTGCTCAGAGCTTTCTTGGTTTCCCTATGTTTCTCTTACTACAAACCCCTCCTATATGCGGAGACCACCTTGACCGTCATAGTGATTGGCGTACAAGAGTACAATATGGCCATGGCCCGTGGGCGAAGTGCAGTCCACAGGCTATTAGCTATGGCTTACTACATATATGGTCGTCTGCAGGGGGACATGTTTCAGCTCGCTACGATCCAGTGTTTGATGTCGAGTCCAAGAAAAATAATGAAACACATGATAGAAAACCCAATCCTCAAGAAGATCTGGCAAGGAGAAACAGAGCTTTTCAACCAGGGTGTCAACCAGTCTAAAATAGTAAACCCAAAAAAGATAGGGTTGGTAGAATTGCAAAAAGGTATGTGTGGTTTGCCGACTGCAGTTCAAAACTTGGTCATATATGCAAAGAAGAATGACTCCCTCATTCTAGGAGAGGTAGGTTATCCGCCTGGAGACCTCACCATTGACGGGTGGGAAATACTAGGCCCTGGCAGGATCCCAAAAATCACTAACGTAGAGTCCGCTAAGATGGACCTACTATCTAAACTAATGACATTCCTGGGGATTGAAAGTTCGAGGGTCCCTAGAACCCCAGTCCACTCCACTAGGAAACTACTGAAGATAGTAAGAGGCATGGAAACTGGGTGGGGGTACACCCATGCTGGAGGAATTAGTAGTGCGAGGCATGTCACCGGTGAGAAGAACCTAATGACACACATGGAGGGCAGGAAGGGCAAGTATATCCTGCAGTCTCAAGAACATGGTGCTGATGAGGTGGAATATGGGGTGAAGACTGACCAGAAAGCACCCGACAATGCATTGTGCTATTGTTTTAATCCTGAAGCTACAAATATAAAGGGAGAGACAGGGGCCATGGTATTCATGAAGAAAATAGGAAAAAAGTGGACTCTCGTAACCTCAGATGGCAACAAAGCTTACTACAATGTAAGCAACTTAAAAGGGTGGTCTGGACTACCGATAATGCTGCACTCTACTGGAGCAATCGTAGGGAGGATCAAGTCGGCGTATTCAGATGAAAATGATCTGGTGGAAGAGCTGATTGACTCCAGGACCATCAGTAAAAGCAATGAGACAAATCTAGATCATCTTATTAAGGAGTTGGCAAGTATGCGGAGAGGGGAGTTCCGCTCAATCACCCTTGGGACGGGCGCCGGAAAAACCACAGAACTACCCAGACAATACCTCACAACAGTGGGGACACATAAATCCGTGCTGGTCTTAGTCCCTTTGAAAGCGCCTGCTGAAAGTGTATGTCGCTTTATGAGGTCTAAATACCCCACTATCAATTTTTCCTTAAGGGTAGGGGAGCGAAAGGAAGGGGATGTGAGTAGCGGCGTCACCTATGCCACTTATGGATTCTGCTGCCAGCTCAACCTAGTGCAACTCAAGGAATGGATATCCAGGTACTCAATGGTGTTCTTCGATGAATACCATACGGCAACTCCAGAACAAATAGCCATAATAAGCAAAATCCATGCATTGAAAGTAAAGACCAGGATTGTGGCTATGTCAGCCACCCCCCCGGGCACTGTGACAACAGAAGGTAGAAAATTCGATATAGAAGAAGTGGGGGTTGCCACAATAGAAAAAGGGGAAGAGCCAAAAAGAGGGCGTATAGCAGTGGCCGGCATGCAGGTTCCGTTAGAAGACTTAACAGGGAAAAACTGCCTGGTGTTCGTGGCAACTAAAGAGGCCGCGGAGACGGAAGCTAAAGAACTACGTGCCAGGGGCATCAACGCCACCTACTATTACTCTGGCATAGATCCCAAAACCCTGGAGTACGGTATGACAAACCAACCGTACTGTATTGTGGCCACCAACGCTATTGAATCAGGTATAACCTGCCCCGACCTGGACGTGGTCATAGACACCATGCAAAAGTATGAAAAAGTAGTGAATTTCTCAGCAAAGATGCCCTTAATTGTCACTTCGCTGGTGAGGAAGAAAATCACTAGAGAGGAGCAAGGCCAGAGGAAAGGCCGAGTAGGCAGGCAAAAGAAGGGTAAATACTATTACCCATCGGGCGTAGTGCCGAATGGGTCGAAAGACTTGAGTTATTTGATCTTGCAGGCCCAAGAATATGGTGTCTTGGAGCAGGTCAACATAACAGAATATTTCATCATAATGAATGAGGACTGGGGGCTTTATGACGTAGATGAGGTGGAAGTGAGAATATTGGAGAGAATGAATAAAGAAATCTTACTCCCGCTAGGTATTGTGGAGAAGCAAATCCTGGAAAGAAGCACTCACCCGGAAAAAGTGGCATTATTGTACAACAAGCTAGTACAGAAAAACCCTATAGTTTACCCAAGGGTTCAGGACGGTGAGATTGGCAAAGAATACAACACCCACAACCTAGCCGTGTATGACAAACTTAAGGACGTTAACCCACAGGCAATATATGTCTTAGCAGAGGAAGAAAGGGCTACGGAAATGATGGGCCTTGAATTTGAGCAGGAGCCTTCTGACCTGCCGGATTCAGTAGGCCAACTTTGTGAAGACATAAAGAGGTACACAAAACTTTCTGGAATTACTGAAAAATTGCTAGTTGGTACGATGGTGGGGTATATTGGATACAAGGCCCTAACCAGAAATCATGTGCCCTGGGTTAGTAAAGAGTATTCTTATGAGTTGACGGATTCACCAGACACTTATGAAAATTCATTTGCACCTTTGGACATAGATGTCCAGACTCCCAGTGATAGCAAACACCCGGAACAACTGGCGGACCACCAGTTAAGACGACTGTTGGAGAACGGGAAGGACAAGGCAATCGACCTCTTAAAAGAAATCCGCCAGTTCACCAGTGGAGTCATAAACAGCCCAAAAGCATTAAGCATATGGGAGAAAATTTACCAATACTTGAATAAGCACCAGGGGGAGATCATTTCATCAGCGGCATGGGGTAGTGCAACAGCCCTTCATGACAGTATCAAATCTAGGCTGGGGGATGAGGTCGCCACAGCAGTGATAATCCTCAAGTATTTAGCATTTGGAGAGAGAGAGTTGTCTGGGCTCACTAGACAAGTCTTAATTGATATTATAGTATATTATATAGTCAACAAGCCCCGGTTTGAGGGGGATGACTATGCAAAAAGAAAAGGGAGGAGACTAGTCATTGAGGTGTTGATGGGGGCACTAGCAACCTATGCTGTATCCAACTTTTGGGGCGTATCTATCAATAAAGTGTTGCAACCAATATCTGACTACTTGCCCTACGCCACTGCCACTCTGGCTTTCCTACGCCCAACTTTTATGGAATCAGCAGTGGTGGTGGCGTCTTCTATCTACAGGGCCTTCCTTTCCATCAAACATGCAGAGAACAGGAGTCTTGTCACGCAGGTCGCCTCGGCTGCCCTTGAAGTCATGGGCTTAACACCAGTATCGGCTGGTTTAGGCGTCCTGTTGGGACTTGGACTATGTGTGCTTCACATGAACATAGATAAGAACGAAGAAAAAAGGACACTAATACTGAAGATGTTCGTCAAAAACTTCATAGACCAGGCGGCGTTAGACGAGCTGGACAAACTGGAGCCGGAAAAAATAATCCTCTCACTGCTGGAAGGCATCCAGACTTGCACAAATCCTGTCAGAGCTGTCATGATTCTGTATAGGGTCTATTACAAAGGGGAATCATTTACAGAAGCCCTTTCTAGGATGGCAGGGAAGTCCCTTATTGTGATGGTTTTAGTGGAATTTCTAGAATTGACAGGCCAAACCCAAGGGGGGTACATAGACCTCAGTGCCAACTTATTAACCTTTCTTTTGGAAAAACTGAAAAAGATGACCAATCTTGCTTTAGGGGAGGCCAGGAAAGCCTTGCTCCCCATCCCATACCTGTACTGTGAAACCTGGCAGTCCGACGCCAGAATCAGAGCCCCAGACTCTTACGACCAGGTGGTGGTGGAATGCAAATGCGGGGCCTCGGCGAGGTATTCCTTTTGTCATGGAGTCTACGAGATGCTTGAAGAGAAAGGGACCAGGTGGTGTAAAAACTTCTTCTTATGGGGACCTAACTTTAAAAACCCGGACCCAAAAAGGATGACATTCTACGAATATGACCAAGCAAAAAAATGTCCTGTAACCATTGCGGGTGAGGACATAACTTTTGGCAAGTATGGCATATATGTCAAATTTGGCCATGGACCTGATGGGAAAAGGTTAATACGGGGCACAACCCATGCCACTATTAGCAGGGAGGAGCTATTAGAAATCCTGTCGGCCCCAAGCCAAGTCGCCATAGGCAAAGTCAAATTGACCGATTATTGCAACCAAAAAGGATTGATAGATAGGAAATTGGCAGTACTTGAGAATGATAAAATACACTTTTGGAGAGCACACCGAGGGTCTAAAATTACCGATCAATTAACCATTGAAAATTTAACGGACGATTTGGGATCGGAAATTAGAGACATTACGTGGGAACTGTACGCAGGGGGGACATATACTGTGAGAGGGGTATCCCTTAGGTCGTGCGCACCAGGGCAAAGGAACAAGGCCACAGTCTTATGTGATTGCACTGACGTGCTTAGCCCCTGTTATCTAGTCAATGGTAGGAAACCATCTCCATTCAACGTGGTAGAAGGTTATGAATGTCACCATCGGAAGCCCCGGGCAACCTATGAAGACCTAGAGATGGAAGAAATATTAAGGAAACGAGTCCCTGTGTATGATCCCCTTTGTCTGTTTGACACCGACAGCAAGCTGCTGCTCCCAGACACGTACTACCTGGAAGAAGACCAAGAAGACTTCGAATATGCACTAAGGTGCTGGGGTCTTGGGGTCTATGTAGCTGGCGAACCCATGACCTCACCTCCAAACATAAGAATACACCACAGCTCTACACTGTTACTATTGACCCCCGGAGTGGACTCCGAATTAAATCTACAGTACATACACTGTTACTCCCACCAGGTAGAAGTTGACGTATACGTTAAGGGCCAACTTCTGGAGGAGGGAGACACTACCACGGAGGTCAGCGACCTCCAAGAAGATAGCGGAGGGGGGACAGAAGATGCAATATTGGATGAAGAGGATACATTGTCCACAACCGAGTCAATGCCTCCGCTAGAAGAAGAAGAGGGGAGTGAAGAGTTGATCACTTATGTGGTCATTAGGGGGCTACAAGAAGAGAGATATACCAGTCATCTTAAGTTGAATGATTGGATCAGTGAGAATGTCACAGAGCCGCACAAGGTTCAGATTATGCTTGACGGGACAGTGAGAGTGACAATAAAAGAGGGTAAAGTCAAGCACCTGTTCGGGGTCTTTAGGGTGGAGAACACCCTAGAAGCAATGTTTAAGGAGACTATAGCTGACCTTCCTGTAGCTACCCAACCGCCCCAAGGGCCCATTTATACAGCCAGAGAACTGGCTCAGGGGAACATTGCCCCAATCCAACCCGCAGTAAACTACTACGGGATGGTTGAGGGAAGAGGCGGCCCAATGACAGCATTTGAAGCTCTATCAGTGTTACGGTCGCAAAAAACTCTAGCCAGAGAAGTAAAAGTGAACACCCGTAGAGCACAGACCTTCTTGAATAAAGTCAAGAGGGCCACCGAGGTCAAAGCATCAGAATTGGCATTAAAGCATTTACCGGTGCTTGGCAAAGTAAATGGGAGGAAATTGATTAGGGAGGAGACCAATATTCCTAACCAAAGGCTAGCGTCAATAATGACCTCAGTAGGAATCAGATTAGAAAAATTGCCAGTTGTCAGGGCCAACACCTCTGGCTCCAAATTTAGACAGTCAATTTTAGAAAAAATGGACAAACATGAAAATGAGCAAGTCCCAGGGCTGCATGAAAAAATGTGGGCTGCATTCCTGGTGACTGCTAGACAAGATTTAAGAAACACATACGAGGAAGTAACCTACTCTGAGTTGGAGAACGGGATCAACCGGAAAGGAGCCCCGGGTTTCTTTGAAAAAGAGGGTTCAATAGGGGAGGTGTTGGAGAGTAAGGACAAAATTGAAACTGTCATCCAAGAAATCAAAAATGGCAACCACTTGTACTATGAGACAGCCATGCCAAAAAACGAAAAAAGAGATGTGCTTGATGACTGGCTGTCTGAGGATTTCGTAACTTACAAGAAACCGCGAGTGATACAGTACCCCGAGGCTGTCACCCGGTTAGCCATCACTAAAATAATGTATAAGTGGGTGAAGCAAAAGCCTATAGTGATCCCTGGCTATGAAGGAAAAACTCCAATTTTTGAAATATTCGAAAAAGTCAGCGCAGACTGGGCCCAATTCAGGAACCCTGTCGCTGTCAGTTTCGATACCAAAGCCTGGGATACTCAAGTAACGAGAGAAGACCTCAGACTGGTAGCAAGGATACAGAAGTATTATTACAAAAAGAAGTACTGGAAGTTCATCGACAACTTAACTGCCATGATGGAGGAAGTACCTGTGATCACTGTGGAAGGGGACATGTTCCTCAGGGTCGGCCAGCGCGGGTCAGGACAACCCGACACCTCGGCAGGTAACTCTATACTGAATGTGCTGACAATGCTGGTGGCTTTCTCAGAGTCCACCAACCTGCCAATAACGGCTGCCTGGAAAGCTTGCCGGATCCATGTCTGTGGGGATGACGGTTTCCTAATTACGGAAGCAGAATTAGGCAGAAAATTCGCTGAAAAAGGCGTACCCTTGTTAGCTGCTTTTGGCAAACCTCAAAAGATCATAGAAGGAGCAAGTTTAAAGATAACCAGCAGTTTTGATGGAATAGAGTTTTGTAGCCACTCTCCTATTAAAGTCCAAACACCAAATGTGCAGTGGATGCCAGCAAGACCAACAGCCACAATCTTAGGGAAAATGAGCACTAGACTAGGCGAGGGCGCCACAAGATCAGGGGAAGAATATGAAAAACAGGTGGCATTTGCATACTTACTCATGTACCCTTGGAATCCATTAGTTAGAAGAATCAGTCTCTTACTATTATCAACTACTGATCCAATAGGAAAAGAGGAAACCCCATGTTCTGATGAAGGAGTGAAGTATGTGGGGGACCCCATAGCTGCATACAGGGACGTGTGGGGGCACAAACTGGAGGACGTCGGGCATGTCGACCAGCCGCAGTTATCCCGGATGAATTACAGCATGACTTACTTGGGGGTCTGGAAGCCGAAGACGAGCCAGCGGCTAGTCGAACAATGCTGCCGGCTAGCTAAAGAAAACAACTGCGTGGCACGTGCTGATTCCCTCATTAAGAAGAAAGTGAAAGTCACTTATGATCCCGGGATAGGGGCAGCTCAGGTCATCCGTAGGTGGGAAGAATTAGAGTGGACCAGAAGGAAACCTGAACTCACCAGTGTAAACGCAGAAGACGACCTCCTTTTGATCCTGTGGAAGAGACTGTCAGAATACGTCTACCAGAAAATGAAGCTCATGCAGAAGATGTTCTCCCCCTACTAGACGGAGGGGCACACAATAAAAATTTTTGCCAGTATCTGGTGGGTGTAGAATCAGTGTAAATAAGATTTTAATTTAAAAAGGGGCAAGTGGCCATACAGGCTGGGGTAATCGCCGTTCCCCCCCTTTACTAGGCGCCTCAACCCCACATGTCGTGGGGTTGTTGTAAATACTTGAATAAATGGAGTAATACGGGTAATAAACTTAAAGGCCAGTATT
| 62,110
|
MK216751.1
|
Atypical porcine pestivirus 1
|
Yan,X.L., Li,Y.Y., He,L.L., Wu,J.L., Tang,X.Y., Chen,G.H., Mai,K.J., Wu,R.T., Li,Q.N., Chen,Y.H., Sun,Y., Ma,J.Y., Xiaoling,Y., Yiyun,L., Lili,H., Jiaoling,W., Xiaoyu,T., Guihua,C., Kaijie,M., Ruiting,W., Qianniu,L., Yonghui,C., Yuan,S., Jingyun,M.
|
South China Agricultural University, College of Animal Science
|
China
|
2019-06-22
|
AH-SG-2018.01
|
Pestivirus scrofae
|
Pestivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 11,509
|
GenBank
| 1
|
China
|
China
|
Sus scrofa
| null |
2018-01
| null | null |
Atypical porcine pestivirus 1 isolate AH-SG-2018.01, complete genome
|
ATATGGGGCATAATGCATAGATTGGCTGCATTATGTGTATAACATCCCAAATTGCCATAGGCTCTGTGGTGAGTGGGGGAAAGGGGTTAACCAGGCCTCTAGTACCACAGGCACCATTTAACAGGGCAACTCAAACCTGAGAGAGAGGTACCGAACTCTTAAGCCTCGAGTACGGGGCAGACGTCACCGAGTAGTACACCCAACGACCACCACATTTAGGTGTAGGGTCTACTGAGGCTCGGGTGGACGTGGGCATGCCCAAAGAGAAAACGGTGGGGGACCTGGGGGTCGGGTCCGCCATGCCCCTCAATGGGGTAGACCTTACTGCTTGATAGAGTGCCGGCGGATGCCTCAGGTAAGAGTATAAAATCCGTTGTTTATTAACATGAAAGAACAAATTACATATTACTTAAAAAAAGAAAAACAAAGGAATGGGTGGACAGAACTAGTAGTAGGGGAAAGCCATACGAAGATAACCACACTCTCCGGGAGGACCTATCGAGGTACTTGGGAAATGGAGAAACGGTCCAACCCTTACGGAATCTACTTCCCTAGGCCAAGTCCTCAACAGCTTACGGCCTTGCATCCACACCCAGTCGTGAACTGTAGGATGATAGAGTACAAAGAAGCTGACCCTAACTATGGCGACTGCCCAAACACAAATGGAGTATTCATAGATGAAAAAGGCAGGAAATTTAGCGGACCCCCGTTGGGTCTCTGGAAGATAAGACTGGACTACTATGACTTGGTGAATGCTAAAAGGCCAACTTTCACAAGTGAACAGATCTCTTATCAAGTCGAAACCTGTAGTGGGGAGCTGGCCACCGTAACACCTACACACGGAAGGGTGTTTGTGAATGACTACAGGAGATTTTATCAGTGGAAACCTAGGTGTGAAGGGATGGTGCTCTACGTGAAAACCTGTTCCGACTGGGCAGATCAAGTAGACAAACAAGAGAAAGAAAGCCCCCCGAAACCACAGAGACCACCGAGACGAGACCCACGGAAAGGGTTGCAGCCGCAAGTCCCCAAAGAAACCGAAATCACAGAGAAAAAGAGACAACCTAGCGTAACTTTAGTGACTGGGGGGCAGAAGGCTCAGATCATTTATAAAGGCAAGACCAAAAATAAAAAGACCCCGGACGGGGTCTATAAGTACCCAGGAGCTAAAGAAGGGGATGTAGTAAAGGTGAGGAAGATGTTAAAAAATTGGCACCTAGCTCTTGTAATGTGTCTGATATATCTTATAAATCCAAGCCTTGCAAAGGTTCAATGGTTTTTGAAGGATGAAAACTCGACAGGAATTAATCAGATATTGTGGCAAAGACGGGTCAACAGGTCCTTGCATGGAGAATGGCCAAACCAAATCTGTCATGGCATGCCAAATGAAACCATTACAGATGAGGAGTTACATAGCCTAGGGATGATAGACACTAGCCCAAGAACAAACTATACCTGCTGCCAACTACAATACCATGAATGGAAGAAACATGGCTGGTGTAATTATCCGCAAAAACAAGCATGGATCAGAAGAATAACAGCTTTACAATCCAACCTTACTGGGGCCTATGAAGGACCAGAATGTGCTGTCATATGTCGGTTTAACGGCAGTCACAACATCGTAAGGCAAGCCAGGGATGAGGTTAGCCCACTTACAGGATGCAAGGAGGGGCACCCTTTTCTATTCTCCGGTGAAAGATCTGAGGCTTCGTGCTTAAGACCGCCTTCCACTAGTTGGGTGAGACCAGTGAAAATGGACGAGGTTTCAGTGGCGGACAGTTTTGCCCATGGGGTAGATAAAGCAATAATATTAATTAGAAAAGGGGCTTCGGGAATTATAAATTTCTTAGACACTATTGGGAGGTGGCTGCCAGTAACCGATGCCACTATCATACCATACTGTGAAACTTACACCGTAACGGGGATGTATGTTCATGTCAAGCATTGCCTTCCTAGGGGGTTACCCAAGCACTCGAAGATAATCTCCCCAACGTTGATATACCTAGGAGAAGGCGATCCAGCCCATAATATCCAACATTTATTCGGCTCAGGCATAGCAAAATGGGTTCTAGTGCTGCTCGGGGTTTTGGGTGAATGGTATGGGGAGCTAGCCTCAACAATATATTTGATACTCGAGTATGGCACTGAGTGGTTAGAACATGAAAACCTGGTCACAGAAGGGCTAATACCTGGCATCAATATAACGGTGGAGCTCCCTGCCAGTCATACGGTACCCGGCTGGGTATGGGTCGCGGGTCAGTGGGTATGTGTGAAACCAGATTGGTGGCCTACGCACATCTGGATCGAAACCGTGGTGGCAGAAGCTTGGCATGTGTTAAAGATGCTAGCCTCGGCCTTGGTCAATATAGTTACTGCATTTGTGAACTTGGAATTGGTTTACCTGGTCATAATATTGGTCAAAGTATCAAAGGGTAACTTGATCGGAGCTATCCTGTGGTGCCTATTACTGTCAGGGGCCGAAGGATCATGCCATGAGCGACAGGACTATTATAATGTCCAATTGGTCGTTAACGAAAAAACGGGCATAGAAAAACGGTCAATAATAGGCAAATGGACCGTAGTGACCAAAGAGGGTCAGGAGCCAAGATTAATGGAACAGATAAATGTGGTATCAAATAGCAGACTGACAGAAACTTACTGCTACAATGAACTAAACACCAGCAGCTGGGGGCGACACCCAATGAAACAGAGGGGGTGTGGGCAAACTGTACCCTATTGGCCTGGTGACAATGTTCTCGAAGAACAATACTTCAGCACGGGTTACTGGGTGAATGCCACAGGAGGTTGCCAGTTGAGGGAAGGTGTGTGGCTATCAAGAAAGGGCGGTGTCCAGTGCCAACGTAACGGCTCATCTTTGATCCTGCAGTTGGCAATCAAGGAGGAAAATGACACCATGGAGATACCATGTGACCCGGTAGAAACCGAAAGCATGGGCCCGGTGGCACAGGGCACTTGCGTGTATAGTTGGGCAGTAGCTCCAAGAGGATGGTACTACAACAGGAAGGATGGCTATTGGCTCCAATATATAAAGAAAAATGGCTATCAGTACTGGACAAAAATGCCCGCGGCTTCGTCCGCTGCAACAATGTACCGGCATTTACTACCTTTGTTGGTGGCTTGCCTTATGGGCGGTAGAATTTCAGTATGGATTGTAGCAATGATTCTATCCCTACAGGTGGAGGCCAGCGAGGTAGGAACCAAACAGTTGGCCGTCACTCTAACTCTATGGAAGATGGATTGGACAGAGTTGCTCTTTTACATTATTATAATCCTGTCCATAAAGGAAGACCTCATAAAGAAGATAGTGACAGCAAGTCTAGTGGCTCTCAAAAATAGCCCAGTAGCCTTAAGCTTCCTAATTGTACTTAGGCTAGTCGGAGGTAGTGAAGCACTCCCAGTAGGGCTACTACTAGAAAAAATGTGTATAGACCAGCCAGAGTTTGGAACCCCTTTCCTAATTTACTTGTGGGACAACTGGAAGTGGACTGTCTTAGTCAGCTTCTCCGCATTAAACCACGAAAAGACCATTAGATTAGCGAGGAAACTCTTATTAGCTACACATATAACTGCACTGACATTGACTGGTCTAAGTGATTCAATTTTTTACGTAATGCTCATAATAACCAATTTACTGATAAAGACATTCATATATCTACTGGGGGCCGGCATTAACTGGGTGGAGAAAGAAAAAAGGAGGCTGCTAGTGAAAAGGAAGCTGATATACAAACAAGCCGTAGTTTGCCATCAAGATGAGGATGAACTAGTGAGCAAATTTAACAAAATAACAATAAACACGGACTTCACCCCATGTAGGCTTGAACTGCTGCAACTGCTCAGAGCTTTCTTGGTTTCCCTATGTTTCTCTTACTACAAACCCCTCCTATATGCGGAGACCACCTTGACCGTCATAGTGATTGGCGTACAAGAGTACAATATGGCCATGGCCCGTGGGCGAAGTGCAGTCCACAGGCTATTAGCTATGGCTTACTACATATATGGTCGTCTGCAGGGGGACATGTTTCAGCTCGCTACGATCCAGTGTTTGATGTCGAGTCCAAGAAAGATAATGAAACACATGATAGAAAACCCAATCCTCAAGAAGATCTGGCAAGGAGAAACAGAGCTTTTCAACCAGGGTGTCAACCAGTCTAAAATAGTAAACCCAAAAAAGATAGGGTTGGTAGAATTGCAAAAAGGTATGTGTGGCTTGCCGACTGCAGTTCAAAACTTGGTCATATATGCAAAGAAGAATGACTCCCTCATTCTAGGAGAGGTAGGTTATCCGCCTGGAGACCTCACCATTGACGGGTGGGAAATACTAGGCCCTGGCAGGATCCCAAAAATCACTAACGTAGAGTCCGCTAAGATGGACCTACTATCTAAACTAATGACATTCCTGGGGATTGAAAGTTCGAGGGTCCCTAGAACCCCAGTCCACTCCACTAGGAAACTACTGAAGATAGTAAGAGGCATGGAAACTGGGTGGGGGTACACCCATGCTGGAGGAATTAGTAGTGCGAGGCATGTCACCGGTGAGAAGAACCTAATGACACACATGGAGGGCAGGAAGGGCAAGTATATCCTGCAGTCTCAAGAACATGGTGCTGATGAGGTGGAATATGGGGTGAAGACTGACCAGAAAGCACCCGACAATGCATTGTGCTATTGTTTTAATCCTGAAGCTACAAATATAAAGGGAGAGACAGGGGCCATGGTATTCATGAAGAAAATAGGAAAAAAGTGGACTCTCGTAACCTCAGATGGCAACAAAGCTTACTACAATGTAAGCAACTTAAAAGGGTGGTCTGGACTACCGATAATGCTGCACTCTACTGGAGCAATCGTAGGGAGGATCAAGTCGGCGTATTCAGATGAAAATGATCTGGTGGAAGAGCTGATTGACTCCAGGACCATCAGTAAAAGCAATGAGACAAATCTAGATCATCTTATTAAGGAGTTGGCAAGTATGCGGAGAGGGGAGTTCCGCTCAATCACCCTTGGGACGGGCGCCGGAAAAACCACAGAACTACCCAGACAATACCTCACAACAGTGGGGACACATAAGTCCGTGCTGGTCTTAGTCCCTTTGAAAGCGCCTGCTGAAAGTGTATGTCGCTTTATGAGGTCTAAATACCCCACTATCAATTTTTCCTTAAGGGTAGGGGAGCGAAAGGAGGGGGATGTGAGTAGCGGCGTCACCTATGCCACTTATGGATTCTGCTGCCAGCTCAACCTAGTGCAACTCAAGGAATGGATATCCAGGTACTCAATGGTGTTCTTCGATGAATACCATACGGCAACTCCAGAACAAATAGCCATAATAAGCAAAATCCATGCATTGAAAGTAAAGACCAGGATTGTGGCTATGTCAGCCACCCCCCCGGGCACTGTGACAACAGAAGGTAGAAAATTCGATATAGAAGAAGTGGGGGTTGCCACAATAGAAAAAGGGGAAGAGCCAAAAAGAGGGCGTATAGCAGTGGCCGGCATGCAGGTTCCGTTAGAAGACTTAACAGGGAAAAACTGCCTGGTGTTCGTGGCAACTAAAGAGGCCGCGGAGACGGAAGCTAAAGAACTACGTGCCAGGGGCATCAACGCCACCTACTATTACTCTGGCATAGATCCCAAAACCCTGGAGTACGGTATGACAAACCAACCGTACTGTATTGTGGCCACCAACGCTATTGAATCAGGTATAACCTGCCCCGACCTGGACGTGGTCATAGACACCATGCAAAAGTATGAAAAAGTAGTGAATTTCTCAGCAAAGATGCCCTTAATTGTCACTTCGCTGGTGAGGAAGAAAATCACTAGAGAGGAGCAAGGCCAGAGGAAAGGCCGAGTAGGCAGGCAAAAGAAGGGTAAATACTATTACCCATCGGGCGTAATGCCGAATGGGTCGAAAGACTTGAGTTATTTGATCTTGCAGGCCCAAGAATATGGTGTCTTGGAGCAGGTCAACATAACAGAATATTTCATCATAATGAATGAGGACTGGGGGCTTTATGACGTAGATGAGGTGGAAGTGAGAATATTGGAGAGAATGAATAAAGAAATCTTACTCCCGCTAGGTATTGTGGAGAAGCAAATCCTGGAAAGAAGCACCCACCCGGAAAAAGTGGCATTATTGTACAACAAGCTAGTACAGAAAAACCCTATAGTTTACCCAAGGGTTCAGGACGGTGAGATTGGCAAAGAATACAATACCCACAACCTAGCCGTGTATGACAAACTTAAGGACGTTAACCCACAGGCAATATATGTCTTAGCAGAGGAAGAAAGGGCTACGGAAATGATGGGCCTTGAATTTGAGCAGGAGCCTTCTGAACTGCCGGATTCAGTAGGCCAACTTTGTGAAGACATAAAGAGGTACACAAAACTTTCTGGAATTACTGAAAAATTGCTAGTTGGTACGATGGTGGGGTATATTGGATACAAGGCCCTAACCAGAAATCATGTGCCCTGGGTTAGTAAAGAGTATTCTTATGAGTTGACGGATTCACCAGACACTTATGAAAATTCATTTGCACCTTTGGACATAGATGTCCAGACTCCCAGTGATAGCAAACACCCGGAACAACTGGCGGACCACCAGTTAAGACGACTGTTGGAGAACGGGAAGGACAAGGCAATCGACCTCTTAAAAGAAATCCGCCAGTTCACCAGTGGAGTCATAAACAGCCCAAAAGCATTAAGCATATGGGAGAAAATTTACCAATACTTGAATAAGCACCAGGGGGAGATCATTTCATCAGCGGCATGGGGTAGTGCAACAGCCCTTCATGACAGTATCAAATCTAGGCTGGGGGATGAGGTCGCCACGGCAGTGATAATCCTCAAGTATTTAGCATTTGGAGAAAGAGAGTTGTCTGGGCTCACTAGACAAGTCTTAATTGATATTATAGTATATTATATAGTCAACAAGCCCCGGTTTGAGGGGGATGACTATGCAAAAAGAAAAGGGAGGAGACTAGTCATTGAGGTGTTGATGGGGGCACTAGCAACCTATGCTGTATCCAACTTTTGGGGCGTATCTATCAATAAAGTGTTGCAACCAATATCTGACTACTTGCCCTACGCCACTGCCACTCTGGCTTTCCTACGCCCAACTTTTATGGAATCAGCAGTGGTGGTGGCGTCTTCTATCTACAGGGCCTTCCTTTCCATCAAACATGCAGAGAACAGGAGTCTTGTCACGCAGGTCGCCTCGGCTGCCCTTGAAGTCATGGGCTTAACACCAGTATCGGCTGGTTTAGGCGTCCTGTTGGGACTTGGACTATGTGTGCTTCACATGAACATAGATAAGAACGAAGAAAAAAGGACACTAATACTGAAGATGTTCGTCAAAAACTTCATAGACCAGGCGGCGTTAGACGAGCTAGACAAGCTGGAGCCGGAAAAAATAATCCTCTCACTGCTGGAAGGCATCCAGACTTGCACAAATCCTGTCAGAGCTGTCATGATTCTGTATAGGGTCTATTACAAAGGGGAATCATTTACAGAAGCCCTTTCTAGGATGGCAGGGAAATCCCTTATTGTGATGGTTTTAGTGGAATTTCTAGAATTGACAGGCCAAACCCAAGGGGGGTACATAGACCTTAGTGCCAACTTATTAACCTTTCTTTTGGAAAAACTGAAAAAGATGACCAATCTTGCTTTAGGGGAGGCCAGGAAAGCCTTACTCCCCATCCCATACCTGTACTGTGAAACCTGGCAGTCCGACGCCAGAATCAGAGCCCCAGACTCTTACGACCAGGTGGTGGTGGAATGCAAATGCGGGGCCTCGGCGAGGTATTCCTTTTGTCATGGAGTCTACGAGATGCTTGAAGAGAAAGGGACCAGGTGGTGTAAAAACTTCTTCTTATGGGGACCTAACTTTAAAAACCCGGACCCAAAAAGGATGACATTCTACGAATATGACCAAGCAAAAAAACGTCCTGTAACCATTGCGGGTGAGGACATAACTTTTGGCAAGTATGGCATATATGTCAAATTTGGCCATGGACCTGATGGGAAAAGGTTAATACGGGGCACAACCCATGCCACTATTAGCAGGGAGGAGCTATTAGAAATCCTGTCGGCCCCAAGCCAAGTCGCCATAGGCAAAGTCAAATTGACCGATTATTGCAACCAAAAAGGACTGATAGATAGGAAATTGGCAGTACTTGAGAATGATAAAATACACTTTTGGAGAGCACACCGAGGGTCTAAAATCACCGATCAATTAACCATTGAAGATTTAACGGACGACTTGGGATCGGAAATTAGAGACATTACGTGGGAACTGTACGCAGGGGGGACATATACTGTGAGAGGGGTATCCCTTAGGTCGTGCGCACCAGGGCAAAGGAACAAGGCCACAGTCTTATGTGATTGCACTGACGTGCTTAGCCCCTGTTATCTAGTCAATGGTAGGAAACCATCTCCATTCAACGTGGTAGAAGGTTATGAATGTCACCATCGGAAGCCCCGGGCAACCTATGAAGACCTAGAGATGGAAGAAATATCAAGGAAACGAGTCCCTGTGTATGATCCCCTTTGTCTGTTTGACACCGACAGCAAGCTGCTGCTCCCAGACACGTACTACCTGGAAGAAGACCAAGAAGACTTCGAATATGCACTGAGGTGCTGGGGTCTTGGGGTCTACGTAGCTGGCGAACCCATGACCTCACCTCCAAACATAAGAATACACCACAGCTCTACACTGTTACTATTGACCCCCGGAGTGGACTCCGAATTAAATCTACAGTACATACACTGTTACTCCCACCAGGTAGAAGTTGACGTATACGTTAAGGGCCAACTCCTGGAGGAGGGAGACACTACCACGGAGGTCAGCGACCTCCAAGAAGATAGCGGAGGGGGGACAGAAGATGCAATATTGGATGAAGAGGATACATTGTCCACAACCGAGTCAATGCCTCCGCTAGAAGAAGAAGAGGGGAGTGAAGAGTTGATCACTTATGTGGTCATTAGGGGGCTACAAGAAGAGAGATATACCAGTCATCTTAAGTTGAATGATTGGATCAGTGAGAATGTCACAGAGCCGCACAAGGTTCAGATTATGCTTGACGGGACAGTGAGAGTGACAATAAAAGAGGGTAAAGTCAAGCACCTGTTCGGGGTCTTTAGGGTGGAGAACACCCTAGAAGCAATGTTTAAGGAGACTATAGCTGACCTTCCTGTAGCTACCCAACCGCCCCAAGGGCCCATTTATACAGCCAGAGAACTGGCTCAGGGGAACATTGCCCCAATCCAACCCGCAGTAAACTACTACGGGATGGTTGAGGGAAGAGGCGGCCCAATGACAGCATTTGAAGCTCTATCAGTGTTACGGTCGCAAAAAACTCTAGCCAGAGAAGTAAAAGTGAACACCCGTAGAGCACAGACCTTCTTGAATAAAGTTAAGAGGGCCACCGAGGTCAAAGCATCAGAATTGGCATTAAAGCATTTACCGGTGCTTGGCAAAGTAAATGGGAGGAAATTGATTAGGGAGGAGACCAATATTCCTAACCAAAGGCTAGCGTCAATAATGACCTCAGTAGGAATCAGATTAGAAAAATTGCCAGTTGTCAGGGCCAACACCTCTGGCTCCAAATTTAGACAGTCAATTTTAGAAAAAATGGACAAACATGAAAATGAGCAAGTCCCAGGGCTGCACGAAAAAATGTGGGCTGCATTCCTGGTGACTGCTAGACAAGATTTAAGAAACACATACGAGGAAGTAACCTACTCTGAGTTGGAGAACGGGATCAACCGGAAAGGAGCCCCGGGTTTCTTTGAAAAAGAGAGTTCAATAGGGGAGGTGTTGGAGAGTAAGGACAAAATTGAAACTGTCATCCAAGAAATCAAAAATGGCAACCACTTGTACTATGAGACAGCCATGCCAAAAAACGAAAAAAGAGATGTGCTTGATGACTGGCTGTCTGAGGATTTCGTAACTTACAAGAAACCGCGAGTGATACAGTACCCCGAGGCTGTCACCCGGTTAGCCATCACTAAAATAATGTATAAGTGGGTGAAGCAAAAGCCTATAGTGATCCCTGGCTATGAAGGAAAAACTCCAATTTTTGAAATATTCGAAAAAGTCAGCGCAGACTGGGCCCAATTCAGGAACCCTGTTGCTGTCAGTTTCGATACCAAAGCCTGGGATACTCAAGTAACGAGAGAAGACCTCAGACTGGTAGCAAGGATACAGAAGTATTATTACAAAAAGAAGTACTGGAAGTTCATCGACAACTTAACTGCCATGATGGAGGAAGTACCTGTGATCACTGTGGAAGGGGACATGTTCCTCAGGGTCGGCCAGCGCGGGTCGGGACAACCCGACACCTCGGCAGGTAACTCTATACTGAATGTGCTGACAATGCTGGTGGCTTTCTCAGAGTCTACCAACCTGCCAATAACGGCTGCCTGGAAAGCTTGCCGGATCCATGTCTGTGGGGATGACGGTTTCCTAATTACGGAAGCAGAATTAGGCAGAAAATTCGCTGAAAAAGGCGTACCCTTGTTAGCTGCTTTTGGCAAACCTCAAAAGATCATAGAAGGAGCAAGTTTAAAGATAACCAGCAGTTTTGATGGAATAGAGTTTTGTAGCCACTCTCCTATTAAAGTCCAAACACCAAATGTGCAGTGGATGCCAGCAAGACCAACAGCCACAATCTTAGGGAAAATGAGCACTAGACTAGGCGAGGGCGCCACAAGATCAGGGGAAGAATATGAAAAACAGGTGGCATTTGCATACTTACTCATGTACCCTTGGAATCCATTAGTCAGAAGAATCAGTCTCTTACTATTATCAACTACTGATCCAATAGGAAAAGAGGAAACCCCATGTTCTGATGAAGGAGTGAAGTATGTGGGGGACCCCATAGCTGCATACAGGGACGTGTGGGGGCACAAACTGGAGGACGTCGGGCATGTCGACCAGCCGCAGTTATCCCGGATGAATTACAGCATGACTTACTTGGGGGTCTGGAAGCCGAAGACGAGCCAGCGGCTAGTCGAACAATGCTGCCGGCTAGCTAAAGAAAACAACTGCGTGGCACGTGCCGATTCCCTCATTAAGAAGAAAGTGAAAGTCACTTATGATCCCGGGATAGGGGCAGCTCAGGTCATCCGTAGGTGGGAAGAATTAGAGTGGACCAGAAGGAAACCTGAACTCACCAGTGTAAACGCAGAAGACGACCTCCTTTTGATCCTGTGGAAGAGACTGTCAGAATACGTCTACCAGAAAATGAAGCTCATGCAGAAGATGTTCTCCCCCTACTAGACGGAGGGGTACACAATAAAAATTTTTGCCAGTATCTGGTGGGTGTAGAATCAGTGTAAATAAGATTTTAATTTAAAAAGGGGCAAGTGGCCATACAGGCTGGGGTAATCGCCGTTCCCCCCCTTTACTAGGCGCCTCAACCCCACATGTCGTGGGGTTGTTGTAAATACTTGAATAAATGGAGTAATACGGGTAATAAACTTAAAGGCCAGTATT
| 62,111
|
MK216752.1
|
Atypical porcine pestivirus 1
|
Yan,X.L., Li,Y.Y., He,L.L., Wu,J.L., Tang,X.Y., Chen,G.H., Mai,K.J., Wu,R.T., Li,Q.N., Chen,Y.H., Sun,Y., Ma,J.Y., Xiaoling,Y., Yiyun,L., Lili,H., Jiaoling,W., Xiaoyu,T., Guihua,C., Kaijie,M., Ruiting,W., Qianniu,L., Yonghui,C., Yuan,S., Jingyun,M.
|
South China Agricultural University, College of Animal Science
|
China
|
2019-06-22
|
GD-HJ-2017.04
|
Pestivirus scrofae
|
Pestivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 11,509
|
GenBank
| 1
|
China
|
China
|
Sus scrofa
| null |
2017-04
| null | null |
Atypical porcine pestivirus 1 isolate GD-HJ-2017.04, complete genome
|
ATATGGGGCATAATGCATAGATTGGCTGCATTATGTGTATAACATCCCAAATTGCCAAAGGCTCTGTGGTGAGTGGGGGAAAGGGGTTAACCAGGCCTCTAGTACCACAGGCACCATTTAACAGGGCAACTCAAACCTGAGAGAGAGGTACCGAACTCTTAAGCCTCGAGTACGGGGCAGACGTCACCGAGTAGTACACCCAACGACCACCACATTTAGGTGTAGGGTCTACTGAGGCTCGGGTGGACGTGGGCATGCCCAAAGAGAAAACGGTGGGGGACCTGGGGGTCGGGTCCGCCATGCCCCTCAATGGGGTAGACCTTACTGCTTGATAGAGTGCCGGCGGATGCCTCAGGTAAGAGTATAAAATCCGTTGTTTATTAACATGAAAGAACAAATTACATATTACTTAAAAAAAGAAAAGCAAAGGAATGGGTGGACAGAACTAGTAGTAGGGGAAAGCCATACGAAGATAACCACACTCTCCGGGAGGACCTACCGAGGTACTTGGGAAATGGAGAAACGGTCCAACCCTTACGGAATCTACTTCCCTAGACCGAGTCCTCAACAGCTTACGGCCTTGCACCCACACCCAGTCGTGAATTGTAGGATGATAGAGTACAAAGAAGCTGACCCTAACTATGGCGACTGCCCAAACACAAATGGAGTATTCATAGATGAAAAAGGCAGGAAATTTAGCGGACCCCCGTTGGGTCTCTGGAAGATAAGACTGGACTACTATGACTTGGTGAATGCTAAAAGGCCAACTTTCACAAGTGAACAGATCTCTTACCAAGTCGAAACCTGTAGTGGGGAGCTGGCCACCGTAACACCTACACACGGCAGGGTGTTTGTGGATGACTACAGGAGATTTTATCAATGGAAACCTAGGTGTGAAGGGATGGTGCTCTACGTGAAAACCTGCTCCGACTGGGCAGATCAAGTAGACAAACAAGAGAAAGAAAGCCCCCCGAAACCACAGAGACCACCGAGACGAGACCCACGGAAAGGGTTGCAGCCGCAAGTCCCCAAAGAAACCGAAATCACAGAGAAAAAGAGACAACCTAGCGTAACTTTAGTGACTGGGGGGCAGAAGGCTCAGATCATTTATAAAGGCAAGACCAAAAATAAGAAGACCCCCGACGGGGTCTATAAGTACCCAGGAGCTAAAGAAGGGGATGTAGTAAAGGTGAGGAAGATGTTAAAAAATTGGCACCTAGCTCTGGTAATGTGTCTGATATATCTTATAAATCCAAGCCTTGCAAAGGTTCAATGGTTTTTGAAGGATGAAAACTCGACAGGAATCAATCAGATATTGTGGCAAAGACGGGTCAACAGGTCCTTGCATGGAGAATGGCCAAACCAAATCTGTCATGGCATGCCAAATGAAACCATTACAGATGAGGAGTTACATAGCCTAGGGATGATAGACACCAGCCCAAGAACAAACTACACCTGCTGCCAACTACAATACCATGAATGGAAGAAACATGGCTGGTGTAATTATCCGCAAAAACAAGCATGGATCAGAAGAATAACAATTTTACAATCCAACCTTACTGGGGCCTATGAAGGACCAGAATGTGCTGTCATATGTCGGTTTAACGGCAGTCACAACATCGTAAGGCAAGCCAGGGATGAGGTTAGCCCGCTTACAGGATGCAAGGAGGGGCACCCTTTTCTATTCTCCGATGAAAGATCTGAGGCTTCGTGCTTAAGACCGCCTTCCACTAGTTGGGTGAGACCAGTGAAAATGGACGAGGCTTCAGTGGCGGACAGTTTTGCCCATGGGGTAGATAAAGCAATAATATTAATTAGAAAAGGGGCTTCGGGAATTATAAATTTCTTAGACACTATTGGGAGGTGGCTACCAGTAACCGATGCCACTATCATACCATACTGTGAAACTTACACCGTAACGGGAATGTATGTTCATGTCAAGCATTGCCTTCCTAGGGGGCTACCCAAGCACTCGAAAATAATCTCCCCAACGTTGATATACCTAGGAGAAGGCGATCCAGCCCATAACATCCAACATTTATTCGGCTCAGGCATAGCAAAATGGATTCTAGTGCTGCTCGGGGTTTTGGGTGAATGGTATGGGGAATTAGCCTCAACAATATATTTAATACTCGAGTATGGCACTGAGTGGTTAGAACATGAAAACCTGGTCACAGAAGGGCTAATACCTGGCATCAATATCACGGTGGAGCTTCCTGCCAGCCATACGGTACCCGGCTGGGTATGGGTCGCGGGTCAGTGGGTATGTGTGAAACCAGATTGGTGGCCTACGCACATCTGGATCGAAACCGTGGTGGCAGAAGCTTGGCATGTGTTAAAGATACTAGCCTCGGCCTTGGTCAATATAGTTGCTGCATTTGTGAACTTGGAATTGATTTACCTGGTCATAATATTGGTCAAAGTATCAAAGGGTAACTTGGTCGGAGCTATCCTGTGGTGCCTATTACTGTCAGGGGCCGAGGGATCATGCCATAAGCGACGGGACTATTATAATGTCCAATTAGTCGTTGACGAAAAAACGGGCATAGAAAAACGGTCAATAATGGGCAAATGGACCGTAGTGACCAAAGAGGGTCAGGAGCCAAGATTAATGGAACAGATAAATATGGTATCAAATAGCAGTCTGACAGAAACTTACTGCTACAATGAACTAAACACCAGCAGCTGGGGGCGATACCCAATAAAACAGAGGGGGTGTGGGCAAACTGTACCCTATTGGCCTGGTGACAATGTTCTTGAAGAACAATACTTCAGCACGGGTTACTGGGTGAATGCCACAGGAGGTTGCCAGTTGAGGGAAGGTGTATGGCTATCAAGAAAGGGCGGTGTCCAGTGCCAACGTAACGGCTCATCTTTGATCCTGCAGTTGGCAATCAAGGAGGAAAACGACACCATGGAGATACCGTGTGACCCGGTAGAAACCGAAAGCATGGGCCCGGTGGCACAGGGCACTTGCGTGTATAGTTGGGCAGTAGCTCCAAGAGGATGGTACTACAACAGGAAGGATGGCTATTGGCTCCAATATATAAAGAAAAATGACTACCAATACTGGACAAAAATGCCCGCGGCTTCGTCCGCTGCAACAATGTACCGGCATTTACTACCTTTGTTGGTGGCTTGCCTTATGGGCGGTAGAATTTCAGTATGGATTGTAGCAATGATTCTATCCCTACAGGTGGAGGCCAGCGAGGTAGGAACCAAACAGTTGGCCGTCACTCTAACTCTATGGAAGATGGATTGGACAGAGTTGCTCTTTTACATTATTATAATCCTGTCCATAAAGGAAGACCTCATAAAGAAGATAGTGACAGCAAGTCTAGTGGCTCTCAAAAATAGCCCAGTAGCCTTAAGCTTCCTAATTGTACTTAGGCTAGTCGGAGGTAGTGAAGCACTCCCAGTAGGGCTACTACTAGAAAAAATGTGTATAGACCAGCCAGAGTTTGGAACCCCTTTTCTAATTTACTTGTGGGACAACTGGAAGTGGACTGTCTTAGTCAGCTTCTCCGCATTAAACCACGAAAAGACCATTAGATTAGCGAGGAAACTCTTATTAGCTACACATATAACTGCACTGACATTGACTGGTCTAAGTGATTCAATTTTTTACGTAATGCTCATAATAACCAATTTACTGATAAAGACATTCATATATCTACTGGGGGCCGGCATTAACTGGGTGGAGAAAGAAAAAAGGAGGCTGCTAGTGAAAAGGAAGCTGATATACAAACAAGCCGTAGTTTGCCATCAAGATGAGGATGAACTAGTGAGCAAATTTAACAAAATAACAATAAACACGGACTTCACCCCATGTAGGCTTGAACTGCTGCAACTGCTCAGAGCTTTCTTAGTTTCCCTATGTTTCTCTTACTACAAACCCCTCCTATATGCGGAGACCACCTTGACCGTCATAGTGATTGGCGTACAAGAGTACAATATGGCCATGGCCCGTGGGCGAAGTGCAGTCCACAGGCTATTAGCTATGGCTTACTACATATATGGTCGTCTGCAGGGGGACATGTTTCAGCTCGCTACGATCCAGTGTTTGATGTCGAGTCCAAGAAAGATAATGAAACACATGATAGAAAACCCAATCCTCAAGAAGATCTGGCAAGGAGAAACAGAGCTTTTCAACCAGGGTGTCAACCAGTCTAAAATAGTAAACCCAAAAAAGATAGGGTTGGTAGAATTGCAAAAAGGTATGTGTGGCTTGCCGACTGCAGTTCAAAACTTGGTCATATATGCAAAGAAGAATGACTCCCTCATTCTAGGAGAGGTAGGTTATCCGCCTGGAGACCTCACCATTGACGGGTGGGAAATACTAGGCCCTGGCAGGATCCCAAAAATCACTAACGTAGAGTCCGCTAAGATGGACCTACTATCTAAACTAATGACATTCCTGGGGATTGAAAGTTCGAGGGTCCCTAGAACCCCAGTCCACTCCACTAGGAAACTACTGAAGATAGTAAGAGGCATGGAAACTGGGTGGGGGTACACCCATGCTGGAGGAATTAGTAGTGCGAGGCATGTCACCGGTGAGAAGAACCTAATGACACACATGGAGGGCAGGAAGGGCAAGTATATCCTGCAGTCTCAAGAACATGGTGCTGATGAGGTGGAATATGGGGTGAAGACTGACCAGAAAGCACCCGACAATGCATTGTGCTATTGTTTTAATCCTGAAGCTACAAATATAAAGGGAGAGACAGGGGCTATGGTATTCATGAAGAAAATAGGAAAAAAGTGGACTCTCGTAACCTCAGATGGCAACAAAGCTTACTACAATGTAAGCAACTTAAAAGGGTGGTCTGGACTACCGATAATGCTGCACTCTACTGGAGCAATCGTAGGGAGGATCAAGTCGGCGTATTCAGATGAAAATGATCTGGTGGAAGAGCTGATTGACTCCAGGACCATCAGTAAAAGTAATGAGACAAATCTAGATCATCTTATTAAGGAGTTGGCAAGCATGCGGAGAGGGGAGTTCCGCTCAATCACCCTTGGGACGGGCGCCGGAAAAACTACAGAACTACCCAGACAATACCTCACAACAGTGGGGACACATAAGTCCGTGCTGGTCTTAGTCCCTTTGAAAGCGCCTGCTGAAAGTGTATGTCGCTTTATGAGATCTAAATACCCCACTATCAATTTTTCCTTAAGGGTAGGGGAGCGAAAGGAAGGGGATGTGAGTAGCGGCGTCACCTATGCCACTTACGGATTCTGCTGCCAGCTCAACCTAGTGCAACTCAAGGAGTGGATATCCAGGTACTCAATGGTGTTCTTCGATGAATACCATACGGCAACTCCAGAACAAATAGCCATAATAAGCAAAATCCATGCATTGAAAGTAAAGACCAGGATTGTGGCTATGTCAGCCACCCCCCCGGGCACTGTGACAACAGAAGGTAGAAAATTTGACATAGAAGAAGTGGGGGTAGCCACAATAGAAAAAGGGGAAGAGCCAAAAAGAGGGCGTATAGCAGTGGCCGGCATGCAGGTTCCGTTAGAAGACTTAACTGGGAAAAATTGCCTGGTGTTCGTGGCAACTAAAGAGGCCGCGGAGACGGAAGCTAAAGAACTACGTGCCAGGGGCATCAACGCCACCTACTATTACTCTGGCATAGATCCCAAAACCTTGGAGTACGGTATGACAAACCAACCGTACTGCATTGTTGCCACCAACGCTATTGAATCAGGTATAACCTGCCCCGACTTGGACGTGGTCATAGACACCATGCAAAAGTATGAAAAAGTAGTGAATTTCTCAGCAAAGATGCCCTTAATTGTCACTTCGCTGGTGAGGAAGAAAATCACTAGAGAGGAGCAAGGCCAGAGGAAAGGCCGAGTAGGCAGGCAAAAGAAGGGTAAATACTATTATCCATCAGGCGTAGTGCCGAATGGGTCAAAAGACTTGAGTTATTTGATCTTGCAGGCCCAAGAATATGGTGTCTTGGAGCAGGTCAATATAACAGAATATTTCATCATAATGAATGAGGACTGGGGGCTCTATGACGTAGATGAGGTGGAAGTGAGAATATTGGAGAGAATGAATAAAGAAATCTTACTCCCGCTAGGTATTGTGGAGAAGCAAATCCTGGAAAGAAGCACCCACCCGGAAAAAGTGGCATTATTGTACAACAAGCTAGTACAGAAAAACCCTATAGTTTACCCAAGGGTCCAGGACGGTGAGATTGGCAAAGAATACAATACCCACAACCTAGCCGTGTATGACAAACTTAAGGACGTTAACCCACAGGCAATATATGTCTTAGCAGAGGAGGAAAGGGCTACGGAAATGATGGGCCTTGAATTTGAGCAGGAGCCTTCTGACCTACCGGATTCAGTAGGCCAACTTTGTGAAGACATAAAGAGGTACACAAAACTTTCTGGAATTACTGAAAAATTGCTAGTTGGTACGATGGTGGGGTATATTGGATACAAGGCCCTAACCAGAAATCATGTGCCCTGGGTTAGTAAAGAGTATTCTTATGAGTTAACGGATTCACCAGACACTTATGAAAATTCATTTGCACCTTTGGACATAGATGTCCAGACTCCCAGTGATAGCAAACACCCGGAACAACTGGCGGACCACCAGTTAAGACGACTGTTGGAGAATGGGAAGGACAAGGCAATCGACCTCTTAAAAGAAATCCGCCAGTTCACCAGTGGAGTCATAAACAGCCCAAAAGCATTAAGCATATGGGAGAAAATTTACCAATACTTGAATAAGCACCAGGGGGAGATCATTTCATCAGCGGCATGGGGTAGTGCAACAGCCCTTCATGACAGTATCAAATCTAGGCTGGGGGATGAGGTCGCCACAGCAGTGATAATCCTCAAGTATTTAGCATTCGGAGAAAGAGAGTTGTCTGGGCTTACTAGACAAGTCTTAATTGACATTATAGTATATTATATAGTCAACAAGCCCCGGTTTGAGGGGGATGACTATGCAAAAAGAAAAGGGAGAAGACTAGTCATTGAGGTGTTGATGGGGGCACTAGCAACCTATGCTGTATCCAACTTTTGGGGCGTATCTATCAATAAAGTGTTGCAACCAATATCTGACTACTTGCCCTACGCCACTGCCACTCTGGCTTTCCTACGCCCAACTTTTATGGAATCAGCAGTGGTGGTGGCGTCTTCTATCTACAGGGCCTTCCTTTCCATCAAACATGCGGAGAACAGGAGTCTTGTTACGCAGGTCGCCTCGGCTGCCCTTGAAGTCATGGGCTTAACACCAGTATCGGCTGGTTTAGGCGTCCTGCTGGGACTTGGACTATGTGTGCTTCACATGAACATAGATAAGAACGAAGAAAAGAGGACACTAATACTGAAGATGTTCGTCAAAAACTTCATAGACCAGGCGGCGTTAGACGAGCTAGACAAACTGGAGCCGGAAAAAATAATCCTCTCACTGCTGGAAGGCATCCAGACTTGCACAAATCCTGTCAGAGCTGTCATGATTCTGTATAGGGTCTATTACAAAGGGGAATCATTTACAGAAGCCCTTTCTAGGATGGCAGGGAAATCCCTCATTGTGATGGTTTTAGTGGAATTTCTAGAATTGACAGGCCAAACCCAAGGGGGGTACATAGACCTCAGTGCCAACTTATTAACCTTTCTTTTGGAAAAACTGAAAAAGATGACCAATCTTGCTTTAGGGGAGGCCAGGAAAGCCTTACTCCCCATCCCATACCTGTACTGTGAAACCTGGCAGTCCGACGCCAGAATCAGAGCCCCAGACTCTTACGACCAGGTGGTGGTGGAATGCAAATGCGGGGCCTCGGCGAGGTATTCCTTTTGTCATGGAGTCTGTGAGATGCTTGAAGAGAAAGGGACCAGGTGGTGTAAAAACTTCTTCTTATGGGGACCTAACTTTAAAAACCCGGACCCAAAAAGGATGACATTCTACGAATACGACCAAGCAAAAAAATGTCCTGTAACTATTGCGGGTGAGGACATAACTTTTGGCAAGTATGGCATATATGTCAAATTTGGCCATGGACCTGATGGGAAAAGGTTAATACGGGGCACAACCCATGCCACTATTAGCAGGGAGGAGCTATTAGAAATCCTGTCGGCCCCAAGCCAAGTCGCCATAGGCAAAGTCAAACTGACCGATTATTGCAACCAAAAAGGACTAATAGATAGGAAATTGGCAGTACTTGAGAATGATAAAATACACTTTTGGAGAGCACACCGAGGGTCTAAAATCACCGATCAATTAACCATTGAAAATTTAACGGACGACTTGGGATCGGAAATTAGAGACATTACGTGGGAACTGTACGCAGGGGGGACATGTACTGTGAGAGGGGTATCCCTTAGGTCTTGCGCACCAGGGCAAAGGAACAAGGCCACAGTCTTATGTGATTGCACTGACGTGCTTAGCCCCTGTTATCTAGTCAATGGTAGGAAACCATCTCCATTCAACGTGGTAGAAGGTTATGAATGCCACCATCGGAAGCCCCGGGCAACCTATGAAGACCTAGAGATGGAAGAAATATTAAGGAAACGAGTCCCTGTGTATGATCCCCTTTGTCTGTTTGACACCGACAGCAAGCTGCTGCCCCCAGACACGTACTACCTAGAAGAAGACCAAGAAGACTTCGAATATGCACTAAGGTGCTGGGGTCTTGGGGTCTATGTAGCTGGCGAACCCATGACCTCACCTCCAAACATAAGAATACACCACAGCTCTACACTGTTACTATTGACCCCCGGAGTGGACTCCGAATTAAATCTACAGTACATACACTGTTACTCCCACCAGGTAGAAGTTGACGTATACGTTAAGGGCCAACTTCTGGAGGAGGGAGACACTACCACGGAGGACAGCGACCTCCGAGAAGATAGCGGAGGGGGGACAGAACATGCAATGTTGGATGAAGAGGATACATTGTCCACAACCGAGTCAATGCCTCCGCTAGAAGAAGAAGAGGGGAGTGAAGAGTTGATCACTTATGTGGTCATTAGGGGGCTACAAGAAGAGAGATACACTAGTCATCTTAAGTTGAATGATTGGATCAGTGAGAATGTCACAGAGCCGCACAAGGTTCAGATTATGCTTGACGGGACAGTGAGAGTGACAATAAAAGAGGGTAAAGTCAAGCACCTGTTTGGGGTCTTTAGGGTGGAGAACACCCTAGAAGCAATGTTTAAGGAGACTATAGCTGACCTTCCTGTAGCTACCCAACCGCCCCAAGGGCCCATTTATACAGCTAGAGAACTGGCTCAGGGGAACATTGCCCCAATCCGACCCGCAGTAAACTACTACGGGATGGTTGAGGGAAGGGGCGACCCAATGACAGCATTTGAAGCTCTATCAGTGTTACGGTCGCAAAAAACTCTAGCCAGAGAAGTAAAAGTGAACACCCGTAGAGCACAGACCTTCTTGAATAAAGTTAAGAGGGCCACCGAGGTCAAAGCATCAGAATTGGCATTAAAGCATTTACCGGTGCTTGGCAAAGTAAATGGGAGGAAATTGATTAGGGAGGAGACCAATATTCCTAACCAAAGGCTAGCGTCAATAATGACCTCAGTAGGAATCAGATTAGAAAAATTGCCAGTTGTCAGGGCCAACACCTCTGGCTCCAAATTTAGACAGTCAATTTTAGAAAAAATGGACAAACATGAAAATGAGCAAGTCCCAGGGCTGCACGAAAAAATGTGGGCTGCATTCCTAGTGACTGCTAGACAAGATTTAAGAAACACATACGAGGAAGTAACCTACTCTGAGTTGGAGAACGGGATCAACCGGAAAGGAGCCCCGGGTTTCTTTGAAAAAGAGGGTTCAATAGGGGAGGTGTTGGAGAGTAAGGACAAAATTGAAACTGTCATCCAAGAAATCAAAAATGGCAATCACTTGTACTATGAGACAGCCATGCCAAAAAACGAAAAAAGAGATGTGCTTGATGACTGGCTGTCTGAAGATTTCGTAACTTACAAGAAACCGCGAGTGATACAGTACCCCGAGGCTGTCACCCGGTTAGCCATCACTAAAATAATGTATAAGTGGGTGAAGCAAAAGCCCATAGTGATCCCTGGCTATGAAGGAAAAACTCCAATTTTTGAAATATTCGAAAAAGTCAGCGCAGACTGGGCCCAATTCAGGAACCCTGTCGCTGTCAGTTTCGATACCAAAGCCTGGGATACTCAAGTAACGAGAGAAGACCTCAGACTGGTAGCAAGGATACAGAAGTATTATTACAAAAAGAAGTACTGGAAGTTCATCGACAACTTAACTGCCATGATGGAGGAAGTACCTGTGATCACTGTGGAAGGGGACATGTTCCTCAGGGTCGGCCAGCGCGGGTCAGGACAACCCGACACCTCGGCAGGTAACTCTATACTGAATGTGCTGACAATGCTGGTGGCTTTCTCAGAGTCCACCAACCTGCCAATAACGGCTGCCTGGAAAGCTTGCCGGATCCATGTCTGTGGGGATGACGGTTTCCTAATTACGGAAGCAGAATTAGGCAAAAAATTCGCTGAAAAAGGCGTACCCTTGTTAGCTGCTTTTGGCAAACCTCAAAAGATCATAGAAGGAGCAAGTTTAAAGATAACCAGCAGTTTCGATGGAATAGAGTTTTGTAGCCACTCTCCTATTAAAGTCCAAACACCAAATGTGCAGTGGATGCCAGCACGACCAACAGCCACAATCTTAGGGAAAATGAGTACTAGACTAGGCGAGGGCGCCACAAGATCAGGGGAAGAATATGAAAAACAGGTGGCATTTGCATACTTACTCATGTACCCTTGGAATCCATTAGTTAGAAGAATCAGTCTCTTACTATTATCAACTACTGATCCAATAGGAAAAGAGGAAACCCCATGTTCTGACGAAGGAGTGAAGTATGTGGGGGACCCCATAGCTGCATACAGGGACGTGTGGGGGCACAAACTGGAGGACGTCGGGCATGTCGACCAGCCGCAGTTATCCCGGATGAATTACAGCATGACTTACTTGGGGGTCTGGAAGCCGAAGACGAGCCAGCGGTTAGTCGAACAATGCTGCCGGCTAGCTAAAGAAAACAACTGCGTGGCACGTGCTGATTCCCTCATTAAGAAGAAAGTGAAAGTCACTTATGATCCCGGGATAGGGGCAGCTCAGGTCATCCGTAGGTGGGAAGAATTAGAGTGGACCAGAAGGAAACCTGAACTCACCAGTGTAAATGCAGAGGACGACCTCCTTTTGATCCTGTGGAAGAGACTGTCAGAATACGTTTACCAGAAAATGAAGCTCATGCAGAAGATGTTCACCTCCTACTAGACGGAGGGGCACACAATAAAAAATTTTTGCCAGTATCTGGTGGGTGTAGAATCAGTGTAAATAAGATTTTAATTTAAAAGGGGCAAGTGGCCATACAGGCTGGGGTAATCGCCGTTCCCCCCCTTTACCAGGCGCCTCAACCCCACATGTCGTGGGGTTGTTGTAAATACTTGAATAAATGGAGTAATACGGGTAATAAACTTAAAGGCCAGTATT
| 62,112
|
MK216753.1
|
Atypical porcine pestivirus 1
|
Yan,X.L., Li,Y.Y., He,L.L., Wu,J.L., Tang,X.Y., Chen,G.H., Mai,K.J., Wu,R.T., Li,Q.N., Chen,Y.H., Sun,Y., Ma,J.Y., Xiaoling,Y., Yiyun,L., Lili,H., Jiaoling,W., Xiaoyu,T., Guihua,C., Kaijie,M., Ruiting,W., Qianniu,L., Yonghui,C., Yuan,S., Jingyun,M.
|
South China Agricultural University, College of Animal Science
|
China
|
2019-06-22
|
GD-LN-2017.04
|
Pestivirus scrofae
|
Pestivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 11,509
|
GenBank
| 1
|
China
|
China
|
Sus scrofa
| null |
2017-04
| null | null |
Atypical porcine pestivirus 1 isolate GD-LN-2017.04, complete genome
|
ATATGGGGCATAATGCATAGATTGGCTGCATTATGTGTATAACATCCCAAATTGCCAAAGGCTCTGTGGTGAGTGGGGGAAAGGGGTTAACCAGGCCTCTAGTACCACAGGCACCATTTAACAGGGCAACTCAAACCTGAGAGAGAGGTACCGAACTCTTAAGCCTCGAGTACGGGGCAGACGTCACCGAGTAGTACACCCAACGACCACCACATTTAGGTGTAGGGTCTACTGAGGCTCGGGTGGACGTGGGCATGCCCAAAGAGAAAACGGTGGGGGACCTGGGGGTCGGGTCCGCCATGCCCCTCAATGGGGTAGACCTTACTGCTTGATAGAGTGCCGGCGGATGCCTCAGGTAAGAGTATAAAATCCGTTGTTTATTAACATGAAAGAACAAATTACATATTACTTAAAAAAAGAAAAGCAAAGGAATGGGTGGACAGAACTAGTAGTAGGGGAAAGCCATACGAAGATAACCACACTCTCCGGGAGGACCTACCGAGGTACTTGGGAAATGGAGAAACGGTCCAACCCTTACGGAATCTACTTCCCTAGACCGAGTCCTCAACAGCTTACGGCCTTGCACCCACACCCAGTCGTGAATTGTAGGATGATAGAGTACAAAGAAGCTGACCCTAACTATGGCGACTGCCCAAACACAAATGGAGTATTCATAGATGAAAAAGGCAGGAAATTTAGCGGACCCCCGTTGGGTCTCTGGAAGATAAGACTGGACTACTATGACTTGGTGAATGCTAAAAGGCCAACTTTCACAAGTGAACAGATCTCTTACCAAGTCGAAACCTGTAGTGGGGAGCTGGCCACCGTAACACCTACACACGGCAGGGTGTTTGTGGATGACTACAGGAGATTTTATCAATGGAAACCTAGGTGTGAAGGGATGGTGCTCTACGTGAAAACCTGCTCCGACTGGGCAGATCAAGTAGACAAACAAGAGAAAGAAAGCCCCCCGAAACCACAGAGACCACCGAGACGAGACCCACGGAAAGGGTTGCAGCCGCAAGTCCCCAAAGAAACCGAAATCACAGAGAAAAAGAGACAACCTAGCGTAACTTTAGTGACTGGGGGGCAGAAGGCTCAGATCATTTATAAAGGCAAGACCAAAAATAAGAAGACCCCCGACGGGGTCTATAAGTACCCAGGAGCTAAAGAAGGGGATGTAGTAAAGGTGAGGAAGATGTTAAAAAATTGGCACCTAGCTCTGGTAATGTGTCTGATATATCTTATAAATCCAAGCCTTGCAAAGGTTCAATGGTTTTTGAAGGATGAAAACTCGACAGGAATCAATCAGATATTGTGGCAAAGACGGGTCAACAGGTCCTTGCATGGAGAATGGCCAAACCAAATCTGTCATGGCATGCCAAATGAAACCATTACAGATGAGGAGTTACATAGCCTAGGGATGATAGACACCAGCCCAAGAACAAACTACACCTGCTGCCAACTACAATACCATGAATGGAAGAAACATGGCTGGTGTAATTATCCGCAAAAACAAGCATGGATCAGAAGAATAACAATTTTACAATCCAACCTTACTGGGGCCTATGAAGGACCAGAATGTGCTGTCATATGTCGGTTTAACGGCAGTCACAACATCGTAAGGCAAGCCAGGGATGAGGTTAGCCCGCTTACAGGATGCAAGGAGGGGCACCCTTTTCTATTCTCCGATGAAAGATCTGAGGCTTCGTGCTTAAGACCGCCTTCCACTAGTTGGGTGAGACCAGTGAAAATGGACGAGGCTTCAGTGGCGGACAGTTTTGCCCATGGGGTAGATAAAGCAATAATATTAATTAGAAAAGGGGCTTCGGGAATTATAAATTTCTTAGACACTATTGGGAGGTGGCTACCAGTAACCGATGCCACTATCATACCATACTGTGAAACTTACACCGTAACGGGAATGTATGTTCATGTCAAGCATTGCCTTCCTAGGGGGCTACCCAAGCACTCGAAAATAATCTCCCCAACGTTGATATACCTAGGAGAAGGCGATCCAGCCCATAACATCCAACATTTATTCGGCTCAGGCATAGCAAAATGGATTCTAGTGCTGCTCGGGGTTTTGGGTGAATGGTATGGGGAATTAGCCTCAACAATATATTTAATACTCGAGTATGGCACTGAGTGGTTAGAACATGAAAACCTGGTCACAGAAGGGCTAATACCTGGCATCAATATCACGGTGGAGCTTCCTGCCAGCCATACGGTACCCGGCTGGGTATGGGTCGCGGGTCAGTGGGTATGTGTGAAACCAGATTGGTGGCCTACGCACATCTGGATCGAAACCGTGGTGGCAGAAGCTTGGCATGTGTTAAAGATACTAGCCTCGGCCTTGGTCAATATAGTTGCTGCATTTGTGAACTTGGAATTGATTTACCTGGTCATAATATTGGTCAAAGTATCAAAGGGTAACTTGGTCGGAGCTATCCTGTGGTGCCTATTACTGTCAGGGGCCGAGGGATCATGCCATAAGCGACGGGACTATTATAATGTCCAATTAGTCGTTGACGAAAAAACGGGCATAGAAAAACGGTCAATAATGGGCAAATGGACCGTAGTGACCAAAGAGGGTCAGGAGCCAAGATTAATGGAACAGATAAATATGGTATCAAATAGCAGTCTGACAGAAACTTACTGCTACAATGAACTAAACACCAGCAGCTGGGGGCGATACCCAATGAAACAGAGGGGGTGTGGGCAAACTGTACCCTATTGGCCTGGTGACAATGTTCTCGAAGAACAATACTTCAGCACGGGTTACTGGGTGAATGCCACAGGAGGTTGCCAGTTGAGGGAAGGTGTGTGGCTATCAAGAAAGGGCGGTGTCCAGTGCCAACGTAACGGCTCATCTTTGATCCTGCAGTTGGCAATCAAGGAGGAAAATGACACCATGGAGATACCGTGTGACCCGGTAGAAACCGAAAGCATGGGCCCGGTGGCACAGGGCACTTGCGTGTATAGTTGGGCAGTAGCTCCAAGAGGATGGTACTACAACAGGAAGGATGGCTATTGGCTCCAGTATATAAAGAAAAATGACTATCAATACTGGACAAAAATGCCCGCGGCTTCGTCCGCTGCAACAATGTACCGGCATTTACTACCTTTGTTGGTGGCTTGCCTTATGGGCGGTAGAATTTCAGTATGGATTGTAGCAATGCTTCTATCCCTACAGGTGGAGGCCAGCGAGGTAGGAACCAAACAGTTGGCCGTCACCCTAACTCTATGGAAGATGGATTGGACAGAGTTGCTCTTTTACATTATTATAATCCTGTCCATAAAGGAAGACCTCATAAAGAAGATAGTGACAGCAAGTCTAGTGGCTCTCAAAAATAGCCCAGTAGCCTTAAGCTTCCTAATTGTACTTAGGCTAGTCGGAGGTAGTGAAGCACTCCCAGTAGGGCTACTGCTAGAAAAAATGTGTATAGACCAGCCAGAGTTTGGAACCCCTTTCCTAATTTACTTGTGGGACAATTGGAAGTGGACTGTCTTAGTCAGCTTCTCCGCATTAAACCACGAAAAGACCATTAGATTAGCAAGGAAACTCTTATTAGCTACACATATAACTGCACTGACATTGACTGGTCTAAGTGATTCAATTTTTTACGTAATGCTCATAATAACCAATTTACTGATAAAGACATTCATATACCTACTGGGGGCCGGCATTAATTGGGTGGAGAAAGAAAAAAGGAGGCTGCTAGTGAAAAGGAAGATGATATACAAACAAGCCGTAGTTTGCCATCAAGATGAGGATGAACTAGTGAGCAAATTTAACAAAATAACAATAAACACGGATTTCACCCCATGTAGGCTTGAACTGCTGCAACTGCTCAGAGCTTTCTTGGTTTCCCTATGTTTCTCTTACTACAAACCCCTCCTATATGCGGAGACCACCTTAACCGTCATAGTGATTGGCGTACAAGAGTACAATCTGGCCATGGCCCGTGGGCGAAGTGCAGTCCACAGGCTATTAGCTATGGCTTACTACATATATGGTCGTCTGCAGGGGGACATGTTTCAGCTCGCTACGATCCAGTGTCTGATGTCGAGTCCAAGAAAGATAATGAAACACATGATAGAAAACCCAATCCTTAAGAAGCTCTGGCAAGGAGAAACAGAGCTTTTCAACCAGGGTGTCAACCAGTCTAAAATAGTAAACCCAAAAAAGATAGGGTTGGTAGAATTGCAAAAAGGTATGTGTGGCTTGCCGACTGCAGTGCAAAACTTGGTCATATATGCAAAGAAGAATGACTCCCTCATTCTAGGAGAGGTGGGTTATCCGCCTGGAGACCTCACCATTGACGGGTGGGAAATACTAGGCCCTGGCAGGATCCCAAAAATCACTAACGTAGAGTCCGCTAAGATGGACCTACTATCTAAACTAATGACATTCCTGGGGATTGAAAGTTCGAGGGTCCCTAGAACCCCAGTCCACTCCACTAGGAAACTACTGAAGATAGTAAGAGGCATGGAAACTGGGTGGGGGTACACCCATGCCGGAGGAATTAGTAGTGCGAGGCATGTCACCGGTGAGAAGAACCTAATGACACACATGGAGGGCAGGAAGGGCAAGTATATCCTGCAGTCTCAAGAACATGGTGCTGATGAGGTGGAATATGGGGTGAAGACTGACCAGAAAGCACCCGACAATGCATTGTGCTATTGTTTTAATCCTGAAGCTACAAATATAAAGGGAGAGACAGGGGCCATGGTATTCATGAAGAAAATAGGAAAAAAGTGGACTCTCGTAACCTCAGATGGCAACAAAGCTTACTACAATGTGAGCAACTTAAAAGGGTGGTCTGGACTGCCGATAATGCTGCACTCTACTGGAGCAATCGTAGGGAGGATCAAGCCGGCGTATTCAGACGAAAATGATCTGGTGGAAGAGCTGATTGACTCCAGGACCATCAGTAAAAGTAATGAGACAAATCTAGATCATCTTATTAAGGAGTTGGCAAGCATGCGGAGAGGGGAGTTCCGCTCAATCACCCTTGGGACGGGCGCCGGAAAAACTACAGAACTACCCAGACAATACCTCACAACAGTGGGGACACATAAGTCCGTGCTGGTCTTAGTCCCCTTGAAAGCGCCTGCTGAAAGTGTATGTCGCTTTATGAGGTCTAAATACCCCACTATCAATTTTTCCTTAAGGGTAGGGGAGCGAAAGGAAGGGGATGTGAGTAGCGGCGTCACCTATGCCACTTATGGATTCTGCTGCCAGCTCAACCTAGTGCAACTCAAGGAATGGATATCCAGGTACTCAATGGTGTTCTTCGATGAATACCATACGGCAACTCCAGAACAAATAGCCATAATAAGCAAAATCCATGCATTGAAAATAAAGACCAGGATTGTGGCTATGTCAGCCACCCCCCCGGGCACTGTGACAACAGAAGGTAGAAAATTTGACATAGAAGAAGTGGGGGTTGCCACAATAGAAAAAGGGGAAGAGCCAAAAAGAGGGCGTATAGCAGTGGCCGGCATGCAGGTTCCGTTAGAAGACTTAACAGGGAAAAATTGCCTGGTGTTCGTGGCAACTAAAGAGGCCGCAGAGACGGAAGCTAAAGAACTACGTGCCAGGGGCATCAACGCCACCTACTATTACTCTGGCATAGATCCCAAAACCCTGGAGTACGGTATGACAAACCAACCGTACTGTATTGTGGCCACTAACGCTATTGAATCAGGTATAACCTGCCCCGACTTGGACGTGGTCATAGACACCATGCAAAAGTATGAAAAAGTAGTGAATTTTTCAGCAAAGATGCCCTTAATTGTCACTTCGCTGGTGAGGAAGAAAATCACTAGAGAGGAGCAAGGCCAGAGGAAAGGCCGAGTAGGCAGGCAAAAGAAGGGTAAATACTATTATCCATCAGGCGTAGTGCCGAATGGATCAAAAGACTTGAGTTATTTGATCTTGCAGGCCCAAGAATATGGTGTCTTGGAGCAGGTCAATATAACAGAATATTTCATCATAATGAATGAAGACTGGGGGCTTTATGACGTAGATGAGGTGGAAGTGAGAATATTGGAGAGAATGAATAAAGAAATCTTACTCCCGCTAGGTATTGTGGAGAAGCAAATCCTGGAAAGAAGCACCCACCCGGAAAAAGTAGCATTATTGTACAACAAGCTAGTACAGAAAAACCCTATAGTTTACCCAAGGGTTCAGGACGGTGAGATTGGCAAAGAATACAATACCCACAACCTAGCCGTGTATGACAAACTTAAGGACGTTAACCCACAGGCAATATATGTCTTAGCAGAGGAAGAAAGGGCTACGGAAATGATGGGCCTTGAATTTGAGCAGGAGCCTTCTGACCTGCCGGATTCAGTAGGCCAACTTTGTGAAGACATAAAGAGGTACACAAAACTTTCTGGAATTACTGAAAAATTGCTAGTTGGTACGATGGTGGGGTATATTGGATACAAGGCCCTAACCAGAAATCATGTGCCCTGGGTTAGTAAAGAGTATTCTTATGAGTTGACGGATTCACCAGACACTTATGAAAATTCATTTGCACCTTTGGACATAGATGTCCAGACTCCCAGTGATAGCAAACACCCGGAACAACTGGCGGACCACCAGTTAAGACGACTGTTGGAGAATGGGAAGGACAAGGCAATCGACCTCTTAAAAGAAATCCGCCAGTTCACCAGTGGAGTCATAAACAGCCCAAAAGCATTAAGCATATGGGAGAAAATTTACCAATACTTGAATAAGCACCAGGGGGAGATCATTTCATCAGCGGCATGGGGTAGTGCAACAGCCCTTCATGACAGTATCAAATCTAGGCTGGGGGATGAGGTCGCCACAGCAGTGATAATCCTCAAGTATTTAGCATTTGGAGAGAGAGAGTTGTCTGGGCTCACTAGACAAGTCTTAATTGATATTATAGTATATTATATAGTCAACAAGCCCCGGTTTGAGGGGGATGACTATGCAAAAAGAAAAGGGAGGAGACTAGTCATTGAGGTGTTGATGGGGGCACTAGCAACCTATGCTGTATCCAACTTTTGGGGCGTATCTATCAATAAAGTGTTGCAACCAATATCTGACTACTTGCCCTACGCCACTGCCACTCTGGCTTTCCTACGCCCAACTTTTATGGAATCAGCAGTGGTGGTGGCGTCTTCTATCTACAGGGCCTTCCTTTCCATCAAACATGCAGAGAACAGGAGTCTTGTCACGCAGGTCGCCTCGGCTGCCCTTGAAGTCATGGGCTTAACACCAGTATCGGCTGGTTTAGGCGTCCTGTTGGGACTTGGACTATGTGTGCTTCACATGAACATAGATAAGAACGAAGAAAAAAGGACACTAATACTGAAGATGTTCGTCAAAAACTTCATAGACCAGGCGGCGTTAGACGAGCTGGACAAACTGGAGCCGGAAAAAATAATCCTCTCACTGCTGGAAGGCATCCAGACTTGCACAAATCCTGTCAGAGCTGTCATGATTCTGTATAGGGTCTATTACAAAGGGGAATCATTTACAGAAGCCCTTTCTAGGATGGCAGGGAAATCCCTTATTGTGATGGTTTTAGTGGAATTTCTAGAATTGACAGGCCAAACCCAAGGGGGGTACATAGACCTCAGTGCCAACTTATTAACCTTTCTTTTGGAAAAACTGAAAAAGATGACCAATCTTGCTTTAGGGGAGGCCAGGAAAGCCTTACTCCCCATCCCATACCTGTACTGTGAAACCTGGCAGTCCGACGCCAGAATCAGAGCCCCAGACTCTTACGACCAGGTGGTGGTGGAATGCAAATGCGGGGCCTCGGCGAGGTATTCCTTTTGTCATGGAGTCTACGAGATGCTTGAAGAGAAAGGGACCAAGTGGTGTAAAAACTTCTTCTTATGGGGACCTAACTTTAAAAACCCGGACCCAAAAAGGATGACATTCTACGAATACGACCAAGCAAAAAAATGTCCTGTAACCATTGCGGGTGAGGACATAACTTTTGGCAAGTATGGCATATATGTCAAATTCGGCCATGGACCTGATGGGAAAAGGTTAATACGGGGCACAACCCATGCCACTATCAGCAGGGAGGAGCTATTAGAAATCCTGTCGGCCCCAAGCCAAGTCGCCATAGGCAAAGTCAAATTGACCGATTATTGCAACCAAAAAGGAATAATAGATAGGAAATTGGCAGTACTTGAGAATGATAAAATACACTTTTGGAGAGCACACCGAGGGTCTAAAATCACCGATCAATTAACCATTGAAAATTTAACGGACGACTTGGGATCGGAAATTAGAGACATTACGTGGGAACTGTACGCAGGGGGGACATGTACTGTGAGAGGGGTATCCCTTAGGTCGTGCGCACCAGGGCAAAGGAACAAGGCCACAGTCTTATGCGATTGCACTGACGTGCTTAGCCCCTGTTATCTAGTCAATGGTAGGAAACCATCTCCATTCAACGTGGTAGAAGGTTATGAATGTCACCATCGGAAGCCCCGGGCAACCTATGAAGACCTAGAGATGGAAGAAATATTGAGGAAACGAGTCCCTGTGTATGATCCCCTTTGTCTGTTTGACACCGACAGCAAGCTGCTGCTCCCAGACACGTACTACCTGGAAGAAGACCAAGAAGACTTCGAATATGCACTAAGGTGCTGGGGTCTTGGGGTCTATGTAGCTGGCGAACCCATGACCTCACCTCCAAACATAAGAATACACCACAGCTCTACACTGTTACTATTGACCCCCGGAGTGGACTCCGAATTAAATCTACAGTACATACACTGTTACTCCCACCAGGTAGAAGTTGACGTATACGTTAAGGGCCAACTCCTGGAGGAGGGAGACACTACCACGGAGGACAGCGACCTCCGAGAAGATAGCGGAGGGGGGACAGAATATGCAATATTGGATGAAGAGGATACATTGTCCACAACCGAGTCAATGCCTCCGCTAGAAGAAGAAGAGGGGAGTGAAGAGTTGATCACTTATGTGGTCATTAGGGGGCTACAAGAAGAGAGATACACCAGTCATCTTAAGTTGAATGATTGGATCAGTGAGAATGTCACAGAGCCGCACAAGGTTCAGATTATGCTTGACGGGACAGTGAGAGTGACAATAAAAGAGGGTAAAGTCAAGCACCTGTTTGGGGTCTTTAGGGTGGAGAACACCCTAGAAGCAATGTTTAAGGAGACTATAGCTGACCTTCCTGTAGCTACCCAACCGCCCCAAGGGCCCATTTATACAGCTAGAGAACTAGCTCAGGGGAACATTGCCCCAATCCAACCCGCAGTAAACTACTACGGGATGGTTGAGGGAAGAAGCGGCCCAATGACAGCATTTGAAGCTCTATCAGTGTTACGGTCGCAAAAAACTCTAGCCAGAGAAGTAAAAGTGAACACCCGTAGAGCACAGACCTTCTTGAATAAAGTTAAGAGGGCCACCGAGGTCAAAGCATCAGAATTGGCATTAAAGCATTTACCGGTGCTTGGCAAAGTAAATGGGAGGAAATTGATTAGGGAGGAGACCAATATTCCTAACCAAAGGCTAGCGTCAATAATGACCTCAGTAGGAATCAGATTAGAAAAATTGCCAGTTGTCAGGGCCAACACCTCTGGCTCCAAATTTAGACAGTCAATTTTAGAAAAAATGGACAAACATGAAAATGAGCAAGTCCCAGGGCTGCACGAAAAAATGTGGGCTGCATTCCTAGTGACTGCTAGACAAGATTTAAGAAACACATACGAGGAAGTAACCTACTCTGAGTTGGAGAACGGGATCAACCGGAAAGGAGCCCCGGGTTTCTTTGAAAAAGAGAGTTCAATAGGGGAGGTGTTGGAGAGTAAGGACAAAATTGAAACTGTCATCCAAGAAATCAAAAATGGCAACCACTTGTACTATGAGACAGCCATGCCAAAAAACGAAAAAAGAGATGTGCTTGATGACTGGCTGTCTGAGGATTTCGTAACTTACAAGAAACCGCGAGTGATACAGTACCCCGAGGCTGTCACCCGGTTAGCCATCACTAAAATAATGTATAAGTGGGTGAAGCAAAAGCCCATAGTGATCCCTGGCTATGAAGGAAAAACTCCAATTTTTGAAATATTCGAAAAAGTCAGCGCAGACTGGGCCCAATTCAGGAACCCTGTCGCTGTCAGTTTCGATACCAAAGCCTGGGATACTCAAGTAACGAGAGAAGACCTCAGACTGGTAGCAAGGATACAGAAGTATTATTACAAAAAGAAGTACTGGAAGTTCATCGACAACTTAACTGCCATGATGGAGGAAGTACCTGTGATCACTGTGGAAGGGGACATGTTCCTCAGGGTCGGCCAGCGCGGGTCAGGACAACCCGACACCTCGGCAGGTAACTCTATACTGAATGTGCTGACAATGCTGGTGGCTTTCTCAGAGTCCACCAACCTGCCAATAACGGCTGCCTGGAAAGCTTGCCGGATCCATGTCTGTGGGGATGACGGTTTCCTAATTACGGAAGCAGAATTAGGCAGAAAATTCGCTGAAAAAGGCGTACCCTTGTTAGCTGCTTTTGGCAAACCTCAAAAGATCATAGAAGGAGCAAGCTTAAAGATAACCAGTAGTTTTGATGGAATAGAGTTTTGTAGCCACTCTCCTATCAAAGTCCAAACACCAAATGTGCAGTGGATGCCAGCACGACCAACAGCCACAATCTTAGGGAAAATGAGTACTAGACTAGGCGAGGGCGCCACAAGATCAGGGGAAGAATATGAAAAACAGGTGGCATTTGCATACTTACTCATGTACCCTTGGAATCCATTAGTTAGAAGAATCAGTCTCTTACTATTATCAACTACTGATCCAATAGGAAAAGAGGAAACCCCATGTTCTGACGAAGGAGTGAAGTATGTGGGGGACCCCATAGCTGCATACAGGGACGTGTGGGGGCACAAACTGGAGGACGTCGGGCATGTCGACCAGCCGCAGTTATCCCGGATGAATTACAGCATGACTTACTTGGGGGTCTGGAAGCCGAAGACGAGCCAGCGGTTAGTCGAACAATGCTGCCGGCTAGCTAAAGAAAACAACTGCGTGGCACGTGCTGATTCCCTCATTAAGAAGAAAGTGAAAGTCACTTATGATCCCGGGATAGGGGCAGCTCAGGTCATCCGTAGGTGGGAAGAATTAGAGTGGACCAGAAGGAAACCTGAACTCACCAGTGTAAATGCAGAGGACGACCTCCTTTTGATCCTGTGGAAGAGACTGTCAGAATACGTTTACCAGAAAATGAAGCTCATGCAGAAGATGTTCACCTCCTACTAGACGGAGGGGCACACAATAAAAAATTTTTGCCAGTATCTGGTGGGTGTAGAATCAGTGTAAATAAGATTTTAATTTAAAAGGGGCAAGTGGCCATACAGGCTGGGGTAATCGCCGTTCCCCCCCTTTACCAGGCGCCTCAACCCCACATGTCGTGGGGTTGTTGTAAATACTTGAATAAATGGAGTAATACGGGTAATAAACTTAAAGGCCAGTATT
| 62,113
|
MK216754.1
|
Atypical porcine pestivirus 1
|
Yan,X.L., Li,Y.Y., He,L.L., Wu,J.L., Tang,X.Y., Chen,G.H., Mai,K.J., Wu,R.T., Li,Q.N., Chen,Y.H., Sun,Y., Ma,J.Y., Xiaoling,Y., Yiyun,L., Lili,H., Jiaoling,W., Xiaoyu,T., Guihua,C., Kaijie,M., Ruiting,W., Qianniu,L., Yonghui,C., Yuan,S., Jingyun,M.
|
South China Agricultural University, College of Animal Science
|
China
|
2019-06-22
|
GD-ZW-2017.10
|
Pestivirus scrofae
|
Pestivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 11,509
|
GenBank
| 1
|
China
|
China
|
Sus scrofa
| null |
2017-10
| null | null |
Atypical porcine pestivirus 1 isolate GD-ZW-2017.10, complete genome
|
ATATGGGGCATAATGCATAGATTGGCTGCATTATGTGTATAACATCCCAAATTGCCATAGGCTCTGTGGTGAGTGGGGGAAAGGGGTTAACCAGGCCTCTAGTACCACAGGCACCATTTAACAGGGCAACTCAAACCTGAGAGAGAGGTACCGAACTCTTAAGCCTCGAGTACGGGGCAGACGTCACCGAGTAGTACACCCAACGACCACCACATTTAGGTGTAGGGTCTACTGAGGCTCGGGTGGACGTGGGCATGCCCAAAGAGAAAACGGTGGGGGACCTGGGGGTCGGGTCCGCCATGCCCCTCAATGGGGTAGACCTTACTGCTTGATAGAGTGCCGGCGGATGCCTCAGGTAAGAGTATAAAATCCGTTGTTCATTAACATGAAAGAACAAATTACATATTACTTAAAAAAAGAAAAGCAAAGGAATGGGTGGACAGAACTAGTAGTAGGGGAAAGCCATACGAAGATAACCACACTCTCCGGGAGGACCTATCGAGGTACTTGGGAAATGGAGAAACGGTCCAACCCTTACGGAATCTACTTCCCTAGGCCAAGTCCTCAACAGCTTACGGCCTTGCACCCACACCCAGTCGTGAACTGTAGGATGATAGAGTACAAAGAAGCTGACCCTAACTATGGCGAYTGCCCAAACACAAATGGAGTATTCATAGATGAAAAAGGCAGGAAATTTAGCGGACCCCCGTTTGGTCTCTGGAAGATAAGACTGGACTACCATGACTTGGTGAATGTTAAAAGGCCAACTTTCACAAGTGAACAGATCTCTTACCAAGTCGAAACCTGTAGTGGGGAGCTGGCCACCGTAACACCTACACACGGCAGGGTGTTCGTGGATGACTACAGGAGATTTTATCAATGGAAACCTAGGTGTGAAGGGATAGTGCTCTACGTGAAAACCTGCTCCGACTGGGCAGATCAAGTAGACAAACAAGAGAAAGAAAGCCCCCCGAAACCACAGAGACCACCGAGACGAGACCCACGGAAAGGGTTGCAGCCGCAAGTCCCCAAAGAAACCGAAATCACAGAGAAAAAGAGACAACCTAGCGTGACTTTAGTGGCTGGGGGGCAGAAGGCTCAGATCATTTATAAAGGCAAGACCAAAAATAAAAAGACCCCGGACGGGGTCTATAAGTACCCAGGAGCTAAAGAAGGGGATGTAGTAAAGGTGAGGAAGATGTTAAAAAATTGGCACCTAGCTCTGGTAATGTGTCTGATATATCTTATAAATCCAAGCCTTGCAAAGGTTCAATGGTTTTTGAAGGATGAAAACTCGACAGGAATCAATCAGATATTGTGGCAAAGACGGGTCAACAGGTCCTTGCATGGAGAATGGCCAAACCAAATCTGTCATGGCATGCCAAACGAAACCATTACAGATGAGGAGTTACATAGCCTAGGGATGATAGACACCAGCCCAAGAACAAACTATACCTGCTGTCAACTACAATACCATGAATGGAAGAAACATGGCTGGTGTAATTATCCGCAAAAACAAGCATGGATCAGAAGAATAACAGCTTTACAATCCAACCTTACTGGGGCCTATGAAGGACCAGAATGTGCTGTCATATGTCGGTTTAACGGCAGTCACAACATCGTAAGGCAAGCCAGGGATGAGGTTAGCCCACTTACAGGATGCAAGGAGGGGCACCCTTTTCTATTCTCCGGTGAAAGATCTGAGGCTTCGTGCTTAAGACCGCCTTCCACTAGTTGGGTGAGACCAGTGAAAATGGACGAGGCTTCAGTGGCGGACAGCTTTGCCCATGGGGTAGATAAAGCAATAATATTAATTAGAAAAGGGGCTTCAGGAATCATAAATTTCTTAGACACTATTGGGAGGTGGCTGCCAGTAACCGATGCCACTATCATACCATACTGTGAAACTTACACCGTAACGGGGATGTATGTTCATGTCAAGCATTGCCTTCCTAGGGGGCTACCCAAGCACTCGAAAATAATCTCCCCAACGTTGATATACCTAGGAGAAGGCGATCCGGCCCATAATATCCAACATTTATTCGGCTCAGGCATAGCAAAATGGGTTCTAGTGCTGCTCGGGGTTTTGGGTGAATGGTATGGGGAACTAGCCTCAACAATATATTTAATACTCGAGTATGGCACTGAGTGGTTAGAACATGAAAACCTGGTCACAGAAGGGCTAATACCTGGCATCAATATCACGGTGGAGCTTCCTGCCAGCCATACGGTACCCGGCTGGGTATGGGTCGCGGGTCAGTGGGTATGTGTGAAACCAGATTGGTGGCCTACGCACATCTGGATCGAAACCGTGGTGGCAGAAGCTTGGCATGTGTTAAAGATACTAGCCTCGGCCTTGGTCAATATAGTTACTGCATTTGTGAACTTGGAATTGATTTACCTGGTCATAATATTGGTCAAAGTATCAAAGGGTAACTTGATCGGAGCCATCCTGTGGTGCCTATTACTGTCAGGGGCCGAAGGATCATGCCATAAGCGACAGGACTATTATAATGTCCAATTAGTCGTTGACGAAAAAACGGGCATAGAAAAACGGTCAATAATGGGCAAATGGACCGTAGTGACCAAAGAGGGTCGAGAGCCAAGATTAATGGAACAGATAAATATGGTATCAAATAGCAGTCTGACAGAAACTTACTGCTACAATGAACTAAACACCAGCAGCTGGGGGCGATACCCAATGAAACAGAGGGGGTGTGGGCAAACTGTACCCTATTGGCCTGGTGACAATGTTCTCGAAGAACAATACTTCAGCACGGGTTACTGGGTGAATGCCACAGGAGGTTGCCAGTTGAGGGAAGGTGTGTGGCTATCAAGAAAGGGCGGTGTCCAGTGCCAACGTAACGGCTCATCTTTGATCCTGCAGTTGGCAATCAAGGAGGAAAATGACACCATGGAGATACCGTGTGACCCGGTAGAAACCGTAAGCATGGGCCCGGTGGCACAGGGCACTTGCGTGTATAGTTGGGCAGTAGCTCCAAGAGGATGGTACTACAACAGGAAGGATGGCTATTGGCTCCAATATATAAAGAAAAATGACTACCAATACTGGACAAAAATGCCCGCGGCTTCGTCCGCTGCAACAATGTACCGGCATTTACTACCTTTGTTGGTGGCTTGCCTTATGGGCGGTAGAATTTCAGTATGGATTGTAGCAATGCTTCTATCCCTACAGGTGGAGGCCAGCGAGGTAGGAACCAAACAGTTGGCCGTCACCCTAACTCTATGGAAGATGGATTGGATAGAGTTGCTCTTTTACATTATTATAATCCTGTCCATAAAGGAAGACCTCATAAAGAAGATAGTGACAGCAAGTCTAGTGGCTCTCAAAAATAGCCCAGTAGCCTTAAGCTTCCTAATTGTACTTAGGCTAGTCGGAGGTAGTGAAGCACTCCCAGTAGGGCTACTACTAGAAAAAATGTGTATAGACCAGCCAGAGTTTGGAACCCCTTTCCTAATTTACTTGTGGGACAATTGGAAGTGGACTGTCTTAGTCAGCTTCTCCGCATTAAACCACGAAAAGACCATTAGATTAGCAAGGAAACTTTTATTAGCTACACATATAACTGCACTGACATTGACCGGCCTAAGTGATTCAATTTTTTACGTAATGCTCATAATAACCAATTTACTGATAAAGACATTCATATATCTACTGGGGGCCGGCATTAACTGGGTGGAGAAAGAAAAAAGGAGGCTGCTAGTGAAAAGGAAGCTGATATACAAACAAGCCGTAGTTTGCCATCAAGATGAGAATGAACTAGTGAGCAAATTTAACAAAATAACAATAAACACGGACTTCACCCCATGTAGGCTTGAACTGCTGCAACTGCTCAGAGCTTTCTTGGTTTCCCTATGTTTCTCTTACTACAAACCCCTCCTATATGCGGAGACCACCTTAACCGTCATAGTGATTGGCGTACAAGAGTACAATCTGGCCATGGCCCGTGGGCGAAGTGCAGTCCACAGGCTATTAGCTATGGCTTACTACATATATGGTCGTCTGCAGGGGGACATGTTTCAGCTCGCTACGATCCAGTGTCTGATGTCGAGTCCAAGAAAGATAATGAAACACATGATAGAAAACCCAATCCTTAAGAAGCTCTGGCAAGGAGAAACAGAGCTTTTCAACCAGGGTGTCAACCAGTCTAAAATAGTAAACCCAAAAAAGATAGGGTTGGTAGAATTGCAAAAAGGTATGTGTGGCTTGCCGACTGCAGTACAAAACTTGGTCATATATGCAAAGAAGAATGACTCCCTCATTCTAGGAGAGGTGGGTTATCCGCCTGGAGACCTCACCATTGACGGGTGGGAAATACTAGGCCCTGGCAGGATCCCAAAAATCACTAACGTAGAGTCCGCTAAGATGGACCTACTATCTAAACTAATGACATTCCTGGGGATTGAAAGTTCGAGGGTCCCTAGAACCCCAGTCCACTCCACTAGGAAACTACTGAAGATAGTAAGAGGCATGGAAACTGGGTGGGGGTACACCCATGCCGGAGGAATTAGTAGTGCGAGGCATGTCACCGGTGAGAAGAACCTAATGACACACATGGAGGGCAGGAAGGGCAAGTATATCCTGCAGTCTCAAGAACATGGTGCTGATGAGGTGGAATATGGGGTGAAGACTGACCAGAAAGCACCCGACAATGCATTGTGCTATTGTTTTAATCCTGAAGCTACAAATATAAAGGGAGAGACAGGGGCTATGGTATTCATGAAGAAAATAGGAAAAAAGTGGACTCTCGTAACCTCAGATGGCAACAAAGCTTACTACAATGTAAGCAACTTAAAAGGGTGGTCTGGACTACCGATAATGCTGCACTCTACTGGAGCAATCGTAGGGAGGATCAAGTCGGCGTATTCAGATGAAAATGATCTGGTGGAAGAGCTGATTGACTCCAGGACCATCAGTAAAAGTAATGAGACAAGTCTAGATCATCTTATTAAGGAGTTGGCAAGCATGCGGAGAGGGGAGTTCCGCTCAATCACCCTTGGGACGGGCGCCGGAAAAACTACAGAACTACCCAGACAATACCTCACAACAGTGGGGACACATAAGTCCGTGCTGGTCTTAGTCCCTTTGAAAGCGCCTGCTGAAAGTGTATGTCGCTTTATGAGGTCTAAATACCCCACTATCAATTTTTCCTTAAGGGTAGGGGAGCGAAAGGAAGGGGATGTGAGTAGCGGCGTCACCTATGCCACTTATGGATTCTGCTGCCAGCTCAACCTAGTGCAACTCAAGGAATGGATATCCAGGTACTCAATGGTGTTCTTCGATGAATACCATACGGCAACTCCAGAACAAATAGCCATAATAAGCAAAATCCATGCATTGAAAGTAAAGACCAGGATTGTGGCTATGTCAGCCACCCCCCCGGGCACTGTGACAACAGAAGGTAGAAAATTTGACATAGAAGAAGTGGGGGTAGCCACAATAGAAAAAGGGGAAGAGCCAAAAAGAGGGCGTATAGCAGTGGCCGGCATGCAGGTTCCGTTAGAAGACTTAACAGGGAAAAATTGCCTGGTGTTCGTGGCAACTAAAGAGGCCGCAGAGACGGAAGCTAAAGAACTACGTGCCAGGGGCATCAACGCCACCTACTATTACTCTGGCATAGATCCCAAAACCCTGGAGTACGGTATGACAAACCAACCGTACTGTATTGTGGCCACCAACGCTATTGAATCAGGTATAACCTGCCCCGACTTGGACGTGGTCATAGACACCATGCAGAAGTATGAAAAAGTAGTGAATTTCTCAGCAAAGATGCCCTTAATTGTCACTTCGTTGGTGAGGAAGAAAATTACTAGAGAGGAGCAAGGCCAGAGGAAAGGCCGAGTAGGCAGGCAAAAGAAGGGTAAATACTATTATCCATCGGGCGTAGTGCCGAATGGGTCAAAAGACTTGAGTTATTTGATCTTGCAGGCCCAAGAATATGGTGTCTTGGAGCAGGTCAATATAACAGAATATTTCATCATAATGAATGAGGACTGGGGGCTTTATGACGTAGATGAGGTGGAAGTGAGAATATTGGAGAGAATGAATAAAGAAATCTTGCTCCCGCTAGGTATTGTGGAGAAGCAAATCCTGGAAAGAAGCACCCACCCGGAAAAAGTGGCATTATTGTACAACAAGCTAGTACAGAAAAACCCTATAGTTTACCCAAGGGTTCAGGACGGTGAGATTGGCAAAGAATACAATACCCACAACCTAGCCGTGTATGACAAACTTAAGGACGTTAACCCACAGGCAATATATGTCTTAGCAGAGGAAGAAAGGGCTACGGAAATGATGGGCCTTGAATTTGAGCAGGAGCCTTCTGACCTGCCGGATTCAGTAGGCCAACTTTGTGAAGACATAAAGAGGTACACAAAACTTTCTGGAATTACTGAAAAATTGCTAGTTGGTACGATGGTGGGGTATATTGGATACAAGGCCCTAACCAGAAATCATGTGCCCTGGGTTAGTAAAGAGTATTCTTATGAGTTGACGGATTCACCAGACACTTATGAAAATTCATTTGCACCTTTGGACATAGATGTCCAGACTCCCAGTGATAGCAAACACCCGGAACAACTGGCGGACCACCAGTTAAGACGACTGTTGGAGAATGGGAAGGACAAGGCAATCGACCTCTTAAAAGAAATCCGCCAGTTCACCAGTGGAGTCATAAACAGCCCAAAAGCATTAAGCATATGGGAGAAAATTTACCAATACTTGAATAAGCACCAGGGGGAGATCATTTCATCAGCGGCATGGGGTAGTGCAACAGCCCTTCATGACAGTATCAAATCTAGGCTGGGGGATGAGGTCGCCACAGCAGTGATAATCCTCAAGTATTTAGCATTTGGAGAGAGAGAGTTGTCTGGGCTCACTAGACAAGTCTTAATTGATATTATAGTATATTATATAGTCAACAAGCCCCGGTTTGAGGGGGATGACTATGCAAAAAGAAAAGGGAGGAGACTAGTCATTGAGGTGTTGATGGGGGCACTAGCAACCTATGCTGTATCCAACTTTTGGGGCGTATCTATCAATAAAGTGTTGCAACCAATATCTGACTACTTGCCCTACGCCACTGCCACTCTGGCTTTCCTACGCCCAACTTTTATGGAATCAGCAGTGGTGGTGGCGTCTTCTATCTACAGGGCCTTCCTTTCCATCAAACATGCAGAGAACAGGAGTCTTGTCACGCAGGTCGCCTCGGCTGCCCTTGAAGTCATGGGCTTAACACCAGTATCGGCTGGTTTAGGCGTCCTGTTGGGACTTGGACTATGTGTGCTTCACATGAACATAGATAAGAACGAAGAAAAAAGGACACTAATACTGAAGATGTTCGTCAAAAACTTCATAGACCAGGCGGCGTTAGACGAGCTGGACAAACTGGAGCCGGAAAAAATAATCCTCTCACTGCTGGAAGGCATCCAGACTTGCACAAATCCTGTCAGAGCTGTCATGATTCTGTATAGGGTCTATTACAAAGGGGAATCATTTACAGAAGCCCTTTCTAGGATGGCAGGGAAATCCCTTATTGTGATGGTTTTAGTGGAATTTCTAGAATTGACAGGCCAAACCCAAGGGGGGTACATAGACCTCAGTGCCAACTTATTAACCTTTCTTTTGGAAAAACTGAAAAAGATGACCAATCTTGCTTTAGGGGAGGCCAGGAAAGCCTTACTCCCCATCCCATACCTGTACTGTGAAACCTGGCAGTCCGACGCCAGAATCAGAGCCCCAGACTCTTACGACCAGGTGGTGGTGGAATGCAAATGCGGGGCCTCGGCGAGGTATTCCTTTTGTCATGGAGTCTACGAGATGCTTGAAGAGAAAGGGACCAAGTGGTGTAAAAACTTCTTCTTATGGGGACCTAACTTTAAAAACCCGGACCCAAAAAGGATGACATTCTACGAATACGACCAAGCAAAAAAATGTCCTGTAACCATAGCGGGTGAGGACATAACTTTTGGCAAGTATGGCATATATGTCAAATTTGGCCATGGACCTGATGGGAAAAGGTTAATACGGGGCACAACCCATGCCACTATTAGCAGGGAGGAGCTATTAGAAATCCTGTCGGCCCCAAGCCAAGTCGCCATAGGCAAAGTCAAATTGACCGATTATTGCAACCAAAAAGGACTAATAGATAGGAAATTGGCAGTACTTGAGAATGATAAAATACACTTTTGGAGAGCACACCGAGGGTCTAAAATCACCGATCAATTAACCATTGAAAATTTAACGGACGACTTGGGATCGGAAATTAGAGACATTACGTGGGAACTGTATGTAGGGGGGACATGTACTGTAAGAGGGGTATCCCTTAGGTCGTGCGCACCAGGGCAAAGGAACAAGGCCACAGTCTTATGTGATTGCACTGACGTGCTTAGCCCCTGTTATCTAGTCAATGGTAGGAAACCATCTCCATTCAACGTGGTAGAAGGTTATGAATGTCACCATCAGAAGCCCCGGGCAACCTATGAAGACCTAGAGATGGAAGAAATATTAAGGAAACGAGTCCCTGTGTATGATCCCCTTTGCCTGTTTGACACCGACAGCAAGCTGCTGCCCCCAGACACGTACTACCTGGAAGAAGACCAAGAAGACTTCGAATATGCACTAAGGTGCTGGGGTCTTGGGGTCTATGTAGCTGGCGAACCCATGACCTCACCTCCAAACATAAGAATACACCACAGCTCTACACTGTTACTATTGACCCCCGGAGTGGACTCCGAATTAAATCTACAGTACATACACTGTTACTCCCATCAGGTAGAAGTTGACGTATACGTTAAGGGCCAACTTCTGGAGGAGGGAGACACTACCACGGAGGACAGCGACCTCCGAGAAGATAGCGGAGGGGGGGCAGAACATGCAATATTGGATGAAGAGGATACATTGTCCACAACCGAGTCAATGCCTCCGCTAGAAGAAGAAGAGGGGAGTGAAGAGTTGATCACTTATGTGGTCATTAGGGGGCTACAAGAAGAGAGATACACCAGTCATCTTAAGTTGAATGATTGGATCAGTGAGAATGTCACAGAGCCGCACAAGGTTCAGATTATGCTTGACGGGACAGTGAGAGTGACAATAAAAGAGGGTAAAGTCAAGCACCTGTTTGGAGTCTTTAGGGTGGAGAACACCCTAGAAGCAATGTTTAAGGAGACTATAGCTGATCTTCCTGTAGCTACCCAACCGCCCCAAGGGCCCATTTATACAGCTAGAGAACTGGCTCAGGGGAACATTGCCCCAATCCAACCCGCAGTAAACTACTACGGGATGGTTGAGGGAAGGGGCGGCCCAATGACAGCATTTGAAGCTCTATCAGTGTTACGGTCGCAAAAAACTCTAGCCAGAGAAGTAAAAGTGAACACCCGTAGAGCACAGACCTTCTTGAATAAAGTTAAGAGGGCCACCGAGGTCAAAGCATCAGAATTGGCATTAAAGCATTTACCGGTGCTTGGCAAAGTAAATGGGAGGAAATTGATTAGGGAGGAGACCAATATTCCTAACCAAAGGCTAGCGTCAATAATGACCTCAGTAGGAATCAGATTAGAAAAATTGCCAGTTGTCAGGGCCAACACCTCTGGCTCCAAATTTAGACAGTCAATTTTAGAAAAAATGGACAAACATGAAAATGAGCAAGTCCCAGGGCTGCACGAAAAAATGTGGGCTGCATTCCTAGTGACTGCTAGACAAGATTTAAGAAACACATACGAGGAAGTAACCTACTCTGAGTTGGAGAACGGGATCAACCGGAAAGGAGCCCCGGGTTTCTTTGAAAAAGAGAGTTCAATAGGGGAGGTGTTGGAGAGTAAGGACAAAATTGAAACTGTCATCCAAGAAATCAAAAATGGCAACCACTTGTACTATGAGACAGCCATGCCAAAAAACGAAAAAAGAGATGTGCTTGATGACTGGCTGTCTGAGGATTTTGTAACTTACAAGAAACCGCGAGTGATACAATACCCCGAGGCTGTCACCCGGTTAGCCATCACTAAAATAATGTATAAGTGGGTGAAGCAAAAGCCCATAGTGATCCCTGGCTATGAAGGAAAAACTCCAATTTTTGAAATATTCGAAAAAGTCAGCGCGGACTGGGCTCAATTCAGGAACCCTGTCGCTGTCAGTTTCGATACCAAAGCCTGGGATACTCAAGTAACGAGAGAAGACCTCAGACTGGTAGCAAGGATACAGAAGTATTATTACAAAAAAAAGTACTGGAAGTTCATCGACAACTTAACTGCCATGATGGAGGAAGTACCTGTGATCACTGTGGAAGGGGACATGTTCCTCAGGGTCGGCCAGCGCGGGTCAGGACAACCCGACACCTCGGCAGGTAACTCTATACTGAATGTGCTGACAATGCTGGTGGCTTTCTCAGAGTCCACCAACCTGCCAATAACGGCTGCCTGGAAAGCTTGCCGGATCCATGTCTGTGGGGATGACGGTTTCCTAATTACGGAAGCAGAATTAGGCAAAAAATTCGCTGAAAAAGGCGTACCCTTGTTAGCTGCTTTTGGCAAACCTCAAAAGATCATAGAAGGAGCAAGTTTAAAGATAACCAGCAGTTTCGATGGAATAGAGTTTTGTAGCCACTCTCCTATTAAAGTCCAAACACCAAATGTGCAGTGGATGCCAGCACGACCAACAGCCACAATCTTAGGGAAAATGAGCACTAGACTAGGCGAGGGCGCCACAAGATCAGGGGAAGAATATGAAAAACAGGTGGCATTTGCATACTTACTCATGTACCCTTGGAATCCATTAGTTAGAAGAATCAGTCTCTTACTATTATCAACTACTGATCCAATAGGAAAAGAGGAAACCCCATGTTCTGATGAAGGAGTGAAGTATGTGGGGGACCCCATAGCTGCATACAGGGACGTGTGGGGGCACAAACTGGAGGACGTCGGGCATGTCGACCAGCCGCAGTTATCCCGGATGAATTACAGCATGACTTACTTGGGGGTCTGGAAGCCGAAGACAAGCCAGCGGCTAGTCGAACAATGCTGCCGGCTAGCTAAAGAAAACAACTGCGTGGCACGTGCTGATTCCCTCATTAAGAAGAAAGTGAAAGTTACTTATGATCCCGGGATAGGGGCAGCTCAGGTCATCCGTAGGTGGGAAGAATTAGAGTGGACCAGAAGGAAACCTGAACTCACCAGTGTAAACGCAGAAGACGACCTCCTTTTGATCCTGTGGAAGAGACTGTCAGAATACGTCTACCAGAAAATGAAGCTCATGCAGAAGATGTTCTCCCCCTACTAGACGGGGGGGCACACAATAAAAAATTTTTGCCAGTATCTGGTGGGTGTAGAATCAGTGTAAATAAGATTTTAATTTAAAAGGGGCAAGTGGCCATACAGGCTGGGGTAATCGCCGTTCCCCCCCTTTACTAGGCGCCTCAACCCCACATGTCGTGGGGTTGTTGTAAATACTTGAATAAATGGAGTAATACGGGTAATAAACTTAAAGGCCAGTATT
| 62,114
|
OM456550.1
|
Aurora borealis virus 3
|
Hepojoki,J.
|
University of Helsinki, Medicum, Department of Virology
|
Finland
|
2022-09-03
|
CR-captive3-FFPE
|
Aurora borealis virus 3
|
Reptarenavirus
|
Arenaviridae
|
ssRNA(+/-)
| 6,902
|
GenBank
| null |
Costa Rica
|
Costa Rica
|
Boa constrictor
| null |
2006
| null | null |
Aurora borealis virus 3 isolate CR-captive3-FFPE segment L, complete sequence
|
GTTAATTTGCAAAAACAATTCTTAAGTGGCACCTGTTTAAGGCGGTGGAAACACCTCAGCTCACTGGGGATCCGCGTTTTCCAGTATCCATCTAAAGAGTTAAATCCAAACAAATTAGATCCAAAGATTGACATCTGAAGGAGTGAGACTCTCAGATTCAAAGCTCAAGACACTCAACATGAGTGGGTCGACCTCCATAGGTCTAACTACAGAGGTGATCTCTATAATAACATTCATACTGGTGATTGCCATATTTGTTGTGGAGATCGTGAGCTGTGTCACCATGATGACTCTCAAGGCGATCACATTGAAGAAGAGACTCAGTTTTTGTCAAGGATGTGGGAAGAATGCAAGTCTTGTGATTCTTCCCTGCAAAAACAAAGTCTGTATGGAATGTGCCCTTAAAATGAGATGCCCAGTTTGCTATGAGGCATGTCTCTGGTGCGAAAACCCAGATGGTTCTCTTACATCATTAGCACTTGTAAACAAAGAGAGGAACAGACACACCAGAGGCGAAGGAGACACCCAAGAGCCCTGAGAAGCCAGAAGCAGAGCAGAGAGACAACAACAAAAGACCCAGGAAGGACAGGAGCAGGGAACAACCCAGACCGCCGAGGAGAGCAGCGCTCTCCTCGGCGGTCTGGGGGGTTCCGGAGCGTGGCCCAGCGATCTAGTCCTCCAGGGTCTCGGGCTCAGGAGTTCCGGACGCCCAGTCCTTGTAGAGCATGAGCCTGTGTCCTTTGTAAAGCAATGGACCCGCTGGATAGCTAACAAGTATTCCCTTCAGCCTGTGAAATACTAAAGTGGGACCTCTAGTGGTGAAGACTCTATCTGTGAATGATAGGAACTCAACAAATGAGTCAAGTTGGTGAAAGCCCATTTCGACCACCTTTTCAACTGTTGAATAACCAAAAATTCTACTTACCATTCCCCATAAGGCATCAAATCTAGCCTTGGGGAGACAAGATATTTCTCCTTTCATCCTTGTTATAAAATATGTCCTCACCAGCTTCCAGAGTTCATCCCATTCAGCCTCCGACATCTGAGTCATTATTGATCCCACCAAATCTGACTCTAAGGGAATTATACAACCCATGAACAAGAAGCATGGCTTTCCATTTGGTTTGGGATTCTCTATAACTGTGACATCTCTAAACTCTAGCATGTCTAACATTTCAGGCTCATCAAATTCTGAATCAGAGATGATTGTCCTTTTGAGAAATATGAAATCCTGATAATGAGCACGTCCTGTATGTGTAATCAGTGTTGCTTGAATTTTGAGATCATCACTCACTTGTTGAAAGCAGCACTGTAACTTTATTGGATTAGATGTCCCTAGTTTGGCACCTCTAACCCATGTGCCATCTTCCAGAGGAGCCTCTGGAGCACCTCTTCCATACACAACAACATTACTAGATGCAATCTCACTTGGCTCATCTTCCTTTTGTCTGTAGTGTGACTCCCTACCTAATAGAATTTGTTGGATATATCTTCTAACACCAGATTCCCCATGTGTCTTCAGCTCATCCATAGAACCTTCATATGGGGCAAGTTTTGTTGCGTCCAGAACCATGACCTTATCTATAATCTTCGGTTCTAATATTGAGTTCAAGATCATTCTGTTGACTATTGCTTGTAAACCTTTTCTTGCAATCCTCTCAGGTCCTCTCTTCTCAAGCTTCATAACCCGTCTTATCAACCTGCTTGGTTCATAATAATCAACTAGTACAACTGCCTCTTCTTGCCTGTCAATCCTACCATCAAAAATAGATAATCCTTCATTTGCACATTCTATTAACAATTCCATCTCAGGTCTAACTTTCCAGGAGTGTCTCATGAGCAGTCTCTTGTCTGGTGGCACAATGTCTTTTAAGTACTTGTCAAAGAGATCAGGCATAGTCATCTCAATAGCTGCAGTCAATTCATCTAATCCAAATCTGAATTCTGCAGTGTTGACAAGTGATGTTCTCATGTAGATGCTCTTGTTTGCCTGCTTACCTAACTCACCTTCAGTTCCACAAACCCAATCACCAACTGCACAAACTGATTGCATTACTAAGGAGGGGAAGATTTCAGCTACAGGTTTTACTACTGCTTTAGATTCCTTTAGAGTCAAGAATGTGCCATCACCCTTCCTAACACATGAACCTGACAAGCTGATACTTAATCCGATGAATCCAGTCACAACTGAACTCTGAAAAGCAGACCTCTCAAGTCCCTCTGCAATTAACAAACCAAGACCTTGCTTTGAATATCTCGAGTAGTGATTGATCAATTTTTTGATCAGGAGATTCTCACATGTCTCATTTATTGTTGTGCCCAAATTAAGCTTACTCCTGACAATTAATTTGAACTCTCCGTTGAGTGTTGGGAACCATTGAGTGATTTCTCCCAATTCTGATTTGCTAATTTCCACCATCCTCTTGTATGCCACAGAAGGTGCTATTGATGATTCTCTTAACTCCTTAATCACTTTTAAAAGTTCAAGTTTTAACACATCAAGCTTAATCTTCTCTATCCCCATGTCCATCAACCAGCTCTCCAGTGATCTCAACTTTCTGTAAGAAAGGCAACCCTCCAACCAATCTTGTTGTCTTGATTCCACAGGCTTCATTAAAGGATCACCAGCATACCCCAACCAGCCTAACATTTCAACCATCCTCCCCTTCAATGAGTCGGCCACCTTTAAAGACATGCCATTGCAAATTCCTTGCTCAACAATGGCATCACATGTGTTGAAAAGTTCCATTGGTGTTTTACACCTAAAATTGTTGATGGAAGCTGCAAAAAACTTTGTGAAGAGAGGAACCATTGTTGCTTCCACTTCAAAGTGAGACTTGAACTCCCCAACAAGTGGACTGCAGCAAAACTTTGGTGAGATGTGTTTATTTAAACAGTTGGATACTAGACACAAAAAGTTTGTGATCAAAAGAAGTTTGTCTTTTTGGTCACAATCTTTGTTTTTGTATTTGACATGAAACAATAACACCATATCATCAGATGTATTCATAGTGCTCGATCTGATTCCAAATATATCCCTTATCTTTTTTGTTATATATTCAGATGCCAGAGACCCGTAGAGGTCAGATGTATGGTGCAAGATTCCCTGACCCATATCAAACCATGAATGGATTTGTGAAGGCACAGGCCTATTGGACAGAACAGCATCCACCATAAATGTCTCAAAAGTTCTTTCTTTTCCAACCTGTCTGTCTCTTCTCCCTAAACTTATATCAAGGGATGATAGGATAACATCTTCCGCCAAGATCTGAGGTGTTTCCACCGCCTTAAACAGGTGCCACTTAAGAATTGTTTTTGCAAATGAGAAATCTAACCTTTTCCCCTCAGTGTCATTAATACTCTCCATAGCTTCAAACATCAAATGGTATTGAAGAGGGCTGTTAAAAGGACCCCATTTTGAGTGATCCATGCTTAGAACTATCTCATTCTCAAAAAAAGATCTTGCAATCCTTTTCATGAAATTGGAGAATTTCTTGTCTGAGTTAAGGCAACTATTATTAAGTTTGTTACCTATGTTTCTCGAAGTCTCTTCCAAGACTCTTGTGATTAGCTTTGTGTCAGAATCTCCAACATAGAGTTCTCTAGGCCCACCTACTTGTTCCTTTATTGCAAGTCCAAACTGGAGTGGCTTGTTATTTGGTCCAACTTCTGAATCCTTAATTTTTAGGTTCAGTGTTGAAAAAAGGATGTTTCTTAGTGTGGGTGCTCCATATTTTATTGCTAGGAGCCTATCCTGCAATGCCTCTGAATTGGTAACCCTTGTTGAAAGCATGCTTTCTCCCCTATATTTATTGGATATTGATAAAAAAGAGCTCTGGGGACCTGATCTATGATCATATGTCCCCTGAAAGTTGTTAAATCCCGCCCAAAGGAGCAAGAATTTAAAGCTCGAGAAAAATTCCTTTGATTCAAATTTTGTGACAACCATGCCTGCCGATATATTAGTCACATCAATGGTTTCAGCTTGTCTAGGAAACTCCAGTGGGGCTCTTAACATTATCTCATTGACAACTTTCTCATAGGCTTCCTCCTTTAACAAATCTGTGGGAAGGTCTGATAATTTGGTACTATAACATGTAGAGCGAACAAGGTCACAAATTTCAGGACCCAGTAGTTCACGAATTACGTCCAAGACTAAGCAGTATTTAGTCTTTTGAAGATCACTCACCTCTTTATAGCTTGACTCCTTAAGCTCATCATTAATTTCTGACATACATTTGCTAATCCGAAGAAGAAAATCACTCAACCCTTCTTCGGAATCAGTCTCAACAATAAGTCCTTGGACAATCCCTAAGAATTCTTCGTAAGCCAACCTGGTTTTTCTTCTTTTTTCACCACCAGCTTTCCAGTTTTTTTCTTTTGCAAGCTTATCCTTTGACTTTAAACCTTTGACTTCCTCCGATTCATTCTCTGCCCTTGTTGATTTTGTGATCCTCTTGTGCAATCTCTCGCTGATTACCCTTTTAAGAAGTTTCTCAGTGTCATATTGCTGATCTAGTGCACCATTTACATGATGTTTTTTTGACCTTTTAAACGTACTTTTGTTTGAAGTCAAATCTAAAACATCAATATTTGATGTTAAGTAATCCTTTGGGTTTAATAACTGCTCACCATCAATGCCATTAAACTTTTCCATTGAGATCCATTTTAAGAAATCAGCAAGAATAGGTTCATACAAGAATGGCTTGGTTTCAAAGGAAGGCTCCTCACATTGAATAAAATCATTGACTTCTTGTTCCATTCTTTCAACCAATTCATCAACGTTCTTACAATCATAGATCATGTTGGACATAAACTGAAATTTTGGTTTAAAGAACTTCTCATAGCAGTCCCTTAAATCTGACAACCTATCTGGAGTTTCTTTTGTGATTAAGTGACATAGGTAAGATATATTCAGTGCCCATGTCACCTTCAAAAATAAGCCTATATTTCTACAAGAAAGGATTTCATTGATTAAGCTATGAGCAAGCTCTCTCAGAAAGTATTCATCATAAGTGATACAGTTACCAACAACTTTAACTTTTAAATCTTTGTGGTGAATGAGGGATAAGGTGTCCATAATGTAATATCTCTGTGACTGAAGCTCTACCTGGAGTCTTTTAGTTGGAGTGGTTAAGATACCGTAGATCAGATAAGTGACTTTGACCTTTAAGCCATCAATTTGTTTGTCAGAATATTCAGATGAGACCAGGAATTCATTCACAGACTCCTGTCTATTTATTGTGTCTTGTAGTCTCTCAATGTCATCATGAATTGGGTTAATAAGCATAATCAATTGATCAACCAAGTTTGCAATAGGTTTTGCACTGAACATAAGTGGGAATAGCCTTGAGGGATTAATGTTGAAAGAATAAAAGCTGTGTCTAAGTTTACCTTGTTTATAGCTTTTACAAAGGAGACTGAATGCCTTCTGTCCTTCACCTGTACATTTATACAGCAATAGACAACCATTGACTGACTGAAAGAAGTACTCTTCACTTGCACTAGCCCTTGGAGTGCTTCTTGTTTTTTGAGAAAGAATGAGATTTAATGCAACTTTTTCAACAACATCTGCTTCATCAGATGTTACAGCAGTGGTCTGTGGTTCACAGGGCATGTCATTTATGATTTTTAGACTCAGAATAGGTTGGGGCACAGTAGTTCTTGGTGCTGACCTAGCATACATGTCCCTCAACACCGAAGGCTCAATTAGATCATGAGATGCTTCTTCCAAAAACTTAATGAGAGTTTCTAATTCTCCTAGCTTTTGTCTACTGCCAACTTCCTTTTGAAGGTTCTGAAGTGACTTTACCATTCTTTCAATCAACTTTTTGTACACCCAAATTGGTGAGTCTATGGAATCCACTTGCACCAGTCTATCATTTACACTAGGGTACCAGCCCTGTGGGAAATCATTGACACCTGATGTTTTAACAAAAAGTGTCAATGCAAGATAGTCATACACTTTGTTTTGTTTTCTTCTAGTATTCAATAAATTCAATGATTTCAGCTTATTCAGCAAACTTAGGTGATTGGTCTTAAAACTCAACCCAACCACAGCATTTCTAATTATTTCCAAGAGTCGCAGTTGTTTAGCTTCTCGTTTGAAATCTTGTATCATCCTTGTCATCTCAGGGCCATCCCAATTTAGAGTGAATGGCAACTCACCATCATTTTCCAGCATCCAATCAAGAAGATTTTTGTATGGATCGTCTGTTGACTCAATGTCAAACAGTAGTTTCTGTCCCTTGAACTCTTCTGTCAGAGTTCTGAAATCGTAGCTTGTCAGTGACTTCTTCAGTTCTAGATAATCCTCTTCTGAAATCCAATTGCAGATATCTGTGGTATAAGACAAGATTGATAATGACGTCGATAGCAATTTAAACATAAGAACTTCAGGAATTCTCCCTATTCTTGGCTTTTTTTCTGAGATTGTGATCACATTCAATGTCCACCCAAGTGGTCGTAGTAGATCCTCGAGACCATCGTACTTTAGTCTATCGAGCTGGACCTTTCTGTTTTGATCAGATGGTTCAGTCCTAGTGCTTACCTCCAAGACTGATAAAATGTTGTTGTTTCCATCAATTAAATAACCATCTGGAACAATTGTTTTGACTGTTTCATGAGATCCGATGGCATCATCAAGTAGCTCATTCATCTCCTTTAGCTCATTGTTGTGTTTGAGCCCTGTGTCCCTACAACAATTTAGCTCATGGATGGTTGATCTGAGCTTGATTGCATTTGTGGCCATCTCCCCAGCCGTATTGGAAATCCATCCTGGTTTATATAAATCTCTTTCATAGGACAGCACTTCCAACACAAGACCTTTTAGTCTCTCTAATTCAGAGTCCTCAGGACATATGGAGCCCATAATTGCCTAACCACCACCACCTCACCACTCG
| 25,857
|
OM456551.1
|
Aurora borealis virus 3
|
Hepojoki,J.
|
University of Helsinki, Medicum, Department of Virology
|
Finland
|
2022-09-03
|
CR-captive4-FFPE
|
Aurora borealis virus 3
|
Reptarenavirus
|
Arenaviridae
|
ssRNA(+/-)
| 6,843
|
GenBank
| null |
Costa Rica
|
Costa Rica
|
Boa constrictor
| null |
2006
| null | null |
Aurora borealis virus 3 isolate CR-captive4-FFPE segment L, complete sequence
|
ATTCTTGGGGATCCGCGTTTTCCAGTATCCATCTAAAGAGTTAAATCCAAACAAATTAGATCCAAAGATTGACATCTGAAGGAGTGAGACTCTCAGATTCAAAGCTCAAGACACTCAACATGAGTGGGTCGACCTCCATAGGTCTAACTACAGAGGTGATCTCTATAATAACATTCATACTGGTGATTGCCATATTTGTTGTGGAGATCGTGAGCTGTGTCACCATGATGACTCTCAAGGCGATCACATTGAAGAAGAGACTCAGTTTTTGTCAAGGATGTGGGAAGAATGCAAGTCTTGTGATTCTTCCCTGCAAAAACAAAGTCTGTATGGAATGTGCCCTTAAAATGAGATGCCCAGTTTGCTATGAGGCATGTCTCTGGTGCGAAAACCCAGATGGTTCTCTTACATCATTAGCACTTGTAAACAAAGAGAGGAACAGACACACCAGAGGCGAAGGAGACACCCAAGAGCCCTGAGAAGCCAGAAGCAGAGCAGAGAGACAACAACAAAAGACCCAGGAAGGACAGGAGCAGGGAACAACCCAGACCGCCGAGGAGAGCAGCGCTCTCCTCGGCGGTCTGGGGGGCTCCGGAGCGTGGCCCAGCGATCTAGTCCTCCAGGGTCTCGGGCTCAGGAGTTCCGGACGCCCAGTCCTTGTAGAGCATGAGCCTGTGTCCTTTGTAAAGCAATGGACCCGCTGGATAGCTAACAAGTATTCCCTTCAGCCTGTGAAATACTAAAGTGGGACCTCTAGTGGTGAAGACTCTATCTGTGAATGATAGGAACTCAACAAATGAGTCAAGTTGGTGAAAGCCCATTTCGACCACCTTTTCAACTGTTGAATAACCAAAAATTCTACTTACCATTCCCCATAAGGCATCAAATCTAGCCTTGGGGAGACAAGATATTTCTCCTTTCATCCTTGTTATAAAATATGTCCTCACCAGCTTCCAGAGTTCATCCCATTCAGCCTCCGACATCTGAGTCATTATTGATCCCACCAAATCTGACTCTAAGGGAATTATACAACCCATGAACAAGAAGCATGGCTTTCCATTTGGTTTGGGATTCTCTATAACTGTGACATCTCTAAACTCTAGCATGTCTAACATTTCAGGCTCATCAAATTCTGAATCAGAGATGATTGTCCTTTTGAGAAATATGAAATCCTGATAATGAGCACGTCCTGTATGTGTAATCAGTGTTGCTTGAATTTTGAGATCATCACTCACTTGTTGAAAGCAGCACTGTAACTTTATTGGATTAGATGTCCCTAGTTTGGCACCTCTAACCCATGTGCCATCTTCCAGAGGAGCCTCTGGAGCACCTCTTCCATACACAACAACATTACTAGATGCAATCTCACTTGGCTCATCTTCCTTTTGTCTGTAGTGTGACTCCCTACCTAATAGAATTTGTTGGATATATCTTCTAACACCAGATTCCCCATGTGTCTTCAGCTCATCCATAGAACCTTCATATGGGGCAAGTTTTGTTGCGTCCAGAACCATGACCTTATCTATAATCTTCGGTTCTAATATTGAGTTCAAGATCATTCTGTTGACTATTGCTTGTAAACCTTTTCTTGCAATCCTCTCAGGTCCTCTCTTCTCAAGCTTCATAACCCGTCTTATCAACCTGCTTGGTTCATAATAATCAACTAGTACAACTGCCTCTTCTTGCCTGTCAATCCTACCATCAAAAATAGATAATCCTTCATTTGCACATTCTATTAACAATTCCATCTCAGGTCTAACTTTCCAGGAGTGTCTCATGAGCAGTCTCTTGTCTGGTGGCACAATGTCTTTTAAGTACTTGTCAAAGAGATCAGGCATAGTCATCTCAATAGCTGCAGTCAATTCATCTAATCCAAATCTGAATTCTGCAGTGTTGACAAGTGATGTTCTCATGTAGATGCTCTTGTTTGCCTGCTTACCTAACTCACCTTCAGTTCCACAAACCCAATCACCAACTGCACAAACTGATTGCATTACTAAGGAGGGGAAGATTTCAGCTACAGGTTTTACTACTGCTTTAGATTCCTTTAGAGTCAAGAATGTGCCATCACCCTTCCTAACACATGAACCTGACAAGCTGATACTTAATCCGATGAATCCAGTCACAACTGAACTCTGAAAAGCAGACCTCTCAAGTCCCTCTGCAATTAACAAACCAAGACCTTGCTTTGAATATCTCGAGTAGTGATTGATCAATTTTTTGATCAGGAGATTCTCACATGTCTCATTTATTGTTGTGCCCAAATTAAGCTTACTCCTGACAATTAATTTGAACTCTCCGTTGAGTGTTGGGAACCATTGAGTGATTTCTCCCAATTCTGATTTGCTAATTTCCACCATCCTCTTGTATGCCACAGAAGGTGCTATTGATGATTCTCTTAACTCCTTAATCACTTTTAAAAGTTCAAGTTTTAACACATCAAGCTTAATCTTCTCTATCCCCATGTCCATCAACCAGCTCTCCAGTGATCTCAACTTTCTGTAAGAAAGGCAACCCTCCAACCAATCTTGTTGTCTTGATTCCACAGGCTTCATTAAAGGATCACCAGCATACCCCAACCAGCCTAACATTTCAACCATCCTCCCCTTCAATGAGTCGGCCACCTTTAAAGACATGCCATTGCAAATTCCTTGCTCAACAATGGCATCACATGTGTTGAAAAGTTCCATTGGTGTTTTACACCTAAAATTGTTGATGGAAGCTGCAAAAAACTTTGTGAAGAGAGGAACCATTGTTGCTTCCACTTCAAAGTGAGACTTGAACTCCCCAACAAGTGGACTGCAGCAAAACTTTGGTGAGATGTGTTTATTTAAACAGTTGGATACTAGACACAAAAAGTTTGTGATCAAAAGAAGTTTGTCTTTTTGGTCACAATCTTTGTTTTTGTATTTGACATGAAACAATAACACCATATCATCAGATGTATTCATAGTGCTCGATCTGATTCCAAATATATCCCTTATCTTTTTTGTTATATATTCAGATGCCAGAGACCCGTAGAGGTCAGATGTATGGTGCAAGATTCCCTGACCCATATCAAACCATGAATGGATTTGTGAAGGCACAGGCCTATTGGACAGAACAGCATCCACCATAAATGTCTCAAAAGTTCTTTCTTTTCCAACCTGTCTGTCTCTTCTCCCTAAACTTATATCAAGGGATGATAGGATAACATCTTCCGCCAAGATCTGAGGTGTTTCCACCGCCTTAAACAGGTGCCACTTAAGAATTGTTTTTGCAAATGAGAAATCTAACCTTTTCCCCTCAGTGTCATTAATACTCTCCATAGCTTCAAACATCAAATGGTATTGAAGAGGGCTGTTAAAAGGACCCCATTTTGAGTGATCCATGCTTAGAACTATCTCATTCTCAAAAAAAGATCTTGCAATCCTTTTCATGAAATTGGAGAATTTCTTGTCTGAGTTAAGGCAACTATTATTAAGTTTGTTACCTATGTTTCTCGAAGTCTCTTCCAAGACTCTTGTGATTAGCTTTGTGTCAGAATCTCCAACATAGAGTTCTCTAGGCCCACCTACTTGTTCCTTTATTGCAAGTCCAAACTGGAGTGGCTTGTTATTTGGTCCAACTTCTGAATCCTTAATTTTTAGGTTCAGTGTTGAAAAAAGGATGTTTCTTAGTGTGGGTGCTCCATATTTTATTGCTAGGAGCCTATCCTGCAATGCCTCTGAATTGGTAACCCTTGTTGAAAGCATGCTTTCTCCCCTATATTTATTGGATATTGATAAAAAAGAGCTCTGGGGACCTGATCTATGATCATATGTCCCCTGAAAGTTGTTAAATCCCGCCCAAAGGAGCAAGAATTTAAAGCTCGAGAAAAATTCCTTTGATTCAAATTTTGTGACAACCATGCCTGCCGATATATTAGTCACATCAATGGTTTCAGCTTGTCTAGGAAACTCCAGTGGGGCTCTTAACATTATCTCATTGACAACTTTCTCATAGGCTTCCTCCTTTAACAAATCTGTGGGAAGGTCTGATAATTTGGTACTATAACATGTAGAGCGAACAAGGTCACAAATTTCAGGACCCAGTAGTTCACGAATTACGTCCAAGACTAAGCAGTATTTAGTCTTTTGAAGATCACTCACCTCTTTATAGCTTGACTCCTTAAGCTCATCATTAATTTCTGACATACATTTGCTAATCCGAAGAAGAAAATCACTCAACCCTTCTTCGGAATCAGTCTCAACAATAAGTCCTTGGACAATCCCTAAGAATTCTTCGTAAGCCAACCTGGTTTTTCTTCTTTTTTCACCACCAGCTTTCCAGTTTTTTTCTTTTGCAAGCTTATCCTTTGACTTTAAACCTTTGACTTCCTCCGATTCATTCTCTGCCCTTGTTGATTTTGTGATCCTCTTGTGCAATCTCTCGCTGATTACCCTTTTAAGAAGTTTCTCAGTGTCATATTGCTGATCTAGTGCACCATTTACATGATGTTTTTTTGACCTTTTAAACGTACTTTTGTTTGAAGTCAAATCTAAAACATCAATATTTGATGTTAAGTAATCCTTTGGGTTTAATAACTGCTCACCATCAATGCCATTAAACTTTTCCATTGAGATCCATTTTAAGAAATCAGCAAGAATAGGTTCATACAAGAATGGCTTGGTTTCAAAGGAAGGCTCCTCACATTGAATAAAATCATTGACTTCTTGTTCCATTCTTTCAACCAATTCATCAACGTTCTTACAATCATAGATCATGTTGGACATAAACTGAAATTTTGGTTTAAAGAACTTCTCATAGCAGTCCCTTAAATCTGACAACCTATCTGGAGTTTCTTTTGTGATTAAGTGACATAGGTAAGATATATTCAGTGCCCATGTCACCTTCAAAAATAAGCCTATATTTCTACAAGAAAGGATTTCATTGATTAAGCTATGAGCAAGCTCTCTCAGAAAGTATTCATCATAAGTGATACAGTTACCAACAACTTTAACTTTTAAATCTTTGTGGTGAATGAGGGATAAGGTGTCCATAATGTAATATCTCTGTGACTGAAGCTCTACCTGGAGTCTTTTAGTTGGAGTGGTTAAGATACCGTAGATCAGATAAGTGACTTTGACCTTTAAGCCATCAATTTGTTTGTCAGAATATTCAGATGAGACCAGGAATTCATTCACAGACTCCTGTCTATTTATTGTGTCTTGTAGTCTCTCAATGTCATCATGAATTGGGTTAATAAGCATAATCAATTGATCAACCAAGTTTGCAATAGGTTTTGCACTGAACATAAGTGGGAATAGCCTTGAGGGATTAATGTTGAAAGAATAAAAGCTGTGTCTAAGTTTACCTTGTTTATAGCTTTTACAAAGGAGACTGAATGCCTTCTGTCCTTCACCTGTACATTTATACAGCAATAAACAACCATTGACTGACTGAAAGAAGTACTCTTCACTTGCACTAGCCCTTGGAGTGCTTCTTGTTTTTTGAGAAAGAATGAGATTTAATGCAACTTTTTCAACAACATCTGCTTCATCAGATGTTACAGCAGTGGTCTGTGGTTCACAGGGCATGTCATTTATGATTTTTAGACTCAGAATAGGTTGGGGCACAGTAGTTCTTGGTGCTGACCTAGCATACATGTCCCTCAACACCGAAGGCTCAATTAGATCATGAGATGCTTCTTCCAAAAACTTAATGAGAGTTTCTAATTCTCCTAGCTTTTGTCTACTGCCAACTTCCTTTTGAAGGTTCTGAAGTGACTTTACCATTCTTTCAATCAACTTTTTGTACACCCAAGTTGGTGAGTCTATGGAATCCACTTGCACCAGTCTATCATTTACACTAGGGTACCAGCCCTGTGGGAAATCATTGACACCTGATGTTTTAACAAAAAGTGTCAATGCAAGATAGTCATACACTTTGTTTTGTTTTCTTCTAGTATTCAATAAATTCAATGATTTCAGCTTATTCAGCAAACTTAGGTGATTGGTCTTAAAACTCAACCCAACCACAGCATTTCTAATTATTTCCAAGAGTCGCAGTTGTTTAGCTTCTCGTTTGAAATCTTGTATCATCCTTGTCATCTCAGGGCCATCCCAATTTAGAGTGAATGGCAACTCACCATCATTTTCCAGCATCCAATCAAGAAGATTTTTGTATGGATCGTCTGTTGACTCAATGTCAAACAGTAGTTTCTGTCCCTTGAACTCTTCTGTCAGAGTTCTGAAATCGTAGCTTGTCAGTGACTTCTTCAGTTCTAGATAATCCTCTTCTGAAATCCAATTGCAGATATCTGTGGTATAAGACAAGATTGATAATGACGTCGATAGCAATTTAAACATAAGAACTTCAGGAATTCTCCCTATTCTTGGCTTTTTTTCTGAGATTGTGATCACATTCAATGTCCACCCAAGTGGTCGTAGTAGATCCTCGAGACCATCGTACTTTAGTCTATCGAGCTGGACCTTTCTGTTTTGATCAGATGGTTCAGTCCTAGTGCTTACCTCCAAGACTGATAAAATGTTGTTGTTTCCATCAATTAAATAACCATCTGGAACAATTGTTTTGACTGTTTCATGAGATCCGATGGCATCATCAAGTAGCTCATTCATCTCCTTTAGCTCATTGTTGTGTTTGAGCCCTGTGTCCCTACAACAATTTAGCTCATGGATGGTTGATCTGAGCTTGATTGCATTTGTGGCCATCTCCCCAGCCGTATTGGAAATCCATCCTGGTTTATATAAATCTCTTTCATAGGACAGCACTTCCAACACAAGACCTTTTAGTCTCTCTAATTCAGAGTCCTCAGGACATATGGAGCCCATAATTGCCTAACCACCACCACCTCACCAGTTG
| 25,858
|
OM456553.1
|
Aurora borealis virus 3
|
Hepojoki,J.
|
University of Helsinki, Medicum, Department of Virology
|
Finland
|
2022-09-03
|
CR-wild1-FFPE
|
Aurora borealis virus 3
|
Reptarenavirus
|
Arenaviridae
|
ssRNA(+/-)
| 6,822
|
GenBank
| null |
Costa Rica
|
Costa Rica
|
Boa constrictor
| null |
1989
| null | null |
Aurora borealis virus 3 isolate CR-wild1-FFPE segment L, complete sequence
|
TAAAGAGTTAAATCCAAACAAATTAGATCCAAAGATTGACATCTGAAGGAGTGAGACTCTCAGATTCAAAGCTCAAGACACTCAACATGAGTGGGTCGACCTCCATAGGTCTAACTACAGAGGTGATCTCTATAATAACATTCATACTGGTGATTGCCATATTTGTTGTGGAGATCGTGAGCTGTGTCACCATGATGACTCTCAAGGCGATCACATTGAAGAAGAGACTCAGTTTTTGTCAAGGATGTGGGAAGAATGCAAGTCTTGTGATTCTTCCCTGCAAAAACAAAGTCTGTATGGAATGTGCCCTTAAAATGAGATGCCCAGTTTGCTATGAGGCATGTCTCTGGTGCGAAAACCCAGATGGTTCTCTTACATCATTAGCACTTGTAAACAAAGAGAGGAACAGACACACCAGAGGCGAAGGAGACACCCAAGAGCCCTGAGAAGCCAGAAGCAGAGCAGAGAGACAACAACAAAAGACCCAGGAAGGACAGGAGCAGGGAACAACCCAGACCACCCAGGAGAGCGCGCTCTCCTCGGCGGTCTGGGGGGTTCCGGAGCGTGGCCCAGCGATCTAGTCCTCCAGGGTCTCGGGCTCAGGAGTTCCGGACGCCCAGTCCTTGTAGAGCATGAGCCTGTGTCCTTTGTAAAGCAATGGACCCGCTGGATAGCTAACAAGTATTCCCTTCAGCCTGTGAAATACTAAAGTGGGACCTCTAGTGGTGAAGACTCTATCTGTGAATGATAGGAACTCAACAAATGAGTCAAGTTGGTGAAAGCCCATTTCGACCACCTTTTCAACTGTTGAATAACCAAAAATTCTACTTACCATTCCCCATAAGGCATCAAATCTAGCCTTGGGGAGACAAGATATTTCTCCTTTCATCCTTGTTATAAAATATGTCCTCACCAGCTTCCAGAGTTCATCCCATTCAGCCTCCGACATCTGAGTCATTATTGATCCCACCAAATCTGACTCTAAGGGAATTATACAACCCATGAACAAGAAGCATGGCTTTCCATTTGGTTTGGGATTCTCTATAACTGTGACATCTCTAAACTCTAGCATGTCTAACATTTCAGGCTCATCAAATTCTGAATCAGAGATGATTGTCCTTTTGAGAAATATGAAATCCTGATAATGAGCACGTCCTGTATGTGTAATCAGTGTTGCTTGAATTTTGAGATCATCACTCACTTGTTGAAAGCAGCACTGTAACTTTATTGGATTAGATGTCCCTAGTTTGGCACCTCTAACCCATGTGCCATCTTCCAGAGGAGCCTCTGGAGCACCTCTTCCATACACAACAACATTACTAGATGCAATCTCACTTGGCTCATCTTCCTTTTGTCTGTAGTGTGACTCCCTACCTAATAGAATTTGTTGGATATATCTTCTAACACCAGATTCCCCATGTGTCTTCAGCTCATCCATAGAACCTTCATATGGGGCAAGTTTTGTTGCGTCCAGAACCATGACCTTATCTATAATCTTCGGTTCTAATATTGAGTTCAAGATCATTCTGTTGACTATTGCTTGTAAACCTTTTCTTGCAATCCTCTCAGGTCCTCTCTTCTCAAGCTTCATAACCCGTCTTATCAACCTGCTTGGTTCATAATAATCAACTAGTACAACTGCCTCTTCTTGCCTGTCAATCCTACCATCAAAAATAGATAATCCTTCATTTGCACATTCTATTAACAATTCCATCTCAGGTCTAACTTTCCAGGAGTGTCTCATGAGCAGTCTCTTGTCTGGTGGCACAATGTCTTTTAAGTACTTGTCAAAGAGATCAGGCATAGTCATCTCAATAGCTGCAGTCAATTCATCTAATCCAAATCTGAATTCTGCAGTGTTGACAAGTGATGTTCTCATGTAGATGCTCTTGTTTGCCTGCTTACCTAACTCACCTTCAGTTCCACAAACCCAATCACCAACTGCACAAACTGATTGCATTACTAAGGAGGGGAAGATTTCAGCTACAGGTTTTACTACTGCTTTAGATTCCTTTAGAGTCAAGAATGTGCCATCACCCTTCCTAACACATGAACCTGACAAGCTGATACTTAATCCGATGAATCCAGTCACAACTGAACTCTGAAAAGCAGACCTCTCAAGTCCCTCTGCAATTAACAAACCAAGACCTTGCTTTGAATATCTCGAGTAGTGATTGATCAATTTTTTGATCAGGAGATTCTCACATGTCTCATTTATTGTTGTGCCCAAATTAAGCTTACTCCTGACAATTAATTTGAACTCTCCGTTGAGTGTTGGGAACCATTGAGTGATTTCTCCCAATTCTGATTTGCTAATTTCCACCATCCTCTTGTATGCCACAGAAGGTGCTATTGATGATTCTCTTAACTCCTTAATCACTTTTAAAAGTTCAAGTTTTAACACATCAAGCTTAATCTTCTCTATCCCCATGTCCATCAACCAGCTCTCCAGTGATCTCAACTTTCTGTAAGAAAGGCAACCCTCCAACCAATCTTGTTGTCTTGATTCCACAGGCTTCATTAAAGGATCACCAGCATACCCCAACCAGCCTAACATTTCAACCATCCTCCCCTTCAATGAGTCGGCCACCTTTAAAGACATGCCATTGCAAATTCCTTGCTCAACAATGGCATCACATGTGTTGAAAAGTTCCATTGGTGTTTTACACCTAAAATTGTTGATGGAAGCTGCAAAAAACTTTGTGAAGAGAGGAACCATTGTTGCTTCCACTTCAAAGTGAGACTTGAACTCCCCAACAAGTGGACTGCAGCAAAACTTTGGTGAGATGTGTTTATTTAAACAGTTGGATACTAGACACAAAAAGTTTGTGATCAAAAGAAGTTTGTCTTTTTGGTCACAATCTTTGTTTTTGTATTTGACATGAAACAATAACACCATATCATCAGATGTATTCATAGTGCTCGATCTGATTCCAAATATATCCCTTATCTTTTTTGTTATATATTCAGATGCCAGAGACCCGTAGAGGTCAGATGTATGGTGCAAGATTCCCTGACCCATATCAAACCATGAATGGATTTGTGAAGGCACAGGCCTATTGGACAGAACAGCATCCACCATAAATGTCTCAAAAGTTCTTTCTTTTCCAACCTGTCTGTCTCTTCTCCCTAAACTTATATCAAGGGATGATAGGATAACATCTTCCGCCAAGATCTGAGGTGTTTCCACCGCCTTAAACAGGTGCCACTTAAGAATTGTTTTTGCAAATGAGAAATCTAACCTTTTCCCCTCAGTGTCATTAATACTCTCCATAGCTTCAAACATCAAATGGTATTGAAGAGGGCTGTTAAAAGGACCCCATTTTGAGTGATCCATGCTTAGAACTATCTCATTCTCAAAAAAAGATCTTGCAATCCTTTTCATGAAATTGGAGAATTTCTTGTCTGAGTTAAGGCAACTATTATTAAGTTTGTTACCTATGTTTCTCGAAGTCTCTTCCAAGACTCTTGTGATTAGCTTTGTGTCAGAATCTCCAACATAGAGTTCTCTAGGCCCACCTACTTGTTCCTTTATTGCAAGTCCAAACTGGAGTGGCTTGTTATTTGGTCCAACTTCTGAATCCTTAATTTTTAGGTTCAGTGTTGAAAAAAGGATGTTTCTTAGTGTGGGTGCTCCATATTTTATTGCTAGGAGCCTATCCTGCAATGCCTCTGAATTGGTAACCCTTGTTGAAAGCATGCTTTCTCCCCTATATTTATTGGATATTGATAAAAAAGAGCTCTGGGGACCTGATCTATGATCATATGTCCCCTGAAAGTTGTTAAATCCCGCCCAAAGGAGCAAGAATTTAAAGCTCGAGAAAAATTCCTTTGATTCAAATTTTGTGACAACCATGCCTGCCGATATATTAGTCACATCAATGGTTTCAGCTTGTCTAGGAAACTCCAGTGGGGCTCTTAACATTATCTCATTGACAACTTTCTCATAGGCTTCCTCCTTTAACAAATCTGTGGGAAGGTCTGATAATTTGGTACTATAACATGTAGAGCGAACAAGGTCACAAATTTCAGGACCCAGTAGTTCACGAATTACGTCCAAGACTAAGCAGTATTTAGTCTTTTGAAGATCACTCACCTCTTTATAGCTTGACTCCTTAAGCTCATCATTAATTTCTGACATACATTTGCTAATCCGAAGAAGAAAATCACTCAACCCTTCTTCGGAATCAGTCTCAACAATAAGTCCTTGGACAATCCCTAAGAATTCTTCGTAAGCCAACCTGGTTTTTCTTCTTTTTTCACCACCAGCTTTCCAGTTTTTTTCTTTTGCAAGCTTATCCTTTGACTTTAAACCTTTGACTTCCTCCGATTCATTCTCTGCCCTTGTTGATTTTGTGATCCTCTTGTGCAATCTCTCGCTGATTACCCTTTTAAGAAGTTTCTCAGTGTCATATTGCTGATCTAGTGCACCATTTACATGATGTTTTTTTGACCTTTTAAACGTACTTTTGTTTGAAGTCAAATCTAAAACATCAATATTTGATGTTAAGTAATCCTTTGGGTTTAATAACTGCTCACCATCAATGCCATTAAACTTTTCCATTGAGATCCATTTTAAGAAATCAGCAAGAATAGGTTCATACAAGAATGGCTTGGTTTCAAAGGAAGGCTCCTCACATTGAATAAAATCATTGACTTCTTGTTCCATTCTTTCAACCAATTCATCAACGTTCTTACAATCATAGATCATGTTGGACATAAACTGAAATTTTGGTTTAAAGAACTTCTCATAGCAGTCCCTTAAATCTGACAACCTATCTGGAGTTTCTTTTGTGATTAAGTGACATAGGTAAGATATATTCAGTGCCCATGTCACCTTCAAAAATAAGCCTATATTTCTACAAGAAAGGATTTCATTGATTAAGCTATGAGCAAGCTCTCTCAGAAAGTATTCATCATAAGTGATACAGTTACCAACAACTTTAACTTTTAAATCTTTGTGGTGAATGAGGGATAAGGTGTCCATAATGTAATATCTCTGTGACTGAAGCTCTACCTGGAGTCTTTTAGTTGGAGTGGTTAAGATACCGTAGATCAGATAAGTGACTTTGACCTTTAAGCCATCAATTTGTTTGTCAGAATATTCAGATGAGACCAGGAATTCATTCACAGACTCCTGTCTATTTATTGTGTCTTGTAGTCTCTCAATGTCATCATGAATTGGGTTAATAAGCATAATCAATTGATCAACCAAGTTTGCAATAGGTTTTGCACTGAACATAAGTGGGAATAGCCTTGAGGGATTAATGTTGAAAGAATAAAAGCTGTGTCTAAGTTTACCTTGTTTATAGCTTTTACAAAGGAGACTGAATGCCTTCTGTCCTTCACCTGTACATTTATACAGCAATAGACAACCATTGACTGACTGAAAGAAGTACTCTTCACTTGCACTAGCCCTTGGAGTGCTTCTTGTTTTTTGAGAAAGAATGAGATTTAATGCAACTTTTTCAACAACATCTGCTTCATCAGATGTTACAGCAGTGGTCTGTGGTTCACAGGGCATGTCATTTATGATTTTTAGACTCAGAATAGGTTGGGGCACAGTAGTTCTTGGTGCTGACCTAGCATACATGTCCCTCAACACCGAAGGCTCAATTAGATCATGAGATGCTTCTTCCAAAAACTTAATGAGAGTTTCTAATTCTCCTAGCTTTTGTCTACTGCCAACTTCCTTTTGAAGGTTCTGAAGTGACTTTACCATTCTTTCAATCAACTTTTTGTACACCCAAATTGGTGAGTCTATGGAATCCACTTGCACCAGTCTATCATTTACACTAGGGTACCAGCCCTGTGGGAAATCATTGACACCTGATGTTTTAACAAAAAGTGTCAATGCAAGATAGTCATACACTTTGTTTTGTTTTCTTCTAGTATTCAATAAATTCAATGATTTCAGCTTATTCAGCAAACTTAGGTGATTGGTCTTAAAACTCAACCCAACCACAGCATTTCTAATTATTTCCAAGAGTCGCAGTTGTTTAGCTTCTCGTTTGAAATCTTGTATCATCCTTGTCATCTCAGGGCCATCCCAATTTAGAGTGAATGGCAACTCACCATCATTTTCCAGCATCCAATCAAGAAGATTTTTGTATGGATCGTCTGTTGACTCAATGTCAAACAGTAGTTTCTGTCCCTTGAACTCTTCTGTCAGAGTTCTGAAATCGTAGCTTGTCAGTGACTTCTTCAGTTCTAGATAATCCTCTTCTGAAATCCAATTGCAGATATCTGTGGTATAAGACAAGATTGATAATGACGTCGATAGCAATTTAAACATAAGAACTTCAGGAATTCTCCCTATTCTTGGCTTTTTTTCTGAGATTGTGATCACATTCAATGTCCACCCAAGTGGTCGTAGTAGATCCTCGAGACCATCGTACTTTAGTCTATCGAGCTGGACCTTTCTGTTTTGATCAGATGGTTCAGTCCTAGTGCTTACCTCCAAGACTGATAAAATGTTGTTGTTTCCATCAATTAAATAACCATCTGGAACAATTGTTTTGACTGTTTCATGAGATCCGATGGCATCATCAAGTAGCTCATTCATCTCCTTTAGCTCATTGTTGTGTTTGAGCCCTGTGTCCCTACAACAATTTAGCTCATGGATGGTTGATCTGAGCTTGATTGCATTTGTGGCCATCTCCCCAGCCGTATTGGAAATCCATCCTGGTTTATATAAATCTCTTTCATAGGACAGCACTTCCAACACAAGACCTTTTAGTCTCTCTAATTCAGAGTCCTCAGGACATATGGAGCCCATAATTGCCTAACCACCACCACCTCACCACCCTTGATGCATCTAAG
| 25,859
|
OM456555.1
|
Aurora borealis virus 3
|
Hepojoki,J.
|
University of Helsinki, Medicum, Department of Virology
|
Finland
|
2022-09-03
|
CR-wild2-FFPE
|
Aurora borealis virus 3
|
Reptarenavirus
|
Arenaviridae
|
ssRNA(+/-)
| 6,895
|
GenBank
| null |
Costa Rica
|
Costa Rica
|
Boa constrictor
| null |
1989
| null | null |
Aurora borealis virus 3 isolate CR-wild2-FFPE segment L, complete sequence
|
AGGGATTGGGGACCCGCGTTTTCCAGTATCCATCTAAAGAGTTAAATCCAAACAAATTAGATCCAAAGATTGACATCTGAAGGAGTGAGACTCTCAGATTCAAAGCTCAAGACACTCAACATGAGTGGGTCGACCTCCATAGGTCTAACTACAGAGGTGATCTCTATAATAACATTCATACTGGTGATTGCCATATTTGTTGTGGAGATCGTGAGCTGTGTCACCATGATGACTCTCAAGGCGATCACATTGAAGAAGAGACTCAGTTTTTGTCAAGGATGTGGGAAGAATGCAAGTCTTGTGATTCTTCCCTGCAAAAACAAAGTCTGTATGGAATGTGCCCTTAAAATGAGATGCCCAGTTTGCTATGAGGCATGTCTCTGGTGCGAAAACCCAGATGGTTCTCTTACATCATTAGCACTTGTAAACAAAGAGAGGAACAGACACACCAGAGGCGAAGGAGACACCCAAGAGCCCTGAGAAGCCAGAAGCAGAGCAGAGAGACAACAACAAAAGACCCAGGAAGGACAGGAGCAGGGAACAACCCAGACCGCCGAGGAGAGCAGCGCTCTCCTCGGCGGTCTGGGGGGTTCCGGAGCGTGGCCCAGCGATCTAGTCCTCCAGGGTCTCGGGCTCAGGAGTTCCGGACGCCCAGTCCTTGTAGAGCATGAGCCTGTGTCCTTTGTAAAGCAATGGACCCGCTGGATAGCTAACAAGTATTCCCTTCAGCCTGTGAAATACTAAAGTGGGACCTCTAGTGGTGAAGACTCTATCTGTGAATGATAGGAACTCAACAAATGAGTCAAGTTGGTGAAAGCCCATTTCGACCACCTTTTCAACTGTTGAATAACCAAAAATTCTACTTACCATTCCCCATAAGGCATCAAATCTAGCCTTGGGGAGACAAGATATTTCTCCTTTCATCCTTGTTATAAAATATGTCCTCACCAGCTTCCAGAGTTCATCCCATTCAGCCTCCGACATCTGAGTCATTATTGATCCCACCAAATCTGACTCTAAGGGAATTATACAACCCATGAACAAGAAGCATGGCTTTCCATTTGGTTTGGGATTCTCTATAACTGTGACATCTCTAAACTCTAGCATGTCTAACATTTCAGGCTCATCAAATTCTGAATCAGAGATGATTGTCCTTTTGAGAAATATGAAATCCTGATAATGAGCACGTCCTGTATGTGTAATCAGTGTTGCTTGAATTTTGAGATCATCACTCACTTGTTGAAAGCAGCACTGTAACTTTATTGGATTAGATGTCCCTAGTTTGGCACCTCTAACCCATGTGCCATCTTCCAGAGGAGCCTCTGGAGCACCTCTTCCATACACAACAACATTACTAGATGCAATCTCACTTGGCTCATCTTCCTTTTGTCTGTAGTGTGACTCCCTACCTAATAGAATTTGTTGGATATATCTTCTAACACCAGATTCCCCATGTGTCTTCAGCTCATCCATAGAACCTTCATATGGGGCAAGTTTTGTTGCGTCCAGAACCATGACCTTATCTATAATCTTCGGTTCTAATATTGAGTTCAAGATCATTCTGTTGACTATTGCTTGTAAACCTTTTCTTGCAATCCTCTCAGGTCCTCTCTTCTCAAGCTTCATAACCCGTCTTATCAACCTGCTTGGTTCATAATAATCAACTAGTACAACTGCCTCTTCTTGCCTGTCAATCCTACCATCAAAAATAGATAATCCTTCATTTGCACATTCTATTAACAATTCCATCTCAGGTCTAACTTTCCAGGAGTGTCTCATGAGCAGTCTCTTGTCTGGTGGCACAATGTCTTTTAAGTACTTGTCAAAGAGATCAGGCATAGTCATCTCAATAGCTGCAGTCAATTCATCTAATCCAAATCTGAATTCTGCAGTGTTGACAAGTGATGTTCTCATGTAGATGCTCTTGTTTGCCTGCTTACCTAACTCACCTTCAGTTCCACAAACCCAATCACCAACTGCACAAACTGATTGCATTACTAAGGAGGGGAAGATTTCAGCTACAGGTTTTACTACTGCTTTAGATTCCTTTAGAGTCAAGAATGTGCCATCACCCTTCCTAACACATGAACCTGACAAGCTGATACTTAATCCGATGAATCCAGTCACAACTGAACTCTGAAAAGCAGACCTCTCAAGTCCCTCTGCAATTAACAAACCAAGACCTTGCTTTGAATATCTCGAGTAGTGATTGATCAATTTTTTGATCAGGAGATTCTCACATGTCTCATTTATTGTTGTGCCCAAATTAAGCTTACTCCTGACAATTAATTTGAACTCTCCGTTGAGTGTTGGGAACCATTGAGTGATTTCTCCCAATTCTGATTTGCTAATTTCCACCATCCTCTTGTATGCCACAGAAGGTGCTATTGATGATTCTCTTAACTCCTTAATCACTTTTAAAAGTTCAAGTTTTAACACATCAAGCTTAATCTTCTCTATCCCCATGTCCATCAACCAGCTCTCCAGTGATCTCAACTTTCTGTAAGAAAGGCAACCCTCCAACCAATCTTGTTGTCTTGATTCCACAGGCTTCATTAAAGGATCACCAGCATACCCCAACCAGCCTAACATTTCAACCATCCTCCCCTTCAATGAGTCGGCCACCTTTAAAGACATGCCATTGCAAATTCCTTGCTCAACAATGGCATCACATGTGTTGAAAAGTTCCATTGGTGTTTTACACCTAAAATTGTTGATGGAAGCTGCAAAAAACTTTGTGAAGAGAGGAACCATTGTTGCTTCCACTTCAAAGTGAGACTTGAACTCCCCAACAAGTGGACTGCAGCAAAACTTTGGTGAGATGTGTTTATTTAAACAGTTGGATACTAGACACAAAAAGTTTGTGATCAAAAGAAGTTTGTCTTTTTGGTCACAATCTTTGTTTTTGTATTTGACATGAAACAATAACACCATATCATCAGATGTATTCATAGTGCTCGATCTGATTCCAAATATATCCCTTATCTTTTTTGTTATATATTCAGATGCCAGAGACCCGTAGAGGTCAGATGTATGGTGCAAGATTCCCTGACCCATATCAAACCATGAATGGATTTGTGAAGGCACAGGCCTATTGGACAGAACAGCATCCACCATAAATGTCTCAAAAGTTCTTTCTTTTCCAACCTGTCTGTCTCTTCTCCCTAAACTTATATCAAGGGATGATAGGATAACATCTTCCGCCAAGATCTGAGGTGTTTCCACCGCCTTAAACAGGTGCCACTTAAGAATTGTTTTTGCAAATGAGAAATCTAACCTTTTCCCCTCAGTGTCATTAATACTCTCCATAGCTTCAAACATCAAATGGTATTGAAGAGGGCTGTTAAAAGGACCCCATTTTGAGTGATCCATGCTTAGAACTATCTCATTCTCAAAAAAAGATCTTGCAATCCTTTTCATGAAATTGGAGAATTTCTTGTCTGAGTTAAGGCAACTATTATTAAGTTTGTTACCTATGTTTCTCGAAGTCTCTTCCAAGACTCTTGTGATTAGCTTTGTGTCAGAATCTCCAACATAGAGTTCTCTAGGCCCACCTACTTGTTCCTTTATTGCAAGTCCAAACTGGAGTGGCTTGTTATTTGGTCCAACTTCTGAATCCTTAATTTTTAGGTTCAGTGTTGAAAAAAGGATGTTTCTTAGTGTGGGTGCTCCATATTTTATTGCTAGGAGCCTATCCTGCAATGCCTCTGAATTGGTAACCCTTGTTGAAAGCATGCTTTCTCCCCTATATTTATTGGATATTGATAAAAAAGAGCTCTGGGGACCTGATCTATGATCATATGTCCCCTGAAAGTTGTTAAATCCCGCCCAAAGGAGCAAGAATTTAAAGCTCGAGAAAAATTCCTTTGATTCAAATTTTGTGACAACCATGCCTGCCGATATATTAGTCACATCAATGGTTTCAGCTTGTCTAGGAAACTCCAGTGGGGCTCTTAACATTATCTCATTGACAACTTTCTCATAGGCTTCCTCCTTTAACAAATCTGTGGGAAGGTCTGATAATTTGGTACTATAACATGTAGAGCGAACAAGGTCACAAATTTCAGGACCCAGTAGTTCACGAATTACGTCCAAGACTAAGCAGTATTTAGTCTTTTGAAGATCACTCACCTCTTTATAGCTTGACTCCTTAAGCTCATCATTAATTTCTGACATACATTTGCTAATCCGAAGAAGAAAATCACTCAACCCTTCTTCGGAATCAGTCTCAACAATAAGTCCTTGGACAATCCCTAAGAATTCTTCGTAAGCCAACCTGGTTTTTCTTCTTTTTTCACCACCAGCTTTCCAGTTTTTTTCTTTTGCAAGCTTATCCTTTGACTTTAAACCTTTGACTTCCTCCGATTCATTCTCTGCCCTTGTTGATTTTGTGATCCTCTTGTGCAATCTCTCGCTGATTACCCTTTTAAGAAGTTTCTCAGTGTCATATTGCTGATCTAGTGCACCATTTACATGATGTTTTTTTGACCTTTTAAACGTACTTTTGTTTGAAGTCAAATCTAAAACATCAATATTTGATGTTAAGTAATCCTTTGGGTTTAATAACTGCTCACCATCAATGCCATTAAACTTTTCCATTGAGATCCATTTTAAGAAATCAGCAAGAATAGGTTCATACAAGAATGGCTTGGTTTCAAAGGAAGGCTCCTCACATTGAATAAAATCATTGACTTCTTGTTCCATTCTTTCAACCAATTCATCAACGTTCTTACAATCATAGATCATGTTGGACATAAACTGAAATTTTGGTTTAAAGAACTTCTCATAGCAGTCCCTTAAATCTGACAACCTATCTGGAGTTTCTTTTGTGATTAAGTGACATAGGTAAGATATATTCAGTGCCCATGTCACCTTCAAAAATAAGCCTATATTTCTACAAGAAAGGATTTCATTGATTAAGCTATGAGCAAGCTCTCTCAGAAAGTATTCATCATAAGTGATACAGTTACCAACAACTTTAACTTTTAAATCTTTGTGGTGAATGAGGGATAAGGTGTCCATAATGTAATATCTCTGTGACTGAAGCTCTACCTGGAGTCTTTTAGTTGGAGTGGTTAAGATACCGTAGATCAGATAAGTGACTTTGACCTTTAAGCCATCAATTTGTTTGTCAGAATATTCAGATGAGACCAGGAATTCATTCACAGACTCCTGTCTATTTATTGTGTCTTGTAGTCTCTCAATGTCATCATGAATTGGGTTAATAAGCATAATCAATTGATCAACCAAGTTTGCAATAGGTTTTGCACTGAACATAAGTGGGAATAGCCTTGAGGGATTAATGTTGAAAGAATAAAAGCTGTGTCTAAGTTTACCTTGTTTATAGCTTTTACAAAGGAGACTGAATGCCTTCTGTCCTTCACCTGTACATTTATACAGCAATAGACAACCATTGACTGACTGAAAGAAGTACTCTTCACTTGCACTAGCCCTTGGAGTGCTTCTTGTTTTTTGAGAAAGAATGAGATTTAATGCAACTTTTTCAACAACATCTGCTTCATCAGATGTTACAGCAGTGGTCTGTGGTTCACAGGGCATGTCATTTATGATTTTTAGACTCAGAATAGGTTGGGGCACAGTAGTTCTTGGTGCTGACCTAGCATACATGTCCCTCAACACCGAAGGCTCAATTAGATCATGAGATGCTTCTTCCAAAAACTTAATGAGAGTTTCTAATTCTCCTAGCTTTTGTCTACTGCCAACTTCCTTTTGAAGGTTCTGAAGTGACTTTACCATTCTTTCAATCAACTTTTTGTACACCCAAATTGGTGAGTCTATGGAATCCACTTGCACCAGTCTATCATTTACACTAGGGTACCAGCCCTGTGGGAAATCATTGACACCTGATGTTTTAACAAAAAGTGTCAATGCAAGATAGTCATACACTTTGTTTTGTTTTCTTCTAGTATTCAATAAATTCAATGATTTCAGCTTATTCAGCAAACTTAGGTGATTGGTCTTAAAACTCAACCCAACCACAGCATTTCTAATTATTTCCAAGAGTCGCAGTTGTTTAGCTTCTCGTTTGAAATCTTGTATCATCCTTGTCATCTCAGGGCCATCCCAATTTAGAGTGAATGGCAACTCACCATCATTTTCCAGCATCCAATCAAGAAGATTTTTGTATGGATCGTCTGTTGACTCAATGTCAAACAGTAGTTTCTGTCCCTTGAACTCTTCTGTCAGAGTTCTGAAATCGTAGCTTGTCAGTGACTTCTTCAGTTCTAGATAATCCTCTTCTGAAATCCAATTGCAGATATCTGTGGTATAAGACAAGATTGATAATGACGTCGATAGCAATTTAAACATAAGAACTTCAGGAATTCTCCCTATTCTTGGCTTTTTTTCTGAGATTGTGATCACATTCAATGTCCACCCAAGTGGTCGTAGTAGATCCTCGAGACCATCGTACTTTAGTCTATCGAGCTGGACCTTTCTGTTTTGATCAGATGGTTCAGTCCTAGTGCTTACCTCCAAGACTGATAAAATGTTGTTGTTTCCATCAATTAAATAACCATCTGGAACAATTGTTTTGACTGTTTCATGAGATCCGATGGCATCATCAAGTAGCTCATTCATCTCCTTTAGCTCATTGTTGTGTTTGAGCCCTGTGTCCCTACAACAATTTAGCTCATGGATGGTTGATCTGAGCTTGATTGCATTTGTGGCCATCTCCCCAGCCGTATTGGAAATCCATCCTGGTTTATATAAATCTCTTTCATAGGACAGCACTTCCAACACAAGACCTTTTAGTCTCTCTAATTCAGAGTCCTCAGGACATATGGAGCCCATAATTGCCTAACCACCACCACCTCACCACCCTTGATGCATCTAAGCAAATTTCCTTCTTTTGATGGATATGGAAATACGCGGG
| 25,860
|
OM456557.1
|
Aurora borealis virus 3
|
Hepojoki,J.
|
University of Helsinki, Medicum, Department of Virology
|
Finland
|
2022-09-03
|
CR-wild3-FFPE
|
Aurora borealis virus 3
|
Reptarenavirus
|
Arenaviridae
|
ssRNA(+/-)
| 6,878
|
GenBank
| null |
Costa Rica
|
Costa Rica
|
Boa constrictor
| null |
2012
| null | null |
Aurora borealis virus 3 isolate CR-wild3-FFPE segment L, complete sequence
|
AATGGGAACTAGCAAAGTCTGTGGAAACACCTCAGATCACTGGGGATCCGCGTTTTCCAGTATCCATCTAAAGAGTTAAATCCAAACAAATTAGATCCAAAGATTGACATCTGAAGGAGTGAGACTCTCAGATTCAAAGCTCAAGACACTCAACATGAGTGGGTCGACCTCCATAGGTCTAACTACAGAGGTGATCTCTATAATAACATTCATACTGGTGATTGCCATATTTGTTGTGGAGATCGTGAGCTGTGTCACCATGATGACTCTCAAGGCGATCACATTGAAGAAGAGACTCAGTTTTTGTCAAGGATGTGGGAAGAATGCAAGTCTTGTGATTCTTCCCTGCAAAAACAAAGTCTGTATGGAATGTGCCCTTAAAATGAGATGCCCAGTTTGCTATGAGGCATGTCTCTGGTGCGAAAACCCAGATGGTTCTCTTACATCATTAGCACTTGTAAACAAAGAGAGGAACAGACACACCAGAGGCGAAGGAGACACCCAAGAGCCCTGAGAAGCCAGAAGCAGAGCAGAGAGACAACAACAAAAGACCCAGGAAGGACAGGAGCAGGGAACAACCCAGACCGCCGAGGAGAGCAGCGCTCTCCTCGGCGGTCTGGGGGGTTCCGGAGCGTGGCCCAGCGATCTAGTCCTCCAGGGTCTCGGGCTCAGGAGTTCCGGACGCCCAGTCCTTGTAGAGCATGAGCCTGTGTCCTTTGTAAAGCAATGGACCCGCTGGATAGCTAACAAGTATTCCCTTCAGCCTGTGAAATACTAAAGTGGGACCTCTAGTGGTGAAGACTCTATCTGTGAATGATAGGAACTCAACAAATGAGTCAAGTTGGTGAAAGCCCATTTCGACCACCTTTTCAACTGTTGAATAACCAAAAATTCTACTTACCATTCCCCATAAGGCATCAAATCTAGCCTTGGGGAGACAAGATATTTCTCCTTTCATCCTTGTTATAAAATATGTCCTCACCAGCTTCCAGAGTTCATCCCATTCAGCCTCCGACATCTGAGTCATTATTGATCCCACCAAATCTGACTCTAAGGGAATTATACAACCCATGAACAAGAAGCATGGCTTTCCATTTGGTTTGGGATTCTCTATAACTGTGACATCTCTAAACTCTAGCATGTCTAACATTTCAGGCTCATCAAATTCTGAATCAGAGATGATTGTCCTTTTGAGAAATATGAAATCCTGATAATGAGCACGTCCTGTATGTGTAATCAGTGTTGCTTGAATTTTGAGATCATCACTCACTTGTTGAAAGCAGCACTGTAACTTTATTGGATTAGATGTCCCTAGTTTGGCACCTCTAACCCATGTGCCATCTTCCAGAGGAGCCTCTGGAGCACCTCTTCCATACACAACAACATTACTAGATGCAATCTCACTTGGCTCATCTTCCTTTTGTCTGTAGTGTGACTCCCTACCTAATAGAATTTGTTGGATATATCTTCTAACACCAGATTCCCCATGTGTCTTCAGCTCATCCATAGAACCTTCATATGGGGCAAGTTTTGTTGCGTCCAGAACCATGACCTTATCTATAATCTTCGGTTCTAATATTGAGTTCAAGATCATTCTGTTGACTATTGCTTGTAAACCTTTTCTTGCAATCCTCTCAGGTCCTCTCTTCTCAAGCTTCATAACCCGTCTTATCAACCTGCTTGGTTCATAATAATCAACTAGTACAACTGCCTCTTCTTGCCTGTCAATCCTACCATCAAAAATAGATAATCCTTCATTTGCACATTCTATTAACAATTCCATCTCAGGTCTAACTTTCCAGGAGTGTCTCATGAGCAGTCTCTTGTCTGGTGGCACAATGTCTTTTAAGTACTTGTCAAAGAGATCAGGCATAGTCATCTCAATAGCTGCAGTCAATTCATCTAATCCAAATCTGAATTCTGCAGTGTTGACAAGTGATGTTCTCATGTAGATGCTCTTGTTTGCCTGCTTACCTAACTCACCTTCAGTTCCACAAACCCAATCACCAACTGCACAAACTGATTGCATTACTAAGGAGGGGAAGATTTCAGCTACAGGTTTTACTACTGCTTTAGATTCCTTTAGAGTCAAGAATGTGCCATCACCCTTCCTAACACATGAACCTGACAAGCTGATACTTAATCCGATGAATCCAGTCACAACTGAACTCTGAAAAGCAGACCTCTCAAGTCCCTCTGCAATTAACAAACCAAGACCTTGCTTTGAATATCTCGAGTAGTGATTGATCAATTTTTTGATCAGGAGATTCTCACATGTCTCATTTATTGTTGTGCCCAAATTAAGCTTACTCCTGACAATTAATTTGAACTCTCCGTTGAGTGTTGGGAACCATTGAGTGATTTCTCCCAATTCTGATTTGCTAATTTCCACCATCCTCTTGTATGCCACAGAAGGTGCTATTGATGATTCTCTTAACTCCTTAATCACTTTTAAAAGTTCAAGTTTTAACACATCAAGCTTAATCTTCTCTATCCCCATGTCCATCAACCAGCTCTCCAGTGATCTCAACTTTCTGTAAGAAAGGCAACCCTCCAACCAATCTTGTTGTCTTGATTCCACAGGCTTCATTAAAGGATCACCAGCATACCCCAACCAGCCTAACATTTCAACCATCCTCCCCTTCAATGAGTCGGCCACCTTTAAAGACATGCCATTGCAAATTCCTTGCTCAACAATGGCATCACATGTGTTGAAAAGTTCCATTGGTGTTTTACACCTAAAATTGTTGATGGAAGCTGCAAAAAACTTTGTGAAGAGAGGAACCATTGTTGCTTCCACTTCAAAGTGAGACTTGAACTCCCCAACAAGTGGACTGCAGCAAAACTTTGGTGAGATGTGTTTATTTAAACAGTTGGATACTAGACACAAAAAGTTTGTGATCAAAAGAAGTTTGTCTTTTTGGTCACAATCTTTGTTTTTGTATTTGACATGAAACAATAACACCATATCATCAGATGTATTCATAGTGCTCGATCTGATTCCAAATATATCCCTTATCTTTTTTGTTATATATTCAGATGCCAGAGACCCGTAGAGGTCAGATGTATGGTGCAAGATTCCCTGACCCATATCAAACCATGAATGGATTTGTGAAGGCACAGGCCTATTGGACAGAACAGCATCCACCATAAATGTCTCAAAAGTTCTTTCTTTTCCAACCTGTCTGTCTCTTCTCCCTAAACTTATATCAAGGGATGATAGGATAACATCTTCCGCCAAGATCTGAGGTGTTTCCACCGCCTTAAACAGGTGCCACTTAAGAATTGTTTTTGCAAATGAGAAATCTAACCTTTTCCCCTCAGTGTCATTAATACTCTCCATAGCTTCAAACATCAAATGGTATTGAAGAGGGCTGTTAAAAGGACCCCATTTTGAGTGATCCATGCTTAGAACTATCTCATTCTCAAAAAAAGATCTTGCAATCCTTTTCATGAAATTGGAGAATTTCTTGTCTGAGTTAAGGCAACTATTATTAAGTTTGTTACCTATGTTTCTCGAAGTCTCTTCCAAGACTCTTGTGATTAGCTTTGTGTCAGAATCTCCAACATAGAGTTCTCTAGGCCCACCTACTTGTTCCTTTATTGCAAGTCCAAACTGGAGTGGCTTGTTATTTGGTCCAACTTCTGAATCCTTAATTTTTAGGTTCAGTGTTGAAAAAAGGATGTTTCTTAGTGTGGGTGCTCCATATTTTATTGCTAGGAGCCTATCCTGCAATGCCTCTGAATTGGTAACCCTTGTTGAAAGCATGCTTTCTCCCCTATATTTATTGGATATTGATAAAAAAGAGCTCTGGGGACCTGATCTATGATCATATGTCCCCTGAAAGTTGTTAAATCCCGCCCAAAGGAGCAAGAATTTAAAGCTCGAGAAAAATTCCTTTGATTCAAATTTTGTGACAACCATGCCTGCCGATATATTAGTCACATCAATGGTTTCAGCTTGTCTAGGAAACTCCAGTGGGGCTCTTAACATTATCTCATTGACAACTTTCTCATAGGCTTCCTCCTTTAACAAATCTGTGGGAAGGTCTGATAATTTGGTACTATAACATGTAGAGCGAACAAGGTCACAAATTTCAGGACCCAGTAGTTCACGAATTACGTCCAAGACTAAGCAGTATTTAGTCTTTTGAAGATCACTCACCTCTTTATAGCTTGACTCCTTAAGCTCATCATTAATTTCTGACATACATTTGCTAATCCGAAGAAGAAAATCACTCAACCCTTCTTCGGAATCAGTCTCAACAATAAGTCCTTGGACAATCCCTAAGAATTCTTCGTAAGCCAACCTGGTTTTTCTTCTTTTTTCACCACCAGCTTTCCAGTTTTTTTCTTTTGCAAGCTTATCCTTTGACTTTAAACCTTTGACTTCCTCCGATTCATTCTCTGCCCTTGTTGATTTTGTGATCCTCTTGTGCAATCTCTCGCTGATTACCCTTTTAAGAAGTTTCTCAGTGTCATATTGCTGATCTAGTGCACCATTTACATGATGTTTTTTTGACCTTTTAAACGTACTTTTGTTTGAAGTCAAATCTAAAACATCAATATTTGATGTTAAGTAATCCTTTGGGTTTAATAACTGCTCACCATCAATGCCATTAAACTTTTCCATTGAGATCCATTTTAAGAAATCAGCAAGAATAGGTTCATACAAGAATGGCTTGGTTTCAAAGGAAGGCTCCTCACATTGAATAAAATCATTGACTTCTTGTTCCATTCTTTCAACCAATTCATCAACGTTCTTACAATCATAGATCATGTTGGACATAAACTGAAATTTTGGTTTAAAGAACTTCTCATAGCAGTCCCTTAAATCTGACAACCTATCTGGAGTTTCTTTTGTGATTAAGTGACATAGGTAAGATATATTCAGTGCCCATGTCACCTTCAAAAATAAGCCTATATTTCTACAAGAAAGGATTTCATTGATTAAGCTATGAGCAAGCTCTCTCAGAAAGTATTCATCATAAGTGATACAGTTACCAACAACTTTAACTTTTAAATCTTTGTGGTGAATGAGGGATAAGGTGTCCATAATGTAATATCTCTGTGACTGAAGCTCTACCTGGAGTCTTTTAGTTGGAGTGGTTAAGATACCGTAGATCAGATAAGTGACTTTGACCTTTAAGCCATCAATTTGTTTGTCAGAATATTCAGATGAGACCAGGAATTCATTCACAGACTCCTGTCTATTTATTGTGTCTTGTAGTCTCTCAATGTCATCATGAATTGGGTTAATAAGCATAATCAATTGATCAACCAAGTTTGCAATAGGTTTTGCACTGAACATAAGTGGGAATAGCCTTGAGGGATTAATGTTGAAAGAATAAAAGCTGTGTCTAAGTTTACCTTGTTTATAGCTTTTACAAAGGAGACTGAATGCCTTCTGTCCTTCACCTGTACATTTATACAGCAATAGACAACCATTGACTGACTGAAAGAAGTACTCTTCACTTGCACTAGCCCTTGGAGTGCTTCTTGTTTTTTGAGAAAGAATGAGATTTAATGCAACTTTTTCAACAACATCTGCTTCATCAGATGTTACAGCAGTGGTCTGTGGTTCACAGGGCATGTCATTTATGATTTTTAGACTCAGAATAGGTTGGGGCACAGTAGTTCTTGGTGCTGACCTAGCATACATGTCCCTCAACACCGAAGGCTCAATTAGATCATGAGATGCTTCTTCCAAAAACTTAATGAGAGTTTCTAATTCTCCTAGCTTTTGTCTACTGCCAACTTCCTTTTGAAGGTTCTGAAGTGACTTTACCATTCTTTCAATCAACTTTTTGTACACCCAAATTGGTGAGTCTATGGAATCCACTTGCACCAGTCTATCATTTACACTAGGGTACCAGCCCTGTGGGAAATCATTGACACCTGATGTTTTAACAAAAAGTGTCAATGCAAGATAGTCATACACTTTGTTTTGTTTTCTTCTAGTATTCAATAAATTCAATGATTTCAGCTTATTCAGCAAACTTAGGTGATTGGTCTTAAAACTCAACCCAACCACAGCATTTCTAATTATTTCCAAGAGTCGCAGTTGTTTAGCTTCTCGTTTGAAATCTTGTATCATCCTTGTCATCTCAGGGCCATCCCAATTTAGAGTGAATGGCAACTCACCATCATTTTCCAGCATCCAATCAAGAAGATTTTTGTATGGATCGTCTGTTGACTCAATGTCAAACAGTAGTTTCTGTCCCTTGAACTCTTCTGTCAGAGTTCTGAAATCGTAGCTTGTCAGTGACTTCTTCAGTTCTAGATAATCCTCTTCTGAAATCCAATTGCAGATATCTGTGGTATAAGACAAGATTGATAATGACGTCGATAGCAATTTAAACATAAGAACTTCAGGAATTCTCCCTATTCTTGGCTTTTTTTCTGAGATTGTGATCACATTCAATGTCCACCCAAGTGGTCGTAGTAGATCCTCGAGACCATCGTACTTTAGTCTATCGAGCTGGACCTTTCTGTTTTGATCAGATGGTTCAGTCCTAGTGCTTACCTCCAAGACTGATAAAATGTTGTTGTTTCCATCAATTAAATAACCATCTGGAACAATTGTTTTGACTGTTTCATGAGATCCGATGGCATCATCAAGTAGCTCATTCATCTCCTTTAGCTCATTGTTGTGTTTGAGCCCTGTGTCCCTACAACAATTTAGCTCATGGATGGTTGATCTGAGCTTGATTGCATTTGTGGCCATCTCCCCAGCCGTATTGGAAATCCATCCTGGTTTATATAAATCTCTTTCATAGGACAGCACTTCCAACACAAGACCTTTTAGTCTCTCTAATTCAGAGTCCTCAGGACATATGGAGCCCATAATTGCCTAACCACCACCACCTCACCATAAG
| 25,861
|
OM456559.1
|
Aurora borealis virus 3
|
Hepojoki,J.
|
University of Helsinki, Medicum, Department of Virology
|
Finland
|
2022-09-03
|
CR-wild4-FFPE
|
Aurora borealis virus 3
|
Reptarenavirus
|
Arenaviridae
|
ssRNA(+/-)
| 6,850
|
GenBank
| null |
Costa Rica
|
Costa Rica
|
Boa constrictor
| null |
2018
| null | null |
Aurora borealis virus 3 isolate CR-wild4-FFPE segment L, complete sequence
|
CGGGATCCGCGTTTTCCAGTATCCATCTAAAGAGTTAAATCTCAACAAATTAAATCCAAAGTTTGACATCTGAGAGAGTGAGACTCTCAGATTCAAAGCTCAGGACATTCAACATGAGTGATTCGACCTCCATAGGTCTAACCACAGAGGTGATCTCTATAATAACATTCATACTGGTGATTGCCATATTTGTTGTAGAGATTGTGAGCTGTGTCACCATGATGACTCTCAAGGCAATCACATTGAAGAAGAGACTCAGTTTTTGTCAAGGATGTGGGAAAAATGCAAGTCTTGTAATTCTTCCCTGCAAAAACAAAGTCTGTATGGAGTGTGCCCTTAAAATGAGATGCCCAGTTTGCTATGAGGCATGTCTCTGGTGTGAAAACCCAGATGGCTCTCTTACATCATTGGCACTTGTCAACAAAGAGAGAAGCAGACACACCGGAGGTGAAGGAGACATCCAGGGGCCCTAAGAGACCACAGCAGAGCAGAGAGACAACAGCAAAAACCCAGAAAGGACAAGAGAAAGGGACAACCCAGACCGCCGAGGGGAGCAGCGCTCCCCTCGGCGGTCTGGGGGGTCTCGAGCATGGCCCTGCGATCTAGTCTTCCAGGGTCTCGGGCTCGGGAGTTCCGGACGCCCAATCCTTGTAGAGCATGAGCCTGTGTCCTTTGTAAAGCAATGGCCCAGCTGGATAGCTAACAAGTATTCCCTTCAACCTGTGAAACACTAAAGTGGGACCTCTAGTGGTAAAGACTCTATCTGTAAATGTTAGGAACTCAACAAATGAGTCAAGCTGGTGAAAGCCCATTTCGACCACTTTTTCAACTGTTGAATAACCAAAGATTCTACTTACCATTCCCCATAGAGCATCAAATCTAGCCTTGGGGAGACAAGATATTTCCCCCTTCATCCTTGTTATAAAATATGTCCTCACCAGCTTCCAGAGTTCATCCCATTCAGCTTCTGACATCTGAGTCATTATTGATCCCACCAAATCTGACTCCAGGGGAATTATACAGCCCATGAACAAGAAACATGGCTTTCCATTTGGCTTGGGATTTTCTATAATTGTAACATCTCTAAACTCTAGCATGTCCAACATTTCAGGCTCATCAAATTCTGAATCAGAGATGATTGTCCTCTTGAGAAATATGAAATCCTGATAATGAGCACGTCCTGTATGTGTAATCAGTGTTGCTTGAATTTTGAGATCATCACTTACCTGCTGAAAGCAGCACTGTAACTTTATTGGATTAGATGTTCCTAGTTTAGCGCCTCTAATCCATGTGCCATCTTCCAGAGGGGCCTCTGGAGCACCTCTCCCATACACAACGACATTACTAGATGCAATCTCACTTGGCTCATCTTCCTTTTGTCTGTAGTGTGACTCCCTGCCTAATAGAATTTGTTGGATGTATCTTCTGACACCAGATTCTCCATGTGTCTTTAGCTCGTCCATAGAACCTTCATATGGAGCAAGTTTTGTTGCATCCAGAACCATAACTTTATCTATAATCTTCGGCTCTAATATTGAGTTCAAGATCATTCTGTTGACTATTGCTTGTAAACCTTTTCTTGCAATTCTCTCAGGTCCTCTTTTCTCAAGCTTCATAACCCGTCTTATCAACCTGCTTGGTTCATAATAATCAACTAGTACAACTGCCTCCTCTTGCCTGTCAATCCTACCATCAAAAATAGATAACCCTTCATTCGCACATTCTATTAACAATTCCATCTCAGGTCTAACTTTCCAGGAGTGTCTCATGAGCAGTCTCTTGTCTGGTGGCACAATGTCTTTTAAGTACTTGTCAAAAAGATCAGGCATGGTCATCTCAATGGCTGCAGTCAATTCATCCAATCCAAATCTGAATTCTGCAGTGTTAACAAGTGATGTTCTCATGTAGATGCTCTTGTTTGCCTGCTTACCTAATCCACCTTCAGTTCCACAAACCCAATCACCAACTGCACAAACTGATTGCATCACTAAGGAGGGGAAGACTTCAGCCACAGATTTTACTACAACTTTAGATTCCTTTAGAGTCAAGAATGTGCCATCACCCTTCCTAACACATGAACCTGACAAGCTGATACTTAATCCGATGAATCCAGTCACAACTGAACTCTGAAAAGCAGACCTTTCAAGTCCTTCTGCAATCAACAAACCAAGACCTTGCTTTGAATATCTCGAGTAGTGATTGATCAACTTTTTGATCAGGAGATTCTCACATGTCTCATTTATTGTTGTGCCCAAATTGAGCTTACTCCTGACAATTAATTTGAATTCTCCGTTGAGTGTTGGGAACCATTGAGTGATTTCTCCCAATTCTGATCTGCTAATTTCTACCATCCTCTTGTATGCCACAGAAGGTGCTATTGATGATTCTCTTAACTCTTTGATCACCTTTAATAGTTCAAGTTTCAACACATCAAGCTTAATCTTCTCTATCCCCATATCCATCAACCAGCTCTCCAATGACCTCAACTTTCTGTAAGAAAGGCAACCCTCCAACCAGTCTTGTTGTCTTGATTCTACAGGCTTCATCAAAGGATCACCAGCATACCCCAACCAGCCTAACATTTCAACCATCCTCCTCTTCAATGAATCAGCCACCTTTAAAGACATGCCATTGCAAATTCCTTGCTCAACAATGGCATCACATGTGTTGAAAAGTTCCATTGGTGTTTTACACCTAAAATTGTTGATGGAGGCTGCAAAAAACTTTGTGAAAAGAGGAACCATTGTTGCTTCCACCTCAAAGTGAGACTTGAATTCCCCAACAAGTGGGCTGCAGCAAAACTTTGGTGAGATGTGTTTATTCAAACAGTTGGACACTAGACACAAAAAGTTTGTGATCAAAAGAAGTTTGTCTCTTTGGTCACAATCTTTGTTTTTGTATTTGACATGAAACAATAACACCATATCATCAGATGTGTTCATAGTGCTCGACCTGATCCCAAATATATCTCTTATCTTTTTTGTTATATATTCAGATGCTAGAGACCCATAAAGGTCAGATGTATGGTGTAAGATTCCCTGACCCATGTCAAACCATGAATGGACTTGTGAAGGCACAGGTCTATTGGACAAGACAGCATCCACCATAAATGTCTCAAAAGTTCTTTCTTTTCCAACCTGTCTATCTCTTCTCCCTAGACTTATATCAAGGGATGATAGGATAACATCTTCTGCCAGGATCTGAGGCGTTTCCACCGCTTTAAACAGGTGCCACTTAAGAATTGTTTTTGCAAATGAAAAATCTAATCTTTTCCCCTCAGTGTCATTGATACTTTCCATTGCCTCAAACATCAAATGGTATTGAAGAGGGCTATTGAAAGGACCCCATTTTGAGTGATCCATGCTCAGAACTATCTCATTCTCAAAAAAAGATCTTGCAATCCTTTTCATGAAATTGGAGAATTTCTTGTCTGAGTTAAGGCAACTATTATTGAGTTTATTACCTATGTTTCTCGAAGTCTCTTCCAAGACTCTTGTGATTAGCTTTGTGTCAGAATCTCCTACATAGAGTTCTCTAGGCCCACCTACTTGTTCTTTTATTGCAAGCCCAAACTGGAGTGGCTTGTTATTTGGTCCAACTTCTGAGTCCTTAATCTTTAGGTTCAGTGTTGAAAAAAGGATGTTTCTTAGTGTGGGTGCTCCATATTTTATTGCTAAGAGTCTATCCTGCAATGCTTCTGAATTGGTAACTCTTGTTGAAAGCATGCTTTCTCCCCTATACTTATTGGATATTGATAAAAAAGAGCTCTGGGGACCTGATCTATGATCATATGTCCCCTGAAAGTTGTTGAATCCCGCCCAGAGGAGCAAGAATTTGAAGCTCGAGAAAAACTCCTTTGATTCAAATTTTGTGACAACCATGCCTGCTGATATATTAGTCACATCAATGGTTTCAGCCTGTCTAGGAAACTCCAGTGGGGCTCTTGACATTATCTCACTGACAACTTTCTCATAGGTTTCCTCCTTTAAGAGATCTGTGGGAAGGTCTGATAATTTGGTACTATAACATGTGGAGCGAACAAGATCACAAATTTCAGGACCCAGTAGCTCACGAATCACATCCAAGACCAAGCAGTATTTAGTTTTTTGAAGATCACTCACATCTTTATAGCTTGACTCCTTAAGCTCATCATCAATTTCTGACATGCACTTGCTGATCCGAAGAAGAAAATCACTCAAACCCTCTTCGGAATCAGTCTCAACAATAAGTCCTTGGACAATCCCTAAGAATTCTTCATAAGCCAACCTAGTTTTTCTTCTTTTTTCACCACCAGCTTTCCAGTTTTTTTCTTTGGCAAGCTTATCCTTTGACTTTGAACCTTTGACTTCTTCCAATTTATTTTCTGCCCCTGTTGATTTTGTGATCCTCTTGTGCAACCTCTCACTGATTACCCTTTTAAGAAGTTTCTCAGTGTCATATTGCTGATCTAGTGCACCATCTACATGATGTTTTTTTGACCTTTTAAACGTACTTTTATTTGAAGTCAAGTCCAAAACATCAATATTTGATGTTAGGTAATCTTTTGGGTTTAATAACTGCTCACCATCAATGCCATTAAACTTTTCCATTGATATCCATTTTAAGAAATCAGCAAGAATAGGTTCATATAAGAATGGCTTGGTTTCAAAAGAGGGCTCCTCACATTGAATAAAATCATTGACTTCTTGTTCCATTCTTTCAACCAATTCATCAACGTTCTTACAGTCATAGATCATGTTAGACATAAACTGAAATTTTGGTTTAAAGAACTTCTCATAGCAGTCCCTTAAATCTGACAACCTGTCTGGAGTTTCTTTTGTAATCAAGTGACACAAGTAAGATATATTCAGTGCCCATGTCACCTTCAAAAATAAGCCTATATTTCTACAAGAAAGGATTTCATTAATTAAGCTATGAGCAAGCTCTCTTAGAAAGTATTCATCATAAGTGATACAGTTACCAACAACTTTATCTTTTAAATCTTTGTGGTGAATGAGGGATAAGGTATCCATGATGTAATATCTCTGTGACTGAAGCTCCACCTGGAGTCTTTTAGTTGGAGTAGTTAAGATGCCGTAGATCAGATAGGTGACTTTGACCTTTAAGCCATCAATTTGCTTATCAGAATATTCAGATGAAACCAGGAATTCATTTACGGACTCCTGCCTGTTTATTGTGTCTTGTAGTCTCTCAATGTCATCATGAATTGGGTTAATAAGCATAATCAATTGATCAACCAAATTTGCAATAGGTTTTGCACTGAATATGAGTGGGAATAGCCTTGAGGGATTAATGTTGAAAGAATAAAAGCTGTATCTAAGTTTACCTTGTTTATAGCTTTTACAAAGGAGACTGAATGCCTTCTGTCCTTCACCTGTACATTTATACAGCAATAGACAACCATTGACTGACTGAAAGAAGTACTCTTCACTTGCACTAGCCCTTGGAGTACTTCTTGTCTTTTGAGAAAGAATGAGATTTAATGCAACTTTTTCAACAACATCTGCTTCATCAGATGTTACAGCAGTACTCTGTGGTTCACAGGGCATATCATTTATAATTTTTAGACTCAGAATTGGTTGGGGCACAGTGGTTCTTGGTGCTGACCTGGCATACATGTCCCTCAACACCGAAGGCTCAATTAGATCATGAGATGCTTCTTCCAAAAACCTGATGAGAGTTCCCAATTCCCCTAGCTTTTGTCTACTGCCAACTTCCTTTTGAAGGTTCTGAAGTGACTTCACCATTCTTTCAATCAACTTTTTGTATACCCAAATTGGTGAGTCTATGGAGTCCACCTGCACCAGTCTATCATTTACACTAGGATACCAGCCCTGTGGGAAATCATTGACATCTGATGTTTTAACAAAAAGTGTCAATGCAAGATAGTCATACACTTTGTTTTGTTTTCTTCTAGTATTCAATAAATTCAATGATTTCAGCTTATTCAGCAAACTTAGGTGATTTGTCTTAAAACTTAACCCAACCACAGCATTTCTAATTATTTCCAAGAGTCGCAGTTGTTTAGCCTCTCGTTTGAAATCTTGTATCATCCTTGTCATATCGGGGCCATCCCAATTTAGAGTGAACGGCAACTCACCATCATTTTCCAGCATCCAATCAAGAAGATTTTTGTATGGATCGTCAGTTGACTCTATGTCAAACAGTAGTTTTTGCCCCTTGAACTCTTCTGTCAGGGTTCTAAAATCGTAACTTGTCAGTGACTTTTTCAGTTCTAGATAATCCTCTTCTGAGATCCAATTGCAGATATCTGTGGTATAAGACAAGATTGATAGTGACGTCGATAGCAATTTAAACATAAGAACTTCAGGAACTCTCCCTATTCTTGGCTTTTTTTCCGAGATTGTGATCACATTCAATGTCCACCCAAGTGGTCGTAGTAGGTCCTCAAGACCATCATACTTTAGTCTGTCGAGCTGGACCTTTCTAGTCTGATCAGATGGCTCAGTCCTAGTGCTCACCTCCAAGACTGATAAAATGTTGTTGTTTCCATCAATCAAATAACCATCTGGAACAATTGTTTTGACTGTTTCATGAGATCCGATAGCATCATCAAGCAGCTCATTCATCTCCTTTAGTTCATTGTTGTGTTTGAGCCCTGTGTCCCTGCAGCAATTTAGCTCATGGATGGTTGATCTGAGCTTGATTGCATTTGTAGCCATCTCCCCAGCCGTGTTGGAAATCCATCCAGGTTTATATAAGTCTCTTTCATAGGACAGCACTTCCAGCACAAGACCTTTTAGTCTCTCTAGTTCAGAGTCCTCAGGACATATGGAGCCCATAATTGCCTAACCACCACCACCTCACCACCCCTGATGCATCTAAGCTT
| 25,862
|
OM456562.1
|
Aurora borealis virus 3
|
Hepojoki,J.
|
University of Helsinki, Medicum, Department of Virology
|
Finland
|
2022-09-03
|
CR-Wild5-brain
|
Aurora borealis virus 3
|
Reptarenavirus
|
Arenaviridae
|
ssRNA(+/-)
| 6,898
|
GenBank
| null |
Costa Rica
|
Costa Rica
|
Boa constrictor
| null |
2018
| null | null |
Aurora borealis virus 3 isolate CR-Wild5-brain segment L, complete sequence
|
CTGGGGATCCGCGTTTTCCAGTATCCATCTAAAGAGTTAAATCCAAACAAATTAGATCCAAAGATTGACATCTGAAGGAGTGAGACTCTCAGATTCAAAGCTCAAGACACTCAACATGAGTGGGTCGACCTCCATAGGTCTAACTACAGAGGTGATCTCTATAATAACATTCATACTGGTGATTGCCATATTTGTTGTGGAGATCGTGAGCTGTGTCACCATGATGACTCTCAAGGCGATCACATTGAAGAAGAGACTCAGTTTTTGTCAAGGATGTGGGAAGAATGCAAGTCTTGTGATTCTTCCCTGCAAAAACAAAGTCTGTATGGAATGTGCCCTTAAAATGAGATGCCCAGTTTGTTATGAGGCATGTCTCTGGTGCGAAAACCCGGATGGTTCTCTTACATCATTAGCACTTGTAAACAAAGAGAGGAACAGACACACCAGAGGCGAAGGAGACACCCAAGAGCCCTGAGAAGCCAGAAGCAGAGCAGAGAGACAACAACAAAAGACCCAGGAAGGACAGGAGCAGGGAACAACCCAGACCGCCGAGGAGAGCAGCGCTCTCCTCGGCGGTCTGGGGGGTTCCGGGGCGTGGCCCAGCGATCTAGTCCTCCAGGGTCTCGGGCTCAGGAGTTCCGGACGCCCAGTCCTTGTAGAGCATGAGCCTGTGTCCTTTGTAAAGCAATGGACCCGCTGGATAGCTAACAAGTATTCCCTTCAGCCTGTGAAATACTAAAGTGGGACCTCTAGTGGTGAAGACTCTATCTGTGAATGATAGGAACTCAACAAATGAGTCAAGTTGGTGAAAGCCCATTTCGACCACCTTTTCAACTGTTGAATAACCAAAAATTCTACTTACCATTCCCCATAAGGCATCAAATCTAGCCTTGGGGAGGCAAGATATTTCTCCTTTCATCCTTGTTATAAAATATGTCCTCACCAGCTTCCAGAGTTCATCCCATTCAGCTTCTGACATCTGAGTCATTATTGATCCCACCAAATCTGACTCTAAGGGAATTATACAACCCATGAACAAGAAGCATGGCTTTCCATTTGGTTTGGGATTCTCTATAATTGTGACATCTCTAAACTCTAGCATGTCTAACATTTCAGGCTCATCAAATTCTGAATCAGAGATGATTGTCCTTTTGAGAAATATGAAATCCTGATAATGAGCACGTCCTGTATGTGTAATCAGTGTTGCTTGAATTTTGAGATCATCACTCACCTGTTGAAAGCAGCACTGCAACTTTATTGGATTAGATGTTCCTAGTTTAGCACCTCTAACCCATGTGCCATCTTCCAGAGGAGCCTCTGGAGCACCTCTTCCATACACAACAACATTACTAGATGCAATCTCACTTGGCTCATCTTCCTTTTGTCTGTAGTGTGACTCCCTACCTAATAGAATTTGTTGGATATATCTTCTAACACCAGATTCCCCATGTGTCTTCAGCTCATCCATAGAACCTTCATATGGGGCAAGTTTTGTTGCGTCCAGAACCATGACCTTATCTATAATCTTCGGTTCTAATATTGAGTTCAAGATCATTCTGTTGACTATTGCTTGTAAACCTTTTCTTGCAATCCTCTCAGGTCCTCTCTTCTCAAGCTTCATAACCCGTCTTATCAACCTGCTTGGTTCATAATAATCAACTAGTACAACTGCCTCTTCTTGCCTGTCAATCCTACCATCAAAAATAGATAATCCTTCATTTGCACATTCTATTAGCAATTCCATCTCAGGTCTAACTTTCCAGGAGTGTCTCATGAGCAGTCTCTTGTCTGGTGGCACAATGTCTTTTAAGTACTTGTCAAAGAGATCAGGCATAGTCATCTCAATAGCTGCAGTCAATTCATCTAATCCAAATCTGAATTCTGCAGTGTTGACAAGTGACGTTCTCATGTAGATGCTCTTGTTTGCCTGCTTACCCAACTCACCTTCAGTTCCACAAACCCAATCACCAACTGCACAAACTGATTGCATTACTAAGGAGGGGAAGATTTCAGCTACAGGTTTTACTACTGCTTTAGATTCCTTTAGAGTTAAGAATGTGCCATCACCCTTCCTAACACATGAACCTGACAAGCTGATACTTAATCCGATGAATCCAGTCACAACTGAACTCTGAAAAGCAGACCTCTCAAGTCCCTCTGCAATTAACAAACCAAGACCTTGCTTTGAATATCTCGAGTAGTGATTGATCAATTTTTTGATCAGGAGATTCTCACATGTCTCATTTATTGTTGTGCCCAAATTAAGCTTACTCCTGACAATTAATTTGAACTCTCCGTTGAGTGTTGGGAACCATTGAGTGATTTCTCCCAATTCTGATTTGCTAATTTCCACCATCCTCTTGTATGCCACAGAAGGTGCTATTGATGATTCTCTTAACTCCTTAATCACTTTTAATAGTTCAAGTTTTAACACATCAAGCTTAATCTTCTCTATCCCCATGTCCATCAACCAGCTCTCCAATGATCTCAACTTTCTGTAAGAAAGGCAACCCTCCAACCAATCTTGTTGTCTTGATTCCACAGGCTTCATCAAAGGATCACCAGCATACCCCAACCAGCCTAACATTTCAACCATCCTCCCCTTCAATGAGTCGGCCACCTTTAAAGACATGCCATTGCAAATTCCTTGCTCAACAATGGCATCACATGTGTTGAAAAGTTCCATTGGTGTTTTACACCTAAAATTGTTGATGGAAGCTGCAAAAAACTTTGTGAAGAGAGGAACCATTGTTGCTTCCACTTCAAAGTGAGACTTGAACTCCCCAACAAGTGGACTGCAGCAAAACTTTGGTGAAATGTGTTTATTTAAACAGTTGGATACTAGACACAAAAAGTTTGTGATCAAAAGAAGTTTGTCTTTTTGGTCACAATCTTTGTTTTTGTATTTGACATGAAACAATAACACCATATCATCAGATGTATTCATAGTGCTCGATCTGATTCCAAATATATCCCTTATCTTTTTTGTTATATATTCAGATGCCAGAGACCCGTAGAGGTCAGATGTATGGTGCAAGATTCCCTGACCCATATCAAACCATGAATGGATTTGTGAAGGCACAGGCCTATTGGACAGAACAGCATCCACCATAAATGTCTCAAAAGTTCTTTCTTTTCCAACCTGTCTGTCTCTTCTCCCTAAACTTATATCAAGGGATGATAGGATAACATCTTCCGCCAAGATCTGAGGTGTTTCCACCGCCTTAAACAGGTGCCACTTAAGAATTGTTTTTGCAAATGAAAAATCTAACCTTTTCCCCTCAGTGTCATTAATACTCTCCATAGCTTCAAACATCAAATGGTATTGAAGAGGGCTGTTAAAAGGACCCCATTTTGAGTGATCCATGCTTAGAACTATCTCATTCTCAAAAAAAGATCTTGCAATCCTTTTCATGAAATTGGAGAATTTCTTGTCTGAGTTAAGGCAACTATTATTGAGTTTGTTACCTATGTTTCTCGAAGTCTCTTCCAAGACTCTTGTGATTAGCTTTGTGTCAGAATCTCCAACATAGAGTTCTCTAGGCCCACCTACTTGTTCCTTTATTGCAAGTCCAAACTGGAGTGGCTTGTTATTTGGTCCAACTTCTGAATCCTTAATCTTTAGGTTCAGTGTTGAAAAAAGGATGTTTCTTAGTGTGGGTGCTCCATATTTTATTGCTAGGAGCCTATCCTGCAATGCCTCTGAATTGGTAACCCTTGTTGAAAGCATGCTTTCTCCCCTATATTTATTGGATATTGATAAAAAAGAGCTCTGGGGACCTGATCTATGATCATATGTCCCCTGAAAGTTGTTGAATCCCGCCCAAAGGAGCAAGAATTTAAAGCTCGAGAAAAATTCCTTTGATTCAAATTTTGTGACAACCATGCCTGCCGATATATTAGTCACATCAATGGTTTCAGCTTGTCTAGGAAACTCCAGTGGGGCTCTTGACATTATCTCATTGACAACTTTCTCATAGGCTTCCTCCTTTAACAAATCTGTGGGAAGGTCTGATAATTTGGTACTATAACATGTAGAGCGAACAAGGTCACAAATTTCAGGACCCAGTAGTTCACGAATTACGTCCAAGACTAAGCAGTATTTAGTCTTTTGAAGATCACTCACCTCTTTATAGCTTGACTCCTTAAGCTCATCATTAATTTCTGACATACATTTGCTAATCCGAAGAAGAAAATCACTCAACCCTTCTTCGGAATCAGTCTCAACAATAAGTCCTTGGACAATCCCTAAGAATTCTTCGTAAGCCAACCTGGTTTTTCTTCTTTTTTCACCACCAGCTTTCCAGTTTTTTTCTTTTGCAAGCTTATCCTTTGACTTTAAACCTTTGACTTCCTCCGATTCATTCTCTGCCCTTGTTGATTTTGTGATCCTCTTGTGCAATCTCTCGCTGATTACCCTTTTAAGAAGTTTCTCAGTGTCATATTGCTGATCTAGTGCACCATTTACATGATGTTTTTTTGACCTTTTAAACGTACTTTTGTTTGAAGTCAAATCTAAAACATCAATATTTGATGTTAGGTAATCCTTTGGGTTTAATAACTGCTCACCATCAATGCCATTAAACTTTTCCATCGAGATCCATTTTAAGAAATCAGCAAGAATAGGTTCATACAAGAATGGCTTGGTTTCAAAGGAAGGCTCCTCACATTGAATAAAATCATTGACTTCTTGTTCCATTCTTTCAACCAATTCATCAACGTTCTTACAATCATAGATCATGTTGGACATAAACTGAAATTTTGGTTTAAAGAACTTCTCATAGCAGTCCCTTAAATCTGACAACCTATCTGGAGTTTCTTTTGTGATTAAGTGACACAGGTAAGATATATTCAGTGCCCATGTCACCTTCAAAAATAAGCCTATATTTCTACAAGAAAGGATTTCATTGATTAAGCTATGAGCAAGCTCTCTCAGAAAGTATTCATCATAAGTGATACAGTTGCCAACAACTTTAACTTTTAAATCTTTGTGGTGAATGAGGGATAAGGTGTCCATAATGTAATATCTCTGTGACTGAAGCTCTACCTGGAGTCTTTTAGTTGGAGTGGTTAAGATACCGTAGATCAGATAAGTGACTTTGACCTTTAAGCCATCAATTTGTTTGTCAGAATATTCAGATGAGACCAGGAATTCATTCACAGACTCCTGTCTATTTATTGTGTCTTGTAGTCTCTCAATGTCATCATGAATTGGGTTAATAAGCATGATCAATTGATCAACCAAGTTTGCAATAGGTTTTGCACTGAACATAAGTGGGAATAGCCTTGAGGGATTAATGTTGAAAGAATAAAAGCTGTGTCTAAGTTTACCTTGTTTATAGCTTTTACAAAGGAGACTGAATGCCTTCTGTCCTTCACCTGTACATTTATACAGCAATAGACAACCATTGACTGACTGAAAGAAGTACTCTTCACTTGCACTAGCCCTTGGAGTGCTTCTTGTTTTTTGAGAAAGAATGAGATTTAATGCAACTTTTTCAACAACATCTGCTTCATCAGATGTTACAGCAGTGGTCTGTGGTTCACAGGGCATGTCATTTATAATTTTTAGACTCAGAATAGGTTGGGGCACAGTAGTTCTTGGTGCTGACCTAGCATACATGTCCCTCAACACCGAAGGCTCAATTAGATCATGAGATGCTTCTTCCAAAAACTTAATGAGAGTTTCCAATTCTCCTAGCTTTTGTCTACTGCCAACTTCCTTTTGAAGGTTCTGAAGTGACTTTACCATTCTTTCAATCAACTTTTTGTACACCCAAATTGGTGAGTCTATGGAATCCACTTGCACCAGTCTATCATTTACACTGGGGTACCAGCCCTGTGGGAAATCATTGACACCTGATGTTTTAACAAAAAGTGTCAATGCAAGATAGTCATACACTTTGTTTTGTTTTCTTCTAGTATTCAATAAATTTAATGATTTCAGCTTATTCAGCAAACTTAGGTGATTGGTCTTAAAACTCAACCCAACCACAGCATTTCTAATTATTTCCAAGAGTCGCAGTTGTTTAGCTTCTCGTTTGAAATCTTGTATCATCCTTGTCATCTCAGGGCCATCCCAATTTAGAGTGAATGGCAACTCACCATCATTTTCCAGCATCCAATCAAGAAGATTTTTGTATGGATCGTCTGTTGACTCAATGTCAAACAGTAGTTTCTGTCCCTTGAACTCTTCTGTCAGAGTTCTAAAATCGTAGCTTGTCAGTGACTTCTTCAGTTCTAGATAATCCTCTTCTGAAATCCAATTGCAGATATCTGTGGTATAAGACAAGATTGATAATGACGTCGATAGCAATTTAAACATAAGAACTTCAGGAATTCTCCCTATTCTTGGCTTTTTTTCTGAGATTGTGATCACATTCAATGTCCACCCAAGTGGTCGTAGTAGATCCTCGAGACCATCGTACTTTAGTCTATCGAGCTGGACCTTTCTGTTTTGATCAGATGGTTCAGTCCTAGTGCTTACCTCCAAGACTGATAAAATGTTGTTGTTTCCATCAATTAAATAACCATCTGGAACAATTGTTTTGACTGTTTCATGAGATCCGATGGCATCATCAAGTAGCTCATTCATCTCCTTTAGCTCATTGTTGTGTTTGAGCCCTGTGTCCCTACAACAATTTAGCTCATGGATGGTTGATCTGAGCTTGATTGCATTTGTGGCCATCTCCCCAGCCGTGTTGGAAATCCATCCTGGTTTATATAAATCTCTTTCATAGGACAGCACTTCCAACACAAGACCTTTTAGTCTCTCTAATTCAGAGTCCTCAGGACATATGGAGCCCATAATTGCCTAACCACCACCACCTCACCACCCTTGATGCATCTAAGCAAATTTCTTTCTTTTGATAGATATGGAAATACGCGGATCCTCAGT
| 25,864
|
MT138209.1
|
Aveparvovirus sp.
|
Xiao,Y., Shan,T., Yang,S., Zhang,W.
|
Jiangsu University, School of Medicine
|
China
|
2020-05-06
|
bfb009ave01
|
Aveparvovirus sp.
|
Aveparvovirus
|
Parvoviridae
|
ssDNA(+/-)
| 5,208
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Aves
|
feces
|
2018
|
SAMN13782218
|
PRJNA600556
|
MAG: Aveparvovirus sp. isolate bfb009ave01, complete genome
|
CTCTTATATACATCTAGCTTGGTTAATCATTGACCATGGACTTTGGTTGATTGAGGCCTACGCCTTTGTATACACAACATTGGGATACCTTGCTTTTTCCTACTTCCTTCCATCTTCCATCCTCCATCTTACACATGACTCCATAGTCACATGTCGGATACTAGTTCTGCGCGCGTAGCGCGCGCGCCTTCGGCGCGAACGTATCCGACATGTGACTATGGAGTCATGTGTAAGATGGAGGATGGAAGATGGAAGGAAGTAGGAAAAAGCAAGGTATCCCAATGTTGTGTATACAAAGGCGTAGGCCTCAATCAACCAAAGTCCATGGTCAATGATTAACCAAGCTAGATGTATATAAGAGTGTACACCGAGCTGCATAGTCACTCCTAGCTAGGATCAGGACCCCAGAGGTGCCTCTCCGCGCTAAGGTAAGATGGCCATTCCTAATTCTGGTGGGTTTTCTGCTATTGTTATGCTGCCTGAGCACGTGCAGATTGGCTCTAACCAAGTTAACCTGCGCGCTGCTGTTTGTGCTAGCTATACTAACCCTAAAGGGGAAGAGGTCCAGACTAAATTTCCTAGAGACCATGAGTTTGAGTCTAAGATTCAAAATTTTCTGGGGGTCCCTGATTGGAACTCAATTGACCTCAATTGGATTAAGCTTCACTATCAGCTCACTAAACATGCCATGGATATCGAGCAGAGCATTAATCCAGCTGCTAGATTCTTTTGGCAGATTGAAATCTCGAATGGAGGCAAAGTCCATGTCCATATCTTATTTATCAGTGGATGGACTTCCAAAAACATAACCTGGACTTTGAAACGGATCAGAAGGGAAATTTGTAAACAATTTTCTGATATCATGAGTACATTTATGCCTGAATGGACTTCGCCCCAGTGGTGGGGTCTTTTGACTAATTGCAGCATGGCAGCCATTTCACTGAACAGAGCATACTCACCAAGATTGGGAAAGACCATTCCTCAGCCGGTGAACCCGTACTCATTTTTGACAAACTACCTGTATAATCCCAAAAAGTCAGTGATGGTTAGAGAATGCTCTATGAACCTCAATGGGGTCCTGAAAACTGATAGACTAGAGGACATTCCAGAACTAGTAGAAGAAGGCGAGCCTGACATTAGACCTATGACCTTGGAACCAGGAGATCAATTGCCTCTGACTTATGTAAGTACCAGCACTGACTGGGAAACAGGTGGTGGTTATAGCACCATTAAAGTTGGTGTTATGGAAAAATTATGCATGGAGGCTTTGAGACTTTGCAAGGAAAATATGATTTTTACCCTAAAAGACTTTAAATTACAATTTCCAGAAAAATTTCTTCAATTTTCCAGCCGTACTCGCGGGACTGAAAAATTATCAGAAACTATTGACCTCTACGTAGAATCCATTTGTGCTGAAGAATCTGCCTGGAACATTGCCAAGGCTAGAATGAAACATGTCCCGGAAGGGGACATGGACCACAATCTGGTGGTCAGACTAATAACCTATCAAGGTTATTCGCCCATGTATATGGGTCAACTTTTAGTCAGCTGGCTAAAAGATGAATTAGGCAAAAAAAATTCTGTCTACTTTTTCGGTCCTGCCAATACTGGCAAAACTATGATGGCAGAGTCCATCTGCAAGATGGTGGGCATTTATGGAAACGTTAACCACAACAATGTTAACTTTCCATTCAATGACTGCCACAACAAAGCTATCATTTGGTGGGAAGAATGCTCCATGCAGGAACAATATGTAGAGGCTGCTAAATGCATACTGGGCGGCTCCGCCGTCAGAGTAGATAAGAAGGGCAAAGACTCTGTTTTGGTTCAAAGGACACCTGTCGTCATCACCAGCAATAATGACATTACTGTTGTTGCCGGAAGAAATGCCATCAGCTCCAATCATGCGGCTGCATTGCGCAGTCGCTGTATGAAGTTTGCCTTCAATAACTGGTTAACCAGTAATTGGGGGCTCATTACACCTGAAGAAATGTTCCAGTTCCTGCATTGGGCAGACTCCACGTTCTCTTGCACTTTGACCTCTGTCATTGCTGCTAATCCAGGCTGTGAAGGTAATATTCCCTACAACCAACCGAGGGGCAATTGGTGCTCCTCTTGTTCTCCTCAGTTCACTACCAAGGAGACTGTCACTCTGTGCCCTTCCTGCTCTGGGTGGACCCGCATTCCTTCTGAGGTCATCGGCCAGGAATATGATGGCAATGAAGTGGCTTTAATGGAAGGTCTCACTGAAGGTATGTATGAATTGGGCGGGGTCAGAGGCTATATATACCCCTGACTGCTTTCTCTTTCAGACCAGCACGAGCTCCTGGCCGACGGAGACGCTAACCGTGCTGTCTGGATCGGCCGACGAGCCAGATCTCACGGTAAACGTCGAGCTGAAAGCCCAGGGGAGGACGAGAGCCCTAGAGCTAAGAGGGAGTGTGCAGCAGGACCCTCCACCGTGCTGCCAACTGCTCTAGGTAAGCCCATCAGAATGTCTGACAACGCTCCTAGCCTTCATGAACTTTACTGTGAAGAAGAAATGTTTTCTTCCTCAGATGAAGATGATACTCCACTTCCTGTTCCTCCACCCAAACCCAGGGACTATGTCATGTGGAGCAATGATGAGAGGAGGTGGATTGAATCATTTGGCGGGAAATGGAGGGTGGCTTTCCACGGGTTCCTGGATTGGTGGCATGACAATATTGAAAATGTCAACAAATTGTATTCCAAACTCCACCCTGACATGAAACCTTCCTTCATAGAACACTGGACAGAGATTAGGGAGTTTTGGGATTTATCTTGCGAGACTGATTTACAAATTAGAGATGCCATTTCTAGAAAAGATTTTACATTTGATATTGGGCTTGATATGAAACTCAATTCGGCCATTGACAAAACAGCTGGGGATTATCCATTGACCATTTGGTCCAAAATTGACCACTTTGCTCAGTGGTGTAATGCACGGGCTTTCTTCATAACAGGACAACAGCAGCCATGAAAAATTATGAGCCCAAAATTCCTACCAACACCGATGAAGCTTATTGGTACAACAGATGGTGGATTGACCATGTTAATTCAGGAAAAGTCATCGGCGGGAAATATGGAGGGGTTAAATCAAAGGGAAAACAATTAACTGCTGCTCAAAAAGAATCACGTAAACGGTTTTTTATTGTGCAGGCTCAGCAGAAAAAGAAGGCAAATGAGCAATTAAAATTTGGCATTCCTACTTCGTCTCAGCACGCAAGATTTTTCCGTAATCATACGGGTAGCGGTGGTGGGAAAGCTAAGGCAAAGACCAAACACATTGACCCTGGATACCAGGTCCCTTCTAATCAAGACCCTGACGAGGGTCCTGCTCCCAAAGTTGCTAAAACTTCTGCTGTTCCTAGACAATCCAACTGGGACATTAGTCCCACTCCAAGTCCAGAATCCTCTAGGGCTCAGACTCCGGCAGCTGCACCTGCGGCCGAACCTCAACAACCTGCTGAGGATCCCAATATTCTGGAAACCGTGATGGCCTCAGAAAATGACATTCCCATGGAGCCTGATCAGAGCGGACTTGCTGCTGATATGGATGTGGGTGGTGGTGGTGCGGGTGGTGGTGGCGGTGTTGGAAATTCTACTGGAAATTGGACTAATGAAACTGTATTCGCGGGTAAAACTATAATAACAAATGCCTCTAGACATTGTGTCTGTCTCAACCGTGATAATGACCATTATAAAATGATTTACAATGGAACCAATACACAAGAAAATAACCAGACTGACAAATCTGGGTGGATAGGGTTCACTACACCCTGGAATTACCTGGACTTTAACCAAAATGCGGTCCATTTCAGTCCTCGTGACTGGCAACATTTGGTCAATAACTACTCACGTTGGAGGCCGCGGGCTGTACACATTAAAATTTTCAACATTCAAGTGGTGCAACGCACCACTACTGCTGACTCTACACTCACCTTTGCCAATGACCTGACTGGCACCATCCAAGTATTTGCTGATCAGGCCAACAGATATCCTAAACTCATGTATCCCAATCAAACCACCATGATGGGGCCTTTCCCTAACATGATTTACTACCTGCCACAATACGGCTACCTCACAAACGGCGGGCCTGGCAATGCTGGACGGCCCTATGACTTGCTGGATGAATACTCGCAGTTTTACTGTCTTGATGAACACCCTTCAGTCATGCTGAGAACCGGCAATACCTGGGAAGGTCATTTTCAATTTGGGGCTGACACTGGGTGGATCTCCAACAGACGGACCACCCGTCCTATCACTAGGAGAATGAACCCCAACTATGACACATGGCAGGTCAATGCTGTCGGTGGAGACGCCAAGTCTGGCACCTATGACACATGGAGGTCCCCATGGCTCACTGGGCCGTGGATGGAACTCTATGAGGCTGCTGACAATACCACCATCTCTAATAACTCACATGTCTATGTGGGTCAAACTGCCATTCCTCTAAACCCTGGACCTCCCATTGGCCGACCTACCAATAAAGCTCACTGTCATCTGTTTTGGGTGAGCAAAGTTCATGGCATGAATGAAGGTGATGTCAATGAGCATTATATTAACCCCAGCACAGCCGTCACTGTGAGAGTGGACAACTCTGGCAGCTATGCCATTAACCCCAGTTCAGCCTATAAACTGCGTGCCAGCAGTGATACTGGGGGAGACAACGGGGGTGCCACCCATCTAATTAAATCACAAGCTATCATGCCCGGTATGATCTGGGATGATAGAATTGCTACCTACTGGGATAATATTTGGCAGGAGTATCCTGAGTCAGACAATAAATTCATGCCACATGGCAGACTTGGCGGCGTCTATACCGACGCCGCCCCGGGGCACGTGTACGTGAAACTCACTCCCAAGCCCACTGGAGAAGCCAATGCCATCATTGATCAATATGCCACTTTCACTGTTACTGTCTCCATTGAATGGGAAGCTGAACCATACACTTGCAGCCAATGGAATATGAGAAAGGTCATTTCCTATGATTCTACTGCTGCTAAATCTTATGATGGATTTTGTGATTCTGATGGAAATTATATTGTTGGTGCCAATGACAGAAATGTGGAAACTCTGTACACTGCCAAAGTCAATCACCGTGTTAACTGAAAAGGTCAAAGTCCAAATAAAATTTCAGTCCTGAATATAACATGTGAGTACCTTGCTTTTCTTCTTCTTCCTTCT
| 50,623
|
MT138210.1
|
Aveparvovirus sp.
|
Xiao,Y., Shan,T., Yang,S., Zhang,W.
|
Jiangsu University, School of Medicine
|
China
|
2020-05-06
|
bfb010ave01
|
Aveparvovirus sp.
|
Aveparvovirus
|
Parvoviridae
|
ssDNA(+/-)
| 5,334
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Aves
|
feces
|
2018
|
SAMN13782218
|
PRJNA600556
|
MAG: Aveparvovirus sp. isolate bfb010ave01, complete genome
|
ATACCTTGCTTTTCCTACTTCCTTCCATCCTCCATCCTCCATCTTACACATGACTCCATAGTCACATGTCGGATACTAGTTCTGCGCGCGTAGCGCGCGCGCCTTCGGCGCGAACGTATCCGACATGTGACTATGGAGTCATGTGTAAGATGGAGGATGGAGGATGGAAGGAAGTAGGAAAAGCAAGGTATCTCATTGTTGTGTATACAAAGGCGTAGGCCTCAATCAACCAAAGTCCATAGTCAATGATTAACTATGCTAGATGTATATAAAGGAGTACGCCGAGCTGCCTAGTCACTCCTAGCTAGGATCAGGACCCCAGAGGTGCCTCTCCGCGCTAAGGTAAGATGGCCATTCCTAATTCTGGTGGGTTTTCTGCTATTGTTATGCTGCCTGAGCACGTGCAGATTGGCTCTAACCAAGTTAACCTGCGCGCTGCTGTTTGTGCTAGCTATACCAACCCTAAGGGGGAAGAGGTCCAGACTAAATTTCCTAGAGACCATGAGTTTGAGTCTAAAATTCAAAATTTTCTGGGGGTCCCTGATTGGAACTCAATTGACCTCAATTGGATTAAGCTTCACTATCAGCTCACTAAACATGCCATGGATATCGAGCAGAGCATTAATCCAGCTGCTAGATTCTTTTGGCAGATTGAAATCTCGAATGGAGGCAAAGTCCATGTCCATATCTTATTTATCAGTGGATGGACTTCCAAAAACATAACCTGGACTTTGAAACGGATCAGAAGGGAAATTTGTAAGCAATTTTCTGATATCATGGGTACATTTATGCCTGAATGGACTTCGCCCCAGTGGTGGGGTCTTTTGACTAATTGCAGCATGGCAGCCATTTCACTGAACAGAGCATACTCACCAAGATTGGGAAAGACCATTCCTCAGCCGGTGAACCCTTACTCATTTTTGACAAACTACCTGTATAATCCCAAAAAGTCAGTGATGGTTAGAGAATGCTCAATGAACCTCAATGGGGTCCTGAAAACTGATAGACTAGAGGACATTCCAGAACTAGTGGAAGAAGGCGAGCCTGACATTAGACCTATGACCTTGGAACCAGGAGATCAATTGCCTCTAACTTATGTAAGTACCAGCACTGACTGGGAAACAGGTGGTGGTTATAGCACCATTAAAGTTGGTGTTATGGAAAAATTATGCATGGAAGCTTTGAGGCTTTGCAAGGAAAATATGATTTTTACCCTAAAAGACTTTAAATTACAATTTCCAGAAAAATTTCTTCAATTTTCCAGCCGTACTCGCGGGACTGAAAAATTATCAGAAACTATTGACCTCTACGTAGAATCCATTTGTGCTGAAGAATCTGCCTGGAACATTGCCAAAGCTAGGATGAAACATGTCCCAGAGGGGGACATGGACCACAATTTGGTGGTCAGACTAATAACTTATCAAGGTTATTCACCCATGTATATGGGTCAGCTTTTAGTCAGCTGGCTGAAAGATGAATTAGGCAAAAAGAATTCCGTCTACTTTTTCGGTCCTGCCAATACTGGCAAAACTATGATGGCAGAATCCATCTGCAAGATGGTGGGCATTTATGGAAATGTTAACCACAACAATGTTAACTTTCCATTCAATGACTGCCACAACAAAGCTATCATTTGGTGGGAAGAATGCTCTATGCAGGAACAATATGTAGAGGCTGCTAAATGCATACTGGGCGGCTCTGCCGTCAGAGTAGATAAGAAGGGCAAAGACTCTGTATTAGTTCAAAGAACACCTGTCGTCATCACCAGCAATAATGACATTACTGTTGTTGCCGGAAGAAATGCCATCAGTTCCAACCATGCGGCTGCATTGCGCAGTCGCTGTATGAAATTTGCCTTCAATAACTGGTTAACCAGTAATTGGGGGCTAATTACACCAGAAGAAATGTTCCAATTCCTGCATTGGGCAGACTCCACATTCTCCTGCACTTTGACCTCTGTCATTGCTGCTAATCCTGGCTGTGAAGGTAATATTCCCTACAACCAACCGAGGGGCAATTGGTGCTCCTCTTGTTCTCCTCAGTTCACTACCAAGGAAACTGTCACCTTGTGCCCTTCCTGCTCTGGGTGGACCCGCATTCCTTCTGAGGTCATCGGCCAAGAATATGATGGCAATGAAGTGGCTTTAATGGAAGGTCTCACTGAAGGTATGTATGAATTGGGCGGGGTCAGAGGCTATATATACCCCTGACTGCTTTCTCTTTCAGACCAACACGAGCTCCTGGCCGACGGAGACGCTAACCGTGCTGTCTGGATCGGCCGACGAGCCAGATCTCACGGTAAACGTCGAGCTGAAAGCCCAGGGGAAGACGAGAGCCCTAGAGCTAAGAGGGAGTGTGCAGCAGGACCCTCCACCGTGCTGCCAACTGCTCTAGGTAAGCCCATCAGAATGTCTGACAACGCTCCTAGTCTTCATGAACTTTACTGTGAAGAAGAAATGTTTTCTTCCTCAGATGAAGATGATGCTCCACTTCCTGTTCCTCCACCTAAACCCAGGGACTATGTCATGTGGAGCAATGATGAAAGGAGGTGGATTGAATCATTTGGCGGGAAATGGAGGGTGGCTTTCCACGGGTTCCTGGATTGGTGGCATGACAATATTGAAAATGTCAACAAATTATATTCCAAACTCCACCCTGACGTGAAACCTTCCTTCATAGAACATTGGACAGAGATTAGGGAGTTTTGGGATTTATCTTGCGAGACTGATTTACAAATTAGAGATGCCATTTCTAGAAAAGATTTTACATTTGATATCGGGCTTGACATGAAACTCAATTCGGCCATTGACAAAACAGCTGGGGATTATCCATTGACCATTTGGTCCAAAATTGACCACTTTGCTCAGTGGTGTAATGCACGGGCTTTCTTCATAACAGGACAACAACAGCCATGAAAAATTATGAGCCCAAAATTCCTACCAACACCGATGAAGCTTATTGGTACAACAGATGGTGGATTGACCATGTTAATTCAGGAAAAGTCATCGGCGGGAAATATGGAGGGGTTAAATCAAAGGGAAAACAATTAACTGCTGCTCAAAAAGAATCACGTAAACGGTTTTTTATTGTGCAGGCTCAGCAGAAAAAGAAGGCAAATGAGCAATTAAAATTTGGCATTCCTACTTCGTCTCAGCACGCAAGATTTTTCCGTAATCATACGGGTAGCGGTGGTGGGAAAGCTAAGGCAAAGACCAAACACATTGACCCTGGATACCAGGTCCCTTCTAATCAAGACCCTGACGAGGGTCCTGCTCCCAAGGTTGCTAAAACTTCTGCTGTTCCTAGACAATCCAACTGGGACATTAGTCCCACTCCAAGTCCAGACTCCTCTAGGGCTCAGACTCCGGCAGCTGCACCTGCGGCCGAACCTCAACAACCTGCTGAGGATCCCAATATTCTGGAAACCGTGATGGCCTCAGAAAATGACATTCCCATGGAGCCTGATCAGAGCGGACTTGCTGCTGATATGGATGTGGGTGGTGGTGGTGCGGGTGGTGGTGGCGGTGTTGGAAATTCTACTGGAAATTGGACTAATGAAACTGTATTCGCGGGTAAAACTATAATAACAAATGCCTCTAGACATTGTGTCTGTCTCAACCGTGATAATGACCATTATAAAATGATTTACAATGGAACCAATACACAAGAAAATAACCAGACTGACAAATCTGGGTGGATAGGGTTCACTACACCCTGGAATTATCTAGACTTTAACCAGAATGCAGTACACTTCAGTCCTCGGGACTGGCAACACTTGGTCAATAACTACTCACGTTGGAGGCCGCGGGCTGTACACATTAAAATTTTCAACATTCAAGTGGTGCAACGCACCACTACTGCTGACTCTACACTCACCTTTGCCAACGACCTAACTGGCACCATCCAAGTGTTTGCTGATCAGGCCAACAGATATCCTAAACTCATGTACCCCAATCAAACTACTATGATGGGACCTTTCCCTAACATGATTTACTACCTGCCACAATACGGCTACCTCACAAACGGCGGGCCTGGCACTGCTGGGCGGCCCTATGACTTGCTGGATGAATACTCGCAATTTTACTGTCTTGACGAACACCCTTCAGTCATGCTAAGAACTGGCAATACCTGGGAAGGTCACTTTCAGTTTGGGGCTGACACTGGGTGGATCTCCAACAGACGGACCACCCGTCCTATCACTAGGAGAATGAACCCCAACTATGACACATGGCAGGTCAATGCTGTCGGTGGAGACGCCAAGTCTGGCACCTATGACACATGGAGGTCCCCATGGCTCACTGGGCCGTGGATGGAACTCTACGAGGCTGCTGACAATACCACCATTTCTAACAACTCACATGTCTATGTGGGTCAAACTGCCATTCCTCTGAACCCTGGGCCTCCCATTGGCCGACCTACCAATAAAGCTCACTGTCATTTGTTTTGGGTGAGCAAAGTTCATGGCATGAATGAAGGTGATGTCAATGAACATTATATTAATCCCAGCACAGCCGTCACTGTGAGAGTGGATAATTCCGGCAGCTATGCCATTAACCCCAGTTCTGCCTATAAACTGCGAGCCAGCAGTGATACTGGGGGAGACAACGGGGGTGCCACCCATCTCATTAAATCACAGGCTATCATGCCCGGCATGATCTGGGATGATAGAATTGCTACCTACTGGGATAATATCTGGCAGGAATATCCTGAGTCAGACAATAAATTCATGCCACATGGCAGACTTGGCGGCGTCTATACCGACGCCGCCCCGGGGCATGTGTACGTGAAACTCACTCCCAAACCCACCGGAGAAGCCAATGCCATTATTGATCAATATGCCACTTTCACTGTTACTGTCTCCATTGAATGGGAAGCTGAACCGTACACTTGCAGTCAATGGAACATGAGAAAGGTCATTTCCTATGATTCTACTGCTGCTAAATCTTATGATGGGTTCTGTGATTCTGATGGAAATTATATTGTTGGAGCTAATGATAGAAATGTGGAAACTCTGTACACTGCCAAAGTCAACCACCGTGTTAACTGAAAGGTCAAAGTCCACAATAAAAATTTATTTCTGAACCACCATGTGAGTTTCACGTACACATGCCCCGGGGCGGCGTCGGTATAGACGCCGCCAAGTCTGCCATGTGGCATGAATTTATTGTCTGACTCAGGATATTCCTGCCAGATATTATCCCAGTAGGTAGCAATTCTATCATCCCAGATCATGCCGGGCATGATAGCCTGTGATTTAATGAGATGGGTGGCACCCCCGTTGTCTCCCCCAGTATCACTGCTGGCTCGCAGTTTATAGGCCGAACTGGGGTTAAT
| 50,624
|
MT138211.1
|
Aveparvovirus sp.
|
Xiao,Y., Shan,T., Yang,S., Zhang,W.
|
Jiangsu University, School of Medicine
|
China
|
2020-05-06
|
bfb011ave01
|
Aveparvovirus sp.
|
Aveparvovirus
|
Parvoviridae
|
ssDNA(+/-)
| 5,339
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Aves
|
feces
|
2018
|
SAMN13782218
|
PRJNA600556
|
MAG: Aveparvovirus sp. isolate bfb011ave01, complete genome
|
CGCCTTTGTATACACAACATTGGGATACCTTGCTTTCCTACTTCCTTCCATCCTCCATCCTCCATCTTACACATGACTCCATAGTCACATGTCGGATACTAGTTCTGCGCGCGTAGCGCGCGCGCCTTCGGCGCGAACGTATCCGACATGTGACTATGGAGTCATGTGTAAGATGGAGGATGGAGGATGGAAGGAAGTAGGAAAGCAAGGTATCCCAATGTTGTGTATACAAAGGCGTATGCCTCAATCAACCAAAGTCCATTGTAAATGATTAACCACGCTAGGCGTATATAAGAGTGTGCGCCGAGCTGCCTAGTCACTCCTAGCTAGGATCAGGACCCCAGAGGTGCCTCTCCGCGCTAAGGTAAGATGGCCATTCCTAATTCTGGTGGGTTTACTGCTATTGTTATGCTGCCTGAGCACGTGCAGATTGGCTCTAACCAAGTTAACCTGCGCGCTGCTGTTTGTGCTAGCTATACTAACCCTAAAGGGGAAGAGGTCCAGACTAAATTTCCTAGAGACCATGAGTTTGAGTCTAAGATTCAAAATTTTCTGGGGGTCCCTGATTGGAACTCAATTGACCTCAATTGGATTAAGCTTCACTATCAGCTCACTAAACATGCCATGGATATCGAGCAGAGCATTAATCCGGCTGCTAGATTCTTTTGGCAGATTGAAATCTCGAATGGAGGCAAAGTCCATGTCCATATCCTATTTATCAGTGGATGGACTTCCAAAAACATAACCTGGACTTTGAAACGGATCAGAAGGGAAATTTGTAAACAATTTTCTGATATCATGAGTACATTTATGCCTGAATGGACTTCGCCCCAGTGGTGGGGTCTTTTGACTAATTGCAGCATGGCAGCCATTTCACTGAACAGAGCATACTCACCAAGATTGGGAAAGACCATTCCTCAGCCGGTGAACCCTTACTCATTTTTGACAAACTACCTGTATAATCCCAAAAAGTCAGTGATGGTTAGAGAATGCTCAATGAACCTCAATGGGGTCCTGAAAACTGATAGACTAGAGGACATTCCAGAACTAGTGGAAGAAGGCGAGCCTGACATTAGACCTATGACCTTGGAACCAGGAGATCAATTACCTCTAACTTATGTAAGTACCAGCACTGACTGGGAAACAGGTGGTGGTTATAGCACCATTAAAGTTGGTGTTATGGAAAAATTATGCATGGAGGCTTTAAGGCTTTGCAAAGAAAATATGATTTTTACCCTAAAAGACTTTAAATTACAATTTCCAGAAAAATTTCTTCAATTTTCCAGCCGTACTCGCGGGACTGAAAAATTATCAGAAACTATTGACCTCTACGTAGAATCCATTTGTGCAGAAGAATCTGCCTGGAATATTGCCAAGGCTAGGATGAAACATGTCCCGGAAGGGGACATGGACCATAATTTAGTGGTCAGACTAGTGACCTATCAAGGTTATTCACCCATGTATATGGGCCAACTTTTAGTCAGCTGGCTGAAAGATGAATTAGGCAAAAAGAATTCTGTCTACTTTTTCGGTCCTGCCAATACTGGCAAAACTATGATGGCAGAATCCATCTGCAAGATGGTGGGCATTTATGGAAATGTTAACCACAACAATGTTAACTTTCCATTCAATGACTGCCACAACAAAGCTATCATTTGGTGGGAAGAATGCTCCATGCAGGAACAATATGTAGAGGCTGCTAAATGCATACTGGGCGGCTCCGCCGTCAGAGTAGATAAGAAAGGCAAAGACTCTGTTTTGGTTCAAAGGACACCTGTCGTCATCACCAGCAATAATGACATTACTGTTGTTGCCGGAAGAAATGCCATCAGCTCCAACCATGCGGCTGCATTGCGCAGTCGCTGTATGAAGTTTGCCTTCAATAACTGGTTAACCAGTAATTGGGGGCTCATTACACCAGAGGAAATGTTCCAGTTCCTGCATTGGGCAGACTCCACATTCTCCTGCACTTTGACCTCTGTCATTGCTGCTAATCCTGGCTGTGAAGGTAATATTCCCTACAACCAACCGAGGGGCAATTGGTGCTCCTCTTGTTCTCCTCAGTTCACTACCAAGGAGACTGTCACCTTGTGCCCTTCCTGCTCTGGGTGGACCCGCATTCCTTCTGAGGTCATCGGCCAAGAATATGATGGCAATGAAGTGGCTTTGATGGAAGGTCTCACAGAAGGTATGTAAGAATTGGGCGGGGTCAGAGGCTATATATACCCCTGACTGCTTTCTCTTTCAGACCAGCACGAGCTCCTGGCCGACGGAGACGCTAACCGTGCTGTCTGGATCGGCCGACGAGCCAGATCTCACGGTAAACGTCGAGCTGAAAGCCCAGGGGAGGACGAGAGCCCTAGAGCTAAGAGGGAGTGTGCAGCAGGACCCTCCACCGTGCTGCCAACTGCTCTAGGTAAGCCCATCAGAATGTCTGACAACGCTCCTAGTCTTCATGAACTTTACTGTGAAGAAGAAATGTTTTCTTCCTCAGATGAAGATGATACTCCACTTCCTGTTCCTCCACCTAAACCCAGGGACTATGTCATGTGGAGCAATGATGAAAGGAGGTGGATTGAATCATTTGGCGGGAAATGGAGGGTGGCTTTCCACGGGTTCCTGGATTGGTGGCATGACAATATTGAAAATGTCAACAAATTGTATTCCAAACTCCACCCTGACATGAAACCTTCCTTCATAGAACATTGGTCAGAGATTAGGGAATTTTGGGATTTATCTTGCGAGACTGATTTACAAATTAGAGATGCCATTTCTAGAAAAGATTTTACATTTGATATCGGGCTTGACATGAAACTCAATTCGGCCATTGACAAAACAGCTGGGGATTATCCATTGACCATTTGGTCCAAAATTGACCACTTTGCTCAGTGGTGTAATGCACGGGCTTTCTTCATAACAGGACAACAGCAGCCATGAAAAATTATGAGCCCAAAATTCCTACCAACACCGATGAAGCTTATTGGTACAACAGATGGTGGATTGACCATGTTAATTCAGGAAAAGTCATCGGCGGGAAATATGGAGGGGTTAAATCAAAGGGAAAACAATTAACTGCTGCTCAAAAAGAATCACGTAAACGGTTTTTTATTGTGCAGGCTCAGCAGAAAAAGAAGGCAAATGAGCAATTAAAATTTGGCATTCCTACTTCGTCTCAGCACGCAAGATTTTTCCGTAATCATACGGGTAGCGGTGGTGGGAAAGCTAAGGCAAAGACCAAACACATTGACCCTGGATACCAGGTCCCTTCTAATCAAGACCCTGACGAGGGTCCTGCTCCCAAGGTTGCTAAAACTTCTGCTGTTCCTAGACAATCCAACTGGGACATTAGTCCCACTCCAAGTCAAGACTCCTCTAGGGCTCAGACTCCGGCAGCTGCACCTGCGGCCGAACCTCAACAACCTGCTGAGGATCCCAATATTCTGGAAACCGTGATGGCCTCAGAAAATGACATTCCCATGGAGCCTGATCAGAGCGGACTTGCTGCTGATATGGATGTGGGTGGTGGTGGTGCGGGTGGTGGTGGCGGTGTTGGAAATTCTACTGGAAATTGGACTAATGAAACTGTATTCGCGGGTAAAACTATAATAACAAATGCCTCTAGACATTGTGTCTGTCTCAACCGTGATAATGACCATTATAAAATGATTTACAATGGAACCAATACACAAGAAAATAACCAGACTGACAAATCTGGGTGGATAGGGTTCACTACACCCTGGAATTACCTGGACTTTAACCAGAATGCAGTCCATTTCAGTCCTCGTGACTGGCAACACTTGGTCAATAACTACTCACGTTGGAGGCCGCGGGCTGTACATATTAAAATTTTCAACATTCAAGTGGTGCAACGCACCACTACTGCTGACTCTACACTCACCTTTGCCAATGACCTGACCGGCACCATCCAAGTATTTGCTGATCAGGCCAACAGATACCCTAAACTCATGTATCCCAATCAAACTACCATGATGGGGCCTTTCCCTAACATGATTTACTACCTGCCACAATACGGCTACCTCACAAACGGCGGGCCTGGCAATGCTGGACGGCCCTATGACTTGCTGGATGAATATTCACAATTTTACTGCCTTGATGAACACCCTTCAGTCATGCTGAGAACTGGCAATACCTGGGAAGGTCACTTTCAGTTTGGGGCTGACACTGGGTGGATCTCCAACAGACGGACCACCCGTCCTATCACTAGAAGAATGAACCCCAATTATGACACATGGCAGGTCAATGCTGTCGGTGGAGACGCCAAGTCTGGCACCTATGACACGTGGAGGTCCCCATGGCTCACTGGGCCGTGGATGGAACTCTATGAGGCTGCTGACAATACCACCATCTCTAACAACTCACATGTCTATGTGGGTCAAACTGCCATTCCTCTGAACCCTGGACCTCCCATTGGCCGGCCCACCAATAAAGCTCACTGTCATCTGTTTTGGGTGAGCAAAGTTCATGGCATGAATGAAGGTGATGTCAATGAACACTATATTAATCCCAGCACAGCCGTCACTGTGAGAGTGGACAACTCTGGCAGCTATGCCATTAACCCCAGTTCTGCCTATAAACTGCGTGCCAGCAGTGATACTGGAGGAGACAACGGGGGTGCCACCCATCTCGTTAAATCTCAGGCTATCATGCCCGGCATGATCTGGGATGATAGAATTGCTACCTACTGGGATAATATTTGGCAGGAATATCCTGAGTCAGACAATAAATTCATGCCACATGGCAGACTTGGCGGCGTCTATACCGACGCCGCCCCGGGGCACGTGTATGTGAAACTCACCCCCAAACCCACTGGAGAGGCCAATGCTATCATTGATCAATATGCCACTTTCACCGTTACTGTCTCCATTGAATGGGAAGCTGAACCGTACACTTGCAGTCAGTGGAACATGAGAAAGGTCATCTCCTATGATTCTACTGCTGCCAAATCTTATGATGGGTTTTGTGATTCTGATGGAAATTATATTGTGGGGGCCAATGATAGAAATGTGGAAACTCTGTACACTGCCAAAGTCAATCATCGTGTTAACTAAAGGTCAAAGTCCAAAATAAATTTTTCTCTGAAACTGTCTTGTGAGTACCTTGCTTTTCTTCTTCTTCCCAGCGTCGGTATAGACGCCGCCAAGTCTGCCATGTGGCATGAATTTATTGTCTGACTCAGGATATTCCTGCCAAATATTATCCCAGTAGGTAGCAATTCTATCATCCCAGATCATGCCGGGCATGATAGCCTGAGATTTAACGAGATGGGTGGCACCCCCGTTGTCTCCTCCAGTATCACTGCTGGCACGCAGTTTATAGGC
| 50,625
|
MT138212.1
|
Aveparvovirus sp.
|
Xiao,Y., Shan,T., Yang,S., Zhang,W.
|
Jiangsu University, School of Medicine
|
China
|
2020-05-06
|
bfb012ave01
|
Aveparvovirus sp.
|
Aveparvovirus
|
Parvoviridae
|
ssDNA(+/-)
| 6,092
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Aves
|
feces
|
2018
|
SAMN13782218
|
PRJNA600556
|
MAG: Aveparvovirus sp. isolate bfb012ave01, complete genome
|
ATTACTGGTTAACCAGTTATTGAAGGCAAATTTCATGCAACGGCTGCGCAATGCAGCCGCGTGGTTGGAGCTGATGGCATTTCTTCCGGCAACAACAGTAATGTCATTATTGCTGGTGATGACGACAGGTGTCCTTTGAACCAAAACAGAGTCTTTGCCCTTCTTATCTACTCTGACGGCGGAGCCGCCTAGTATGCATTTAGCAGCCTCTACATATTGTTCCTGCATGGAGCATTCTTCCCACCAAATGATAGCTTTGTTGTGGCAGTCATTGAATGGAAAGTTAACATTGTTGTGGTTAACATTTCCATAAATGCCCACCATCTTGCAGATGGATTCTGCCATCATAGTTTTGCCAGTATTGGCAGGACCGAAAAAGTAGACAGAATTCTTTTTGCCTAATTCATCCTTCAGCCAGCTGACTAAAAGCTGACCCATATACATGGGTGAATAACCTTGATAGGTCACTAGTCTGACCACTAAATTGTGGTCCATGTCCCCTTCCGGGACATGTTTCATCCTAGCCTTGGCAATATTCCAGGCAGAATCTTCAGCACAAATGGATTCTACGTAGAGGTCAATAGTTTCTGATAATTTTTCAGTCCCGCGAGTACGGCTGGAAAATTGAAGAAATTTTTCTGGAAATTGTAATTTAAAGTCTTTTAGGGTAAAAATCATATTTTCTTTGCAAAGCCTCAAAGTCTCCATGCTAGGTGTATATAAGAGTGCTACGCACGAGTTGCTTATTGACTCCTGGACTTTGGGACCAGGACCCCAGAGGTGCCTCTCCGCGCTAAGGTAAGATGGCCATTCCTAATTCTGGTGGGTTTTCTGCTATTGTTATGCTGCCTGAGCACGTGCAGATTGGCTCTAACCAAGTTAACCTGCGCGCTGCTGTTTGTGCTAGCTATACTAACCCTAAAGGCGAAGAAATCCAAACTAAATTTCCTAGAGACCATGAGTTTGAGTCTAAAATTCAAAATTTTCTGGGGGTCCCTGATTGGAACTCAATTGACCTCAATTGGATTAAGCTTCACTATCAGCTCACTAAACATGCCATGGATATCGAGCAGAGCATTAATCCAGCTGCTAGATTCTTTTGGCAGATTGAAATCTCGAATGGAGGCAAAGTCCATGTCCATATCTTATTTATCAGTGGATGGACTTCCAAAAACATAACCTGGACTTTGAAACGGATCAGAAGAGAAATTTGTAAACAATTTTCTGATATCATGGGTACATTTATGCCTGAATGGACTTCGCCCCAATGGTGGGGTCTTTTGACTAATTGCAGCATGGCAGCCATTTCACTAAACAGAGCATACTCACCAAGATTGGGAAAGACCATTCCTCAGCCGGTGAACCCTTACTCGTTTTTGACAAACTACCTGTATAATCCCAAAAAGTCAGTGATGGTTAGAGAATGCTCAATGAACCTCAATGGGGTCCTGAAAACTGATAGACTAGAGGACATTCCAGAACTAGTGGAAGAAGGCGAGCCTGACATTAGACCTATGACCTTGGAACCAGGAGATCAATTGCCTCTGACTTATGTAAGTACCAGCACTGACTGGGAAACAGGTGGTGGTTATAGCACCATTAAAGTTGGTGTTATGGAAAAATTATGCATGGAGGCTTTAAGACTTTGCAAAGAAAATATGATTTTTACCCTAAAAGACTTTAAATTACAATTTCCAGAAAAATTTCTTCAATTTTCCAGCCGTACTCGCGGGACTGAAAAATTATCAGAAACTATTGACCTCTACGTAGAATCCATTTGTGCTGAAGAATCTGCCTGGAACATTGCCAAGGCTAGGATGAAACATGTCCCAGAAGGGGACATGGACCATAATTTGGTGGTCAGACTAGTGACCTATCAAGGTTATTCACCCATGTATATGGGTCAGCTTTTAGTCAGCTGGCTGAAAGATGAATTAGGCAAAAAGAATTCTGTCTACTTTTTCGGTCCTGCCAATACTGGCAAAACTATGATGGCAGAATCCATCTGCAAGATGGTGGGCATTTATGGAAATGTTAACCACAACAACGTTAACTTTCCATTCAATGACTGCCACAACAAAGCTATCATTTGGTGGGAAGAATGCTCTATGCAGGAACAATATGTAGAAGCTGCTAAATGCATACTGGGCGGCTCCGCCGTCAGAGTAGATAAGAAGGGCAAAGACTCTGTTTTAGTTCAAAGGACACCTGTCGTCATCACCAGCAATAATGACATTACTGTTGTTGCCGGAAGAAACGCCATCAGCTCCAACCATGCAGCTGCATTACGCAGCCGTTGCATGAAATTTGCCTTCAATAACTGGTTAACCAGTAATTGGGGTCTCATTACACCAGAAGAAATGTTCCAGTTCCTGCATTGGGCAGACTCCACGTTCTCCTGCACTTTGACCTCTGTCATTGCTGCTAACCCTGGATGTGAAGGTAATATTCCCTACAACCAACCGAGGGGCAATTGGTGCTCCTCTTGTTCTCCTCAGTTCACTACCAAGGAAACTGTCACCTTGTGCCCTTCCTGCTCTGGGTGGACCCGCATTCCTTCTGAGGTCATCGGCCAAGAATATGATGGCAATGAAGTGGCTTTAATGGAAGGTCTCACTGAAGGTATGTATGAATTGGGCGGGGTCAGAGGCTATATATACCCCTGACTGCTTTACCTTTCAGACCAGCACGAGCTCCTGGCCGACGGAGACGCTAACCGCGCTGTCTGGATCGGCCGACGAGCCAGATCTCACGGTAAACGTCGAGCTGAAAGCCCAGGGGAGGACGAGAGCCCTAGAGCTAAGAGGGAGTGTGCAGCAGGACCCTCCACCGTGCTGCCAACTGCTCTAGGTAAGCCCATCAGAATGTCTGACAACGCTCCTAGCCTTCATGAACTTTACTGTGAAGAAGAAATGTTTTCTTCCTCAGATGAAGATGATACTCCACTTCCTGTTCCTCCACCTAAACCCAGGGACTATGTCATGTGGAGCAATGATGAAAGGAGGTGGATTGAATCATTTGGCGGGAAATGGAGGGTGGCTTTCCACGGGTTCCTGGATTGGTGGCATGACAATATTGAAAATGTCAACAAATTGTATTCCAAACTCCACCCTGACATGAAACCTTCCTTCATAGAACATTGGACAGAAATTAGGGAGTTTTGGGATTTATCTTGCGAGACTGATTTACAAATTAGAGATGCCATTTCTAGAAAAGATTTTACATTTGATATCGGGCTTGACATGAAACTCAATTCGGCCATTGACAAAACAGCTGGGGATTATCCATTGACCATTTGGTCCAAAATTGACCACTTTGCTCAGTGGTGTAATGCACGGGCTTTCTTCATAACAGGACAACAGCAGCCATGAAAAATTATGAGCCCAAAATTCCTACCAACACCGATGAAGCTTATTGGTACAACAGATGGTGGATTGACCATGTTAATTCAGGAAAAGTCATCGGCGGGAAATATGGAGGGGTTAAATCAAAGGGAAAACAATTAACTGCTGCTCAAAAAGAATCACGTAAACGGTTTTTTATTGTACAGGCTCAGCAGAAAAAGAAGGCAAATGAGCAATTAAAATTTGGCATTCCTACTTCGTCTCAGCACGCAAGATTTTTCCGTAATCATACGGGTAGCGGTGGTGGGAAAGCTAGAGCAAAGACCAAACACATTGACCCTGGATACCAGGTCCCTTCTAATCAAGACCCTGACGAGGGTCCTGCTCCCAAGGTTGCTAAAACTTCTGCTGTTCCTAGACAATCCAACTGGGACATTAGTCCCACTCCAAGTCCAGACTCCTCTAGGGCTCAGACTCCGTCAGCTGCACCTGCGGCCGAACCTCAACAACCTGCTGAGGATCCCAATATTCTGGAAACCGTGATGGCCTCAGAAAATGACATTCCCATGGAGCCTGATCAGAGCGGACTTGCTGCTGATATGGATGTGGGTGGTGGTGGTGCGGGTGGTGGTGGCGGTGTTGGAAATTCTACTGGAAATTGGACTAATGAAACTGTATTCGCGGGTAAAACTATAATAACAAATGCCTCTAGACATTGTGTCTGTCTCAACCGTGATAATGACCATTATAAAATGATTTACAATGGAACCAATACACAAGAAAATAACCAGACTGACAAATCTGGGTGGATAGGGTTCACCACACCCTGGAATTACCTGGACTTTAACCAGAATGCAGTACACTTCAGTCCTCGTGACTGGCAACACTTGGTCAATAACTACTCACGTTGGAGGCCGCGGGCTGTACACATTAAAATTTTCAACATTCAAGTGGTGCAACGCACCACTACTGCTGACTCTACACTCACCTTTGCCAATGACCTAACTGGCACCATCCAAGTGTTTGCTGATCAAGCCAACAGATATCCTAAACTCATGTACCCCAATCAAACTACTATGATGGGGCCTTTCCCTAACATGATTTACTACCTGCCACAATACGGCTACCTCACAAACGGCGGGCCCGGCAATGCTGGGCGACCCTATGACTTGCTGGATGAATACTCACAGTTTTACTGTCTTGATGAACACCCTTCAGTCATGCTGAGAACCGGCAATACCTGGGAAGGTCACTTTCAGTTTGGGGCTGACACCGGGTGGATCTCCAACAGACGGACCACCCGTCCTATCACTAGGAGAATGAACCCCAACTATGACACGTGGCAGGTCAATGCTGTCGGTGGAGACGCCAAGTCTGGCACCTATGACACATGGAGATCCCCATGGCTCACTGGGCCGTGGATGGAACTCTATGAGGCTGCTGACAATACCACCATTTCTAACAACTCACATGTCTATGTAGGTCAGACTGCCATTCCTCTAAACCCTGGACCTCCCATTGGCCGGCCTACCAATAAAGCTCACTGTCATTTGTTTTGGGTGAGCAAAGTTCATGGCATGAATGAAGGTGATGTCAATGAACATTATATTAACCCCAGCACGGCCGTCACTGTGAGAGTGGACAACTCTGGCAGCTATGCCATTAACCCCAGTTCTGCCTATAAACTACGTGCCAGCAGTGATACTGGGGGAGACAACGGGGGTGCCACCCATCTCATTAAATCACAGGCTATCATGCCCGGCATGATCTGGGATGATAGAATTGCTACCTACTGGGATAATATCTGGCAGGAATATCCTGAGTCAGACAATAAATTCATGCCACATGGCAGACTTGGCGGCGTCTATACCGACGCCGCCCCGGGGCACGTGTACGTGAAACTCACTCCCAAACCCACTGGAGAAGCCAATGCCATCATTGATCAATATGCCACTTTTACCGTTACTGTATCCATTGAATGGGAAGCTGAACCATACACTTGCAGCCAATGGAATATGAGAAAGGTCATTTCCTATGATTCTACTGCTGCTAAATCTTATGATGGATTTTGTGATTCTGATGGAAATTATATTGTGGGGGCTAATGATAGAAATGTGGAAACTCTGTATACTGCTAAAGTCAACCACCGTGTTAACTAAAGGTCAAAGTCCACAATAAAATAATTCCCTGAAACATGACTTGTGAGTACCTTGCTTTTCTTCTTCTTCCTTCTTCCATCCGCCATTGTAATTCTTCAATAAAGACTATGTAATTCTCTCGGTTCGTTCGCGGCCGAAGGCCGCGCGCGCTTCGCGCGCAGAACTAGAACCGAGAGAATTACATAGTCTTTATTGAAGAATTACAATGGCGGATGGAAGAAGGAAGAAGAAGAAAAGCAAGGTACTCACAATTCAGTTTCAGAACAGAAATTTTATTTTGTACTTTGACCTTTAGTTAACACGGTGGTTGACTTTAGCAGTGTACAGAGTTTCCACATTTCTGTCATTAGCCCCCACGATATAATTTCCATCAGAATCACAGAATCCATCATAAGATTTAGCAGCAGTAGAATCATAGGAAATGACCTTTCTCATATTCCATTGGCTGCAAGTGTACGGTTCAGCTTCCCATTCAATGGAGACAGTAACAGTGAAAGTGGCATATTGATCAATGATGGCATTGGCTTCTCCAGTGGGCTTGGGAGTGAGTTTCACGTACACGTGCCCCGGGGCGGCGTCGGTATAGACG
| 50,626
|
MT138213.1
|
Aveparvovirus sp.
|
Xiao,Y., Shan,T., Yang,S., Zhang,W.
|
Jiangsu University, School of Medicine
|
China
|
2020-05-06
|
bfb013ave01
|
Aveparvovirus sp.
|
Aveparvovirus
|
Parvoviridae
|
ssDNA(+/-)
| 5,619
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Aves
|
feces
|
2018
|
SAMN13782218
|
PRJNA600556
|
MAG: Aveparvovirus sp. isolate bfb013ave01, complete genome
|
TATCCTATTGTTATGTATACATAGGCGTAGGCCTCAATCAACCAAAGTCCATTGTAAATGATTAACTAGTCTATGTGTATATAAGAGTGTACGCCGAGCTGCCTAGTCACTCCTAGCTAGGATCAGGACCCCAGAGGTGCCTCTCCGCGCTAAGGTAAGATGGCCATTCCTAATTCTGGTGGGTTTTCTGCTATTGTTATGCTGCCTGAGCACGTGCAGATTGGCTCTAACCAAGTTAACCTGCGCGCTGCTATTTGTGCTAGCTATACTAACCCTAAAGGAGAAGAGGTCCAGACTAAATTTCCTAGAGACCATGAGTTTGAGTCTAAAATTCAAAATTTTCTGGGGGTCCCTGATTGGAACTCAATTGACCTCAATTGGATTAAGCTTCACTATCAGCTCACTAAACATGCCATGGATATCGAGCAGAGCATTAATCCAGCTGCTAGATTCTTTTGGCAGATTGAAATCTCGAATGGAGGCAAAGTCCATGTCCATATCTTATTTATCAGTGGATGGACTTCCAAAAACATAACCTGGACTTTGAAACGGATCAGAAGGGAAATTTGTAAACAATTTTCTGATATCATGGGTACATTTATGCCTGAATGGACTTCGCCTCAATGGTGGGGTCTTTTGACTAATTGCAGCATGGCAGCCATTTCACTGAACAGAGCATACTCACCAAGATTGGGAAAGACCATTCCTCAGCCGGTGAACCCTTACTCATTTTTGACAAACTACCTGTATAATCCCAAAAAGTCAGTGATGGTTAGAGAATGCTCAATGAACCTCAATGGGGTCCTGAAAACTGATAGACTAGAGAACATTCCAGAACTAGTGGAAGAAGGCGAGCCTGACATTAGACCTATGACCTTGGAACCAGGAGATCAATTGCCTCTGACTTATGTAAGTACCAGCACTGACTGGGAAACAGGTGGTGGTTATAGCACCATTAAAGTTGGTGTTATGGAAAAATTATGCATGGAGGCTTTGAGGCTTTGCAAAGAAAATATGATTTTTACCCTAAAAGACTTTAAATTACAATTTCCAGAAAAATTTCTTCAATTTTCCAGCCGTACTCGCGGGACTGAAAAATTATCAGAAACTATTGACCTCTACGTAGAATCCATTTGTGCTGAAGAATCTGCCTGGAACATTGCTAAGGCTAGGATGAAACATGTCCCAGAAGGGGACATGGACCACAATTTAGTGGTCAGACTAGTGACATATCAAGGTTATTCACCCATGTATATGGGCCAGCTTTTAGTCAGCTGGCTGAAGGATGAATTAGGCAAAAAAAATTCTGTCTACTTTTTCGGTCCTGCCAATACTGGCAAAACTATGATGGCAGAGTCCATCTGCAAGATGGTGGGCATTTATGGAAATGTTAACCACAACAATGTTAACTTTCCATTCAATGACTGCCACAACAAAGCTATCATTTGGTGGGAAGAATGCTCCATGCAGGAACAATATGTAGAGGCTGCTAAATGCATACTGGGCGGCTCCGCCGTCAGAGTAGATAAGAAGGGCAAAGACTCTGTTTTGGTTCAAAGGACACCTGTCGTCATCACCAGCAATAATGACATTACTGTTGTTGCCGGAAGAAATGCCATCAGCTCCAATCACGCGGCTGCATTGCGCAGTCGCTGTATGAAGTTTGCCTTCAATAACTGGTTAACCAGTAATTGGGGGCTCATTACACCAGAAGAAATGTTCCAGTTCCTGCATTGGGCAGACACCACGTTCTCCTGCACTTTGACCTCTGTCATTGCTGCTAATCCTGGCTGTGAAGGTAATATTCCCTACAACCAACCGAGGGGCAATTGGTGCTCCTCTTGTTCTCCTCAGTTCACTACCAAGGAGACTGTCACCTTGTGTCCTTCCTGCTCTGGGTGGACCCGCATTCCTTCTGAGGTCATCGGACAAGAATATGATGGCAATGAAGTGGCTTTAATGGAAGGTCTCACTGAAGGTATGTATGAATTGGGCGGGGTCAGAGGCTATATATACCCCTGACTGCTTTATCTTTCAGACCAGCACGAGCTCCTGGCCGACGGAGACGCTAACCGTGCTGTCTGGATCGGCCGACGAGCCAGATCTCACGGTAAACGTCGAGCTGAAAGCCCAGGGGAGGACGAGAGCCCTAGAGCTAAGAGGGAGTGTGCAGCAGGACCCTCCGCCGTGCTGCCAACTGCTCTAGGTAAGCCCATCAGAATGTCTGACAACGCTCCTAGTCTTCATGAACTTTACTGTGAAGAAGAAATGTTTTCTTCCTCAGATGAAGATGATACTCCACTTCCTGTTCCTCCACCTAAACCCAGGGACTATGTCATGTGGAGCAATGATGAAAGGAGGTGGATTGAATCGTTTGGCGGGAAATGGAGGGTGGCTTTCCACGGGTTCCTGGATTGGTGGCATGACAATATTGAAAATGTCAACAAATTATATTCCAAACTCCACCCTGACATGAAACCTTCCTTCATAGAACATTGGTCAGAGATTAGGGAGTTTTGGGATCTATCTTGCGAGACTGATTTACAAATTAGAGATGCCATTTCTAGAAAAGATTTTACATTTGATATCGGGCTTGACATGAAACTCAATTCGGCCATTGACAAAACAGCTGGGGATTATCCGTTGACCATATGGTCCAAAATTGACCACTTTGCTCAGTGGTGTAATGCACGGGCTTTCTTCATAACAGGACGGACAACAGCAGCCATGAAAAATTATGAGCCCAAAATCCCTACCAACACCGATGAAGCTTATTGGTACAACAGATGGTGGATTGACCATGTTAATTCAGGAAAAGTCATCGGCGGGAAATATGGAGGGGTTAAATCAAAGGGAAAACAATTAACTGCTGCTCAAAAAGAATCACGTAAACGGTTTTTTATTGTGCAGGCTCAGCAGAAAAAGAAGGCAAATGAGCAATTAAAATTTGGCATTCCTACTTCGTCTCAGCACGCAAGATTTTTCCGTAATCATACGGGTAGCGGTGGTGGGAAAGCTAAGGCAAAGACCAAACACATTGACCCTGGATACCAGGTCCCTTCTAATCAAGACCCTGACGAGGGTCCTGCTCCCAAGGTTGCTAAAACTTCTGCTGTTCCTAGACAATCCAACTGGGACTAATGTCCCAGTTGGATTGTCTAGGAACAGCAGAAGTTTTAGCAACCTTGGGAGCAGGACCCTCGTCAGGGTCTTGATTAGAAGGGACCTGGTATCCAGGGTCAATGTGTTTGGTCTTTGCCTTAGCTTTCCCACCACCGCTACCCGTATGATTACGGAAAAATCTTGCGTGCTGAGACGAAGTAGGAATGCCAAATTTTAATTGCTCATTTGCCTTCTTTTTCTGCTGAGCCTGCACAATAAAAAACCGTTTACGTGATTCTTTTTGAGCAGCAGTTAATTGTTTTCCCTTTGATTTAACCCCTCCATATTTCCCGCCGATGACTTTTCCTGAATTAACATGGTCAATCCACCATCTGTTGTACCAATAAGCTTCATCGGTGGGAAATATGGAGGGGTTAAATCAAAGGGAAAACAATTAACTGCTGCTCAAAAAGAATCACGTAAACGGTTTTTTATTGTGCAGGCTCAGCAGAAAAAGAAGGCAAATGAGCAATTAAAATTTGGCATTCCTACTTCGTCTCAGCACGCAAGATTTTTCCGTAATCATACGGGTAGCGGTGGTGGGAAAGCTAAGGCAAAGACCAAACACATTGACCCTGGAACTGTATTCGCGGGTAAAACTATAATAACAAATGCCTCTAGACATTGTGTCTGTCTCAACCGTGATAATGACCATTATAAAATGATTTACAATGGAACCAATACACAAGAAAATAACCAGACTGACAAATCTGGGTGGATAGGGTTCACTACACCCTGGAATTACCTGGACTTTAACCAGAATGCAGTCCATTTCAGCCCTCGTGACTGGCAACACTTGGTCAATAACTACTCCCGTTGGAGGCCGCGGGCTGTACACATTAAAATTTTCAACATTCAAGTGGTGCAGCGCACCACTACTACAGACTCTACACTCACCTTTGCCAATGACCTGACTGGCACCATCCAAGTATTTGCCGATCAGGCCAACAGATACCCTAAACTCATGTACCCCAATCAAACTACTATGATGGGGCCTTTCCCTAACATGATTTACTACCTGCCACAATACGGCTACCTCACAAACGGCGGGCCTGGCAATACTGGACGGCCCTATGACTTGCTGGATGAATACTCACAGTTTTACTGTCTTGACGAACACCCTTCAGTCATGCTAAGAACCGGCAATACCTGGGAAGGTCACTTTCAATTTGGGGCTGACACTGGGTGGATCTCCAACAGACGGACCACCCGTCCTATCACTAGGAGAATGAACCCCAACTATGACACATGGCAGGTCAATGCTGTCGGTGGAGACGCCAAGTCTGGCACCTATGACACATGGAGGTCCCCGTGGCTCACTGGGCCGTGGATGGAACTCTATGAGGCTGCTGACAATACCACCATCTCTAACAACTCACATGTCTATGTGGGTCAAACTGCCATTCCTCTGAACCCTGGACCTCCCATTGGCCGGCCTACCAATAAAGCTCATTGTCATTTGTTTTGGGTGAGCAAAGTTCATGGCATGAATGAAGGTGATGTCAATGAACATTATATTAACCCCAGCACAGCCGTCACTGTGAGAGTGGACAACTCTGGCAGCTATGCCATTAACCCCAGTTCTGCCTATAAACTACGTGCCAGCAGTGATACTGGGGGAGACAACGGGAGTGCCACTCATCTCATTAAGTCTCAGGCTATCATGCCCGGCATGATATGGGATGATAGAATTGCTACTTACTGGGATAATATTTGGCAAGAATATCCTGAGTCAGACAATAAATTCATGCCACATGGCAGACTTGGTGGCGTCTATACCGACGCCGCCCCGGGGCACGTGTACGTGAAACTCACCCCCAAACCCACTGGAGAAGCCAATGCCATTATTGATCAATATGCCACTTTCACTGTTACTGTATCCATTGAATGGGAAGCTGAACCGTACACTTGCAGTCAATGGAATATGAGAAAAGTCATCTCCTATGATTCTACTGCTGCCAAATCTTATGATGGGTTTTGTGATTCTGATGGAAATTATATTGTGGGGGCAAATGATAGAAATGTAGAAACTCTGTACACTGCCAAAGTCAACCACCGTGTTAACTGAAAGGTCAAAGTCCAAAATAAAAGTTGTATTTAGAACTATATTTGTGAGTACCTTGCTTTTCTTCTTCTTCCTTCTTCCATCCGCCATTGTAATTCTTCAATAAATACTATGTAATTCTCTCGGTTCGTTCGCGGCCGAAGGCCGCGCGCGCTTCGCGCGCAGAACTAGAACCGAGAGAATTACATAGTATTTATTGAAGAATTACAATGGCGGATGGAAGAAGGAAGAAGAAGAAAAGCAAGGTACTCACAAATATAGTTCTAAATACAACTTTTATTTTGGACTTTGACCTTTCAGTTAACACGGTGGTTGACTTTGGCAGTGTACAGAGTTTCTACATTTCTATCATTTGCCCCCACAATATAATTTCCATCAGAATCACAAAACCC
| 50,627
|
MT138214.1
|
Aveparvovirus sp.
|
Xiao,Y., Shan,T., Yang,S., Zhang,W.
|
Jiangsu University, School of Medicine
|
China
|
2020-05-06
|
bfb014ave01
|
Aveparvovirus sp.
|
Aveparvovirus
|
Parvoviridae
|
ssDNA(+/-)
| 5,728
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Aves
|
feces
|
2018
|
SAMN13782218
|
PRJNA600556
|
MAG: Aveparvovirus sp. isolate bfb014ave01, complete genome
|
TATCCGACATGTGACTATGGAGTCATGTGTAAGATGGAGGATGGAGGATGGAAGGAAGTAGGATTAGCAAGGTATCCTATTGTTATGTATACATAGGCGTAGGCCTCAATCAACCAAAGTCCATTGTAAATGATTAACTAGTCTATGTGTATATAAGAGTGTACGCCGAGCTGCCTAGTCACTCCTAGCTAGGATCAGGACCCCAGAGGTGCCTCTCCGCGCTAAGGTAAGATGGCCATTCCTAATTCTGGTGGGTTTTCTGCTATTGTTATGCTGCCTGAGCACGTGCAGATTGGCTCTAACCAAGTTAACCTGCGCGCTGCTATTTGTGCTAGCTATACTAACCCTAAAGGAGAAGAGGTCCAGACTAAATTTCCTAGAGACCATGAGTTTGAGTCTAAAATTCAAAATTTTCTGGGGGTCCCTGATTGGAACTCAATTGACCTCAATTGGATTAAGCTTCACTATCAGCTCACTAAACATGCCATGGATATCGAGCAGAGCATTAATCCAGCTGCTAGATTCTTTTGGCAGATTGAAATCTCGAATGGAGGCAAAGTCCATGTCCATATCTTATTTATCAGTGGATGGACTTCCAAAAACATAACCTGGACTTTGAAACGGATCAGAAGGGAAATTTGTAAACAATTTTCTGATATCATGGGTACATTTATGCCTGAATGGACTTCGCCTCAATGGTGGGGTCTTTTGACTAATTGCAGCATGGCAGCCATTTCACTGAACAGAGCATACTCACCAAGATTGGGAAAGACCATTCCTCAGCCGGTGAACCCTTACTCATTTTTGACAAACTACCTGTATAATCCCAAAAAGTCAGTGATGGTTAGAGAATGCTCAATGAACCTCAATGGGGTCCTGAAAACTGATAGACTAGAGAACATTCCAGAACTAGTGGAAGAAGGCGAGCCTGACATTAGACCTATGACCTTGGAACCAGGAGATCAATTGCCTCTGACTTATGTAAGTACCAGCACTGACTGGGAAACAGGTGGTGGTTATAGCACCATTAAAGTTGGTGTTATGGAAAAATTATGCATGGAGGCTTTGAGGCTTTGCAAAGAAAATATGATTTTTACCCTAAAAGACTTTAAATTACAATTTCCAGAAAAATTTCTTCAATTTTCCAGCCGTACTCGCGGGACTGAAAAATTATCAGAAACTATTGACCTCTACGTAGAATCCATTTGTGCTGAAGAATCTGCCTGGAACATTGCTAAGGCTAGGATGAAACATGTCCCAGAAGGGGACATGGACCACAATTTAGTGGTCAGACTAGTGACATATCAAGGTTATTCACCCATGTATATGGGCCAGCTTTTAGTCAGCTGGCTGAAGGATGAATTAGGCAAAAAAAATTCTGTCTACTTTTTCGGTCCTGCCAATACTGGCAAAACTATGATGGCAGAGTCCATCTGCAAGATGGTGGGCATTTATGGAAATGTTAACCACAACAATGTTAACTTTCCATTCAATGACTGCCACAACAAAGCTATCATTTGGTGGGAAGAATGCTCCATGCAGGAACAATATGTAGAGGCTGCTAAATGCATACTGGGCGGCTCCGCCGTCAGAGTAGATAAGAAGGGCAAAGACTCTGTTTTGGTTCAAAGGACACCTGTCGTCATCACCAGCAATAATGACATTACTGTTGTTGCCGGAAGAAATGCCATCAGCTCCAATCACGCGGCTGCATTGCGCAGTCGCTGTATGAAGTTTGCCTTCAATAACTGGTTAACCAGTAATTGGGGGCTCATTACACCAGAAGAAATGTTCCAGTTCCTGCATTGGGCAGACACCACGTTCTCCTGCACTTTGACCTCTGTCATTGCTGCTAATCCTGGCTGTGAAGGTAATATTCCCTACAACCAACCGAGGGGCAATTGGTGCTCCTCTTGTTCTCCTCAGTTCACTACCAAGGAGACTGTCACCTTGTGTCCTTCCTGCTCTGGGTGGACCCGCATTCCTTCTGAGGTCATCGGACAAGAATATGATGGCAATGAAGTGGCTTTAATGGAAGGTCTCACTGAAGGTATGTATGAATTGGGCGGGGTCAGAGGCTATATATACCCCTGACTGCTTTATCTTTCAGACCAGCACGAGCTCCTGGCCGACGGAGACGCTAACCGTGCTGTCTGGATCGGCCGACGAGCCAGATCTCACGGTAAACGTCGAGCTGAAAGCCCAGGGGAGGACGAGAGCCCTAGAGCTAAGAGGGAGTGTGCAGCAGGACCCTCCGCCGTGCTGCCAACTGCTCTAGGTAAGCCCATCAGAATGTCTGACAACGCTCCTAGTCTTCATGAACTTTACTGTGAAGAAGAAATGTTTTCTTCCTCAGATGAAGATGATACTCCACTTCCTGTTCCTCCACCTAAACCCAGGGACTATGTCATGTGGAGCAATGATGAAAGGAGGTGGATTGAATCGTTTGGCGGGAAATGGAGGGTGGCTTTCCACGGGTTCCTGGATTGGTGGCATGACAATATTGAAAATGTCAACAAATTATATTCCAAACTCCACCCTGACATGAAACCTTCCTTCATAGAACATTGGTCAGAGATTAGGGAGTTTTGGGATCTATCTTGCGAGACTGATTTACAAATTAGAGATGCCATTTCTAGAAAAGATTTTACATTTGATATCGGGCTTGACATGAAACTCAATTCGGCCATTGACAAAACAGCTGGGGATTATCCGTTGACCATATGGTCCAAAATTGACCACTTTGCTCAGTGGTGTAATGCACGGGCTTTCTTCATAACAGGACAACAGCAGCCATGAAAAATTATGAGCCCAAAATCCCTACCAACACCGATGAAGCTTATTGGTACAACAGATGGTGGATTGACCATGTTAATTCAGGAAAAGTCATCGGCGGGAAATATGGAGGGGTTAAATCAAAGGGAAAACAATTAACTGCTGCTCAAAAAGAATCACGTAAACGGTTTTTTATTGTGCAGGCTCAGCAGAAAAAGAAGGCAAATGAGCAATTAAAATTTGGCATTCCTACTTCGTCTCAGCACGCAAGATTTTTCCGTAATCATACGGGTAGCGGTGGTGGGAAAGCTAAGGCAAAGACCAAACACATTGACCCTGGATACCAGGTCCCTTCTAATCAAGACCCTGACGAGGGGTAAGTGTAGCTGCCGGAGTCTGAGCCCTAGAGGAGTCTGGACTTGGAGTGGGACTAATGTCCCAGTTGGATTGTCTAGGAACAGCAGAAGTTTTAGCAACCTTGGGAGCAGGACCCTCGTCAGGGTCTTGATTAGAAGGGACCTGGTATCCAGGGTCAATGTGTTTGGTCTTTGCCTTAGCTTTCCCACCACCGCTACCCGTATGATTACGGAAAAATCTTGCGTGCTGAGACGAAGTAGGAATGCCAAATTTTAATTGCTCATTTGCCTTCTTTTTCTGCTGAGCCTGCACAATAAAAAACCGTTTACGTGATTCTTTTTGAGCAGCAGTTAATTGTTTTCCCTTTGATTTAACCCCTCCATATTTCCCGCCGATGACTTTTCCTGAATTAACATGGTCAATCCACCATCTGTTGTACCAATAAGCTTCATCGGTGGGAAATATGGAGGGGTTAAATCAAAGGGAAAACAATTAACTGCTGCTCAAAAAGAATCACGTAAACGGTTTTTTATTGTGCAGGCTCAGCAGAAAAAGAAGGCAAATGAGCAATTAAAATTTGGCATTCCTACTTCGTCTCAGCACGCAAGATTTTTCCGTAATCATACGGGTAGCGGTGGTGGGAAAGCTAAGGCAAAGACCTGAAAATTGGACTAATGAAACTGTATTCGCGGGTAAAACTATAATAACAAATGCCTCTAGACATTGTGTCTGTCTCAACCGTGATAATGACCATTATAAAATGATTTACAATGGAACCAATACACAAGAAAATAACCAGACTGACAAATCTGGGTGGATAGGGTTCACTACACCCTGGAATTACCTGGACTTTAACCAGAATGCAGTCCATTTCAGCCCTCGTGACTGGCAACACTTGGTCAATAACTACTCCCGTTGGAGGCCGCGGGCTGTACACATTAAAATTTTCAACATTCAAGTGGTGCAGCGCACCACTACTACAGACTCTACACTCACCTTTGCCAATGACCTGACTGGCACCATCCAAGTATTTGCCGATCAGGCCAACAGATACCCTAAACTCATGTACCCCAATCAAACTACTATGATGGGGCCTTTCCCTAACATGATTTACTACCTGCCACAATACGGCTACCTCACAAACGGCGGGCCTGGCAATACTGGACGGCCCTATGACTTGCTGGATGAATACTCACAGTTTTACTGTCTTGACGAACACCCTTCAGTCATGCTAAGAACCGGCAATACCTGGGAAGGTCACTTTCAATTTGGGGCTGACACTGGGTGGATCTCCAACAGACGGACCACCCGTCCTATCACTAGGAGAATGAACCCCAACTATGACACATGGCAGGTCAATGCTGTCGGTGGAGACGCCAAGTCTGGCACCTATGACACATGGAGGTCCCCGTGGCTCACTGGGCCGTGGATGGAACTCTATGAGGCTGCTGACAATACCACCATCTCTAACAACTCACATGTCTATGTGGGTCAAACTGCCATTCCTCTGAACCCTGGACCTCCCATTGGCCGGCCTACCAATAAAGCTCATTGTCATTTGTTTTGGGTGAGCAAAGTTCATGGCATGAATGAAGGTGATGTCAATGAACATTATATTAACCCCAGCACAGCCGTCACTGTGAGAGTGGACAACTCTGGCAGCTATGCCATTAACCCCAGTTCTGCCTATAAACTACGTGCCAGCAGTGATACTGGGGGAGACAACGGGAGTGCCACTCATCTCATTAAGTCTCAGGCTATCATGCCCGGCATGATATGGGATGATAGAATTGCTACTTACTGGGATAATATTTGGCAAGAATATCCTGAGTCAGACAATAAATTCATGCCACATGGCAGACTTGGTGGCGTCTATACCGACGCCGCCCCGGGGCACGTGTACGTGAAACTCACCCCCAAACCCACTGGAGAAGCCAATGCCATTATTGATCAATATGCCACTTTCACTGTTACTGTATCCATTGAATGGGAAGCTGAACCGTACACTTGCAGTCAATGGAATATGAGAAAAGTCATCTCCTATGATTCTACTGCTGCCAAATCTTATGATGGGTTTTGTGATTCTGATGGAAATTATATTGTGGGGGCAAATGATAGAAATGTAGAAACTCTGTACACTGCCAAAGTCAACCACCGTGTTAACTGAAAGGTCAAAGTCCAAAATAAAAGTTGTATTTAGAACTATATTTGTGAGTACCTTGCTTTTCTTCTTCTTCCTTCTTCCATCCGCCATTGTAATTCTTCAATAAATACTATGTAATTCTCTCGGTTCGTTCGCGGCCGAAGGCCGCGCGCGCTTCGCGCGCAGAACTAGAACCGAGAGAATTACATAGTATTTATTGAAGAATTACAATGGCGGATGGAAGAAGGAAGAAGAAGAAAAGCAAGGTACTCACAAATATAGTTCTAAATACAACTTTTATTTTGGACTTTGACCTTTCAGTTAACACGGTGGTTGACTTTGGCAGTGTACAGAGTTTCTACATTTCTATCATTTGCCCCCACAATATAATTTCCATCAGAATCACAAAACCCATCATAAGATTTGGCAGCAGTAGAATCATAGGAGATGACT
| 50,628
|
MT138215.1
|
Aveparvovirus sp.
|
Xiao,Y., Shan,T., Yang,S., Zhang,W.
|
Jiangsu University, School of Medicine
|
China
|
2020-05-06
|
bfb098ave01
|
Aveparvovirus sp.
|
Aveparvovirus
|
Parvoviridae
|
ssDNA(+/-)
| 5,891
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Aves
|
feces
|
2018
|
SAMN13782218
|
PRJNA600556
|
MAG: Aveparvovirus sp. isolate bfb098ave01, complete genome
|
TAGTACGGTCTCGTGGGCTCGGAGATGTGTCTGTCTCTTATACAGCCTTTAGGGTTAGTATAGCTGGCACAAACAGCAGCGCGCAGGTTAACTTGGTTAGAGCCAATCTGCACGTGCTCAGGCAGCATAACAATAGCAGAAAACCCACCAGAATTAGGAATGGCCATCTTACCTTAGCGCGGAGAGGCACCTCTGGGGTCCTGATCCTAGCTAGGAGTGTCTAGGCAGCTCGGCGTACACTCTTATATACACCTAGGCTAGTTAATTATTTACTGTGGACTTTGGTTGATTGAGGCCTACGCCCTTGTATACACAACAATTGGGATACCTTGCTTTTCCTACTTCCTTCCATCCTCCATCCTCCATCTTACACATGACTCCATAGTCACATGTCGGATACTAGTTCTGCGCGCGTAGCGCGCGCGCCTTCGGCGCGAACGTATCCGACATGTGACTATGGAGTCATGTGTAAGATGGAGGATGGAGGATGGAAGGAAGTAGGAAAAGCAAGGTATCCCAATTGTTGTGTATACAAGGGCGTAGGCCTCAATCAACCAAAGTCCACAGTAAATAATTAACTAGCCTAGGTGTATATAAGAGTGTACGCCGAGCTGCCTAGACACTCCTAGCTAGGATCAGGACCCCAGAGGTGCCTCTCCGCGCTAAGGTAAGATGGCCATTCCTAATTCTGGTGGGTTTTCTGCTATTGTTATGCTGCCTGAGCACGTGCAGATTGGCTCTAACCAAGTTAACCTGCGCGCTGCTGTTTGTGCCAGCTATACTAACCCTAAAGGGGAAGAGGTCCAGACTAAATTCCCTAGAGACCATGAGTTTGAGTCTAAGATTCAAAATTTTCTGGGGGTCCCTGATTGGAACTCAATTGACCTCAATTGGATTAAGCTTCACTATCAGCTCACTAAACATGCCATGGATATCGAGCAGAGCATTAATCCAGCTGCTAGATTCTTTTGGCAGATTGAAATCTCGAATGGAGGCAAAGTCCATGTCCATATCTTATTTATCAGTGGATGGACTTCCAAAAACATAACCTGGACTTTGAAACGGATCAGAAGGGAAATTTGTAAACAATTTTCTGATATCATGGGTACATTTATGCCTGAATGGACTTCGCCCCAGTGGTGGGGTCTTTTGACTAATTGCAGCATGGCAGCCATTTCACTGAACAGAGCATACTCACCAAGATTGGGAAAGACCATTCCTCAGCCGGTGAACCCTTACTCATTTTTGACAAACTACCTGTATAATCCCAAAAAGTCAGTGATGGTTAGAGAATGCTCAATGAACCTCAATGGGGTCCTGAAAACTGATAGACTAGAGGACATTCCAGAACTAGTGGAAGAAGGCGAGCCTGACATTAGACCTATGACCTTGGAGCCAGGAGATCAATTGCCTCTGACTTATGTAAGTACCAGCACTGACTGGGAAACAGGTGGTGGTTATAGCACCATTAAAGTTGGTGTTATGGAAAAATTATGCATGGAGGCTTTGAGACTTTGCAAAGAAAATATGATTTTTACCTTAAAAGACTTTAAATTACAATTTCCAGAAAAATTTCTTCAATTTTCCAGCCGTACTCGCGGGACTGAAAAATTATCAGAAACCATTGACCTCTACGTAGAATCCATTTGTGCTGAAGAATCTGCCTGGAACATTGCCAAGGCTAGGATGAAACATGTCCCAGAAGGGGACATGGACCACAATTTGGTGGTCAGACTAGTGACCTATCAAGGTTATTCACCTATGTATATGGGTCAGCTTCTAGTCAGCTGGCTGAAAGATGAATTAGGAAAAAAGAATTCTGTCTATTTTTTCGGTCCTGCCAATACTGGCAAAACTATGATGGCAGAATCCATCTGCAAGATGGTGGGCATTTATGGAAACGTTAACCACAACAATGTTAACTTTCCATTCAATGACTGCCACAACAAAGCTATCATTTGGTGGGAAGAATGCTCCATGCAGGAACAATATGTAGAGGCTGCTAAATGCATACTGGGCGGCTCCGCCGTCAGAGTAGATAAGAAGGGCAAAGACTCTGTTTTGGTTCAAAGGACACCTGTCGTCATCACCAGCAATAATGACATTACAGTTGTTGCCGGAAGAAATGCCATCAGCTCCAACCACGCGGCTGCATTGCGCAGCCGTTGCATGAAATTTGCCTTCAATAACTGGTTAACCAGTAATTGGGGTCTCATTACACCAGAAGAAATGTTCCAGTTCCTGCATTGGGCAGACTCTACTTTTTCCTGCACTTTGACCTCTGTCATTGCCGCTAATCCTGGCTGTGAAGGTAATATTCCCTACAACCAACCGAGGGGCAATTGGTGCTCCTCTTGTTCTCCTCAGTTCACTACCAAGGAAACTGTCACCTTGTGTCCCTCCTGCTCTGGGTGGACCCGCATTCCTTCTGAGGTCATCGGCCAAGAATATGATGGCAATGAAGTGGCTTTGATGGAAGGTCTCACTGAAGGTATGTATGAATTGGGCGGGGTCAGAGGCTATATATACCCCTGACTGCTTTCTCTTTCAGACCAGCACGAGCTCCTGGCCGACGGAGACGCTAACCGTGCTGTCTGGATCGGCCGACGAGCCAGATCTCACGGTAAACGTCGAGCTGAAAGCCCAGGGGAAAACGAGAGCCCTAGAGCTAAGAGGGAGTGTGCAGCAGGACCCTCCACCGTGCTGCCAACTGCTCTAGGTAAGCCCATCAGAATGTCTGACAACGCTCCTAGCCTTCATGAACTTTACTGTGAAGAAGAAATGTTTTCTTCCTCAGATGAAGATGATACTCCACTTCCTGTTCCTCCACCTAAACCCAGGGACTATGTCATGTGGAGCAATGATGAGAGGAGGTGGATTGAATCATTTGGCGGGAAATGGAGGGTGGCTTTCCACGGGTTCCTGGATTGGTGGCATGACAATATTGAAAATGTCAACAAATTGTATTCCAAACTCCACCCTGACATGAAACCTTCCTTCATAGAACATTGGACAGAGATTAGGGAGTTTTGGGATTTATCTTGCGAGACTGATTTACAAATTAGAGATGCCATTTCTAGAAAAGATTTTACATTTGATATCGGGCTTGACATGAAACTAAATTCGGCCATTGACAAAACAGCTGGGGATTATCCATTGACCATTTGGTCCAAAATTGACCACTTTGCTCAGTGGTGTAATGCACGGGCTTTCTTCATAACAGGACAACAGCAGCCATGAAAAATTATGAGCCCAAAATTCCTACCAACACCGATGAAGCTTATTGGTACAACAGATGGTGGATTGACCATGTTAATTCAGGAAAAGTCATCGGCGGGAAATATGGAGGGGTTAAATCAAAGGGAAAACAATTAACTGCTGCTCAAAAAGAATCACGTAAACGGTTTTTTATTGTGCAGGCTCAGCAGAAAAAGAAGGCAAATGAGCAATTAAAATTTGGCATTCCTACTTCGTCTCAGCACGCAAGATTTTTCCGTAATCATACGGGTAGCGGTGGTGGGAAAGCTAAGGCAAAGACCAAACACATTGACCCTGGATACCAGGTCCCTTCTAATCAAGACCCTGACGAGGGTCCTGCTCCCAAGGTTGCTAAAACTTCTGCTGTTCCTAGACAATCCAACTGGGACATTAGTCCCACTCCAAGTCCAGACTCCTCTAGGGCTCAGACTCCGGCAGCTGCGCCTACGGCCGAACCTCAACAACCTGCTGAGGATCCCAATATTCTGGAAACCGTGATGGCCTCAGAAAATGACATTCCCATGGAGCCTGATCAGAGCGGACTTGCTGCTGATATGGATGTGGGTGGTGGTGGTGCGGGTGGTGGTGGCGGTGTTGGAAATTCTACTGGAAATTGGACTAATGAAACTGTATTCGCGGGTAAAACTATAATAACAAATGCCTCTAGACATTGTGTCTGTCTCAACCGTGATAATGACCATTATAAAATGATTTACAATGGAACCAATACACAAGAAAATAACCAAACTGACAAATCTGGGTGGATAGGGTTCACTACACCCTGGAATTACCTGGACTTTAACCAGAATGCAGTCCATTTCAGTCCTCGTGACTGGCAACACTTGGTCAATAACTACTCCCGTTGGAGGCCACGGGCTGTACACATTAAAATTTTCAACATTCAAGTGGTGCAGCGCACCACTACTGCAGACTCTACGCTCACCTTTGCCAATGACTTGACTGGCACCATCCAAGTATTTGCTGATCAGGCCAACAGATATCCTAAACTCATGTACCCCAATCAAACTACTATGATGGGGCCTTTCCCTAACATGATTTACTACCTGCCACAATACGGCTACCTCACAAACGGCGGGCCTGGCAATGCTGGACGGCCCTATGACTTGCTGGATGAATACTCACAGTTTTACTGTCTTGACGAACACCCTTCAGTCATGCTAAGAACCGGCAATACCTGGGAAGGTCACTTTCAGTTTGGGGCTGACACTGGGTGGATCTCCAACAGACGGACCACCCGTCCTATCACTAGGAGAATGAACCCCAACTATGACACATGGCAGGTCAATGCTGTCGGTGGAGACGCCAAGTCTGGCACCTATGACACATGGAGGTCCCCGTGGCTCACTGGGCCGTGGATGGAACTCTATGAGGCTGCTGACAATACCACCATCTCTAACAACTCACATGTCTATGTGGGTCAAACTGCCATTCCTCTGAACCCTGGACCTCCCATTGGCCGGCCTACCAATAAAGCTCACTGTCATTTGTTTTGGGTGAGCAAAGTTCATGGCATGAACGAAGGCGATGTCAATGAACATTATATTAACCCCAGCACAGCCGTCACTGTGAGAGTGGACAATTCCGGCAGCTATGCCATTAACCCCAGTTCTGCCTATAAACTACGTGCCAGCAGTGATACTGGGGGAGACAACGGGAGTGCCACCCATCTCATTAAATCACAAGCTATCATGCCGGGCATGATCTGGGATGATAGAATTGCTACCTACTGGGATAATATCTGGCAAGAATATCCTGAGTCAGACAATAAATTCATGCCACACGGCAGACTTGGCGGCGTCTATACCGACGCCGCCCCGGGGCACGTGTACGTGAAACTCACCCCCAAACCCACTGGAGAAGCCAATGCCATTATTGATCAATATGCCACTTTCACTGTTACTGTCTCTATTGAATGGGAAGCTGAACCATACACTTGCAGTCAATGGAATATGAGAAAGGTCATCTCCTATGATTCTACTGCTGCCAAATCTTATGATGGATTTTGTGATTCTGATGGAAATTATATTGTTGGAGCTAATGACAGAAATGTGGAAACTCTGTACACTGCCAAAGTCAACCACCGTGTTAACTGAAAGGTCAAAGTCCAAAATAAAAAGCTTCTGAAAATAACTTGTGAGTACCTTGCTTTTCTTCTTCTTCCTTCTTCCATCCGCCATTGTAATTCTTAAATAAAGACTATGTAATTCTCTCGGTTCGTTCGCGGCCGAAGGCCGCGCGCGCTTCGCGCGCAGAACTAGAACCGAGAGAATTACATAGTCTTTATTTAAGAATTACAATGGCGGATGGAAGAAGGAAGAAGAAGAAAAGCAAGGTACTCACAAGTTATTTTCAGAAGCTTTTTATTTTGGACTTTGACCTTTCAGTTAACACGGTGGTTGACTTTGGCAGTGTACAGAGTTTCCACATTTCTGTCATTAGCTCCAACAATATAATTTCCATCAGAATCACAAAATCCATCATAAGATTTGGCAGCAGTAGAATCATAGGAGATGACCTTTCTCATATTCCATTGACTGCAAGTGTATGGTTCAGCTTCCCATTCAATAGAGACAGTAACAGTGAAAGTGGCATATTGATCAATAATGGCATTG
| 50,629
|
Subsets and Splits
No community queries yet
The top public SQL queries from the community will appear here once available.